2024年4月6日发(作者:漆学)
新疆农业科学
2001,53(4)
:
700
-7H
Xinjiany
AgUca/urai
Sciescas
doi
/
41
6448/j.
isx.
641
-
4334.
Hl.
44.413
4
种
RNA
的
dsRNA
提取方法
果评价
常瑞
3
王
俊
2
,
付开*
5
,
廖兰兰
5
,
丁新华
5
,
何
江
5
,
郭文超
4
,
吐尔逊•阿合买提
5
,
任羽
1
(1
.喀什大学生命与地理科学学
3,
新疆喀什
844006
;
2.
新疆农业农村厅植物保护
O
,
鸟鲁木齐
830049
;
5.
新疆农业科学
3
植物保护研究所/
农业部西北荒漠化绿
{
作物有害生物综合洽理
E
点实验
I,
鸟鲁木齐
830091
;
4.
新疆农业科学
3
微生物
{用研究所
/
新疆特殊环境微生
GE
点实验
I,
鸟鲁木齐
836691
)
摘
要
:
【
目的
】
构建表达不同片段长度和
GC
含量的
dseWp
片段
,
比较
4
种
dsRNA
提取方法,获得最佳的提
取方
法
以及dsRNA
相对
最优
的表达载体
,
为
dsRNA
的降解研究提
供
基础
。
【
方法
】
4
pET-2p
和
L4444
为载
体
,
分别构建
5
组不同长度
、
不同
CG
含量的
Op
-241
-34CG
、
Wp
-241
-54
-
CG
、
Wp
-423
-
32CG
、
gfp
-423
-54CG
和
Wp-403
-74CG
为目的片段的
dsWp
表达载体
,
运用
T/zoi
法
、
酚
氯仿
法
、
RNA-
不均提取液以及
75%
酒精沉淀法分别提取
1
和
54
mL
经异丙基硫代
-
0
-
D
-
半乳糖
3(
(
PTG)
诱导菌液表达的
dsWu,
核酸检
测
A
4o/
A
4o
、
A
4o/
A
o/
比较纯度,
以体外合成
dsWp
为对照
,
评价
4
种方法提取效率及
2
种载体
dsWp
表达能
力
。
【
结果
4
种提取方法经多重方差分析,
其中提取纯度最高的是
TUzoi
法和酚氯仿法
A
2
00/
/
A
28
7-,A
2
00/
/
A
0
3
0
均
值分别可达
7
83
、
/
97;
7
78
、
2.
1,
损失率分别为
23.
83%
H
24%
。
其次是
75%
酒精沉淀法
A
2
00/
/
A
28
0
,
A
26
0/
(
A
56
均值可达
78,7
78,
损失率为
36.
8%
o
提取纯度最低的为
RNA
-
平均提取液
,
其
A
26
0/
/
A
28
9
A
26
0/
/
A
0
3
7
均值
可达
7
56
、
7
56,
损
失率
为
371
60%
。
利用内标混合
纯
dsRNA
的方
法
,
计
算获得每毫
升
pET-2P
和
L4444
表
,
达载体诱导菌液可发酵产生
&7~24.39
R
g
、
7.28~22.47
R
g
dsWp
。
【
结论
】
提取
pET-2p
和
L4444
表达的
-W
p
,
其中酚氯仿法可用于快速提取高质量
、
高
纯
度原核表达的
dsWp,pET
-2p
为
ds/u
最优表达载体
。
关键词
原核;双链
RNA
;
提取;降解
中图分类号:
S188
文献标识码:
A
文章编号
:
641
-
4336
(2401)44
-
4744
-
17
4
引言
【
研究意义
】
马铃薯甲虫
(
LeptUotara
decem-
Puata
Sna
专一性
、
安全性强
,
且植物生
响
,
对
挖
掘更多生物防
要
[
]
。
但
dsRNA
生产成本高
、
产量无法预测
、
稳定性低
。
)
是马铃
性害虫
。
持续化学防治
【
前
进展
]
dsRNA
在环境中极
定
,
自然
。
并且其
使马铃
虫对部分拟除虫
、
氨基甲酸酯
、
有
机磷
、
新
类和微生物杀虫剂产生了抗性
[
]
。
下
3
~7
h
就
NA
在紫外
;
示
等
[
]
发现
dsR-
下
,4h
就
系统
,
植物
使用
RNAi
技术,喂食马铃薯甲虫涂抹
dsRNA
的
铃薯叶片
2
低
、
沉默马铃
机制
、
扩增
虫特定基
-RNA
以及有害生物对
RNAi
敏感性差别大等因
因表达
,
抑制马
铃
虫的正常生
,
具有高
素⑷
。
目前
,
dsRNA
主要通过
3
个方法大量生
收稿日期
(Receives)
:
2020
-
11
-47
基金项目
:
勺治区创新环境(人才、
基地)建设专项(人才专项计划
-
天山雪松计划
)(
218XS36
)
新疆农业科学院科技创新重点培育专
项
“
新疆重大新发农林入侵生物监测预警与综合防控
”
(XU
cp
-002
)
作者简介
:
常瑞
(693
--
,
男
,
新疆人
,
硕士研究生
,
研究方向为资源微生物开发与利用
,(E-maii)
;
cyagpSS
@0
x
111.
cm
通信作者
:
文超
(
666-
)
男,
可北人
,
研究员
,
博士生导师
,
研究方向为农业害虫综合防治
,
E-mUi)
增
**********
付开赞
(
1987
-
-
,
男
,
浙江人
,
助理研究员
,
在站博士后
,
研究方向为昆虫生理生化与分子生物学
,
E-maii)fuUaiyyuC7@
65
2
anm
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
771
产:一是合成含有
T3
启动子的
-RNA
特异性引
物
2
外合成试剂盒合成
dsRNA
S4]
。
二是
原核生物
生产
-RNA,
最早用于干扰秀丽引
线虫
,
喂食
引线虫时可产生强烈干扰
。
将构
建完成的
-RNA
表达载体导入
RNase
III
缺陷型
大肠杆菌
HT115
(
DE3
-感受态中
,
经异丙基硫代
-0
-D
-
半乳糖
3
(
ITG
)
诱导
,
产生
dsR-
NA
[
2,
]
。
过转基因植物表达
dsRNA
,
使植
物具有
“
终生
”
防御性
,
害虫啃食植物后
2
次
抑制其生
死亡
,
无
为干
预
[
,1
。
【
本
切入点
】
方法可大量合成
-R-
NA,
快速高效
,
合成
dsRNA
可直接使用,但体外
合成试剂盒成本较高
,
实际大规模推广使
切
际
。
方法
得到大量
-RNA,
且成本较
低
。
但
、
诱导过程中
,
如何保
高活
性
、
持续产生
-RNA,
仍需有待研究
。
针对
RNAi
的特异性以及原
获得
-RNA
良好的应用
前景
,
以
pET-2p
和
)
444
为载体发酵产生
dsR-
NA
的
法为基础
。
筛选
4
种提
取菌液总
RNA
方法以提高菌液
-RNA
的获取
率
。
【
拟解决的关键问题
】
利用
720
bp
-
荧光
蛋白
Wu
[1_I5
]
为模板
,
分别随机改变碱基改变
GC
含量,并构建
5
组
组合的
-增
0
片段
:
201
bp
长度的
30%
CG
含量的
dsWp
(
简称
201
-
37CG
,
下同
)
,201
-
50CG
、
423
-
37CG
、
423
-
50CG
、
423
-72CG
。
运用试剂盒体外合成以上
7
种
dpf,
检测其浓度
、
纯
为
标准
。
将以
上
6
组表达
原
,
运用
TUzoi
法
、
酚
氯仿法
、
RNA-
平均
提取液
、
以及
75%
酒精沉淀
法
分另
U
提取
―增小
。
建立菌液表达
dsRNA
的最佳
提
法以及最优表达
提供理论支持
。
1
材料与方法
1
2
材料
1.1.1
载体
pET
-2p
、
L449
质粒实验室保存
。
1.1.6
菌株
大肠杆菌
HT115
(
DE3
-菌株购自上海唯地生
物技术有限公司
,
培养至二代菌株由该实验室保
。
1.1.3
主要试剂及仪器
试剂:
Truss
-
T1
感受态细胞
、
2xEasy
Taq
PCR
Supee
MS
(
全式金
)
;
琼脂糖
(
西班牙
)
;
LB
broth
(
MDBia
,
Ise
-;
卡那霉素
(
Kans
-
、
四环素
(
Tel
)
、
氨节青霉素
(
Amp
)
、
I
PTG
粉末
;
苯酚:氯仿
合液
(
20
:
24
)
等
(
SolarUia
-
;
质
提试剂盒
、
琼脂糖凝胶
剂盒
(
OMEGA
-
;
Hibcribe™T
2
High
Yield
RNA
Syythesis
Kii
(
NEB
-;限制性内切
酶
EcoRS
、
NotO
、
HUgA
i
、
XhoU
(
Thermo
-
;
ClosEx-
pressI
I
Osa
Step
Closinq
Kit
、
RNA
-
essp
提取液
(
Vazyme
)
;
TUzoi
Reaqest
(
ambios
-
;
焦炭酸二乙酯
(
DEPC
2
Sshap
)
;
异丙醇
、
无水乙醇均为分析纯
;
D
全
se-/R
全
se
-
0
平
离心管
、
移液器枪头
(
BU
o/pix
)
。
:离心机
(
湘立
TGL6M
)
;
PCR
仪
(
ICy-
cliny
96
梯度-
;
摇床
(
TASITEDY
-200B
-
;
电热恒
温干燥箱
(
TASITE299
-1AB
)
;
水浴锅
(
BATHS
-
;
核酸电泳系统
(
北京六一
DYY-6D
);
凝胶成像
系统
(
Wealtac
Dolphin
)
D
)
;
B
-
500
BIUPHOTO
METER
(
METASH
-
;
-87°C
冰箱
(
Thermo
ULTS1873
-
;
超净工作台
(
江苏通净
VD
-650
-
;
超纯水机
(
青岛富勒姆
FBZ0502
-
SUP
)
。
1.3
方法
1.2.3
dsfC
基因
、
引物合成
以来自于
720
bpWu
的序列为模板
,
对其基因
进行设计优化
,
随
变碱基
CG
含量
,
交由南京
金
斯
瑞生物科技有限公司完成基因合成
。
合
成了
7
组不同长度组合的―增小片段
:
2
01
bp
长度
的
37%
CG
含量的
dsWp
(
简称
201
-
37CG
,
下
同
)、
201
-50CG
、
423
-30CG
、
423
-50CG
、
423
-
77CG
。
以
T
2
启动子为起始序列设计
、
合成引物
,
用于体外合成
―增小
。
以
XhoI
、
HUidIII
(
L4444
)
和
KpU
、
Nof
(
4hT
-20-
为双酶切位点设计
、
合成引
物
,
用于构建
)
444
-
增
0
和
pET
-2p
-
Wu
表达
载体
。
表
3
图
1
722
53
卷
表
、
用于
dsRNA
合成
、
载体
构建引物序列
Table
1
POmer
Ur
dsRNA
synthesis
and
化<^
00
111
x
1:01
引
物
Prinmes
T7-G221-32-F
T7-G221-32-R
T
-
G201
-56
-F
序
列
(5tW
J
)
Sequences
(5
toO
5
TAATACGACTCACTATAGGGAATAAGTTAAGAGACTGCA
TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTTATTATCTAAC
TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
T
-G201
-56
-R
T
-G425
-30
-F
TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
TAATACGACTCACTATAGGTGATTCATCTTGATATCGATCAT
T-G425
-30
-R
T
-G425
-56
-F
TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
TAATACGACTCACTATAGGGGACTCCCCCTGGTGGC
TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTTCAGCGTGTGC
T-G425
-56
-R
T
-G425
-77
-F
T-G425
-77
-R
L-G201
-30
-F
*
L-G221-32-R
TAATACGACTCACTATAGGGCTTTCGCCCTGATGAC
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGAATAAGTTAAGAGACTGCA
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTTATTATCTAACTTGT
L
-
G201
-56
-F
L-G201
-56
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTGATTCATCTTGATATCGATCAT
L
-
G405 -30
-F
L-G405
-30
-R
L
-
G405 -56
-F
L-G405
-56
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGGACTCCCCCTGGTGGC
L
-
G405 -77
-F
L-G405
-77
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTTCAGCGTGTGC
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGCTTTCGCCCTGATGAC
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGAATAAGTTAAGAGACTGCA
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTTATTATCTAAC
P-G221-32-F
P-G221-32-R
P
-
G201
-56
-F
P-G201
-56
-R
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTGATTCATCTTGATATCGATCAT
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
P
-
G405 -30
-F
P-G405
-30
-R
P
-
G405 -56
-F
P-G405
-56
-R
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGGACTCCCCCTGGTGGC
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTTCAGCGTGTGC
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGTCTTTCGCCCTGATGAC
P
-
G405 -77
-F
P-G405
-77
-R
pET
-
0p/L4447uw
TAATACGACTCACTATAGGG
注
5
:
L
为
L4447
载体缩写
,
P
为
pET-2p
载体缩写
Note
:
*
:
L
is
the
aUbreviation
of
L4440
vector
,
P
2-
the
adbreviaUw
of
pET
-
2p
vector
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
773
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-70CG
GA
TAAGTtcA
G
gT
c
tcGtgGt
G
GGt
GtTg
cAt
TaCgtcAAgc
GAtc
GAaGTTCA
T
AtcAT
G
A
gc
G
gc
T
c
cA
c
a
g
GA
CA
Cc
H0
160
'GAA
'GU
CA|C|
180
AT
200
220
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
I
40
jat
J
at
B
a
S
gt
j
H
cmtg
I
t
T
3
T
AT
TATAATAT
1
I
(:
ICAAGTT0
201
201
hAGTT
hAGTT
mm
A.
T
'GU
taat
I
CG
C
C
TC
'CCATGAATATACCATCTTATTCAAGGACAAC
TCTAAGACCAGi
jTGCTCATCATCTTCtAi
238
230
238
423-7OCG
i
;
C
■CG
CGC
TC
GC
hAGTT
|TGCGC|TC
TCTGCGTCCGG
TGCGCtChCCIGCjGi
:
TGCAGGGTCGTC
GA
cT
cgt
g
gc
c
T
cAacC tTaCc
agaCcaCAtGAA
g
a
G
T
T
CAAGTT
g
cA
aGa
G
260
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
423-70CG
PACTAGA
CTAATAK|AGGTGAAGTTC®®T|hTT
:
TGGTGAATCATATTGAATTGAATGAT
TAmTAACAT^
TAGTATAC1AATTGGAGTA
357
35?
GCAGGATCCCCGjAGAGGTGAAGTTCGTGGTA&ACATC!
:
AGGTGAACCTCATAGAGCTGAAGGGC
|TCJ
GCI
TGCAAGACCCGCGTCGTGGTGAAGTTCGTGGCCGTCACC
:
CGGGTGAACCGC|Tc|TGCGpAG|Tc|c
y^G|AGG?Tl
'GGCCGTCAACACCCGGGCGCGCAGGCGGGTGTG
357
360
300
MO
420
201-30CG
201-50CG
n3-30CG
CAACTAi
:
AACAATUCA
ATGTCTATATCATGATTGACAAATAGATGATCGATATCAAGATGAATCA
423
423
423
423-50CG
423-70CG
:
AATEAi
:
AACAACCTC4
AAGATTATATCAC
■GTCGCCAGGCAGAAGAACG
CCi
GGEAGTCC
CAACTGCAGCAGCCGCAGCGTCTGTATCAC
1GTCGTCAAGCGGAGGAGCG
TC
ATCAGGGCGAAAGC
图
1
不同长度
、
CG
组合的
dsgfp
片段
序列
Fig.
1
Sequeece
of
dsgfp
fragmeets
of
differeet
leegths
and
CG
cambinations
1.2.2
重组表达载体构建
1.2.2.
2
目的基因
PCR
扩增及回收
1.2.2.3
感受态细胞制备
HT119
(
DE3
)
X
代甘油超低温保存菌种以
1
:
110
圭
以人工合成的目的片段为模板,使用表
1
引
物进行
)
444
-
Wu
、
pET-2p-Wu
Q
的片段
PCR
反应
:94
c
3
mk
;
94°C
30$
、
65
30s
,
每个循环降
0.5°C
、
72°C
30
均
17
个循环
;
94°C
30x56°C
30
均
72°C
30s,
35
个循环
;
72°C6
mk
。
7
9%
琼脂糖
含四环素
(
Te/
)
-
LB
培养基
中
,
37C
250
g
离心力培养过夜
。
挑取单克隆
37°C
250
y
离心力培养
7
h
o
活化后菌液
1
:
60
在
LB
液体培养基
(
Te/
)
37°C
250
g
离心力培养
0
~3
量至
OD
为
0.
4
~0.
6
。
将菌液冰上放置
10
凝胶电泳检测
,
切下目的条带运用试剂
的构建
。
1.2.2.
3
L4449
-
Wu
与
P
ET-2P-Wu
表达载体
mis,
使温度降至
0
°C
,0-
1
mol/L
CaC/
溶液同时
放置冰上预冷
。
4C
9
10
y
离心力
6
mk
。
沉淀
中加入
5
:
1
体积预冷后
0.
1
mo/L
CaC/
溶液悬
(
11
L4449
载体与
pET
-
2p
载体线性化
)
440
载体双酶切体系为
:
6
r
L
DNA
、
2
r
L
XhoI
、
2
r
L
HkSIII
、
2
r
L
17xFast/igesi
Green
Buff-
vr^
r
L
I
HO,
总体积为
20
r
L,37
o
C
6
mk
;
浮
。
冰上放置
6
~37
增
(
,
4
七
9
000
y
离心力
10
mk
。
沉淀加入
27
:
1
体积
0.
1
mol/L
CaC/
溶液和
27
:
1
体积
37%
甘油
,
冰上放置
17
mk
o
菌体重
87C
17
mko
pET
-
2p
载体双酶切的体系为
:
6
r
L
DNA
、
2
r
L
N
o
U
悬,分装并
-80°C
保存
。
、
2
r
L
K
p
U
、
2
r
L
17xFast/igesi
724
Green
Buffer
、
、
»L
dd
比
0,
总体积为
2/
»L,37°C
5
min;84C
5
m
—
。
1%
琼月旨糖凝胶电泳
,
回收目
的
DNA
o
(
2
)
L4440
-
Fu
与
pET
-
2p
-
gfj
重组载体构
建与表达
使用
C
—
nExpressII
Ona
Step
Clon
—
p
Kit
将线
性化质粒与目的片段重组
,
反应体系为
50
r
L
重
组产物加入
62
r
L
Trans
-
T1
感受态
,
5
鱼固
体
LB
培养基
(
L440
:
氨节青霉素
AmppET
-
2
品卡那霉素
KaNW
)
37°C
过夜
。
次日挑取
单克隆
37C
250
g
离心力培养
5
h
o
运用表
1
的
引物进行菌液
PCR
验证
。
验证正确的菌液
5
62
接种于
LB
液体培养基中
(
L4444
:
AmupET
-
2
品
KaNW
)
37°C
250
y
离
心力培养
8.6
代
提取
质
进行
双
酶
切验证
,剩
送
北京华大
基因
公
司
测序
。
将验证正确的质粒转入
HT118
(
DE3
)
感受
态,涂布至
LB
固体培养基上
(
L4444
:
AmppET
-2
品
KaNW
)
37°C
倒置过夜
。
次日挑取单克隆
87%
256
a
离心力培养
5
h
o
运用表
1
引物进行
菌液
PCR
验证,保存验证成功的菌液
。
1.0.8
dsgfp
的诱导表达
将验证正确的菌液
5
1
002
接种于
LB
液体
培养基
(
L4440
:
Amp
Tet
;
pET
-
2p
:
KaNa
(
、
TeU
)
37°C
256
p
离心力活化过夜
。
以
1
:
80
接
种于
LB
液体培养基
(
L440
:
AmpTet
+
;
pET
-
2
品
KaNa
+
、
TU
)
37°C
250
p
离心力培养
8.6
U
,
加入
IPTG
溶液继续振荡培养
5
ho
取
1
mL
菌液
提取总核酸
5%
琼月旨糖电泳检测
,41X5
J
软件灰
度分析电泳条带
。
将成功诱导
dsgfj
的菌液加
56%
甘油
(
1
:
1
)
-82C
保存
。
1.2.0
体外合成
dsgfp
1.0.4.
1
DNA
模板制备
将成功诱导
PFu
的菌液
5
1
002
接种于
LB
液体培养基
(
L4440
:
Amp
+
、
TU
;
pET
-
2p
:
Ka-
NaTei
+
)
37
o
C
256
p
离心力培养
16
~
6
h
提取
质粒
。
含有
T
丿
目的引物进行
PCR
反
应
,5
5%
糖
凝胶电泳检
测
,
切下目的条带运
剂
。
表
1
1.0.
0.
0
体外转录
、
退火形成
dsbu
反
应体系为
:
NTP
Buffar
Mia
16
r
L,
Temp
lata
DNA
3
r
L
(
2.
6
Ry
)
,
T
RNA
po
—
merasa
Mia
6
53
卷
r
L,
总体积
为
20
r
L
o
37°C
温浴
4~6
代
将反
应
液于
74°C
水浴
12
m
—
,冷却至室温
。
加入
10
:
1
体积
Dnnsa
I
和
Rnnsa
A
稀释液
(
稀释
2/0
倍
)
,
37
°C
39
m
—
。
取
1
r
L
合成
dsbu
溶于
6
r
L
Nn-
cleusa
-
Frea
water,
5
5%
糖凝
胶电泳检
测
,
产物
-84C
保存
。
1.2.0
4
种方法分别提取
-440
-
Fu
和
pET-2p
-
Fu
表达
PFu
1
.0.
0.
1
Trizol
法
52mL
,
4C
7522g
离
心
5mnt
。
沉淀加入
52
:
1
体积
Trizol,
震荡
,
室温放置
5
m
—
o
加入
5
:
1
体积氯仿
,
震荡
5s,
室温放置
12
mix
,
4C
6
002
n
离心
5
m
—
o
上清加入
2
:
1
体积异
丙醇
,
颠倒
5~6
次
,
室温静置
6
m
—,
O
C
6
002
g
离心力
12
m
—
o
沉淀加入
1
:
1
体积
75%
乙
醇
4C
7
570
g
离心力
5
m
—
o
重复洗涤
、
次
。
沉淀
室温静置
5
~12
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶
解的
dsRNA
加入
12
:
1
体积稀释的
Rnnsa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37
°C
6
mP
,
-82°C
保存
。
1.0.7.0
酚氯仿法
取
56
mL
诱导菌液
,
4C
7
570
y
离心力
5
m
—
o
沉淀加入
62
:
1
体积
STE
buffer,
涡旋振荡
。
加入
、
:
1
体积苯
酚:氯
合液
(
25
:
24
)
,
涡旋
102s
。
4C
6
002
y
离
心
力
5
min,
上清加入
2
:
1
体积异
丙
醇
,
室温
16
m
—,
O
C
6
002
g
离
心
力
6
m
—
o
沉淀加入
1
:
1
体积
75%
乙醇
4C
7
570
g
离
心
力
5
m
—
o
重复洗
涤
、
次
。
沉淀室温
静置
5
~
12
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶解的
dsRNA
力
[
J
入
12
:
1
体积稀释的
Rnnsa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37°C
6
mP
,
-82°C
保存
o
1.2.
5.
3
RNA
-
eusp
提取液
52mL
的
,
4C
7522g
离心力
5
m
—
,1xPBS
清洗沉淀
。
加入
102
:
1
体积
RNA
-
easy
提取液
,
室温
6
002
p
离心力
5
mix
。
上清
加入
、
:
1
体积异丙醇
,
室温静置
6
m
—
o
室温
16
002
y
离心力
16
m
—
o
沉淀加入
1
:
体积
75%
乙醇
4C
7
502
g
离心力
5
m
—
o
重复洗涤
、
次
。
沉淀室温静置
5
~16
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶解的
dsRNA
加入
6
:
1
体积稀释的
Rnasa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37
°C
6
mP
,
-82°C
保存
。
1.0.
7.0
75%
酒精沉淀法
取
56
mL
诱导菌液
,
4C
7
570
y
离心力
5
4
期
常瑞
等
:
4
种原核表达双
链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
725
同/自沉淀加入
25
:
1
体积
75%
乙
醇
,
室
温静置
5
液
dsFu
测定浓度
,
根据提取方法损失率
,
计算
pET
-2P
、
L440
表达的
dsFu
产量
。
m
—
o
加入
4
:
1
体积
66
mmo
—
L
NaCt
溶液
,
室温
静置
60
mix,
2
°C
6
002
p
离心力
6
m
—
。
上清加
入
6
:
1
体积稀释的
Rnasa
A
和
Dnnsa
I
消
化后
,
87
°C
5
mP
,
-84°C
保存
o
1.2.6
dsFu
浓度
、
纯度讽
'J
定
1.5
数据处理
运用
Imapa
J
软件分析载体表达
dsFu
灰度
值
。
Microsoft
offica
Excel
2/6
、
SPSS
25.
0
软件对
体外合成
PFu
以及菌液提取
dsFuA
26
o
/
/
A
28
4
4
1.2.6.
1
体外合成
dsFu
浓度
、
纯度
A262/A232
值进行多重方差分析和新复极差法进行
显著性分析
。
2
样本间均数比较采用配对
T
检
取
2
r
L
dsFu
样品于
B
-
570
BIOPHOTO
METER
检测
,
用
Nncleusa
-
Free
watar
分别稀释
。
至浓度为
、
002
、
502
、
252
、
125
、
62.5
和
8
5
05
平/
r
L
并检测
A264/
A2
54
4
A262/
A
232
。
稀释
dsFu
5
5%
6
结果与分析
2.
1
IPTG
诱导基于
PET-
2
P
、
L4440
产生
dsFu
琼脂糖凝胶电泳检测
6/
V
25
m
—
o
1.0.
0.
0
菌液提取
dsFu
浓度
、
纯度
pET
-
2
品
和
L440
经
IPTG
诱导表达产生
取
2
r
L
dsFu
样本于
B
-
570
BIOPHOTO
METER
检测
,
用
Nncleusa
-
Free
watar
分别稀释
PRNA
,
经
RNase
A
消化后
5
5%
琼脂糖凝胶电泳
检测
,
pET
-
2p
-
Fu
和
L4440
-
Fu
表达载体
。
图
6
2
.
4
pET
-2P.L4440
产生
dsFu
电泳条带
至浓度为
、
002
、
502
、
252
、
125
、
62.5
和
8
5
05
平/
r
L
并检测
A264/
A2
54
4
A262/
A
/32
。
稀释
PFu
5
6%
琼脂糖凝胶电泳检测
6/
V
25
m
—
o
1.2.0
损失率检测及
dsFu
产量
研究表明
,
基于
pET
-
2P
载体表达的
5
组不
同长度
、
不同
CG
含量的
dsFu
灰度值均高于基于
L440
载体表达的
5
组
量
/
将体外合成的
5
组
PFu
分别稀释至
1
002
中
,
运用以上
2
、
不同
CG
含量的
r
L,
将
39
r
L
稀释液混合至
56
mL
未经
IPTG
dsFu
,
具有显著差异
(
P<0.05
)
。
其中
法进行提取
,
B-
pET-2p
表达
2/1
-
39CG
以及
4/8
-
39CG
灰度
570
BIXPHOTO
METER
检测浓
^4
A
26
0
/A
28
4
>
值明显高于
L440
表达
2/1
-
39CG
和
4/8
-
39CG
灰度值
。
图
8
A
260
/
A
252
。
运用最佳提取方法分别提取
1
mL
菌
D2000
201-30GC
201-50GC
423-30GC
423-50GC
423-70GC
DL5000D2000
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
423-70CG
500
250
+Rnase
A
*-Rnase
A
+Rnase
A
+Rnase
A
»Rnase
A
a
b
注:品基于
pET-4p
表达
dsFu
;
b
:
基于
L4440
表达/表品
D2600
:
分子质量标记(天根
)
其大小分别是
0
0223
22
、
752
、
502
、
252
、
100
;
DL5002
:
分子质量标记
(
TaKaRa)
,
其大小分别是
5
000
、
5
0024
0023
002
、
752
、
502
、
252
、
62
Note
:
v
:
express
dsFu
bawb
on
pET
-
0p
,
b
:
express
dsFu
bawb
on
L4447.
D2000
:
molecular mass
marker
(Tiangeu)
of
2,500,
1
,200,
756
,
502
,
256
,
102
;
DL5002
:
molecular
mass
marker
(
TaKaRa)
of
5
,
202
,3
,
202
,
2
,202
,
1
,202
,
750
,
562
,
250
,
62
图
2
基于
pET
-2p
和
L4440
表达
dpU
5
5%
琼脂糖凝胶电泳检测
Fig
・
2
Agarose
gei
electrophoresis
detection
based
dsyfu
5
6%
pET
-2p
and
L4440
eapression
706
53
卷
■
pET-2p
D
L4440
输
0
1.
a
8
6
4
■
pET-2p
D
L4440
*
e
。
u
血
-
e
u
©
J
a
l
u
g/d
6sp,
a
a
注
/
表示在
0.93
水平上差异
显著(配
对
T
检验
)o
a
:
基于
pET-4p
和
L4440
表达
201
bp
dsWp
条带灰度
;
b
:
基于
pET-4p
和
L4449
表达
445
bp
dsWp
条带灰度
;
Note
:
*
means
significant
diSeresce
at
the
0.
23
level
)
paiph
T
test),
a
:
Gray
analysis
of
21
bp
dsWp
bands
expresseh
baseh
on
pET
-
4p
and
L4449
;
b
:
Gray
analysis
of
445
bp
dsWp
bands
expresseh
baseh
on
pET
-
4p
and
L4449
图
3
基于
pET-2p
和
L4449
表达
dse
7
5
%
琼脂糖凝胶电泳条带灰度
Fig
・
3
Gey
analysis
dsge
7
5
%
agarrse
get
electrrphoresis
bands
bases
on
pET
-2p
2.
3
体外合成
dsWp
浓度
、
纯度
研究表明
,
分别梯度稀释
6
组浓度
,
每组
du/
fp
八
44
株
281
均在
7
9
〜
2.
2,
合成的
7
组
dsWp
纯度
较髙
。
稀释至
87
25
全
/
r
L
的
5
组
dsWp
稀释液
,
人
26
株
231
值均在
3.
4
-3.4
,
浓度过低
,
达到仪器检
测最
,
进行
,
出现偏差
。
其余
7
组
dsWp
稀释
。
图
4,
图
7
在
2.2
~
3.
4
。
5
组体外合成
dsWp
可以作为
标
准
注:
D2000
:
分子质量标记(天根-,
其大小分别是
2
01
、
1
01
、
750
、
51
、
250
、
60
Note
:
D20
00
:
mcVecy/s
mass
marUce
(
Tiangex
-
of
4
,
000
,
1
,
000
,
750
,
500
,
250
,
60
注
:
a
:
5
组
dsWp
稀释至不同浓度检测
A260/A200
;
b
:
5
组
dsWp
稀释至不同浓度检测
A260/A037
Note
:
a
:
five
gpups
dsWp
di/teh
to
diSerex)
cncen/atioss
A260/
A
255
detection
;
b
:
five
gropps
dsWp
di/teh
to
dikerex)
cnces/atioss
A260/
A237
detection
Fig.
2
Analysis
oO
dsge
cancentration
and
pu
UI
oO
eve
grrups
synthesfee
in
vitrr
m/egstloz
ffl
©
*
」
u
:
a.
,
&
s
p
L
・
0
z
」
p
CA
z
n
*
E
尊
a
2
a
0
201-30CG201-50CG
423-50CG
423-70CG
a
b
and
L4440
eepression
图
4
体外合成
dge
7
5
%
琼脂糖凝胶电泳检测
Fig
・
4
Detection
dsge
7
5
%
agarrse
get
eUctrophoresis
•
1
000
ng/gL
■
500
ng/piL
▲
250
ng/p.L
•
1
000
ng/ptL
■
500
ng/p.L
▲
250
ng/|iL
▼
125
ng/gL
♦
62.5
ng/piL
▼
125
ng/gL
♦
62.5
ng/p.L
O
31.25
ng/p.L
0-
O
31.25
ng/gL
a
b
图
7
体外合成
7
组
dsge
浓度
、
纯度
4
期
常瑞等
:
4
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
7
7
2.
3
4
种方法提取菌液
dsRNA
6.
2.
0
提
取基于
L4440
载体表达
dsFu
6.0.1
提
取基于
pET-2p
载体表达
dsFu
研究表明
,
根据提取
dsFu
核酸检测值
,
对
A264/A284
和
A264/A232
利用
SPSS
分别构建多重比
研究表明
,
根据提取
dsFu
核酸检测值
,
对
A262/
A
54
和
A262/
A
232
利用
SPSS
分别构建多重比
较模型
,
模型截距
(
F
=
16
2/6.
446,
P
=
2.
002
)(
F
=
526.
04
,
P
=
0.002
),
提取方法因素
(F
=
25
.
043,
P
=
2.
002
)
(F
=65
338,
P
=
2.
002
)
分别
较模型
,
模型
截
距
(
F
=
5
246.
017,
P=
2.
002
)
(
F
=
739.011
,
P
=
0.002
),
提取方法因素
(F
=
32.
320,
P=
2.
002
)
(F
=
24.
035,
P
=
2.
022
)
分别
达极显著水平
,
浓度因素分别达到显著
(
F
=
达极显著水平
,
浓度因素分别达到显著
(
F
=
2.
363,
P=
2
.
041
)
和不显著水平
(F
=2
.
227,
P
=
2.
955
)o
新复极差法显著性检验显示不同浓度
3.453,
P=0.021)
和不显著水平
(
F
=
2.
344,
P
=
2.
882
)
。
新复极差法显著性检验显示不同浓度
之间差异不显著
。
提取纯度最高的
Trizol
法和
酚
之间差异不显著
。
提取纯度最高的
Trizol
法和
酚
氯仿法
(
CK
为对照)
,
且这
两
者差异不显著
,
其次
75%
氯仿法
(
CK
为对照)
,
且这两者差异不显著
,
其次
是
75%
法
,
提取纯度最低的为
RNA
-
exy
提取液
。
图
6,
图
7
2.5
法
,
提取纯度最低的为
RNA
-
easy
提取液
。
图
6,
图
7
■
CK
1=1
Tri
1=1
Phe
a
Ale
a
rir
■
CK
口
Tri
pET-2p-gfp
L4440-gfp
pET-2p-gfp
L4440-gfp
a
b
注:数据后附不同字母者表示在
2.
05
水平上差异显著(邓肯氏新复极差法
)
;
CK
:
体外合成
;
Tri
:
Trizol
法;
Pho
:
酚氯仿法
;
Alc
:
75%
酒
精沉淀法
;RIR
:
RNA
-
小同提取液;
a
:
提取
pET-4p
和
L4447
表达/表
3
,
分别稀释至不同浓度检测
A260/A250
;
b
:
提取
pET
-
2p
和
L4447
表达
dsF
品分别稀释至不同浓度检测
A260/A239
Note
:
Those
with
diderent
letters
after
the
data
inddato
zigUVcant
diPerencos
at
Uo
2.05
level
(Duncat
new
multiple
range
method
)
;
CK
:
0-
vitro
syuthesis
;
Tri
:
Trizol
meUod
;
Phe
:
pPeuol
chloroform
mothod
;
Ale
:
75%
alcohol
precipitation
method
;
RIR
:
RNA
-
easy
extract
;
v
:
Ex
tract
pET
-
4p
and
L4447
to
express
dsFu
wd
dilute
to
diRereut
conceuUa
均
ns
to
detect
A
26
/z
7
A
28
/
;
b
:
ExUact
pET
-
4p
and
L4447
to
express
dr-
gp
and
dilute
to
diderent
conceuUa
均
ns
to
detect
A260/A
535
图
6
4
种方法提取
pET
-
2p
和
L4440
载体表达
dsyfu
纯度
Fig.
2
Purity
analysis
ot
pET
-2p
and
L444
0
vector
eapression
eatracten
by
four
methods
703
53
卷
注:
D2000
:
分子质量标记(天根-其大小分别是
2
10
、
、
10
、
750
、
51
、
250
、
60
;
a
:
酚氯仿法提取基于
pET2p
表达
d
S
Wu(
经
Dux
I
和
Rnase
A
消化
,
稀释至
500
排株)
;
:
酚氯仿法提取基于
L4449
表达
dxfp
(经
Duel
和
Rnase
A
消化
,
稀释至
500
排
/
r
L
)
eT/zl
法
提取基于
pET2p
表达
dsWp
(经
Dux
I
和
R
排均
A
消化
,
稀释至
500
排
/
r
L)
;
;
:TUzoi
法提取基于
L4449
表达
dyfu
(经
Dux
I
和
R
排均
A
消化,稀释至
500
排
/
)
r
L
Note
:
D2000
:
McOecy/r
mass
marUer
(
Tiangex
)
,
its
size
is
4,200
,
1,200
,
750
,
500
,
250
,
60
;
a
:
Phenol
-
chlorofoun
extraction
methoP
baseh on
pET2p
expression
dsgS
(
digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
di/teh
to
500
ng/
r
L)
;
b
:
Phenol
-
chlorofoun
extraction
methoP
baseh
on
L4449
to
express
dsWp
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
diluteh
to
500
ng/
r
L
)
;
c
:
T/zol
methoP
extracts
dsWp
baseh
on
pET2p
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
diluteh
to
500
ng/
r
L
)
;
d
:
TUzoi
methoP
extracts
dsWp
baseh
on
L4440
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
di/teh
to
500
ng/
r
L
)
图
7
酚氯仿法和
Trizei
法提取
50
mL
菌液表达
dsyfe
75
%
琼脂糖凝胶电泳
Fig.
2
Pheeoi
chloroform
method
and
Trizei
method
i
eatract
5
0
mL
bacteriai
solution
i
eepress
dsge
1.5
%
aaarose
get
qectrophoresis
2.5
4
种提取方法损失率
度
、
纯度最高
,
与体外合成的差异最小
,
计算提取
研究表明
2
种方法提取后的体外合成
dsWp
与提取前的体外合成
dsWp
浓度纯
明显差
(
P<
损失率分别为
07
49%
、
23.
38%
,75%
酒精沉淀
法和
RNA
-
essp
提取液提取的
dsWp
浓度
、
纯度
异
,
经
SPSS
软件分析
,
差异有统计
最低,与体外合成差异最大
,
计算提取损失
率
分别
为
32.
3%
、
37.62%
。
表
0
0.
05
)
。
其中
酚氯
仿法和
TUzoi
法提取的
dsWp
浓
表
0
9
种方法提取内标混合纯
dsyfe
浓度
、纯度
Table
0
Comparison
and
analysis
oi
the
canceetration
and
purith
oi
the
internai
standarU
miped
put
dsge
eaaadee
by
four
methods
外合成
Is
vitro
酚氯
法
Phenol
ChloroSmi
*
u
t
values
TUzoi
法
i
t
values
75%
法
RNA-eney
syy
thesis
T/zol
tau
*
75%
a/oPol
i
t
values
提
RNA-eney
extract
*
i
t
values
precipitation
*
676214±6229
浓度
(
排
/
r
L
)
A
200
y/
A
280
A260/A230
998.
72
±3.36
784.56
±5.27
39222
3280
15.96
760.77
±5.37
43290
3280
31.72
62320±622
70283
3260
17220
1.98
±0.24
4.35
±6.27
3
34
±00
1282±00
1218±00
1284±00
32334
41.99
1.35
±00
028±0207
"±00
6.34
0276±00
注:*表示在
0.
23
水平上差异显著
(配
对
T
检验-
Note
:
*
means
significant
diSeresce
at
the
0.
23
level
)
paUeh
T
test
)
4
期
常瑞等
:
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
729
2
.
3
基于
pET
-2
P
、
L4440
产生
dsFu
产量
dsFu
浓度,具有显著差异
(P<0-45
)o
基于
pET
-
2P
和
L440
表达载体
1
mL
研究表明
,
基于
pET-
2P
载体表达
5
组不同
产
长度
、
不同
CG
含量的
PFu
浓度均高于基于
L4442
表达
5
组
1
生
3
6
~24.
39
R
y
、
5.
43
~22.
47
R
y
dsFu
。
图
3
、
CG
含
的
■
pET-2p
口
L4440
盘
.
30-1
5-
6
U
800-1
f"
600-
匸
Mb
400-
M
h
■
pET-2p
■
口
L4440
注
:
*
表示在
2.
05
水平上差异显著(配对
F
检验
)
;
v
:
酚氯仿法提取基于
pET-2p
和
L4447
表达
dsFu
浓度
;
:
基于
pET
-
4p
和
L4447
表达
dwl
产量
Note
:
*
means
WgU
小
ant
PRereuce
at
the
2.
05
level
(
paireb
T
test)
;
v
:
Phenol
chloroform
extraction
method
baseb
on
pET
-
4p
and
L4447
express
dsFu
conceuUatUn
;
b
:
Baseb
on
pET
-
4p
and
L444
2
express
dsFu
yield
Fig
・
2
Analysis
ot
the
concentration
and
yielU
ot
dsyfu
eatracten
from
1
mL
bacteriai
solution
by
phenoi
一
chlooUvm
method
uo
e
lueouooJli
/6U^*"
200-
图
3
酚氯仿法提取
1
mL
菌液
dsyfu
浓度及产量
3
讨论
邹晓蕾
、
Eb
每
以及
Tyagl
等
4/
-
10
]
均报道了提
取细菌总
RNA
的方法
,
主要包括
Trizol
法
,
酚
氯
提取
pET-2p
和
L440
表达的
dsFu,
检测核酸浓
度
,
发现
2
个载体表达的
428
-39CG
明显高于其
他
4
组
,
说明
pET
-2p
和
L440
均具有较强的表
达能力
。
通过浓度分析,根据提取损失率计算
1
mL
菌液
dsFu
产量
,
发现基于
pET
-
2p
产生的
5
仿法以及部分市售
RNA
快速提取试剂盒
。
其中
Trizol
法在细菌总
RNA
提取中使用较为普
遍
,
利
组
dsFu
产量均高于
L4440
产生的
5
组
dsFu
产
量
,
最高可达
24.
39
Rp/mL'
p
ET
-2p
可作为
dsFu
用异硫氧酸弧等物质迅速裂解细胞
,
同时抑制核
酸酶的活性
,
保持
RNA
的完整性,氯仿使
RNA
溶
的相对最优表达
2
。
相
,
从
蛋白等物质相分离,为提取细菌总
提取
、
纯化原核表达
dsRNA
对于真核生物来
说
,
难度更大
,
尚无成熟方法借鉴
[
24
]
,研究采用
4
RNA
的
首
选方法
43
]
。
苯酚
-
氯
提也是提取
细菌总
RNA
常用方法之一
,
利用酚反复抽提使蛋
白质变性
,
SDS
(
十二浣基磺酸钠
)
使细胞裂解
,
种常用提取细菌总
RNA
的方法
,
试图通过提取完
整纯净的总
RNA,
经
Rnasa
A
、
Dtse
I
消化得到
入
氯
仿分层
,
获得含总
RNA
的水相
49
]
。
市售总
RNA
提取试剂盒成本较高
、
使用次数有限
,
不适
纯净的
dsRNA
。
Trizol
法和酚氯仿提取细菌总
RNA,
经
Rnasa
I
消化后
,
稀释核酸检测
A
10/
A
10
4
A264/
A
432
,
均值分别为
5
77
4
5
83
和
用于大量提取检测
,
故未选用进行
。
表
明
,
以体外合成
PFu
为对照
CK,
通过使用
Trizol
法和酚
氯
法
高
提
细
总
RNA
,
Rnasa
A
与
Dnnsa
I
消化后
,
可得到较为纯净的
1.74
、
2.
1,
与体外合成
dsRNA
值差异最
、
。
但
1-3%
糖凝胶电泳检测后
,
稀释至不同浓度的
dsFu
条带均出现不同程度弥散
,
无法得到清晰电
dsFu,
损失率最低
。
RNA
-
eusp
提取液和
75%
酒
泳图
,
可能存在以下原因
:
原核诱导表达的
dsFu
脆弱
,
使用有机溶剂以及提取过程中反复高速离
心损伤
dsFu
;
核酸检测稀释时间过长
,dsFu
在自
法提
率明显低于前者,不适用于快速
1mL
提取细菌总
RNA
以及
dsFu
。
与前人的研究结果
基本一
。
酚
氯
法,分
然环境下发生降解
;
电泳液含有核酸酶
。
712
4
结论
通过
酚
氯仿法提取
2
种载体表达
dsF
品
检测
发现
随
着目的片段
CG
含
,
1
表达的
PFU
浓度及其产
渐降低
。
pET
-
2p
载体
表达能力高于
L4440
载体
,
uET-2p
可作为
dsFu
的相对最优表达载体
。
为
PFu
在不同环境
降解程
以及
产物分析提供了技术
支
。
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Leptiptarso
UeceuUa-
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by
RNA
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sipnaPp
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素廿小种平
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Lepiboptem
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successful
and
uuuccessPl
stud
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experimeutal
desigy
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Joupal
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B.
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Joueol
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InveXebetc
Pahofpy
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68
-
74.
[6
]
Ivashuta
S
,
Zhang
Yji
:
Wiggins
BE,)
al.
Environ
mental
RNAi
in
herbivorous
insects
[
J
].
RNA
(
Neo
Yor0
,
N.
Y.
')
,
2013
:
41
(5)
:
840
-856.
[7
]
Z
-
Feng
Shi
:
Jia
Fu
,
Li
-
Li
Mu,
c)
al.
Two
Leptipta/o
uridine
dipPwpPaU
N
-
ace
均
—
ucosamine
pyropPospUoryl
a
scr
are
spe
cialized
for
chitin
syuthesis
in
larval
epidermal
cuticle
and
midgut
peritrophic
matox
[
J
].
Irged
BiocUeuiap
and
Molecular
Biolo
gy
,466
,68.
J
]
Li
Xiaoxxc
:
Zhang
Mingy
an
,
Zhang
Hodgyu.
RNA
—
素廿小种平
of
four
veuer
in
adul)
Bmdocem
dopPP
by
feebing
their
dsRNAs
[J].
Pfb
0/2211,6(3)
:
1
-11.
[9]
Baum
J
A
,
Bogaeri
T
,
Clinton
W,et
al.
Control
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coleopteray
in
sect
pesU
throuah
RNA
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J
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OdtecOrndgy
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卷
2007,
(11)
:
1824-1846.
[12]
Koch
A,Kcpei
K
H.
Nex
wind
in
the
sails
:
improving
the
agro
nomic
value
of
crop
p
—
nU
throuah
RNA
、
-
mediaUd
xene
siPn-
cing[
J
].
Plant
BdPcOplopy
Jourual
,
226,12
(
7
)
:
821
-
831.
35
吴沛桥
,
巴晓革
,
胡海
,
等•绿色荧光蛋白
GFP
的研究进展及
应用
J].
生物医学工程研究
2029
28(1)
:
83
-86.
WU
Peiqivo
:
BA
Xiaogo,
HU
Hvi
:
et
al.
Research
progress
and
app/caCon
of
green
Juoresceut
protein
GFP
J
].
BdfeOaxl
E
p
gmeegp
Reseo/U
,2705,28(1)
:
83
-
86.
32]Juvder
BE,
Welch
J
,
Braiby
N
,3"
k.
CcwsOuc
均
n
and
use
of
a
Cuggpibm
sncPor
H16
so
—
Ulc
hyUrooeuase
promoter
(
P4H
)
fusion
to
Fu
(green
Juoresceut protein)
[J].
Peep,
226,4
(7)
:
X269.
[6
]
C
—
rk
Grznarova
P
,
Stansell
E
,
et
al.
A Mason
-
Pfizer
Monkey
Virus
Gag
-
GFP
Fusion
Vector
Allows
Visualization
of
Capsid
Transport
in
Live
Cells
and
Demonstrates
a
Role
for
MProtuPulcs
J].
Plus
O/
,
2013,
8.
[
6
]
邵美丽
,
郭瑞雪
,
韩秀英
,
等•趋磁细菌
RNA
提取方法的比较
研究
[
J]
.
安徽农业科学
265
,1
(5)
:
3680
-
5681,
5743.
SHAO
Meili
,
GUO
Ruixxc
,
HAN
Xiuying
,
e)
al.
Comparative
study
on
RNA
extraction
methoPr
of
bacteria
J]
.
AnPU
AgbcU-
tuel
Sae/es
:
2013
,
41(18)
:
5280
-
5681,
5743.
[6]
邹晓蕾
,
刘礼崔,罗立新•细菌总
RNA
提取方法的比较
[J].
现代食品科技
,225,29(8)
:
1048
-1654.
ZOU
Xiaolei
,
LIE
Licui
,
LUO
Lixin.
Comparison
of
extraction
meUods
of
bacterial
total
RNA
[
J
].
Mo
bee
Foob
Sdeyce
and
TuPpfpy,
225,29(
8)
:
1048
-1654.
[6
]
Deep-i
Tyagp
Autumn
L.
Rolation
of
Bacterial
RNA
from
Foods
Inoculateb
with
Patdogeu
[
J
].
Methobs
in
molecular
biology
(Clpou,
N.
J.
)
,466,195.
[17
]
Villa
-
Rodriguez
E
,
Ibarra
-
Gamea
C
,
do
lor
Santos
-
Villalo
bos
S.
Extraction
of
high
-
qualip
RNA
from
Bacil
—
r
suPtilis
with
a
lysozyme
pre
-
treatment
followeb
by
Uo
Trizol
method
J]
.
Joueol
of
Microbdlopicol
Methobs
,225.67.
[18]
Rio
D
C
Arcs
M
,
Hannon
G
J,et
al.
Purification
of
RNA
using
TRIzol
(
TRI
reagey))
[
J].
Cold
Spring
HmOor
p/Pcob
:
2010
,
(6)
:
pdb.
uroU439.
[6]
Chomczyuki
P,
Sacchi
N.
Single
-
step
method
of
RNA
isolation
by
acid
guanibinium
thiocyanate
-
pPeuol
-
chloroform
extraction
J].
1987,164(1)
:
186
-185.
[22]NwWepi
A
0,
Kung
A
W,
Kilby
P
M
,
c)
al.
Puri/cation
and
characterisation
of
dsRNA
using
ion
pair
reverse
pPase
chromv-
toeranPy
and
mass
spectrometry
[
J
].
Joueol
g
Ch/mPopmphy
A,
2017,
1484
:
14-25.
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
711
Comparativv
Study
on
the
Effed
of
4
kind
oO
dsRNA
Extraction
Methods
form
Prakaraytic
Expression
Double
-
$501
x
10
RNA
CHANG
RuU
,
WANG
Jus
2
,
FU
Kaiyys
5
,
LIAO
Lanins
5
,
DING
Xindss
5
,
HE
Jiany
5
,
GUO
Wex
每
av
2
,
Top/ps
AhemaP
,
REN
Yu
3
(7
Collepo
eg
Life
nnd
Geographie
Scieccos
,
KuPi
UnwersPR
,
KuPt
XiUinng
344906,
ChUa
;
0
.
Plant
Protection
Station
og
Xifiang
Uygun
Autonomous
Repion
,
Urumqi
332049
,
CCUa
;
8
.
Kop
Laboratorp
og
Ings-
graPeC
Manpunci
of
Harnfri
Crop
Vermin
of
CCUn
NortUwestern
Oasis,
Mfgpp
ug
ApPculturo
SgPUte
og
Plant
Protection
,
Xifing
PcuPemy
og
Apraultural
S
100X0
,
Ummqi
530091,
CCUa
,
MOARP
/
;
9
.
Xifiang
Kop
Laboratorp
og
Speciai
EuironmeUai
Mhmbflogy/IuUUe
of
AppPeC
Mhrobflopy
,
Xifiang
PcuPeuy
og
Apri-
culturai
Scfncos
,
Ummqi
530091
,
CCUa
-
Abstract
:
8
Objective
t
Pronamotlc
expression
of
dsRNA
hus
u
wiba
ranya
of
potextiai
示
p/ctions
is
ths
field
of
pul
cXpO
[
Methods
)
Usky
pET
-2p
and
L4440
ns
vectorscons/uci
five
yronus
of
Wu
一
201
-
37CG,
Wu
-201
-50
-
CG,
Wu
-423
-
30CG
,
Wu
-423
-
50CG
and
Wu
-423
-
77CG
of
differexi
/syth
and
diheresi
CG
contesi
ns
ths
tarpei
fraymesis
of
dsWp
expression
,
TUzoi
methoP
,
phesoi
ch/rofoun
mUh-
oP
,
RNA
一平均
extraction
solution
and
75%
PcoPol
precipitation
methoP
tv
extraci
lmi
and
50
mL
of
dsWp
induceS
by
isopropylthiv
-
0
-
D
-
qa/ctosiba
(IPTG)
is
bacteUai
solution
,
up
均
t/Sy
Nuc/lc
scib
detec
tion
A264/A
2
51
,
A264/A
231
compare
tha
piiUty
,
with
is
vitra
syythesis
of
PsgpD
ns
s
control
,
tv
evaluaiv
tha
平-
traction
均
小
Sscy
of
tha
fone
mathoPs
and
tha
expression
示
ility
of
tha
too
eCop
dspp.
【
ResylUg
Tha
fone
extraction
methoPs
were
ana/zeh
by
mu/ipiv
vaUasca
示
Pysis.
Amony
them
,
tha
TUzoi
methoP
and
tha
pPv-
soi
-
ch/roSrm
methoP
A264/A284
示
X
A264/A234
with
tha
highesi
ex/scFon
piiUty
1
■平每不
1.38
and
1.79
p-
spective/
;
1.73
and
9.
3
,
psp
均
t/Sy
,
ha
loss
rata
wss
23.
38%
,
21.
44%
.
Followeh
by
tha
75%
a/oPol
precipitation
methoP
,
tha
sveraya
valuvs
of
A264/A
254
and
A
16
1/
A434
can
reach
:
1.3
,
1.73
,
and
tha
loss
rata
s
37.
3%
3
Tha
/wu)
extraction
piiUty
is
s
tha
RNA
一
平均
extract
,
whose
sveraya
valuvs
of
A264/A
254
and
A264/
A234
can
reach
1.70
and
1.70
,
and
tha
loss
rata
is
s
37.
62%
.
Usinq
tha
methoP
of
mixkq
pure
dsRNA
with
intepai
standarU
,
it
wss
calcalated
thsi
par
mil/Utee
of
pET
-2P
and
L4449
expression
veetve
inSuceS
bacte
ria/
/quip
can
feunesi
tv
uroPuco
3.7
-24.
39
Ry
and
7.
45
-22.
4
Ry
dspp.
Usinq
intepai
standarU
mixeh
pure
dsRNA
methoP
,
tha
feunestation
of
pET
-
2P
and
L4449
expression
veetve
kSuceh
bacteUx
solution
wss
calch/teP
tv
uroPuco
3.7
-24.
39
Ry
7.
45
-22.
47
Ry
dspp.
par
md
【
Conclusion
]
F
ops
methoPs
量
nseh
tv
extract
dspp
expresseh
by
pET
-
2p
and
L4449
Tha
ha
pOenoi
chlorofoun
methoP
can
ba
ns
不
tv
quichiy
平-
traci
high
-
qualitp
and
high
一
piiUty
oroParyotic
dsgpDquShiy
pET
-
2p
is
tha
optisai
expression
of
dspp
ha
carUve
proviSgs
technicai
suppo/
S
s
tha
subs
不
n
不
i
study
of
tha
UepraSadon
deprev
of
dspp
is
diUereni
envi
ronments
and
tha
analysis
of
UepraSation
p
量
nncts.
Key
words
:
oronamotlc;
doup/
-
strandeh
RNA
;
ex/scFon
;
UepraSation
Fund
project
:
Usovation
esvironmest(
tales)
,
base)
cnstruction
projection
is
Xinjiang
(
a/s)
project
-
Tianshas
cehar
project)
)2018XS36)
;
Key
cal/vation
projects
of
scientific
and
tech
排
/gicai
insovadon
of
Xinjiang
Acahemy
of
Ag/ca/u
量
Sciences"
Monitoring
and
Ea/y
Warning
and
ComppSessive
Prevention
and
Control
of
Major
and
Neu/
IsvaPeh
AgUcatu
量
and
Forestp
Pests
is
Xinjiang"
(xjhcpy
-002)
Corpspo
全
esce
aut
hos
:
3•
UO
Wexchao
(
666
-
-
,
mate
,
bore
is
Hehei,
P
p
O
ssos
,
d
octo
rat
supemisos,
Research
direction
:
Integrates
manage-
mestof
AgUcatu
量
invasive
pests
:
(
E
-
mait)
增
c666@
63.
cm
FU
Kaiyys
(1987
-
-
,
mate
,
bore
is
Zhejiang
,
Post
-
doctora/
a)
Post
-
doctora/
MoPiie
Station
of
Xinjiang
AgUca/urai
U-
niversity/
Pos
-
thocto
量
WorUstation
of
Xinjiang
Acahemy
of
Ag/ca/u
量
Sciences
:
Professor
associate
,
Research
direc
tion
:
Integrates
managemes)
of
Ag/caturai
invasive
pests
,
(
E
-
)
fukaiyu
排
7
@
63.
cm
2024年4月6日发(作者:漆学)
新疆农业科学
2001,53(4)
:
700
-7H
Xinjiany
AgUca/urai
Sciescas
doi
/
41
6448/j.
isx.
641
-
4334.
Hl.
44.413
4
种
RNA
的
dsRNA
提取方法
果评价
常瑞
3
王
俊
2
,
付开*
5
,
廖兰兰
5
,
丁新华
5
,
何
江
5
,
郭文超
4
,
吐尔逊•阿合买提
5
,
任羽
1
(1
.喀什大学生命与地理科学学
3,
新疆喀什
844006
;
2.
新疆农业农村厅植物保护
O
,
鸟鲁木齐
830049
;
5.
新疆农业科学
3
植物保护研究所/
农业部西北荒漠化绿
{
作物有害生物综合洽理
E
点实验
I,
鸟鲁木齐
830091
;
4.
新疆农业科学
3
微生物
{用研究所
/
新疆特殊环境微生
GE
点实验
I,
鸟鲁木齐
836691
)
摘
要
:
【
目的
】
构建表达不同片段长度和
GC
含量的
dseWp
片段
,
比较
4
种
dsRNA
提取方法,获得最佳的提
取方
法
以及dsRNA
相对
最优
的表达载体
,
为
dsRNA
的降解研究提
供
基础
。
【
方法
】
4
pET-2p
和
L4444
为载
体
,
分别构建
5
组不同长度
、
不同
CG
含量的
Op
-241
-34CG
、
Wp
-241
-54
-
CG
、
Wp
-423
-
32CG
、
gfp
-423
-54CG
和
Wp-403
-74CG
为目的片段的
dsWp
表达载体
,
运用
T/zoi
法
、
酚
氯仿
法
、
RNA-
不均提取液以及
75%
酒精沉淀法分别提取
1
和
54
mL
经异丙基硫代
-
0
-
D
-
半乳糖
3(
(
PTG)
诱导菌液表达的
dsWu,
核酸检
测
A
4o/
A
4o
、
A
4o/
A
o/
比较纯度,
以体外合成
dsWp
为对照
,
评价
4
种方法提取效率及
2
种载体
dsWp
表达能
力
。
【
结果
4
种提取方法经多重方差分析,
其中提取纯度最高的是
TUzoi
法和酚氯仿法
A
2
00/
/
A
28
7-,A
2
00/
/
A
0
3
0
均
值分别可达
7
83
、
/
97;
7
78
、
2.
1,
损失率分别为
23.
83%
H
24%
。
其次是
75%
酒精沉淀法
A
2
00/
/
A
28
0
,
A
26
0/
(
A
56
均值可达
78,7
78,
损失率为
36.
8%
o
提取纯度最低的为
RNA
-
平均提取液
,
其
A
26
0/
/
A
28
9
A
26
0/
/
A
0
3
7
均值
可达
7
56
、
7
56,
损
失率
为
371
60%
。
利用内标混合
纯
dsRNA
的方
法
,
计
算获得每毫
升
pET-2P
和
L4444
表
,
达载体诱导菌液可发酵产生
&7~24.39
R
g
、
7.28~22.47
R
g
dsWp
。
【
结论
】
提取
pET-2p
和
L4444
表达的
-W
p
,
其中酚氯仿法可用于快速提取高质量
、
高
纯
度原核表达的
dsWp,pET
-2p
为
ds/u
最优表达载体
。
关键词
原核;双链
RNA
;
提取;降解
中图分类号:
S188
文献标识码:
A
文章编号
:
641
-
4336
(2401)44
-
4744
-
17
4
引言
【
研究意义
】
马铃薯甲虫
(
LeptUotara
decem-
Puata
Sna
专一性
、
安全性强
,
且植物生
响
,
对
挖
掘更多生物防
要
[
]
。
但
dsRNA
生产成本高
、
产量无法预测
、
稳定性低
。
)
是马铃
性害虫
。
持续化学防治
【
前
进展
]
dsRNA
在环境中极
定
,
自然
。
并且其
使马铃
虫对部分拟除虫
、
氨基甲酸酯
、
有
机磷
、
新
类和微生物杀虫剂产生了抗性
[
]
。
下
3
~7
h
就
NA
在紫外
;
示
等
[
]
发现
dsR-
下
,4h
就
系统
,
植物
使用
RNAi
技术,喂食马铃薯甲虫涂抹
dsRNA
的
铃薯叶片
2
低
、
沉默马铃
机制
、
扩增
虫特定基
-RNA
以及有害生物对
RNAi
敏感性差别大等因
因表达
,
抑制马
铃
虫的正常生
,
具有高
素⑷
。
目前
,
dsRNA
主要通过
3
个方法大量生
收稿日期
(Receives)
:
2020
-
11
-47
基金项目
:
勺治区创新环境(人才、
基地)建设专项(人才专项计划
-
天山雪松计划
)(
218XS36
)
新疆农业科学院科技创新重点培育专
项
“
新疆重大新发农林入侵生物监测预警与综合防控
”
(XU
cp
-002
)
作者简介
:
常瑞
(693
--
,
男
,
新疆人
,
硕士研究生
,
研究方向为资源微生物开发与利用
,(E-maii)
;
cyagpSS
@0
x
111.
cm
通信作者
:
文超
(
666-
)
男,
可北人
,
研究员
,
博士生导师
,
研究方向为农业害虫综合防治
,
E-mUi)
增
**********
付开赞
(
1987
-
-
,
男
,
浙江人
,
助理研究员
,
在站博士后
,
研究方向为昆虫生理生化与分子生物学
,
E-maii)fuUaiyyuC7@
65
2
anm
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
771
产:一是合成含有
T3
启动子的
-RNA
特异性引
物
2
外合成试剂盒合成
dsRNA
S4]
。
二是
原核生物
生产
-RNA,
最早用于干扰秀丽引
线虫
,
喂食
引线虫时可产生强烈干扰
。
将构
建完成的
-RNA
表达载体导入
RNase
III
缺陷型
大肠杆菌
HT115
(
DE3
-感受态中
,
经异丙基硫代
-0
-D
-
半乳糖
3
(
ITG
)
诱导
,
产生
dsR-
NA
[
2,
]
。
过转基因植物表达
dsRNA
,
使植
物具有
“
终生
”
防御性
,
害虫啃食植物后
2
次
抑制其生
死亡
,
无
为干
预
[
,1
。
【
本
切入点
】
方法可大量合成
-R-
NA,
快速高效
,
合成
dsRNA
可直接使用,但体外
合成试剂盒成本较高
,
实际大规模推广使
切
际
。
方法
得到大量
-RNA,
且成本较
低
。
但
、
诱导过程中
,
如何保
高活
性
、
持续产生
-RNA,
仍需有待研究
。
针对
RNAi
的特异性以及原
获得
-RNA
良好的应用
前景
,
以
pET-2p
和
)
444
为载体发酵产生
dsR-
NA
的
法为基础
。
筛选
4
种提
取菌液总
RNA
方法以提高菌液
-RNA
的获取
率
。
【
拟解决的关键问题
】
利用
720
bp
-
荧光
蛋白
Wu
[1_I5
]
为模板
,
分别随机改变碱基改变
GC
含量,并构建
5
组
组合的
-增
0
片段
:
201
bp
长度的
30%
CG
含量的
dsWp
(
简称
201
-
37CG
,
下同
)
,201
-
50CG
、
423
-
37CG
、
423
-
50CG
、
423
-72CG
。
运用试剂盒体外合成以上
7
种
dpf,
检测其浓度
、
纯
为
标准
。
将以
上
6
组表达
原
,
运用
TUzoi
法
、
酚
氯仿法
、
RNA-
平均
提取液
、
以及
75%
酒精沉淀
法
分另
U
提取
―增小
。
建立菌液表达
dsRNA
的最佳
提
法以及最优表达
提供理论支持
。
1
材料与方法
1
2
材料
1.1.1
载体
pET
-2p
、
L449
质粒实验室保存
。
1.1.6
菌株
大肠杆菌
HT115
(
DE3
-菌株购自上海唯地生
物技术有限公司
,
培养至二代菌株由该实验室保
。
1.1.3
主要试剂及仪器
试剂:
Truss
-
T1
感受态细胞
、
2xEasy
Taq
PCR
Supee
MS
(
全式金
)
;
琼脂糖
(
西班牙
)
;
LB
broth
(
MDBia
,
Ise
-;
卡那霉素
(
Kans
-
、
四环素
(
Tel
)
、
氨节青霉素
(
Amp
)
、
I
PTG
粉末
;
苯酚:氯仿
合液
(
20
:
24
)
等
(
SolarUia
-
;
质
提试剂盒
、
琼脂糖凝胶
剂盒
(
OMEGA
-
;
Hibcribe™T
2
High
Yield
RNA
Syythesis
Kii
(
NEB
-;限制性内切
酶
EcoRS
、
NotO
、
HUgA
i
、
XhoU
(
Thermo
-
;
ClosEx-
pressI
I
Osa
Step
Closinq
Kit
、
RNA
-
essp
提取液
(
Vazyme
)
;
TUzoi
Reaqest
(
ambios
-
;
焦炭酸二乙酯
(
DEPC
2
Sshap
)
;
异丙醇
、
无水乙醇均为分析纯
;
D
全
se-/R
全
se
-
0
平
离心管
、
移液器枪头
(
BU
o/pix
)
。
:离心机
(
湘立
TGL6M
)
;
PCR
仪
(
ICy-
cliny
96
梯度-
;
摇床
(
TASITEDY
-200B
-
;
电热恒
温干燥箱
(
TASITE299
-1AB
)
;
水浴锅
(
BATHS
-
;
核酸电泳系统
(
北京六一
DYY-6D
);
凝胶成像
系统
(
Wealtac
Dolphin
)
D
)
;
B
-
500
BIUPHOTO
METER
(
METASH
-
;
-87°C
冰箱
(
Thermo
ULTS1873
-
;
超净工作台
(
江苏通净
VD
-650
-
;
超纯水机
(
青岛富勒姆
FBZ0502
-
SUP
)
。
1.3
方法
1.2.3
dsfC
基因
、
引物合成
以来自于
720
bpWu
的序列为模板
,
对其基因
进行设计优化
,
随
变碱基
CG
含量
,
交由南京
金
斯
瑞生物科技有限公司完成基因合成
。
合
成了
7
组不同长度组合的―增小片段
:
2
01
bp
长度
的
37%
CG
含量的
dsWp
(
简称
201
-
37CG
,
下
同
)、
201
-50CG
、
423
-30CG
、
423
-50CG
、
423
-
77CG
。
以
T
2
启动子为起始序列设计
、
合成引物
,
用于体外合成
―增小
。
以
XhoI
、
HUidIII
(
L4444
)
和
KpU
、
Nof
(
4hT
-20-
为双酶切位点设计
、
合成引
物
,
用于构建
)
444
-
增
0
和
pET
-2p
-
Wu
表达
载体
。
表
3
图
1
722
53
卷
表
、
用于
dsRNA
合成
、
载体
构建引物序列
Table
1
POmer
Ur
dsRNA
synthesis
and
化<^
00
111
x
1:01
引
物
Prinmes
T7-G221-32-F
T7-G221-32-R
T
-
G201
-56
-F
序
列
(5tW
J
)
Sequences
(5
toO
5
TAATACGACTCACTATAGGGAATAAGTTAAGAGACTGCA
TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTTATTATCTAAC
TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
T
-G201
-56
-R
T
-G425
-30
-F
TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
TAATACGACTCACTATAGGTGATTCATCTTGATATCGATCAT
T-G425
-30
-R
T
-G425
-56
-F
TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
TAATACGACTCACTATAGGGGACTCCCCCTGGTGGC
TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTTCAGCGTGTGC
T-G425
-56
-R
T
-G425
-77
-F
T-G425
-77
-R
L-G201
-30
-F
*
L-G221-32-R
TAATACGACTCACTATAGGGCTTTCGCCCTGATGAC
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGAATAAGTTAAGAGACTGCA
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTTATTATCTAACTTGT
L
-
G201
-56
-F
L-G201
-56
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTGATTCATCTTGATATCGATCAT
L
-
G405 -30
-F
L-G405
-30
-R
L
-
G405 -56
-F
L-G405
-56
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGGACTCCCCCTGGTGGC
L
-
G405 -77
-F
L-G405
-77
-R
GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTTCAGCGTGTGC
GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGCTTTCGCCCTGATGAC
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGAATAAGTTAAGAGACTGCA
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTTATTATCTAAC
P-G221-32-F
P-G221-32-R
P
-
G201
-56
-F
P-G201
-56
-R
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTGCAGAGAGTGCG
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAATGTGTCATATG
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTGATTCATCTTGATATCGATCAT
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG
P
-
G405 -30
-F
P-G405
-30
-R
P
-
G405 -56
-F
P-G405
-56
-R
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGGACTCCCCCTGGTGGC
CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTTCAGCGTGTGC
AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGTCTTTCGCCCTGATGAC
P
-
G405 -77
-F
P-G405
-77
-R
pET
-
0p/L4447uw
TAATACGACTCACTATAGGG
注
5
:
L
为
L4447
载体缩写
,
P
为
pET-2p
载体缩写
Note
:
*
:
L
is
the
aUbreviation
of
L4440
vector
,
P
2-
the
adbreviaUw
of
pET
-
2p
vector
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
773
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-70CG
GA
TAAGTtcA
G
gT
c
tcGtgGt
G
GGt
GtTg
cAt
TaCgtcAAgc
GAtc
GAaGTTCA
T
AtcAT
G
A
gc
G
gc
T
c
cA
c
a
g
GA
CA
Cc
H0
160
'GAA
'GU
CA|C|
180
AT
200
220
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
I
40
jat
J
at
B
a
S
gt
j
H
cmtg
I
t
T
3
T
AT
TATAATAT
1
I
(:
ICAAGTT0
201
201
hAGTT
hAGTT
mm
A.
T
'GU
taat
I
CG
C
C
TC
'CCATGAATATACCATCTTATTCAAGGACAAC
TCTAAGACCAGi
jTGCTCATCATCTTCtAi
238
230
238
423-7OCG
i
;
C
■CG
CGC
TC
GC
hAGTT
|TGCGC|TC
TCTGCGTCCGG
TGCGCtChCCIGCjGi
:
TGCAGGGTCGTC
GA
cT
cgt
g
gc
c
T
cAacC tTaCc
agaCcaCAtGAA
g
a
G
T
T
CAAGTT
g
cA
aGa
G
260
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
423-70CG
PACTAGA
CTAATAK|AGGTGAAGTTC®®T|hTT
:
TGGTGAATCATATTGAATTGAATGAT
TAmTAACAT^
TAGTATAC1AATTGGAGTA
357
35?
GCAGGATCCCCGjAGAGGTGAAGTTCGTGGTA&ACATC!
:
AGGTGAACCTCATAGAGCTGAAGGGC
|TCJ
GCI
TGCAAGACCCGCGTCGTGGTGAAGTTCGTGGCCGTCACC
:
CGGGTGAACCGC|Tc|TGCGpAG|Tc|c
y^G|AGG?Tl
'GGCCGTCAACACCCGGGCGCGCAGGCGGGTGTG
357
360
300
MO
420
201-30CG
201-50CG
n3-30CG
CAACTAi
:
AACAATUCA
ATGTCTATATCATGATTGACAAATAGATGATCGATATCAAGATGAATCA
423
423
423
423-50CG
423-70CG
:
AATEAi
:
AACAACCTC4
AAGATTATATCAC
■GTCGCCAGGCAGAAGAACG
CCi
GGEAGTCC
CAACTGCAGCAGCCGCAGCGTCTGTATCAC
1GTCGTCAAGCGGAGGAGCG
TC
ATCAGGGCGAAAGC
图
1
不同长度
、
CG
组合的
dsgfp
片段
序列
Fig.
1
Sequeece
of
dsgfp
fragmeets
of
differeet
leegths
and
CG
cambinations
1.2.2
重组表达载体构建
1.2.2.
2
目的基因
PCR
扩增及回收
1.2.2.3
感受态细胞制备
HT119
(
DE3
)
X
代甘油超低温保存菌种以
1
:
110
圭
以人工合成的目的片段为模板,使用表
1
引
物进行
)
444
-
Wu
、
pET-2p-Wu
Q
的片段
PCR
反应
:94
c
3
mk
;
94°C
30$
、
65
30s
,
每个循环降
0.5°C
、
72°C
30
均
17
个循环
;
94°C
30x56°C
30
均
72°C
30s,
35
个循环
;
72°C6
mk
。
7
9%
琼脂糖
含四环素
(
Te/
)
-
LB
培养基
中
,
37C
250
g
离心力培养过夜
。
挑取单克隆
37°C
250
y
离心力培养
7
h
o
活化后菌液
1
:
60
在
LB
液体培养基
(
Te/
)
37°C
250
g
离心力培养
0
~3
量至
OD
为
0.
4
~0.
6
。
将菌液冰上放置
10
凝胶电泳检测
,
切下目的条带运用试剂
的构建
。
1.2.2.
3
L4449
-
Wu
与
P
ET-2P-Wu
表达载体
mis,
使温度降至
0
°C
,0-
1
mol/L
CaC/
溶液同时
放置冰上预冷
。
4C
9
10
y
离心力
6
mk
。
沉淀
中加入
5
:
1
体积预冷后
0.
1
mo/L
CaC/
溶液悬
(
11
L4449
载体与
pET
-
2p
载体线性化
)
440
载体双酶切体系为
:
6
r
L
DNA
、
2
r
L
XhoI
、
2
r
L
HkSIII
、
2
r
L
17xFast/igesi
Green
Buff-
vr^
r
L
I
HO,
总体积为
20
r
L,37
o
C
6
mk
;
浮
。
冰上放置
6
~37
增
(
,
4
七
9
000
y
离心力
10
mk
。
沉淀加入
27
:
1
体积
0.
1
mol/L
CaC/
溶液和
27
:
1
体积
37%
甘油
,
冰上放置
17
mk
o
菌体重
87C
17
mko
pET
-
2p
载体双酶切的体系为
:
6
r
L
DNA
、
2
r
L
N
o
U
悬,分装并
-80°C
保存
。
、
2
r
L
K
p
U
、
2
r
L
17xFast/igesi
724
Green
Buffer
、
、
»L
dd
比
0,
总体积为
2/
»L,37°C
5
min;84C
5
m
—
。
1%
琼月旨糖凝胶电泳
,
回收目
的
DNA
o
(
2
)
L4440
-
Fu
与
pET
-
2p
-
gfj
重组载体构
建与表达
使用
C
—
nExpressII
Ona
Step
Clon
—
p
Kit
将线
性化质粒与目的片段重组
,
反应体系为
50
r
L
重
组产物加入
62
r
L
Trans
-
T1
感受态
,
5
鱼固
体
LB
培养基
(
L440
:
氨节青霉素
AmppET
-
2
品卡那霉素
KaNW
)
37°C
过夜
。
次日挑取
单克隆
37C
250
g
离心力培养
5
h
o
运用表
1
的
引物进行菌液
PCR
验证
。
验证正确的菌液
5
62
接种于
LB
液体培养基中
(
L4444
:
AmupET
-
2
品
KaNW
)
37°C
250
y
离
心力培养
8.6
代
提取
质
进行
双
酶
切验证
,剩
送
北京华大
基因
公
司
测序
。
将验证正确的质粒转入
HT118
(
DE3
)
感受
态,涂布至
LB
固体培养基上
(
L4444
:
AmppET
-2
品
KaNW
)
37°C
倒置过夜
。
次日挑取单克隆
87%
256
a
离心力培养
5
h
o
运用表
1
引物进行
菌液
PCR
验证,保存验证成功的菌液
。
1.0.8
dsgfp
的诱导表达
将验证正确的菌液
5
1
002
接种于
LB
液体
培养基
(
L4440
:
Amp
Tet
;
pET
-
2p
:
KaNa
(
、
TeU
)
37°C
256
p
离心力活化过夜
。
以
1
:
80
接
种于
LB
液体培养基
(
L440
:
AmpTet
+
;
pET
-
2
品
KaNa
+
、
TU
)
37°C
250
p
离心力培养
8.6
U
,
加入
IPTG
溶液继续振荡培养
5
ho
取
1
mL
菌液
提取总核酸
5%
琼月旨糖电泳检测
,41X5
J
软件灰
度分析电泳条带
。
将成功诱导
dsgfj
的菌液加
56%
甘油
(
1
:
1
)
-82C
保存
。
1.2.0
体外合成
dsgfp
1.0.4.
1
DNA
模板制备
将成功诱导
PFu
的菌液
5
1
002
接种于
LB
液体培养基
(
L4440
:
Amp
+
、
TU
;
pET
-
2p
:
Ka-
NaTei
+
)
37
o
C
256
p
离心力培养
16
~
6
h
提取
质粒
。
含有
T
丿
目的引物进行
PCR
反
应
,5
5%
糖
凝胶电泳检
测
,
切下目的条带运
剂
。
表
1
1.0.
0.
0
体外转录
、
退火形成
dsbu
反
应体系为
:
NTP
Buffar
Mia
16
r
L,
Temp
lata
DNA
3
r
L
(
2.
6
Ry
)
,
T
RNA
po
—
merasa
Mia
6
53
卷
r
L,
总体积
为
20
r
L
o
37°C
温浴
4~6
代
将反
应
液于
74°C
水浴
12
m
—
,冷却至室温
。
加入
10
:
1
体积
Dnnsa
I
和
Rnnsa
A
稀释液
(
稀释
2/0
倍
)
,
37
°C
39
m
—
。
取
1
r
L
合成
dsbu
溶于
6
r
L
Nn-
cleusa
-
Frea
water,
5
5%
糖凝
胶电泳检
测
,
产物
-84C
保存
。
1.2.0
4
种方法分别提取
-440
-
Fu
和
pET-2p
-
Fu
表达
PFu
1
.0.
0.
1
Trizol
法
52mL
,
4C
7522g
离
心
5mnt
。
沉淀加入
52
:
1
体积
Trizol,
震荡
,
室温放置
5
m
—
o
加入
5
:
1
体积氯仿
,
震荡
5s,
室温放置
12
mix
,
4C
6
002
n
离心
5
m
—
o
上清加入
2
:
1
体积异
丙醇
,
颠倒
5~6
次
,
室温静置
6
m
—,
O
C
6
002
g
离心力
12
m
—
o
沉淀加入
1
:
1
体积
75%
乙
醇
4C
7
570
g
离心力
5
m
—
o
重复洗涤
、
次
。
沉淀
室温静置
5
~12
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶
解的
dsRNA
加入
12
:
1
体积稀释的
Rnnsa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37
°C
6
mP
,
-82°C
保存
。
1.0.7.0
酚氯仿法
取
56
mL
诱导菌液
,
4C
7
570
y
离心力
5
m
—
o
沉淀加入
62
:
1
体积
STE
buffer,
涡旋振荡
。
加入
、
:
1
体积苯
酚:氯
合液
(
25
:
24
)
,
涡旋
102s
。
4C
6
002
y
离
心
力
5
min,
上清加入
2
:
1
体积异
丙
醇
,
室温
16
m
—,
O
C
6
002
g
离
心
力
6
m
—
o
沉淀加入
1
:
1
体积
75%
乙醇
4C
7
570
g
离
心
力
5
m
—
o
重复洗
涤
、
次
。
沉淀室温
静置
5
~
12
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶解的
dsRNA
力
[
J
入
12
:
1
体积稀释的
Rnnsa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37°C
6
mP
,
-82°C
保存
o
1.2.
5.
3
RNA
-
eusp
提取液
52mL
的
,
4C
7522g
离心力
5
m
—
,1xPBS
清洗沉淀
。
加入
102
:
1
体积
RNA
-
easy
提取液
,
室温
6
002
p
离心力
5
mix
。
上清
加入
、
:
1
体积异丙醇
,
室温静置
6
m
—
o
室温
16
002
y
离心力
16
m
—
o
沉淀加入
1
:
体积
75%
乙醇
4C
7
502
g
离心力
5
m
—
o
重复洗涤
、
次
。
沉淀室温静置
5
~16
mix
后加入
39
r
L
DEPC
水
。
溶解的
dsRNA
加入
6
:
1
体积稀释的
Rnasa
A
和
Dnasa
I
消化后
,37
°C
6
mP
,
-82°C
保存
。
1.0.
7.0
75%
酒精沉淀法
取
56
mL
诱导菌液
,
4C
7
570
y
离心力
5
4
期
常瑞
等
:
4
种原核表达双
链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
725
同/自沉淀加入
25
:
1
体积
75%
乙
醇
,
室
温静置
5
液
dsFu
测定浓度
,
根据提取方法损失率
,
计算
pET
-2P
、
L440
表达的
dsFu
产量
。
m
—
o
加入
4
:
1
体积
66
mmo
—
L
NaCt
溶液
,
室温
静置
60
mix,
2
°C
6
002
p
离心力
6
m
—
。
上清加
入
6
:
1
体积稀释的
Rnasa
A
和
Dnnsa
I
消
化后
,
87
°C
5
mP
,
-84°C
保存
o
1.2.6
dsFu
浓度
、
纯度讽
'J
定
1.5
数据处理
运用
Imapa
J
软件分析载体表达
dsFu
灰度
值
。
Microsoft
offica
Excel
2/6
、
SPSS
25.
0
软件对
体外合成
PFu
以及菌液提取
dsFuA
26
o
/
/
A
28
4
4
1.2.6.
1
体外合成
dsFu
浓度
、
纯度
A262/A232
值进行多重方差分析和新复极差法进行
显著性分析
。
2
样本间均数比较采用配对
T
检
取
2
r
L
dsFu
样品于
B
-
570
BIOPHOTO
METER
检测
,
用
Nncleusa
-
Free
watar
分别稀释
。
至浓度为
、
002
、
502
、
252
、
125
、
62.5
和
8
5
05
平/
r
L
并检测
A264/
A2
54
4
A262/
A
232
。
稀释
dsFu
5
5%
6
结果与分析
2.
1
IPTG
诱导基于
PET-
2
P
、
L4440
产生
dsFu
琼脂糖凝胶电泳检测
6/
V
25
m
—
o
1.0.
0.
0
菌液提取
dsFu
浓度
、
纯度
pET
-
2
品
和
L440
经
IPTG
诱导表达产生
取
2
r
L
dsFu
样本于
B
-
570
BIOPHOTO
METER
检测
,
用
Nncleusa
-
Free
watar
分别稀释
PRNA
,
经
RNase
A
消化后
5
5%
琼脂糖凝胶电泳
检测
,
pET
-
2p
-
Fu
和
L4440
-
Fu
表达载体
。
图
6
2
.
4
pET
-2P.L4440
产生
dsFu
电泳条带
至浓度为
、
002
、
502
、
252
、
125
、
62.5
和
8
5
05
平/
r
L
并检测
A264/
A2
54
4
A262/
A
/32
。
稀释
PFu
5
6%
琼脂糖凝胶电泳检测
6/
V
25
m
—
o
1.2.0
损失率检测及
dsFu
产量
研究表明
,
基于
pET
-
2P
载体表达的
5
组不
同长度
、
不同
CG
含量的
dsFu
灰度值均高于基于
L440
载体表达的
5
组
量
/
将体外合成的
5
组
PFu
分别稀释至
1
002
中
,
运用以上
2
、
不同
CG
含量的
r
L,
将
39
r
L
稀释液混合至
56
mL
未经
IPTG
dsFu
,
具有显著差异
(
P<0.05
)
。
其中
法进行提取
,
B-
pET-2p
表达
2/1
-
39CG
以及
4/8
-
39CG
灰度
570
BIXPHOTO
METER
检测浓
^4
A
26
0
/A
28
4
>
值明显高于
L440
表达
2/1
-
39CG
和
4/8
-
39CG
灰度值
。
图
8
A
260
/
A
252
。
运用最佳提取方法分别提取
1
mL
菌
D2000
201-30GC
201-50GC
423-30GC
423-50GC
423-70GC
DL5000D2000
201-30CG
201-50CG
423-30CG
423-50CG
423-70CG
500
250
+Rnase
A
*-Rnase
A
+Rnase
A
+Rnase
A
»Rnase
A
a
b
注:品基于
pET-4p
表达
dsFu
;
b
:
基于
L4440
表达/表品
D2600
:
分子质量标记(天根
)
其大小分别是
0
0223
22
、
752
、
502
、
252
、
100
;
DL5002
:
分子质量标记
(
TaKaRa)
,
其大小分别是
5
000
、
5
0024
0023
002
、
752
、
502
、
252
、
62
Note
:
v
:
express
dsFu
bawb
on
pET
-
0p
,
b
:
express
dsFu
bawb
on
L4447.
D2000
:
molecular mass
marker
(Tiangeu)
of
2,500,
1
,200,
756
,
502
,
256
,
102
;
DL5002
:
molecular
mass
marker
(
TaKaRa)
of
5
,
202
,3
,
202
,
2
,202
,
1
,202
,
750
,
562
,
250
,
62
图
2
基于
pET
-2p
和
L4440
表达
dpU
5
5%
琼脂糖凝胶电泳检测
Fig
・
2
Agarose
gei
electrophoresis
detection
based
dsyfu
5
6%
pET
-2p
and
L4440
eapression
706
53
卷
■
pET-2p
D
L4440
输
0
1.
a
8
6
4
■
pET-2p
D
L4440
*
e
。
u
血
-
e
u
©
J
a
l
u
g/d
6sp,
a
a
注
/
表示在
0.93
水平上差异
显著(配
对
T
检验
)o
a
:
基于
pET-4p
和
L4440
表达
201
bp
dsWp
条带灰度
;
b
:
基于
pET-4p
和
L4449
表达
445
bp
dsWp
条带灰度
;
Note
:
*
means
significant
diSeresce
at
the
0.
23
level
)
paiph
T
test),
a
:
Gray
analysis
of
21
bp
dsWp
bands
expresseh
baseh
on
pET
-
4p
and
L4449
;
b
:
Gray
analysis
of
445
bp
dsWp
bands
expresseh
baseh
on
pET
-
4p
and
L4449
图
3
基于
pET-2p
和
L4449
表达
dse
7
5
%
琼脂糖凝胶电泳条带灰度
Fig
・
3
Gey
analysis
dsge
7
5
%
agarrse
get
electrrphoresis
bands
bases
on
pET
-2p
2.
3
体外合成
dsWp
浓度
、
纯度
研究表明
,
分别梯度稀释
6
组浓度
,
每组
du/
fp
八
44
株
281
均在
7
9
〜
2.
2,
合成的
7
组
dsWp
纯度
较髙
。
稀释至
87
25
全
/
r
L
的
5
组
dsWp
稀释液
,
人
26
株
231
值均在
3.
4
-3.4
,
浓度过低
,
达到仪器检
测最
,
进行
,
出现偏差
。
其余
7
组
dsWp
稀释
。
图
4,
图
7
在
2.2
~
3.
4
。
5
组体外合成
dsWp
可以作为
标
准
注:
D2000
:
分子质量标记(天根-,
其大小分别是
2
01
、
1
01
、
750
、
51
、
250
、
60
Note
:
D20
00
:
mcVecy/s
mass
marUce
(
Tiangex
-
of
4
,
000
,
1
,
000
,
750
,
500
,
250
,
60
注
:
a
:
5
组
dsWp
稀释至不同浓度检测
A260/A200
;
b
:
5
组
dsWp
稀释至不同浓度检测
A260/A037
Note
:
a
:
five
gpups
dsWp
di/teh
to
diSerex)
cncen/atioss
A260/
A
255
detection
;
b
:
five
gropps
dsWp
di/teh
to
dikerex)
cnces/atioss
A260/
A237
detection
Fig.
2
Analysis
oO
dsge
cancentration
and
pu
UI
oO
eve
grrups
synthesfee
in
vitrr
m/egstloz
ffl
©
*
」
u
:
a.
,
&
s
p
L
・
0
z
」
p
CA
z
n
*
E
尊
a
2
a
0
201-30CG201-50CG
423-50CG
423-70CG
a
b
and
L4440
eepression
图
4
体外合成
dge
7
5
%
琼脂糖凝胶电泳检测
Fig
・
4
Detection
dsge
7
5
%
agarrse
get
eUctrophoresis
•
1
000
ng/gL
■
500
ng/piL
▲
250
ng/p.L
•
1
000
ng/ptL
■
500
ng/p.L
▲
250
ng/|iL
▼
125
ng/gL
♦
62.5
ng/piL
▼
125
ng/gL
♦
62.5
ng/p.L
O
31.25
ng/p.L
0-
O
31.25
ng/gL
a
b
图
7
体外合成
7
组
dsge
浓度
、
纯度
4
期
常瑞等
:
4
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
7
7
2.
3
4
种方法提取菌液
dsRNA
6.
2.
0
提
取基于
L4440
载体表达
dsFu
6.0.1
提
取基于
pET-2p
载体表达
dsFu
研究表明
,
根据提取
dsFu
核酸检测值
,
对
A264/A284
和
A264/A232
利用
SPSS
分别构建多重比
研究表明
,
根据提取
dsFu
核酸检测值
,
对
A262/
A
54
和
A262/
A
232
利用
SPSS
分别构建多重比
较模型
,
模型截距
(
F
=
16
2/6.
446,
P
=
2.
002
)(
F
=
526.
04
,
P
=
0.002
),
提取方法因素
(F
=
25
.
043,
P
=
2.
002
)
(F
=65
338,
P
=
2.
002
)
分别
较模型
,
模型
截
距
(
F
=
5
246.
017,
P=
2.
002
)
(
F
=
739.011
,
P
=
0.002
),
提取方法因素
(F
=
32.
320,
P=
2.
002
)
(F
=
24.
035,
P
=
2.
022
)
分别
达极显著水平
,
浓度因素分别达到显著
(
F
=
达极显著水平
,
浓度因素分别达到显著
(
F
=
2.
363,
P=
2
.
041
)
和不显著水平
(F
=2
.
227,
P
=
2.
955
)o
新复极差法显著性检验显示不同浓度
3.453,
P=0.021)
和不显著水平
(
F
=
2.
344,
P
=
2.
882
)
。
新复极差法显著性检验显示不同浓度
之间差异不显著
。
提取纯度最高的
Trizol
法和
酚
之间差异不显著
。
提取纯度最高的
Trizol
法和
酚
氯仿法
(
CK
为对照)
,
且这
两
者差异不显著
,
其次
75%
氯仿法
(
CK
为对照)
,
且这两者差异不显著
,
其次
是
75%
法
,
提取纯度最低的为
RNA
-
exy
提取液
。
图
6,
图
7
2.5
法
,
提取纯度最低的为
RNA
-
easy
提取液
。
图
6,
图
7
■
CK
1=1
Tri
1=1
Phe
a
Ale
a
rir
■
CK
口
Tri
pET-2p-gfp
L4440-gfp
pET-2p-gfp
L4440-gfp
a
b
注:数据后附不同字母者表示在
2.
05
水平上差异显著(邓肯氏新复极差法
)
;
CK
:
体外合成
;
Tri
:
Trizol
法;
Pho
:
酚氯仿法
;
Alc
:
75%
酒
精沉淀法
;RIR
:
RNA
-
小同提取液;
a
:
提取
pET-4p
和
L4447
表达/表
3
,
分别稀释至不同浓度检测
A260/A250
;
b
:
提取
pET
-
2p
和
L4447
表达
dsF
品分别稀释至不同浓度检测
A260/A239
Note
:
Those
with
diderent
letters
after
the
data
inddato
zigUVcant
diPerencos
at
Uo
2.05
level
(Duncat
new
multiple
range
method
)
;
CK
:
0-
vitro
syuthesis
;
Tri
:
Trizol
meUod
;
Phe
:
pPeuol
chloroform
mothod
;
Ale
:
75%
alcohol
precipitation
method
;
RIR
:
RNA
-
easy
extract
;
v
:
Ex
tract
pET
-
4p
and
L4447
to
express
dsFu
wd
dilute
to
diRereut
conceuUa
均
ns
to
detect
A
26
/z
7
A
28
/
;
b
:
ExUact
pET
-
4p
and
L4447
to
express
dr-
gp
and
dilute
to
diderent
conceuUa
均
ns
to
detect
A260/A
535
图
6
4
种方法提取
pET
-
2p
和
L4440
载体表达
dsyfu
纯度
Fig.
2
Purity
analysis
ot
pET
-2p
and
L444
0
vector
eapression
eatracten
by
four
methods
703
53
卷
注:
D2000
:
分子质量标记(天根-其大小分别是
2
10
、
、
10
、
750
、
51
、
250
、
60
;
a
:
酚氯仿法提取基于
pET2p
表达
d
S
Wu(
经
Dux
I
和
Rnase
A
消化
,
稀释至
500
排株)
;
:
酚氯仿法提取基于
L4449
表达
dxfp
(经
Duel
和
Rnase
A
消化
,
稀释至
500
排
/
r
L
)
eT/zl
法
提取基于
pET2p
表达
dsWp
(经
Dux
I
和
R
排均
A
消化
,
稀释至
500
排
/
r
L)
;
;
:TUzoi
法提取基于
L4449
表达
dyfu
(经
Dux
I
和
R
排均
A
消化,稀释至
500
排
/
)
r
L
Note
:
D2000
:
McOecy/r
mass
marUer
(
Tiangex
)
,
its
size
is
4,200
,
1,200
,
750
,
500
,
250
,
60
;
a
:
Phenol
-
chlorofoun
extraction
methoP
baseh on
pET2p
expression
dsgS
(
digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
di/teh
to
500
ng/
r
L)
;
b
:
Phenol
-
chlorofoun
extraction
methoP
baseh
on
L4449
to
express
dsWp
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
diluteh
to
500
ng/
r
L
)
;
c
:
T/zol
methoP
extracts
dsWp
baseh
on
pET2p
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
diluteh
to
500
ng/
r
L
)
;
d
:
TUzoi
methoP
extracts
dsWp
baseh
on
L4440
(digeXeS
with
Dnase
I
and
Rnase
A
,
di/teh
to
500
ng/
r
L
)
图
7
酚氯仿法和
Trizei
法提取
50
mL
菌液表达
dsyfe
75
%
琼脂糖凝胶电泳
Fig.
2
Pheeoi
chloroform
method
and
Trizei
method
i
eatract
5
0
mL
bacteriai
solution
i
eepress
dsge
1.5
%
aaarose
get
qectrophoresis
2.5
4
种提取方法损失率
度
、
纯度最高
,
与体外合成的差异最小
,
计算提取
研究表明
2
种方法提取后的体外合成
dsWp
与提取前的体外合成
dsWp
浓度纯
明显差
(
P<
损失率分别为
07
49%
、
23.
38%
,75%
酒精沉淀
法和
RNA
-
essp
提取液提取的
dsWp
浓度
、
纯度
异
,
经
SPSS
软件分析
,
差异有统计
最低,与体外合成差异最大
,
计算提取损失
率
分别
为
32.
3%
、
37.62%
。
表
0
0.
05
)
。
其中
酚氯
仿法和
TUzoi
法提取的
dsWp
浓
表
0
9
种方法提取内标混合纯
dsyfe
浓度
、纯度
Table
0
Comparison
and
analysis
oi
the
canceetration
and
purith
oi
the
internai
standarU
miped
put
dsge
eaaadee
by
four
methods
外合成
Is
vitro
酚氯
法
Phenol
ChloroSmi
*
u
t
values
TUzoi
法
i
t
values
75%
法
RNA-eney
syy
thesis
T/zol
tau
*
75%
a/oPol
i
t
values
提
RNA-eney
extract
*
i
t
values
precipitation
*
676214±6229
浓度
(
排
/
r
L
)
A
200
y/
A
280
A260/A230
998.
72
±3.36
784.56
±5.27
39222
3280
15.96
760.77
±5.37
43290
3280
31.72
62320±622
70283
3260
17220
1.98
±0.24
4.35
±6.27
3
34
±00
1282±00
1218±00
1284±00
32334
41.99
1.35
±00
028±0207
"±00
6.34
0276±00
注:*表示在
0.
23
水平上差异显著
(配
对
T
检验-
Note
:
*
means
significant
diSeresce
at
the
0.
23
level
)
paUeh
T
test
)
4
期
常瑞等
:
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
729
2
.
3
基于
pET
-2
P
、
L4440
产生
dsFu
产量
dsFu
浓度,具有显著差异
(P<0-45
)o
基于
pET
-
2P
和
L440
表达载体
1
mL
研究表明
,
基于
pET-
2P
载体表达
5
组不同
产
长度
、
不同
CG
含量的
PFu
浓度均高于基于
L4442
表达
5
组
1
生
3
6
~24.
39
R
y
、
5.
43
~22.
47
R
y
dsFu
。
图
3
、
CG
含
的
■
pET-2p
口
L4440
盘
.
30-1
5-
6
U
800-1
f"
600-
匸
Mb
400-
M
h
■
pET-2p
■
口
L4440
注
:
*
表示在
2.
05
水平上差异显著(配对
F
检验
)
;
v
:
酚氯仿法提取基于
pET-2p
和
L4447
表达
dsFu
浓度
;
:
基于
pET
-
4p
和
L4447
表达
dwl
产量
Note
:
*
means
WgU
小
ant
PRereuce
at
the
2.
05
level
(
paireb
T
test)
;
v
:
Phenol
chloroform
extraction
method
baseb
on
pET
-
4p
and
L4447
express
dsFu
conceuUatUn
;
b
:
Baseb
on
pET
-
4p
and
L444
2
express
dsFu
yield
Fig
・
2
Analysis
ot
the
concentration
and
yielU
ot
dsyfu
eatracten
from
1
mL
bacteriai
solution
by
phenoi
一
chlooUvm
method
uo
e
lueouooJli
/6U^*"
200-
图
3
酚氯仿法提取
1
mL
菌液
dsyfu
浓度及产量
3
讨论
邹晓蕾
、
Eb
每
以及
Tyagl
等
4/
-
10
]
均报道了提
取细菌总
RNA
的方法
,
主要包括
Trizol
法
,
酚
氯
提取
pET-2p
和
L440
表达的
dsFu,
检测核酸浓
度
,
发现
2
个载体表达的
428
-39CG
明显高于其
他
4
组
,
说明
pET
-2p
和
L440
均具有较强的表
达能力
。
通过浓度分析,根据提取损失率计算
1
mL
菌液
dsFu
产量
,
发现基于
pET
-
2p
产生的
5
仿法以及部分市售
RNA
快速提取试剂盒
。
其中
Trizol
法在细菌总
RNA
提取中使用较为普
遍
,
利
组
dsFu
产量均高于
L4440
产生的
5
组
dsFu
产
量
,
最高可达
24.
39
Rp/mL'
p
ET
-2p
可作为
dsFu
用异硫氧酸弧等物质迅速裂解细胞
,
同时抑制核
酸酶的活性
,
保持
RNA
的完整性,氯仿使
RNA
溶
的相对最优表达
2
。
相
,
从
蛋白等物质相分离,为提取细菌总
提取
、
纯化原核表达
dsRNA
对于真核生物来
说
,
难度更大
,
尚无成熟方法借鉴
[
24
]
,研究采用
4
RNA
的
首
选方法
43
]
。
苯酚
-
氯
提也是提取
细菌总
RNA
常用方法之一
,
利用酚反复抽提使蛋
白质变性
,
SDS
(
十二浣基磺酸钠
)
使细胞裂解
,
种常用提取细菌总
RNA
的方法
,
试图通过提取完
整纯净的总
RNA,
经
Rnasa
A
、
Dtse
I
消化得到
入
氯
仿分层
,
获得含总
RNA
的水相
49
]
。
市售总
RNA
提取试剂盒成本较高
、
使用次数有限
,
不适
纯净的
dsRNA
。
Trizol
法和酚氯仿提取细菌总
RNA,
经
Rnasa
I
消化后
,
稀释核酸检测
A
10/
A
10
4
A264/
A
432
,
均值分别为
5
77
4
5
83
和
用于大量提取检测
,
故未选用进行
。
表
明
,
以体外合成
PFu
为对照
CK,
通过使用
Trizol
法和酚
氯
法
高
提
细
总
RNA
,
Rnasa
A
与
Dnnsa
I
消化后
,
可得到较为纯净的
1.74
、
2.
1,
与体外合成
dsRNA
值差异最
、
。
但
1-3%
糖凝胶电泳检测后
,
稀释至不同浓度的
dsFu
条带均出现不同程度弥散
,
无法得到清晰电
dsFu,
损失率最低
。
RNA
-
eusp
提取液和
75%
酒
泳图
,
可能存在以下原因
:
原核诱导表达的
dsFu
脆弱
,
使用有机溶剂以及提取过程中反复高速离
心损伤
dsFu
;
核酸检测稀释时间过长
,dsFu
在自
法提
率明显低于前者,不适用于快速
1mL
提取细菌总
RNA
以及
dsFu
。
与前人的研究结果
基本一
。
酚
氯
法,分
然环境下发生降解
;
电泳液含有核酸酶
。
712
4
结论
通过
酚
氯仿法提取
2
种载体表达
dsF
品
检测
发现
随
着目的片段
CG
含
,
1
表达的
PFU
浓度及其产
渐降低
。
pET
-
2p
载体
表达能力高于
L4440
载体
,
uET-2p
可作为
dsFu
的相对最优表达载体
。
为
PFu
在不同环境
降解程
以及
产物分析提供了技术
支
。
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Leptiptarso
UeceuUa-
eats)
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RNA
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the
ipUd
-
Uke
sipnaPp
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dsRNA
ft
staple
as
a
foliar
-
aqplieU
insecticide
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Put
Manapexent
Seance,
2613,
74(4)
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821
-805.
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0,
Papanicolaou
A
,
Garbut)
J
S.
c)
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RNA
—
素廿小种平
0-
Lepiboptem
:
an
overview
of
successful
and
uuuccessPl
stud
ies
and
implications
for
experimeutal
desigy
J
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Joupal
of
tped
physdfgy,
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J
P
,
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W
B.
RNAi
:
Future
in
insect
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J]
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Joueol
g
InveXebetc
Pahofpy
,
225,112
:
68
-
74.
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Ivashuta
S
,
Zhang
Yji
:
Wiggins
BE,)
al.
Environ
mental
RNAi
in
herbivorous
insects
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J
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RNA
(
Neo
Yor0
,
N.
Y.
')
,
2013
:
41
(5)
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840
-856.
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Z
-
Feng
Shi
:
Jia
Fu
,
Li
-
Li
Mu,
c)
al.
Two
Leptipta/o
uridine
dipPwpPaU
N
-
ace
均
—
ucosamine
pyropPospUoryl
a
scr
are
spe
cialized
for
chitin
syuthesis
in
larval
epidermal
cuticle
and
midgut
peritrophic
matox
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Irged
BiocUeuiap
and
Molecular
Biolo
gy
,466
,68.
J
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Li
Xiaoxxc
:
Zhang
Mingy
an
,
Zhang
Hodgyu.
RNA
—
素廿小种平
of
four
veuer
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adul)
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、
-
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xene
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Plant
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Jourual
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E
p
gmeegp
Reseo/U
,2705,28(1)
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BE,
Welch
J
,
Braiby
N
,3"
k.
CcwsOuc
均
n
and
use
of
a
Cuggpibm
sncPor
H16
so
—
Ulc
hyUrooeuase
promoter
(
P4H
)
fusion
to
Fu
(green
Juoresceut protein)
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226,4
(7)
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—
rk
Grznarova
P
,
Stansell
E
,
et
al.
A Mason
-
Pfizer
Monkey
Virus
Gag
-
GFP
Fusion
Vector
Allows
Visualization
of
Capsid
Transport
in
Live
Cells
and
Demonstrates
a
Role
for
MProtuPulcs
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3680
-
5681,
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SHAO
Meili
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GUO
Ruixxc
,
HAN
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Xiaolei
,
LIE
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LUO
Lixin.
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Mo
bee
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Sdeyce
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N.
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Villa
-
Rodriguez
E
,
Ibarra
-
Gamea
C
,
do
lor
Santos
-
Villalo
bos
S.
Extraction
of
high
-
qualip
RNA
from
Bacil
—
r
suPtilis
with
a
lysozyme
pre
-
treatment
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by
Uo
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Microbdlopicol
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Rio
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C
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M
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TRI
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Spring
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P,
Sacchi
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Single
-
step
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guanibinium
thiocyanate
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pPeuol
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[22]NwWepi
A
0,
Kung
A
W,
Kilby
P
M
,
c)
al.
Puri/cation
and
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of
dsRNA
using
ion
pair
reverse
pPase
chromv-
toeranPy
and
mass
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Joueol
g
Ch/mPopmphy
A,
2017,
1484
:
14-25.
9
期
常瑞等
7
种原核表达双链
RNA
的
dsRNA
提取方法效果评价
711
Comparativv
Study
on
the
Effed
of
4
kind
oO
dsRNA
Extraction
Methods
form
Prakaraytic
Expression
Double
-
$501
x
10
RNA
CHANG
RuU
,
WANG
Jus
2
,
FU
Kaiyys
5
,
LIAO
Lanins
5
,
DING
Xindss
5
,
HE
Jiany
5
,
GUO
Wex
每
av
2
,
Top/ps
AhemaP
,
REN
Yu
3
(7
Collepo
eg
Life
nnd
Geographie
Scieccos
,
KuPi
UnwersPR
,
KuPt
XiUinng
344906,
ChUa
;
0
.
Plant
Protection
Station
og
Xifiang
Uygun
Autonomous
Repion
,
Urumqi
332049
,
CCUa
;
8
.
Kop
Laboratorp
og
Ings-
graPeC
Manpunci
of
Harnfri
Crop
Vermin
of
CCUn
NortUwestern
Oasis,
Mfgpp
ug
ApPculturo
SgPUte
og
Plant
Protection
,
Xifing
PcuPemy
og
Apraultural
S
100X0
,
Ummqi
530091,
CCUa
,
MOARP
/
;
9
.
Xifiang
Kop
Laboratorp
og
Speciai
EuironmeUai
Mhmbflogy/IuUUe
of
AppPeC
Mhrobflopy
,
Xifiang
PcuPeuy
og
Apri-
culturai
Scfncos
,
Ummqi
530091
,
CCUa
-
Abstract
:
8
Objective
t
Pronamotlc
expression
of
dsRNA
hus
u
wiba
ranya
of
potextiai
示
p/ctions
is
ths
field
of
pul
cXpO
[
Methods
)
Usky
pET
-2p
and
L4440
ns
vectorscons/uci
five
yronus
of
Wu
一
201
-
37CG,
Wu
-201
-50
-
CG,
Wu
-423
-
30CG
,
Wu
-423
-
50CG
and
Wu
-423
-
77CG
of
differexi
/syth
and
diheresi
CG
contesi
ns
ths
tarpei
fraymesis
of
dsWp
expression
,
TUzoi
methoP
,
phesoi
ch/rofoun
mUh-
oP
,
RNA
一平均
extraction
solution
and
75%
PcoPol
precipitation
methoP
tv
extraci
lmi
and
50
mL
of
dsWp
induceS
by
isopropylthiv
-
0
-
D
-
qa/ctosiba
(IPTG)
is
bacteUai
solution
,
up
均
t/Sy
Nuc/lc
scib
detec
tion
A264/A
2
51
,
A264/A
231
compare
tha
piiUty
,
with
is
vitra
syythesis
of
PsgpD
ns
s
control
,
tv
evaluaiv
tha
平-
traction
均
小
Sscy
of
tha
fone
mathoPs
and
tha
expression
示
ility
of
tha
too
eCop
dspp.
【
ResylUg
Tha
fone
extraction
methoPs
were
ana/zeh
by
mu/ipiv
vaUasca
示
Pysis.
Amony
them
,
tha
TUzoi
methoP
and
tha
pPv-
soi
-
ch/roSrm
methoP
A264/A284
示
X
A264/A234
with
tha
highesi
ex/scFon
piiUty
1
■平每不
1.38
and
1.79
p-
spective/
;
1.73
and
9.
3
,
psp
均
t/Sy
,
ha
loss
rata
wss
23.
38%
,
21.
44%
.
Followeh
by
tha
75%
a/oPol
precipitation
methoP
,
tha
sveraya
valuvs
of
A264/A
254
and
A
16
1/
A434
can
reach
:
1.3
,
1.73
,
and
tha
loss
rata
s
37.
3%
3
Tha
/wu)
extraction
piiUty
is
s
tha
RNA
一
平均
extract
,
whose
sveraya
valuvs
of
A264/A
254
and
A264/
A234
can
reach
1.70
and
1.70
,
and
tha
loss
rata
is
s
37.
62%
.
Usinq
tha
methoP
of
mixkq
pure
dsRNA
with
intepai
standarU
,
it
wss
calcalated
thsi
par
mil/Utee
of
pET
-2P
and
L4449
expression
veetve
inSuceS
bacte
ria/
/quip
can
feunesi
tv
uroPuco
3.7
-24.
39
Ry
and
7.
45
-22.
4
Ry
dspp.
Usinq
intepai
standarU
mixeh
pure
dsRNA
methoP
,
tha
feunestation
of
pET
-
2P
and
L4449
expression
veetve
kSuceh
bacteUx
solution
wss
calch/teP
tv
uroPuco
3.7
-24.
39
Ry
7.
45
-22.
47
Ry
dspp.
par
md
【
Conclusion
]
F
ops
methoPs
量
nseh
tv
extract
dspp
expresseh
by
pET
-
2p
and
L4449
Tha
ha
pOenoi
chlorofoun
methoP
can
ba
ns
不
tv
quichiy
平-
traci
high
-
qualitp
and
high
一
piiUty
oroParyotic
dsgpDquShiy
pET
-
2p
is
tha
optisai
expression
of
dspp
ha
carUve
proviSgs
technicai
suppo/
S
s
tha
subs
不
n
不
i
study
of
tha
UepraSadon
deprev
of
dspp
is
diUereni
envi
ronments
and
tha
analysis
of
UepraSation
p
量
nncts.
Key
words
:
oronamotlc;
doup/
-
strandeh
RNA
;
ex/scFon
;
UepraSation
Fund
project
:
Usovation
esvironmest(
tales)
,
base)
cnstruction
projection
is
Xinjiang
(
a/s)
project
-
Tianshas
cehar
project)
)2018XS36)
;
Key
cal/vation
projects
of
scientific
and
tech
排
/gicai
insovadon
of
Xinjiang
Acahemy
of
Ag/ca/u
量
Sciences"
Monitoring
and
Ea/y
Warning
and
ComppSessive
Prevention
and
Control
of
Major
and
Neu/
IsvaPeh
AgUcatu
量
and
Forestp
Pests
is
Xinjiang"
(xjhcpy
-002)
Corpspo
全
esce
aut
hos
:
3•
UO
Wexchao
(
666
-
-
,
mate
,
bore
is
Hehei,
P
p
O
ssos
,
d
octo
rat
supemisos,
Research
direction
:
Integrates
manage-
mestof
AgUcatu
量
invasive
pests
:
(
E
-
mait)
增
c666@
63.
cm
FU
Kaiyys
(1987
-
-
,
mate
,
bore
is
Zhejiang
,
Post
-
doctora/
a)
Post
-
doctora/
MoPiie
Station
of
Xinjiang
AgUca/urai
U-
niversity/
Pos
-
thocto
量
WorUstation
of
Xinjiang
Acahemy
of
Ag/ca/u
量
Sciences
:
Professor
associate
,
Research
direc
tion
:
Integrates
managemes)
of
Ag/caturai
invasive
pests
,
(
E
-
)
fukaiyu
排
7
@
63.
cm