2024年3月29日发(作者:边小之)
国家计量技术规范规程制修订
《数字
PCR
仪校准规范》
(征求意见稿)
实验报告
中国计量科学研究院
南京市计量监督检测院
2020年07月
实验报告
一、实验目的
验证《数字PCR仪校准规范》的适用性和可行性。
二、实验地点
BioradQX200验证实验分别在在中国计量科学研究院、南京市计量监督检测
院、南京海关动植物与食品检测中心、南京市食品药品监督检验院、中国科学院
武汉病毒研究所、广州医科大学附属第一医院、北京昭衍新药研究中心股份有限
公司、广州优泽医学检验实验室有限公司、新羿DropMakerM1/ChipReaderR1
验证实验在新羿制造科技(北京)有限公司进行;ThermoFisherQuantStudio3D
验证实验在南京市计量监督检测院进行。
三、环境条件
实验过程中环境温度均在(20-30)
C,在校准过程中环境温度的变化均在
3
C以内。
四、实验仪器与实验设计
在验证实验中,共对Biorad公司、ThermoFisher公司、新羿制造科技(北京)
有限公司的12台数字PCR仪进行了12次验证实验。从公司数量来看,涵盖了
市场上主要的数字PCR仪生产厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌
的数字PCR仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。
五、标准物质
进行验证实验使用的标准物质有GBW09857人基因组标准物质,
GBW(E)090640EGFR基因突变标准物质,GBW(E)091103定量PCR仪校准用标
准物质,GBW(E)091098新型冠状病毒核酸标准物质(低浓度),GBW10086转
基因玉米NK603质粒分子标准物质。
。
六、实验结果
6.1BioradQX200验证实验
6.1.1QX200仪器1验证实验
根据校准规范的要求,采用GBW09857人基因组标准物质对南京市计量监
督检测院的BioradQX200进行了验证实验。
(1)拷贝数浓度示值误差和重复性
采用人基因组标准物质进行拷贝数浓度示值误差校准,以TE0.1为稀释液,
用天平秤量法将标准物质稀释至S2约5000copy/
L,将S2重复测量6次,取
其平均值,计算相对示值误差,并计算重复性。结果如表1所示,相对示值误差
为1.6%,重复性为1.0%。
表1拷贝数浓度示值误差和重复性校准结果
标准值(copy/μL)
测量值(copy/μL)
平均值(copy/μL)
相对示值误差(%)
重复性(%)
494650075042
4907
5047
4987
1.6
1.0
49464935
(
2
)荧光通道一致性
选择校准板中标记为
S2
的孔,分别用
FAM
通道测定得到的拷贝数浓度除以
VIC
通道测定得到的拷贝数浓度,得到的比值的平均值来表征荧光通道定量的一
致性。结果如表
2
所示,荧光通道一致性为
1.05
。
表2荧光通道一致性校准结果
1
FAM通道拷贝数
浓度(copy/μL)
VIC通道拷贝数
浓度(copy/μL)
2024年3月29日发(作者:边小之)
国家计量技术规范规程制修订
《数字
PCR
仪校准规范》
(征求意见稿)
实验报告
中国计量科学研究院
南京市计量监督检测院
2020年07月
实验报告
一、实验目的
验证《数字PCR仪校准规范》的适用性和可行性。
二、实验地点
BioradQX200验证实验分别在在中国计量科学研究院、南京市计量监督检测
院、南京海关动植物与食品检测中心、南京市食品药品监督检验院、中国科学院
武汉病毒研究所、广州医科大学附属第一医院、北京昭衍新药研究中心股份有限
公司、广州优泽医学检验实验室有限公司、新羿DropMakerM1/ChipReaderR1
验证实验在新羿制造科技(北京)有限公司进行;ThermoFisherQuantStudio3D
验证实验在南京市计量监督检测院进行。
三、环境条件
实验过程中环境温度均在(20-30)
C,在校准过程中环境温度的变化均在
3
C以内。
四、实验仪器与实验设计
在验证实验中,共对Biorad公司、ThermoFisher公司、新羿制造科技(北京)
有限公司的12台数字PCR仪进行了12次验证实验。从公司数量来看,涵盖了
市场上主要的数字PCR仪生产厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌
的数字PCR仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。
五、标准物质
进行验证实验使用的标准物质有GBW09857人基因组标准物质,
GBW(E)090640EGFR基因突变标准物质,GBW(E)091103定量PCR仪校准用标
准物质,GBW(E)091098新型冠状病毒核酸标准物质(低浓度),GBW10086转
基因玉米NK603质粒分子标准物质。
。
六、实验结果
6.1BioradQX200验证实验
6.1.1QX200仪器1验证实验
根据校准规范的要求,采用GBW09857人基因组标准物质对南京市计量监
督检测院的BioradQX200进行了验证实验。
(1)拷贝数浓度示值误差和重复性
采用人基因组标准物质进行拷贝数浓度示值误差校准,以TE0.1为稀释液,
用天平秤量法将标准物质稀释至S2约5000copy/
L,将S2重复测量6次,取
其平均值,计算相对示值误差,并计算重复性。结果如表1所示,相对示值误差
为1.6%,重复性为1.0%。
表1拷贝数浓度示值误差和重复性校准结果
标准值(copy/μL)
测量值(copy/μL)
平均值(copy/μL)
相对示值误差(%)
重复性(%)
494650075042
4907
5047
4987
1.6
1.0
49464935
(
2
)荧光通道一致性
选择校准板中标记为
S2
的孔,分别用
FAM
通道测定得到的拷贝数浓度除以
VIC
通道测定得到的拷贝数浓度,得到的比值的平均值来表征荧光通道定量的一
致性。结果如表
2
所示,荧光通道一致性为
1.05
。
表2荧光通道一致性校准结果
1
FAM通道拷贝数
浓度(copy/μL)
VIC通道拷贝数
浓度(copy/μL)