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4种原核表达双链RNA的dsRNA提取方法效果评价

IT圈 admin 114浏览 0评论

2024年4月6日发(作者:漆学)

新疆农业科学

2001,53(4)

700

-7H

Xinjiany

AgUca/urai

Sciescas

doi

/

41

6448/j.

isx.

641

-

4334.

Hl.

44.413

4

RNA

dsRNA

提取方法

果评价

常瑞

3

2

,

付开*

5

,

廖兰兰

5

,

丁新华

5

,

5

,

郭文超

4

,

吐尔逊•阿合买提

5

,

任羽

1

(1

.喀什大学生命与地理科学学

3,

新疆喀什

844006

2.

新疆农业农村厅植物保护

O

,

鸟鲁木齐

830049

5.

新疆农业科学

3

植物保护研究所/

农业部西北荒漠化绿

作物有害生物综合洽理

E

点实验

I,

鸟鲁木齐

830091

4.

新疆农业科学

3

微生物

{用研究所

/

新疆特殊环境微生

GE

点实验

I,

鸟鲁木齐

836691

)

目的

构建表达不同片段长度和

GC

含量的

dseWp

片段

比较

4

dsRNA

提取方法,获得最佳的提

取方

以及dsRNA

相对

最优

的表达载体

dsRNA

的降解研究提

基础

方法

4

pET-2p

L4444

为载

分别构建

5

组不同长度

不同

CG

含量的

Op

-241

-34CG

Wp

-241

-54

-

CG

Wp

-423

-

32CG

gfp

-423

-54CG

Wp-403

-74CG

为目的片段的

dsWp

表达载体

运用

T/zoi

氯仿

RNA-

不均提取液以及

75%

酒精沉淀法分别提取

1

54

mL

经异丙基硫代

-

0

-

D

-

半乳糖

3(

(

PTG)

诱导菌液表达的

dsWu,

核酸检

A

4o/

A

4o

A

4o/

A

o/

比较纯度,

以体外合成

dsWp

为对照

评价

4

种方法提取效率及

2

种载体

dsWp

表达能

结果

4

种提取方法经多重方差分析,

其中提取纯度最高的是

TUzoi

法和酚氯仿法

A

2

00/

/

A

28

7-,A

2

00/

/

A

0

3

0

值分别可达

7

83

/

97;

7

78

2.

1,

损失率分别为

23.

83%

H

24%

其次是

75%

酒精沉淀法

A

2

00/

/

A

28

0

A

26

0/

(

A

56

均值可达

78,7

78,

损失率为

36.

8%

o

提取纯度最低的为

RNA

-

平均提取液

A

26

0/

/

A

28

9

A

26

0/

/

A

0

3

7

均值

可达

7

56

7

56,

失率

371

60%

利用内标混合

dsRNA

的方

算获得每毫

pET-2P

L4444

达载体诱导菌液可发酵产生

&7~24.39

R

g

7.28~22.47

R

g

dsWp

结论

提取

pET-2p

L4444

表达的

-W

p

,

其中酚氯仿法可用于快速提取高质量

度原核表达的

dsWp,pET

-2p

ds/u

最优表达载体

关键词

原核;双链

RNA

提取;降解

中图分类号:

S188

文献标识码:

A

文章编号

641

-

4336

(2401)44

-

4744

-

17

4

引言

研究意义

马铃薯甲虫

(

LeptUotara

decem-

Puata

Sna

专一性

安全性强

且植物生

掘更多生物防

dsRNA

生产成本高

产量无法预测

稳定性低

)

是马铃

性害虫

持续化学防治

进展

dsRNA

在环境中极

自然

并且其

使马铃

虫对部分拟除虫

氨基甲酸酯

机磷

类和微生物杀虫剂产生了抗性

3

~7

h

NA

在紫外

发现

dsR-

,4h

系统

植物

使用

RNAi

技术,喂食马铃薯甲虫涂抹

dsRNA

铃薯叶片

2

沉默马铃

机制

扩增

虫特定基

-RNA

以及有害生物对

RNAi

敏感性差别大等因

因表达

抑制马

虫的正常生

具有高

素⑷

目前

dsRNA

主要通过

3

个方法大量生

收稿日期

(Receives)

2020

-

11

-47

基金项目

勺治区创新环境(人才、

基地)建设专项(人才专项计划

-

天山雪松计划

)(

218XS36

)

新疆农业科学院科技创新重点培育专

新疆重大新发农林入侵生物监测预警与综合防控

(XU

cp

-002

)

作者简介

常瑞

(693

--

新疆人

硕士研究生

研究方向为资源微生物开发与利用

,(E-maii)

cyagpSS

@0

x

111.

cm

通信作者

文超

(

666-

)

男,

可北人

研究员

博士生导师

研究方向为农业害虫综合防治

,

E-mUi)

**********

付开赞

(

1987

-

-

浙江人

助理研究员

在站博士后

研究方向为昆虫生理生化与分子生物学

,

E-maii)fuUaiyyuC7@

65

2

anm

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

771

产:一是合成含有

T3

启动子的

-RNA

特异性引

2

外合成试剂盒合成

dsRNA

S4]

二是

原核生物

生产

-RNA,

最早用于干扰秀丽引

线虫

喂食

引线虫时可产生强烈干扰

将构

建完成的

-RNA

表达载体导入

RNase

III

缺陷型

大肠杆菌

HT115

DE3

-感受态中

经异丙基硫代

-0

-D

-

半乳糖

3

ITG

诱导

产生

dsR-

NA

2,

过转基因植物表达

dsRNA

,

使植

物具有

终生

防御性

害虫啃食植物后

2

抑制其生

死亡

为干

,1

切入点

方法可大量合成

-R-

NA,

快速高效

合成

dsRNA

可直接使用,但体外

合成试剂盒成本较高

实际大规模推广使

方法

得到大量

-RNA,

且成本较

诱导过程中

如何保

高活

持续产生

-RNA,

仍需有待研究

针对

RNAi

的特异性以及原

获得

-RNA

良好的应用

前景

pET-2p

444

为载体发酵产生

dsR-

NA

法为基础

筛选

4

种提

取菌液总

RNA

方法以提高菌液

-RNA

的获取

拟解决的关键问题

利用

720

bp

-

荧光

蛋白

Wu

[1_I5

为模板

分别随机改变碱基改变

GC

含量,并构建

5

组合的

-增

0

片段

201

bp

长度的

30%

CG

含量的

dsWp

简称

201

-

37CG

,

下同

,201

-

50CG

423

-

37CG

423

-

50CG

423

-72CG

运用试剂盒体外合成以上

7

dpf,

检测其浓度

标准

将以

6

组表达

运用

TUzoi

氯仿法

RNA-

平均

提取液

以及

75%

酒精沉淀

分另

U

提取

―增小

建立菌液表达

dsRNA

的最佳

法以及最优表达

提供理论支持

1

材料与方法

1

2

材料

1.1.1

载体

pET

-2p

L449

质粒实验室保存

1.1.6

菌株

大肠杆菌

HT115

DE3

-菌株购自上海唯地生

物技术有限公司

培养至二代菌株由该实验室保

1.1.3

主要试剂及仪器

试剂:

Truss

-

T1

感受态细胞

2xEasy

Taq

PCR

Supee

MS

全式金

琼脂糖

西班牙

LB

broth

MDBia

,

Ise

-;

卡那霉素

Kans

-

四环素

Tel

氨节青霉素

Amp

I

PTG

粉末

苯酚:氯仿

合液

20

24

SolarUia

-

提试剂盒

琼脂糖凝胶

剂盒

OMEGA

-

Hibcribe™T

2

High

Yield

RNA

Syythesis

Kii

NEB

-;限制性内切

EcoRS

NotO

HUgA

i

XhoU

Thermo

-

;

ClosEx-

pressI

I

Osa

Step

Closinq

Kit

RNA

-

essp

提取液

Vazyme

TUzoi

Reaqest

ambios

-

;

焦炭酸二乙酯

DEPC

2

Sshap

;

异丙醇

无水乙醇均为分析纯

D

se-/R

se

-

0

离心管

移液器枪头

BU

o/pix

:离心机

湘立

TGL6M

PCR

ICy-

cliny

96

梯度-

摇床

TASITEDY

-200B

-

电热恒

温干燥箱

TASITE299

-1AB

水浴锅

BATHS

-

核酸电泳系统

北京六一

DYY-6D

);

凝胶成像

系统

Wealtac

Dolphin

D

B

-

500

BIUPHOTO

METER

METASH

-

-87°C

冰箱

Thermo

ULTS1873

-

超净工作台

江苏通净

VD

-650

-

超纯水机

青岛富勒姆

FBZ0502

-

SUP

1.3

方法

1.2.3

dsfC

基因

引物合成

以来自于

720

bpWu

的序列为模板

对其基因

进行设计优化

,

变碱基

CG

含量

交由南京

瑞生物科技有限公司完成基因合成

成了

7

组不同长度组合的―增小片段

2

01

bp

长度

37%

CG

含量的

dsWp

简称

201

-

37CG

,

)、

201

-50CG

423

-30CG

423

-50CG

423

-

77CG

T

2

启动子为起始序列设计

合成引物

用于体外合成

―增小

XhoI

HUidIII

L4444

KpU

Nof

4hT

-20-

为双酶切位点设计

合成引

用于构建

444

-

0

pET

-2p

-

Wu

表达

载体

3

1

722

53

用于

dsRNA

合成

载体

构建引物序列

Table

1

POmer

Ur

dsRNA

synthesis

and

化<^

00

111

x

1:01

Prinmes

T7-G221-32-F

T7-G221-32-R

T

-

G201

-56

-F

(5tW

J

)

Sequences

(5

toO

5

TAATACGACTCACTATAGGGAATAAGTTAAGAGACTGCA

TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTTATTATCTAAC

TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

T

-G201

-56

-R

T

-G425

-30

-F

TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

TAATACGACTCACTATAGGTGATTCATCTTGATATCGATCAT

T-G425

-30

-R

T

-G425

-56

-F

TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

TAATACGACTCACTATAGGGGACTCCCCCTGGTGGC

TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTTCAGCGTGTGC

T-G425

-56

-R

T

-G425

-77

-F

T-G425

-77

-R

L-G201

-30

-F

*

L-G221-32-R

TAATACGACTCACTATAGGGCTTTCGCCCTGATGAC

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGAATAAGTTAAGAGACTGCA

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTTATTATCTAACTTGT

L

-

G201

-56

-F

L-G201

-56

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTGATTCATCTTGATATCGATCAT

L

-

G405 -30

-F

L-G405

-30

-R

L

-

G405 -56

-F

L-G405

-56

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGGACTCCCCCTGGTGGC

L

-

G405 -77

-F

L-G405

-77

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTTCAGCGTGTGC

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGCTTTCGCCCTGATGAC

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGAATAAGTTAAGAGACTGCA

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTTATTATCTAAC

P-G221-32-F

P-G221-32-R

P

-

G201

-56

-F

P-G201

-56

-R

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTGATTCATCTTGATATCGATCAT

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

P

-

G405 -30

-F

P-G405

-30

-R

P

-

G405 -56

-F

P-G405

-56

-R

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGGACTCCCCCTGGTGGC

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTTCAGCGTGTGC

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGTCTTTCGCCCTGATGAC

P

-

G405 -77

-F

P-G405

-77

-R

pET

-

0p/L4447uw

TAATACGACTCACTATAGGG

5

:

L

L4447

载体缩写

,

P

pET-2p

载体缩写

Note

:

*

:

L

is

the

aUbreviation

of

L4440

vector

,

P

2-

the

adbreviaUw

of

pET

-

2p

vector

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

773

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-70CG

GA

TAAGTtcA

G

gT

c

tcGtgGt

G

GGt

GtTg

cAt

TaCgtcAAgc

GAtc

GAaGTTCA

T

AtcAT

G

A

gc

G

gc

T

c

cA

c

a

g

GA

CA

Cc

H0

160

'GAA

'GU

CA|C|

180

AT

200

220

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

I

40

jat

J

at

B

a

S

gt

j

H

cmtg

I

t

T

3

T

AT

TATAATAT

1

I

(:

ICAAGTT0

201

201

hAGTT

hAGTT

mm

A.

T

'GU

taat

I

CG

C

C

TC

'CCATGAATATACCATCTTATTCAAGGACAAC

TCTAAGACCAGi

jTGCTCATCATCTTCtAi

238

230

238

423-7OCG

i

C

■CG

CGC

TC

GC

hAGTT

|TGCGC|TC

TCTGCGTCCGG

TGCGCtChCCIGCjGi

:

TGCAGGGTCGTC

GA

cT

cgt

g

gc

c

T

cAacC tTaCc

agaCcaCAtGAA

g

a

G

T

T

CAAGTT

g

cA

aGa

G

260

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

423-70CG

PACTAGA

CTAATAK|AGGTGAAGTTC®®T|hTT

:

TGGTGAATCATATTGAATTGAATGAT

TAmTAACAT^

TAGTATAC1AATTGGAGTA

357

35?

GCAGGATCCCCGjAGAGGTGAAGTTCGTGGTA&ACATC!

:

AGGTGAACCTCATAGAGCTGAAGGGC

|TCJ

GCI

TGCAAGACCCGCGTCGTGGTGAAGTTCGTGGCCGTCACC

:

CGGGTGAACCGC|Tc|TGCGpAG|Tc|c

y^G|AGG?Tl

'GGCCGTCAACACCCGGGCGCGCAGGCGGGTGTG

357

360

300

MO

420

201-30CG

201-50CG

n3-30CG

CAACTAi

:

AACAATUCA

ATGTCTATATCATGATTGACAAATAGATGATCGATATCAAGATGAATCA

423

423

423

423-50CG

423-70CG

:

AATEAi

:

AACAACCTC4

AAGATTATATCAC

■GTCGCCAGGCAGAAGAACG

CCi

GGEAGTCC

CAACTGCAGCAGCCGCAGCGTCTGTATCAC

1GTCGTCAAGCGGAGGAGCG

TC

ATCAGGGCGAAAGC

1

不同长度

CG

组合的

dsgfp

片段

序列

Fig.

1

Sequeece

of

dsgfp

fragmeets

of

differeet

leegths

and

CG

cambinations

1.2.2

重组表达载体构建

1.2.2.

2

目的基因

PCR

扩增及回收

1.2.2.3

感受态细胞制备

HT119

DE3

X

代甘油超低温保存菌种以

1

110

以人工合成的目的片段为模板,使用表

1

物进行

444

-

Wu

pET-2p-Wu

Q

的片段

PCR

反应

:94

c

3

mk

94°C

30$

65

30s

,

每个循环降

0.5°C

72°C

30

17

个循环

94°C

30x56°C

30

72°C

30s,

35

个循环

72°C6

mk

7

9%

琼脂糖

含四环素

Te/

-

LB

培养基

37C

250

g

离心力培养过夜

挑取单克隆

37°C

250

y

离心力培养

7

h

o

活化后菌液

1

:

60

LB

液体培养基

Te/

37°C

250

g

离心力培养

0

~3

量至

OD

0.

4

~0.

6

将菌液冰上放置

10

凝胶电泳检测

切下目的条带运用试剂

的构建

1.2.2.

3

L4449

-

Wu

P

ET-2P-Wu

表达载体

mis,

使温度降至

0

°C

,0-

1

mol/L

CaC/

溶液同时

放置冰上预冷

4C

9

10

y

离心力

6

mk

沉淀

中加入

5

1

体积预冷后

0.

1

mo/L

CaC/

溶液悬

11

L4449

载体与

pET

-

2p

载体线性化

440

载体双酶切体系为

6

r

L

DNA

2

r

L

XhoI

2

r

L

HkSIII

2

r

L

17xFast/igesi

Green

Buff-

vr^

r

L

I

HO,

总体积为

20

r

L,37

o

C

6

mk

冰上放置

6

~37

,

4

9

000

y

离心力

10

mk

沉淀加入

27

1

体积

0.

1

mol/L

CaC/

溶液和

27

1

体积

37%

甘油

,

冰上放置

17

mk

o

菌体重

87C

17

mko

pET

-

2p

载体双酶切的体系为

6

r

L

DNA

2

r

L

N

o

U

悬,分装并

-80°C

保存

2

r

L

K

p

U

2

r

L

17xFast/igesi

724

Green

Buffer

»L

dd

0,

总体积为

2/

»L,37°C

5

min;84C

5

m

1%

琼月旨糖凝胶电泳

回收目

DNA

o

2

L4440

-

Fu

pET

-

2p

-

gfj

重组载体构

建与表达

使用

C

nExpressII

Ona

Step

Clon

p

Kit

将线

性化质粒与目的片段重组

反应体系为

50

r

L

组产物加入

62

r

L

Trans

-

T1

感受态

,

5

鱼固

LB

培养基

L440

氨节青霉素

AmppET

-

2

品卡那霉素

KaNW

37°C

过夜

次日挑取

单克隆

37C

250

g

离心力培养

5

h

o

运用表

1

引物进行菌液

PCR

验证

验证正确的菌液

5

62

接种于

LB

液体培养基中

L4444

AmupET

-

2

KaNW

37°C

250

y

心力培养

8.6

提取

进行

切验证

,剩

北京华大

基因

测序

将验证正确的质粒转入

HT118

DE3

感受

态,涂布至

LB

固体培养基上

L4444

AmppET

-2

KaNW

37°C

倒置过夜

次日挑取单克隆

87%

256

a

离心力培养

5

h

o

运用表

1

引物进行

菌液

PCR

验证,保存验证成功的菌液

1.0.8

dsgfp

的诱导表达

将验证正确的菌液

5

1

002

接种于

LB

液体

培养基

L4440

:

Amp

Tet

pET

-

2p

:

KaNa

TeU

37°C

256

p

离心力活化过夜

1

80

种于

LB

液体培养基

L440

:

AmpTet

+

pET

-

2

KaNa

+

TU

37°C

250

p

离心力培养

8.6

U

,

加入

IPTG

溶液继续振荡培养

5

ho

1

mL

菌液

提取总核酸

5%

琼月旨糖电泳检测

,41X5

J

软件灰

度分析电泳条带

将成功诱导

dsgfj

的菌液加

56%

甘油

1

1

-82C

保存

1.2.0

体外合成

dsgfp

1.0.4.

1

DNA

模板制备

将成功诱导

PFu

的菌液

5

1

002

接种于

LB

液体培养基

L4440

Amp

+

TU

pET

-

2p

:

Ka-

NaTei

+

37

o

C

256

p

离心力培养

16

~

6

h

提取

质粒

含有

T

丿

目的引物进行

PCR

,5

5%

凝胶电泳检

切下目的条带运

1

1.0.

0.

0

体外转录

退火形成

dsbu

应体系为

NTP

Buffar

Mia

16

r

L,

Temp

lata

DNA

3

r

L

2.

6

Ry

,

T

RNA

po

merasa

Mia

6

53

r

L,

总体积

20

r

L

o

37°C

温浴

4~6

将反

液于

74°C

水浴

12

m

,冷却至室温

加入

10

1

体积

Dnnsa

I

Rnnsa

A

稀释液

稀释

2/0

,

37

°C

39

m

1

r

L

合成

dsbu

溶于

6

r

L

Nn-

cleusa

-

Frea

water,

5

5%

糖凝

胶电泳检

产物

-84C

保存

1.2.0

4

种方法分别提取

-440

-

Fu

pET-2p

-

Fu

表达

PFu

1

.0.

0.

1

Trizol

52mL

4C

7522g

5mnt

沉淀加入

52

1

体积

Trizol,

震荡

室温放置

5

m

o

加入

5

1

体积氯仿

震荡

5s,

室温放置

12

mix

,

4C

6

002

n

离心

5

m

o

上清加入

2

1

体积异

丙醇

颠倒

5~6

室温静置

6

m

—,

O

C

6

002

g

离心力

12

m

o

沉淀加入

1

:

1

体积

75%

4C

7

570

g

离心力

5

m

o

重复洗涤

沉淀

室温静置

5

~12

mix

后加入

39

r

L

DEPC

解的

dsRNA

加入

12

1

体积稀释的

Rnnsa

A

Dnasa

I

消化后

,37

°C

6

mP

,

-82°C

保存

1.0.7.0

酚氯仿法

56

mL

诱导菌液

4C

7

570

y

离心力

5

m

o

沉淀加入

62

1

体积

STE

buffer,

涡旋振荡

加入

1

体积苯

酚:氯

合液

25

24

,

涡旋

102s

4C

6

002

y

5

min,

上清加入

2

1

体积异

室温

16

m

—,

O

C

6

002

g

6

m

o

沉淀加入

1

:

1

体积

75%

乙醇

4C

7

570

g

5

m

o

重复洗

沉淀室温

静置

5

~

12

mix

后加入

39

r

L

DEPC

溶解的

dsRNA

J

12

1

体积稀释的

Rnnsa

A

Dnasa

I

消化后

,37°C

6

mP

,

-82°C

保存

o

1.2.

5.

3

RNA

-

eusp

提取液

52mL

4C

7522g

离心力

5

m

,1xPBS

清洗沉淀

加入

102

1

体积

RNA

-

easy

提取液

室温

6

002

p

离心力

5

mix

上清

加入

1

体积异丙醇

室温静置

6

m

o

室温

16

002

y

离心力

16

m

o

沉淀加入

1

体积

75%

乙醇

4C

7

502

g

离心力

5

m

o

重复洗涤

沉淀室温静置

5

~16

mix

后加入

39

r

L

DEPC

溶解的

dsRNA

加入

6

1

体积稀释的

Rnasa

A

Dnasa

I

消化后

,37

°C

6

mP

,

-82°C

保存

1.0.

7.0

75%

酒精沉淀法

56

mL

诱导菌液

4C

7

570

y

离心力

5

4

常瑞

4

种原核表达双

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

725

同/自沉淀加入

25

1

体积

75%

温静置

5

dsFu

测定浓度

根据提取方法损失率

计算

pET

-2P

L440

表达的

dsFu

产量

m

o

加入

4

1

体积

66

mmo

L

NaCt

溶液

室温

静置

60

mix,

2

°C

6

002

p

离心力

6

m

上清加

6

1

体积稀释的

Rnasa

A

Dnnsa

I

化后

87

°C

5

mP

,

-84°C

保存

o

1.2.6

dsFu

浓度

纯度讽

'J

1.5

数据处理

运用

Imapa

J

软件分析载体表达

dsFu

灰度

Microsoft

offica

Excel

2/6

SPSS

25.

0

软件对

体外合成

PFu

以及菌液提取

dsFuA

26

o

/

/

A

28

4

4

1.2.6.

1

体外合成

dsFu

浓度

纯度

A262/A232

值进行多重方差分析和新复极差法进行

显著性分析

2

样本间均数比较采用配对

T

2

r

L

dsFu

样品于

B

-

570

BIOPHOTO

METER

检测

Nncleusa

-

Free

watar

分别稀释

至浓度为

002

502

252

125

62.5

8

5

05

平/

r

L

并检测

A264/

A2

54

4

A262/

A

232

稀释

dsFu

5

5%

6

结果与分析

2.

1

IPTG

诱导基于

PET-

2

P

L4440

产生

dsFu

琼脂糖凝胶电泳检测

6/

V

25

m

o

1.0.

0.

0

菌液提取

dsFu

浓度

纯度

pET

-

2

L440

IPTG

诱导表达产生

2

r

L

dsFu

样本于

B

-

570

BIOPHOTO

METER

检测

Nncleusa

-

Free

watar

分别稀释

PRNA

,

RNase

A

消化后

5

5%

琼脂糖凝胶电泳

检测

pET

-

2p

-

Fu

L4440

-

Fu

表达载体

6

2

.

4

pET

-2P.L4440

产生

dsFu

电泳条带

至浓度为

002

502

252

125

62.5

8

5

05

平/

r

L

并检测

A264/

A2

54

4

A262/

A

/32

稀释

PFu

5

6%

琼脂糖凝胶电泳检测

6/

V

25

m

o

1.2.0

损失率检测及

dsFu

产量

研究表明

,

基于

pET

-

2P

载体表达的

5

组不

同长度

不同

CG

含量的

dsFu

灰度值均高于基于

L440

载体表达的

5

/

将体外合成的

5

PFu

分别稀释至

1

002

运用以上

2

不同

CG

含量的

r

L,

39

r

L

稀释液混合至

56

mL

未经

IPTG

dsFu

具有显著差异

P<0.05

其中

法进行提取

B-

pET-2p

表达

2/1

-

39CG

以及

4/8

-

39CG

灰度

570

BIXPHOTO

METER

检测浓

^4

A

26

0

/A

28

4

>

值明显高于

L440

表达

2/1

-

39CG

4/8

-

39CG

灰度值

8

A

260

/

A

252

运用最佳提取方法分别提取

1

mL

D2000

201-30GC

201-50GC

423-30GC

423-50GC

423-70GC

DL5000D2000

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

423-70CG

500

250

+Rnase

A

*-Rnase

A

+Rnase

A

+Rnase

A

»Rnase

A

a

b

注:品基于

pET-4p

表达

dsFu

b

基于

L4440

表达/表品

D2600

分子质量标记(天根

)

其大小分别是

0

0223

22

752

502

252

100

DL5002

分子质量标记

(

TaKaRa)

其大小分别是

5

000

5

0024

0023

002

752

502

252

62

Note

:

v

:

express

dsFu

bawb

on

pET

-

0p

,

b

:

express

dsFu

bawb

on

L4447.

D2000

:

molecular mass

marker

(Tiangeu)

of

2,500,

1

,200,

756

,

502

,

256

,

102

DL5002

:

molecular

mass

marker

(

TaKaRa)

of

5

,

202

,3

,

202

,

2

,202

,

1

,202

,

750

,

562

,

250

,

62

2

基于

pET

-2p

L4440

表达

dpU

5

5%

琼脂糖凝胶电泳检测

Fig

2

Agarose

gei

electrophoresis

detection

based

dsyfu

5

6%

pET

-2p

and

L4440

eapression

706

53

pET-2p

D

L4440

0

1.

a

8

6

4

pET-2p

D

L4440

*

e

u

-

e

u

©

J

a

l

u

g/d

6sp,

a

a

/

表示在

0.93

水平上差异

显著(配

T

检验

)o

a

基于

pET-4p

L4440

表达

201

bp

dsWp

条带灰度

b

基于

pET-4p

L4449

表达

445

bp

dsWp

条带灰度

Note

:

*

means

significant

diSeresce

at

the

0.

23

level

)

paiph

T

test),

a

:

Gray

analysis

of

21

bp

dsWp

bands

expresseh

baseh

on

pET

-

4p

and

L4449

b

:

Gray

analysis

of

445

bp

dsWp

bands

expresseh

baseh

on

pET

-

4p

and

L4449

3

基于

pET-2p

L4449

表达

dse

7

5

%

琼脂糖凝胶电泳条带灰度

Fig

3

Gey

analysis

dsge

7

5

%

agarrse

get

electrrphoresis

bands

bases

on

pET

-2p

2.

3

体外合成

dsWp

浓度

纯度

研究表明

,

分别梯度稀释

6

组浓度

每组

du/

fp

44

281

均在

7

9

2.

2,

合成的

7

dsWp

纯度

较髙

稀释至

87

25

/

r

L

5

dsWp

稀释液

,

26

231

值均在

3.

4

-3.4

,

浓度过低

达到仪器检

测最

进行

出现偏差

其余

7

dsWp

稀释

4,

7

2.2

~

3.

4

5

组体外合成

dsWp

可以作为

注:

D2000

分子质量标记(天根-,

其大小分别是

2

01

1

01

750

51

250

60

Note

:

D20

00

:

mcVecy/s

mass

marUce

(

Tiangex

-

of

4

,

000

,

1

,

000

,

750

,

500

,

250

,

60

a

5

dsWp

稀释至不同浓度检测

A260/A200

;

b

5

dsWp

稀释至不同浓度检测

A260/A037

Note

:

a

:

five

gpups

dsWp

di/teh

to

diSerex)

cncen/atioss

A260/

A

255

detection

b

:

five

gropps

dsWp

di/teh

to

dikerex)

cnces/atioss

A260/

A237

detection

Fig.

2

Analysis

oO

dsge

cancentration

and

pu

UI

oO

eve

grrups

synthesfee

in

vitrr

m/egstloz

ffl

©

*

u

:

a.

,

&

s

p

L

0

z

p

CA

z

n

*

E

a

2

a

0

201-30CG201-50CG

423-50CG

423-70CG

a

b

and

L4440

eepression

4

体外合成

dge

7

5

%

琼脂糖凝胶电泳检测

Fig

4

Detection

dsge

7

5

%

agarrse

get

eUctrophoresis

1

000

ng/gL

500

ng/piL

250

ng/p.L

1

000

ng/ptL

500

ng/p.L

250

ng/|iL

125

ng/gL

62.5

ng/piL

125

ng/gL

62.5

ng/p.L

O

31.25

ng/p.L

0-

O

31.25

ng/gL

a

b

7

体外合成

7

dsge

浓度

纯度

4

常瑞等

4

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

7

7

2.

3

4

种方法提取菌液

dsRNA

6.

2.

0

取基于

L4440

载体表达

dsFu

6.0.1

取基于

pET-2p

载体表达

dsFu

研究表明

,

根据提取

dsFu

核酸检测值

,

A264/A284

A264/A232

利用

SPSS

分别构建多重比

研究表明

,

根据提取

dsFu

核酸检测值

,

A262/

A

54

A262/

A

232

利用

SPSS

分别构建多重比

较模型

,

模型截距

(

F

=

16

2/6.

446,

P

=

2.

002

)(

F

=

526.

04

,

P

=

0.002

),

提取方法因素

(F

=

25

.

043,

P

=

2.

002

)

(F

=65

338,

P

=

2.

002

)

分别

较模型

,

模型

(

F

=

5

246.

017,

P=

2.

002

)

(

F

=

739.011

,

P

=

0.002

),

提取方法因素

(F

=

32.

320,

P=

2.

002

)

(F

=

24.

035,

P

=

2.

022

)

分别

达极显著水平

浓度因素分别达到显著

(

F

=

达极显著水平

,

浓度因素分别达到显著

(

F

=

2.

363,

P=

2

.

041

)

和不显著水平

(F

=2

.

227,

P

=

2.

955

)o

新复极差法显著性检验显示不同浓度

3.453,

P=0.021)

和不显著水平

(

F

=

2.

344,

P

=

2.

882

)

新复极差法显著性检验显示不同浓度

之间差异不显著

提取纯度最高的

Trizol

法和

之间差异不显著

提取纯度最高的

Trizol

法和

氯仿法

(

CK

为对照)

且这

者差异不显著

其次

75%

氯仿法

(

CK

为对照)

且这两者差异不显著

其次

75%

,

提取纯度最低的为

RNA

-

exy

提取液

6,

7

2.5

提取纯度最低的为

RNA

-

easy

提取液

6,

7

CK

1=1

Tri

1=1

Phe

a

Ale

a

rir

CK

Tri

pET-2p-gfp

L4440-gfp

pET-2p-gfp

L4440-gfp

a

b

注:数据后附不同字母者表示在

2.

05

水平上差异显著(邓肯氏新复极差法

)

CK

体外合成

Tri

Trizol

法;

Pho

酚氯仿法

Alc

75%

精沉淀法

;RIR

:

RNA

-

小同提取液;

a

提取

pET-4p

L4447

表达/表

3

分别稀释至不同浓度检测

A260/A250

;

b

提取

pET

-

2p

L4447

表达

dsF

品分别稀释至不同浓度检测

A260/A239

Note

:

Those

with

diderent

letters

after

the

data

inddato

zigUVcant

diPerencos

at

Uo

2.05

level

(Duncat

new

multiple

range

method

)

CK

:

0-

vitro

syuthesis

;

Tri

:

Trizol

meUod

;

Phe

:

pPeuol

chloroform

mothod

;

Ale

:

75%

alcohol

precipitation

method

;

RIR

:

RNA

-

easy

extract

;

v

:

Ex

­

tract

pET

-

4p

and

L4447

to

express

dsFu

wd

dilute

to

diRereut

conceuUa

ns

to

detect

A

26

/z

7

A

28

/

b

:

ExUact

pET

-

4p

and

L4447

to

express

dr-

gp

and

dilute

to

diderent

conceuUa

ns

to

detect

A260/A

535

6

4

种方法提取

pET

-

2p

L4440

载体表达

dsyfu

纯度

Fig.

2

Purity

analysis

ot

pET

-2p

and

L444

0

vector

eapression

eatracten

by

four

methods

703

53

注:

D2000

分子质量标记(天根-其大小分别是

2

10

10

750

51

250

60

a

酚氯仿法提取基于

pET2p

表达

d

S

Wu(

Dux

I

Rnase

A

消化

稀释至

500

排株)

酚氯仿法提取基于

L4449

表达

dxfp

(经

Duel

Rnase

A

消化

稀释至

500

/

r

L

)

eT/zl

提取基于

pET2p

表达

dsWp

(经

Dux

I

R

排均

A

消化

稀释至

500

/

r

L)

:TUzoi

法提取基于

L4449

表达

dyfu

(经

Dux

I

R

排均

A

消化,稀释至

500

/

)

r

L

Note

:

D2000

:

McOecy/r

mass

marUer

(

Tiangex

)

,

its

size

is

4,200

,

1,200

,

750

,

500

,

250

,

60

a

:

Phenol

-

chlorofoun

extraction

methoP

baseh on

pET2p

expression

dsgS

(

digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

di/teh

to

500

ng/

r

L)

b

:

Phenol

-

chlorofoun

extraction

methoP

baseh

on

L4449

to

express

dsWp

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

diluteh

to

500

ng/

r

L

)

c

:

T/zol

methoP

extracts

dsWp

baseh

on

pET2p

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

diluteh

to

500

ng/

r

L

)

d

:

TUzoi

methoP

extracts

dsWp

baseh

on

L4440

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

di/teh

to

500

ng/

r

L

)

7

酚氯仿法和

Trizei

法提取

50

mL

菌液表达

dsyfe

75

%

琼脂糖凝胶电泳

Fig.

2

Pheeoi

chloroform

method

and

Trizei

method

i

eatract

5

0

mL

bacteriai

solution

i

eepress

dsge

1.5

%

aaarose

get

qectrophoresis

2.5

4

种提取方法损失率

纯度最高

与体外合成的差异最小

计算提取

研究表明

2

种方法提取后的体外合成

dsWp

与提取前的体外合成

dsWp

浓度纯

明显差

P<

损失率分别为

07

49%

23.

38%

,75%

酒精沉淀

法和

RNA

-

essp

提取液提取的

dsWp

浓度

纯度

SPSS

软件分析

差异有统计

最低,与体外合成差异最大

,

计算提取损失

分别

32.

3%

37.62%

0

0.

05

其中

酚氯

仿法和

TUzoi

法提取的

dsWp

0

9

种方法提取内标混合纯

dsyfe

浓度

、纯度

Table

0

Comparison

and

analysis

oi

the

canceetration

and

purith

oi

the

internai

standarU

miped

put

dsge

eaaadee

by

four

methods

外合成

Is

vitro

酚氯

Phenol

ChloroSmi

*

u

t

values

TUzoi

i

t

values

75%

RNA-eney

syy

thesis

T/zol

tau

*

75%

a/oPol

i

t

values

RNA-eney

extract

*

i

t

values

precipitation

*

676214±6229

浓度

/

r

L

A

200

y/

A

280

A260/A230

998.

72

±3.36

784.56

±5.27

39222

3280

15.96

760.77

±5.37

43290

3280

31.72

62320±622

70283

3260

17220

1.98

±0.24

4.35

±6.27

3

34

±00

1282±00

1218±00

1284±00

32334

41.99

1.35

±00

028±0207

"±00

6.34

0276±00

注:*表示在

0.

23

水平上差异显著

(配

T

检验-

Note

:

*

means

significant

diSeresce

at

the

0.

23

level

)

paUeh

T

test

)

4

常瑞等

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

729

2

.

3

基于

pET

-2

P

L4440

产生

dsFu

产量

dsFu

浓度,具有显著差异

(P<0-45

)o

基于

pET

-

2P

L440

表达载体

1

mL

研究表明

基于

pET-

2P

载体表达

5

组不同

长度

不同

CG

含量的

PFu

浓度均高于基于

L4442

表达

5

1

3

6

~24.

39

R

y

5.

43

~22.

47

R

y

dsFu

3

CG

pET-2p

L4440

.

30-1

5-

6

U

800-1

f"

600-

Mb

400-

M

h

pET-2p

L4440

*

表示在

2.

05

水平上差异显著(配对

F

检验

)

v

酚氯仿法提取基于

pET-2p

L4447

表达

dsFu

浓度

基于

pET

-

4p

L4447

表达

dwl

产量

Note

:

*

means

WgU

ant

PRereuce

at

the

2.

05

level

(

paireb

T

test)

v

:

Phenol

chloroform

extraction

method

baseb

on

pET

-

4p

and

L4447

express

dsFu

conceuUatUn

b

Baseb

on

pET

-

4p

and

L444

2

express

dsFu

yield

Fig

2

Analysis

ot

the

concentration

and

yielU

ot

dsyfu

eatracten

from

1

mL

bacteriai

solution

by

phenoi

chlooUvm

method

uo

e

lueouooJli

/6U^*"

200-

3

酚氯仿法提取

1

mL

菌液

dsyfu

浓度及产量

3

讨论

邹晓蕾

Eb

以及

Tyagl

4/

-

10

均报道了提

取细菌总

RNA

的方法

主要包括

Trizol

提取

pET-2p

L440

表达的

dsFu,

检测核酸浓

发现

2

个载体表达的

428

-39CG

明显高于其

4

说明

pET

-2p

L440

均具有较强的表

达能力

通过浓度分析,根据提取损失率计算

1

mL

菌液

dsFu

产量

发现基于

pET

-

2p

产生的

5

仿法以及部分市售

RNA

快速提取试剂盒

其中

Trizol

法在细菌总

RNA

提取中使用较为普

dsFu

产量均高于

L4440

产生的

5

dsFu

最高可达

24.

39

Rp/mL'

p

ET

-2p

可作为

dsFu

用异硫氧酸弧等物质迅速裂解细胞

同时抑制核

酸酶的活性

保持

RNA

的完整性,氯仿使

RNA

的相对最优表达

2

蛋白等物质相分离,为提取细菌总

提取

纯化原核表达

dsRNA

对于真核生物来

难度更大

尚无成熟方法借鉴

24

,研究采用

4

RNA

选方法

43

苯酚

-

提也是提取

细菌总

RNA

常用方法之一

利用酚反复抽提使蛋

白质变性

,

SDS

十二浣基磺酸钠

使细胞裂解

,

种常用提取细菌总

RNA

的方法

试图通过提取完

整纯净的总

RNA,

Rnasa

A

Dtse

I

消化得到

仿分层

获得含总

RNA

的水相

49

市售总

RNA

提取试剂盒成本较高

使用次数有限

不适

纯净的

dsRNA

Trizol

法和酚氯仿提取细菌总

RNA,

Rnasa

I

消化后

稀释核酸检测

A

10/

A

10

4

A264/

A

432

均值分别为

5

77

4

5

83

用于大量提取检测

故未选用进行

以体外合成

PFu

为对照

CK,

通过使用

Trizol

法和酚

RNA

,

Rnasa

A

Dnnsa

I

消化后

可得到较为纯净的

1.74

2.

1,

与体外合成

dsRNA

值差异最

1-3%

糖凝胶电泳检测后

稀释至不同浓度的

dsFu

条带均出现不同程度弥散

无法得到清晰电

dsFu,

损失率最低

RNA

-

eusp

提取液和

75%

泳图

可能存在以下原因

原核诱导表达的

dsFu

脆弱

使用有机溶剂以及提取过程中反复高速离

心损伤

dsFu

核酸检测稀释时间过长

,dsFu

在自

法提

率明显低于前者,不适用于快速

1mL

提取细菌总

RNA

以及

dsFu

与前人的研究结果

基本一

法,分

然环境下发生降解

;

电泳液含有核酸酶

712

4

结论

通过

氯仿法提取

2

种载体表达

dsF

检测

发现

着目的片段

CG

,

1

表达的

PFU

浓度及其产

渐降低

pET

-

2p

载体

表达能力高于

L4440

载体

,

uET-2p

可作为

dsFu

的相对最优表达载体

PFu

在不同环境

降解程

以及

产物分析提供了技术

参考文献

(

References

)

3]

郭文超

吐尔逊

许建军

等•马铃薯甲虫识别及其在新疆

的分布

传播和危害

[]•

新疆农业科学

226,

(5):906

-

955

.

GUO

Weuchao

:

Turxpu

,

XU

Jianjun

:

ot

aP

Potato

beetle

ibeuti-

fication

and

its

disUibution,

spread

and

harm

0-

Xinjiang

[

J

].

Xipioag

Agbcdtumi

Scie/es

:

226

,

(5)

656

-

955.

[2]

付开赞

.

RNA

干扰马铃薯甲虫(

LepOppopa

deceuli/as

[

基酸营养吸收与运输相关的基因对类胰岛素信号途径的影

[D].

南京:南京农业大学

,25

.

FU

Kaiyun.

The

yffect

ggons

selafU

io

the

obso/iPu

cP

Ooas-

poP

g

amPo

adds

to the

potato

beetle

(

Leptiptarso

UeceuUa-

eats)

by

RNA

inf/ere/e

on

the

ipUd

-

Uke

sipnaPp

pahwop

[

D]

.

Nanjing

:

Nanjing

Agricultural

University

,

225.

[3

]

San

M

K

,

Scott

f

G.

The

next

xeneraCon

of

insecticides

:

dsRNA

ft

staple

as

a

foliar

-

aqplieU

insecticide

[

J]

.

Put

Manapexent

Seance,

2613,

74(4)

821

-805.

[4]

Terenius

0,

Papanicolaou

A

,

Garbut)

J

S.

c)

al.

RNA

素廿小种平

0-

Lepiboptem

:

an

overview

of

successful

and

uuuccessPl

stud

­

ies

and

implications

for

experimeutal

desigy

J

]

Joupal

of

tped

physdfgy,

2011,57(4)

231

-245.

[5

]

Burand

J

P

,

Hunter

W

B.

RNAi

:

Future

in

insect

[

J]

.

Joueol

g

InveXebetc

Pahofpy

,

225,112

68

-

74.

[6

]

Ivashuta

S

,

Zhang

Yji

:

Wiggins

BE,)

al.

Environ

mental

RNAi

in

herbivorous

insects

[

J

].

RNA

(

Neo

Yor0

,

N.

Y.

')

,

2013

:

41

(5)

840

-856.

[7

]

Z

-

Feng

Shi

:

Jia

Fu

,

Li

-

Li

Mu,

c)

al.

Two

Leptipta/o

uridine

dipPwpPaU

N

-

ace

ucosamine

pyropPospUoryl

a

scr

are

spe

­

cialized

for

chitin

syuthesis

in

larval

epidermal

cuticle

and

midgut

peritrophic

matox

[

J

].

Irged

BiocUeuiap

and

Molecular

Biolo­

gy

,466

,68.

J

]

Li

Xiaoxxc

:

Zhang

Mingy

an

,

Zhang

Hodgyu.

RNA

素廿小种平

of

four

veuer

in

adul)

Bmdocem

dopPP

by

feebing

their

dsRNAs

[J].

Pfb

0/2211,6(3)

1

-11.

[9]

Baum

J

A

,

Bogaeri

T

,

Clinton

W,et

al.

Control

of

coleopteray

in

­

sect

pesU

throuah

RNA

murcercuce

[

J

].

Nature

OdtecOrndgy

,

53

2007,

(11)

1824-1846.

[12]

Koch

A,Kcpei

K

H.

Nex

wind

in

the

sails

:

improving

the

agro

­

nomic

value

of

crop

p

nU

throuah

RNA

-

mediaUd

xene

siPn-

cing[

J

].

Plant

BdPcOplopy

Jourual

,

226,12

(

7

)

821

-

831.

35

吴沛桥

巴晓革

胡海

等•绿色荧光蛋白

GFP

的研究进展及

应用

J].

生物医学工程研究

2029

28(1)

83

-86.

WU

Peiqivo

:

BA

Xiaogo,

HU

Hvi

:

et

al.

Research

progress

and

app/caCon

of

green

Juoresceut

protein

GFP

J

].

BdfeOaxl

E

p

gmeegp

Reseo/U

,2705,28(1)

83

-

86.

32]Juvder

BE,

Welch

J

,

Braiby

N

,3"

k.

CcwsOuc

n

and

use

of

a

Cuggpibm

sncPor

H16

so

Ulc

hyUrooeuase

promoter

(

P4H

)

fusion

to

Fu

(green

Juoresceut protein)

[J].

Peep,

226,4

(7)

X269.

[6

]

C

rk

Grznarova

P

,

Stansell

E

,

et

al.

A Mason

-

Pfizer

Monkey

Virus

Gag

-

GFP

Fusion

Vector

Allows

Visualization

of

Capsid

Transport

in

Live

Cells

and

Demonstrates

a

Role

for

MProtuPulcs

J].

Plus

O/

,

2013,

8.

[

6

]

邵美丽

郭瑞雪

韩秀英

等•趋磁细菌

RNA

提取方法的比较

研究

[

J]

.

安徽农业科学

265

,1

(5)

3680

-

5681,

5743.

SHAO

Meili

,

GUO

Ruixxc

,

HAN

Xiuying

,

e)

al.

Comparative

study

on

RNA

extraction

methoPr

of

bacteria

J]

.

AnPU

AgbcU-

tuel

Sae/es

:

2013

,

41(18)

:

5280

-

5681,

5743.

[6]

邹晓蕾

刘礼崔,罗立新•细菌总

RNA

提取方法的比较

[J].

现代食品科技

,225,29(8)

1048

-1654.

ZOU

Xiaolei

,

LIE

Licui

,

LUO

Lixin.

Comparison

of

extraction

meUods

of

bacterial

total

RNA

[

J

].

Mo

bee

Foob

Sdeyce

and

TuPpfpy,

225,29(

8)

1048

-1654.

[6

]

Deep-i

Tyagp

Autumn

L.

Rolation

of

Bacterial

RNA

from

Foods

Inoculateb

with

Patdogeu

[

J

].

Methobs

in

molecular

biology

(Clpou,

N.

J.

)

,466,195.

[17

]

Villa

-

Rodriguez

E

,

Ibarra

-

Gamea

C

,

do

lor

Santos

-

Villalo

­

bos

S.

Extraction

of

high

-

qualip

RNA

from

Bacil

r

suPtilis

with

a

lysozyme

pre

-

treatment

followeb

by

Uo

Trizol

method

J]

.

Joueol

of

Microbdlopicol

Methobs

,225.67.

[18]

Rio

D

C

Arcs

M

,

Hannon

G

J,et

al.

Purification

of

RNA

using

TRIzol

(

TRI

reagey))

[

J].

Cold

Spring

HmOor

p/Pcob

:

2010

,

(6)

:

pdb.

uroU439.

[6]

Chomczyuki

P,

Sacchi

N.

Single

-

step

method

of

RNA

isolation

by

acid

guanibinium

thiocyanate

-

pPeuol

-

chloroform

extraction

J].

1987,164(1)

186

-185.

[22]NwWepi

A

0,

Kung

A

W,

Kilby

P

M

,

c)

al.

Puri/cation

and

characterisation

of

dsRNA

using

ion

pair

reverse

pPase

chromv-

toeranPy

and

mass

spectrometry

[

J

].

Joueol

g

Ch/mPopmphy

A,

2017,

1484

14-25.

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

711

Comparativv

Study

on

the

Effed

of

4

kind

oO

dsRNA

Extraction

Methods

form

Prakaraytic

Expression

Double

-

$501

x

10

RNA

CHANG

RuU

,

WANG

Jus

2

,

FU

Kaiyys

5

,

LIAO

Lanins

5

,

DING

Xindss

5

,

HE

Jiany

5

,

GUO

Wex

av

2

,

Top/ps

AhemaP

,

REN

Yu

3

(7

Collepo

eg

Life

nnd

Geographie

Scieccos

,

KuPi

UnwersPR

,

KuPt

XiUinng

344906,

ChUa

0

.

Plant

Protection

Station

og

Xifiang

Uygun

Autonomous

Repion

,

Urumqi

332049

,

CCUa

8

.

Kop

Laboratorp

og

Ings-

graPeC

Manpunci

of

Harnfri

Crop

Vermin

of

CCUn

NortUwestern

Oasis,

Mfgpp

ug

ApPculturo

SgPUte

og

Plant

Protection

,

Xifing

PcuPemy

og

Apraultural

S

100X0

,

Ummqi

530091,

CCUa

,

MOARP

/

9

.

Xifiang

Kop

Laboratorp

og

Speciai

EuironmeUai

Mhmbflogy/IuUUe

of

AppPeC

Mhrobflopy

,

Xifiang

PcuPeuy

og

Apri-

culturai

Scfncos

,

Ummqi

530091

,

CCUa

-

Abstract

:

8

Objective

t

Pronamotlc

expression

of

dsRNA

hus

u

wiba

ranya

of

potextiai

p/ctions

is

ths

field

of

pul

cXpO

[

Methods

)

Usky

pET

-2p

and

L4440

ns

vectorscons/uci

five

yronus

of

Wu

201

-

37CG,

Wu

-201

-50

-

CG,

Wu

-423

-

30CG

,

Wu

-423

-

50CG

and

Wu

-423

-

77CG

of

differexi

/syth

and

diheresi

CG

contesi

ns

ths

tarpei

fraymesis

of

dsWp

expression

,

TUzoi

methoP

,

phesoi

ch/rofoun

mUh-

oP

,

RNA

一平均

extraction

solution

and

75%

PcoPol

precipitation

methoP

tv

extraci

lmi

and

50

mL

of

dsWp

induceS

by

isopropylthiv

-

0

-

D

-

qa/ctosiba

(IPTG)

is

bacteUai

solution

,

up

t/Sy

Nuc/lc

scib

detec

­

tion

A264/A

2

51

,

A264/A

231

compare

tha

piiUty

,

with

is

vitra

syythesis

of

PsgpD

ns

s

control

,

tv

evaluaiv

tha

平-

traction

Sscy

of

tha

fone

mathoPs

and

tha

expression

ility

of

tha

too

eCop

dspp.

ResylUg

Tha

fone

extraction

methoPs

were

ana/zeh

by

mu/ipiv

vaUasca

Pysis.

Amony

them

,

tha

TUzoi

methoP

and

tha

pPv-

soi

-

ch/roSrm

methoP

A264/A284

X

A264/A234

with

tha

highesi

ex/scFon

piiUty

1

■平每不

1.38

and

1.79

p-

spective/

;

1.73

and

9.

3

,

psp

t/Sy

,

ha

loss

rata

wss

23.

38%

,

21.

44%

.

Followeh

by

tha

75%

a/oPol

precipitation

methoP

,

tha

sveraya

valuvs

of

A264/A

254

and

A

16

1/

A434

can

reach

:

1.3

,

1.73

,

and

tha

loss

rata

s

37.

3%

3

Tha

/wu)

extraction

piiUty

is

s

tha

RNA

平均

extract

,

whose

sveraya

valuvs

of

A264/A

254

and

A264/

A234

can

reach

1.70

and

1.70

,

and

tha

loss

rata

is

s

37.

62%

.

Usinq

tha

methoP

of

mixkq

pure

dsRNA

with

intepai

standarU

,

it

wss

calcalated

thsi

par

mil/Utee

of

pET

-2P

and

L4449

expression

veetve

inSuceS

bacte

­

ria/

/quip

can

feunesi

tv

uroPuco

3.7

-24.

39

Ry

and

7.

45

-22.

4

Ry

dspp.

Usinq

intepai

standarU

mixeh

pure

dsRNA

methoP

,

tha

feunestation

of

pET

-

2P

and

L4449

expression

veetve

kSuceh

bacteUx

solution

wss

calch/teP

tv

uroPuco

3.7

-24.

39

Ry

7.

45

-22.

47

Ry

dspp.

par

md

Conclusion

]

F

ops

methoPs

nseh

tv

extract

dspp

expresseh

by

pET

-

2p

and

L4449

Tha

ha

pOenoi

chlorofoun

methoP

can

ba

ns

tv

quichiy

平-

traci

high

-

qualitp

and

high

piiUty

oroParyotic

dsgpDquShiy

pET

-

2p

is

tha

optisai

expression

of

dspp

ha

carUve

proviSgs

technicai

suppo/

S

s

tha

subs

n

i

study

of

tha

UepraSadon

deprev

of

dspp

is

diUereni

envi

­

ronments

and

tha

analysis

of

UepraSation

p

nncts.

Key

words

:

oronamotlc;

doup/

-

strandeh

RNA

ex/scFon

;

UepraSation

Fund

project

:

Usovation

esvironmest(

tales)

,

base)

cnstruction

projection

is

Xinjiang

(

a/s)

project

-

Tianshas

cehar

project)

)2018XS36)

Key

cal/vation

projects

of

scientific

and

tech

/gicai

insovadon

of

Xinjiang

Acahemy

of

Ag/ca/u

Sciences"

Monitoring

and

Ea/y

Warning

and

ComppSessive

Prevention

and

Control

of

Major

and

Neu/

IsvaPeh

AgUcatu

and

Forestp

Pests

is

Xinjiang"

(xjhcpy

-002)

Corpspo

esce

aut

hos

3•

UO

Wexchao

(

666

-

-

,

mate

,

bore

is

Hehei,

P

p

O

ssos

,

d

octo

rat

supemisos,

Research

direction

:

Integrates

manage-

mestof

AgUcatu

invasive

pests

:

(

E

-

mait)

c666@

63.

cm

FU

Kaiyys

(1987

-

-

,

mate

,

bore

is

Zhejiang

,

Post

-

doctora/

a)

Post

-

doctora/

MoPiie

Station

of

Xinjiang

AgUca/urai

U-

niversity/

Pos

-

thocto

WorUstation

of

Xinjiang

Acahemy

of

Ag/ca/u

Sciences

:

Professor

associate

,

Research

direc

­

tion

:

Integrates

managemes)

of

Ag/caturai

invasive

pests

,

(

E

-

mail

)

fukaiyu

7

@

63.

cm

2024年4月6日发(作者:漆学)

新疆农业科学

2001,53(4)

700

-7H

Xinjiany

AgUca/urai

Sciescas

doi

/

41

6448/j.

isx.

641

-

4334.

Hl.

44.413

4

RNA

dsRNA

提取方法

果评价

常瑞

3

2

,

付开*

5

,

廖兰兰

5

,

丁新华

5

,

5

,

郭文超

4

,

吐尔逊•阿合买提

5

,

任羽

1

(1

.喀什大学生命与地理科学学

3,

新疆喀什

844006

2.

新疆农业农村厅植物保护

O

,

鸟鲁木齐

830049

5.

新疆农业科学

3

植物保护研究所/

农业部西北荒漠化绿

作物有害生物综合洽理

E

点实验

I,

鸟鲁木齐

830091

4.

新疆农业科学

3

微生物

{用研究所

/

新疆特殊环境微生

GE

点实验

I,

鸟鲁木齐

836691

)

目的

构建表达不同片段长度和

GC

含量的

dseWp

片段

比较

4

dsRNA

提取方法,获得最佳的提

取方

以及dsRNA

相对

最优

的表达载体

dsRNA

的降解研究提

基础

方法

4

pET-2p

L4444

为载

分别构建

5

组不同长度

不同

CG

含量的

Op

-241

-34CG

Wp

-241

-54

-

CG

Wp

-423

-

32CG

gfp

-423

-54CG

Wp-403

-74CG

为目的片段的

dsWp

表达载体

运用

T/zoi

氯仿

RNA-

不均提取液以及

75%

酒精沉淀法分别提取

1

54

mL

经异丙基硫代

-

0

-

D

-

半乳糖

3(

(

PTG)

诱导菌液表达的

dsWu,

核酸检

A

4o/

A

4o

A

4o/

A

o/

比较纯度,

以体外合成

dsWp

为对照

评价

4

种方法提取效率及

2

种载体

dsWp

表达能

结果

4

种提取方法经多重方差分析,

其中提取纯度最高的是

TUzoi

法和酚氯仿法

A

2

00/

/

A

28

7-,A

2

00/

/

A

0

3

0

值分别可达

7

83

/

97;

7

78

2.

1,

损失率分别为

23.

83%

H

24%

其次是

75%

酒精沉淀法

A

2

00/

/

A

28

0

A

26

0/

(

A

56

均值可达

78,7

78,

损失率为

36.

8%

o

提取纯度最低的为

RNA

-

平均提取液

A

26

0/

/

A

28

9

A

26

0/

/

A

0

3

7

均值

可达

7

56

7

56,

失率

371

60%

利用内标混合

dsRNA

的方

算获得每毫

pET-2P

L4444

达载体诱导菌液可发酵产生

&7~24.39

R

g

7.28~22.47

R

g

dsWp

结论

提取

pET-2p

L4444

表达的

-W

p

,

其中酚氯仿法可用于快速提取高质量

度原核表达的

dsWp,pET

-2p

ds/u

最优表达载体

关键词

原核;双链

RNA

提取;降解

中图分类号:

S188

文献标识码:

A

文章编号

641

-

4336

(2401)44

-

4744

-

17

4

引言

研究意义

马铃薯甲虫

(

LeptUotara

decem-

Puata

Sna

专一性

安全性强

且植物生

掘更多生物防

dsRNA

生产成本高

产量无法预测

稳定性低

)

是马铃

性害虫

持续化学防治

进展

dsRNA

在环境中极

自然

并且其

使马铃

虫对部分拟除虫

氨基甲酸酯

机磷

类和微生物杀虫剂产生了抗性

3

~7

h

NA

在紫外

发现

dsR-

,4h

系统

植物

使用

RNAi

技术,喂食马铃薯甲虫涂抹

dsRNA

铃薯叶片

2

沉默马铃

机制

扩增

虫特定基

-RNA

以及有害生物对

RNAi

敏感性差别大等因

因表达

抑制马

虫的正常生

具有高

素⑷

目前

dsRNA

主要通过

3

个方法大量生

收稿日期

(Receives)

2020

-

11

-47

基金项目

勺治区创新环境(人才、

基地)建设专项(人才专项计划

-

天山雪松计划

)(

218XS36

)

新疆农业科学院科技创新重点培育专

新疆重大新发农林入侵生物监测预警与综合防控

(XU

cp

-002

)

作者简介

常瑞

(693

--

新疆人

硕士研究生

研究方向为资源微生物开发与利用

,(E-maii)

cyagpSS

@0

x

111.

cm

通信作者

文超

(

666-

)

男,

可北人

研究员

博士生导师

研究方向为农业害虫综合防治

,

E-mUi)

**********

付开赞

(

1987

-

-

浙江人

助理研究员

在站博士后

研究方向为昆虫生理生化与分子生物学

,

E-maii)fuUaiyyuC7@

65

2

anm

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

771

产:一是合成含有

T3

启动子的

-RNA

特异性引

2

外合成试剂盒合成

dsRNA

S4]

二是

原核生物

生产

-RNA,

最早用于干扰秀丽引

线虫

喂食

引线虫时可产生强烈干扰

将构

建完成的

-RNA

表达载体导入

RNase

III

缺陷型

大肠杆菌

HT115

DE3

-感受态中

经异丙基硫代

-0

-D

-

半乳糖

3

ITG

诱导

产生

dsR-

NA

2,

过转基因植物表达

dsRNA

,

使植

物具有

终生

防御性

害虫啃食植物后

2

抑制其生

死亡

为干

,1

切入点

方法可大量合成

-R-

NA,

快速高效

合成

dsRNA

可直接使用,但体外

合成试剂盒成本较高

实际大规模推广使

方法

得到大量

-RNA,

且成本较

诱导过程中

如何保

高活

持续产生

-RNA,

仍需有待研究

针对

RNAi

的特异性以及原

获得

-RNA

良好的应用

前景

pET-2p

444

为载体发酵产生

dsR-

NA

法为基础

筛选

4

种提

取菌液总

RNA

方法以提高菌液

-RNA

的获取

拟解决的关键问题

利用

720

bp

-

荧光

蛋白

Wu

[1_I5

为模板

分别随机改变碱基改变

GC

含量,并构建

5

组合的

-增

0

片段

201

bp

长度的

30%

CG

含量的

dsWp

简称

201

-

37CG

,

下同

,201

-

50CG

423

-

37CG

423

-

50CG

423

-72CG

运用试剂盒体外合成以上

7

dpf,

检测其浓度

标准

将以

6

组表达

运用

TUzoi

氯仿法

RNA-

平均

提取液

以及

75%

酒精沉淀

分另

U

提取

―增小

建立菌液表达

dsRNA

的最佳

法以及最优表达

提供理论支持

1

材料与方法

1

2

材料

1.1.1

载体

pET

-2p

L449

质粒实验室保存

1.1.6

菌株

大肠杆菌

HT115

DE3

-菌株购自上海唯地生

物技术有限公司

培养至二代菌株由该实验室保

1.1.3

主要试剂及仪器

试剂:

Truss

-

T1

感受态细胞

2xEasy

Taq

PCR

Supee

MS

全式金

琼脂糖

西班牙

LB

broth

MDBia

,

Ise

-;

卡那霉素

Kans

-

四环素

Tel

氨节青霉素

Amp

I

PTG

粉末

苯酚:氯仿

合液

20

24

SolarUia

-

提试剂盒

琼脂糖凝胶

剂盒

OMEGA

-

Hibcribe™T

2

High

Yield

RNA

Syythesis

Kii

NEB

-;限制性内切

EcoRS

NotO

HUgA

i

XhoU

Thermo

-

;

ClosEx-

pressI

I

Osa

Step

Closinq

Kit

RNA

-

essp

提取液

Vazyme

TUzoi

Reaqest

ambios

-

;

焦炭酸二乙酯

DEPC

2

Sshap

;

异丙醇

无水乙醇均为分析纯

D

se-/R

se

-

0

离心管

移液器枪头

BU

o/pix

:离心机

湘立

TGL6M

PCR

ICy-

cliny

96

梯度-

摇床

TASITEDY

-200B

-

电热恒

温干燥箱

TASITE299

-1AB

水浴锅

BATHS

-

核酸电泳系统

北京六一

DYY-6D

);

凝胶成像

系统

Wealtac

Dolphin

D

B

-

500

BIUPHOTO

METER

METASH

-

-87°C

冰箱

Thermo

ULTS1873

-

超净工作台

江苏通净

VD

-650

-

超纯水机

青岛富勒姆

FBZ0502

-

SUP

1.3

方法

1.2.3

dsfC

基因

引物合成

以来自于

720

bpWu

的序列为模板

对其基因

进行设计优化

,

变碱基

CG

含量

交由南京

瑞生物科技有限公司完成基因合成

成了

7

组不同长度组合的―增小片段

2

01

bp

长度

37%

CG

含量的

dsWp

简称

201

-

37CG

,

)、

201

-50CG

423

-30CG

423

-50CG

423

-

77CG

T

2

启动子为起始序列设计

合成引物

用于体外合成

―增小

XhoI

HUidIII

L4444

KpU

Nof

4hT

-20-

为双酶切位点设计

合成引

用于构建

444

-

0

pET

-2p

-

Wu

表达

载体

3

1

722

53

用于

dsRNA

合成

载体

构建引物序列

Table

1

POmer

Ur

dsRNA

synthesis

and

化<^

00

111

x

1:01

Prinmes

T7-G221-32-F

T7-G221-32-R

T

-

G201

-56

-F

(5tW

J

)

Sequences

(5

toO

5

TAATACGACTCACTATAGGGAATAAGTTAAGAGACTGCA

TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTTATTATCTAAC

TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

TAATACGACTCACTATAGGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

T

-G201

-56

-R

T

-G425

-30

-F

TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

TAATACGACTCACTATAGGTGATTCATCTTGATATCGATCAT

T-G425

-30

-R

T

-G425

-56

-F

TAATACGACTCACTATAGGGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

TAATACGACTCACTATAGGGGACTCCCCCTGGTGGC

TAATACGACTCACTATAGGGACTAAGTTCAGCGTGTGC

T-G425

-56

-R

T

-G425

-77

-F

T-G425

-77

-R

L-G201

-30

-F

*

L-G221-32-R

TAATACGACTCACTATAGGGCTTTCGCCCTGATGAC

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGAATAAGTTAAGAGACTGCA

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTTATTATCTAACTTGT

L

-

G201

-56

-F

L-G201

-56

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGTGATTCATCTTGATATCGATCAT

L

-

G405 -30

-F

L-G405

-30

-R

L

-

G405 -56

-F

L-G405

-56

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGGACTCCCCCTGGTGGC

L

-

G405 -77

-F

L-G405

-77

-R

GGCAGATCTGATATCAAGCTTGACTAAGTTCAGCGTGTGC

GGTACCGGGCCCCCCCTCGAGGCTTTCGCCCTGATGAC

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGAATAAGTTAAGAGACTGCA

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTTATTATCTAAC

P-G221-32-F

P-G221-32-R

P

-

G201

-56

-F

P-G201

-56

-R

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTGCAGAGAGTGCG

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTCTTCTTGCGTGTCTAACTTGTAATA

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAATGTGTCATATG

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCTGATTCATCTTGATATCGATCAT

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGATTAAGTTCAAAGAGTTCGTCGTGG

P

-

G405 -30

-F

P-G405

-30

-R

P

-

G405 -56

-F

P-G405

-56

-R

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGGACTCCCCCTGGTGGC

CTCCCGGCCGCCATGGCGGCCGCGACTAAGTTCAGCGTGTGC

AAGGGGTTATGCTAGGGTACCGTCTTTCGCCCTGATGAC

P

-

G405 -77

-F

P-G405

-77

-R

pET

-

0p/L4447uw

TAATACGACTCACTATAGGG

5

:

L

L4447

载体缩写

,

P

pET-2p

载体缩写

Note

:

*

:

L

is

the

aUbreviation

of

L4440

vector

,

P

2-

the

adbreviaUw

of

pET

-

2p

vector

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

773

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-70CG

GA

TAAGTtcA

G

gT

c

tcGtgGt

G

GGt

GtTg

cAt

TaCgtcAAgc

GAtc

GAaGTTCA

T

AtcAT

G

A

gc

G

gc

T

c

cA

c

a

g

GA

CA

Cc

H0

160

'GAA

'GU

CA|C|

180

AT

200

220

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

I

40

jat

J

at

B

a

S

gt

j

H

cmtg

I

t

T

3

T

AT

TATAATAT

1

I

(:

ICAAGTT0

201

201

hAGTT

hAGTT

mm

A.

T

'GU

taat

I

CG

C

C

TC

'CCATGAATATACCATCTTATTCAAGGACAAC

TCTAAGACCAGi

jTGCTCATCATCTTCtAi

238

230

238

423-7OCG

i

C

■CG

CGC

TC

GC

hAGTT

|TGCGC|TC

TCTGCGTCCGG

TGCGCtChCCIGCjGi

:

TGCAGGGTCGTC

GA

cT

cgt

g

gc

c

T

cAacC tTaCc

agaCcaCAtGAA

g

a

G

T

T

CAAGTT

g

cA

aGa

G

260

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

423-70CG

PACTAGA

CTAATAK|AGGTGAAGTTC®®T|hTT

:

TGGTGAATCATATTGAATTGAATGAT

TAmTAACAT^

TAGTATAC1AATTGGAGTA

357

35?

GCAGGATCCCCGjAGAGGTGAAGTTCGTGGTA&ACATC!

:

AGGTGAACCTCATAGAGCTGAAGGGC

|TCJ

GCI

TGCAAGACCCGCGTCGTGGTGAAGTTCGTGGCCGTCACC

:

CGGGTGAACCGC|Tc|TGCGpAG|Tc|c

y^G|AGG?Tl

'GGCCGTCAACACCCGGGCGCGCAGGCGGGTGTG

357

360

300

MO

420

201-30CG

201-50CG

n3-30CG

CAACTAi

:

AACAATUCA

ATGTCTATATCATGATTGACAAATAGATGATCGATATCAAGATGAATCA

423

423

423

423-50CG

423-70CG

:

AATEAi

:

AACAACCTC4

AAGATTATATCAC

■GTCGCCAGGCAGAAGAACG

CCi

GGEAGTCC

CAACTGCAGCAGCCGCAGCGTCTGTATCAC

1GTCGTCAAGCGGAGGAGCG

TC

ATCAGGGCGAAAGC

1

不同长度

CG

组合的

dsgfp

片段

序列

Fig.

1

Sequeece

of

dsgfp

fragmeets

of

differeet

leegths

and

CG

cambinations

1.2.2

重组表达载体构建

1.2.2.

2

目的基因

PCR

扩增及回收

1.2.2.3

感受态细胞制备

HT119

DE3

X

代甘油超低温保存菌种以

1

110

以人工合成的目的片段为模板,使用表

1

物进行

444

-

Wu

pET-2p-Wu

Q

的片段

PCR

反应

:94

c

3

mk

94°C

30$

65

30s

,

每个循环降

0.5°C

72°C

30

17

个循环

94°C

30x56°C

30

72°C

30s,

35

个循环

72°C6

mk

7

9%

琼脂糖

含四环素

Te/

-

LB

培养基

37C

250

g

离心力培养过夜

挑取单克隆

37°C

250

y

离心力培养

7

h

o

活化后菌液

1

:

60

LB

液体培养基

Te/

37°C

250

g

离心力培养

0

~3

量至

OD

0.

4

~0.

6

将菌液冰上放置

10

凝胶电泳检测

切下目的条带运用试剂

的构建

1.2.2.

3

L4449

-

Wu

P

ET-2P-Wu

表达载体

mis,

使温度降至

0

°C

,0-

1

mol/L

CaC/

溶液同时

放置冰上预冷

4C

9

10

y

离心力

6

mk

沉淀

中加入

5

1

体积预冷后

0.

1

mo/L

CaC/

溶液悬

11

L4449

载体与

pET

-

2p

载体线性化

440

载体双酶切体系为

6

r

L

DNA

2

r

L

XhoI

2

r

L

HkSIII

2

r

L

17xFast/igesi

Green

Buff-

vr^

r

L

I

HO,

总体积为

20

r

L,37

o

C

6

mk

冰上放置

6

~37

,

4

9

000

y

离心力

10

mk

沉淀加入

27

1

体积

0.

1

mol/L

CaC/

溶液和

27

1

体积

37%

甘油

,

冰上放置

17

mk

o

菌体重

87C

17

mko

pET

-

2p

载体双酶切的体系为

6

r

L

DNA

2

r

L

N

o

U

悬,分装并

-80°C

保存

2

r

L

K

p

U

2

r

L

17xFast/igesi

724

Green

Buffer

»L

dd

0,

总体积为

2/

»L,37°C

5

min;84C

5

m

1%

琼月旨糖凝胶电泳

回收目

DNA

o

2

L4440

-

Fu

pET

-

2p

-

gfj

重组载体构

建与表达

使用

C

nExpressII

Ona

Step

Clon

p

Kit

将线

性化质粒与目的片段重组

反应体系为

50

r

L

组产物加入

62

r

L

Trans

-

T1

感受态

,

5

鱼固

LB

培养基

L440

氨节青霉素

AmppET

-

2

品卡那霉素

KaNW

37°C

过夜

次日挑取

单克隆

37C

250

g

离心力培养

5

h

o

运用表

1

引物进行菌液

PCR

验证

验证正确的菌液

5

62

接种于

LB

液体培养基中

L4444

AmupET

-

2

KaNW

37°C

250

y

心力培养

8.6

提取

进行

切验证

,剩

北京华大

基因

测序

将验证正确的质粒转入

HT118

DE3

感受

态,涂布至

LB

固体培养基上

L4444

AmppET

-2

KaNW

37°C

倒置过夜

次日挑取单克隆

87%

256

a

离心力培养

5

h

o

运用表

1

引物进行

菌液

PCR

验证,保存验证成功的菌液

1.0.8

dsgfp

的诱导表达

将验证正确的菌液

5

1

002

接种于

LB

液体

培养基

L4440

:

Amp

Tet

pET

-

2p

:

KaNa

TeU

37°C

256

p

离心力活化过夜

1

80

种于

LB

液体培养基

L440

:

AmpTet

+

pET

-

2

KaNa

+

TU

37°C

250

p

离心力培养

8.6

U

,

加入

IPTG

溶液继续振荡培养

5

ho

1

mL

菌液

提取总核酸

5%

琼月旨糖电泳检测

,41X5

J

软件灰

度分析电泳条带

将成功诱导

dsgfj

的菌液加

56%

甘油

1

1

-82C

保存

1.2.0

体外合成

dsgfp

1.0.4.

1

DNA

模板制备

将成功诱导

PFu

的菌液

5

1

002

接种于

LB

液体培养基

L4440

Amp

+

TU

pET

-

2p

:

Ka-

NaTei

+

37

o

C

256

p

离心力培养

16

~

6

h

提取

质粒

含有

T

丿

目的引物进行

PCR

,5

5%

凝胶电泳检

切下目的条带运

1

1.0.

0.

0

体外转录

退火形成

dsbu

应体系为

NTP

Buffar

Mia

16

r

L,

Temp

lata

DNA

3

r

L

2.

6

Ry

,

T

RNA

po

merasa

Mia

6

53

r

L,

总体积

20

r

L

o

37°C

温浴

4~6

将反

液于

74°C

水浴

12

m

,冷却至室温

加入

10

1

体积

Dnnsa

I

Rnnsa

A

稀释液

稀释

2/0

,

37

°C

39

m

1

r

L

合成

dsbu

溶于

6

r

L

Nn-

cleusa

-

Frea

water,

5

5%

糖凝

胶电泳检

产物

-84C

保存

1.2.0

4

种方法分别提取

-440

-

Fu

pET-2p

-

Fu

表达

PFu

1

.0.

0.

1

Trizol

52mL

4C

7522g

5mnt

沉淀加入

52

1

体积

Trizol,

震荡

室温放置

5

m

o

加入

5

1

体积氯仿

震荡

5s,

室温放置

12

mix

,

4C

6

002

n

离心

5

m

o

上清加入

2

1

体积异

丙醇

颠倒

5~6

室温静置

6

m

—,

O

C

6

002

g

离心力

12

m

o

沉淀加入

1

:

1

体积

75%

4C

7

570

g

离心力

5

m

o

重复洗涤

沉淀

室温静置

5

~12

mix

后加入

39

r

L

DEPC

解的

dsRNA

加入

12

1

体积稀释的

Rnnsa

A

Dnasa

I

消化后

,37

°C

6

mP

,

-82°C

保存

1.0.7.0

酚氯仿法

56

mL

诱导菌液

4C

7

570

y

离心力

5

m

o

沉淀加入

62

1

体积

STE

buffer,

涡旋振荡

加入

1

体积苯

酚:氯

合液

25

24

,

涡旋

102s

4C

6

002

y

5

min,

上清加入

2

1

体积异

室温

16

m

—,

O

C

6

002

g

6

m

o

沉淀加入

1

:

1

体积

75%

乙醇

4C

7

570

g

5

m

o

重复洗

沉淀室温

静置

5

~

12

mix

后加入

39

r

L

DEPC

溶解的

dsRNA

J

12

1

体积稀释的

Rnnsa

A

Dnasa

I

消化后

,37°C

6

mP

,

-82°C

保存

o

1.2.

5.

3

RNA

-

eusp

提取液

52mL

4C

7522g

离心力

5

m

,1xPBS

清洗沉淀

加入

102

1

体积

RNA

-

easy

提取液

室温

6

002

p

离心力

5

mix

上清

加入

1

体积异丙醇

室温静置

6

m

o

室温

16

002

y

离心力

16

m

o

沉淀加入

1

体积

75%

乙醇

4C

7

502

g

离心力

5

m

o

重复洗涤

沉淀室温静置

5

~16

mix

后加入

39

r

L

DEPC

溶解的

dsRNA

加入

6

1

体积稀释的

Rnasa

A

Dnasa

I

消化后

,37

°C

6

mP

,

-82°C

保存

1.0.

7.0

75%

酒精沉淀法

56

mL

诱导菌液

4C

7

570

y

离心力

5

4

常瑞

4

种原核表达双

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

725

同/自沉淀加入

25

1

体积

75%

温静置

5

dsFu

测定浓度

根据提取方法损失率

计算

pET

-2P

L440

表达的

dsFu

产量

m

o

加入

4

1

体积

66

mmo

L

NaCt

溶液

室温

静置

60

mix,

2

°C

6

002

p

离心力

6

m

上清加

6

1

体积稀释的

Rnasa

A

Dnnsa

I

化后

87

°C

5

mP

,

-84°C

保存

o

1.2.6

dsFu

浓度

纯度讽

'J

1.5

数据处理

运用

Imapa

J

软件分析载体表达

dsFu

灰度

Microsoft

offica

Excel

2/6

SPSS

25.

0

软件对

体外合成

PFu

以及菌液提取

dsFuA

26

o

/

/

A

28

4

4

1.2.6.

1

体外合成

dsFu

浓度

纯度

A262/A232

值进行多重方差分析和新复极差法进行

显著性分析

2

样本间均数比较采用配对

T

2

r

L

dsFu

样品于

B

-

570

BIOPHOTO

METER

检测

Nncleusa

-

Free

watar

分别稀释

至浓度为

002

502

252

125

62.5

8

5

05

平/

r

L

并检测

A264/

A2

54

4

A262/

A

232

稀释

dsFu

5

5%

6

结果与分析

2.

1

IPTG

诱导基于

PET-

2

P

L4440

产生

dsFu

琼脂糖凝胶电泳检测

6/

V

25

m

o

1.0.

0.

0

菌液提取

dsFu

浓度

纯度

pET

-

2

L440

IPTG

诱导表达产生

2

r

L

dsFu

样本于

B

-

570

BIOPHOTO

METER

检测

Nncleusa

-

Free

watar

分别稀释

PRNA

,

RNase

A

消化后

5

5%

琼脂糖凝胶电泳

检测

pET

-

2p

-

Fu

L4440

-

Fu

表达载体

6

2

.

4

pET

-2P.L4440

产生

dsFu

电泳条带

至浓度为

002

502

252

125

62.5

8

5

05

平/

r

L

并检测

A264/

A2

54

4

A262/

A

/32

稀释

PFu

5

6%

琼脂糖凝胶电泳检测

6/

V

25

m

o

1.2.0

损失率检测及

dsFu

产量

研究表明

,

基于

pET

-

2P

载体表达的

5

组不

同长度

不同

CG

含量的

dsFu

灰度值均高于基于

L440

载体表达的

5

/

将体外合成的

5

PFu

分别稀释至

1

002

运用以上

2

不同

CG

含量的

r

L,

39

r

L

稀释液混合至

56

mL

未经

IPTG

dsFu

具有显著差异

P<0.05

其中

法进行提取

B-

pET-2p

表达

2/1

-

39CG

以及

4/8

-

39CG

灰度

570

BIXPHOTO

METER

检测浓

^4

A

26

0

/A

28

4

>

值明显高于

L440

表达

2/1

-

39CG

4/8

-

39CG

灰度值

8

A

260

/

A

252

运用最佳提取方法分别提取

1

mL

D2000

201-30GC

201-50GC

423-30GC

423-50GC

423-70GC

DL5000D2000

201-30CG

201-50CG

423-30CG

423-50CG

423-70CG

500

250

+Rnase

A

*-Rnase

A

+Rnase

A

+Rnase

A

»Rnase

A

a

b

注:品基于

pET-4p

表达

dsFu

b

基于

L4440

表达/表品

D2600

分子质量标记(天根

)

其大小分别是

0

0223

22

752

502

252

100

DL5002

分子质量标记

(

TaKaRa)

其大小分别是

5

000

5

0024

0023

002

752

502

252

62

Note

:

v

:

express

dsFu

bawb

on

pET

-

0p

,

b

:

express

dsFu

bawb

on

L4447.

D2000

:

molecular mass

marker

(Tiangeu)

of

2,500,

1

,200,

756

,

502

,

256

,

102

DL5002

:

molecular

mass

marker

(

TaKaRa)

of

5

,

202

,3

,

202

,

2

,202

,

1

,202

,

750

,

562

,

250

,

62

2

基于

pET

-2p

L4440

表达

dpU

5

5%

琼脂糖凝胶电泳检测

Fig

2

Agarose

gei

electrophoresis

detection

based

dsyfu

5

6%

pET

-2p

and

L4440

eapression

706

53

pET-2p

D

L4440

0

1.

a

8

6

4

pET-2p

D

L4440

*

e

u

-

e

u

©

J

a

l

u

g/d

6sp,

a

a

/

表示在

0.93

水平上差异

显著(配

T

检验

)o

a

基于

pET-4p

L4440

表达

201

bp

dsWp

条带灰度

b

基于

pET-4p

L4449

表达

445

bp

dsWp

条带灰度

Note

:

*

means

significant

diSeresce

at

the

0.

23

level

)

paiph

T

test),

a

:

Gray

analysis

of

21

bp

dsWp

bands

expresseh

baseh

on

pET

-

4p

and

L4449

b

:

Gray

analysis

of

445

bp

dsWp

bands

expresseh

baseh

on

pET

-

4p

and

L4449

3

基于

pET-2p

L4449

表达

dse

7

5

%

琼脂糖凝胶电泳条带灰度

Fig

3

Gey

analysis

dsge

7

5

%

agarrse

get

electrrphoresis

bands

bases

on

pET

-2p

2.

3

体外合成

dsWp

浓度

纯度

研究表明

,

分别梯度稀释

6

组浓度

每组

du/

fp

44

281

均在

7

9

2.

2,

合成的

7

dsWp

纯度

较髙

稀释至

87

25

/

r

L

5

dsWp

稀释液

,

26

231

值均在

3.

4

-3.4

,

浓度过低

达到仪器检

测最

进行

出现偏差

其余

7

dsWp

稀释

4,

7

2.2

~

3.

4

5

组体外合成

dsWp

可以作为

注:

D2000

分子质量标记(天根-,

其大小分别是

2

01

1

01

750

51

250

60

Note

:

D20

00

:

mcVecy/s

mass

marUce

(

Tiangex

-

of

4

,

000

,

1

,

000

,

750

,

500

,

250

,

60

a

5

dsWp

稀释至不同浓度检测

A260/A200

;

b

5

dsWp

稀释至不同浓度检测

A260/A037

Note

:

a

:

five

gpups

dsWp

di/teh

to

diSerex)

cncen/atioss

A260/

A

255

detection

b

:

five

gropps

dsWp

di/teh

to

dikerex)

cnces/atioss

A260/

A237

detection

Fig.

2

Analysis

oO

dsge

cancentration

and

pu

UI

oO

eve

grrups

synthesfee

in

vitrr

m/egstloz

ffl

©

*

u

:

a.

,

&

s

p

L

0

z

p

CA

z

n

*

E

a

2

a

0

201-30CG201-50CG

423-50CG

423-70CG

a

b

and

L4440

eepression

4

体外合成

dge

7

5

%

琼脂糖凝胶电泳检测

Fig

4

Detection

dsge

7

5

%

agarrse

get

eUctrophoresis

1

000

ng/gL

500

ng/piL

250

ng/p.L

1

000

ng/ptL

500

ng/p.L

250

ng/|iL

125

ng/gL

62.5

ng/piL

125

ng/gL

62.5

ng/p.L

O

31.25

ng/p.L

0-

O

31.25

ng/gL

a

b

7

体外合成

7

dsge

浓度

纯度

4

常瑞等

4

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

7

7

2.

3

4

种方法提取菌液

dsRNA

6.

2.

0

取基于

L4440

载体表达

dsFu

6.0.1

取基于

pET-2p

载体表达

dsFu

研究表明

,

根据提取

dsFu

核酸检测值

,

A264/A284

A264/A232

利用

SPSS

分别构建多重比

研究表明

,

根据提取

dsFu

核酸检测值

,

A262/

A

54

A262/

A

232

利用

SPSS

分别构建多重比

较模型

,

模型截距

(

F

=

16

2/6.

446,

P

=

2.

002

)(

F

=

526.

04

,

P

=

0.002

),

提取方法因素

(F

=

25

.

043,

P

=

2.

002

)

(F

=65

338,

P

=

2.

002

)

分别

较模型

,

模型

(

F

=

5

246.

017,

P=

2.

002

)

(

F

=

739.011

,

P

=

0.002

),

提取方法因素

(F

=

32.

320,

P=

2.

002

)

(F

=

24.

035,

P

=

2.

022

)

分别

达极显著水平

浓度因素分别达到显著

(

F

=

达极显著水平

,

浓度因素分别达到显著

(

F

=

2.

363,

P=

2

.

041

)

和不显著水平

(F

=2

.

227,

P

=

2.

955

)o

新复极差法显著性检验显示不同浓度

3.453,

P=0.021)

和不显著水平

(

F

=

2.

344,

P

=

2.

882

)

新复极差法显著性检验显示不同浓度

之间差异不显著

提取纯度最高的

Trizol

法和

之间差异不显著

提取纯度最高的

Trizol

法和

氯仿法

(

CK

为对照)

且这

者差异不显著

其次

75%

氯仿法

(

CK

为对照)

且这两者差异不显著

其次

75%

,

提取纯度最低的为

RNA

-

exy

提取液

6,

7

2.5

提取纯度最低的为

RNA

-

easy

提取液

6,

7

CK

1=1

Tri

1=1

Phe

a

Ale

a

rir

CK

Tri

pET-2p-gfp

L4440-gfp

pET-2p-gfp

L4440-gfp

a

b

注:数据后附不同字母者表示在

2.

05

水平上差异显著(邓肯氏新复极差法

)

CK

体外合成

Tri

Trizol

法;

Pho

酚氯仿法

Alc

75%

精沉淀法

;RIR

:

RNA

-

小同提取液;

a

提取

pET-4p

L4447

表达/表

3

分别稀释至不同浓度检测

A260/A250

;

b

提取

pET

-

2p

L4447

表达

dsF

品分别稀释至不同浓度检测

A260/A239

Note

:

Those

with

diderent

letters

after

the

data

inddato

zigUVcant

diPerencos

at

Uo

2.05

level

(Duncat

new

multiple

range

method

)

CK

:

0-

vitro

syuthesis

;

Tri

:

Trizol

meUod

;

Phe

:

pPeuol

chloroform

mothod

;

Ale

:

75%

alcohol

precipitation

method

;

RIR

:

RNA

-

easy

extract

;

v

:

Ex

­

tract

pET

-

4p

and

L4447

to

express

dsFu

wd

dilute

to

diRereut

conceuUa

ns

to

detect

A

26

/z

7

A

28

/

b

:

ExUact

pET

-

4p

and

L4447

to

express

dr-

gp

and

dilute

to

diderent

conceuUa

ns

to

detect

A260/A

535

6

4

种方法提取

pET

-

2p

L4440

载体表达

dsyfu

纯度

Fig.

2

Purity

analysis

ot

pET

-2p

and

L444

0

vector

eapression

eatracten

by

four

methods

703

53

注:

D2000

分子质量标记(天根-其大小分别是

2

10

10

750

51

250

60

a

酚氯仿法提取基于

pET2p

表达

d

S

Wu(

Dux

I

Rnase

A

消化

稀释至

500

排株)

酚氯仿法提取基于

L4449

表达

dxfp

(经

Duel

Rnase

A

消化

稀释至

500

/

r

L

)

eT/zl

提取基于

pET2p

表达

dsWp

(经

Dux

I

R

排均

A

消化

稀释至

500

/

r

L)

:TUzoi

法提取基于

L4449

表达

dyfu

(经

Dux

I

R

排均

A

消化,稀释至

500

/

)

r

L

Note

:

D2000

:

McOecy/r

mass

marUer

(

Tiangex

)

,

its

size

is

4,200

,

1,200

,

750

,

500

,

250

,

60

a

:

Phenol

-

chlorofoun

extraction

methoP

baseh on

pET2p

expression

dsgS

(

digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

di/teh

to

500

ng/

r

L)

b

:

Phenol

-

chlorofoun

extraction

methoP

baseh

on

L4449

to

express

dsWp

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

diluteh

to

500

ng/

r

L

)

c

:

T/zol

methoP

extracts

dsWp

baseh

on

pET2p

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

diluteh

to

500

ng/

r

L

)

d

:

TUzoi

methoP

extracts

dsWp

baseh

on

L4440

(digeXeS

with

Dnase

I

and

Rnase

A

,

di/teh

to

500

ng/

r

L

)

7

酚氯仿法和

Trizei

法提取

50

mL

菌液表达

dsyfe

75

%

琼脂糖凝胶电泳

Fig.

2

Pheeoi

chloroform

method

and

Trizei

method

i

eatract

5

0

mL

bacteriai

solution

i

eepress

dsge

1.5

%

aaarose

get

qectrophoresis

2.5

4

种提取方法损失率

纯度最高

与体外合成的差异最小

计算提取

研究表明

2

种方法提取后的体外合成

dsWp

与提取前的体外合成

dsWp

浓度纯

明显差

P<

损失率分别为

07

49%

23.

38%

,75%

酒精沉淀

法和

RNA

-

essp

提取液提取的

dsWp

浓度

纯度

SPSS

软件分析

差异有统计

最低,与体外合成差异最大

,

计算提取损失

分别

32.

3%

37.62%

0

0.

05

其中

酚氯

仿法和

TUzoi

法提取的

dsWp

0

9

种方法提取内标混合纯

dsyfe

浓度

、纯度

Table

0

Comparison

and

analysis

oi

the

canceetration

and

purith

oi

the

internai

standarU

miped

put

dsge

eaaadee

by

four

methods

外合成

Is

vitro

酚氯

Phenol

ChloroSmi

*

u

t

values

TUzoi

i

t

values

75%

RNA-eney

syy

thesis

T/zol

tau

*

75%

a/oPol

i

t

values

RNA-eney

extract

*

i

t

values

precipitation

*

676214±6229

浓度

/

r

L

A

200

y/

A

280

A260/A230

998.

72

±3.36

784.56

±5.27

39222

3280

15.96

760.77

±5.37

43290

3280

31.72

62320±622

70283

3260

17220

1.98

±0.24

4.35

±6.27

3

34

±00

1282±00

1218±00

1284±00

32334

41.99

1.35

±00

028±0207

"±00

6.34

0276±00

注:*表示在

0.

23

水平上差异显著

(配

T

检验-

Note

:

*

means

significant

diSeresce

at

the

0.

23

level

)

paUeh

T

test

)

4

常瑞等

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

729

2

.

3

基于

pET

-2

P

L4440

产生

dsFu

产量

dsFu

浓度,具有显著差异

(P<0-45

)o

基于

pET

-

2P

L440

表达载体

1

mL

研究表明

基于

pET-

2P

载体表达

5

组不同

长度

不同

CG

含量的

PFu

浓度均高于基于

L4442

表达

5

1

3

6

~24.

39

R

y

5.

43

~22.

47

R

y

dsFu

3

CG

pET-2p

L4440

.

30-1

5-

6

U

800-1

f"

600-

Mb

400-

M

h

pET-2p

L4440

*

表示在

2.

05

水平上差异显著(配对

F

检验

)

v

酚氯仿法提取基于

pET-2p

L4447

表达

dsFu

浓度

基于

pET

-

4p

L4447

表达

dwl

产量

Note

:

*

means

WgU

ant

PRereuce

at

the

2.

05

level

(

paireb

T

test)

v

:

Phenol

chloroform

extraction

method

baseb

on

pET

-

4p

and

L4447

express

dsFu

conceuUatUn

b

Baseb

on

pET

-

4p

and

L444

2

express

dsFu

yield

Fig

2

Analysis

ot

the

concentration

and

yielU

ot

dsyfu

eatracten

from

1

mL

bacteriai

solution

by

phenoi

chlooUvm

method

uo

e

lueouooJli

/6U^*"

200-

3

酚氯仿法提取

1

mL

菌液

dsyfu

浓度及产量

3

讨论

邹晓蕾

Eb

以及

Tyagl

4/

-

10

均报道了提

取细菌总

RNA

的方法

主要包括

Trizol

提取

pET-2p

L440

表达的

dsFu,

检测核酸浓

发现

2

个载体表达的

428

-39CG

明显高于其

4

说明

pET

-2p

L440

均具有较强的表

达能力

通过浓度分析,根据提取损失率计算

1

mL

菌液

dsFu

产量

发现基于

pET

-

2p

产生的

5

仿法以及部分市售

RNA

快速提取试剂盒

其中

Trizol

法在细菌总

RNA

提取中使用较为普

dsFu

产量均高于

L4440

产生的

5

dsFu

最高可达

24.

39

Rp/mL'

p

ET

-2p

可作为

dsFu

用异硫氧酸弧等物质迅速裂解细胞

同时抑制核

酸酶的活性

保持

RNA

的完整性,氯仿使

RNA

的相对最优表达

2

蛋白等物质相分离,为提取细菌总

提取

纯化原核表达

dsRNA

对于真核生物来

难度更大

尚无成熟方法借鉴

24

,研究采用

4

RNA

选方法

43

苯酚

-

提也是提取

细菌总

RNA

常用方法之一

利用酚反复抽提使蛋

白质变性

,

SDS

十二浣基磺酸钠

使细胞裂解

,

种常用提取细菌总

RNA

的方法

试图通过提取完

整纯净的总

RNA,

Rnasa

A

Dtse

I

消化得到

仿分层

获得含总

RNA

的水相

49

市售总

RNA

提取试剂盒成本较高

使用次数有限

不适

纯净的

dsRNA

Trizol

法和酚氯仿提取细菌总

RNA,

Rnasa

I

消化后

稀释核酸检测

A

10/

A

10

4

A264/

A

432

均值分别为

5

77

4

5

83

用于大量提取检测

故未选用进行

以体外合成

PFu

为对照

CK,

通过使用

Trizol

法和酚

RNA

,

Rnasa

A

Dnnsa

I

消化后

可得到较为纯净的

1.74

2.

1,

与体外合成

dsRNA

值差异最

1-3%

糖凝胶电泳检测后

稀释至不同浓度的

dsFu

条带均出现不同程度弥散

无法得到清晰电

dsFu,

损失率最低

RNA

-

eusp

提取液和

75%

泳图

可能存在以下原因

原核诱导表达的

dsFu

脆弱

使用有机溶剂以及提取过程中反复高速离

心损伤

dsFu

核酸检测稀释时间过长

,dsFu

在自

法提

率明显低于前者,不适用于快速

1mL

提取细菌总

RNA

以及

dsFu

与前人的研究结果

基本一

法,分

然环境下发生降解

;

电泳液含有核酸酶

712

4

结论

通过

氯仿法提取

2

种载体表达

dsF

检测

发现

着目的片段

CG

,

1

表达的

PFU

浓度及其产

渐降低

pET

-

2p

载体

表达能力高于

L4440

载体

,

uET-2p

可作为

dsFu

的相对最优表达载体

PFu

在不同环境

降解程

以及

产物分析提供了技术

参考文献

(

References

)

3]

郭文超

吐尔逊

许建军

等•马铃薯甲虫识别及其在新疆

的分布

传播和危害

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新疆农业科学

226,

(5):906

-

955

.

GUO

Weuchao

:

Turxpu

,

XU

Jianjun

:

ot

aP

Potato

beetle

ibeuti-

fication

and

its

disUibution,

spread

and

harm

0-

Xinjiang

[

J

].

Xipioag

Agbcdtumi

Scie/es

:

226

,

(5)

656

-

955.

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LepOppopa

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The

yffect

ggons

selafU

io

the

obso/iPu

cP

Ooas-

poP

g

amPo

adds

to the

potato

beetle

(

Leptiptarso

UeceuUa-

eats)

by

RNA

inf/ere/e

on

the

ipUd

-

Uke

sipnaPp

pahwop

[

D]

.

Nanjing

:

Nanjing

Agricultural

University

,

225.

[3

]

San

M

K

,

Scott

f

G.

The

next

xeneraCon

of

insecticides

:

dsRNA

ft

staple

as

a

foliar

-

aqplieU

insecticide

[

J]

.

Put

Manapexent

Seance,

2613,

74(4)

821

-805.

[4]

Terenius

0,

Papanicolaou

A

,

Garbut)

J

S.

c)

al.

RNA

素廿小种平

0-

Lepiboptem

:

an

overview

of

successful

and

uuuccessPl

stud

­

ies

and

implications

for

experimeutal

desigy

J

]

Joupal

of

tped

physdfgy,

2011,57(4)

231

-245.

[5

]

Burand

J

P

,

Hunter

W

B.

RNAi

:

Future

in

insect

[

J]

.

Joueol

g

InveXebetc

Pahofpy

,

225,112

68

-

74.

[6

]

Ivashuta

S

,

Zhang

Yji

:

Wiggins

BE,)

al.

Environ

mental

RNAi

in

herbivorous

insects

[

J

].

RNA

(

Neo

Yor0

,

N.

Y.

')

,

2013

:

41

(5)

840

-856.

[7

]

Z

-

Feng

Shi

:

Jia

Fu

,

Li

-

Li

Mu,

c)

al.

Two

Leptipta/o

uridine

dipPwpPaU

N

-

ace

ucosamine

pyropPospUoryl

a

scr

are

spe

­

cialized

for

chitin

syuthesis

in

larval

epidermal

cuticle

and

midgut

peritrophic

matox

[

J

].

Irged

BiocUeuiap

and

Molecular

Biolo­

gy

,466

,68.

J

]

Li

Xiaoxxc

:

Zhang

Mingy

an

,

Zhang

Hodgyu.

RNA

素廿小种平

of

four

veuer

in

adul)

Bmdocem

dopPP

by

feebing

their

dsRNAs

[J].

Pfb

0/2211,6(3)

1

-11.

[9]

Baum

J

A

,

Bogaeri

T

,

Clinton

W,et

al.

Control

of

coleopteray

in

­

sect

pesU

throuah

RNA

murcercuce

[

J

].

Nature

OdtecOrndgy

,

53

2007,

(11)

1824-1846.

[12]

Koch

A,Kcpei

K

H.

Nex

wind

in

the

sails

:

improving

the

agro

­

nomic

value

of

crop

p

nU

throuah

RNA

-

mediaUd

xene

siPn-

cing[

J

].

Plant

BdPcOplopy

Jourual

,

226,12

(

7

)

821

-

831.

35

吴沛桥

巴晓革

胡海

等•绿色荧光蛋白

GFP

的研究进展及

应用

J].

生物医学工程研究

2029

28(1)

83

-86.

WU

Peiqivo

:

BA

Xiaogo,

HU

Hvi

:

et

al.

Research

progress

and

app/caCon

of

green

Juoresceut

protein

GFP

J

].

BdfeOaxl

E

p

gmeegp

Reseo/U

,2705,28(1)

83

-

86.

32]Juvder

BE,

Welch

J

,

Braiby

N

,3"

k.

CcwsOuc

n

and

use

of

a

Cuggpibm

sncPor

H16

so

Ulc

hyUrooeuase

promoter

(

P4H

)

fusion

to

Fu

(green

Juoresceut protein)

[J].

Peep,

226,4

(7)

X269.

[6

]

C

rk

Grznarova

P

,

Stansell

E

,

et

al.

A Mason

-

Pfizer

Monkey

Virus

Gag

-

GFP

Fusion

Vector

Allows

Visualization

of

Capsid

Transport

in

Live

Cells

and

Demonstrates

a

Role

for

MProtuPulcs

J].

Plus

O/

,

2013,

8.

[

6

]

邵美丽

郭瑞雪

韩秀英

等•趋磁细菌

RNA

提取方法的比较

研究

[

J]

.

安徽农业科学

265

,1

(5)

3680

-

5681,

5743.

SHAO

Meili

,

GUO

Ruixxc

,

HAN

Xiuying

,

e)

al.

Comparative

study

on

RNA

extraction

methoPr

of

bacteria

J]

.

AnPU

AgbcU-

tuel

Sae/es

:

2013

,

41(18)

:

5280

-

5681,

5743.

[6]

邹晓蕾

刘礼崔,罗立新•细菌总

RNA

提取方法的比较

[J].

现代食品科技

,225,29(8)

1048

-1654.

ZOU

Xiaolei

,

LIE

Licui

,

LUO

Lixin.

Comparison

of

extraction

meUods

of

bacterial

total

RNA

[

J

].

Mo

bee

Foob

Sdeyce

and

TuPpfpy,

225,29(

8)

1048

-1654.

[6

]

Deep-i

Tyagp

Autumn

L.

Rolation

of

Bacterial

RNA

from

Foods

Inoculateb

with

Patdogeu

[

J

].

Methobs

in

molecular

biology

(Clpou,

N.

J.

)

,466,195.

[17

]

Villa

-

Rodriguez

E

,

Ibarra

-

Gamea

C

,

do

lor

Santos

-

Villalo

­

bos

S.

Extraction

of

high

-

qualip

RNA

from

Bacil

r

suPtilis

with

a

lysozyme

pre

-

treatment

followeb

by

Uo

Trizol

method

J]

.

Joueol

of

Microbdlopicol

Methobs

,225.67.

[18]

Rio

D

C

Arcs

M

,

Hannon

G

J,et

al.

Purification

of

RNA

using

TRIzol

(

TRI

reagey))

[

J].

Cold

Spring

HmOor

p/Pcob

:

2010

,

(6)

:

pdb.

uroU439.

[6]

Chomczyuki

P,

Sacchi

N.

Single

-

step

method

of

RNA

isolation

by

acid

guanibinium

thiocyanate

-

pPeuol

-

chloroform

extraction

J].

1987,164(1)

186

-185.

[22]NwWepi

A

0,

Kung

A

W,

Kilby

P

M

,

c)

al.

Puri/cation

and

characterisation

of

dsRNA

using

ion

pair

reverse

pPase

chromv-

toeranPy

and

mass

spectrometry

[

J

].

Joueol

g

Ch/mPopmphy

A,

2017,

1484

14-25.

9

常瑞等

7

种原核表达双链

RNA

dsRNA

提取方法效果评价

711

Comparativv

Study

on

the

Effed

of

4

kind

oO

dsRNA

Extraction

Methods

form

Prakaraytic

Expression

Double

-

$501

x

10

RNA

CHANG

RuU

,

WANG

Jus

2

,

FU

Kaiyys

5

,

LIAO

Lanins

5

,

DING

Xindss

5

,

HE

Jiany

5

,

GUO

Wex

av

2

,

Top/ps

AhemaP

,

REN

Yu

3

(7

Collepo

eg

Life

nnd

Geographie

Scieccos

,

KuPi

UnwersPR

,

KuPt

XiUinng

344906,

ChUa

0

.

Plant

Protection

Station

og

Xifiang

Uygun

Autonomous

Repion

,

Urumqi

332049

,

CCUa

8

.

Kop

Laboratorp

og

Ings-

graPeC

Manpunci

of

Harnfri

Crop

Vermin

of

CCUn

NortUwestern

Oasis,

Mfgpp

ug

ApPculturo

SgPUte

og

Plant

Protection

,

Xifing

PcuPemy

og

Apraultural

S

100X0

,

Ummqi

530091,

CCUa

,

MOARP

/

9

.

Xifiang

Kop

Laboratorp

og

Speciai

EuironmeUai

Mhmbflogy/IuUUe

of

AppPeC

Mhrobflopy

,

Xifiang

PcuPeuy

og

Apri-

culturai

Scfncos

,

Ummqi

530091

,

CCUa

-

Abstract

:

8

Objective

t

Pronamotlc

expression

of

dsRNA

hus

u

wiba

ranya

of

potextiai

p/ctions

is

ths

field

of

pul

cXpO

[

Methods

)

Usky

pET

-2p

and

L4440

ns

vectorscons/uci

five

yronus

of

Wu

201

-

37CG,

Wu

-201

-50

-

CG,

Wu

-423

-

30CG

,

Wu

-423

-

50CG

and

Wu

-423

-

77CG

of

differexi

/syth

and

diheresi

CG

contesi

ns

ths

tarpei

fraymesis

of

dsWp

expression

,

TUzoi

methoP

,

phesoi

ch/rofoun

mUh-

oP

,

RNA

一平均

extraction

solution

and

75%

PcoPol

precipitation

methoP

tv

extraci

lmi

and

50

mL

of

dsWp

induceS

by

isopropylthiv

-

0

-

D

-

qa/ctosiba

(IPTG)

is

bacteUai

solution

,

up

t/Sy

Nuc/lc

scib

detec

­

tion

A264/A

2

51

,

A264/A

231

compare

tha

piiUty

,

with

is

vitra

syythesis

of

PsgpD

ns

s

control

,

tv

evaluaiv

tha

平-

traction

Sscy

of

tha

fone

mathoPs

and

tha

expression

ility

of

tha

too

eCop

dspp.

ResylUg

Tha

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extraction

methoPs

were

ana/zeh

by

mu/ipiv

vaUasca

Pysis.

Amony

them

,

tha

TUzoi

methoP

and

tha

pPv-

soi

-

ch/roSrm

methoP

A264/A284

X

A264/A234

with

tha

highesi

ex/scFon

piiUty

1

■平每不

1.38

and

1.79

p-

spective/

;

1.73

and

9.

3

,

psp

t/Sy

,

ha

loss

rata

wss

23.

38%

,

21.

44%

.

Followeh

by

tha

75%

a/oPol

precipitation

methoP

,

tha

sveraya

valuvs

of

A264/A

254

and

A

16

1/

A434

can

reach

:

1.3

,

1.73

,

and

tha

loss

rata

s

37.

3%

3

Tha

/wu)

extraction

piiUty

is

s

tha

RNA

平均

extract

,

whose

sveraya

valuvs

of

A264/A

254

and

A264/

A234

can

reach

1.70

and

1.70

,

and

tha

loss

rata

is

s

37.

62%

.

Usinq

tha

methoP

of

mixkq

pure

dsRNA

with

intepai

standarU

,

it

wss

calcalated

thsi

par

mil/Utee

of

pET

-2P

and

L4449

expression

veetve

inSuceS

bacte

­

ria/

/quip

can

feunesi

tv

uroPuco

3.7

-24.

39

Ry

and

7.

45

-22.

4

Ry

dspp.

Usinq

intepai

standarU

mixeh

pure

dsRNA

methoP

,

tha

feunestation

of

pET

-

2P

and

L4449

expression

veetve

kSuceh

bacteUx

solution

wss

calch/teP

tv

uroPuco

3.7

-24.

39

Ry

7.

45

-22.

47

Ry

dspp.

par

md

Conclusion

]

F

ops

methoPs

nseh

tv

extract

dspp

expresseh

by

pET

-

2p

and

L4449

Tha

ha

pOenoi

chlorofoun

methoP

can

ba

ns

tv

quichiy

平-

traci

high

-

qualitp

and

high

piiUty

oroParyotic

dsgpDquShiy

pET

-

2p

is

tha

optisai

expression

of

dspp

ha

carUve

proviSgs

technicai

suppo/

S

s

tha

subs

n

i

study

of

tha

UepraSadon

deprev

of

dspp

is

diUereni

envi

­

ronments

and

tha

analysis

of

UepraSation

p

nncts.

Key

words

:

oronamotlc;

doup/

-

strandeh

RNA

ex/scFon

;

UepraSation

Fund

project

:

Usovation

esvironmest(

tales)

,

base)

cnstruction

projection

is

Xinjiang

(

a/s)

project

-

Tianshas

cehar

project)

)2018XS36)

Key

cal/vation

projects

of

scientific

and

tech

/gicai

insovadon

of

Xinjiang

Acahemy

of

Ag/ca/u

Sciences"

Monitoring

and

Ea/y

Warning

and

ComppSessive

Prevention

and

Control

of

Major

and

Neu/

IsvaPeh

AgUcatu

and

Forestp

Pests

is

Xinjiang"

(xjhcpy

-002)

Corpspo

esce

aut

hos

3•

UO

Wexchao

(

666

-

-

,

mate

,

bore

is

Hehei,

P

p

O

ssos

,

d

octo

rat

supemisos,

Research

direction

:

Integrates

manage-

mestof

AgUcatu

invasive

pests

:

(

E

-

mait)

c666@

63.

cm

FU

Kaiyys

(1987

-

-

,

mate

,

bore

is

Zhejiang

,

Post

-

doctora/

a)

Post

-

doctora/

MoPiie

Station

of

Xinjiang

AgUca/urai

U-

niversity/

Pos

-

thocto

WorUstation

of

Xinjiang

Acahemy

of

Ag/ca/u

Sciences

:

Professor

associate

,

Research

direc

­

tion

:

Integrates

managemes)

of

Ag/caturai

invasive

pests

,

(

E

-

mail

)

fukaiyu

7

@

63.

cm

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