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逆转录酶活性检测荧光定量PCR方法

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2024年5月23日发(作者:羿暄和)

逆转录酶活性检测荧光定量 PCR 方法

孔艳 吴小红 杨立宏 安祺 董关木 俞永新

【摘要】

目的 在我们传统 PERT 方法的基础上建立荧光实时定量逆转录 PCR

( Real-time Quantitive Reverse Transcription Polymerase Chain

Reaction)检测方法,使得检测灵敏度进一步增强。

方法 以噬菌体 MS2 RNA 为模板,应用标准 AMV 逆转录酶催化体外

逆转录反应合成相应 cDNA.实时荧光定量 PCR 法检测底物 cDNA 模

板量,进而得出逆转录酶的相对活性。

结果 将 AMV 逆转录酶标准 10 倍倍比连续稀释后催化逆转录反应,

实时荧光定量 PCR 分析所得的逆转录产物 cDNA, 得到标准荧光值

曲线,从而间接推测样品中有无逆转录病毒污染。

结论 成功建立了基于实时荧光定量 PCR 检测逆转录酶活性的新型

方法,为生物制品外来污染尤其是逆转录病毒的污染的检测提供了参

考指标。

【关键词】荧光定量 PCR 检测法;逆转录酶; 逆转录酶是所有逆转录

病毒的一个重要标志,目前逆转录病毒的

检测方法被普遍应用的是以 PCR 为基本方法的逆转录酶活性检测法

Ulyra Sensitive Product Enhanced Reverse Transcriptase(PERT),我们曾

经在国内首次报道了逆转录酶的 PERT 检测方法,但传统 PERT 方

作者单位:100050 北京 中国药品生物制品检定所 通讯作者:孔艳,

Email:*****************.cn

法的实验过程容易造成污染和假阳性,并且无法做到实时监控。本次

报导是在原有方法的基础上

( 1 )

,以噬菌体 MS2 RNA 为模板合成引物

和探针,建立检测逆转录酶活性的实时荧光定量 PCR 方法

( 2 )

荧光实时定量 PCR 技术是由美国 Applied Biosysems 公司推出,

20 世纪 90 年代发展起来

( 3 )

。在 PCR 反应系统中加入荧光基因利用

荧光信号积累实时检测整个 PCR 过程,最后通过标准曲线对未知模

板进行定量分析的方法。由于引入了荧光标记探针提高了方法的高灵

敏性,可直接监测扩增中的荧光信号变化获得定量结果,定量和扩增

同步进行,克服了 PCR 的平台效应的特点,使方法具有高精确性,

能实现多重反应、无污染性、因此方法具有高特异性、实时性和可靠

性等特点。目前已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、免疫分析、 基

因表达、突变和多态性研究等多个领域

( 4 )

我们所建立的检测逆转录酶活性的荧光实时定量 PCR 方法与普

通 PERT 方法相比,实验操作过程减少,所使用的起始模版量仅为传

统 PERT 法的 1/50,降低气溶胶等外来核酸造成的污染,同时通过样

品的 PCR 扩增产物变化曲线对感染病毒的数量达到精确定量。

1 材料与方法:

1.1 材料

1.1.1 引物的设计:在我们以往设计的引物基础上,再合成一条探针

并分别在 5`端加上 FAM 荧光素, 3`端加上 TAMRA 荧光素。即以噬菌

体 MS2 RNA 为模板设计引物:RT-1: (5`-d(GCC TTA GCA GTG CCC

TGT CT)-3`) ,RT-2: (5`-d(AAC ATG CTC GAG GGC CTTA)-3`),

2024年5月23日发(作者:羿暄和)

逆转录酶活性检测荧光定量 PCR 方法

孔艳 吴小红 杨立宏 安祺 董关木 俞永新

【摘要】

目的 在我们传统 PERT 方法的基础上建立荧光实时定量逆转录 PCR

( Real-time Quantitive Reverse Transcription Polymerase Chain

Reaction)检测方法,使得检测灵敏度进一步增强。

方法 以噬菌体 MS2 RNA 为模板,应用标准 AMV 逆转录酶催化体外

逆转录反应合成相应 cDNA.实时荧光定量 PCR 法检测底物 cDNA 模

板量,进而得出逆转录酶的相对活性。

结果 将 AMV 逆转录酶标准 10 倍倍比连续稀释后催化逆转录反应,

实时荧光定量 PCR 分析所得的逆转录产物 cDNA, 得到标准荧光值

曲线,从而间接推测样品中有无逆转录病毒污染。

结论 成功建立了基于实时荧光定量 PCR 检测逆转录酶活性的新型

方法,为生物制品外来污染尤其是逆转录病毒的污染的检测提供了参

考指标。

【关键词】荧光定量 PCR 检测法;逆转录酶; 逆转录酶是所有逆转录

病毒的一个重要标志,目前逆转录病毒的

检测方法被普遍应用的是以 PCR 为基本方法的逆转录酶活性检测法

Ulyra Sensitive Product Enhanced Reverse Transcriptase(PERT),我们曾

经在国内首次报道了逆转录酶的 PERT 检测方法,但传统 PERT 方

作者单位:100050 北京 中国药品生物制品检定所 通讯作者:孔艳,

Email:*****************.cn

法的实验过程容易造成污染和假阳性,并且无法做到实时监控。本次

报导是在原有方法的基础上

( 1 )

,以噬菌体 MS2 RNA 为模板合成引物

和探针,建立检测逆转录酶活性的实时荧光定量 PCR 方法

( 2 )

荧光实时定量 PCR 技术是由美国 Applied Biosysems 公司推出,

20 世纪 90 年代发展起来

( 3 )

。在 PCR 反应系统中加入荧光基因利用

荧光信号积累实时检测整个 PCR 过程,最后通过标准曲线对未知模

板进行定量分析的方法。由于引入了荧光标记探针提高了方法的高灵

敏性,可直接监测扩增中的荧光信号变化获得定量结果,定量和扩增

同步进行,克服了 PCR 的平台效应的特点,使方法具有高精确性,

能实现多重反应、无污染性、因此方法具有高特异性、实时性和可靠

性等特点。目前已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、免疫分析、 基

因表达、突变和多态性研究等多个领域

( 4 )

我们所建立的检测逆转录酶活性的荧光实时定量 PCR 方法与普

通 PERT 方法相比,实验操作过程减少,所使用的起始模版量仅为传

统 PERT 法的 1/50,降低气溶胶等外来核酸造成的污染,同时通过样

品的 PCR 扩增产物变化曲线对感染病毒的数量达到精确定量。

1 材料与方法:

1.1 材料

1.1.1 引物的设计:在我们以往设计的引物基础上,再合成一条探针

并分别在 5`端加上 FAM 荧光素, 3`端加上 TAMRA 荧光素。即以噬菌

体 MS2 RNA 为模板设计引物:RT-1: (5`-d(GCC TTA GCA GTG CCC

TGT CT)-3`) ,RT-2: (5`-d(AAC ATG CTC GAG GGC CTTA)-3`),

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