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数字PCR仪校准规范实验报告-v1.5

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2024年3月29日发(作者:边小之)

国家计量技术规范规程制修订

《数字

PCR

仪校准规范》

(征求意见稿)

实验报告

中国计量科学研究院

南京市计量监督检测院

2020年07月

实验报告

一、实验目的

验证《数字PCR仪校准规范》的适用性和可行性。

二、实验地点

BioradQX200验证实验分别在在中国计量科学研究院、南京市计量监督检测

院、南京海关动植物与食品检测中心、南京市食品药品监督检验院、中国科学院

武汉病毒研究所、广州医科大学附属第一医院、北京昭衍新药研究中心股份有限

公司、广州优泽医学检验实验室有限公司、新羿DropMakerM1/ChipReaderR1

验证实验在新羿制造科技(北京)有限公司进行;ThermoFisherQuantStudio3D

验证实验在南京市计量监督检测院进行。

三、环境条件

实验过程中环境温度均在(20-30)

C,在校准过程中环境温度的变化均在

3

C以内。

四、实验仪器与实验设计

在验证实验中,共对Biorad公司、ThermoFisher公司、新羿制造科技(北京)

有限公司的12台数字PCR仪进行了12次验证实验。从公司数量来看,涵盖了

市场上主要的数字PCR仪生产厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌

的数字PCR仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。

五、标准物质

进行验证实验使用的标准物质有GBW09857人基因组标准物质,

GBW(E)090640EGFR基因突变标准物质,GBW(E)091103定量PCR仪校准用标

准物质,GBW(E)091098新型冠状病毒核酸标准物质(低浓度),GBW10086转

基因玉米NK603质粒分子标准物质。

六、实验结果

6.1BioradQX200验证实验

6.1.1QX200仪器1验证实验

根据校准规范的要求,采用GBW09857人基因组标准物质对南京市计量监

督检测院的BioradQX200进行了验证实验。

(1)拷贝数浓度示值误差和重复性

采用人基因组标准物质进行拷贝数浓度示值误差校准,以TE0.1为稀释液,

用天平秤量法将标准物质稀释至S2约5000copy/

L,将S2重复测量6次,取

其平均值,计算相对示值误差,并计算重复性。结果如表1所示,相对示值误差

为1.6%,重复性为1.0%。

表1拷贝数浓度示值误差和重复性校准结果

标准值(copy/μL)

测量值(copy/μL)

平均值(copy/μL)

相对示值误差(%)

重复性(%)

494650075042

4907

5047

4987

1.6

1.0

49464935

2

)荧光通道一致性

选择校准板中标记为

S2

的孔,分别用

FAM

通道测定得到的拷贝数浓度除以

VIC

通道测定得到的拷贝数浓度,得到的比值的平均值来表征荧光通道定量的一

致性。结果如表

2

所示,荧光通道一致性为

1.05

表2荧光通道一致性校准结果

1

FAM通道拷贝数

浓度(copy/μL)

VIC通道拷贝数

浓度(copy/μL)

2024年3月29日发(作者:边小之)

国家计量技术规范规程制修订

《数字

PCR

仪校准规范》

(征求意见稿)

实验报告

中国计量科学研究院

南京市计量监督检测院

2020年07月

实验报告

一、实验目的

验证《数字PCR仪校准规范》的适用性和可行性。

二、实验地点

BioradQX200验证实验分别在在中国计量科学研究院、南京市计量监督检测

院、南京海关动植物与食品检测中心、南京市食品药品监督检验院、中国科学院

武汉病毒研究所、广州医科大学附属第一医院、北京昭衍新药研究中心股份有限

公司、广州优泽医学检验实验室有限公司、新羿DropMakerM1/ChipReaderR1

验证实验在新羿制造科技(北京)有限公司进行;ThermoFisherQuantStudio3D

验证实验在南京市计量监督检测院进行。

三、环境条件

实验过程中环境温度均在(20-30)

C,在校准过程中环境温度的变化均在

3

C以内。

四、实验仪器与实验设计

在验证实验中,共对Biorad公司、ThermoFisher公司、新羿制造科技(北京)

有限公司的12台数字PCR仪进行了12次验证实验。从公司数量来看,涵盖了

市场上主要的数字PCR仪生产厂家。在实验设计上,按照校准规范对不同品牌

的数字PCR仪进行校准,根据实验结果验证校准规范的可行性和有效性。

五、标准物质

进行验证实验使用的标准物质有GBW09857人基因组标准物质,

GBW(E)090640EGFR基因突变标准物质,GBW(E)091103定量PCR仪校准用标

准物质,GBW(E)091098新型冠状病毒核酸标准物质(低浓度),GBW10086转

基因玉米NK603质粒分子标准物质。

六、实验结果

6.1BioradQX200验证实验

6.1.1QX200仪器1验证实验

根据校准规范的要求,采用GBW09857人基因组标准物质对南京市计量监

督检测院的BioradQX200进行了验证实验。

(1)拷贝数浓度示值误差和重复性

采用人基因组标准物质进行拷贝数浓度示值误差校准,以TE0.1为稀释液,

用天平秤量法将标准物质稀释至S2约5000copy/

L,将S2重复测量6次,取

其平均值,计算相对示值误差,并计算重复性。结果如表1所示,相对示值误差

为1.6%,重复性为1.0%。

表1拷贝数浓度示值误差和重复性校准结果

标准值(copy/μL)

测量值(copy/μL)

平均值(copy/μL)

相对示值误差(%)

重复性(%)

494650075042

4907

5047

4987

1.6

1.0

49464935

2

)荧光通道一致性

选择校准板中标记为

S2

的孔,分别用

FAM

通道测定得到的拷贝数浓度除以

VIC

通道测定得到的拷贝数浓度,得到的比值的平均值来表征荧光通道定量的一

致性。结果如表

2

所示,荧光通道一致性为

1.05

表2荧光通道一致性校准结果

1

FAM通道拷贝数

浓度(copy/μL)

VIC通道拷贝数

浓度(copy/μL)

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