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尿素循环障碍患者家系的基因突变分析及产前诊断

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2024年4月21日发(作者:不烨华)

国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3

F

V

N

DOI:10.12280/gjszjk.20200537

··

185

·论著·

张庆华,郝胜菊,王兴,陈雪,周秉博,刘芙蓉,郑雷,冯暄,张钏

【摘要】目的:分析7例尿素循环障碍UCD)(ureacycledisorder,患者家系的基因突变情况,并对2例再

生育家庭进行产前诊断。方法:联合应用高通量测序(panel)结合Sanger测序、长距离-聚合酶链反应(LD-

PCR)MLPA)以及多重连接探针扩增(multiplexligation-dependentprobeamplification,等基因检测技术,对7例

疑似UCD患者家系进行相关致病基因突变分析,并对其中2例高风险家系的胎儿羊水标本进行产前基因诊

断。结果:7例疑似UCD患者均得到明确基因诊断:4例患儿为SLC25A13基因突变引起的新生儿肝内胆汁淤积

NICCD)症(neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency,,且1例同时患脊髓性肌萎缩症(spinal

muscularatrophy,SMA)1例患儿为ASS1基因突变引起的瓜氨酸血症Ⅰ型(citrullinaemiatypeⅠ,CTLN1)2例;;

OTCD)患儿为OTC基因突变引起的鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症(ornithinetranscarbamylasedeficiency,。2家系

1例胎儿为父源SLC25A13致病基因携带者;1例为OTC正常的UCD胎儿。结论:基因诊再生育时产前诊断结果:

断有助于可疑UCD患者的明确诊断以及分型,部分疑似UCD胎儿可能OTC正常。对于生育过UCD患儿的家系,

再生育时进行产前基因诊断可积极预防出生缺陷。

【关键词】尿素循环障碍,DNA突变分析;先天性;瓜氨酸血症;鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症;产前诊

断;新生儿肝内胆汁淤积症

GeneMutationAnalysisandPrenatalDiagnosisofFamilywithUreaCycleDisorderZHANGQing-hua,

HAOSheng-ju,WANGXing,CHENXue,ZHOUBing-bo,LIUFu-rong,ZHENGLei,FENGXuan,ZHANG

rovinceMedicalGeneticsCenter,GansuProvinceMaternalandChildHealthCareHospital,

Lanzhou730050,China

Correspondingauthor:ZHANGChuan,E-mail:**********************

Abstract

Objective:Toinvestigatethegenemutationsofsevenfamiliessuspectedwithureacycle

disorders(UCD),s:Targetsequencecapture

combinedwithhigh-throughputnext-generationsequencing,andSangersequencing/LD-PCR/MLPA(multiplex

ligation-dependentprobeamplification)technologieswereusedtoinvestigatethegenemutationsforsevenfamilies

hegenotypesofthepedigreeswereidentified,twoamnioticfluidsamplesfromhigh-

s:ThediagnosisofUCDwasconfirmedin

fthem,fourpatientswerediagnosedastheneonatalintrahepaticcholestasis

causedbycitrindeficiency(NICCD)andoneofthemwascoexistwithspinalmuscularatrophy(SMA).Onepatient

wasdiagnosedwithcitrullinaemiatypeⅠ(CTLN1).Andtwopatientswerediagnosedwithornithinetranscarbamylase

deficiency(OTCD).Prenatalgeneticdiagnosisoftwofamiliesshowthatonefetushadamutationataheterozygous

mutationofSLC25A13withpaternal;sions:

r,somefamilieswithsuspectedUCD

natalgeneticdiagnosiscombinedwithOTCgenetestingcanpreventthe

rebirthdefectsinhigh-riskfamilies.

Keywords

Ureacycledisorders

inborn

Citrullinemia

Ornithinecarbamoyltransferasedeficiencydisease

DNAmutationalanalysis

Prenataldiagnosis

Neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency

JIntReprodHealth蛐FamPlan

2021

,40:185-188)

UC)尿素循环(ureacycle,是人体内清除氨的主

要途径,有6种关键酶:鸟氨酸氨基甲酰转移酶

OTC)N-乙酰谷氨(ornithinecarbamoyltransferase,、

基金项目:兰州市人才创新创业项目(2018-RC-95);国家人口与生

殖健康科学数据中心项目(2005DKA32408);甘肃省卫生

行业科研计划项目(GSWSKY-2015-22)

730050兰州,作者单位:甘肃省妇幼保健院医学遗传中心

NAGS)酸合成酶(N-acetylglutamatesynthase,、氨甲

酰磷酸合成酶Ⅰ(carbamylphosphatesynthaseⅠ,

CPSⅠ)、精氨酸琥珀酸合成酶(argininosuccinate

synthetase,ASS)、精氨酸代琥珀酸裂解酶(arginine

和精氨酸酶(arginase,,两succinatelyase,ASL)ARG)

种转运体(线粒体内膜鸟氨酸转运体和柠檬酸转运

体)的参与,其中任何一个酶或转运体的缺陷都会导

[1]

致尿素循环障碍(ureacycledisorder,UCD)UCD总。

通信作者:张钏,E-mail:**********************

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国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3

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进行检测;按照试剂盒说明书操作完成MLPA反应。Holland)

体发病率在活产婴中约为1∶69000~1∶35000,其中

约50%的UCD伴有新生儿高氨血症,死亡率高达

存活者会遗留不可逆性神经系统后遗25%~50%,

[2]

。本研究对7例疑似UCD患儿等进行基因检测,以

明确其致病基因及基因分型,对这些患者家系提供

遗传咨询及再生育时的产前诊断。

MLPA反应产物在ABI3500DX测序仪上进行毛细管电泳。电

泳结果采样MLPA数据分析专用软件Coffalyser进行分析。

患儿母亲再孕时,孕18~21周经腹行羊膜

腔穿刺,抽取羊水15mL行先证者突变位点检测。

1对象与方法

1.1研究对象选取2017年9月—2019年9月在甘肃省妇幼

保健院(我院)收治的患儿,根据临床表现与遗传代谢病串联

质谱检测及尿气相分析检测等生化代谢改变高度疑似UCD

患者7例,男4例、女3例,年龄4d~3个月;经患者监护人签署

知情同意书及经医院学术伦理委员会批准后,采集患儿及父

(乙二胺四乙酸抗凝)进行基因突变分析。母静脉血2~3mL

2结果

2.1患者基因测序分析结果

例1检测到

SLC25A13基因自发杂合突变c.1737G>A;例2检测

检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1364G>T,

到母源杂合突变c.1660_1661ins16bp;例3检测到

1.2方法

应用北京天根公司(中国)的基

SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;例4

检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;

例5检测到ASS1基因父源杂合突变c.1088G>A,检测

到母源杂合突变c.787G>A;例6检测到OTC基因自

发半合子突变c.958C>T。见表1。

例1及其母亲、例3及其

母亲、例4及其母亲均检测到SLC25A13基因杂合突

变IVS16ins3kb。见表1。

因组DNA提取试剂盒,按照试剂盒说明书进行。

利用遗传代谢病基因检测panel(北京

迈基诺公司)进行高通量测序以明确致病突变,测序平均深

度为200×。对检测到的变异进行过滤筛选,应用PolyPhen2和

MutationTaster软件对新变异进行蛋白功能预测,新变异致病

性判读根据美国医学遗传学与基因组学会2015指南进行。

①Sanger测序。应用Primer5软

件针对变异位点设计引物,引物由上海生工生物工程有限公

扩增产物用纯化试剂盒纯化司合成。对聚合酶链反应(PCR)

后,上机进行测序(ABI3500DX,美国),应用SeqMan软件对测

序结果与标准序列进行比对分析。②长距离-PCR(LD-

P060探针在例1上检测到

SMN1基因E7-8del纯合突变,其父母均为杂合突变

P079探针在例7上检测到OTC基因杂合突变携带者。

其母亲为7-9外显子的杂合性缺失突变Exon7-9Del,

携带者,例7和其母亲均检测到杂合突变,但母亲未

患病。见表1。

7例疑似UCD患儿得到了明确分通过分子检测,

PCR)。使用LongPCR试剂盒(北京普洛麦格生物技术有限公

司)进行PCR扩增,对扩增产物进行电泳来检测SLC25A13基因

IVS16ins3kb位点突变情况。③多重连接探针扩增(multiplex

技术分析。对MLPA)ligation-dependentprobeamplification,

(MRC-Holland)进行检1例OTC缺乏的患儿通过MLPAP079探针

4例为NICCD1例为瓜氨酸血症Ⅰ型型:(57%),

14.3%)2例为鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏,(CTLN1,

OTCD,症(ornithinecarbamoyltransferasedeficiency,

28.7%),见表1。

本研究共发现3个UCD相关致病基因:

SLC25A13、ASS1和OTC,发现相应的9个等位基因突

1例新生儿肝内胆汁淤积症测;(neonatalintrahepaticcholestasis

causedbycitrindeficiency,NICCD)疑似合并脊髓性肌萎缩症

SMA)先证者通过P060探针(MRC-(spinalmuscularatrophy,

表1

序号性别

1

2

3

4

5

6

7

7例UCD患者的临床表型及基因检测结果

基因

SLC25A13

SMN1

SLC25A13

临床表型

基因型(父/母)

父源性

-

E7-8del

c.1364G>T

母源性

IVS16ins3kb

E7-8del

c.1660_1661ins16bp

IVS16ins3kb

IVS16ins3kb

c.787G>A

-

Exon7-9Del

新发性

c.1737G>A

-

-

-

-

-

c.958C>T

-

疾病名称

NICCD合并SMA

NICCD

NICCD

NICCD

CTLN1

OTCD

OTCD

遗传模式

AR

AR

AR

AR

AR

AR

XL

XL

女颈部柔软,无抵抗,皮肤巩膜黄染,高胆红素血症

男胆汁淤积,黄疸,肉碱代谢异常,瓜氨酸代谢异常

女皮肤黄染,高胆红素血症,瓜氨酸指标异常

男胆汁淤积性肝病,血液蛋白不足,低纤维蛋白原血症

男高氨血症,新生儿惊厥,呼吸暂停

男新生儿惊厥,代谢性酸中毒,高氨酸血症

女高氨血症,尿素循环障碍,呼吸衰竭

SLC25A13c.1638_1660dup23

SLC25A13c.1638_1660dup23

ASS1

OTC

OTC

c.1088G>A

-

-

AR为常染色体隐性遗传,XL为X染色体连锁遗传。注:

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变,包括3种错义突变、2种移码突变、1种无义突变、1

种插入突变,1种缺失突变。其中突变频率最高的是

SLC25A13基因IVS16ins3kb等位基因突变,见表2。

表27例UCD患者家系主要基因突变类型及频率

基因名称碱基改变氨基酸改变突变类型频数

HGMDclinvar

(+/-)(+/-)

SLC25A13c.1737G>Ap.W579X无义突变1+-

IVS16ins3kb-插入突变3++

c.1638_1660dup23p.A554Gfs*17移码突变2++

c.1364G>Tp.R455L错义突变1+-

c.1660_1661ins16bpp.A554Gfs*17移码突变1-+

ASS1c.787G>Ap.V263M错义突变1++

c.1088G>Ap.R363Q错义突变1++

OTCc.958C>Tp.R320X无义突变1+-

Exon7-9Del-缺失突变1++

注:HGMD为人类基因突变数据库(),

clinvar网址/clinvar/。

2.2产前诊断结果分析例2和例6家系再次妊娠

时,在孕19周通过羊水穿刺进行了产前基因诊断:例

2家系胎儿检测到SLC25A13基因c.1364G>T父源致

病基因携带变异,见图1A和图1B(见后插一);例6家

系胎儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T

半合子突变,见图1C见后插一)。经遗传咨询后,告

知这两家系胎儿患病风险较低,这两家系均选择了

继续妊娠,胎儿随访至生后1个月,足跟血串联质谱

检查未见异常,发育良好。

3讨论

3.1基因检测可对UCD患儿进行精确分型UCD

是一组遗传代谢病,患儿的体征、临床表现未见特异

性,难以进行鉴别诊断。因此对相关致病基因进行

基因诊断尤为重要。本研究通过对7例疑似UCD患儿

进行基因诊断后,发现5例瓜氨酸血症(4例NICCD及

1例CTLN1)和2例OTCD。其中病例1较罕见,除

SLC25A13基因复合杂合突变外还伴有SMN1基因外

显子7和8纯合缺失,该患儿共患NICCD及SMA。

3.2UCD致病基因的异质性瓜氨酸血症是一组

通常表现为神经精神症状及血清中瓜氨酸和氨浓

度升高的UCD,通常分为Ⅱ型(NICCD)和Ⅰ型

CTLN1),分别为SLC25A13和ASS1双等位基因变异

导致的常染色体隐性遗传病

[3]

瓜氨酸血症Ⅱ型(NICCD)由SLC25A13基因突

变所致。其发病率具有地域性差异,在我国南方约

1/9200,北方约1/3500000,我国呈南高北低趋势。

同时,NICCD致病基因的携带率及突变类型亦有差

异:SLC25A13基因杂合子携带率在日本、韩国人群

中分别为1/69、1/50

[4]

,中国人群中为1/63;已报道的

SLC25A13基因致病突变类型超过90种,而中国人

群中c.851_854delGTAT、c.1638-1660dup23、c.615+

5G>A、IVS16ins3kb和c.1399C>T等5个突变约占

85.40%的突变等位基因,构成中国人普遍存在的

SLC25A13突变

[5]

。本研究共检测出4例NICCD患儿,

发现5种SLC25A13等位基因变异(IVS16ins3kb、

c.1638-1660dup23、c.1364G>T、c.1737G>A和c.1660_

1661ins23),其中IVS16ins3kb和c.1638-1660dup23

与研究报道其在中国人群高发

[4]

相符。此外,上述变

异存在地域差异,如:IVS16ins3kb作为一种转座后

插入突变,在日本较为常见

[6]

,在中国北方人群高于

南方;

c.1364G>T

在中国北方较为常见;而

c.1638-

1660dup23的相对频率在中国不同区域则相对一

[7]

。本研究4例NICCD患儿中,有3例均有SLC25A13

基因IVS16ins3kb杂合突变(3/4),与在中国北方较为

常见的趋势一致。

瓜氨酸血症Ⅰ型(CTLN1)是由于ASS基因突变

所致,是UCD中第三大类型,发病率约为1/200000~

1/44300

[3]

。其致病基因ASS1基因突变频率具有一

定的地域性分布差异,且不同基因与临床表型严

重程度有关。本研究共发现2个ASS1等位基因错义

突变,分别为c.787G>A(p.Val263Met)和c.1088G>A

(p.Arg363Trp)。有研究报道ASS1基因携带亦存在地

域性差异:363Trp在德国(包括德国人和居住

在德国的土耳其人)患者中的携带率为13.5%;而

263Met在土耳其患者中携带率为7.9%

[8]

。本研

究中因ASS1等位基因变异较少,突变频率是否存在

地区性差异有待后续进一步分析。同时,有研究报

道263Met等位基因复合杂合或纯合突变情况

下多表现为迟发和(或)轻度瓜氨酸血症

[9]

。本研究

中患者目前仅主要表现为血清瓜氨酸指标等异常增

高;未见其他显著临床表现,临床表型与这一等位基

因复合杂合变异表型相符,故而,对于这种轻型或迟

发型CTLN1,基因诊断显得更加重要,及时应用基因

诊断明确变异类型,高度重视予以积极治疗及预防,

可有效避免突发异常的出现。

OTCD由OTC基因突变引起,是UCD中最常见的

亚型,平均发病率为7.1/100000,属于X连锁不完全

显性或X连锁隐性遗传代谢病;OTCD的临床表现主

要与酶的残余活性相关。目前OTC基因已报道超过

400种基因突变类型

[10]

。本研究共发现2个OTC等位

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国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3

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基因分别为c.958C>T和外显子7-10缺失;其中无义

突变c.958C>T(p.R320X)为一男性半合子突变患儿,

该男性患者病情较重,主要是由于OTC基因携带在X

染色体上,这一酶的活性在男孩体内完全失活,导致

急性氨中毒,该临床表型与XL基因变异遗传模式相

符;而另一等位基因变异外显子7-10缺失,为一女

性杂合子突变患儿。通常女性杂合子突变,临床表

现高度多样,约15%患者发病;多数杂合子携带者

不出现高氨血症

[11]

。由于实验条件限制,本研究没有

做X染色体随机失活检测,但笔者推测例7正常的那

条X染色体发生了非随机失活,从而导致了疾病的

发生

[12-13]

3.3产前基因诊断可避免患儿出生本研究为2个

再生育家系提供产前基因诊断:例2家系胎儿检测到

SLC25A13

基因

c.1364G>T

父源携带突变;例

6

家系胎

儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T半合

子突变。2个家庭均选择了继续妊娠,出生后随访至

1个月,生化指标及发育状况均正常。

综上,笔者对7例疑似UCD患儿进行了基因分

析,明确了其治病原因,并对两患者家系再生育时进

行了产前诊断。通过高通量测序技术对患者进行基

因分型后可及早给予干预治疗,可为遗传咨询及产

前诊断提供可靠依据

[14-16]

;进而在致病基因明确的

前提下,通过产前诊断或胚胎植入前单基因病检测

PGT-M)有效预防出生缺陷。

参考文献

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doi:10.1186/s13023-018-0908-1.

(收稿日期:2020-09-16)

[本文编辑王琳]

·后插一·

石家庄地区新生儿Citrin蛋白缺乏症串联质谱筛查结果分析

(正文见第182页

AB

注:A为c.1021+1G>A;B为c.851_854delTATG。

图1例1患儿的SLC25A13基因突变检测结果

尿素循环障碍患者家系的基因突变分析及产前诊断

(正文见第185页

先证者

父亲

母亲

胎儿

A例2家系SLC25A13基因变异c.1364G>TB例2家系SLC25A13基因变异c.1660_1661ins

图1产前诊断测序图

C例6家系OTC基因变异c.958C>T

胎儿埃布斯坦畸形一例

(正文见第196页

图1三尖瓣发育畸形图2三尖瓣返流

2024年4月21日发(作者:不烨华)

国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3

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DOI:10.12280/gjszjk.20200537

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·论著·

张庆华,郝胜菊,王兴,陈雪,周秉博,刘芙蓉,郑雷,冯暄,张钏

【摘要】目的:分析7例尿素循环障碍UCD)(ureacycledisorder,患者家系的基因突变情况,并对2例再

生育家庭进行产前诊断。方法:联合应用高通量测序(panel)结合Sanger测序、长距离-聚合酶链反应(LD-

PCR)MLPA)以及多重连接探针扩增(multiplexligation-dependentprobeamplification,等基因检测技术,对7例

疑似UCD患者家系进行相关致病基因突变分析,并对其中2例高风险家系的胎儿羊水标本进行产前基因诊

断。结果:7例疑似UCD患者均得到明确基因诊断:4例患儿为SLC25A13基因突变引起的新生儿肝内胆汁淤积

NICCD)症(neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency,,且1例同时患脊髓性肌萎缩症(spinal

muscularatrophy,SMA)1例患儿为ASS1基因突变引起的瓜氨酸血症Ⅰ型(citrullinaemiatypeⅠ,CTLN1)2例;;

OTCD)患儿为OTC基因突变引起的鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症(ornithinetranscarbamylasedeficiency,。2家系

1例胎儿为父源SLC25A13致病基因携带者;1例为OTC正常的UCD胎儿。结论:基因诊再生育时产前诊断结果:

断有助于可疑UCD患者的明确诊断以及分型,部分疑似UCD胎儿可能OTC正常。对于生育过UCD患儿的家系,

再生育时进行产前基因诊断可积极预防出生缺陷。

【关键词】尿素循环障碍,DNA突变分析;先天性;瓜氨酸血症;鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症;产前诊

断;新生儿肝内胆汁淤积症

GeneMutationAnalysisandPrenatalDiagnosisofFamilywithUreaCycleDisorderZHANGQing-hua,

HAOSheng-ju,WANGXing,CHENXue,ZHOUBing-bo,LIUFu-rong,ZHENGLei,FENGXuan,ZHANG

rovinceMedicalGeneticsCenter,GansuProvinceMaternalandChildHealthCareHospital,

Lanzhou730050,China

Correspondingauthor:ZHANGChuan,E-mail:**********************

Abstract

Objective:Toinvestigatethegenemutationsofsevenfamiliessuspectedwithureacycle

disorders(UCD),s:Targetsequencecapture

combinedwithhigh-throughputnext-generationsequencing,andSangersequencing/LD-PCR/MLPA(multiplex

ligation-dependentprobeamplification)technologieswereusedtoinvestigatethegenemutationsforsevenfamilies

hegenotypesofthepedigreeswereidentified,twoamnioticfluidsamplesfromhigh-

s:ThediagnosisofUCDwasconfirmedin

fthem,fourpatientswerediagnosedastheneonatalintrahepaticcholestasis

causedbycitrindeficiency(NICCD)andoneofthemwascoexistwithspinalmuscularatrophy(SMA).Onepatient

wasdiagnosedwithcitrullinaemiatypeⅠ(CTLN1).Andtwopatientswerediagnosedwithornithinetranscarbamylase

deficiency(OTCD).Prenatalgeneticdiagnosisoftwofamiliesshowthatonefetushadamutationataheterozygous

mutationofSLC25A13withpaternal;sions:

r,somefamilieswithsuspectedUCD

natalgeneticdiagnosiscombinedwithOTCgenetestingcanpreventthe

rebirthdefectsinhigh-riskfamilies.

Keywords

Ureacycledisorders

inborn

Citrullinemia

Ornithinecarbamoyltransferasedeficiencydisease

DNAmutationalanalysis

Prenataldiagnosis

Neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency

JIntReprodHealth蛐FamPlan

2021

,40:185-188)

UC)尿素循环(ureacycle,是人体内清除氨的主

要途径,有6种关键酶:鸟氨酸氨基甲酰转移酶

OTC)N-乙酰谷氨(ornithinecarbamoyltransferase,、

基金项目:兰州市人才创新创业项目(2018-RC-95);国家人口与生

殖健康科学数据中心项目(2005DKA32408);甘肃省卫生

行业科研计划项目(GSWSKY-2015-22)

730050兰州,作者单位:甘肃省妇幼保健院医学遗传中心

NAGS)酸合成酶(N-acetylglutamatesynthase,、氨甲

酰磷酸合成酶Ⅰ(carbamylphosphatesynthaseⅠ,

CPSⅠ)、精氨酸琥珀酸合成酶(argininosuccinate

synthetase,ASS)、精氨酸代琥珀酸裂解酶(arginine

和精氨酸酶(arginase,,两succinatelyase,ASL)ARG)

种转运体(线粒体内膜鸟氨酸转运体和柠檬酸转运

体)的参与,其中任何一个酶或转运体的缺陷都会导

[1]

致尿素循环障碍(ureacycledisorder,UCD)UCD总。

通信作者:张钏,E-mail:**********************

··

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进行检测;按照试剂盒说明书操作完成MLPA反应。Holland)

体发病率在活产婴中约为1∶69000~1∶35000,其中

约50%的UCD伴有新生儿高氨血症,死亡率高达

存活者会遗留不可逆性神经系统后遗25%~50%,

[2]

。本研究对7例疑似UCD患儿等进行基因检测,以

明确其致病基因及基因分型,对这些患者家系提供

遗传咨询及再生育时的产前诊断。

MLPA反应产物在ABI3500DX测序仪上进行毛细管电泳。电

泳结果采样MLPA数据分析专用软件Coffalyser进行分析。

患儿母亲再孕时,孕18~21周经腹行羊膜

腔穿刺,抽取羊水15mL行先证者突变位点检测。

1对象与方法

1.1研究对象选取2017年9月—2019年9月在甘肃省妇幼

保健院(我院)收治的患儿,根据临床表现与遗传代谢病串联

质谱检测及尿气相分析检测等生化代谢改变高度疑似UCD

患者7例,男4例、女3例,年龄4d~3个月;经患者监护人签署

知情同意书及经医院学术伦理委员会批准后,采集患儿及父

(乙二胺四乙酸抗凝)进行基因突变分析。母静脉血2~3mL

2结果

2.1患者基因测序分析结果

例1检测到

SLC25A13基因自发杂合突变c.1737G>A;例2检测

检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1364G>T,

到母源杂合突变c.1660_1661ins16bp;例3检测到

1.2方法

应用北京天根公司(中国)的基

SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;例4

检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;

例5检测到ASS1基因父源杂合突变c.1088G>A,检测

到母源杂合突变c.787G>A;例6检测到OTC基因自

发半合子突变c.958C>T。见表1。

例1及其母亲、例3及其

母亲、例4及其母亲均检测到SLC25A13基因杂合突

变IVS16ins3kb。见表1。

因组DNA提取试剂盒,按照试剂盒说明书进行。

利用遗传代谢病基因检测panel(北京

迈基诺公司)进行高通量测序以明确致病突变,测序平均深

度为200×。对检测到的变异进行过滤筛选,应用PolyPhen2和

MutationTaster软件对新变异进行蛋白功能预测,新变异致病

性判读根据美国医学遗传学与基因组学会2015指南进行。

①Sanger测序。应用Primer5软

件针对变异位点设计引物,引物由上海生工生物工程有限公

扩增产物用纯化试剂盒纯化司合成。对聚合酶链反应(PCR)

后,上机进行测序(ABI3500DX,美国),应用SeqMan软件对测

序结果与标准序列进行比对分析。②长距离-PCR(LD-

P060探针在例1上检测到

SMN1基因E7-8del纯合突变,其父母均为杂合突变

P079探针在例7上检测到OTC基因杂合突变携带者。

其母亲为7-9外显子的杂合性缺失突变Exon7-9Del,

携带者,例7和其母亲均检测到杂合突变,但母亲未

患病。见表1。

7例疑似UCD患儿得到了明确分通过分子检测,

PCR)。使用LongPCR试剂盒(北京普洛麦格生物技术有限公

司)进行PCR扩增,对扩增产物进行电泳来检测SLC25A13基因

IVS16ins3kb位点突变情况。③多重连接探针扩增(multiplex

技术分析。对MLPA)ligation-dependentprobeamplification,

(MRC-Holland)进行检1例OTC缺乏的患儿通过MLPAP079探针

4例为NICCD1例为瓜氨酸血症Ⅰ型型:(57%),

14.3%)2例为鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏,(CTLN1,

OTCD,症(ornithinecarbamoyltransferasedeficiency,

28.7%),见表1。

本研究共发现3个UCD相关致病基因:

SLC25A13、ASS1和OTC,发现相应的9个等位基因突

1例新生儿肝内胆汁淤积症测;(neonatalintrahepaticcholestasis

causedbycitrindeficiency,NICCD)疑似合并脊髓性肌萎缩症

SMA)先证者通过P060探针(MRC-(spinalmuscularatrophy,

表1

序号性别

1

2

3

4

5

6

7

7例UCD患者的临床表型及基因检测结果

基因

SLC25A13

SMN1

SLC25A13

临床表型

基因型(父/母)

父源性

-

E7-8del

c.1364G>T

母源性

IVS16ins3kb

E7-8del

c.1660_1661ins16bp

IVS16ins3kb

IVS16ins3kb

c.787G>A

-

Exon7-9Del

新发性

c.1737G>A

-

-

-

-

-

c.958C>T

-

疾病名称

NICCD合并SMA

NICCD

NICCD

NICCD

CTLN1

OTCD

OTCD

遗传模式

AR

AR

AR

AR

AR

AR

XL

XL

女颈部柔软,无抵抗,皮肤巩膜黄染,高胆红素血症

男胆汁淤积,黄疸,肉碱代谢异常,瓜氨酸代谢异常

女皮肤黄染,高胆红素血症,瓜氨酸指标异常

男胆汁淤积性肝病,血液蛋白不足,低纤维蛋白原血症

男高氨血症,新生儿惊厥,呼吸暂停

男新生儿惊厥,代谢性酸中毒,高氨酸血症

女高氨血症,尿素循环障碍,呼吸衰竭

SLC25A13c.1638_1660dup23

SLC25A13c.1638_1660dup23

ASS1

OTC

OTC

c.1088G>A

-

-

AR为常染色体隐性遗传,XL为X染色体连锁遗传。注:

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变,包括3种错义突变、2种移码突变、1种无义突变、1

种插入突变,1种缺失突变。其中突变频率最高的是

SLC25A13基因IVS16ins3kb等位基因突变,见表2。

表27例UCD患者家系主要基因突变类型及频率

基因名称碱基改变氨基酸改变突变类型频数

HGMDclinvar

(+/-)(+/-)

SLC25A13c.1737G>Ap.W579X无义突变1+-

IVS16ins3kb-插入突变3++

c.1638_1660dup23p.A554Gfs*17移码突变2++

c.1364G>Tp.R455L错义突变1+-

c.1660_1661ins16bpp.A554Gfs*17移码突变1-+

ASS1c.787G>Ap.V263M错义突变1++

c.1088G>Ap.R363Q错义突变1++

OTCc.958C>Tp.R320X无义突变1+-

Exon7-9Del-缺失突变1++

注:HGMD为人类基因突变数据库(),

clinvar网址/clinvar/。

2.2产前诊断结果分析例2和例6家系再次妊娠

时,在孕19周通过羊水穿刺进行了产前基因诊断:例

2家系胎儿检测到SLC25A13基因c.1364G>T父源致

病基因携带变异,见图1A和图1B(见后插一);例6家

系胎儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T

半合子突变,见图1C见后插一)。经遗传咨询后,告

知这两家系胎儿患病风险较低,这两家系均选择了

继续妊娠,胎儿随访至生后1个月,足跟血串联质谱

检查未见异常,发育良好。

3讨论

3.1基因检测可对UCD患儿进行精确分型UCD

是一组遗传代谢病,患儿的体征、临床表现未见特异

性,难以进行鉴别诊断。因此对相关致病基因进行

基因诊断尤为重要。本研究通过对7例疑似UCD患儿

进行基因诊断后,发现5例瓜氨酸血症(4例NICCD及

1例CTLN1)和2例OTCD。其中病例1较罕见,除

SLC25A13基因复合杂合突变外还伴有SMN1基因外

显子7和8纯合缺失,该患儿共患NICCD及SMA。

3.2UCD致病基因的异质性瓜氨酸血症是一组

通常表现为神经精神症状及血清中瓜氨酸和氨浓

度升高的UCD,通常分为Ⅱ型(NICCD)和Ⅰ型

CTLN1),分别为SLC25A13和ASS1双等位基因变异

导致的常染色体隐性遗传病

[3]

瓜氨酸血症Ⅱ型(NICCD)由SLC25A13基因突

变所致。其发病率具有地域性差异,在我国南方约

1/9200,北方约1/3500000,我国呈南高北低趋势。

同时,NICCD致病基因的携带率及突变类型亦有差

异:SLC25A13基因杂合子携带率在日本、韩国人群

中分别为1/69、1/50

[4]

,中国人群中为1/63;已报道的

SLC25A13基因致病突变类型超过90种,而中国人

群中c.851_854delGTAT、c.1638-1660dup23、c.615+

5G>A、IVS16ins3kb和c.1399C>T等5个突变约占

85.40%的突变等位基因,构成中国人普遍存在的

SLC25A13突变

[5]

。本研究共检测出4例NICCD患儿,

发现5种SLC25A13等位基因变异(IVS16ins3kb、

c.1638-1660dup23、c.1364G>T、c.1737G>A和c.1660_

1661ins23),其中IVS16ins3kb和c.1638-1660dup23

与研究报道其在中国人群高发

[4]

相符。此外,上述变

异存在地域差异,如:IVS16ins3kb作为一种转座后

插入突变,在日本较为常见

[6]

,在中国北方人群高于

南方;

c.1364G>T

在中国北方较为常见;而

c.1638-

1660dup23的相对频率在中国不同区域则相对一

[7]

。本研究4例NICCD患儿中,有3例均有SLC25A13

基因IVS16ins3kb杂合突变(3/4),与在中国北方较为

常见的趋势一致。

瓜氨酸血症Ⅰ型(CTLN1)是由于ASS基因突变

所致,是UCD中第三大类型,发病率约为1/200000~

1/44300

[3]

。其致病基因ASS1基因突变频率具有一

定的地域性分布差异,且不同基因与临床表型严

重程度有关。本研究共发现2个ASS1等位基因错义

突变,分别为c.787G>A(p.Val263Met)和c.1088G>A

(p.Arg363Trp)。有研究报道ASS1基因携带亦存在地

域性差异:363Trp在德国(包括德国人和居住

在德国的土耳其人)患者中的携带率为13.5%;而

263Met在土耳其患者中携带率为7.9%

[8]

。本研

究中因ASS1等位基因变异较少,突变频率是否存在

地区性差异有待后续进一步分析。同时,有研究报

道263Met等位基因复合杂合或纯合突变情况

下多表现为迟发和(或)轻度瓜氨酸血症

[9]

。本研究

中患者目前仅主要表现为血清瓜氨酸指标等异常增

高;未见其他显著临床表现,临床表型与这一等位基

因复合杂合变异表型相符,故而,对于这种轻型或迟

发型CTLN1,基因诊断显得更加重要,及时应用基因

诊断明确变异类型,高度重视予以积极治疗及预防,

可有效避免突发异常的出现。

OTCD由OTC基因突变引起,是UCD中最常见的

亚型,平均发病率为7.1/100000,属于X连锁不完全

显性或X连锁隐性遗传代谢病;OTCD的临床表现主

要与酶的残余活性相关。目前OTC基因已报道超过

400种基因突变类型

[10]

。本研究共发现2个OTC等位

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基因分别为c.958C>T和外显子7-10缺失;其中无义

突变c.958C>T(p.R320X)为一男性半合子突变患儿,

该男性患者病情较重,主要是由于OTC基因携带在X

染色体上,这一酶的活性在男孩体内完全失活,导致

急性氨中毒,该临床表型与XL基因变异遗传模式相

符;而另一等位基因变异外显子7-10缺失,为一女

性杂合子突变患儿。通常女性杂合子突变,临床表

现高度多样,约15%患者发病;多数杂合子携带者

不出现高氨血症

[11]

。由于实验条件限制,本研究没有

做X染色体随机失活检测,但笔者推测例7正常的那

条X染色体发生了非随机失活,从而导致了疾病的

发生

[12-13]

3.3产前基因诊断可避免患儿出生本研究为2个

再生育家系提供产前基因诊断:例2家系胎儿检测到

SLC25A13

基因

c.1364G>T

父源携带突变;例

6

家系胎

儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T半合

子突变。2个家庭均选择了继续妊娠,出生后随访至

1个月,生化指标及发育状况均正常。

综上,笔者对7例疑似UCD患儿进行了基因分

析,明确了其治病原因,并对两患者家系再生育时进

行了产前诊断。通过高通量测序技术对患者进行基

因分型后可及早给予干预治疗,可为遗传咨询及产

前诊断提供可靠依据

[14-16]

;进而在致病基因明确的

前提下,通过产前诊断或胚胎植入前单基因病检测

PGT-M)有效预防出生缺陷。

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doi:10.1186/s13023-018-0908-1.

(收稿日期:2020-09-16)

[本文编辑王琳]

·后插一·

石家庄地区新生儿Citrin蛋白缺乏症串联质谱筛查结果分析

(正文见第182页

AB

注:A为c.1021+1G>A;B为c.851_854delTATG。

图1例1患儿的SLC25A13基因突变检测结果

尿素循环障碍患者家系的基因突变分析及产前诊断

(正文见第185页

先证者

父亲

母亲

胎儿

A例2家系SLC25A13基因变异c.1364G>TB例2家系SLC25A13基因变异c.1660_1661ins

图1产前诊断测序图

C例6家系OTC基因变异c.958C>T

胎儿埃布斯坦畸形一例

(正文见第196页

图1三尖瓣发育畸形图2三尖瓣返流

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