2024年8月22日发(作者:百里慧巧)
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利说明书
(21)申请号 CN2.X
(22)申请日 2011.09.20
(71)申请人 山东大学
地址 250100 山东省济南市历城区山大南路27号
(72)发明人 谷立川 朱春原 许素娟 陈颖 李冰清
(74)专利代理机构 济南圣达知识产权代理有限公司
代理人 李健康
(51)
C07H19/213
C07H1/06
(10)申请公布号 CN 102443031 A
(43)申请公布日 2012.05.09
权利要求说明书 说明书 幅图
(54)发明名称
一种c-di-GMP的分离纯化方法
(57)摘要
本发明公开了一种c-di-GMP的分
离纯化方法,是将c-di-GMP粗产物溶液直
接上样于配有离子交换色谱柱的快速蛋白
液相色谱,用pH8.0缓冲液梯度洗脱,紫
外检测器254nm检测,收集出峰位置处洗
脱液,用质谱确证结构,然后将含目标化
合物洗脱液冻干,即制得固体c-di-GMP。
本发明方法制得的c-di-GMP经反相高效液
相色谱检测其纯度达95%以上,并实现了
一步法直接从c-di-GMP粗产物溶液中分离
纯化c-di-GMP,且本发明工艺简单,周期
短,不使用毒性有机溶剂,是一种高效、
环保、适合工业化生产的新方法。
法律状态
法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
权 利 要 求 说 明 书
1.一种c-di-GMP的分离纯化方法,步骤是:
(1)取含c-di-GMP的粗产物溶液,以1~5mL/min的流速,直接上样于配有离子交
换色
(2)上样结束后,用洗脱液A和洗脱液B梯度洗脱,流速为1~5mL/min;其中所述
洗脱 液A为pH8.0的缓冲液,所述缓冲液为Tris-HCl、
谱柱的快速蛋白液相色谱,上样量为1~1000mL;
Na2HPO4-NaH2PO4或
K2HPO4-KH2PO4;
(3)用紫外检测器在254nm下检测,收集出峰位置处洗脱液,用质谱确证结构,然
后将
(4)以反相高效液相色谱检测,确定固体c-di-GMP纯度。
2.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述快速蛋白液
相色
3.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述离子交换色
谱柱 为Mini Q 4.6/50PE时,上样量为1~10mL,上样流速和洗脱
子交换色谱柱为
谱选GE AKTAFPLC。
含目标化合物洗脱液冻干,制得固体c-di-GMP;
所述洗脱液B为A液中加入1MNaCl;
流速均为1~2mL/min;所述离
Source Q HP 10/10时,上样量为10~100mL,上样流速和洗脱流速均为3~
4mL/min;所述离子交换色谱柱为Source Q HP 16/10时,上样量为50~
和洗脱流速均为4~5mL/min。 1000mL,上样流速
4.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述梯度洗脱以
0→ 20倍柱体积进行,所述洗脱液A的浓度值以100%→0进行,
100%进行。 同时洗脱液B的浓度值以0→
5.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述缓冲液为
Tris-HCl。
6.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述高效液相色
谱为 Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为
pH4.8的
Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液A为
10mM乙酸胺水溶液,洗脱液B为乙腈,流速为1mL/min;梯度洗脱运行时间30
分,洗脱液A的浓度值以100%→50%进行,同时洗脱液B的浓度
产物c-di-GMP保留时间在12.0~12.5min。值以0→50%进行;目标
说 明 书
技术领域
本发明涉及一种环鸟苷二磷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)的分离纯化方法,具
体地 说,是涉及用配有离子交换色谱柱的快速蛋白液相色谱
FPLC)分离纯化c-di-GMP的方法。(Fast protein liquid chromatography,
背景技术
环鸟苷二磷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种具有细菌特异性的新型第二信
使, 它广泛存在于各种真细菌中,但不存在于真核生物中。c-di-GMP参
过程,包括生物膜的形成、运动性的调节、毒力
主要的生存方式,给人类的
据
与调控细菌的多种生理
因子的表达等。生物膜作为自然界中细菌
生产生活带来了严重危害。除了危害环境和工业生产以外,根
NIH的调查报告,80%以上的细菌性感染与生物膜有关,生物膜可以使细菌大幅度
提高
问题。
c-di-GMP在相关科研工作中有重要用途,但市场价格昂贵使其使用受限,2009年
12月 份价格调整为原价十分之一后,1μmol(0.7mg)仍需150欧元
它可以用多种方法来制备,例如组织提取
本的主要因素是其分
对抗生素的耐受性并抵抗机体的免疫防御,从而导致严重的临床耐药
(Biolog Life Science Institute)。
法、化学合成法或者酶促合成法,影响质量和成
离纯化。
现有技术通常采用反相高效液相色谱(High performance Liquid Chromatography,
HPLC) 来分离纯化c-di-GMP。以酶促合成c-di-GMP为例,步骤为:酶与底
c-di-GMP的混合液→煮沸、加入酸碱等方法使酶变性物GTP反应生成含
沉淀→离心→滤膜过滤除酶→冻干浓 缩→反相HPLC分离纯化→冻干
乙酸胺水溶液→得固体c-di-GMP。其中,HPLC所用流动相分别为乙腈和
(pH4.8),用紫外检测器在254nm下检测产物。
由此可见,传统方法的分离纯化工艺复杂,耗时耗能。反相色谱柱对样品要求比较
严, 要先除去可能会在柱子上沉积的杂质(如酶),不然会降低色谱柱使用
要有冻干仪又会耗费大量时间,致使生产效率低
溶剂,会对操作者和环境造
离纯化
寿命;冻干过程既需
下。并且由于在制备过程中使用大量有机
成危害,环保效果差。因此,开发新的简便、高效、绿色的分
技术是非常有必要的。
发明内容
针对现有技术中分离纯化c-di-GMP所存在的不足,本发明提供了一种新型的分离
纯
本发明所述c-di-GMP的分离纯化方法,步骤是:
(1)取含c-di-GMP的粗产物溶液,以1~5mL/min的流速,直接上样于配有离子交
换 色谱柱的快速蛋白液相色谱(Fast protein liquid chromatography,
1000mL;
化c-di-GMP的方法。
FPLC),上样量为1~
(2)上样结束后,用洗脱液A和洗脱液B梯度洗脱,流速为1~5mL/min;其中所述
洗脱液A为pH8.0的缓冲液,所述缓冲液为Tris-HCl、
Na2HPO4-NaH2PO4或
K2HPO4-KH2PO4;所述
洗脱液B为A液中加入1M NaCl;
(3)用紫外检测器在254nm下检测,收集出峰位置处洗脱液,用质谱确证结构,然
后
(4)以反相高效液相色谱(High performance Liquid Chromatography,HPLC)检测,确
定
上述洗脱结束后的离子交换色谱柱,经洗脱液B彻底清除柱上吸附物,再经洗脱
液A
上述c-di-GMP分离纯化方法中,优选的实施条件是:
所述快速蛋白液相色谱优选GEAKTAFPLC;
所述离子交换色谱柱为Mini Q 4.6/50PE时,优选上样量为1~10mL,优选上样流
速 和洗脱流速均为1~2mL/min;所述离子交换色谱柱为
为10~100mL,优选上样流速和
Q HP 16/10时,
平衡后还可用于下一轮c-di-GMP的分离纯化。
固体c-di-GMP纯度。
将含目标化合物洗脱液冻干,制得固体c-di-GMP;
Source Q HP 10/10时,优选上样量
洗脱流速均为3~4mL/min;所述离子交换色谱柱为Source
优选上样量为50~1000mL,优选上样流速和洗脱流速均为4~5mL/min;
所述梯度洗脱优选以0→20倍柱体积进行,所述洗脱液A的浓度值以100%→0进
行,
所述缓冲液优选Tris-HCl;
同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
所述高效液相色谱为Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为Agela Venusil MP C18
4.6mm×250mm,洗脱液A为pH4.8的10mM乙酸胺水溶液,洗脱液B为乙
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值以
B的浓度值以0→50%进行;目标产物c-
腈,流速为
100%→50%进行,同时洗脱液
di-GMP保留时间在12.0~12.5min。
利用本发明方法分离纯化后的c-di-GMP产物经反相HPLC检测,纯度达95%以上,
快速蛋白液相色谱(Fast protein liquid chromatography,FPLC)是一种新型、快速、
高效 色谱技术,目前主要用于分离纯化蛋白质,目前尚没有利用FPLC分
本发明采用离子交换FPLC装置作为主要设备来
产物,且待分离纯化的原料
理,实现了一
符合生物学、动物药理学等科研工作需要。
离纯化核苷酸的报导。
分离纯化c-di-GMP,不仅能够获得纯净的
在进入离子交换FPLC装置之前不需经过除酶、冻干浓缩等处
步法直接从酶反应液或组织提取液中分离纯化c-di-GMP。并且,离子交换
FPLC装置柱容量大、回收效率高且不易使生物分子失活,一次可以处理较
一步缩减了分离纯化时间,提高了分离纯化速度。 多的原料,进
与传统反相HPLC分离纯化技术相比,本发明在简化步骤、节省时间的同时,还
避免 了毒性有机溶剂乙腈的大量使用,显著提高了c-di-GMP分离纯化的
操作者和环境造成的危害。生产成本的降低、环
工业应用前景。
效率,消除了乙腈对
境污染的减轻无疑给该工作带来了广阔的
附图说明
图1.采用离子交换FPLC分离纯化c-di-GMP的图谱。
其中:FPLC为GE AKTA FPLC,离子交换色谱柱为Mini Q 4.6/50PE,两种洗脱液
分 别为25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl(pH8.0)+1M NaCl(B)。
c-di-GMP在洗脱液电导为35.97mS/cm时出峰。 目标产物
图2.本发明所得c-di-GMP经HPLC纯度鉴定图谱。
其中:HPLC为Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为Agela Venusil MP C18
4.6mm×250mm,两种洗脱液分别为10mM乙酸胺水溶液(pH4.8)(A)和乙腈
c-di-GMP保留时间在12.3min。 (B);目标产物
具体实施方式
下面结合实施例对本发明作详细的描述,但本发明保护内容不仅限于此。
实施例1c-di-GMP的粗产物溶液的制备(酶促反应法)
将GTP(购自Sigma)和具有c-di-GMP合成活性的酶VCA0956以摩尔比1000∶2的
比例
加入到反应缓冲液(75mM Tris-HCl pH 8.0,250mM NaCl,25mM KCl,
室温下反应过夜,得含c-di-GMP的粗产10mM MgCl2)中,
物溶液。
其中:上述VCA0956的表达纯化及c-di-GMP的粗产物溶液制备的详细方法及步
骤请 参阅文献:Rita Tamayo,Anna er,
and Andrew EAL domain protein VieA
is a cyclic diguanylate .,2005,280,33324-
33330.
实施例2
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液4mL,以1mL/min的流速,上样于
(2)上样结束后,以1.5mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-
配有Mini Q 4.6/50PE的离子交换色谱柱GE AKTA FPLC;
HCl (pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进脱液A的浓度值以
行;
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为35.97mS/cm时出峰,收集出峰
位置洗脱液,用质谱确证其结构[(ESI+):m/e(relative intensity):
346.2],此部分洗脱液冻干,即得[M+1]+691.2,[M+2]2+
固体c-di-GMP(结果如图1所示);
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C18 4.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
进行,同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
实施例3
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液30mL,以3mL/min的流速,上样
于
(2)上样结束后,以3mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl
(pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗脱液A
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
配有Source Q HP 10/10离子交换色谱柱的GE AKTA FPLC;
的c-di-GMP纯度达100%(结果如图2所示)。
的浓度值以
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为36.03mS/cm时出峰,收集出峰
位置洗脱液,用质谱确证其结构,此部分洗脱液冻干,即得固体c-di-GMP;
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%进行,
的c-
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/miin梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
di-GMP纯度达96%。
实施例4
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液200mL,以5mL/min的流速,上样
(2)上样结束后,以4mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl
(pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗脱液A
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
于配有Source Q HP 16/10离子交换色谱柱的GE AKTAFPLC;
的浓度值以
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为36.07mS/cm时出峰,收集出峰
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%
位置洗脱液,用质谱确证其结构,此部分洗脱液冻干,即得固体c-di-GMP;
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
进行,同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
的c-di-GMP纯度达95%。
2024年8月22日发(作者:百里慧巧)
(19)中华人民共和国国家知识产权局
(12)发明专利说明书
(21)申请号 CN2.X
(22)申请日 2011.09.20
(71)申请人 山东大学
地址 250100 山东省济南市历城区山大南路27号
(72)发明人 谷立川 朱春原 许素娟 陈颖 李冰清
(74)专利代理机构 济南圣达知识产权代理有限公司
代理人 李健康
(51)
C07H19/213
C07H1/06
(10)申请公布号 CN 102443031 A
(43)申请公布日 2012.05.09
权利要求说明书 说明书 幅图
(54)发明名称
一种c-di-GMP的分离纯化方法
(57)摘要
本发明公开了一种c-di-GMP的分
离纯化方法,是将c-di-GMP粗产物溶液直
接上样于配有离子交换色谱柱的快速蛋白
液相色谱,用pH8.0缓冲液梯度洗脱,紫
外检测器254nm检测,收集出峰位置处洗
脱液,用质谱确证结构,然后将含目标化
合物洗脱液冻干,即制得固体c-di-GMP。
本发明方法制得的c-di-GMP经反相高效液
相色谱检测其纯度达95%以上,并实现了
一步法直接从c-di-GMP粗产物溶液中分离
纯化c-di-GMP,且本发明工艺简单,周期
短,不使用毒性有机溶剂,是一种高效、
环保、适合工业化生产的新方法。
法律状态
法律状态公告日
法律状态信息
法律状态
权 利 要 求 说 明 书
1.一种c-di-GMP的分离纯化方法,步骤是:
(1)取含c-di-GMP的粗产物溶液,以1~5mL/min的流速,直接上样于配有离子交
换色
(2)上样结束后,用洗脱液A和洗脱液B梯度洗脱,流速为1~5mL/min;其中所述
洗脱 液A为pH8.0的缓冲液,所述缓冲液为Tris-HCl、
谱柱的快速蛋白液相色谱,上样量为1~1000mL;
Na2HPO4-NaH2PO4或
K2HPO4-KH2PO4;
(3)用紫外检测器在254nm下检测,收集出峰位置处洗脱液,用质谱确证结构,然
后将
(4)以反相高效液相色谱检测,确定固体c-di-GMP纯度。
2.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述快速蛋白液
相色
3.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述离子交换色
谱柱 为Mini Q 4.6/50PE时,上样量为1~10mL,上样流速和洗脱
子交换色谱柱为
谱选GE AKTAFPLC。
含目标化合物洗脱液冻干,制得固体c-di-GMP;
所述洗脱液B为A液中加入1MNaCl;
流速均为1~2mL/min;所述离
Source Q HP 10/10时,上样量为10~100mL,上样流速和洗脱流速均为3~
4mL/min;所述离子交换色谱柱为Source Q HP 16/10时,上样量为50~
和洗脱流速均为4~5mL/min。 1000mL,上样流速
4.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述梯度洗脱以
0→ 20倍柱体积进行,所述洗脱液A的浓度值以100%→0进行,
100%进行。 同时洗脱液B的浓度值以0→
5.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述缓冲液为
Tris-HCl。
6.根据权利要求1所述c-di-GMP的分离纯化方法,其特征在于,所述高效液相色
谱为 Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为
pH4.8的
Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液A为
10mM乙酸胺水溶液,洗脱液B为乙腈,流速为1mL/min;梯度洗脱运行时间30
分,洗脱液A的浓度值以100%→50%进行,同时洗脱液B的浓度
产物c-di-GMP保留时间在12.0~12.5min。值以0→50%进行;目标
说 明 书
技术领域
本发明涉及一种环鸟苷二磷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)的分离纯化方法,具
体地 说,是涉及用配有离子交换色谱柱的快速蛋白液相色谱
FPLC)分离纯化c-di-GMP的方法。(Fast protein liquid chromatography,
背景技术
环鸟苷二磷酸(Cyclic diguanylate,c-di-GMP)是一种具有细菌特异性的新型第二信
使, 它广泛存在于各种真细菌中,但不存在于真核生物中。c-di-GMP参
过程,包括生物膜的形成、运动性的调节、毒力
主要的生存方式,给人类的
据
与调控细菌的多种生理
因子的表达等。生物膜作为自然界中细菌
生产生活带来了严重危害。除了危害环境和工业生产以外,根
NIH的调查报告,80%以上的细菌性感染与生物膜有关,生物膜可以使细菌大幅度
提高
问题。
c-di-GMP在相关科研工作中有重要用途,但市场价格昂贵使其使用受限,2009年
12月 份价格调整为原价十分之一后,1μmol(0.7mg)仍需150欧元
它可以用多种方法来制备,例如组织提取
本的主要因素是其分
对抗生素的耐受性并抵抗机体的免疫防御,从而导致严重的临床耐药
(Biolog Life Science Institute)。
法、化学合成法或者酶促合成法,影响质量和成
离纯化。
现有技术通常采用反相高效液相色谱(High performance Liquid Chromatography,
HPLC) 来分离纯化c-di-GMP。以酶促合成c-di-GMP为例,步骤为:酶与底
c-di-GMP的混合液→煮沸、加入酸碱等方法使酶变性物GTP反应生成含
沉淀→离心→滤膜过滤除酶→冻干浓 缩→反相HPLC分离纯化→冻干
乙酸胺水溶液→得固体c-di-GMP。其中,HPLC所用流动相分别为乙腈和
(pH4.8),用紫外检测器在254nm下检测产物。
由此可见,传统方法的分离纯化工艺复杂,耗时耗能。反相色谱柱对样品要求比较
严, 要先除去可能会在柱子上沉积的杂质(如酶),不然会降低色谱柱使用
要有冻干仪又会耗费大量时间,致使生产效率低
溶剂,会对操作者和环境造
离纯化
寿命;冻干过程既需
下。并且由于在制备过程中使用大量有机
成危害,环保效果差。因此,开发新的简便、高效、绿色的分
技术是非常有必要的。
发明内容
针对现有技术中分离纯化c-di-GMP所存在的不足,本发明提供了一种新型的分离
纯
本发明所述c-di-GMP的分离纯化方法,步骤是:
(1)取含c-di-GMP的粗产物溶液,以1~5mL/min的流速,直接上样于配有离子交
换 色谱柱的快速蛋白液相色谱(Fast protein liquid chromatography,
1000mL;
化c-di-GMP的方法。
FPLC),上样量为1~
(2)上样结束后,用洗脱液A和洗脱液B梯度洗脱,流速为1~5mL/min;其中所述
洗脱液A为pH8.0的缓冲液,所述缓冲液为Tris-HCl、
Na2HPO4-NaH2PO4或
K2HPO4-KH2PO4;所述
洗脱液B为A液中加入1M NaCl;
(3)用紫外检测器在254nm下检测,收集出峰位置处洗脱液,用质谱确证结构,然
后
(4)以反相高效液相色谱(High performance Liquid Chromatography,HPLC)检测,确
定
上述洗脱结束后的离子交换色谱柱,经洗脱液B彻底清除柱上吸附物,再经洗脱
液A
上述c-di-GMP分离纯化方法中,优选的实施条件是:
所述快速蛋白液相色谱优选GEAKTAFPLC;
所述离子交换色谱柱为Mini Q 4.6/50PE时,优选上样量为1~10mL,优选上样流
速 和洗脱流速均为1~2mL/min;所述离子交换色谱柱为
为10~100mL,优选上样流速和
Q HP 16/10时,
平衡后还可用于下一轮c-di-GMP的分离纯化。
固体c-di-GMP纯度。
将含目标化合物洗脱液冻干,制得固体c-di-GMP;
Source Q HP 10/10时,优选上样量
洗脱流速均为3~4mL/min;所述离子交换色谱柱为Source
优选上样量为50~1000mL,优选上样流速和洗脱流速均为4~5mL/min;
所述梯度洗脱优选以0→20倍柱体积进行,所述洗脱液A的浓度值以100%→0进
行,
所述缓冲液优选Tris-HCl;
同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
所述高效液相色谱为Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为Agela Venusil MP C18
4.6mm×250mm,洗脱液A为pH4.8的10mM乙酸胺水溶液,洗脱液B为乙
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值以
B的浓度值以0→50%进行;目标产物c-
腈,流速为
100%→50%进行,同时洗脱液
di-GMP保留时间在12.0~12.5min。
利用本发明方法分离纯化后的c-di-GMP产物经反相HPLC检测,纯度达95%以上,
快速蛋白液相色谱(Fast protein liquid chromatography,FPLC)是一种新型、快速、
高效 色谱技术,目前主要用于分离纯化蛋白质,目前尚没有利用FPLC分
本发明采用离子交换FPLC装置作为主要设备来
产物,且待分离纯化的原料
理,实现了一
符合生物学、动物药理学等科研工作需要。
离纯化核苷酸的报导。
分离纯化c-di-GMP,不仅能够获得纯净的
在进入离子交换FPLC装置之前不需经过除酶、冻干浓缩等处
步法直接从酶反应液或组织提取液中分离纯化c-di-GMP。并且,离子交换
FPLC装置柱容量大、回收效率高且不易使生物分子失活,一次可以处理较
一步缩减了分离纯化时间,提高了分离纯化速度。 多的原料,进
与传统反相HPLC分离纯化技术相比,本发明在简化步骤、节省时间的同时,还
避免 了毒性有机溶剂乙腈的大量使用,显著提高了c-di-GMP分离纯化的
操作者和环境造成的危害。生产成本的降低、环
工业应用前景。
效率,消除了乙腈对
境污染的减轻无疑给该工作带来了广阔的
附图说明
图1.采用离子交换FPLC分离纯化c-di-GMP的图谱。
其中:FPLC为GE AKTA FPLC,离子交换色谱柱为Mini Q 4.6/50PE,两种洗脱液
分 别为25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl(pH8.0)+1M NaCl(B)。
c-di-GMP在洗脱液电导为35.97mS/cm时出峰。 目标产物
图2.本发明所得c-di-GMP经HPLC纯度鉴定图谱。
其中:HPLC为Shimadzu LC-10AD/AT,反相色谱柱为Agela Venusil MP C18
4.6mm×250mm,两种洗脱液分别为10mM乙酸胺水溶液(pH4.8)(A)和乙腈
c-di-GMP保留时间在12.3min。 (B);目标产物
具体实施方式
下面结合实施例对本发明作详细的描述,但本发明保护内容不仅限于此。
实施例1c-di-GMP的粗产物溶液的制备(酶促反应法)
将GTP(购自Sigma)和具有c-di-GMP合成活性的酶VCA0956以摩尔比1000∶2的
比例
加入到反应缓冲液(75mM Tris-HCl pH 8.0,250mM NaCl,25mM KCl,
室温下反应过夜,得含c-di-GMP的粗产10mM MgCl2)中,
物溶液。
其中:上述VCA0956的表达纯化及c-di-GMP的粗产物溶液制备的详细方法及步
骤请 参阅文献:Rita Tamayo,Anna er,
and Andrew EAL domain protein VieA
is a cyclic diguanylate .,2005,280,33324-
33330.
实施例2
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液4mL,以1mL/min的流速,上样于
(2)上样结束后,以1.5mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-
配有Mini Q 4.6/50PE的离子交换色谱柱GE AKTA FPLC;
HCl (pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进脱液A的浓度值以
行;
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为35.97mS/cm时出峰,收集出峰
位置洗脱液,用质谱确证其结构[(ESI+):m/e(relative intensity):
346.2],此部分洗脱液冻干,即得[M+1]+691.2,[M+2]2+
固体c-di-GMP(结果如图1所示);
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C18 4.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
进行,同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
实施例3
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液30mL,以3mL/min的流速,上样
于
(2)上样结束后,以3mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl
(pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗脱液A
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
配有Source Q HP 10/10离子交换色谱柱的GE AKTA FPLC;
的c-di-GMP纯度达100%(结果如图2所示)。
的浓度值以
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为36.03mS/cm时出峰,收集出峰
位置洗脱液,用质谱确证其结构,此部分洗脱液冻干,即得固体c-di-GMP;
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%进行,
的c-
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/miin梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
di-GMP纯度达96%。
实施例4
(1)取实施例1制备的含c-di-GMP的粗产物溶液200mL,以5mL/min的流速,上样
(2)上样结束后,以4mL/min流速,用25mM Tris-HCl(pH8.0)(A)和25mM Tris-HCl
(pH8.0)+1M NaCl(B)梯度洗脱,梯度洗脱以0→20倍柱体积进行,洗脱液A
100%→0进行,同时洗脱液B的浓度值以0→100%进行;
于配有Source Q HP 16/10离子交换色谱柱的GE AKTAFPLC;
的浓度值以
(3)用紫外检测器在254nm下检测;在洗脱液电导为36.07mS/cm时出峰,收集出峰
(4)将步骤(3)的产物经反相HPLC检测,所用高效液相色谱为Shimadzu LC-
10AD/AT, 反相色谱柱为Agela Venusil MP C184.6mm×250mm,洗脱液
溶液,洗脱液B为乙腈,流速为
以100%→50%
位置洗脱液,用质谱确证其结构,此部分洗脱液冻干,即得固体c-di-GMP;
A为pH4.8的10mM乙酸胺水
1mL/min;梯度洗脱运行时间30分,洗脱液A的浓度值
进行,同时洗脱液B的浓度值以0→50%进行;检测结果:本实施例所制得
的c-di-GMP纯度达95%。