最新消息: USBMI致力于为网友们分享Windows、安卓、IOS等主流手机系统相关的资讯以及评测、同时提供相关教程、应用、软件下载等服务。

Biacore X100简易操作指南

IT圈 admin 26浏览 0评论

2024年5月6日发(作者:诺高)

Biacore X100简易操作指南

一、Biacore X100设备介绍

分子相互作用分析系统Biacore是由仪器主机和电脑两部分组成。

仪器开关在主机右后方,仪器正面左侧为缓冲液入口,可放置运行缓冲液,中上部分

为状态面板,以指示灯显示仪器状态,状态面板右边即为芯片的放置位置,芯片会与SPR

光学检测器、微流控系统IFC嵌合,开展结合分析过程。右侧为样品舱,可放置15个

1.5ml的EP管,下方放有废液瓶。如下图所示。

二、实验准备

实验前需根据实验需求选择芯片,GE提供羧基葡聚糖表面的CM系列芯片、适用于

HIS标签蛋白的NTA芯片、应用于生物素标记分子的SA芯片(通常用于核酸、多肽)等,

蛋白研究最常用CM5芯片,开展实验时会固定一个分子(配体)在芯片表面,另一个分

子(分析物)以流动相流过芯片,通过表面等离子共振SPR的原理研究相互作用的过程。

根据实验目的,需要确定配体的偶联量,可通过以下公式进行计算,其中R

max

代表芯

片的最大结合容量,为分析物在表面的最大响应值,Sm为化学计量比,LigandMW为配体

的分子量,AnalyteMW为分析物的分子量,R

L

代表配体的偶联水平,也即需要求得的值,

实际固定量一般设为1.5R

L

。动力学分析中,R

max

需低于100RU。

Biacore对分子的互作检测是基于功能性的,所以实验过程必须要新鲜有活性的样品,

0.22um膜过滤或者仔细离心,配体纯度要求在90%以上,分析物的纯度依实验类型而定,

进行动力学/亲和力分析时需要90%以上的纯度,进行浓度/特异性测定时可以进混合样品。

缓冲体系选择:大多数缓冲液均适用,可根据样品活性确定最适缓冲液,须新鲜配制,

经0.22um膜过滤及脱气。氨基偶联方法固定配体时,缓冲液中不能含有Tris、甘氨酸等

带有伯胺基的物质。分析物溶液中,不能含甘油、蔗糖、咪唑等高折光率物质,如果样品

中含有该物质,可通过缓冲液置换、透析的方法除去。

三、实验操作

在该部分中,选用CM5芯片,以配体mouse-anti-human β2-microglobulin antibody和分

析物human β2-microglobulin的动力学分析为例进行操作介绍(样品均来自 Biacore getting

started kit),实验流程为配体固定-表面测试-再生条件筛选-分析物进样-芯片再生-数据分

析。

首先将缓冲液更换为实验所用缓冲液HBS-EP+,芯片更换为CM5芯片,选择Tools-

undock chip,填入芯片信息,按照芯片表面箭头所指方向,将芯片放入并合上舱门,点击

dock chip。缓冲液、芯片放置完毕,选择Tools-prime进行缓冲体系更换。

1、pH scouting:在CM5芯片上固定配体之前,需要筛选合适的配体缓冲液pH,使

配体通过静电吸附的作用富集到芯片表面附近,达到较好的偶联效果,通常会从pH5.5,

5.0,4.5,4的10mM醋酸钠中筛选,一般配体浓度为10-100ug/ml,初次实验可尝试

20ug/ml。选择Assay flow-wizard

surface preparation-immobilization pH scouting,单击

New,可设置过程参数。首先选择芯片通道,可从1,2,3,4通道任选一个,buffer已经预置

四种条件,10mM醋酸钠,pH5.5 , 5.0 , 4.5, 4,单击Next,输入配体名称mouse-anti-

human β2-microglobulin antibody,contact time 180s,流速5ul/min,之后用50mM NaOH

再生表面,单击Next,可进行芯片表面温度和样品舱温度的设置,单击Next,左侧选择

sample and reagent rack1,按照样品架中对应位置放置溶液即可,点击Next保存实验方法,

即可开始实验。

2、配体固定:配体在表面的偶联有直接偶联法和捕获法,本实验中使用氨基直接偶

联的方法进行固定。选择Assay flow-wizard

surface preparation-immobilization,单击New,

芯片选择CM5,可对FC1、2、3、4 四通道分别设置,一般1,2通道配对使用(1通道作

为参比),3,4通道配对使用(3通道作为参比),参比通道可用空白对比或活化-封闭

无配体固定的方式,实验用通道1和2,通道2上偶联配体。直接的共价偶联方式有氨基、

巯基或醛基等方法可选,最常用氨基偶联,一般流程是先用EDC/NHS活化,固定配体,再

用乙醇胺封闭。偶联模式有aim for immobilized level 和specify contact time两种,aim for

immobilized level只需输入目标偶联水平,软件会自动实现相应水平的偶联,contact time

模式需要输入进样时间和流速,一般在一定的预实验基础上使用。本实验为动力学分析过

程,Rmax要低于100RU,所以1.5RL计算出来为1000RU左右,直接使用aim for

immobilized level模式,输入target level 1000RU,进行自动偶联。Next之后的步骤同上,

进行实验过程的参数设置。偶联结束后,通过Response bound进行偶联量的检测。

2024年5月6日发(作者:诺高)

Biacore X100简易操作指南

一、Biacore X100设备介绍

分子相互作用分析系统Biacore是由仪器主机和电脑两部分组成。

仪器开关在主机右后方,仪器正面左侧为缓冲液入口,可放置运行缓冲液,中上部分

为状态面板,以指示灯显示仪器状态,状态面板右边即为芯片的放置位置,芯片会与SPR

光学检测器、微流控系统IFC嵌合,开展结合分析过程。右侧为样品舱,可放置15个

1.5ml的EP管,下方放有废液瓶。如下图所示。

二、实验准备

实验前需根据实验需求选择芯片,GE提供羧基葡聚糖表面的CM系列芯片、适用于

HIS标签蛋白的NTA芯片、应用于生物素标记分子的SA芯片(通常用于核酸、多肽)等,

蛋白研究最常用CM5芯片,开展实验时会固定一个分子(配体)在芯片表面,另一个分

子(分析物)以流动相流过芯片,通过表面等离子共振SPR的原理研究相互作用的过程。

根据实验目的,需要确定配体的偶联量,可通过以下公式进行计算,其中R

max

代表芯

片的最大结合容量,为分析物在表面的最大响应值,Sm为化学计量比,LigandMW为配体

的分子量,AnalyteMW为分析物的分子量,R

L

代表配体的偶联水平,也即需要求得的值,

实际固定量一般设为1.5R

L

。动力学分析中,R

max

需低于100RU。

Biacore对分子的互作检测是基于功能性的,所以实验过程必须要新鲜有活性的样品,

0.22um膜过滤或者仔细离心,配体纯度要求在90%以上,分析物的纯度依实验类型而定,

进行动力学/亲和力分析时需要90%以上的纯度,进行浓度/特异性测定时可以进混合样品。

缓冲体系选择:大多数缓冲液均适用,可根据样品活性确定最适缓冲液,须新鲜配制,

经0.22um膜过滤及脱气。氨基偶联方法固定配体时,缓冲液中不能含有Tris、甘氨酸等

带有伯胺基的物质。分析物溶液中,不能含甘油、蔗糖、咪唑等高折光率物质,如果样品

中含有该物质,可通过缓冲液置换、透析的方法除去。

三、实验操作

在该部分中,选用CM5芯片,以配体mouse-anti-human β2-microglobulin antibody和分

析物human β2-microglobulin的动力学分析为例进行操作介绍(样品均来自 Biacore getting

started kit),实验流程为配体固定-表面测试-再生条件筛选-分析物进样-芯片再生-数据分

析。

首先将缓冲液更换为实验所用缓冲液HBS-EP+,芯片更换为CM5芯片,选择Tools-

undock chip,填入芯片信息,按照芯片表面箭头所指方向,将芯片放入并合上舱门,点击

dock chip。缓冲液、芯片放置完毕,选择Tools-prime进行缓冲体系更换。

1、pH scouting:在CM5芯片上固定配体之前,需要筛选合适的配体缓冲液pH,使

配体通过静电吸附的作用富集到芯片表面附近,达到较好的偶联效果,通常会从pH5.5,

5.0,4.5,4的10mM醋酸钠中筛选,一般配体浓度为10-100ug/ml,初次实验可尝试

20ug/ml。选择Assay flow-wizard

surface preparation-immobilization pH scouting,单击

New,可设置过程参数。首先选择芯片通道,可从1,2,3,4通道任选一个,buffer已经预置

四种条件,10mM醋酸钠,pH5.5 , 5.0 , 4.5, 4,单击Next,输入配体名称mouse-anti-

human β2-microglobulin antibody,contact time 180s,流速5ul/min,之后用50mM NaOH

再生表面,单击Next,可进行芯片表面温度和样品舱温度的设置,单击Next,左侧选择

sample and reagent rack1,按照样品架中对应位置放置溶液即可,点击Next保存实验方法,

即可开始实验。

2、配体固定:配体在表面的偶联有直接偶联法和捕获法,本实验中使用氨基直接偶

联的方法进行固定。选择Assay flow-wizard

surface preparation-immobilization,单击New,

芯片选择CM5,可对FC1、2、3、4 四通道分别设置,一般1,2通道配对使用(1通道作

为参比),3,4通道配对使用(3通道作为参比),参比通道可用空白对比或活化-封闭

无配体固定的方式,实验用通道1和2,通道2上偶联配体。直接的共价偶联方式有氨基、

巯基或醛基等方法可选,最常用氨基偶联,一般流程是先用EDC/NHS活化,固定配体,再

用乙醇胺封闭。偶联模式有aim for immobilized level 和specify contact time两种,aim for

immobilized level只需输入目标偶联水平,软件会自动实现相应水平的偶联,contact time

模式需要输入进样时间和流速,一般在一定的预实验基础上使用。本实验为动力学分析过

程,Rmax要低于100RU,所以1.5RL计算出来为1000RU左右,直接使用aim for

immobilized level模式,输入target level 1000RU,进行自动偶联。Next之后的步骤同上,

进行实验过程的参数设置。偶联结束后,通过Response bound进行偶联量的检测。

发布评论

评论列表 (0)

  1. 暂无评论