2024年3月29日发(作者：有友卉)
AB SC IEX Tr iple TOF 5600+质谱仪操作流程
1. . 打 开 A naly st® TF 软 件
双 击 桌 面 【 A B S C IEX A pplication Launcher】， 选 择 【 A naly st】 进 入 软 件 ， 或 直 接 点 击
桌 面 【 A naly st TF1 .7 S oftw a re】 进 入 软 件 。
2. . 激 活 硬 件 配 置 （ Hardw are config uration）
在 左 侧 导 航 栏 中 双 击 C onfig ure 菜 单 下 的【 Hardw a re config uration】按 钮 ，弹 出 Hardw are
config uration Editor， 选 中 【 L C +5600 】， 点 击 右 侧 【 A ctivate Profile】 按 钮 ， 激 活 仪 器 。
3. . 手 动 校 正 仪 器 （ M anual tuning ）
3 .1 TOF M S 正 离 子 校 正
在 左 侧 导 航 栏 中 点 击【 Tune and C a l ibrate】菜 单 下 的【 M anual tuning 】，出 现 一 个 校 正 采
集 方 法 的 模 板 , 点 击 源 /气 （ S ource /Ga s） 标 签 ， 更 改 离 子 源 参 数 （ 参 数 可 设 置 为 GS 1 ： 50 ；
GS 2 ： 50 ； C U R ： 30 ； TEM ： 550 ； IS V F 默 认 值 不 变 ）， 方 法 选 择 “ M S M ethod”， 扫 描 类 型
（ S can ty pe） 改 为 “ TOF M S ”， 极 性 polarity 选 择 “ Positive ”。 设 置 完 成 后 在 校 准 传 输 系 统
（ C DS ） 控 制 按 钮 中 点 击 【 C DS Purg e】 （ 消 除 残 存 的 溶 液 或 气 泡 ）， 然 后 点 击
【 C DS R efill】
左 侧【 S ta rt】
（ 充 满 校 正 液 ）， 完 成 后 点 击 【 C DS Inject】 ， 同 时 点 击
开 始 采 集 数 据（ 数 据 采 集 开 始 后 下 面 两 个 窗 口 同 时 被 打 开 ，左 侧 是 TIC
总 离 子 流 图 ，右 侧 是 TOF M S 质 谱 图 ），持 续 采 集 2 min，以 获 得 稳 定 的 TIC 图 ，然 后 点 击【 S top】
停 止 采 集 ， 同 时 点 击 【 C DS S top】 ， 选 择 总 离 子 流 图 TIC 后 部 分 的 图 谱
0 .5 ~1 m in ， 双 击 TIC 图 的 高 亮 区 ， 显 示 出 TOF M S 选 择 区 域 的 平 均 图 ， 点 击 右 键 选 择
【 R e-C a l ibrate TOF】， 弹 出 TOF C a libration 窗 口 ， 在 参 照 表 （ R eference Table） 下 拉 菜 单 选
择“ A PC I Positive C a l ibration S olution”，依 次 点 击【 C a lculate new calibrations】→【 C a l ibrate
spectrum】 → 【 Entire File 】， 然 后 点 击 【 S ave 】， 弹 出 Ex plore Dir 窗 口 ， 点 击 【 OK】， 弹 出
TOF recalibration 窗 口 后 再 点 击 【 OK】， 再 点 击 【 C lose 】， 完 成 TOF M S 正 离 子 校 正 。
3.2 2 Product Ion 正 离 子 校 正
S can Ty pe 选 择 【 Product Ion】， 选 择 【 Hig h S ensitivity 】， 方 法 C a l ibrate 选 择 【 A uto C a l
ibration】， 其 它 参 数 不 变 ， 点 击 【 S ta rt】 开 始 采 集 数 据 ， 其 后 步 骤 同 TOF M S 正 离 子 校 正 。
3.3 3 TOF M S 负 离 子 、Product Ion 负 离 子 校 正 同 TOF M S 正 离 子 、Product Ion 正 离 子 校 正 ，
只 需 将 极 性 polarity 改 为 “ Neg a tive ”， 将 R eference Table 改 为 “ A PC I Neg tive C a l ibration
S olution”。
4. . 建 立 LC -M S 方 法 （ B uild acquisition method）
41. 1 在 左 侧 导 航 栏 A cquire 菜 单 中 双 击【 B uild A cquisition M ethod】， 弹 出 A cquisition M
ethod 窗 口 ， 点 击【 TOF M S (+) 】， S can ty pe 选 择“ TOF M S ”， 点 击【 Edit Parameters】 按 钮 ，
弹 出 Parameter S etting s 窗 口 ， 点 击 【 S ource /Ga s】 标 签 ， 设 置 离 子 源 参 数 （ 参 数 可 设 置 为 GS
1 ： 55 ； GS 2 ： 55 ； C U R ： 30 ； TEM ： 550 ； IS V F 默 认 值 不 变 ）， TOF M asses 范 围 M ax 可 设
为 1200 Da。 A ccum ulation tim e 设 置 在 0 .15 s 左 右 （ >0 .08 s， 并 保 证 单 个 循 环 时 间 在 0 .7 s 左
右 ）， 完 成 后 点 击 OK。点 击【 C reate IDA Ex p】，弹 出 C reate IDA Experiments 窗 口 ，循 环 可 设
“ 8 ”， 同 时 保 证 Dy nam ic backg round subtract 为 选 中 状 态 （ 默 认 ），。
42. 2 点 击 【 Product Ion（ +） IDA 】， TOF M asses 范 围 可 设 为 M in： 50 Da， M ax： 1200 Da，
选 择 “ Hig h S ensitivity ”， 点 击 【 Edit Parameters】， S ource /Ga s 同 前 设 置 ， 设 置 C ompound 参
数 ( DP： 80 ； C E： 35 ； C ES ： 15 ； IR D、 IRW 默 认 值 不 变 )， 完 成 后 点 击 【 OK】。
4 .3 选 择 A g i lent 1290 B inary Pump， 编 辑 色 谱 方 法 （ 目 前 此 步 骤 略 ， 按 照 安 捷 伦 1290 色 谱
仪 操 作 流 程 操 作 ）。
4 .4 保 存 方 法 ： 点 击【 S aves】
点 击 【 S ave 】。
保 存 ， 弹 出 S ave A cquisition M ethod 窗 口 ， 输 入 File name，
5. . 建 立 批 处 理 表 ： 左 侧 导 航 栏 A cquire 菜 单 中 双 击 【 B uild A cquisition B a tch】， 在 右 边 窗 口
S am ple 栏 点 击【 A dd set】 ，再 点 击【 A dd S am ples】 ，弹 出“ A dd S ample”
窗 口 ，可 填 写 Prefix 栏 和 New S amples 的 数 量 ，完 成 后 点 击【 OK】，在 出 现 的 序 列 表 中 可 输
入 或 修 改 样 本 名 ， 瓶 位 （ Vial Position）， 保 存 数 据 文 件 名 等 信 息 。 在 M ehod editor 栏 选 择 采
集 方 法 ， C a librate 栏 可 勾 选 “ A uto C a l ibrte ”， 并 选 择 定 标 频 率 （ 可 每 5 个 样 本 定 标 1 次 ），
点 击 【 S ave】 保 存 ， 弹 出 S ave A cquisition B a tch 窗 口 ， 输 入 “ B a tch 名 ”， 点 击 【 S ave】
保 存 批 处 理 表 。在 S ubmit 标 签 中 点 击【 S ubmit】
可 浏 览 该 列 表 。
6 . 平 衡 并 采 集 数 据
提 交 列 表 。点 击【 View Queue】
点 击 【 Equilibrate】 平 衡 仪 器 ， 弹 出 Equilibrate 窗 口 ， 平 衡 时 间 可 设 为 “ 3 ” m in，
点 击 【 Ok 】。 平 衡 完 成 后 点 击 【 S ta rt S am ple】
7 . Peakview 定 性 检 测
开 始 采 集 数 据 。
7 .1 目 标 性 筛 查 检 测 ： 使 用 目 标 化 合 物 分 子 式 提 取 化 合 物 信 息 。
7 .2 非 目 标 性 纯 未 知 检 测 ： 使 用 Peakview 的 Non-Targ et peak Find 功 能 提 取 满 足 条 件 的 化 合
物 信 息 。
8 . 开 、 关 机 流 程
8 .1 开 机 流 程 ： 打 开 氮 气 发 生 器 ， 确 定 气 压 正 常 → 打 开 机 械 泵 电 源 → 等 待 约 1 h→ 打 开 质
谱 主 机 电 源 → 结 束 。
8 .2 关 机 流 程 ： 关 闭 质 谱 主 机 电 源 → 等 待 20 ~30 min→ 关 闭 机 械 泵 电 源 → 关 闭 氮 气 发 生 器
→ 结 束 。
2024年3月29日发(作者：有友卉)
AB SC IEX Tr iple TOF 5600+质谱仪操作流程
1. . 打 开 A naly st® TF 软 件
双 击 桌 面 【 A B S C IEX A pplication Launcher】， 选 择 【 A naly st】 进 入 软 件 ， 或 直 接 点 击
桌 面 【 A naly st TF1 .7 S oftw a re】 进 入 软 件 。
2. . 激 活 硬 件 配 置 （ Hardw are config uration）
在 左 侧 导 航 栏 中 双 击 C onfig ure 菜 单 下 的【 Hardw a re config uration】按 钮 ，弹 出 Hardw are
config uration Editor， 选 中 【 L C +5600 】， 点 击 右 侧 【 A ctivate Profile】 按 钮 ， 激 活 仪 器 。
3. . 手 动 校 正 仪 器 （ M anual tuning ）
3 .1 TOF M S 正 离 子 校 正
在 左 侧 导 航 栏 中 点 击【 Tune and C a l ibrate】菜 单 下 的【 M anual tuning 】，出 现 一 个 校 正 采
集 方 法 的 模 板 , 点 击 源 /气 （ S ource /Ga s） 标 签 ， 更 改 离 子 源 参 数 （ 参 数 可 设 置 为 GS 1 ： 50 ；
GS 2 ： 50 ； C U R ： 30 ； TEM ： 550 ； IS V F 默 认 值 不 变 ）， 方 法 选 择 “ M S M ethod”， 扫 描 类 型
（ S can ty pe） 改 为 “ TOF M S ”， 极 性 polarity 选 择 “ Positive ”。 设 置 完 成 后 在 校 准 传 输 系 统
（ C DS ） 控 制 按 钮 中 点 击 【 C DS Purg e】 （ 消 除 残 存 的 溶 液 或 气 泡 ）， 然 后 点 击
【 C DS R efill】
左 侧【 S ta rt】
（ 充 满 校 正 液 ）， 完 成 后 点 击 【 C DS Inject】 ， 同 时 点 击
开 始 采 集 数 据（ 数 据 采 集 开 始 后 下 面 两 个 窗 口 同 时 被 打 开 ，左 侧 是 TIC
总 离 子 流 图 ，右 侧 是 TOF M S 质 谱 图 ），持 续 采 集 2 min，以 获 得 稳 定 的 TIC 图 ，然 后 点 击【 S top】
停 止 采 集 ， 同 时 点 击 【 C DS S top】 ， 选 择 总 离 子 流 图 TIC 后 部 分 的 图 谱
0 .5 ~1 m in ， 双 击 TIC 图 的 高 亮 区 ， 显 示 出 TOF M S 选 择 区 域 的 平 均 图 ， 点 击 右 键 选 择
【 R e-C a l ibrate TOF】， 弹 出 TOF C a libration 窗 口 ， 在 参 照 表 （ R eference Table） 下 拉 菜 单 选
择“ A PC I Positive C a l ibration S olution”，依 次 点 击【 C a lculate new calibrations】→【 C a l ibrate
spectrum】 → 【 Entire File 】， 然 后 点 击 【 S ave 】， 弹 出 Ex plore Dir 窗 口 ， 点 击 【 OK】， 弹 出
TOF recalibration 窗 口 后 再 点 击 【 OK】， 再 点 击 【 C lose 】， 完 成 TOF M S 正 离 子 校 正 。
3.2 2 Product Ion 正 离 子 校 正
S can Ty pe 选 择 【 Product Ion】， 选 择 【 Hig h S ensitivity 】， 方 法 C a l ibrate 选 择 【 A uto C a l
ibration】， 其 它 参 数 不 变 ， 点 击 【 S ta rt】 开 始 采 集 数 据 ， 其 后 步 骤 同 TOF M S 正 离 子 校 正 。
3.3 3 TOF M S 负 离 子 、Product Ion 负 离 子 校 正 同 TOF M S 正 离 子 、Product Ion 正 离 子 校 正 ，
只 需 将 极 性 polarity 改 为 “ Neg a tive ”， 将 R eference Table 改 为 “ A PC I Neg tive C a l ibration
S olution”。
4. . 建 立 LC -M S 方 法 （ B uild acquisition method）
41. 1 在 左 侧 导 航 栏 A cquire 菜 单 中 双 击【 B uild A cquisition M ethod】， 弹 出 A cquisition M
ethod 窗 口 ， 点 击【 TOF M S (+) 】， S can ty pe 选 择“ TOF M S ”， 点 击【 Edit Parameters】 按 钮 ，
弹 出 Parameter S etting s 窗 口 ， 点 击 【 S ource /Ga s】 标 签 ， 设 置 离 子 源 参 数 （ 参 数 可 设 置 为 GS
1 ： 55 ； GS 2 ： 55 ； C U R ： 30 ； TEM ： 550 ； IS V F 默 认 值 不 变 ）， TOF M asses 范 围 M ax 可 设
为 1200 Da。 A ccum ulation tim e 设 置 在 0 .15 s 左 右 （ >0 .08 s， 并 保 证 单 个 循 环 时 间 在 0 .7 s 左
右 ）， 完 成 后 点 击 OK。点 击【 C reate IDA Ex p】，弹 出 C reate IDA Experiments 窗 口 ，循 环 可 设
“ 8 ”， 同 时 保 证 Dy nam ic backg round subtract 为 选 中 状 态 （ 默 认 ），。
42. 2 点 击 【 Product Ion（ +） IDA 】， TOF M asses 范 围 可 设 为 M in： 50 Da， M ax： 1200 Da，
选 择 “ Hig h S ensitivity ”， 点 击 【 Edit Parameters】， S ource /Ga s 同 前 设 置 ， 设 置 C ompound 参
数 ( DP： 80 ； C E： 35 ； C ES ： 15 ； IR D、 IRW 默 认 值 不 变 )， 完 成 后 点 击 【 OK】。
4 .3 选 择 A g i lent 1290 B inary Pump， 编 辑 色 谱 方 法 （ 目 前 此 步 骤 略 ， 按 照 安 捷 伦 1290 色 谱
仪 操 作 流 程 操 作 ）。
4 .4 保 存 方 法 ： 点 击【 S aves】
点 击 【 S ave 】。
保 存 ， 弹 出 S ave A cquisition M ethod 窗 口 ， 输 入 File name，
5. . 建 立 批 处 理 表 ： 左 侧 导 航 栏 A cquire 菜 单 中 双 击 【 B uild A cquisition B a tch】， 在 右 边 窗 口
S am ple 栏 点 击【 A dd set】 ，再 点 击【 A dd S am ples】 ，弹 出“ A dd S ample”
窗 口 ，可 填 写 Prefix 栏 和 New S amples 的 数 量 ，完 成 后 点 击【 OK】，在 出 现 的 序 列 表 中 可 输
入 或 修 改 样 本 名 ， 瓶 位 （ Vial Position）， 保 存 数 据 文 件 名 等 信 息 。 在 M ehod editor 栏 选 择 采
集 方 法 ， C a librate 栏 可 勾 选 “ A uto C a l ibrte ”， 并 选 择 定 标 频 率 （ 可 每 5 个 样 本 定 标 1 次 ），
点 击 【 S ave】 保 存 ， 弹 出 S ave A cquisition B a tch 窗 口 ， 输 入 “ B a tch 名 ”， 点 击 【 S ave】
保 存 批 处 理 表 。在 S ubmit 标 签 中 点 击【 S ubmit】
可 浏 览 该 列 表 。
6 . 平 衡 并 采 集 数 据
提 交 列 表 。点 击【 View Queue】
点 击 【 Equilibrate】 平 衡 仪 器 ， 弹 出 Equilibrate 窗 口 ， 平 衡 时 间 可 设 为 “ 3 ” m in，
点 击 【 Ok 】。 平 衡 完 成 后 点 击 【 S ta rt S am ple】
7 . Peakview 定 性 检 测
开 始 采 集 数 据 。
7 .1 目 标 性 筛 查 检 测 ： 使 用 目 标 化 合 物 分 子 式 提 取 化 合 物 信 息 。
7 .2 非 目 标 性 纯 未 知 检 测 ： 使 用 Peakview 的 Non-Targ et peak Find 功 能 提 取 满 足 条 件 的 化 合
物 信 息 。
8 . 开 、 关 机 流 程
8 .1 开 机 流 程 ： 打 开 氮 气 发 生 器 ， 确 定 气 压 正 常 → 打 开 机 械 泵 电 源 → 等 待 约 1 h→ 打 开 质
谱 主 机 电 源 → 结 束 。
8 .2 关 机 流 程 ： 关 闭 质 谱 主 机 电 源 → 等 待 20 ~30 min→ 关 闭 机 械 泵 电 源 → 关 闭 氮 气 发 生 器
→ 结 束 。