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中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析

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2024年4月21日发(作者:东方以)

中国农业科学2014,47(5):856・864 

Scientia Agficulurta Sinica doi:10.3864 ̄.issn.0578—1752.2014.05.003 

中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 

王凤格,田红丽,赵久然,王璐,易红梅,宋伟,高玉倩,杨国航 

(北京市农林科学院玉米研究中心,北京100097) 

摘要:【目的】从育成年份、种植区域角度分析中国328个玉米品种的遗传多样性,在分子水平上分析各适 

宜种植区域品种的遗传分化特点,为玉米品种区域试验、审定管理以及育种策略提供一定的理论依据。【方法】利 

用均匀分布于玉米基因组的40对核心SSR弓I物,采用1 0重荧光毛细管电泳检测技术对328个代表性育成品种进 

行基因分型;通过Power-/darker vet.3.25软件评估4O对SSR§J物多态性,对参试品种按年份、区试组分析遗传 

多样性情况;利用多变量统计分析软件MVSP ver.3.1 3对328个品种按区试组进行主坐标分析。【结果】基于328 

个玉米品种数据,检测到40对SSR引物等位基因变异范围为3—16个,平均8.1 0个,多态信息指数(PIC)值变 

化范围为0.18一O.85,平均为0.63。参试品种不同年份间遗传多样性变化不大,PIC值在0.60左右摆动;8个区 

试组品种的总等位基因和总基因型变异范围为170—262和2OO一511,京津唐和西南组分别表现出了最低值和最 

高值,京津唐组PIC值最低为0.51,其余组均接近于0.60,平均杂合度均在0.60左右。8个区试组主坐标分析 

显示鲜食、极早熟品种遗传分布偏离普通玉米区域,具有明显的种质特异性;青贮玉米由于早期对照品种为普通 

玉米导致遗传分布向普通玉米延伸,仅有少数品种分布偏离普通玉米;京津唐、西南、东北早熟三组品种遗传分 

布相对集中;极早熟、京津唐、西南三组之间品种遗传分布几乎无重叠区域;东华北和黄淮海两组参试品种遗传分 

布具有明显的分化但也有部分重叠,原因与对照品种曾经相同、育种同质化有关。【结论】利用SSR标记分析328份 

玉米品种的遗传多样性及遗传分化特点,表明近年来育成品种遗传多样性指数在不同年份间变化不大,除京津唐组 

之外在其它区试组间差异性也不大。参试品种主坐标分析显示各区试组划分、对照品种设置起到了育种导向的作用。 

关键词:玉米;SSR标记;区域试验;遗传多样性 

Genetic Diversity Analysis of 328 Maize Varieties 

(Hybridized Combinations)Using SSR Markers 

WANG Feng—ge,TIAN Hong—li,ZHAO Jiu—ran,WANG Lu,YI Hong—mei,SONG Wei, 

GAO Yu—qian,YANG Guo—hang 

(Maize Research Center,BeijingAcademy ofAgriculture&Forestry Sciences.Beijing 100097) 

Abstract:[Objective]The objective of this study is to analyze the genetic diversity of 328 maize varieties from breeding 

years,planting regions,and to research the genetic differentiation characteristics of all the varieties from every appropriate planting 

region,This study will provide a theoretical basis for het maize regional trial,validation management and breeding strategic adjustment. 

[Method]Forty core SSR primers covering the entire maize genome were used to SCan 328 samples by high--throughput 10-・plex 

capillary electrophoresis platform.The polymorphism of 40 SSR loci and genetic diversiy of t328 samples were evaluated via the 

software Power—Marker ver.3.25,and the Principal Coordinate Analysis(PCoA)of these samples from every regional trial groups 

was executed using statistica1 analysis software MVSP ver.3.13.【Result]The detected alleles of40 SSR primers ranged from 3 to 

16,with an average of 8.10,the polymorphism information index(PIC)ranged from 0.18 to 0.85,with an average of 0.63.There 

收稿日期:2013—09—04;接受日期:2013.12—02 

基金项目:国家国际科技合作项目(2010DFB33740)、国家“十二五”农村领域国家科技计划课题(2叭1BAD35B09) 

联系方式:王风格,E—mail:gege0106@163.tom;田红丽,E—mail:tianhongli9963@163.com;王风格和田红丽为同等贡献作者。通信作者赵久然 

E-mail:maizezhao@126.tom 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 857 

were no signiicant genetic difversity changes among varieties from diferent years.and all the PIC values were about 0.60.The total 

allele and gene—type number of 8 regional trial groups ranged rom 1f 70 to 262 and from 200 to 5 1 1.The varieties from Jing—Jin—Tang 

and Xi-Nan displayed the minimum and maximum values.The varieties from Jing-Jin-Tang roup displgayed the lowest PIC value of 

0.5 1,and the remaining groups were near 0.60,and the average heterozygosity was about 0.60.Principal coordinate nalaysis(PCoA) 

of varieties from eight regional trial roupsg showed that the genetic distirbution of varieties rfom Xian—Shi(maize for table use)and 

Ji-Zao-Shu(very early maturiy tmaize)groups deviated rfom the common maize region,displayed an obvious germplasm speciifcity. 

As the common maize varieties were used as control samples at early stage,the genetic distribution of Qing—Chu(silage corn) 

extended to common maize.The genetic distribution of varieties from Jing-Jin—Tang,Xi-Nan and Dong—Bei-Zao groups was relatively 

concentrated.The genetic distribution of varieties from Ji—Zao—Shu.Jing—Jin—Tang and Xi-Nan groups was almost no overlap.There 

is an obvious genetic variation of varieties from Dong—Hua-Bei and Huang—Huai—Hai groups,but also there are some overlaps,and the 

reasons might be he tsame control variety nd ahet same breeding resource.[Conclusion]Genetic diversiy tnd agenetic ifdferentiation 

of 328 maize varieties were analyzed using 40 SSR markers.The results showed that there were no significant genetic diversity 

changes amongvarietiesindiferentyears,andtherewere alsono significantchanges amongdiferentgroups exceptthatfrom Jing—Jin—Tang. 

Principal coordinate nalaysis showed that he tsettng iofregional trial groups and control varieties has played a guiding role n ibreeding. 

Key words:maize;SSR marker;regional trial;genetic diversiy t

0 引言 

【研究意义】玉米是具有粮、经、果、饲、能多 

元用途的中国重要农作物之一,就种植面积而言已经 

是第一大作物,其总产的增加对全国粮食增产贡献率 

位居各大粮食作物之首。除了面积、产量快速增加之 

位点可共享如maizeGDB和panzea网站公布大量SSR 

位点。这些研究为玉米品种DNA指纹数据库构建、 

遗传多样性分析等研究奠定了良好的基础。迄今,国 

内外关于玉米遗传多样性的报道,主要集中在自交系 

种质资源评估和杂种优势群划分[ ,¨ 或地方品种 

遗传多样性分析【 , 。 【本研究切入点】相对于玉 

外,随着育种进程的加快,玉米品种数量也急剧增加。 

统计1999—.201 1年数据,通过国家和各省市审定的玉 

米品种数目大约5 600个,其中,国家审定417个, 

而且近几年每年参加国家和各省市的区域试验样品数 

米自交系而言,育成杂交种的报道极少,在中国仅有 

早期基于形态或系谱对杂交种的分析[1 ,2005年国家 

预试品种分析[ 或省内推广品种的分析[20-21];国外玉 

米杂交种的研究主要是欧洲近50年来育成品种的遗 

千个。虽然玉米已经日益凸现出重要性,但是就杂交 

种而言其遗传多样性研究报道极少,玉米杂交种多样 

性研究主要体现在已经大面积推广应用的杂交种和参 

加区域试验的品种。玉米区域试验是玉米育种和新品 

种推广的重要环节,参试品种尤其是进入生产试验品 

种代表了当前玉米育种的动向和水平,因此,对参试 

品种的遗传多样性进行分析,可以客观、全面了解当 

传多样性分析[2 。育成玉米杂交种代表了当前育种水 

平和动态,品种管理者和育种家十分关注杂交种的具 

体情况,其审定品种的SSR标准指纹均已经构建,但 

是玉米杂交种的遗传多样性没有进行系统的分析。因 

此除应继续加强DNA标准指纹数据库构建之外,可 

按国家、各省逐步开展玉米杂交种的遗传多样研究, 

以便及时对中国玉米杂交种的遗传多样性进行动态监 

前玉米品种现状,对于品种管理、品种选育以及种质 测。【拟解决的关键问题】本研究利用40对SSR引 

物对2004--2009年来参加国家玉米区试生产试验品 

种及大面积推广品种共计328个品种,从育成年份、 

适宜种植区域多个角度进行遗传多样性分析,试图在 

分子水平上摸清中国育成品种的遗传多样性情况,各 

种植区域品种的遗传分化特点,主要目的为玉米品种 

区域试验、审定管理提供理论依据,同时对育种策略 

资源收集和保护具有重要意义。 【前人研究进展】随 

着分子生物技术的发展,分子标记种类和检测手段日 

趋完善,各种分子标记已经广泛应用玉米遗传多样性 

研究中【】。6】。众多分子标记中,简单重复序列(simple 

sequence repeats,SSR)标记因具有简便、快捷、重复 

性高、多态性高、共显性标记等优点而被广泛应用。 

中国水稻[7】、小麦[ 】、大豆[ 等重要农作物均已利用 

SSR标记对核心种质或育成品种进行了分析评估,为 

的调整具有一定的参考价值。 

遗传研究和育种工作提供重要的依据和参考。对玉米 

而言,全基因组测序研究基础较好,开发的大量标记 

1材料与方法 

1.1 试验材料 

858 中国农业科学 47卷 

供试材料包括2004--2009年参加国家玉米区试 

生产试验的品种289份(表1);各区组对照品种l9 

份;为了全面反映育成品种现状,并且数据分析时具 

有参照样品,同时补充了在全国推广面积前20位的品 

种(按2000---2009年累计推广面积统计),共计328 

份品种。 

1.2基因组DNA提取 

供试品种总DNA提取采取CTAB大量提取法, 

具体步骤按照CIMMYT(International Maize and 

Wheat Improvement Center)实验操作流程[23]。DNA 

质量和浓度用NanoDrop 2000(Thermo Scientiifc)紫 

外分光光度计进行测定,根据测量值调节工作液浓度。 

1.3 SSR标记分析 

选用的40对引物是由北京市农林科学院玉米研 

究中心报道的第1组的20对基本核心引物和第1I组 

的20对扩展核心引物,引物名称、序列等具体信息参 

考已发表的文献[241,这40对引物为国家玉米品种区 

域试验DNA指纹鉴定指定引物。每对引物其中一条 

的5 端用一种荧光染料标记,共选用了PET、NED、 

VIC、FAM四种荧光染料(Applied Biosystems,USA 

公司合成)。PCR反应体系为20此,包括4 gL DNA、 

0.25 ktmol・L 引物、0.15 gmol-L~dNTP、2.5 mmol・L 

MgC12、1单位Taq酶(Genacea,美国)、1×PCR Buffer。 

PCR反应在BIO.RAD公司的PTC.100型PCR仪器上 

进行,程序为94℃5 min;94℃40 S,60℃35 S,72℃ 

45 S,35个循环;72 oC 10 min,4℃保存待测。PCR 

产物在毛细管荧光电泳系统AB 3730XL DNA分析仪 

(Applied Biosystems,USA)上检测。采用l0重PCR 

产物电泳检测的方法,即按照扩增片段大小和荧光 

染料的种类可将l0对引物的扩增产物混合在一起 

电泳【 钔。在96孔电泳板的单个孔中分别加入1.5 10 

重PCR产物的混合物,8.5 甲酰胺,0.1 gL内标 

(GeneScanTM.500 LIZ,Applied Biosystems,USA)。 

上述混合样品在PCR仪上运行95℃变性5 rain,将变 

性后的电泳产物取出,1 000 r/min离心1 min后,于 

AB 373OXL DNA分析仪上进行电泳。预电泳时间为2 

min,15 KV,电泳时间为20 min,15 KV。Date 

Collection Ver.1.0软件收集原始数据。 

1.4数据统计分析 

用GeneMapper Ver.3.7(Applied Biosystems, 

USA)进行原始数据统计和校正,得到328样品×40 

对SSR引物的原始数据表。根据40对核心引物等位 

基因信息表对上述原始数据进行等位基因确定,并形 

成标准DNA指纹数据,该等位基因信息表由北京市 

农林科学院玉米研究中心通过在毛细管荧光电泳系统 

分析大量自交系和杂交种数据总结整理得Nt 。选用 

Power-Marker ver.3.25软件【2制,基于328份玉米品种 

数据分析每对引物的等位基因数目和PIC值 

(polymorphism information content)。同时对参试品 

种按年份、按区试组别分别对等位基因变异丰富度(即 

等位基因数目变化情况)、PIC值、杂合度 

(Heterozygosity)等情况进行分析。选用群体遗传分 

析软件Popgenever.1.31[ ]分析各区试组之间的Nei遗 

传距离【 刚。参考Reif等 针对于杂交种分析方法,在 

本研究中选用多变量统计分析软件MVSP ver.3.13 

(Kovach computing services),将8个区组分别作为 

独立群体进行主坐标分析(principal coordinate 

analysis,PCoA),直观反映8个区试组之间的关系, 

为了进一步确定东华北与黄淮海两区,西南与东北早 

两区之间参试样品关系,将其独立进行主坐标分析。 

2 结果 

2.1 40对SSR引物多态性分析 

基于328份品种数据分析40对SSR引物的等位 

基因和PIC指数变化(图l-A),4O对引物检测到的 

等位基因变异范围为3—16个,平均8.10个,多态信 

息指数PIC值变化范围为0.18—0.85,平均0.63,反 

映PIC指数变化与等位基因变异丰富度密切相关,随 

着等位基因数目的增加PIC值也在增加,但并非线性 

关系,有的位点(如N19)等位基因数目较多,但PIC 

值却较低。对N19(等位基因数=6,PIC=O.36)和 

N22(等位基因=16,PIC=0.85)2个位点的所有等位 

基因在所有品种中的分布频率进行统计分析(图1-B 

和图1.C),位点N19的6个等位基因中,等位基因 

222分布频率非常高达78%,因此,6个等位基因在 

杂交种的分布不均匀。与N19的情况相反,位点N22 

的等位基因分布频率相对均匀,有多个高频率的等位 

基因。 

2.2 中国选育玉米品种的遗传多样性和遗传结构分 

析 

不同年份选育玉米品种的遗传多样性比较:289 

份区域试验品种依据年份划分为6组,进行遗传多样 

性分析评价(表1)。2005--2007、2009年品种的总 

等位基因数、总基因型数、平均等位基因数、平均基 

因型数均高于2004和2008年相应的值,但可能受参 

试品种数目变化影响;各年度间PIC值以及平均杂合 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 859 

竺篇g吕 Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z 暑 =2罱 昌 答!S 高 导Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z 譬 :。g 2 8 苫=罱 

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A:基于328份玉米品种数据,4O对SSR引物等位基因和PIC指数变化情况,横坐标引物位置按照等位基因数目从小到大顺序排列;B:引物tune1432y6 

(N19)检测到的等位基因变异及其频率;c:引物bnlg1671y17(N22)检测到的等位基因及其频率 

A:Change of alleles and PIC index of the 40 SSR primers based on 328 samples data,the order ofprimers displayed on the abscissa is according to the allele 

number;B:Alleles variation and frequencies detected in primers umc1432y6(N19);C:Alleles variation and frequencies detected in primers bnlg1671yl7 

(N22) 

图1 4O对核心SSR引物多态性分析 

Fig.1 Polymorphism of the 40 core SSR primers used in this study 

表1 参加生产试验玉米品种不同年份之间的遗传多样性 

Table 1 Genetic diversity comparison of maize varieties tested in national production trial in diferent years 

O O O 0 0 O O O 0 0 

9 8 7 6 5 4 3 2 l O 

度变化不大,PIC值和杂合度均在0.60左右摆动,说 

明近些年来参加国家玉米品种生产试验样品的遗传多 

样性没有较大变化。 

不同区试组别玉米品种的遗传多样性比较:国家 

参与比较分析的8个区试组品种的总等位基因和总基 

因型变异范围为l7O一262和20O一51 1,京津唐和西 

南组分别表现出了最低值和最高值,就平均等位基因 

和平均基因型数而言,京津唐和极早熟组相对较低, 

PIC值京津唐组最低为0.5 1,其余均接近于0.60,平 

均杂合度均在0.60左右。说明除京津唐组之外,各区 

组之间遗传多样性差异不大。 

玉米品种区域试验主管部门依据生态区划、农业区划、 

品种类型、结合生产实际、播期类型等划分各个试验 

区组。328份杂交种按照用途和区域试验组别划分为 

10组(根据2009年国家玉米品种区域试验方案划分), 

其中,西北春玉米组由于每年进入生产试验的样品量 

较少,东南玉米组是2007年才增加的一个区试组别, 

所以这两个组中样品量较少没有列入分析(表2)。 

杂交种各区试组之间的遗传距离:以8个区试组 

别为单位分析各组别之间的Nei[28】遗传距离(表3)。 

就各组之间的遗传距离而言,京津唐与其他组之间遗 

传距离最远,如京津唐与极早熟、鲜食、东华北、西 

860 中国农业科学 47卷 

南之间的遗传距离相对于其他组别之间最远,西南组 

与东华北组之间遗传距离最近,各组之间遗传距离相 

对较近的均集中在西南、东北华与青贮、黄淮海、东 

北早熟之间。 

北早两组在地理分布上无任何交叉但遗传分布重叠 

(图2一B和图2-C)。东华北、黄淮海两组品种的遗 

传变异较大(图2.D)。根据8个区试组别的具体分 

布情况将主坐标分析图划分成4个区域I、II、III、 

杂交种各区试组的PCoA分析:对8个区试组进 

行主坐标分析,直观反映它们之间的关系(图2)。 

Ⅳ,西南、东北早熟组分布在I区,青贮玉米分布 

在I和II区,但主要集中在I区,鲜食和极早熟组 

鲜食与普通玉米能明显区分开,虽然在分布上有一定 

的重叠区域,但基本上各自占据相应的位置。青贮 

主要分布在II区,京津唐组分布在Ⅳ组,东华北和 

黄淮海组在I和Ⅳ区都有分布但东华北组分布主要 

集中在I区。根据8个区组分析结果显示,西南和 

绝大部分品种与其他普通玉米分布重叠没有区分 

开,少数品种与普通玉米能区分开,但青贮玉米的 

区试对照品种(雅玉青贮26和雅玉青贮8号)分布 

偏离普通玉米区域。除了鲜食玉米之外,极早熟玉 

米与其他普通玉米在分布上也有一定的隔离(图 

2-A)。极早熟、京津唐、西南、东北早熟这四个组 

东北早两组样品遗传分布几乎完全重叠,东华北和 

黄淮海两组样品遗传分布有重叠,但是两组具有一 

定的分化。将东华北与黄淮海两组、西南与东北早 

两组之间参试样品独立进行主坐标分析显示,东华 

北和黄淮海两组样品遗传分布有部分重叠但明显有 

分化,西南与东北早两组样品遗传分布几乎无重叠, 

并且对照品种分布于各白区域内(图3)。 

的品种遗传变异相对集中,极早熟、京津唐、西南 

三组之间样品遗传分布几乎无重叠区域;西南与东 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 861 

A:鲜食、极早熟、青贮、其他普通品种之间的相互关系;B:极早熟、京津唐、西南各组品种之间的相互关系;C:极早熟、京津唐、西南、东北 

早各组品种之间的相互关系;D:东华北、黄淮海组品种之间的相互关系。被黑色空心圆圈标示的为各区对照样品 

A:This ifgure reflected the relationship among varieties Xian—Shi,Ji-Zao—Shu,Qing—Chu and other coulmon maize varieties,B:This ifgure reflected he trelationship 

among Ji-Zao・Shu,Jing—Jin—Tang,Xi—Nan groups,C:This figure reflected the relationship among Ji—Zao-Shu,Jing-Jin-Tang,Xi-Nan and Dong・Bei—Zao groups, 

D:This igure freflected the relationship between Dong-Hua—Bei and Huang-Huai—Hai groups.Control varieties ofeach groups marked by a black circle 

图2基于40对SSR引物数据8个区试组别玉米品种的主坐标分析 

Fig.2 Principal coordinate analysis(PCoA)of vaireties from eight regional tiral groups based on 40 SSR primers data 

0.21.0.17 0.13-0.09.0 040.00 0 04 0.09 0.13 0.17 0.21 

A:基于4O对SSR引物数据,黄淮海与东华北2组主坐标分析;B:基于4O对SSR引物数据,西南与东北早2组主坐标分析 

A:PCoA analysis ofHHH nd aDHB groups based on 40 SSR primers data;B:PCoA analysis ofXN nd aDB groups based on 40 SSR primers data 

图3基于4O对SSR引物数据黄淮海与东华北、西南与东北早区试组之间玉米品种的主坐标分析 

Fig.3 Principal coordinate analysis(PCoA)of varieties from Huang—Huai—Hai(HHH),Dong・Hua-Bei(CHB),Xi-Nan(xN),and 

Dong-Bei—Zao(DB)groups based on 40 SSR primers data 

862 中国农业科学 47卷 

3 讨论 

3.1 玉米品种遗传多样-I生分析 

评价玉米品种遗传多样性可以从2个方面着手, 

是参加区域试验样品的遗传多样性,二是生产上已 

经大面积推广应用的品种。本研究利用40对核心SSR 

引物系统分析2004--2009年参加生产试验和大面积 

推广玉米品种的遗传多样性状况。328份样品在某些 

引物中等位基因的分布规律表现出了一定的种质利用 

趋同趋势,即在部分引物(如N02、N19)表现出在 

个或两个等位基因的分布频率非常高,而在其它的 

等位基因频率非常低的特点,这可能是由于农艺性状 

的选择导致了等位基因分布不平衡,也可能与某些资 

源尤其是优良骨干自交系的集中利用有关。近年来育 

成品种遗传多样性在不同年份问,不同区试组之间波 

动都不大。8个区试组比较显示京津唐、极早熟组等 

位基因、基因型数目上相对较低,西南组显示出了最 

高值,就PIC值而言除京津唐之外其余组差别不大。 

这可能与京津唐区域地理跨度最小,气候、土壤、耕 

作栽培特点等差异小有关,相反西南区域地理跨度较 

大,并且气候复杂,耕作栽培特点多样化,故品种多 

样化程度较高¨ 。 

小麦、水稻育成品种的遗传多样性均有揭示品种 

遗传基础狭窄化的状况[ 名]。本研究结果显示玉米育成 

品种遗传基础狭窄问题不明显,这应该与所研究材料 

有一定的关系,因小麦、水稻分析比较的材料时间跨 

度比较大,早期推广应用的地方原始品种比较多一些, 

从纵向上来比较遗传多样性可能在下降。另一方面也 

与作物本身的特征有一定的关系,小麦、水稻属于自 

交授粉并且大部分品种属于常规育种,而玉米属于杂 

交授粉而且目前全部是单交种,因此玉米类群本身遗 

传变异相对大,根据Buckler等[凹】的报道玉米种内的 

遗传变异非常高以至于2份玉米品种之间的平均差异 

度比人类和灵长类之间差异还大。 

3.2国家玉米品种区域试验、审定制度与现代育种 

国家玉米品种区域试验于2002年启动参试样品 

的DNA指纹检测,2004年普通玉米品种DNA指纹 

检测范围由5个区试组扩大到8个区试组,2006年将 

检测范围扩大到鲜食和青贮,并且在2005年要求所有 

参试样品均入长期库保存。本文选取了参加2004— 

2009年生产试验玉米样品,基本上代表了最新育成的 

品种情况,在一定程度上反映了中国当前一个时期玉 

米育种的水平和特点。对这些品种的遗传多样性和种 

植区域遗传分化进行分析评估,一是服务于中国玉米 

品种区试、审定管理工作,二是服务于品种选育工作, 

为两者提供数据支持。 

国家玉米品种区域试验各区组育成品种与区组划 

分情况:玉米品种按用途分为普通玉米、鲜食、青贮 

和爆裂(2013年新增加爆裂玉米)四大类,普通玉米 

适宜种植区域划分在2009年稳定为京津唐、东北早 

熟、东华北、黄淮海、西南、西北、东南、极早熟8 

个区域。划分玉米各区组是为了针对不同品种类型和 

生态特点筛选区域适应性的品种,从而使玉米品种的 

选育推广具有针对性。本研究结果显示育成的鲜食玉 

米具有类型特异性,可与普通玉米明显区分开。青贮 

玉米育种的遗传基础较宽泛,与普通玉米重叠分布, 

原因可能是与早期对照样品为粮饲兼用型玉米农大 

108有关,2007年之后对照样品修改为青贮专用型玉 

米,因此,预期2009年之后的选育的品种会向青贮专 

用资源转变。极早熟样品具有区域特殊性,遗传分布 

相对集中且与其它普通玉米之间的遗传差异较大。东 

华北和黄淮海两个组不仅在地理分布上有重叠,主坐 

标分析结果显示其育成品种遗传分布也有部分重叠, 

但两区的参试样品具有的遗传分化。表明两组的育种 

资源具有部分相似性,如两组中黄改系的应用【1 9];除 

此之外同一品种同时参加两组审定相对较多,如富友 

9号、安玉13、农华101等,造成东华北和黄淮海两 

组品种存在种质利用趋同情况;但是根据2个组样品 

主坐标分析结果显示两区遗传分化是比较明显的,(图 

3-A),这应该与2大主产区所涉及地理区域和生态 

区域差异性、适宜品种类型差异性、主要育种资源、 

育种模式差异性相关。 

国家玉米品种区域试验各区组育成品种与对照品 

种关系:对照品种代表了各区最适宜推广种植的品种 

类型,对各区玉米品种选育发挥导向作用。本研究显 

示鲜食、京津唐、极早熟、东北早、西南区组的对照 

品种基本上能代表各自区域特异性。青贮区组对照品 

种2007年以来改为青贮专用型品种雅玉青贮8号和雅 

玉青贮26,以引导青贮专用玉米选育,主坐标分析结 

果显示雅玉青贮8号和雅玉青贮26的分布偏离普通玉 

米的整体分布,用它们作为青贮对照能够起到育种导 

向从粮饲兼用型向青贮专用型转变的作用。根据主坐 

标分析显示,东华北和黄淮海两组具有比较明显的分 

化,也有部分重叠。这与两组对照品种设置历史是相 

符的,对照品种早期(2004年以前)均为农大108, 

之后黄淮海区修改为郑单958,东华北除郑单958之 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 863 

外还设置其他对照品种。同时也说明2个区虽然有一 

定的重叠,但所涉及地理区域和生态区域差异比较大, 

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育种资源、育种模式具有一定差异性,导致参试品种 

呈现一定的分化、倾向性。因此应该选择各自分化区 

681-688(in Chinese) 

[8J郝晨阳,王兰芬,张学勇,游光霞,董玉琛,贾继增,刘旭,尚勋武, 

域的代表类型作为其对照品种,从而在育种导向上明 

确这两个区的区域特殊性。 

4结论 

通过利用SSR标记分析328份玉米品种的遗传多 

样性及遗传分化特点,发现近年来育成品种遗传多样 

性指数在不同年份间变化不大,除京津唐区之外在其 

它区试组间差异性也不大。参试品种主坐标分析显示 

各区试组划分、对照品种设置起到了育种导向的作用。 

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(责任编辑李莉) 

2024年4月21日发(作者:东方以)

中国农业科学2014,47(5):856・864 

Scientia Agficulurta Sinica doi:10.3864 ̄.issn.0578—1752.2014.05.003 

中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 

王凤格,田红丽,赵久然,王璐,易红梅,宋伟,高玉倩,杨国航 

(北京市农林科学院玉米研究中心,北京100097) 

摘要:【目的】从育成年份、种植区域角度分析中国328个玉米品种的遗传多样性,在分子水平上分析各适 

宜种植区域品种的遗传分化特点,为玉米品种区域试验、审定管理以及育种策略提供一定的理论依据。【方法】利 

用均匀分布于玉米基因组的40对核心SSR弓I物,采用1 0重荧光毛细管电泳检测技术对328个代表性育成品种进 

行基因分型;通过Power-/darker vet.3.25软件评估4O对SSR§J物多态性,对参试品种按年份、区试组分析遗传 

多样性情况;利用多变量统计分析软件MVSP ver.3.1 3对328个品种按区试组进行主坐标分析。【结果】基于328 

个玉米品种数据,检测到40对SSR引物等位基因变异范围为3—16个,平均8.1 0个,多态信息指数(PIC)值变 

化范围为0.18一O.85,平均为0.63。参试品种不同年份间遗传多样性变化不大,PIC值在0.60左右摆动;8个区 

试组品种的总等位基因和总基因型变异范围为170—262和2OO一511,京津唐和西南组分别表现出了最低值和最 

高值,京津唐组PIC值最低为0.51,其余组均接近于0.60,平均杂合度均在0.60左右。8个区试组主坐标分析 

显示鲜食、极早熟品种遗传分布偏离普通玉米区域,具有明显的种质特异性;青贮玉米由于早期对照品种为普通 

玉米导致遗传分布向普通玉米延伸,仅有少数品种分布偏离普通玉米;京津唐、西南、东北早熟三组品种遗传分 

布相对集中;极早熟、京津唐、西南三组之间品种遗传分布几乎无重叠区域;东华北和黄淮海两组参试品种遗传分 

布具有明显的分化但也有部分重叠,原因与对照品种曾经相同、育种同质化有关。【结论】利用SSR标记分析328份 

玉米品种的遗传多样性及遗传分化特点,表明近年来育成品种遗传多样性指数在不同年份间变化不大,除京津唐组 

之外在其它区试组间差异性也不大。参试品种主坐标分析显示各区试组划分、对照品种设置起到了育种导向的作用。 

关键词:玉米;SSR标记;区域试验;遗传多样性 

Genetic Diversity Analysis of 328 Maize Varieties 

(Hybridized Combinations)Using SSR Markers 

WANG Feng—ge,TIAN Hong—li,ZHAO Jiu—ran,WANG Lu,YI Hong—mei,SONG Wei, 

GAO Yu—qian,YANG Guo—hang 

(Maize Research Center,BeijingAcademy ofAgriculture&Forestry Sciences.Beijing 100097) 

Abstract:[Objective]The objective of this study is to analyze the genetic diversity of 328 maize varieties from breeding 

years,planting regions,and to research the genetic differentiation characteristics of all the varieties from every appropriate planting 

region,This study will provide a theoretical basis for het maize regional trial,validation management and breeding strategic adjustment. 

[Method]Forty core SSR primers covering the entire maize genome were used to SCan 328 samples by high--throughput 10-・plex 

capillary electrophoresis platform.The polymorphism of 40 SSR loci and genetic diversiy of t328 samples were evaluated via the 

software Power—Marker ver.3.25,and the Principal Coordinate Analysis(PCoA)of these samples from every regional trial groups 

was executed using statistica1 analysis software MVSP ver.3.13.【Result]The detected alleles of40 SSR primers ranged from 3 to 

16,with an average of 8.10,the polymorphism information index(PIC)ranged from 0.18 to 0.85,with an average of 0.63.There 

收稿日期:2013—09—04;接受日期:2013.12—02 

基金项目:国家国际科技合作项目(2010DFB33740)、国家“十二五”农村领域国家科技计划课题(2叭1BAD35B09) 

联系方式:王风格,E—mail:gege0106@163.tom;田红丽,E—mail:tianhongli9963@163.com;王风格和田红丽为同等贡献作者。通信作者赵久然 

E-mail:maizezhao@126.tom 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 857 

were no signiicant genetic difversity changes among varieties from diferent years.and all the PIC values were about 0.60.The total 

allele and gene—type number of 8 regional trial groups ranged rom 1f 70 to 262 and from 200 to 5 1 1.The varieties from Jing—Jin—Tang 

and Xi-Nan displayed the minimum and maximum values.The varieties from Jing-Jin-Tang roup displgayed the lowest PIC value of 

0.5 1,and the remaining groups were near 0.60,and the average heterozygosity was about 0.60.Principal coordinate nalaysis(PCoA) 

of varieties from eight regional trial roupsg showed that the genetic distirbution of varieties rfom Xian—Shi(maize for table use)and 

Ji-Zao-Shu(very early maturiy tmaize)groups deviated rfom the common maize region,displayed an obvious germplasm speciifcity. 

As the common maize varieties were used as control samples at early stage,the genetic distribution of Qing—Chu(silage corn) 

extended to common maize.The genetic distribution of varieties from Jing-Jin—Tang,Xi-Nan and Dong—Bei-Zao groups was relatively 

concentrated.The genetic distribution of varieties from Ji—Zao—Shu.Jing—Jin—Tang and Xi-Nan groups was almost no overlap.There 

is an obvious genetic variation of varieties from Dong—Hua-Bei and Huang—Huai—Hai groups,but also there are some overlaps,and the 

reasons might be he tsame control variety nd ahet same breeding resource.[Conclusion]Genetic diversiy tnd agenetic ifdferentiation 

of 328 maize varieties were analyzed using 40 SSR markers.The results showed that there were no significant genetic diversity 

changes amongvarietiesindiferentyears,andtherewere alsono significantchanges amongdiferentgroups exceptthatfrom Jing—Jin—Tang. 

Principal coordinate nalaysis showed that he tsettng iofregional trial groups and control varieties has played a guiding role n ibreeding. 

Key words:maize;SSR marker;regional trial;genetic diversiy t

0 引言 

【研究意义】玉米是具有粮、经、果、饲、能多 

元用途的中国重要农作物之一,就种植面积而言已经 

是第一大作物,其总产的增加对全国粮食增产贡献率 

位居各大粮食作物之首。除了面积、产量快速增加之 

位点可共享如maizeGDB和panzea网站公布大量SSR 

位点。这些研究为玉米品种DNA指纹数据库构建、 

遗传多样性分析等研究奠定了良好的基础。迄今,国 

内外关于玉米遗传多样性的报道,主要集中在自交系 

种质资源评估和杂种优势群划分[ ,¨ 或地方品种 

遗传多样性分析【 , 。 【本研究切入点】相对于玉 

外,随着育种进程的加快,玉米品种数量也急剧增加。 

统计1999—.201 1年数据,通过国家和各省市审定的玉 

米品种数目大约5 600个,其中,国家审定417个, 

而且近几年每年参加国家和各省市的区域试验样品数 

米自交系而言,育成杂交种的报道极少,在中国仅有 

早期基于形态或系谱对杂交种的分析[1 ,2005年国家 

预试品种分析[ 或省内推广品种的分析[20-21];国外玉 

米杂交种的研究主要是欧洲近50年来育成品种的遗 

千个。虽然玉米已经日益凸现出重要性,但是就杂交 

种而言其遗传多样性研究报道极少,玉米杂交种多样 

性研究主要体现在已经大面积推广应用的杂交种和参 

加区域试验的品种。玉米区域试验是玉米育种和新品 

种推广的重要环节,参试品种尤其是进入生产试验品 

种代表了当前玉米育种的动向和水平,因此,对参试 

品种的遗传多样性进行分析,可以客观、全面了解当 

传多样性分析[2 。育成玉米杂交种代表了当前育种水 

平和动态,品种管理者和育种家十分关注杂交种的具 

体情况,其审定品种的SSR标准指纹均已经构建,但 

是玉米杂交种的遗传多样性没有进行系统的分析。因 

此除应继续加强DNA标准指纹数据库构建之外,可 

按国家、各省逐步开展玉米杂交种的遗传多样研究, 

以便及时对中国玉米杂交种的遗传多样性进行动态监 

前玉米品种现状,对于品种管理、品种选育以及种质 测。【拟解决的关键问题】本研究利用40对SSR引 

物对2004--2009年来参加国家玉米区试生产试验品 

种及大面积推广品种共计328个品种,从育成年份、 

适宜种植区域多个角度进行遗传多样性分析,试图在 

分子水平上摸清中国育成品种的遗传多样性情况,各 

种植区域品种的遗传分化特点,主要目的为玉米品种 

区域试验、审定管理提供理论依据,同时对育种策略 

资源收集和保护具有重要意义。 【前人研究进展】随 

着分子生物技术的发展,分子标记种类和检测手段日 

趋完善,各种分子标记已经广泛应用玉米遗传多样性 

研究中【】。6】。众多分子标记中,简单重复序列(simple 

sequence repeats,SSR)标记因具有简便、快捷、重复 

性高、多态性高、共显性标记等优点而被广泛应用。 

中国水稻[7】、小麦[ 】、大豆[ 等重要农作物均已利用 

SSR标记对核心种质或育成品种进行了分析评估,为 

的调整具有一定的参考价值。 

遗传研究和育种工作提供重要的依据和参考。对玉米 

而言,全基因组测序研究基础较好,开发的大量标记 

1材料与方法 

1.1 试验材料 

858 中国农业科学 47卷 

供试材料包括2004--2009年参加国家玉米区试 

生产试验的品种289份(表1);各区组对照品种l9 

份;为了全面反映育成品种现状,并且数据分析时具 

有参照样品,同时补充了在全国推广面积前20位的品 

种(按2000---2009年累计推广面积统计),共计328 

份品种。 

1.2基因组DNA提取 

供试品种总DNA提取采取CTAB大量提取法, 

具体步骤按照CIMMYT(International Maize and 

Wheat Improvement Center)实验操作流程[23]。DNA 

质量和浓度用NanoDrop 2000(Thermo Scientiifc)紫 

外分光光度计进行测定,根据测量值调节工作液浓度。 

1.3 SSR标记分析 

选用的40对引物是由北京市农林科学院玉米研 

究中心报道的第1组的20对基本核心引物和第1I组 

的20对扩展核心引物,引物名称、序列等具体信息参 

考已发表的文献[241,这40对引物为国家玉米品种区 

域试验DNA指纹鉴定指定引物。每对引物其中一条 

的5 端用一种荧光染料标记,共选用了PET、NED、 

VIC、FAM四种荧光染料(Applied Biosystems,USA 

公司合成)。PCR反应体系为20此,包括4 gL DNA、 

0.25 ktmol・L 引物、0.15 gmol-L~dNTP、2.5 mmol・L 

MgC12、1单位Taq酶(Genacea,美国)、1×PCR Buffer。 

PCR反应在BIO.RAD公司的PTC.100型PCR仪器上 

进行,程序为94℃5 min;94℃40 S,60℃35 S,72℃ 

45 S,35个循环;72 oC 10 min,4℃保存待测。PCR 

产物在毛细管荧光电泳系统AB 3730XL DNA分析仪 

(Applied Biosystems,USA)上检测。采用l0重PCR 

产物电泳检测的方法,即按照扩增片段大小和荧光 

染料的种类可将l0对引物的扩增产物混合在一起 

电泳【 钔。在96孔电泳板的单个孔中分别加入1.5 10 

重PCR产物的混合物,8.5 甲酰胺,0.1 gL内标 

(GeneScanTM.500 LIZ,Applied Biosystems,USA)。 

上述混合样品在PCR仪上运行95℃变性5 rain,将变 

性后的电泳产物取出,1 000 r/min离心1 min后,于 

AB 373OXL DNA分析仪上进行电泳。预电泳时间为2 

min,15 KV,电泳时间为20 min,15 KV。Date 

Collection Ver.1.0软件收集原始数据。 

1.4数据统计分析 

用GeneMapper Ver.3.7(Applied Biosystems, 

USA)进行原始数据统计和校正,得到328样品×40 

对SSR引物的原始数据表。根据40对核心引物等位 

基因信息表对上述原始数据进行等位基因确定,并形 

成标准DNA指纹数据,该等位基因信息表由北京市 

农林科学院玉米研究中心通过在毛细管荧光电泳系统 

分析大量自交系和杂交种数据总结整理得Nt 。选用 

Power-Marker ver.3.25软件【2制,基于328份玉米品种 

数据分析每对引物的等位基因数目和PIC值 

(polymorphism information content)。同时对参试品 

种按年份、按区试组别分别对等位基因变异丰富度(即 

等位基因数目变化情况)、PIC值、杂合度 

(Heterozygosity)等情况进行分析。选用群体遗传分 

析软件Popgenever.1.31[ ]分析各区试组之间的Nei遗 

传距离【 刚。参考Reif等 针对于杂交种分析方法,在 

本研究中选用多变量统计分析软件MVSP ver.3.13 

(Kovach computing services),将8个区组分别作为 

独立群体进行主坐标分析(principal coordinate 

analysis,PCoA),直观反映8个区试组之间的关系, 

为了进一步确定东华北与黄淮海两区,西南与东北早 

两区之间参试样品关系,将其独立进行主坐标分析。 

2 结果 

2.1 40对SSR引物多态性分析 

基于328份品种数据分析40对SSR引物的等位 

基因和PIC指数变化(图l-A),4O对引物检测到的 

等位基因变异范围为3—16个,平均8.10个,多态信 

息指数PIC值变化范围为0.18—0.85,平均0.63,反 

映PIC指数变化与等位基因变异丰富度密切相关,随 

着等位基因数目的增加PIC值也在增加,但并非线性 

关系,有的位点(如N19)等位基因数目较多,但PIC 

值却较低。对N19(等位基因数=6,PIC=O.36)和 

N22(等位基因=16,PIC=0.85)2个位点的所有等位 

基因在所有品种中的分布频率进行统计分析(图1-B 

和图1.C),位点N19的6个等位基因中,等位基因 

222分布频率非常高达78%,因此,6个等位基因在 

杂交种的分布不均匀。与N19的情况相反,位点N22 

的等位基因分布频率相对均匀,有多个高频率的等位 

基因。 

2.2 中国选育玉米品种的遗传多样性和遗传结构分 

析 

不同年份选育玉米品种的遗传多样性比较:289 

份区域试验品种依据年份划分为6组,进行遗传多样 

性分析评价(表1)。2005--2007、2009年品种的总 

等位基因数、总基因型数、平均等位基因数、平均基 

因型数均高于2004和2008年相应的值,但可能受参 

试品种数目变化影响;各年度间PIC值以及平均杂合 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 859 

竺篇g吕 Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z 暑 =2罱 昌 答!S 高 导Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z Z 譬 :。g 2 8 苫=罱 

t.0 

25 

8 

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鲁 

15 

10 

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岂 

料 

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O.O 

骚 

00 

A:基于328份玉米品种数据,4O对SSR引物等位基因和PIC指数变化情况,横坐标引物位置按照等位基因数目从小到大顺序排列;B:引物tune1432y6 

(N19)检测到的等位基因变异及其频率;c:引物bnlg1671y17(N22)检测到的等位基因及其频率 

A:Change of alleles and PIC index of the 40 SSR primers based on 328 samples data,the order ofprimers displayed on the abscissa is according to the allele 

number;B:Alleles variation and frequencies detected in primers umc1432y6(N19);C:Alleles variation and frequencies detected in primers bnlg1671yl7 

(N22) 

图1 4O对核心SSR引物多态性分析 

Fig.1 Polymorphism of the 40 core SSR primers used in this study 

表1 参加生产试验玉米品种不同年份之间的遗传多样性 

Table 1 Genetic diversity comparison of maize varieties tested in national production trial in diferent years 

O O O 0 0 O O O 0 0 

9 8 7 6 5 4 3 2 l O 

度变化不大,PIC值和杂合度均在0.60左右摆动,说 

明近些年来参加国家玉米品种生产试验样品的遗传多 

样性没有较大变化。 

不同区试组别玉米品种的遗传多样性比较:国家 

参与比较分析的8个区试组品种的总等位基因和总基 

因型变异范围为l7O一262和20O一51 1,京津唐和西 

南组分别表现出了最低值和最高值,就平均等位基因 

和平均基因型数而言,京津唐和极早熟组相对较低, 

PIC值京津唐组最低为0.5 1,其余均接近于0.60,平 

均杂合度均在0.60左右。说明除京津唐组之外,各区 

组之间遗传多样性差异不大。 

玉米品种区域试验主管部门依据生态区划、农业区划、 

品种类型、结合生产实际、播期类型等划分各个试验 

区组。328份杂交种按照用途和区域试验组别划分为 

10组(根据2009年国家玉米品种区域试验方案划分), 

其中,西北春玉米组由于每年进入生产试验的样品量 

较少,东南玉米组是2007年才增加的一个区试组别, 

所以这两个组中样品量较少没有列入分析(表2)。 

杂交种各区试组之间的遗传距离:以8个区试组 

别为单位分析各组别之间的Nei[28】遗传距离(表3)。 

就各组之间的遗传距离而言,京津唐与其他组之间遗 

传距离最远,如京津唐与极早熟、鲜食、东华北、西 

860 中国农业科学 47卷 

南之间的遗传距离相对于其他组别之间最远,西南组 

与东华北组之间遗传距离最近,各组之间遗传距离相 

对较近的均集中在西南、东北华与青贮、黄淮海、东 

北早熟之间。 

北早两组在地理分布上无任何交叉但遗传分布重叠 

(图2一B和图2-C)。东华北、黄淮海两组品种的遗 

传变异较大(图2.D)。根据8个区试组别的具体分 

布情况将主坐标分析图划分成4个区域I、II、III、 

杂交种各区试组的PCoA分析:对8个区试组进 

行主坐标分析,直观反映它们之间的关系(图2)。 

Ⅳ,西南、东北早熟组分布在I区,青贮玉米分布 

在I和II区,但主要集中在I区,鲜食和极早熟组 

鲜食与普通玉米能明显区分开,虽然在分布上有一定 

的重叠区域,但基本上各自占据相应的位置。青贮 

主要分布在II区,京津唐组分布在Ⅳ组,东华北和 

黄淮海组在I和Ⅳ区都有分布但东华北组分布主要 

集中在I区。根据8个区组分析结果显示,西南和 

绝大部分品种与其他普通玉米分布重叠没有区分 

开,少数品种与普通玉米能区分开,但青贮玉米的 

区试对照品种(雅玉青贮26和雅玉青贮8号)分布 

偏离普通玉米区域。除了鲜食玉米之外,极早熟玉 

米与其他普通玉米在分布上也有一定的隔离(图 

2-A)。极早熟、京津唐、西南、东北早熟这四个组 

东北早两组样品遗传分布几乎完全重叠,东华北和 

黄淮海两组样品遗传分布有重叠,但是两组具有一 

定的分化。将东华北与黄淮海两组、西南与东北早 

两组之间参试样品独立进行主坐标分析显示,东华 

北和黄淮海两组样品遗传分布有部分重叠但明显有 

分化,西南与东北早两组样品遗传分布几乎无重叠, 

并且对照品种分布于各白区域内(图3)。 

的品种遗传变异相对集中,极早熟、京津唐、西南 

三组之间样品遗传分布几乎无重叠区域;西南与东 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 861 

A:鲜食、极早熟、青贮、其他普通品种之间的相互关系;B:极早熟、京津唐、西南各组品种之间的相互关系;C:极早熟、京津唐、西南、东北 

早各组品种之间的相互关系;D:东华北、黄淮海组品种之间的相互关系。被黑色空心圆圈标示的为各区对照样品 

A:This ifgure reflected the relationship among varieties Xian—Shi,Ji-Zao—Shu,Qing—Chu and other coulmon maize varieties,B:This ifgure reflected he trelationship 

among Ji-Zao・Shu,Jing—Jin—Tang,Xi—Nan groups,C:This figure reflected the relationship among Ji—Zao-Shu,Jing-Jin-Tang,Xi-Nan and Dong・Bei—Zao groups, 

D:This igure freflected the relationship between Dong-Hua—Bei and Huang-Huai—Hai groups.Control varieties ofeach groups marked by a black circle 

图2基于40对SSR引物数据8个区试组别玉米品种的主坐标分析 

Fig.2 Principal coordinate analysis(PCoA)of vaireties from eight regional tiral groups based on 40 SSR primers data 

0.21.0.17 0.13-0.09.0 040.00 0 04 0.09 0.13 0.17 0.21 

A:基于4O对SSR引物数据,黄淮海与东华北2组主坐标分析;B:基于4O对SSR引物数据,西南与东北早2组主坐标分析 

A:PCoA analysis ofHHH nd aDHB groups based on 40 SSR primers data;B:PCoA analysis ofXN nd aDB groups based on 40 SSR primers data 

图3基于4O对SSR引物数据黄淮海与东华北、西南与东北早区试组之间玉米品种的主坐标分析 

Fig.3 Principal coordinate analysis(PCoA)of varieties from Huang—Huai—Hai(HHH),Dong・Hua-Bei(CHB),Xi-Nan(xN),and 

Dong-Bei—Zao(DB)groups based on 40 SSR primers data 

862 中国农业科学 47卷 

3 讨论 

3.1 玉米品种遗传多样-I生分析 

评价玉米品种遗传多样性可以从2个方面着手, 

是参加区域试验样品的遗传多样性,二是生产上已 

经大面积推广应用的品种。本研究利用40对核心SSR 

引物系统分析2004--2009年参加生产试验和大面积 

推广玉米品种的遗传多样性状况。328份样品在某些 

引物中等位基因的分布规律表现出了一定的种质利用 

趋同趋势,即在部分引物(如N02、N19)表现出在 

个或两个等位基因的分布频率非常高,而在其它的 

等位基因频率非常低的特点,这可能是由于农艺性状 

的选择导致了等位基因分布不平衡,也可能与某些资 

源尤其是优良骨干自交系的集中利用有关。近年来育 

成品种遗传多样性在不同年份问,不同区试组之间波 

动都不大。8个区试组比较显示京津唐、极早熟组等 

位基因、基因型数目上相对较低,西南组显示出了最 

高值,就PIC值而言除京津唐之外其余组差别不大。 

这可能与京津唐区域地理跨度最小,气候、土壤、耕 

作栽培特点等差异小有关,相反西南区域地理跨度较 

大,并且气候复杂,耕作栽培特点多样化,故品种多 

样化程度较高¨ 。 

小麦、水稻育成品种的遗传多样性均有揭示品种 

遗传基础狭窄化的状况[ 名]。本研究结果显示玉米育成 

品种遗传基础狭窄问题不明显,这应该与所研究材料 

有一定的关系,因小麦、水稻分析比较的材料时间跨 

度比较大,早期推广应用的地方原始品种比较多一些, 

从纵向上来比较遗传多样性可能在下降。另一方面也 

与作物本身的特征有一定的关系,小麦、水稻属于自 

交授粉并且大部分品种属于常规育种,而玉米属于杂 

交授粉而且目前全部是单交种,因此玉米类群本身遗 

传变异相对大,根据Buckler等[凹】的报道玉米种内的 

遗传变异非常高以至于2份玉米品种之间的平均差异 

度比人类和灵长类之间差异还大。 

3.2国家玉米品种区域试验、审定制度与现代育种 

国家玉米品种区域试验于2002年启动参试样品 

的DNA指纹检测,2004年普通玉米品种DNA指纹 

检测范围由5个区试组扩大到8个区试组,2006年将 

检测范围扩大到鲜食和青贮,并且在2005年要求所有 

参试样品均入长期库保存。本文选取了参加2004— 

2009年生产试验玉米样品,基本上代表了最新育成的 

品种情况,在一定程度上反映了中国当前一个时期玉 

米育种的水平和特点。对这些品种的遗传多样性和种 

植区域遗传分化进行分析评估,一是服务于中国玉米 

品种区试、审定管理工作,二是服务于品种选育工作, 

为两者提供数据支持。 

国家玉米品种区域试验各区组育成品种与区组划 

分情况:玉米品种按用途分为普通玉米、鲜食、青贮 

和爆裂(2013年新增加爆裂玉米)四大类,普通玉米 

适宜种植区域划分在2009年稳定为京津唐、东北早 

熟、东华北、黄淮海、西南、西北、东南、极早熟8 

个区域。划分玉米各区组是为了针对不同品种类型和 

生态特点筛选区域适应性的品种,从而使玉米品种的 

选育推广具有针对性。本研究结果显示育成的鲜食玉 

米具有类型特异性,可与普通玉米明显区分开。青贮 

玉米育种的遗传基础较宽泛,与普通玉米重叠分布, 

原因可能是与早期对照样品为粮饲兼用型玉米农大 

108有关,2007年之后对照样品修改为青贮专用型玉 

米,因此,预期2009年之后的选育的品种会向青贮专 

用资源转变。极早熟样品具有区域特殊性,遗传分布 

相对集中且与其它普通玉米之间的遗传差异较大。东 

华北和黄淮海两个组不仅在地理分布上有重叠,主坐 

标分析结果显示其育成品种遗传分布也有部分重叠, 

但两区的参试样品具有的遗传分化。表明两组的育种 

资源具有部分相似性,如两组中黄改系的应用【1 9];除 

此之外同一品种同时参加两组审定相对较多,如富友 

9号、安玉13、农华101等,造成东华北和黄淮海两 

组品种存在种质利用趋同情况;但是根据2个组样品 

主坐标分析结果显示两区遗传分化是比较明显的,(图 

3-A),这应该与2大主产区所涉及地理区域和生态 

区域差异性、适宜品种类型差异性、主要育种资源、 

育种模式差异性相关。 

国家玉米品种区域试验各区组育成品种与对照品 

种关系:对照品种代表了各区最适宜推广种植的品种 

类型,对各区玉米品种选育发挥导向作用。本研究显 

示鲜食、京津唐、极早熟、东北早、西南区组的对照 

品种基本上能代表各自区域特异性。青贮区组对照品 

种2007年以来改为青贮专用型品种雅玉青贮8号和雅 

玉青贮26,以引导青贮专用玉米选育,主坐标分析结 

果显示雅玉青贮8号和雅玉青贮26的分布偏离普通玉 

米的整体分布,用它们作为青贮对照能够起到育种导 

向从粮饲兼用型向青贮专用型转变的作用。根据主坐 

标分析显示,东华北和黄淮海两组具有比较明显的分 

化,也有部分重叠。这与两组对照品种设置历史是相 

符的,对照品种早期(2004年以前)均为农大108, 

之后黄淮海区修改为郑单958,东华北除郑单958之 

5期 王风格等:中国328个玉米品种(组合)SSR标记遗传多样性分析 863 

外还设置其他对照品种。同时也说明2个区虽然有一 

定的重叠,但所涉及地理区域和生态区域差异比较大, 

diversity of ifce eultivars(Oryza Sativa L.)in China and he ttemporal 

rendst in recent fifty years.Chinese Science Bulletin

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育种资源、育种模式具有一定差异性,导致参试品种 

呈现一定的分化、倾向性。因此应该选择各自分化区 

681-688(in Chinese) 

[8J郝晨阳,王兰芬,张学勇,游光霞,董玉琛,贾继增,刘旭,尚勋武, 

域的代表类型作为其对照品种,从而在育种导向上明 

确这两个区的区域特殊性。 

4结论 

通过利用SSR标记分析328份玉米品种的遗传多 

样性及遗传分化特点,发现近年来育成品种遗传多样 

性指数在不同年份间变化不大,除京津唐区之外在其 

它区试组间差异性也不大。参试品种主坐标分析显示 

各区试组划分、对照品种设置起到了育种导向的作用。 

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(责任编辑李莉) 

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