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OAS-1基因SNP rs2660与慢性HBV感染者自发性HBeAg血清转换的关系_

IT圈 admin 30浏览 0评论

2024年9月8日发(作者:闻子明)

第3l卷

20lO年

第5期 

9月 

中山大学学报(医学科学版) 

JOURNA1 OF SUN YAT—SEN UNIVERSITY(MEDICAI SCIENCES) 

V{)I.3 1 No.5 

Sep.2010 

OAS.1基因SNP rs2660与慢性HBV感染者自发性 

HBeAg血清转换的关系 

陈禄彪 ,揭育胜 .许

(中山大学附属第三跃院

镇 ,徐启桓 ,彭晓谋 ,高志良 

1.感染科,2.肝病学实验室.广东厂 州510630) 

摘要:【目的】探讨寡聚腺苷酸合成酶基因一1(OAS—1)位点 ̄2660的单核苷酸多态性(SNP)与慢性乙型肝炎病毒 

(HBV)感染者自发性HBeAg血清转换的关系。【方法】收集126例慢性HBV感染者(HBeAg阳性组58例,HBeAt)阳性组68 

例)手『i无HBV感染者(埘照组72例)的外周m,进行DNA提取和扩增,再利用竞争分化聚合酶链反应(CD—PCR)进行扩增, 

并结合酶免疫法显包以检测陔SNP的基 .两组间基因型比例或等位基因频率采用× 检验和优势比(OR)汁算,【结果】 

存HBeAg阳性组SNP rs2660基因型GG+GA比例为29.3%(17/58)、等位基 G频率为l6.4%(19/1 16),而 ItBeAt 阳性 

组分别为47,l%(32/68)和28.7%(39/136).对照组分别为52.7%(38/72)和1 30.6%(44/144);HBeAg阳性组 j ItBeAb 性 

组或对照组之问的差异均存存统汁学意义(基冈型:P=0.042和0.007:等位基因:P=0.021和0.008),而HBeAb阳性组与 

对照组之问的差异无统计学意义(基 型:P=0.499;等位基因:P=0.731) 【结论】SNP rs2660等位基 G【J『能仃助丁慢性 

HB、 感染者发生自发性HBeAg血清转换.其基 型检测对于干扰素治疗慢性liB\'感染者可能有一定的疗效预洲价值 . 

关键词:寡聚腺苷酸合成酶;单核苷酸多态性;乙型肝炎病毒;等位基因;基 型 

中图分类号:Q39.R512.6+2 文献标志码:A 文章编号:1672—3554(2010)05—0657—4 0

Relationship between SNP rs2660 of OAS-1 Gene and Spontaneous HBeAg Seroconversion 

on Patients with Chronic HBV Infection 

CHEN Lu-biao ,JIE Yu—sheng ,XU Zhen ,XU Qi—huan ,PENG Xiao・lnOU ,GAO Zhi—liang 

(1.Department of Infectious Disease,2.Hepatolo ̄Laboratory,The Fhird Affiliated Hospital, 

Sun gat—sen University,Guangzhou 5 1 0630,China) 

Abstract:【Objective】 rhe aim of this stud?,Was to investigate the telationship between the single nucleotide polymoz’phism 

(SNI )rs2660 of oligoadenylate synthetase gene一1(OAS一1)and spontaneous HBeAg seroconversion on patients with chronic 

hepatitis B virus(HBV)infection.【Methods】Blood samples were collected from 1 28 patients with ehronie ttBV infection(58 

HBeAg positive,68 HBeAb positive),and 72 normal control cases without HBV infection.Chromosomal DNA was extracted and 

OAS一1 gene was ampliifed. SNP genotyping was pefrormed with the enzyme immunoassay (EIA) after the compelitively 

differentiated polyme ̄ ase chain reaction(CD—PCR).Odds ratio and chi—square test were applied in statistical analysis.【Resuhs】ln 

HBeAg positive group,frequencies of genotype GG plus GA and allele G were 29.3%(17/58)and 16.4%(19/1 16)on SNP 

rs2660,respectively. they were 47.1%(32/68)and 28.7%(39/1 36)in HBeAb positive group,52.7%(38/72)and 30.6% 

(44/144)in normal control group,respectively.Differences between HBeAg positive group and HBeAb positive group or normal 

control group were statistically signiifcant(genotype:P:0.042 and 0.007;allele:P=0.02 1 and O.008).But the.v weren’t 

between HBeAt)positive group and normal control group(genotype:P=O.499;allele:尸=0.73 1).【Conclusion】Allele G(m 

SNP rs2660 of OAS一1 gene maybe benefit patients with chronic HBV infection to achieve spontaneous HBeAg seroeonversion. 

Genotyping on this SNP may be predicting valuable for interferon therapy for chronic HBV infection. 

Key words:oligoadenylate synthetase;single nucleotide polymorphism;hepatitis B virus;allele;genotype 

[J SUN Yat—sen Univ(Med Sci),2010,31(5):657—660] 

收稿日期:2010—01一l0 

基金项目:广东肯科技计划项目(2009B030801 106) 

作者简介:陈禄彪,主治医师,医学博士,E-mail:clubgz@hotmail.coIrn; 通信作者:徐启桓,主任医师,硕士生导师,E--mail:xqh0303@ 

yahoo.corn.cn 

658 中山大学学报(医学科学版) 第31卷 

人寡聚腺苷酸合成酶(oligoadenylate synthetase, 

OAS)是一类由干扰素(interferon,IFN)诱导产生 

的酶蛋白,由OAS一1、OAS一2和OAS一3基因编码, 

具有激活潜在性RNA酶(1atent Rnase,RNase L) 

降解病毒mRNA、抑制病毒蛋白合成和促进病毒 

感染细胞发生凋亡的作用.在先天性抗病毒免疫 

中发挥重要的作用l_ 。已有研究发现OAS一1基因 

上存在的多个SNP可能对丙型肝炎、SARS等病毒 

感染性疾病的转归产生影响E3-4 ̄,目前国内外关于 

OAS.1基因SNP对慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B 

virus,HBV)感染影响的研究甚少,孔晓飞等[ ] 

发现SNP rs2660与HBV自限性感染呈弱相关。 

具体可能机制未能阐述。为此。本研究利用先前 

建立的相对经济和简便的竞争分化聚合酶链反 

应 ](competitively differentiated polymerase chain 

reaction,CD-PCR)技术,对OAS-1基因上SNP rs2660 

进行基因型检测,探讨它与慢性HBV感染者自发 

性HBeAg血清转换的关系.了解检测该SNP基因 

型作为HBeAg血清转换预测指标的可能性。 

1材料与方法 

1.1研究对象 

收集2006年5月至2007年5月在我院感染 

科就诊的慢性HBV感染病例,根据入选前1个月 

内在本院的乙肝两对半检查结果(AXSYM)分成 

HBeAg阳性组和HBeAb阳性组,两组间的年龄、 

性别比例、谷丙转氨酶水平均具有可比性 入选标 

准:年龄8~30周岁。无接受IFN、核苷(酸)类似 

物等抗HBV药物治疗历史,无明确合并HCV、 

HDV、HIV感染,HBeAb阳性组者HBV DNA<1 

x 10 拷『j!/mL(PE5700荧光定量PCR)和血清HBV 

前c区G1896A变异株阴性(方法参见文献『7])。 

另外收集72名无HBV感染者作为正常对照。采 

静脉 5 mL肝素抗凝保存于一20℃冰箱待检。 

I.2引物探针 

OAS一1基因cDNA的参考序列(GenBank,Acce. 

No.NC

000012),引物和探针用Primer Premier软 

件自行设计并由Invitrogen公司合成(表1),用 

Milli—Q级ddH O稀释成10 nmol/mL。 

1.3试剂和设备 

DNA提取试剂盒购白美国Omega公司,PCR 

试剂、T4 DNA连接酶、E.Coli JM109感受态细胞和 

表1 PCR引物和DNA杂交探针 

Table 1 Primers for PCR and probe for DNA 

hybridization 

0AS1.S ATGTCACAGTC『rCTACCGTAAATG 

0AS1.A AGAGAATAGGTGGAATGAAGTGAG 

0AS1一CLS CCACGCGTATGTCACAGTGTCTACCGTAAATG 

0AS1.CLA TCGCGGCCGCAGAGAATAGGTGGAATGAAGTGAG 

0AS1.1 CGGCGTCCA1、cA GA_flAGGATAGAGGGCATAGAAGG 

0AS1.P Amin01inkerC6.CC rGGAYI"ATACACCAGCTCAC rGAGGAGCm 

0AS1.G DIG.CGTCCCCGTCACA GTGGGACACTTGATCCAGAGTG 

0AS1.A FIFC.GTCAGCGTCCATC GTGGGACAC I’I’GATCCAGAGTA 

OAS1.GC CCACGCGTGGTGGGACTCTrCATCCAGACACGA 

0AS1.AC CCACGCGTGG I℃GGACTCTI℃ATCCAGAGAAGA 

内切酶Not I、Mlu I均购自Takara大连公司,质 

粒载体pCI—neo购自美国Promega公司.DNA凝胶 

纯化试剂盒购自德国QiaGen公司,辣根过氧化物 

酶标记的地高辛抗体(anti—DIC)和异硫氰酸荧光素 

抗体(anti.FIFC)购自瑞士Roche公司。PCR扩增采 

用PTC一200热循环仪、DNA测序采用ABI 3730XL 

测序仪,光密度测定采用Labsystem MK3酶标仪。 

1.4 DNA提取和基础PCR扩增 

取抗凝血细胞100 ILL用ddH O 200 tzL稀释, 

用Omega试剂盒进行DNA提取,DNA提取终液为 

50 L,保存于一20℃备用。对SNP所在DNA片断进 

行基础PCR扩增,50 L反应体系组成:10×PCR 

缓冲液(100 mmol/L Tris—HC1,pH 8.3,500 mmol/L 

KC1,15 mmol/L MgC12)5 L、2.5 mmol/L dNTP 

液4}xL、DNA提取液5 txL、ddH20 34 p,L、引物 

OAS1一S和OAS1一A各1 L、TaqDNA聚合酶1.5 U; 

反应步骤:94℃预热5 rain、94℃变性40 S-,52℃退 

火40 s,72℃延伸60 s、循环数35个、最后延伸5 min。 

1.5制备CD.PCR阳性对照质粒DNA 

随机取一例基因组DNA为模板,上游引物分 

别为OAS1.GC或OAS1一AC和下游引物OAS1一 

CLA进行扩增,除引物外50 L PCR反应体系 

组成和反应条件同基础PCR扩增,扩增产物经 

Not I、Mlu I双酶切后进行2%琼脂糖凝胶电泳, 

用QiaGen DNA纯化试剂盒提取DNA并与质粒载 

体pCI—neo连接,再用E.Coli JM109感受态细胞进 

行转化,挑取克隆菌落在LB培养基增菌,随后提 

取质粒DNA作为CD—PCR检测两个SNP不同等 

位基因的阳性对照 

第5期 陈禄彪。等.OAS—I基因SNP m2660与慢性HBV感染者自发性HBeAg血清转换的关系 659 

1.6 CD.PCR扩增 

经优化得到25 L反应体系:10×PCR缓冲 

液(100 mmol/L Tris.HCI,pH 8.3,500 mmol/L KCI, 

15 mmol/L MgCI2)2.5 L、2.5 mmol/L dNTP溶液 

0.125 ILL、Taq DNA聚合酶2.0 U、基础PCR产物 

1.0 IxL、下游公共引物OAS1.1 0.10 、上游混合 

引物OASI.G 0.38 I.LL和OAS1.A 0.30 L,最后加 

Ae Ge Sl S2 S3 S4 S5 S6 

一●●■■一一曩anti删G 

■■■■●■誓■anit 珲c 

AA GG GA GA GA GA GG AA B 

ddH2O至总反应体积25 L;PCR反应条件:94℃ 

变性1 min、56 oC复性2 min、72 cc延伸2 min、共 

2个循环,然后94℃变性30 S、68 oC复性30 s、72 

图1 基础PCR产物电泳和CD.PCR产物酶反应显色结 

果示意图 

Fig.1 Electrophoresis of basal PCR products and 

genotyping of CD-PCR products by EIA 

A:M was DNA size fnakers.1ane 1—8 were DNA(468 hp) 

ampliifed fi'mn different samples; B: anti—DIG and anti—FIFC in 

different two rows was applied to detect allele G anti A respectively. 

AA.GG()r GA indicated the genotype of each column from the same 

sample.Colunms of Ac&Gc were positive eontrols.Columns of S I— 

S6 were diferent samples. 

。【=延伸40 S、最后72℃延伸5 min.共20个循环。 

1.7酶免疫显色 

用1 X缓冲液(0.1 mol/L Na2CO3和O.1 mol/L 

NaHCO3,体积比为35:65,5 mmol/L EDTA,pH 

9.6)配制探针液OAS1.P(O.04 OD/mL),然后进行 

包板。取每个CD—PCR产物各l0 L加上下对应 

两孔,每孑L加入50 L变性液室温下变性10 min, 

随后各孔加入50 L中和杂交液,60 o【=水浴30 

min后洗涤拍干。上孔加入辣根过氧化物酶标记的 

anti—DIC酶标液(1:1 5oo)50 L以检测等位基因 

G,下孑L加入辣根过氧化物酶标记anti—FITC酶标 

液(1:2 000)50 ixL以检测等位基因A。37℃水浴 

30 min后洗涤拍于。加入含有四甲基联苯胺的底 

物缓冲液。10 min后显色并加入反应终止液,酶标 

PCR扩增产物进行测序.测序结果验证了CD—PCR 

结合酶显色方法对SNP基因型检测的准确性。 

2.3 CD.PCR基因型检测结果 

所用标本的基因型均成功检测(表2),基因型 

GG和GA比例或等位基因G频率在HBeAg阳性 

组明显低于HBeAb阳性组或正常对照组,而 

HBeAb阳性组和正常对照组之间差异无统计学意 

义,提示等位基因G可能有利于宿主发生自发性 

HBeAg血清学转换(OR=2.053,P=0.021);同 

样地,基因型GG和GA可能有利于宿主发生自发 

性HBeAg血清学转换(OR=2.1 14,P=0.042)。 

仪进行/4值测定(波长450 nm),上下两孑L A值比 

(R)≥2.0判为基因型GG,R≤0.5判为基因型 

AA,0.5<R<2.0判为基因型GA 

O 0 湖Ⅲ 

O 

1.8数据统计 

A 

结果采用SPSS 13.0软件进行分析,两组间率 

的比较采用x 检验,并计算相应的优势比(odds 

ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval, 

CI):P<0.05认为差异具有统计学意义。 

3 讨 论 

IFN是机体抵抗病毒感染的先天性免疫中重 

要的细胞因子.OAS.RNase L是IFN抗病毒感染 

的重要途径之一。SNP rs2660位于OAS.1基因的 

3 一UTR区.对OAS.1基因转录活性的影响及 

2 结 果 

2.1 基础PCR扩增和酶反应显色结果 

其机制尚不十分清楚。He等…的研究认为SNP 

rs2660等位基因G对SARS有保护作用.机制并 取基础PCR扩增的DNA液5 L在2%琼脂 

糖凝胶中进行电泳.结果显示符合目的片段468 bp 

大小(图1A);取各样本CD.PCR产物各1O L加 

人上下对应两孑L.经酶免疫反应酶标仪判读SNP 

基因型.显色效果如图1B。 

2.2 CD.PCR产物测序结果 

未阐明:孑L晓飞等 r发现SNP rs2660与HBV自限 

性感染呈弱相关。以上资料提示OAS.1基因的 

SNP对HBV感染的转归可能产生影响,其与 

HBeAg血清转换的关系也值得深入探讨。事实上, 

本研究发现。在年龄小于30岁的HBV感染患者 

中,SNP rs2660等位基因G以及基因型GG和GA 各取2例基因型分别为GG、GA和AA的CD— 

660 中山大学学报(医学科学版) 第31卷 

(1)HBeAb positive(n=68) 

(2)HBeAg positive(n=58) 

(3)Normal control(n:72) 

(1):(2) 

OR(95%C1) (1):(3) 

(2):(3) 

1)P<0.o5 

7(10.3)+25(36.8) 

2(3.4)+15(25.9) 

6(8.3)+32(44.4) 

2.114(1.024~4.490) 

36(52.9) 

4l(7O.7) 

39(28,7) 

19(16.4) 

97(71.3) 

97(83.6) 

100(69.4) 

0.487(0.263~O,902、 

34(47.2) 

0.466(0.223—0.9771 

1.257(0.647~2.442) 

2.696(1.298~5.597) 

4(30.6) 

2.053(1.108—3.802) ) 

O.795(0.409—1.5451 

O-37l f0.179—0.770) 

0.914(0.547—1.527) 

0.45(0.243~0.8161 ) 

1.094(0.655—1,829) 

2.246(1.225~4.1 19) 

均有利于慢性HBV感染者发生自发性HBeAg血 

清转换。本研究的观察对象为小于30岁的HBV 

感染患者.主要考虑到年龄小的患者在肝炎充分 

1 2 j Diaz—Guerra M,Rivas C,Esteban M.Activation of the 

IFN-inducible enzyme RNase L causes apoptosis of 

animal cells[J].Virology,1997,236(2):354—363. 

[3]Knapp S,Yee LJ,Frodsham AJ,et a1.Polymorphisms 

in interferon—induced genes and the outcome of 

hepatitis C virus infection:roles of MxA,OAS一1 and 

活动前就出现自发性HBeAg血清转换可能更能 

体现个体遗传素质的优越性,这也可能是本研究 

观察到OAS 1基因SNP r82660与自发性HBeAg 

血清转换较强相关性的原因。 

我们先前在OAS一1基因SNP rs10774671上 

PKR[J].Genes Immun,2003,4(6):411-419. 

[4]He J,Feng D,de Vlas SJ,et 1.Asasociation of SARS 

susceptibility with single nucleic acid polymorphisms of 

有与此相似的发现【8],该SNP位于OAS.1外显子 

OAS1 and MxA genes:a case—control study[J].BMC 

Infect Dis,2006,6:106. 

E下游,其等位基因决定了mRNA的剪接,当等位 

基因为G时表达相应产物为p46,而为A时表达 

产物为p48和/或p52[ m]。产物p46具有更高的 

酶催化活性,从而导致2 .5 OA合成增多【8'-o]。可 

能更有效地抑制病毒复制和病毒蛋白的合成。而 

SNP rs2660位于rs10774671的下游.虽然本实验 

并没有对所有样本进行DNA测序验证。但已有一 

[5]孔晓飞,张欣欣,杨之寿,等.2'-5 寡聚腺苷酸合成酶 

1基因多态性与乙型肝炎病毒易感性和抗病毒疗效 

的相关性[J].中华肝脏病杂志,2007,15(10):779-780. 

[6]Peng XM,Chen XJ,Li JG,et a1.Novel assay of 

competitively diferentiated polymerase chain reaction 

for screening point mutation of hepatitis B virus[J]. 

World J Gastroenterol,2003,9(8):1743—1746. 

些研究发现这两个SNP存在不平衡连锁关系 , 

这可能是SNP rs2660对HBeAg血清转换产生影 

响的真正原因 

[7]黄绍萍,王冯滨.慢性乙型重型肝炎患者C区变异株 

检测及对预后的影响[J].实用肝脏病杂志,2006,9 

(6):328—329. 

目前,IFN仍然是抗HBV治疗的重要药物之 

[8]陈禄彪,彭晓谋,曹红,等.OAS一1基因SNP 

在抗HBV治疗过程中出现HBV DNA载量下 

rs10774671与慢性HBV感染者自发性HBeAg血清 

降伴随HBeAg血清转换往往是取得良好应答的 

重要评价指标。而在本研究的结果提示,不同个体 

的OAS 1基因SNP rs2660等位基因可能与自发 

性HBeAg血清转换存在关系,因此该SNP基因型 

转换的关系[J].中华实验和临床病毒学杂志,2009, 

23(1):35-37. 

[9]Bonnevie—Nielsen V,Field LL,Lu S,et a1.Variation 

in antivirla 2’,5 一oligoadenylate synthetase(2 5 AS) 

enzyme activity is controlled by a single—nucleotide 

polymorphism at a splice—acceptor site in the OAS1 

检测可作为自发性HBeAg血清转换或IFN抗 

HBV治疗疗效的预测指标。 

参考文献: 

[1]Justesen J,Hartmann R,Kjeldgaard NO.Gene structure 

and function of the 2 一5 一oligoadenylate synthetase 

gene[J].Am J Hum Genet,2005,76(4):623—633. 

[10]Field LL,Bonnevie—Nielsen V,Pociot F,et a1.OAS1 

splice site polymorphism controlling antiviral enzyme 

activity influences susceptibility to type 1 diabetes[J]. 

Diabetes,2005,54(5):1588—1591. 

(编辑孙慧兰) 

family[J].Cel Mol Life Sci,2000,57(11):1593—1612. 

2024年9月8日发(作者:闻子明)

第3l卷

20lO年

第5期 

9月 

中山大学学报(医学科学版) 

JOURNA1 OF SUN YAT—SEN UNIVERSITY(MEDICAI SCIENCES) 

V{)I.3 1 No.5 

Sep.2010 

OAS.1基因SNP rs2660与慢性HBV感染者自发性 

HBeAg血清转换的关系 

陈禄彪 ,揭育胜 .许

(中山大学附属第三跃院

镇 ,徐启桓 ,彭晓谋 ,高志良 

1.感染科,2.肝病学实验室.广东厂 州510630) 

摘要:【目的】探讨寡聚腺苷酸合成酶基因一1(OAS—1)位点 ̄2660的单核苷酸多态性(SNP)与慢性乙型肝炎病毒 

(HBV)感染者自发性HBeAg血清转换的关系。【方法】收集126例慢性HBV感染者(HBeAg阳性组58例,HBeAt)阳性组68 

例)手『i无HBV感染者(埘照组72例)的外周m,进行DNA提取和扩增,再利用竞争分化聚合酶链反应(CD—PCR)进行扩增, 

并结合酶免疫法显包以检测陔SNP的基 .两组间基因型比例或等位基因频率采用× 检验和优势比(OR)汁算,【结果】 

存HBeAg阳性组SNP rs2660基因型GG+GA比例为29.3%(17/58)、等位基 G频率为l6.4%(19/1 16),而 ItBeAt 阳性 

组分别为47,l%(32/68)和28.7%(39/136).对照组分别为52.7%(38/72)和1 30.6%(44/144);HBeAg阳性组 j ItBeAb 性 

组或对照组之问的差异均存存统汁学意义(基冈型:P=0.042和0.007:等位基因:P=0.021和0.008),而HBeAb阳性组与 

对照组之问的差异无统计学意义(基 型:P=0.499;等位基因:P=0.731) 【结论】SNP rs2660等位基 G【J『能仃助丁慢性 

HB、 感染者发生自发性HBeAg血清转换.其基 型检测对于干扰素治疗慢性liB\'感染者可能有一定的疗效预洲价值 . 

关键词:寡聚腺苷酸合成酶;单核苷酸多态性;乙型肝炎病毒;等位基因;基 型 

中图分类号:Q39.R512.6+2 文献标志码:A 文章编号:1672—3554(2010)05—0657—4 0

Relationship between SNP rs2660 of OAS-1 Gene and Spontaneous HBeAg Seroconversion 

on Patients with Chronic HBV Infection 

CHEN Lu-biao ,JIE Yu—sheng ,XU Zhen ,XU Qi—huan ,PENG Xiao・lnOU ,GAO Zhi—liang 

(1.Department of Infectious Disease,2.Hepatolo ̄Laboratory,The Fhird Affiliated Hospital, 

Sun gat—sen University,Guangzhou 5 1 0630,China) 

Abstract:【Objective】 rhe aim of this stud?,Was to investigate the telationship between the single nucleotide polymoz’phism 

(SNI )rs2660 of oligoadenylate synthetase gene一1(OAS一1)and spontaneous HBeAg seroconversion on patients with chronic 

hepatitis B virus(HBV)infection.【Methods】Blood samples were collected from 1 28 patients with ehronie ttBV infection(58 

HBeAg positive,68 HBeAb positive),and 72 normal control cases without HBV infection.Chromosomal DNA was extracted and 

OAS一1 gene was ampliifed. SNP genotyping was pefrormed with the enzyme immunoassay (EIA) after the compelitively 

differentiated polyme ̄ ase chain reaction(CD—PCR).Odds ratio and chi—square test were applied in statistical analysis.【Resuhs】ln 

HBeAg positive group,frequencies of genotype GG plus GA and allele G were 29.3%(17/58)and 16.4%(19/1 16)on SNP 

rs2660,respectively. they were 47.1%(32/68)and 28.7%(39/1 36)in HBeAb positive group,52.7%(38/72)and 30.6% 

(44/144)in normal control group,respectively.Differences between HBeAg positive group and HBeAb positive group or normal 

control group were statistically signiifcant(genotype:P:0.042 and 0.007;allele:P=0.02 1 and O.008).But the.v weren’t 

between HBeAt)positive group and normal control group(genotype:P=O.499;allele:尸=0.73 1).【Conclusion】Allele G(m 

SNP rs2660 of OAS一1 gene maybe benefit patients with chronic HBV infection to achieve spontaneous HBeAg seroeonversion. 

Genotyping on this SNP may be predicting valuable for interferon therapy for chronic HBV infection. 

Key words:oligoadenylate synthetase;single nucleotide polymorphism;hepatitis B virus;allele;genotype 

[J SUN Yat—sen Univ(Med Sci),2010,31(5):657—660] 

收稿日期:2010—01一l0 

基金项目:广东肯科技计划项目(2009B030801 106) 

作者简介:陈禄彪,主治医师,医学博士,E-mail:clubgz@hotmail.coIrn; 通信作者:徐启桓,主任医师,硕士生导师,E--mail:xqh0303@ 

yahoo.corn.cn 

658 中山大学学报(医学科学版) 第31卷 

人寡聚腺苷酸合成酶(oligoadenylate synthetase, 

OAS)是一类由干扰素(interferon,IFN)诱导产生 

的酶蛋白,由OAS一1、OAS一2和OAS一3基因编码, 

具有激活潜在性RNA酶(1atent Rnase,RNase L) 

降解病毒mRNA、抑制病毒蛋白合成和促进病毒 

感染细胞发生凋亡的作用.在先天性抗病毒免疫 

中发挥重要的作用l_ 。已有研究发现OAS一1基因 

上存在的多个SNP可能对丙型肝炎、SARS等病毒 

感染性疾病的转归产生影响E3-4 ̄,目前国内外关于 

OAS.1基因SNP对慢性乙型肝炎病毒(hepatitis B 

virus,HBV)感染影响的研究甚少,孔晓飞等[ ] 

发现SNP rs2660与HBV自限性感染呈弱相关。 

具体可能机制未能阐述。为此。本研究利用先前 

建立的相对经济和简便的竞争分化聚合酶链反 

应 ](competitively differentiated polymerase chain 

reaction,CD-PCR)技术,对OAS-1基因上SNP rs2660 

进行基因型检测,探讨它与慢性HBV感染者自发 

性HBeAg血清转换的关系.了解检测该SNP基因 

型作为HBeAg血清转换预测指标的可能性。 

1材料与方法 

1.1研究对象 

收集2006年5月至2007年5月在我院感染 

科就诊的慢性HBV感染病例,根据入选前1个月 

内在本院的乙肝两对半检查结果(AXSYM)分成 

HBeAg阳性组和HBeAb阳性组,两组间的年龄、 

性别比例、谷丙转氨酶水平均具有可比性 入选标 

准:年龄8~30周岁。无接受IFN、核苷(酸)类似 

物等抗HBV药物治疗历史,无明确合并HCV、 

HDV、HIV感染,HBeAb阳性组者HBV DNA<1 

x 10 拷『j!/mL(PE5700荧光定量PCR)和血清HBV 

前c区G1896A变异株阴性(方法参见文献『7])。 

另外收集72名无HBV感染者作为正常对照。采 

静脉 5 mL肝素抗凝保存于一20℃冰箱待检。 

I.2引物探针 

OAS一1基因cDNA的参考序列(GenBank,Acce. 

No.NC

000012),引物和探针用Primer Premier软 

件自行设计并由Invitrogen公司合成(表1),用 

Milli—Q级ddH O稀释成10 nmol/mL。 

1.3试剂和设备 

DNA提取试剂盒购白美国Omega公司,PCR 

试剂、T4 DNA连接酶、E.Coli JM109感受态细胞和 

表1 PCR引物和DNA杂交探针 

Table 1 Primers for PCR and probe for DNA 

hybridization 

0AS1.S ATGTCACAGTC『rCTACCGTAAATG 

0AS1.A AGAGAATAGGTGGAATGAAGTGAG 

0AS1一CLS CCACGCGTATGTCACAGTGTCTACCGTAAATG 

0AS1.CLA TCGCGGCCGCAGAGAATAGGTGGAATGAAGTGAG 

0AS1.1 CGGCGTCCA1、cA GA_flAGGATAGAGGGCATAGAAGG 

0AS1.P Amin01inkerC6.CC rGGAYI"ATACACCAGCTCAC rGAGGAGCm 

0AS1.G DIG.CGTCCCCGTCACA GTGGGACACTTGATCCAGAGTG 

0AS1.A FIFC.GTCAGCGTCCATC GTGGGACAC I’I’GATCCAGAGTA 

OAS1.GC CCACGCGTGGTGGGACTCTrCATCCAGACACGA 

0AS1.AC CCACGCGTGG I℃GGACTCTI℃ATCCAGAGAAGA 

内切酶Not I、Mlu I均购自Takara大连公司,质 

粒载体pCI—neo购自美国Promega公司.DNA凝胶 

纯化试剂盒购自德国QiaGen公司,辣根过氧化物 

酶标记的地高辛抗体(anti—DIC)和异硫氰酸荧光素 

抗体(anti.FIFC)购自瑞士Roche公司。PCR扩增采 

用PTC一200热循环仪、DNA测序采用ABI 3730XL 

测序仪,光密度测定采用Labsystem MK3酶标仪。 

1.4 DNA提取和基础PCR扩增 

取抗凝血细胞100 ILL用ddH O 200 tzL稀释, 

用Omega试剂盒进行DNA提取,DNA提取终液为 

50 L,保存于一20℃备用。对SNP所在DNA片断进 

行基础PCR扩增,50 L反应体系组成:10×PCR 

缓冲液(100 mmol/L Tris—HC1,pH 8.3,500 mmol/L 

KC1,15 mmol/L MgC12)5 L、2.5 mmol/L dNTP 

液4}xL、DNA提取液5 txL、ddH20 34 p,L、引物 

OAS1一S和OAS1一A各1 L、TaqDNA聚合酶1.5 U; 

反应步骤:94℃预热5 rain、94℃变性40 S-,52℃退 

火40 s,72℃延伸60 s、循环数35个、最后延伸5 min。 

1.5制备CD.PCR阳性对照质粒DNA 

随机取一例基因组DNA为模板,上游引物分 

别为OAS1.GC或OAS1一AC和下游引物OAS1一 

CLA进行扩增,除引物外50 L PCR反应体系 

组成和反应条件同基础PCR扩增,扩增产物经 

Not I、Mlu I双酶切后进行2%琼脂糖凝胶电泳, 

用QiaGen DNA纯化试剂盒提取DNA并与质粒载 

体pCI—neo连接,再用E.Coli JM109感受态细胞进 

行转化,挑取克隆菌落在LB培养基增菌,随后提 

取质粒DNA作为CD—PCR检测两个SNP不同等 

位基因的阳性对照 

第5期 陈禄彪。等.OAS—I基因SNP m2660与慢性HBV感染者自发性HBeAg血清转换的关系 659 

1.6 CD.PCR扩增 

经优化得到25 L反应体系:10×PCR缓冲 

液(100 mmol/L Tris.HCI,pH 8.3,500 mmol/L KCI, 

15 mmol/L MgCI2)2.5 L、2.5 mmol/L dNTP溶液 

0.125 ILL、Taq DNA聚合酶2.0 U、基础PCR产物 

1.0 IxL、下游公共引物OAS1.1 0.10 、上游混合 

引物OASI.G 0.38 I.LL和OAS1.A 0.30 L,最后加 

Ae Ge Sl S2 S3 S4 S5 S6 

一●●■■一一曩anti删G 

■■■■●■誓■anit 珲c 

AA GG GA GA GA GA GG AA B 

ddH2O至总反应体积25 L;PCR反应条件:94℃ 

变性1 min、56 oC复性2 min、72 cc延伸2 min、共 

2个循环,然后94℃变性30 S、68 oC复性30 s、72 

图1 基础PCR产物电泳和CD.PCR产物酶反应显色结 

果示意图 

Fig.1 Electrophoresis of basal PCR products and 

genotyping of CD-PCR products by EIA 

A:M was DNA size fnakers.1ane 1—8 were DNA(468 hp) 

ampliifed fi'mn different samples; B: anti—DIG and anti—FIFC in 

different two rows was applied to detect allele G anti A respectively. 

AA.GG()r GA indicated the genotype of each column from the same 

sample.Colunms of Ac&Gc were positive eontrols.Columns of S I— 

S6 were diferent samples. 

。【=延伸40 S、最后72℃延伸5 min.共20个循环。 

1.7酶免疫显色 

用1 X缓冲液(0.1 mol/L Na2CO3和O.1 mol/L 

NaHCO3,体积比为35:65,5 mmol/L EDTA,pH 

9.6)配制探针液OAS1.P(O.04 OD/mL),然后进行 

包板。取每个CD—PCR产物各l0 L加上下对应 

两孔,每孑L加入50 L变性液室温下变性10 min, 

随后各孔加入50 L中和杂交液,60 o【=水浴30 

min后洗涤拍干。上孔加入辣根过氧化物酶标记的 

anti—DIC酶标液(1:1 5oo)50 L以检测等位基因 

G,下孑L加入辣根过氧化物酶标记anti—FITC酶标 

液(1:2 000)50 ixL以检测等位基因A。37℃水浴 

30 min后洗涤拍于。加入含有四甲基联苯胺的底 

物缓冲液。10 min后显色并加入反应终止液,酶标 

PCR扩增产物进行测序.测序结果验证了CD—PCR 

结合酶显色方法对SNP基因型检测的准确性。 

2.3 CD.PCR基因型检测结果 

所用标本的基因型均成功检测(表2),基因型 

GG和GA比例或等位基因G频率在HBeAg阳性 

组明显低于HBeAb阳性组或正常对照组,而 

HBeAb阳性组和正常对照组之间差异无统计学意 

义,提示等位基因G可能有利于宿主发生自发性 

HBeAg血清学转换(OR=2.053,P=0.021);同 

样地,基因型GG和GA可能有利于宿主发生自发 

性HBeAg血清学转换(OR=2.1 14,P=0.042)。 

仪进行/4值测定(波长450 nm),上下两孑L A值比 

(R)≥2.0判为基因型GG,R≤0.5判为基因型 

AA,0.5<R<2.0判为基因型GA 

O 0 湖Ⅲ 

O 

1.8数据统计 

A 

结果采用SPSS 13.0软件进行分析,两组间率 

的比较采用x 检验,并计算相应的优势比(odds 

ratio,OR)和95%置信区间(confidence interval, 

CI):P<0.05认为差异具有统计学意义。 

3 讨 论 

IFN是机体抵抗病毒感染的先天性免疫中重 

要的细胞因子.OAS.RNase L是IFN抗病毒感染 

的重要途径之一。SNP rs2660位于OAS.1基因的 

3 一UTR区.对OAS.1基因转录活性的影响及 

2 结 果 

2.1 基础PCR扩增和酶反应显色结果 

其机制尚不十分清楚。He等…的研究认为SNP 

rs2660等位基因G对SARS有保护作用.机制并 取基础PCR扩增的DNA液5 L在2%琼脂 

糖凝胶中进行电泳.结果显示符合目的片段468 bp 

大小(图1A);取各样本CD.PCR产物各1O L加 

人上下对应两孑L.经酶免疫反应酶标仪判读SNP 

基因型.显色效果如图1B。 

2.2 CD.PCR产物测序结果 

未阐明:孑L晓飞等 r发现SNP rs2660与HBV自限 

性感染呈弱相关。以上资料提示OAS.1基因的 

SNP对HBV感染的转归可能产生影响,其与 

HBeAg血清转换的关系也值得深入探讨。事实上, 

本研究发现。在年龄小于30岁的HBV感染患者 

中,SNP rs2660等位基因G以及基因型GG和GA 各取2例基因型分别为GG、GA和AA的CD— 

660 中山大学学报(医学科学版) 第31卷 

(1)HBeAb positive(n=68) 

(2)HBeAg positive(n=58) 

(3)Normal control(n:72) 

(1):(2) 

OR(95%C1) (1):(3) 

(2):(3) 

1)P<0.o5 

7(10.3)+25(36.8) 

2(3.4)+15(25.9) 

6(8.3)+32(44.4) 

2.114(1.024~4.490) 

36(52.9) 

4l(7O.7) 

39(28,7) 

19(16.4) 

97(71.3) 

97(83.6) 

100(69.4) 

0.487(0.263~O,902、 

34(47.2) 

0.466(0.223—0.9771 

1.257(0.647~2.442) 

2.696(1.298~5.597) 

4(30.6) 

2.053(1.108—3.802) ) 

O.795(0.409—1.5451 

O-37l f0.179—0.770) 

0.914(0.547—1.527) 

0.45(0.243~0.8161 ) 

1.094(0.655—1,829) 

2.246(1.225~4.1 19) 

均有利于慢性HBV感染者发生自发性HBeAg血 

清转换。本研究的观察对象为小于30岁的HBV 

感染患者.主要考虑到年龄小的患者在肝炎充分 

1 2 j Diaz—Guerra M,Rivas C,Esteban M.Activation of the 

IFN-inducible enzyme RNase L causes apoptosis of 

animal cells[J].Virology,1997,236(2):354—363. 

[3]Knapp S,Yee LJ,Frodsham AJ,et a1.Polymorphisms 

in interferon—induced genes and the outcome of 

hepatitis C virus infection:roles of MxA,OAS一1 and 

活动前就出现自发性HBeAg血清转换可能更能 

体现个体遗传素质的优越性,这也可能是本研究 

观察到OAS 1基因SNP r82660与自发性HBeAg 

血清转换较强相关性的原因。 

我们先前在OAS一1基因SNP rs10774671上 

PKR[J].Genes Immun,2003,4(6):411-419. 

[4]He J,Feng D,de Vlas SJ,et 1.Asasociation of SARS 

susceptibility with single nucleic acid polymorphisms of 

有与此相似的发现【8],该SNP位于OAS.1外显子 

OAS1 and MxA genes:a case—control study[J].BMC 

Infect Dis,2006,6:106. 

E下游,其等位基因决定了mRNA的剪接,当等位 

基因为G时表达相应产物为p46,而为A时表达 

产物为p48和/或p52[ m]。产物p46具有更高的 

酶催化活性,从而导致2 .5 OA合成增多【8'-o]。可 

能更有效地抑制病毒复制和病毒蛋白的合成。而 

SNP rs2660位于rs10774671的下游.虽然本实验 

并没有对所有样本进行DNA测序验证。但已有一 

[5]孔晓飞,张欣欣,杨之寿,等.2'-5 寡聚腺苷酸合成酶 

1基因多态性与乙型肝炎病毒易感性和抗病毒疗效 

的相关性[J].中华肝脏病杂志,2007,15(10):779-780. 

[6]Peng XM,Chen XJ,Li JG,et a1.Novel assay of 

competitively diferentiated polymerase chain reaction 

for screening point mutation of hepatitis B virus[J]. 

World J Gastroenterol,2003,9(8):1743—1746. 

些研究发现这两个SNP存在不平衡连锁关系 , 

这可能是SNP rs2660对HBeAg血清转换产生影 

响的真正原因 

[7]黄绍萍,王冯滨.慢性乙型重型肝炎患者C区变异株 

检测及对预后的影响[J].实用肝脏病杂志,2006,9 

(6):328—329. 

目前,IFN仍然是抗HBV治疗的重要药物之 

[8]陈禄彪,彭晓谋,曹红,等.OAS一1基因SNP 

在抗HBV治疗过程中出现HBV DNA载量下 

rs10774671与慢性HBV感染者自发性HBeAg血清 

降伴随HBeAg血清转换往往是取得良好应答的 

重要评价指标。而在本研究的结果提示,不同个体 

的OAS 1基因SNP rs2660等位基因可能与自发 

性HBeAg血清转换存在关系,因此该SNP基因型 

转换的关系[J].中华实验和临床病毒学杂志,2009, 

23(1):35-37. 

[9]Bonnevie—Nielsen V,Field LL,Lu S,et a1.Variation 

in antivirla 2’,5 一oligoadenylate synthetase(2 5 AS) 

enzyme activity is controlled by a single—nucleotide 

polymorphism at a splice—acceptor site in the OAS1 

检测可作为自发性HBeAg血清转换或IFN抗 

HBV治疗疗效的预测指标。 

参考文献: 

[1]Justesen J,Hartmann R,Kjeldgaard NO.Gene structure 

and function of the 2 一5 一oligoadenylate synthetase 

gene[J].Am J Hum Genet,2005,76(4):623—633. 

[10]Field LL,Bonnevie—Nielsen V,Pociot F,et a1.OAS1 

splice site polymorphism controlling antiviral enzyme 

activity influences susceptibility to type 1 diabetes[J]. 

Diabetes,2005,54(5):1588—1591. 

(编辑孙慧兰) 

family[J].Cel Mol Life Sci,2000,57(11):1593—1612. 

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