2024年6月3日发(作者：卜和璧)
植物[编辑]
物种 基因组大小和开放阅读框 文献
Sesamum indicum L. Sesame 芝麻（2n = 26） 293.7 Mb, 10,656 orfs 1
Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2
Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3
Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4
Prunus persica Peach 桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5
Aegilops tauschii 山羊草（DD） 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6
Triticum urartu 乌拉尔图小麦（AA） 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7
moso bamboo (Phyllostachys heterocycla) 毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8
Cicer arietinum Chickpea鹰嘴豆 ~738-Mb，28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740
Mb), 27,571 orfs 10
Prunus mume 梅 280 Mb, 31,390 orfs 11
Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12
Gossypium hirsutum L. 雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13
Citrus sinensis 甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14
甜橙 367 Mb 15
Citrullus lanatus watermelon 西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16
Betula nana dwarf birch，矮桦 450 Mb 17
Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻（产油藻类之一） 28.7 Mb，
11,973 orfs 18
Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19
Hordeum vulgare L. barley 大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb，26,159 high confidence
orfs，53,000 low confidence orfs 20
Gossypium raimondii cotton 雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976
orfs 21
Linum usitatissimum flax 亚麻 302 mb (81%), 43,384 orfs 22
Musa acuminata banana 香蕉 472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs 23
Cucumis melo L. melon 甜瓜 375 Mb（83.3%）27,427 orfs 24
Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli 梨（砀山酥梨） 512.0 Mb (97.1%),
42,812 orfs 25,26
Solanum lycopersicum 番茄 760/900 Mb，34727 orfs 27
S. pimpinellifolium LA1589野生番茄 739 Mb
Setaria 狗尾草属（谷子、青狗尾草） 400 Mb，25000-29000 orfs 28,29
Cajanus cajan pigeonpea木豆 833 Mb，48,680 orfs 30
Nannochloropis gaditana 一种海藻 ~29 Mb, 9,052 orfs 31
Medicago truncatula蒺藜苜蓿 350.2 Mb, 62,388 orfs 32
Brassica rapa 白菜 485 Mb 33
Solanum tuberosum 马铃薯 0.73 Mb,39031 orfs 34
Thellungiella parvula条叶蓝芥 13.08 Mb 29,338 orfs 35
Arabidopsis lyrata lyrata 玉山筷子芥? 183.7 Mb, 32670 orfs 36
Fragaria vesca 野草莓 240 Mb，34,809 orfs 37
Theobroma cacao 可可 76% of 430 Mb, 28,798 orfs 38
Aureococcus anophagefferens褐潮藻 32 Mb, 11501 orfs 39
Selaginella moellendorfii江南卷柏 208.5 Mb, 34782 orfs 40
Jatropha curcas Palawan麻疯树 285.9 Mb, 40929 orfs 41
Oryza glaberrima 光稃稻（非洲栽培稻） 206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs (>70%
coverage) 42
Phoenix dactylifera 棕枣 380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs 43
Chlorella sp. NC64A小球藻属 40000 Kb, 9791 orfs 44
Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs 45
Malus domestica (Malus x domestica) 苹果 742.3 Mb 46
Volvox carteri f. nagariensis 69-1b一种团藻 120 Mb, 14437 orfs 47
Brachypodium distachyon 短柄草 272 Mb，25,532 orfs 48
Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆 1.1 Gb, 46430 orfs 49
Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana
Tripsacum dactyloides var. meridionale 无法下载附表 50
Zea mays mays cv. B73玉米 2.06 Gb, 106046 orfs 51
Cucumis sativus 9930 黄瓜 243.5 Mb, 63312 orfs 52
Micromonas pusilla金藻 21.7 Mb, 10248 orfs 53
Sorghum bicolor 高粱 697.6 Mb, 32886 orfs 54
Phaeodactylum tricornutum 三角褐指藻 24.6 Mb, 9479 orfs 55
Carica papaya L. papaya 番木瓜 271 Mb (75%), 28,629 orfs 56
Physcomitrella patens patens小立碗藓 454 Mb, 35805 orfs 57
Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115葡萄 504.6 Mb, 29585 orfs 58
Vitis vinifera PN40024葡萄 475 Mb 59
Ostreococcus lucimarinus绿色鞭毛藻 13.2 Mb, 7640 orfs 60
Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻 100 Mb, 15256 orfs 61
Populus trichocarpa黑三角叶杨 550 Mb, 45000 orfs 62
Ostreococcus tauri 绿藻 12.6 Mb, 7892 orfs 63
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 360.8 Mb, 37544 orfs 64
Thalassiosira pseudonana 硅藻 25 Mb, 11242 orfs 65
Cyanidioschyzon merolae 10D红藻 16.5 Mb, 5331 orfs 66
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 420 Mb, 50000 orfs 67
Oryza sativa L. ssp. Indica籼稻 420 Mb, 59855 orfs 68
Guillardia theta -蓝隐藻， 551 Kb, 553 orfs 69
Arabidopsis thaliana Columbia拟南芥 119.7 Mb, 31392 orfs 70
参考文献
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70 Kaul, S. et al. Analysis of the genome sequence of the flowering plant
Arabidopsis thaliana. Nature 408, 796-815 (2000).
动物[编辑]
•
Anopheles gambiae
- 疟蚊
•
Apis mellifera
- 蜜蜂
•
Bos taurus cattle
- 牛
•
Caenorhabditis briggsae
- 一种线虫
•
Caenorhabditis elegans
- 秀丽隐杆线虫，模式生物
•
Canis lupus familiaris dog
- 狗
•
Ciona intestinalis
- 一种海鞘
•
Ciona savignyi
- 一种海鞘
•
Drosophila melanogaster
- 黑腹果蝇，模式生物
•
Fugu rubripes
- 河豚
•
Gallus gallus
- 鸡
•
Homo sapiens
- 人
•
Mus musculus
- 小鼠, 模式生物
•
Pan troglodytes
- 黑猩猩
•
Rattus norvegicus
- 大鼠
•
Schistosoma haematobium
- 埃及血吸虫
下表是目前为止已经被相当完全测序的生物。
古菌[编辑]
•
Aeropyrum pernix
- Archaea aus japanischen Thermalquellen
•
Archaeoglobus fulgidus
- Schwefel-Archaea
•
Halobacterium spec.
- Archaea aus Salzseen
•
Methanobacterium thermoautotrophicum
- Methanproduzierender Archaea
•
Methanococcoides burtonii
- kältetolerante und aerobe Archaea aus dem
Ace Lake, Antarktis
•
Methanococcus jannaschii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Methanococcus maripaludi
- Archaea aus Salzseen in Georgia
•
Methanogenium frigidum
- kältetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace
Lake, Antarktis
•
Methanopyrus kandleri
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Methanosarcina acetivorans
- Archaea aus Ölquellen, Kuhmägen u. a.
•
Methanosarcina mazei
- Archaea mit der Fähigkeit Acetat u. a. abzubauen
•
Nanoarchaeum equitans
- Archaea an heißen Quellen, Parasit anderer
Mikroorganismen
•
Pyrobaculum aerophilum
- Archaea aus heißen Quellen
•
Pyrococcus abyssi
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrococcus furiosus
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrococcus horikoshii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrolobus fumarii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Sulfolobus solfataricus
- Archaea aus heißen Schwefelquellen
•
Sulfolobus tokodaii
- Archaea aus heißen Schwefelquellen
•
Thermoplasma acidophilum
- sehr säureliebender Archaea,
Bergwerkshalden u. a.
•
Thermoplasma volcanium
- wärmeliebender Archaea
reinigt
细菌[编辑]
•
Agrobacterium tumefaciens
- Pflanzenpathogenes Bakterium, tumorbildend
•
Aquifex aeolicus
- Hyperthermophiles Meeresbakterium
•
Bacillus anthracis
- Anthrax-Erreger
•
Bacillus cereus
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Bacillus halodurans
- Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
•
Bacillus subtilis
- Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
•
Bacteroides thetaiotaomicron
- Darmbakterium
•
Bifidobacterium longum
- Darmbakterium
•
Blochmannia floridanus
- Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen
•
Bordetella bronchiseptica
- Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
•
Bordetella parapertussis
- Erreger von mildem Keuchhusten
•
Bordetella pertussis
- Erreger von Keuchhusten
•
Borrelia burgdorferi
- Borreliose-Erreger
•
Bradyrhizobium japonicum
- Knöllchenbakterium der Sojabohne
•
Brucella melitensis
- Erreger des Maltafiebers
•
Brucella suis
- potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
•
Buchnera aphidicola
- Bakterium in Symbiose mit Blattläusen
•
Burkholderia mallei
- Erreger des Rotzes bei Huftieren, auch humanpathogen
(Einsatz als Biowaffe)
•
Burkholderia pseudomallei
- Erreger der Melioidose, vor allem in
Südostasien
•
Campylobacter jejuni
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Caulobacter crescentus
- Süßwasserbakterium
•
Chlamydia muridarum
- Atemwegsinfektionen bei Maus
und Meerschweinchen
•
Chlamydophila caviae
- Augenentzündungen bei Meerschweinchen
•
Chlamydia trachomatis
- Erreger der Harnröhrenentzündung
•
Chlamydophila pneumoniae
- Erreger einer Bronchitis
•
Chlorobium tepidum
- Grünes Schwefelbakterium
•
Chromobacterium violaceum
- humanpathogenes Bakterium (Diarrhoe und
andere Erkrankungen)
•
Clostridium
Bakterium
acetobutylicum
- Aceton- und Butanol-produzierendes
•
Clostridium perfringens
- Erreger Diarrhoe etc.
•
Clostridium tetani
- Tetanus-Erreger
•
Corynebacterium diphtheriae
- Erreger der Diphtherie
•
Corynebacterium jeikeium
- nosokomial pathogener Hautbewohner
•
Corynebacterium efficiens
- Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a.
•
Coxiella burnetti
- Erreger des Q-Fieber
•
Deinococcus radiodurans
- extrem strahlungstolerantes Bakterium
•
Desulfotalea psychrophila
- extrem kältetolerantes Bakterium
des arktischen Eismeeres
•
Desulfovibrio vulgaris
- Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling
•
Enterococcus faecalis
- Darmbakterium, Modellorganismus
•
Escherichia coli
- Darmbakterium, Modellorganismus
•
Fusobacterium nucleatum
- Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag
•
Haemophilus ducreyi
- Erreger des Schanker
•
Haemophilus influenzae
- Erreger einer Erkältung
•
Helicobacter hepaticus
- Erreger chronischer Hepatis und
von Lebergeschwüren bei Mäusen.
•
Helicobacter pylori
- Erreger von Magengeschwüren
•
Lactobacillus plantarum
- Milchsäurebakterium
•
Lactococcus lactis
- Käsebakterium
•
Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit
•
Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium
•
Leptospira interrogans
- Erreger der Leptospirosis
•
Listeria innocua
- nicht pathogene Listeria-Art
•
Listeria monocytogenes
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Mannheimia succiniciproducens
- symbiotisches Bakterium im Magen von
Kühen
•
Mesoplasma florum
- Bakterium mit extrem kleinen Genom
•
Mesorhizobium loti
- Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten
•
Mycobacterium leprae
- Erreger der Lepra
•
Mycobacterium bovis
- Erreger der Rindertuberkulose
•
Mycobacterium paratuberculosis
- Erreger der Rinderkrankheit Johne's
Desease
•
Mycobacterium tuberculosis
- Erreger der Tuberkulose
•
Mycoplasma gallisepticum
- Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung
bei Geflügel
•
Mycoplasma genitalium
- Erreger von Infektionen des Genitaltraktes
•
Mycoplasma penetrans
- Erreger von Entzündungen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus (AIDS)
•
Mycoplasma pneumoniae
- Erreger einer Bronchitis
•
Mycoplasma pulmonis
- Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen
•
Neisseria meningitidis
- Erreger der Meningitis (Hirnhautentzündung)
•
Nitrisomonas europaea
- Nitratbakterium
•
Oceanobacillus iheyensis
- Tiefseebakterium
•
Pasteurella multocida
- Erreger von Vogelcholera, Ansteckender
Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei
Schweinen und Menschen u.a.
•
Photorabdus luminescens
- Bakterium in Symbiose mit
insektenpathogenen Fadenwürmern
•
Porphyromonas gingivalis
- Erreger von Parodontose
•
Prochlorococcus marinus
- Meeresbakterium
•
Pseudomonas aeruginosa
- als Opportunist bei
geschwächtem Immunsystem pathogen
•
Pseudomonas putida
- Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchungen
•
Pseudomonas
a. Tomatenschädling
syringae
- Pflanzenpathogenes Bakterium, u.
•
Ralstonia solanacearum
- Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke bei
Hunderten verschiedener Pflanzenarten
•
Rhodopirellula baltica
- Rotes Meeresbakterium
•
Rhodopseudomonas palustris
- Purpurbakterium
•
Rickettsia conorii
- Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber
•
Rickettsia prowazekii
- Erreger des Typhus
•
Rickettsia sibirica
- Erreger von Zeckenfieber in Nordasien
•
Rickettsia typhi
- Erreger des Mäusetyphus (auch humanpathogen)
•
Salmonella typhi
- Erreger des Typhusfieber
•
Salmonella typhimurium
- Erreger des Typhusfieber bei der Maus
•
Shewanella oneidensis
- Metallabbauendes Bodenbakterium
•
Shigella flexneria
- evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod
•
Sinorhizobium meliloti
- Knöllchenbakterium des Alfalfa
•
Staphylococcus aureus
- Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks
•
Staphylococcus epidermidis
- Hautbakterium, pathogen bei Wunden
•
Streptococcus agalactiae
- Erreger von
schweren Neugeboreneninfektionen, Meningitis u. a.
•
Streptococcus mutans
- Erreger von Karies
•
Streptococcus pneumoniae
- Erreger
von Lungenentzündungen, Menigitis und Blutvergiftungen
•
Streptococcus pyogenes
- Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks
u. a.
•
Streptomyces avermitilis
- Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell
genutzt)
•
Streptomyces coelicolor
- Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell
genutzt)
•
Thermoanaerobacter tengcongensis
- Bakterium aus heißen Quellen
in Volksrepublik China
•
Thermotoga maritima
- sehr säureliebendes Bakterium, reinigt
Bergwerkshalden u. a.
•
Thermus thermophilus
- hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz
in der PCR und anderswo.
•
Treponema pallidum
- Erreger der Syphilis
•
Tropheryma whippley
- Erreger der Whipple-Krankheit
•
Ureaplasma urealyticum
- Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes
•
Vibrio cholerae
- Erreger der Cholera
•
Vibrio fischeri
- Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die
Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird
•
Vibrio parahaemolyticus
- Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen
•
Vibrio vulnificus
- Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr
von rohen Meeresorganismen führen.
•
Wigglesworthia glossinidia
- Erreger der Schlafkrankheit
•
Wolinella succinogenes
- Bakterium im Kuhmagen
•
Xanthomonas axonopodis
- Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt
Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten
•
Xanthomonas campestris
- Pflanzenpathogenes Bakterium,
erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern
•
Xylella fastidiosa
- Pflanzenpathogenes
und Kaffee-Plantagen in
Bakterium,
Nord- schwerer Schädling in Obst-, Nuss-
und Südamerika
•
Yersinia pestis
- Erreger der Pest
蓝藻[编辑]
•
Anabaena spec.
- Fadenblaualge
•
Gloeobacter violaceus
- primitive Blaualge
•
Synechococcus spec.
- Meeres-Blaualge
•
Synechocystis spec.
- Meeres-Blaualge
•
Thermosynechococcus elongatus
- Thermophile Blaualge
真核生物[编辑]
原生生物[编辑]
•
Leishmania infantum
- 一种利什曼原虫
•
Leishmania major
- 一种利什曼原虫
•
Plasmodium falciparum
- 恶性疟原虫
•
Plasmodium yoelii yoelii
- 约氏疟原虫，引起啮齿动物疟疾
•
Thalassiosira pseudonana
- 一种海洋硅藻
•
Trypanosoma brucei
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma congolense
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma cruci
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma vivax
- 一种锥体虫
真菌[编辑]
•
Ashbya gossypii
- 感染柑橘类和棉花的真菌
•
Aspergillus fumigatus
- 烟曲霉，人类致病菌
•
Aspergillus nidulans
- 构巢曲霉
•
Debaryomyces hansenii
- 耐盐的酵母
•
Encephalitozoon cuniculi
- 一种单细胞微孢子虫
•
Kluyveromyces lactis
- 具有潜在药用生産价值的酵母
•
Kluyveromyces waltii
- 一种酵母
•
Magnaporthe grisea
- 稻瘟病病菌
•
Neurospora crassa
- 粗糙脉孢菌，橙色的面包霉，模式生物
•
Phanerochaete chrysosporium
- 白腐病病菌
•
Saccharomyces cerevisiae
- 酿酒酵母，模式生物
•
Schizosaccharomyces pombe
- 粟酒裂殖酵母
•
Trichoderma reesei
=
Hypocrea jecorina
- 一种木霉
•
Yarrowia lipolytica
- 一种酵母
•
Candida albicans
- 白色念珠菌，人类致病菌
2024年6月3日发(作者：卜和璧)
植物[编辑]
物种 基因组大小和开放阅读框 文献
Sesamum indicum L. Sesame 芝麻（2n = 26） 293.7 Mb, 10,656 orfs 1
Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2
Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3
Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4
Prunus persica Peach 桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5
Aegilops tauschii 山羊草（DD） 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6
Triticum urartu 乌拉尔图小麦（AA） 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7
moso bamboo (Phyllostachys heterocycla) 毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8
Cicer arietinum Chickpea鹰嘴豆 ~738-Mb，28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740
Mb), 27,571 orfs 10
Prunus mume 梅 280 Mb, 31,390 orfs 11
Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12
Gossypium hirsutum L. 雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13
Citrus sinensis 甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14
甜橙 367 Mb 15
Citrullus lanatus watermelon 西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16
Betula nana dwarf birch，矮桦 450 Mb 17
Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻（产油藻类之一） 28.7 Mb，
11,973 orfs 18
Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19
Hordeum vulgare L. barley 大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb，26,159 high confidence
orfs，53,000 low confidence orfs 20
Gossypium raimondii cotton 雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976
orfs 21
Linum usitatissimum flax 亚麻 302 mb (81%), 43,384 orfs 22
Musa acuminata banana 香蕉 472.2 of 523 Mb, 36,542 orfs 23
Cucumis melo L. melon 甜瓜 375 Mb（83.3%）27,427 orfs 24
Pyrus bretschneideri Rehd. cv. Dangshansuli 梨（砀山酥梨） 512.0 Mb (97.1%),
42,812 orfs 25,26
Solanum lycopersicum 番茄 760/900 Mb，34727 orfs 27
S. pimpinellifolium LA1589野生番茄 739 Mb
Setaria 狗尾草属（谷子、青狗尾草） 400 Mb，25000-29000 orfs 28,29
Cajanus cajan pigeonpea木豆 833 Mb，48,680 orfs 30
Nannochloropis gaditana 一种海藻 ~29 Mb, 9,052 orfs 31
Medicago truncatula蒺藜苜蓿 350.2 Mb, 62,388 orfs 32
Brassica rapa 白菜 485 Mb 33
Solanum tuberosum 马铃薯 0.73 Mb,39031 orfs 34
Thellungiella parvula条叶蓝芥 13.08 Mb 29,338 orfs 35
Arabidopsis lyrata lyrata 玉山筷子芥? 183.7 Mb, 32670 orfs 36
Fragaria vesca 野草莓 240 Mb，34,809 orfs 37
Theobroma cacao 可可 76% of 430 Mb, 28,798 orfs 38
Aureococcus anophagefferens褐潮藻 32 Mb, 11501 orfs 39
Selaginella moellendorfii江南卷柏 208.5 Mb, 34782 orfs 40
Jatropha curcas Palawan麻疯树 285.9 Mb, 40929 orfs 41
Oryza glaberrima 光稃稻（非洲栽培稻） 206.3 Mb (0.6x), 10 080 orfs (>70%
coverage) 42
Phoenix dactylifera 棕枣 380 Mb of 658 Mb, 25,059 orfs 43
Chlorella sp. NC64A小球藻属 40000 Kb, 9791 orfs 44
Ricinus communis蓖麻 325 Mb, 31,237 orfs 45
Malus domestica (Malus x domestica) 苹果 742.3 Mb 46
Volvox carteri f. nagariensis 69-1b一种团藻 120 Mb, 14437 orfs 47
Brachypodium distachyon 短柄草 272 Mb，25,532 orfs 48
Glycine max cultivar Williams 82栽培大豆 1.1 Gb, 46430 orfs 49
Zea mays ssp. Mays Zea mays ssp. Parviglumis Zea mays ssp. Mexicana
Tripsacum dactyloides var. meridionale 无法下载附表 50
Zea mays mays cv. B73玉米 2.06 Gb, 106046 orfs 51
Cucumis sativus 9930 黄瓜 243.5 Mb, 63312 orfs 52
Micromonas pusilla金藻 21.7 Mb, 10248 orfs 53
Sorghum bicolor 高粱 697.6 Mb, 32886 orfs 54
Phaeodactylum tricornutum 三角褐指藻 24.6 Mb, 9479 orfs 55
Carica papaya L. papaya 番木瓜 271 Mb (75%), 28,629 orfs 56
Physcomitrella patens patens小立碗藓 454 Mb, 35805 orfs 57
Vitis vinifera L. Pinot Noir, clone ENTAV 115葡萄 504.6 Mb, 29585 orfs 58
Vitis vinifera PN40024葡萄 475 Mb 59
Ostreococcus lucimarinus绿色鞭毛藻 13.2 Mb, 7640 orfs 60
Chlamydomonas reinhardtii 莱茵衣藻 100 Mb, 15256 orfs 61
Populus trichocarpa黑三角叶杨 550 Mb, 45000 orfs 62
Ostreococcus tauri 绿藻 12.6 Mb, 7892 orfs 63
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 360.8 Mb, 37544 orfs 64
Thalassiosira pseudonana 硅藻 25 Mb, 11242 orfs 65
Cyanidioschyzon merolae 10D红藻 16.5 Mb, 5331 orfs 66
Oryza sativa ssp. japonica 粳稻 420 Mb, 50000 orfs 67
Oryza sativa L. ssp. Indica籼稻 420 Mb, 59855 orfs 68
Guillardia theta -蓝隐藻， 551 Kb, 553 orfs 69
Arabidopsis thaliana Columbia拟南芥 119.7 Mb, 31392 orfs 70
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Arabidopsis thaliana. Nature 408, 796-815 (2000).
动物[编辑]
•
Anopheles gambiae
- 疟蚊
•
Apis mellifera
- 蜜蜂
•
Bos taurus cattle
- 牛
•
Caenorhabditis briggsae
- 一种线虫
•
Caenorhabditis elegans
- 秀丽隐杆线虫，模式生物
•
Canis lupus familiaris dog
- 狗
•
Ciona intestinalis
- 一种海鞘
•
Ciona savignyi
- 一种海鞘
•
Drosophila melanogaster
- 黑腹果蝇，模式生物
•
Fugu rubripes
- 河豚
•
Gallus gallus
- 鸡
•
Homo sapiens
- 人
•
Mus musculus
- 小鼠, 模式生物
•
Pan troglodytes
- 黑猩猩
•
Rattus norvegicus
- 大鼠
•
Schistosoma haematobium
- 埃及血吸虫
下表是目前为止已经被相当完全测序的生物。
古菌[编辑]
•
Aeropyrum pernix
- Archaea aus japanischen Thermalquellen
•
Archaeoglobus fulgidus
- Schwefel-Archaea
•
Halobacterium spec.
- Archaea aus Salzseen
•
Methanobacterium thermoautotrophicum
- Methanproduzierender Archaea
•
Methanococcoides burtonii
- kältetolerante und aerobe Archaea aus dem
Ace Lake, Antarktis
•
Methanococcus jannaschii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Methanococcus maripaludi
- Archaea aus Salzseen in Georgia
•
Methanogenium frigidum
- kältetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace
Lake, Antarktis
•
Methanopyrus kandleri
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Methanosarcina acetivorans
- Archaea aus Ölquellen, Kuhmägen u. a.
•
Methanosarcina mazei
- Archaea mit der Fähigkeit Acetat u. a. abzubauen
•
Nanoarchaeum equitans
- Archaea an heißen Quellen, Parasit anderer
Mikroorganismen
•
Pyrobaculum aerophilum
- Archaea aus heißen Quellen
•
Pyrococcus abyssi
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrococcus furiosus
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrococcus horikoshii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Pyrolobus fumarii
- Tiefseearchaea an Black Smokern
•
Sulfolobus solfataricus
- Archaea aus heißen Schwefelquellen
•
Sulfolobus tokodaii
- Archaea aus heißen Schwefelquellen
•
Thermoplasma acidophilum
- sehr säureliebender Archaea,
Bergwerkshalden u. a.
•
Thermoplasma volcanium
- wärmeliebender Archaea
reinigt
细菌[编辑]
•
Agrobacterium tumefaciens
- Pflanzenpathogenes Bakterium, tumorbildend
•
Aquifex aeolicus
- Hyperthermophiles Meeresbakterium
•
Bacillus anthracis
- Anthrax-Erreger
•
Bacillus cereus
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Bacillus halodurans
- Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
•
Bacillus subtilis
- Enzymproduzierendes Bakterium (Industriell genutzt)
•
Bacteroides thetaiotaomicron
- Darmbakterium
•
Bifidobacterium longum
- Darmbakterium
•
Blochmannia floridanus
- Bakterium in Symbiose mit Ernteameisen
•
Bordetella bronchiseptica
- Erreger chronischer Infektionen der Atemwege
•
Bordetella parapertussis
- Erreger von mildem Keuchhusten
•
Bordetella pertussis
- Erreger von Keuchhusten
•
Borrelia burgdorferi
- Borreliose-Erreger
•
Bradyrhizobium japonicum
- Knöllchenbakterium der Sojabohne
•
Brucella melitensis
- Erreger des Maltafiebers
•
Brucella suis
- potentielle Biowaffe der USA, wirkt abtreibend
•
Buchnera aphidicola
- Bakterium in Symbiose mit Blattläusen
•
Burkholderia mallei
- Erreger des Rotzes bei Huftieren, auch humanpathogen
(Einsatz als Biowaffe)
•
Burkholderia pseudomallei
- Erreger der Melioidose, vor allem in
Südostasien
•
Campylobacter jejuni
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Caulobacter crescentus
- Süßwasserbakterium
•
Chlamydia muridarum
- Atemwegsinfektionen bei Maus
und Meerschweinchen
•
Chlamydophila caviae
- Augenentzündungen bei Meerschweinchen
•
Chlamydia trachomatis
- Erreger der Harnröhrenentzündung
•
Chlamydophila pneumoniae
- Erreger einer Bronchitis
•
Chlorobium tepidum
- Grünes Schwefelbakterium
•
Chromobacterium violaceum
- humanpathogenes Bakterium (Diarrhoe und
andere Erkrankungen)
•
Clostridium
Bakterium
acetobutylicum
- Aceton- und Butanol-produzierendes
•
Clostridium perfringens
- Erreger Diarrhoe etc.
•
Clostridium tetani
- Tetanus-Erreger
•
Corynebacterium diphtheriae
- Erreger der Diphtherie
•
Corynebacterium jeikeium
- nosokomial pathogener Hautbewohner
•
Corynebacterium efficiens
- Bakterium zur Produktion von Aminosäuren u. a.
•
Coxiella burnetti
- Erreger des Q-Fieber
•
Deinococcus radiodurans
- extrem strahlungstolerantes Bakterium
•
Desulfotalea psychrophila
- extrem kältetolerantes Bakterium
des arktischen Eismeeres
•
Desulfovibrio vulgaris
- Bakterium aus Ölfeldern, wirtschaftlicher Schädling
•
Enterococcus faecalis
- Darmbakterium, Modellorganismus
•
Escherichia coli
- Darmbakterium, Modellorganismus
•
Fusobacterium nucleatum
- Verbreitetes Bakterium im Zahnbelag
•
Haemophilus ducreyi
- Erreger des Schanker
•
Haemophilus influenzae
- Erreger einer Erkältung
•
Helicobacter hepaticus
- Erreger chronischer Hepatis und
von Lebergeschwüren bei Mäusen.
•
Helicobacter pylori
- Erreger von Magengeschwüren
•
Lactobacillus plantarum
- Milchsäurebakterium
•
Lactococcus lactis
- Käsebakterium
•
Legionella pneumophila - Erreger der Legionärskrankheit
•
Leifsonia xyli - ein pflanzenpathogenes Bakterium
•
Leptospira interrogans
- Erreger der Leptospirosis
•
Listeria innocua
- nicht pathogene Listeria-Art
•
Listeria monocytogenes
- Erreger einer Lebensmittelvergiftung
•
Mannheimia succiniciproducens
- symbiotisches Bakterium im Magen von
Kühen
•
Mesoplasma florum
- Bakterium mit extrem kleinen Genom
•
Mesorhizobium loti
- Knöllchenbakterium bei Lotus-Arten
•
Mycobacterium leprae
- Erreger der Lepra
•
Mycobacterium bovis
- Erreger der Rindertuberkulose
•
Mycobacterium paratuberculosis
- Erreger der Rinderkrankheit Johne's
Desease
•
Mycobacterium tuberculosis
- Erreger der Tuberkulose
•
Mycoplasma gallisepticum
- Erreger einer chronischen Atemwegserkrankung
bei Geflügel
•
Mycoplasma genitalium
- Erreger von Infektionen des Genitaltraktes
•
Mycoplasma penetrans
- Erreger von Entzündungen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege, evtl. assoziiert mit dem HI-Virus (AIDS)
•
Mycoplasma pneumoniae
- Erreger einer Bronchitis
•
Mycoplasma pulmonis
- Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes sowie der Atemwege bei Mäusen
•
Neisseria meningitidis
- Erreger der Meningitis (Hirnhautentzündung)
•
Nitrisomonas europaea
- Nitratbakterium
•
Oceanobacillus iheyensis
- Tiefseebakterium
•
Pasteurella multocida
- Erreger von Vogelcholera, Ansteckender
Kaninchenschnupfen, Hämorrhagischem Fieber bei Weidevieh und Arthritis bei
Schweinen und Menschen u.a.
•
Photorabdus luminescens
- Bakterium in Symbiose mit
insektenpathogenen Fadenwürmern
•
Porphyromonas gingivalis
- Erreger von Parodontose
•
Prochlorococcus marinus
- Meeresbakterium
•
Pseudomonas aeruginosa
- als Opportunist bei
geschwächtem Immunsystem pathogen
•
Pseudomonas putida
- Bodenbakterium zum Abbau von Verseuchungen
•
Pseudomonas
a. Tomatenschädling
syringae
- Pflanzenpathogenes Bakterium, u.
•
Ralstonia solanacearum
- Pflanzenpathogenes Bakterium, Welke bei
Hunderten verschiedener Pflanzenarten
•
Rhodopirellula baltica
- Rotes Meeresbakterium
•
Rhodopseudomonas palustris
- Purpurbakterium
•
Rickettsia conorii
- Erreger des Mittelmeer-Fleckfieber
•
Rickettsia prowazekii
- Erreger des Typhus
•
Rickettsia sibirica
- Erreger von Zeckenfieber in Nordasien
•
Rickettsia typhi
- Erreger des Mäusetyphus (auch humanpathogen)
•
Salmonella typhi
- Erreger des Typhusfieber
•
Salmonella typhimurium
- Erreger des Typhusfieber bei der Maus
•
Shewanella oneidensis
- Metallabbauendes Bodenbakterium
•
Shigella flexneria
- evtl. Ursache von Plötzlichem Kindstod
•
Sinorhizobium meliloti
- Knöllchenbakterium des Alfalfa
•
Staphylococcus aureus
- Erreger von Scharlachfieber und Toxinschocks
•
Staphylococcus epidermidis
- Hautbakterium, pathogen bei Wunden
•
Streptococcus agalactiae
- Erreger von
schweren Neugeboreneninfektionen, Meningitis u. a.
•
Streptococcus mutans
- Erreger von Karies
•
Streptococcus pneumoniae
- Erreger
von Lungenentzündungen, Menigitis und Blutvergiftungen
•
Streptococcus pyogenes
- Erreger von Rheumatischem Fieber, Toxinschocks
u. a.
•
Streptomyces avermitilis
- Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell
genutzt)
•
Streptomyces coelicolor
- Antibiotikaproduzierendes Bakterium (industriell
genutzt)
•
Thermoanaerobacter tengcongensis
- Bakterium aus heißen Quellen
in Volksrepublik China
•
Thermotoga maritima
- sehr säureliebendes Bakterium, reinigt
Bergwerkshalden u. a.
•
Thermus thermophilus
- hitzeliebendes Bakterium aus Japan, findet Einsatz
in der PCR und anderswo.
•
Treponema pallidum
- Erreger der Syphilis
•
Tropheryma whippley
- Erreger der Whipple-Krankheit
•
Ureaplasma urealyticum
- Erreger von Infektionen des Harn- und
Genitaltraktes
•
Vibrio cholerae
- Erreger der Cholera
•
Vibrio fischeri
- Leuchtbakterium, das im Meer lebt und für die
Qualitätsbestimmung von Abwasser verwendet wird
•
Vibrio parahaemolyticus
- Erreger schwerer Magen-Darm-Entzündungen
•
Vibrio vulnificus
- Meeresbakterium, kann zu Erkrankungen durch Verzehr
von rohen Meeresorganismen führen.
•
Wigglesworthia glossinidia
- Erreger der Schlafkrankheit
•
Wolinella succinogenes
- Bakterium im Kuhmagen
•
Xanthomonas axonopodis
- Pflanzenpathogenes Bakterium, erzeugt
Zitronenkrebs bei Zitrusfrüchten
•
Xanthomonas campestris
- Pflanzenpathogenes Bakterium,
erzeugt Schwarzfäule bei Kreuzblütern
•
Xylella fastidiosa
- Pflanzenpathogenes
und Kaffee-Plantagen in
Bakterium,
Nord- schwerer Schädling in Obst-, Nuss-
und Südamerika
•
Yersinia pestis
- Erreger der Pest
蓝藻[编辑]
•
Anabaena spec.
- Fadenblaualge
•
Gloeobacter violaceus
- primitive Blaualge
•
Synechococcus spec.
- Meeres-Blaualge
•
Synechocystis spec.
- Meeres-Blaualge
•
Thermosynechococcus elongatus
- Thermophile Blaualge
真核生物[编辑]
原生生物[编辑]
•
Leishmania infantum
- 一种利什曼原虫
•
Leishmania major
- 一种利什曼原虫
•
Plasmodium falciparum
- 恶性疟原虫
•
Plasmodium yoelii yoelii
- 约氏疟原虫，引起啮齿动物疟疾
•
Thalassiosira pseudonana
- 一种海洋硅藻
•
Trypanosoma brucei
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma congolense
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma cruci
- 一种锥体虫
•
Trypanosoma vivax
- 一种锥体虫
真菌[编辑]
•
Ashbya gossypii
- 感染柑橘类和棉花的真菌
•
Aspergillus fumigatus
- 烟曲霉，人类致病菌
•
Aspergillus nidulans
- 构巢曲霉
•
Debaryomyces hansenii
- 耐盐的酵母
•
Encephalitozoon cuniculi
- 一种单细胞微孢子虫
•
Kluyveromyces lactis
- 具有潜在药用生産价值的酵母
•
Kluyveromyces waltii
- 一种酵母
•
Magnaporthe grisea
- 稻瘟病病菌
•
Neurospora crassa
- 粗糙脉孢菌，橙色的面包霉，模式生物
•
Phanerochaete chrysosporium
- 白腐病病菌
•
Saccharomyces cerevisiae
- 酿酒酵母，模式生物
•
Schizosaccharomyces pombe
- 粟酒裂殖酵母
•
Trichoderma reesei
=
Hypocrea jecorina
- 一种木霉
•
Yarrowia lipolytica
- 一种酵母
•
Candida albicans
- 白色念珠菌，人类致病菌