2024年4月21日发(作者:不烨华)
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
DOI:10.12280/gjszjk.20200537
··
185
·论著·
张庆华,郝胜菊,王兴,陈雪,周秉博,刘芙蓉,郑雷,冯暄,张钏
【摘要】目的:分析7例尿素循环障碍UCD)(ureacycledisorder,患者家系的基因突变情况,并对2例再
生育家庭进行产前诊断。方法:联合应用高通量测序(panel)结合Sanger测序、长距离-聚合酶链反应(LD-
PCR)MLPA)以及多重连接探针扩增(multiplexligation-dependentprobeamplification,等基因检测技术,对7例
疑似UCD患者家系进行相关致病基因突变分析,并对其中2例高风险家系的胎儿羊水标本进行产前基因诊
断。结果:7例疑似UCD患者均得到明确基因诊断:4例患儿为SLC25A13基因突变引起的新生儿肝内胆汁淤积
NICCD)症(neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency,,且1例同时患脊髓性肌萎缩症(spinal
muscularatrophy,SMA)1例患儿为ASS1基因突变引起的瓜氨酸血症Ⅰ型(citrullinaemiatypeⅠ,CTLN1)2例;;
OTCD)患儿为OTC基因突变引起的鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症(ornithinetranscarbamylasedeficiency,。2家系
1例胎儿为父源SLC25A13致病基因携带者;1例为OTC正常的UCD胎儿。结论:基因诊再生育时产前诊断结果:
断有助于可疑UCD患者的明确诊断以及分型,部分疑似UCD胎儿可能OTC正常。对于生育过UCD患儿的家系,
再生育时进行产前基因诊断可积极预防出生缺陷。
【关键词】尿素循环障碍,DNA突变分析;先天性;瓜氨酸血症;鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症;产前诊
断;新生儿肝内胆汁淤积症
GeneMutationAnalysisandPrenatalDiagnosisofFamilywithUreaCycleDisorderZHANGQing-hua,
HAOSheng-ju,WANGXing,CHENXue,ZHOUBing-bo,LIUFu-rong,ZHENGLei,FENGXuan,ZHANG
rovinceMedicalGeneticsCenter,GansuProvinceMaternalandChildHealthCareHospital,
Lanzhou730050,China
Correspondingauthor:ZHANGChuan,E-mail:**********************
【
Abstract
】
Objective:Toinvestigatethegenemutationsofsevenfamiliessuspectedwithureacycle
disorders(UCD),s:Targetsequencecapture
combinedwithhigh-throughputnext-generationsequencing,andSangersequencing/LD-PCR/MLPA(multiplex
ligation-dependentprobeamplification)technologieswereusedtoinvestigatethegenemutationsforsevenfamilies
hegenotypesofthepedigreeswereidentified,twoamnioticfluidsamplesfromhigh-
s:ThediagnosisofUCDwasconfirmedin
fthem,fourpatientswerediagnosedastheneonatalintrahepaticcholestasis
causedbycitrindeficiency(NICCD)andoneofthemwascoexistwithspinalmuscularatrophy(SMA).Onepatient
wasdiagnosedwithcitrullinaemiatypeⅠ(CTLN1).Andtwopatientswerediagnosedwithornithinetranscarbamylase
deficiency(OTCD).Prenatalgeneticdiagnosisoftwofamiliesshowthatonefetushadamutationataheterozygous
mutationofSLC25A13withpaternal;sions:
r,somefamilieswithsuspectedUCD
natalgeneticdiagnosiscombinedwithOTCgenetestingcanpreventthe
rebirthdefectsinhigh-riskfamilies.
【
Keywords
】
Ureacycledisorders
,
inborn
;
Citrullinemia
;
Ornithinecarbamoyltransferasedeficiencydisease
;
DNAmutationalanalysis
;
Prenataldiagnosis
;
Neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency
(
JIntReprodHealth蛐FamPlan
,
2021
,40:185-188)
UC)尿素循环(ureacycle,是人体内清除氨的主
要途径,有6种关键酶:鸟氨酸氨基甲酰转移酶
OTC)N-乙酰谷氨(ornithinecarbamoyltransferase,、
基金项目:兰州市人才创新创业项目(2018-RC-95);国家人口与生
殖健康科学数据中心项目(2005DKA32408);甘肃省卫生
行业科研计划项目(GSWSKY-2015-22)
730050兰州,作者单位:甘肃省妇幼保健院医学遗传中心
NAGS)酸合成酶(N-acetylglutamatesynthase,、氨甲
酰磷酸合成酶Ⅰ(carbamylphosphatesynthaseⅠ,
CPSⅠ)、精氨酸琥珀酸合成酶(argininosuccinate
synthetase,ASS)、精氨酸代琥珀酸裂解酶(arginine
和精氨酸酶(arginase,,两succinatelyase,ASL)ARG)
种转运体(线粒体内膜鸟氨酸转运体和柠檬酸转运
体)的参与,其中任何一个酶或转运体的缺陷都会导
[1]
致尿素循环障碍(ureacycledisorder,UCD)UCD总。
通信作者:张钏,E-mail:**********************
··
186
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
进行检测;按照试剂盒说明书操作完成MLPA反应。Holland)
体发病率在活产婴中约为1∶69000~1∶35000,其中
约50%的UCD伴有新生儿高氨血症,死亡率高达
存活者会遗留不可逆性神经系统后遗25%~50%,
症
[2]
。本研究对7例疑似UCD患儿等进行基因检测,以
明确其致病基因及基因分型,对这些患者家系提供
遗传咨询及再生育时的产前诊断。
MLPA反应产物在ABI3500DX测序仪上进行毛细管电泳。电
泳结果采样MLPA数据分析专用软件Coffalyser进行分析。
患儿母亲再孕时,孕18~21周经腹行羊膜
腔穿刺,抽取羊水15mL行先证者突变位点检测。
1对象与方法
1.1研究对象选取2017年9月—2019年9月在甘肃省妇幼
保健院(我院)收治的患儿,根据临床表现与遗传代谢病串联
质谱检测及尿气相分析检测等生化代谢改变高度疑似UCD
患者7例,男4例、女3例,年龄4d~3个月;经患者监护人签署
知情同意书及经医院学术伦理委员会批准后,采集患儿及父
(乙二胺四乙酸抗凝)进行基因突变分析。母静脉血2~3mL
2结果
2.1患者基因测序分析结果
例1检测到
SLC25A13基因自发杂合突变c.1737G>A;例2检测
检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1364G>T,
到母源杂合突变c.1660_1661ins16bp;例3检测到
1.2方法
应用北京天根公司(中国)的基
SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;例4
检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;
例5检测到ASS1基因父源杂合突变c.1088G>A,检测
到母源杂合突变c.787G>A;例6检测到OTC基因自
发半合子突变c.958C>T。见表1。
例1及其母亲、例3及其
母亲、例4及其母亲均检测到SLC25A13基因杂合突
变IVS16ins3kb。见表1。
因组DNA提取试剂盒,按照试剂盒说明书进行。
利用遗传代谢病基因检测panel(北京
迈基诺公司)进行高通量测序以明确致病突变,测序平均深
度为200×。对检测到的变异进行过滤筛选,应用PolyPhen2和
MutationTaster软件对新变异进行蛋白功能预测,新变异致病
性判读根据美国医学遗传学与基因组学会2015指南进行。
①Sanger测序。应用Primer5软
件针对变异位点设计引物,引物由上海生工生物工程有限公
扩增产物用纯化试剂盒纯化司合成。对聚合酶链反应(PCR)
后,上机进行测序(ABI3500DX,美国),应用SeqMan软件对测
序结果与标准序列进行比对分析。②长距离-PCR(LD-
P060探针在例1上检测到
SMN1基因E7-8del纯合突变,其父母均为杂合突变
P079探针在例7上检测到OTC基因杂合突变携带者。
其母亲为7-9外显子的杂合性缺失突变Exon7-9Del,
携带者,例7和其母亲均检测到杂合突变,但母亲未
患病。见表1。
7例疑似UCD患儿得到了明确分通过分子检测,
PCR)。使用LongPCR试剂盒(北京普洛麦格生物技术有限公
司)进行PCR扩增,对扩增产物进行电泳来检测SLC25A13基因
IVS16ins3kb位点突变情况。③多重连接探针扩增(multiplex
技术分析。对MLPA)ligation-dependentprobeamplification,
(MRC-Holland)进行检1例OTC缺乏的患儿通过MLPAP079探针
4例为NICCD1例为瓜氨酸血症Ⅰ型型:(57%),
14.3%)2例为鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏,(CTLN1,
OTCD,症(ornithinecarbamoyltransferasedeficiency,
28.7%),见表1。
本研究共发现3个UCD相关致病基因:
SLC25A13、ASS1和OTC,发现相应的9个等位基因突
1例新生儿肝内胆汁淤积症测;(neonatalintrahepaticcholestasis
causedbycitrindeficiency,NICCD)疑似合并脊髓性肌萎缩症
SMA)先证者通过P060探针(MRC-(spinalmuscularatrophy,
表1
序号性别
1
2
3
4
5
6
7
7例UCD患者的临床表型及基因检测结果
基因
SLC25A13
SMN1
SLC25A13
临床表型
基因型(父/母)
父源性
-
E7-8del
c.1364G>T
母源性
IVS16ins3kb
E7-8del
c.1660_1661ins16bp
IVS16ins3kb
IVS16ins3kb
c.787G>A
-
Exon7-9Del
新发性
c.1737G>A
-
-
-
-
-
c.958C>T
-
疾病名称
NICCD合并SMA
NICCD
NICCD
NICCD
CTLN1
OTCD
OTCD
遗传模式
AR
AR
AR
AR
AR
AR
XL
XL
女颈部柔软,无抵抗,皮肤巩膜黄染,高胆红素血症
男胆汁淤积,黄疸,肉碱代谢异常,瓜氨酸代谢异常
女皮肤黄染,高胆红素血症,瓜氨酸指标异常
男胆汁淤积性肝病,血液蛋白不足,低纤维蛋白原血症
男高氨血症,新生儿惊厥,呼吸暂停
男新生儿惊厥,代谢性酸中毒,高氨酸血症
女高氨血症,尿素循环障碍,呼吸衰竭
SLC25A13c.1638_1660dup23
SLC25A13c.1638_1660dup23
ASS1
OTC
OTC
c.1088G>A
-
-
AR为常染色体隐性遗传,XL为X染色体连锁遗传。注:
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
··
187
变,包括3种错义突变、2种移码突变、1种无义突变、1
种插入突变,1种缺失突变。其中突变频率最高的是
SLC25A13基因IVS16ins3kb等位基因突变,见表2。
表27例UCD患者家系主要基因突变类型及频率
基因名称碱基改变氨基酸改变突变类型频数
HGMDclinvar
(+/-)(+/-)
SLC25A13c.1737G>Ap.W579X无义突变1+-
IVS16ins3kb-插入突变3++
c.1638_1660dup23p.A554Gfs*17移码突变2++
c.1364G>Tp.R455L错义突变1+-
c.1660_1661ins16bpp.A554Gfs*17移码突变1-+
ASS1c.787G>Ap.V263M错义突变1++
c.1088G>Ap.R363Q错义突变1++
OTCc.958C>Tp.R320X无义突变1+-
Exon7-9Del-缺失突变1++
注:HGMD为人类基因突变数据库(),
clinvar网址/clinvar/。
2.2产前诊断结果分析例2和例6家系再次妊娠
时,在孕19周通过羊水穿刺进行了产前基因诊断:例
2家系胎儿检测到SLC25A13基因c.1364G>T父源致
病基因携带变异,见图1A和图1B(见后插一);例6家
系胎儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T
半合子突变,见图1C见后插一)。经遗传咨询后,告
知这两家系胎儿患病风险较低,这两家系均选择了
继续妊娠,胎儿随访至生后1个月,足跟血串联质谱
检查未见异常,发育良好。
3讨论
3.1基因检测可对UCD患儿进行精确分型UCD
是一组遗传代谢病,患儿的体征、临床表现未见特异
性,难以进行鉴别诊断。因此对相关致病基因进行
基因诊断尤为重要。本研究通过对7例疑似UCD患儿
进行基因诊断后,发现5例瓜氨酸血症(4例NICCD及
1例CTLN1)和2例OTCD。其中病例1较罕见,除
SLC25A13基因复合杂合突变外还伴有SMN1基因外
显子7和8纯合缺失,该患儿共患NICCD及SMA。
3.2UCD致病基因的异质性瓜氨酸血症是一组
通常表现为神经精神症状及血清中瓜氨酸和氨浓
度升高的UCD,通常分为Ⅱ型(NICCD)和Ⅰ型
CTLN1),分别为SLC25A13和ASS1双等位基因变异
导致的常染色体隐性遗传病
[3]
。
瓜氨酸血症Ⅱ型(NICCD)由SLC25A13基因突
变所致。其发病率具有地域性差异,在我国南方约
1/9200,北方约1/3500000,我国呈南高北低趋势。
同时,NICCD致病基因的携带率及突变类型亦有差
异:SLC25A13基因杂合子携带率在日本、韩国人群
中分别为1/69、1/50
[4]
,中国人群中为1/63;已报道的
SLC25A13基因致病突变类型超过90种,而中国人
群中c.851_854delGTAT、c.1638-1660dup23、c.615+
5G>A、IVS16ins3kb和c.1399C>T等5个突变约占
85.40%的突变等位基因,构成中国人普遍存在的
SLC25A13突变
[5]
。本研究共检测出4例NICCD患儿,
发现5种SLC25A13等位基因变异(IVS16ins3kb、
c.1638-1660dup23、c.1364G>T、c.1737G>A和c.1660_
1661ins23),其中IVS16ins3kb和c.1638-1660dup23
与研究报道其在中国人群高发
[4]
相符。此外,上述变
异存在地域差异,如:IVS16ins3kb作为一种转座后
插入突变,在日本较为常见
[6]
,在中国北方人群高于
南方;
c.1364G>T
在中国北方较为常见;而
c.1638-
1660dup23的相对频率在中国不同区域则相对一
致
[7]
。本研究4例NICCD患儿中,有3例均有SLC25A13
基因IVS16ins3kb杂合突变(3/4),与在中国北方较为
常见的趋势一致。
瓜氨酸血症Ⅰ型(CTLN1)是由于ASS基因突变
所致,是UCD中第三大类型,发病率约为1/200000~
1/44300
[3]
。其致病基因ASS1基因突变频率具有一
定的地域性分布差异,且不同基因与临床表型严
重程度有关。本研究共发现2个ASS1等位基因错义
突变,分别为c.787G>A(p.Val263Met)和c.1088G>A
(p.Arg363Trp)。有研究报道ASS1基因携带亦存在地
域性差异:363Trp在德国(包括德国人和居住
在德国的土耳其人)患者中的携带率为13.5%;而
263Met在土耳其患者中携带率为7.9%
[8]
。本研
究中因ASS1等位基因变异较少,突变频率是否存在
地区性差异有待后续进一步分析。同时,有研究报
道263Met等位基因复合杂合或纯合突变情况
下多表现为迟发和(或)轻度瓜氨酸血症
[9]
。本研究
中患者目前仅主要表现为血清瓜氨酸指标等异常增
高;未见其他显著临床表现,临床表型与这一等位基
因复合杂合变异表型相符,故而,对于这种轻型或迟
发型CTLN1,基因诊断显得更加重要,及时应用基因
诊断明确变异类型,高度重视予以积极治疗及预防,
可有效避免突发异常的出现。
OTCD由OTC基因突变引起,是UCD中最常见的
亚型,平均发病率为7.1/100000,属于X连锁不完全
显性或X连锁隐性遗传代谢病;OTCD的临床表现主
要与酶的残余活性相关。目前OTC基因已报道超过
400种基因突变类型
[10]
。本研究共发现2个OTC等位
(
··
188
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
基因分别为c.958C>T和外显子7-10缺失;其中无义
突变c.958C>T(p.R320X)为一男性半合子突变患儿,
该男性患者病情较重,主要是由于OTC基因携带在X
染色体上,这一酶的活性在男孩体内完全失活,导致
急性氨中毒,该临床表型与XL基因变异遗传模式相
符;而另一等位基因变异外显子7-10缺失,为一女
性杂合子突变患儿。通常女性杂合子突变,临床表
现高度多样,约15%患者发病;多数杂合子携带者
不出现高氨血症
[11]
。由于实验条件限制,本研究没有
做X染色体随机失活检测,但笔者推测例7正常的那
条X染色体发生了非随机失活,从而导致了疾病的
发生
[12-13]
。
3.3产前基因诊断可避免患儿出生本研究为2个
再生育家系提供产前基因诊断:例2家系胎儿检测到
SLC25A13
基因
c.1364G>T
父源携带突变;例
6
家系胎
儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T半合
子突变。2个家庭均选择了继续妊娠,出生后随访至
1个月,生化指标及发育状况均正常。
综上,笔者对7例疑似UCD患儿进行了基因分
析,明确了其治病原因,并对两患者家系再生育时进
行了产前诊断。通过高通量测序技术对患者进行基
因分型后可及早给予干预治疗,可为遗传咨询及产
前诊断提供可靠依据
[14-16]
;进而在致病基因明确的
前提下,通过产前诊断或胚胎植入前单基因病检测
PGT-M)有效预防出生缺陷。
参考文献
[1]赵静.迟发型鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症11例临床特点及基因
分析[D].重庆:重庆医科大学,2019.
[2]H覿berleJ,BurlinaA,ChakrapaniA,tedguidelinesfor
thediagnosisandmanagementofureacycledisorders:First
revision[J].JInheritMetabDis,2019,42(6)::
10.1002/jimd.12100.
[3]WooHI,ParkHD,largeneticsofcitrullinemia
typesIandII[J].ClinChimActa,2014,431::10.1016/j.
cca.2014.01.032.
[4]KobayashiK,BangLuY,XianLiM,ingofnine
SLC25A13mutations:theirfrequencyinpatientswithcitrin
deficiencyandhighcarrierratesinAsianpopulations[J].MolGenet
Metab,2003,80(3)::10.1016/S1096-7192(03)
00140-9.
[5]ZhangZH,YangZG,ChenFP,ingforfiveprevalent
mutationsofSLC25A13geneinGuangdong,China:amolecular
epidemiologicsurveyofcitrindeficiency[J].TohokuJExpMed,
2014,233(4)::10.1620/tjem.233.275.
[6]TabataA,ShengJS,UshikaiM,ficationof13novel
mutationsincludingaretrotransposalinsertioninSLC25A13gene
andfrequencyof30mutationsfoundinpatientswithcitrin
deficiency[J].JHumGenet,2008,53(6)::10.1007/
s10038-008-0282-2.
[7]LinWX,ZengHS,ZhangZH,lardiagnosisof
pediatricpatientswithcitrindeficiencyinChina:SLC25A13
mutationspectrumandthegeographicdistribution[J].SciRep,
2016,6::10.1038/srep29732.
[8]Diez-FernandezC,RüfenachtV,H覿onsinthe
HumanArgininosuccinateSynthetase(ASS1)Gene,Impacton
Patients,CommonChanges,andStructuralConsiderations[J].Hum
Mutat,2017,38(5)::10.1002/humu.23184.
[9]Marquis-NicholsonR,GlamuzinaE,ProsserD,linemia
typeI:molecularscreeningoftheASS1genebyexonicsequencing
andtargetedmutationanalysis[J].GenetMolRes,2010,9(3):
:10.4238/vol9-3gmr834.
[10]ChoiJH,LeeBH,KimJH,aloutcomesandthe
mutationspectrumoftheOTCgeneinpatientswithornithine
transcarbamylasedeficiency[J].JHumGenet,2015,60(9):501-
:10.1038/jhg.2015.54.
[11]ShaoY,JiangM,LinY,alandmutationanalysisof24
Chinesepatientswithornithinetranscarbamylasedeficiency[J].
ClinGenet,2017,92(3)::10.1111/cge.13004.
[12]MusalkovaD,SticovaE,RebounM,leX-chromosome
inactivationandenlargementofpericentralglutaminesynthetase
zonesintheliverofheterozygousfemaleswithOTCdeficiency[J].
VirchowsArch,2018,472(6)::10.1007/s00428-
018-2345-x.
[13]SloasHA3rd,EnceTC,MendezDR,ntersectionof
toxicology,psychiatry,andgenetics:adiagnosisofornithine
transcarbamylasedeficiency[J].AmJEmergMed,2013,31(9):
:10.1016/.2013.05.010.
[14]潘蕾,何志明,张锐.高通量测序技术在先天性脑积水基因诊断
中的应用[J].国际生殖健康/计划生育杂志,2019,38(6):450-
:10.3969/.1674-1889.2019.06.002.
[15]LiS,CaiY,ShiC,tationAnalysisandPrenatal
DiagnosisoftheOrnithineTranscarbamylase(OTC)GeneinTwo
FamilieswithOrnithineTranscarbamylaseDeficiency[J].MedSci
Monit,2018,24::10.12659/MSM.911295.
[16]Bijarnia-MahayS,H覿berleJ,JalanAB,cledisorders
inIndia:clinicalcourse,biochemicalandgeneticinvestigations,
andprenataltesting[J].OrphanetJRareDis,2018,13(1):174.
doi:10.1186/s13023-018-0908-1.
(收稿日期:2020-09-16)
[本文编辑王琳]
(
·后插一·
石家庄地区新生儿Citrin蛋白缺乏症串联质谱筛查结果分析
(正文见第182页
)
AB
注:A为c.1021+1G>A;B为c.851_854delTATG。
图1例1患儿的SLC25A13基因突变检测结果
尿素循环障碍患者家系的基因突变分析及产前诊断
(正文见第185页
)
先证者
父亲
母亲
胎儿
A例2家系SLC25A13基因变异c.1364G>TB例2家系SLC25A13基因变异c.1660_1661ins
图1产前诊断测序图
C例6家系OTC基因变异c.958C>T
胎儿埃布斯坦畸形一例
(正文见第196页
)
图1三尖瓣发育畸形图2三尖瓣返流
2024年4月21日发(作者:不烨华)
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
DOI:10.12280/gjszjk.20200537
··
185
·论著·
张庆华,郝胜菊,王兴,陈雪,周秉博,刘芙蓉,郑雷,冯暄,张钏
【摘要】目的:分析7例尿素循环障碍UCD)(ureacycledisorder,患者家系的基因突变情况,并对2例再
生育家庭进行产前诊断。方法:联合应用高通量测序(panel)结合Sanger测序、长距离-聚合酶链反应(LD-
PCR)MLPA)以及多重连接探针扩增(multiplexligation-dependentprobeamplification,等基因检测技术,对7例
疑似UCD患者家系进行相关致病基因突变分析,并对其中2例高风险家系的胎儿羊水标本进行产前基因诊
断。结果:7例疑似UCD患者均得到明确基因诊断:4例患儿为SLC25A13基因突变引起的新生儿肝内胆汁淤积
NICCD)症(neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency,,且1例同时患脊髓性肌萎缩症(spinal
muscularatrophy,SMA)1例患儿为ASS1基因突变引起的瓜氨酸血症Ⅰ型(citrullinaemiatypeⅠ,CTLN1)2例;;
OTCD)患儿为OTC基因突变引起的鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症(ornithinetranscarbamylasedeficiency,。2家系
1例胎儿为父源SLC25A13致病基因携带者;1例为OTC正常的UCD胎儿。结论:基因诊再生育时产前诊断结果:
断有助于可疑UCD患者的明确诊断以及分型,部分疑似UCD胎儿可能OTC正常。对于生育过UCD患儿的家系,
再生育时进行产前基因诊断可积极预防出生缺陷。
【关键词】尿素循环障碍,DNA突变分析;先天性;瓜氨酸血症;鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症;产前诊
断;新生儿肝内胆汁淤积症
GeneMutationAnalysisandPrenatalDiagnosisofFamilywithUreaCycleDisorderZHANGQing-hua,
HAOSheng-ju,WANGXing,CHENXue,ZHOUBing-bo,LIUFu-rong,ZHENGLei,FENGXuan,ZHANG
rovinceMedicalGeneticsCenter,GansuProvinceMaternalandChildHealthCareHospital,
Lanzhou730050,China
Correspondingauthor:ZHANGChuan,E-mail:**********************
【
Abstract
】
Objective:Toinvestigatethegenemutationsofsevenfamiliessuspectedwithureacycle
disorders(UCD),s:Targetsequencecapture
combinedwithhigh-throughputnext-generationsequencing,andSangersequencing/LD-PCR/MLPA(multiplex
ligation-dependentprobeamplification)technologieswereusedtoinvestigatethegenemutationsforsevenfamilies
hegenotypesofthepedigreeswereidentified,twoamnioticfluidsamplesfromhigh-
s:ThediagnosisofUCDwasconfirmedin
fthem,fourpatientswerediagnosedastheneonatalintrahepaticcholestasis
causedbycitrindeficiency(NICCD)andoneofthemwascoexistwithspinalmuscularatrophy(SMA).Onepatient
wasdiagnosedwithcitrullinaemiatypeⅠ(CTLN1).Andtwopatientswerediagnosedwithornithinetranscarbamylase
deficiency(OTCD).Prenatalgeneticdiagnosisoftwofamiliesshowthatonefetushadamutationataheterozygous
mutationofSLC25A13withpaternal;sions:
r,somefamilieswithsuspectedUCD
natalgeneticdiagnosiscombinedwithOTCgenetestingcanpreventthe
rebirthdefectsinhigh-riskfamilies.
【
Keywords
】
Ureacycledisorders
,
inborn
;
Citrullinemia
;
Ornithinecarbamoyltransferasedeficiencydisease
;
DNAmutationalanalysis
;
Prenataldiagnosis
;
Neonatalintrahepaticcholestasiscausedbycitrindeficiency
(
JIntReprodHealth蛐FamPlan
,
2021
,40:185-188)
UC)尿素循环(ureacycle,是人体内清除氨的主
要途径,有6种关键酶:鸟氨酸氨基甲酰转移酶
OTC)N-乙酰谷氨(ornithinecarbamoyltransferase,、
基金项目:兰州市人才创新创业项目(2018-RC-95);国家人口与生
殖健康科学数据中心项目(2005DKA32408);甘肃省卫生
行业科研计划项目(GSWSKY-2015-22)
730050兰州,作者单位:甘肃省妇幼保健院医学遗传中心
NAGS)酸合成酶(N-acetylglutamatesynthase,、氨甲
酰磷酸合成酶Ⅰ(carbamylphosphatesynthaseⅠ,
CPSⅠ)、精氨酸琥珀酸合成酶(argininosuccinate
synthetase,ASS)、精氨酸代琥珀酸裂解酶(arginine
和精氨酸酶(arginase,,两succinatelyase,ASL)ARG)
种转运体(线粒体内膜鸟氨酸转运体和柠檬酸转运
体)的参与,其中任何一个酶或转运体的缺陷都会导
[1]
致尿素循环障碍(ureacycledisorder,UCD)UCD总。
通信作者:张钏,E-mail:**********************
··
186
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
进行检测;按照试剂盒说明书操作完成MLPA反应。Holland)
体发病率在活产婴中约为1∶69000~1∶35000,其中
约50%的UCD伴有新生儿高氨血症,死亡率高达
存活者会遗留不可逆性神经系统后遗25%~50%,
症
[2]
。本研究对7例疑似UCD患儿等进行基因检测,以
明确其致病基因及基因分型,对这些患者家系提供
遗传咨询及再生育时的产前诊断。
MLPA反应产物在ABI3500DX测序仪上进行毛细管电泳。电
泳结果采样MLPA数据分析专用软件Coffalyser进行分析。
患儿母亲再孕时,孕18~21周经腹行羊膜
腔穿刺,抽取羊水15mL行先证者突变位点检测。
1对象与方法
1.1研究对象选取2017年9月—2019年9月在甘肃省妇幼
保健院(我院)收治的患儿,根据临床表现与遗传代谢病串联
质谱检测及尿气相分析检测等生化代谢改变高度疑似UCD
患者7例,男4例、女3例,年龄4d~3个月;经患者监护人签署
知情同意书及经医院学术伦理委员会批准后,采集患儿及父
(乙二胺四乙酸抗凝)进行基因突变分析。母静脉血2~3mL
2结果
2.1患者基因测序分析结果
例1检测到
SLC25A13基因自发杂合突变c.1737G>A;例2检测
检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1364G>T,
到母源杂合突变c.1660_1661ins16bp;例3检测到
1.2方法
应用北京天根公司(中国)的基
SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;例4
检测到SLC25A13基因父源杂合突变c.1638_1660dup23;
例5检测到ASS1基因父源杂合突变c.1088G>A,检测
到母源杂合突变c.787G>A;例6检测到OTC基因自
发半合子突变c.958C>T。见表1。
例1及其母亲、例3及其
母亲、例4及其母亲均检测到SLC25A13基因杂合突
变IVS16ins3kb。见表1。
因组DNA提取试剂盒,按照试剂盒说明书进行。
利用遗传代谢病基因检测panel(北京
迈基诺公司)进行高通量测序以明确致病突变,测序平均深
度为200×。对检测到的变异进行过滤筛选,应用PolyPhen2和
MutationTaster软件对新变异进行蛋白功能预测,新变异致病
性判读根据美国医学遗传学与基因组学会2015指南进行。
①Sanger测序。应用Primer5软
件针对变异位点设计引物,引物由上海生工生物工程有限公
扩增产物用纯化试剂盒纯化司合成。对聚合酶链反应(PCR)
后,上机进行测序(ABI3500DX,美国),应用SeqMan软件对测
序结果与标准序列进行比对分析。②长距离-PCR(LD-
P060探针在例1上检测到
SMN1基因E7-8del纯合突变,其父母均为杂合突变
P079探针在例7上检测到OTC基因杂合突变携带者。
其母亲为7-9外显子的杂合性缺失突变Exon7-9Del,
携带者,例7和其母亲均检测到杂合突变,但母亲未
患病。见表1。
7例疑似UCD患儿得到了明确分通过分子检测,
PCR)。使用LongPCR试剂盒(北京普洛麦格生物技术有限公
司)进行PCR扩增,对扩增产物进行电泳来检测SLC25A13基因
IVS16ins3kb位点突变情况。③多重连接探针扩增(multiplex
技术分析。对MLPA)ligation-dependentprobeamplification,
(MRC-Holland)进行检1例OTC缺乏的患儿通过MLPAP079探针
4例为NICCD1例为瓜氨酸血症Ⅰ型型:(57%),
14.3%)2例为鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏,(CTLN1,
OTCD,症(ornithinecarbamoyltransferasedeficiency,
28.7%),见表1。
本研究共发现3个UCD相关致病基因:
SLC25A13、ASS1和OTC,发现相应的9个等位基因突
1例新生儿肝内胆汁淤积症测;(neonatalintrahepaticcholestasis
causedbycitrindeficiency,NICCD)疑似合并脊髓性肌萎缩症
SMA)先证者通过P060探针(MRC-(spinalmuscularatrophy,
表1
序号性别
1
2
3
4
5
6
7
7例UCD患者的临床表型及基因检测结果
基因
SLC25A13
SMN1
SLC25A13
临床表型
基因型(父/母)
父源性
-
E7-8del
c.1364G>T
母源性
IVS16ins3kb
E7-8del
c.1660_1661ins16bp
IVS16ins3kb
IVS16ins3kb
c.787G>A
-
Exon7-9Del
新发性
c.1737G>A
-
-
-
-
-
c.958C>T
-
疾病名称
NICCD合并SMA
NICCD
NICCD
NICCD
CTLN1
OTCD
OTCD
遗传模式
AR
AR
AR
AR
AR
AR
XL
XL
女颈部柔软,无抵抗,皮肤巩膜黄染,高胆红素血症
男胆汁淤积,黄疸,肉碱代谢异常,瓜氨酸代谢异常
女皮肤黄染,高胆红素血症,瓜氨酸指标异常
男胆汁淤积性肝病,血液蛋白不足,低纤维蛋白原血症
男高氨血症,新生儿惊厥,呼吸暂停
男新生儿惊厥,代谢性酸中毒,高氨酸血症
女高氨血症,尿素循环障碍,呼吸衰竭
SLC25A13c.1638_1660dup23
SLC25A13c.1638_1660dup23
ASS1
OTC
OTC
c.1088G>A
-
-
AR为常染色体隐性遗传,XL为X染色体连锁遗传。注:
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
··
187
变,包括3种错义突变、2种移码突变、1种无义突变、1
种插入突变,1种缺失突变。其中突变频率最高的是
SLC25A13基因IVS16ins3kb等位基因突变,见表2。
表27例UCD患者家系主要基因突变类型及频率
基因名称碱基改变氨基酸改变突变类型频数
HGMDclinvar
(+/-)(+/-)
SLC25A13c.1737G>Ap.W579X无义突变1+-
IVS16ins3kb-插入突变3++
c.1638_1660dup23p.A554Gfs*17移码突变2++
c.1364G>Tp.R455L错义突变1+-
c.1660_1661ins16bpp.A554Gfs*17移码突变1-+
ASS1c.787G>Ap.V263M错义突变1++
c.1088G>Ap.R363Q错义突变1++
OTCc.958C>Tp.R320X无义突变1+-
Exon7-9Del-缺失突变1++
注:HGMD为人类基因突变数据库(),
clinvar网址/clinvar/。
2.2产前诊断结果分析例2和例6家系再次妊娠
时,在孕19周通过羊水穿刺进行了产前基因诊断:例
2家系胎儿检测到SLC25A13基因c.1364G>T父源致
病基因携带变异,见图1A和图1B(见后插一);例6家
系胎儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T
半合子突变,见图1C见后插一)。经遗传咨询后,告
知这两家系胎儿患病风险较低,这两家系均选择了
继续妊娠,胎儿随访至生后1个月,足跟血串联质谱
检查未见异常,发育良好。
3讨论
3.1基因检测可对UCD患儿进行精确分型UCD
是一组遗传代谢病,患儿的体征、临床表现未见特异
性,难以进行鉴别诊断。因此对相关致病基因进行
基因诊断尤为重要。本研究通过对7例疑似UCD患儿
进行基因诊断后,发现5例瓜氨酸血症(4例NICCD及
1例CTLN1)和2例OTCD。其中病例1较罕见,除
SLC25A13基因复合杂合突变外还伴有SMN1基因外
显子7和8纯合缺失,该患儿共患NICCD及SMA。
3.2UCD致病基因的异质性瓜氨酸血症是一组
通常表现为神经精神症状及血清中瓜氨酸和氨浓
度升高的UCD,通常分为Ⅱ型(NICCD)和Ⅰ型
CTLN1),分别为SLC25A13和ASS1双等位基因变异
导致的常染色体隐性遗传病
[3]
。
瓜氨酸血症Ⅱ型(NICCD)由SLC25A13基因突
变所致。其发病率具有地域性差异,在我国南方约
1/9200,北方约1/3500000,我国呈南高北低趋势。
同时,NICCD致病基因的携带率及突变类型亦有差
异:SLC25A13基因杂合子携带率在日本、韩国人群
中分别为1/69、1/50
[4]
,中国人群中为1/63;已报道的
SLC25A13基因致病突变类型超过90种,而中国人
群中c.851_854delGTAT、c.1638-1660dup23、c.615+
5G>A、IVS16ins3kb和c.1399C>T等5个突变约占
85.40%的突变等位基因,构成中国人普遍存在的
SLC25A13突变
[5]
。本研究共检测出4例NICCD患儿,
发现5种SLC25A13等位基因变异(IVS16ins3kb、
c.1638-1660dup23、c.1364G>T、c.1737G>A和c.1660_
1661ins23),其中IVS16ins3kb和c.1638-1660dup23
与研究报道其在中国人群高发
[4]
相符。此外,上述变
异存在地域差异,如:IVS16ins3kb作为一种转座后
插入突变,在日本较为常见
[6]
,在中国北方人群高于
南方;
c.1364G>T
在中国北方较为常见;而
c.1638-
1660dup23的相对频率在中国不同区域则相对一
致
[7]
。本研究4例NICCD患儿中,有3例均有SLC25A13
基因IVS16ins3kb杂合突变(3/4),与在中国北方较为
常见的趋势一致。
瓜氨酸血症Ⅰ型(CTLN1)是由于ASS基因突变
所致,是UCD中第三大类型,发病率约为1/200000~
1/44300
[3]
。其致病基因ASS1基因突变频率具有一
定的地域性分布差异,且不同基因与临床表型严
重程度有关。本研究共发现2个ASS1等位基因错义
突变,分别为c.787G>A(p.Val263Met)和c.1088G>A
(p.Arg363Trp)。有研究报道ASS1基因携带亦存在地
域性差异:363Trp在德国(包括德国人和居住
在德国的土耳其人)患者中的携带率为13.5%;而
263Met在土耳其患者中携带率为7.9%
[8]
。本研
究中因ASS1等位基因变异较少,突变频率是否存在
地区性差异有待后续进一步分析。同时,有研究报
道263Met等位基因复合杂合或纯合突变情况
下多表现为迟发和(或)轻度瓜氨酸血症
[9]
。本研究
中患者目前仅主要表现为血清瓜氨酸指标等异常增
高;未见其他显著临床表现,临床表型与这一等位基
因复合杂合变异表型相符,故而,对于这种轻型或迟
发型CTLN1,基因诊断显得更加重要,及时应用基因
诊断明确变异类型,高度重视予以积极治疗及预防,
可有效避免突发异常的出现。
OTCD由OTC基因突变引起,是UCD中最常见的
亚型,平均发病率为7.1/100000,属于X连锁不完全
显性或X连锁隐性遗传代谢病;OTCD的临床表现主
要与酶的残余活性相关。目前OTC基因已报道超过
400种基因突变类型
[10]
。本研究共发现2个OTC等位
(
··
188
国际生殖健康/计划生育杂志2021年5月第40卷第3期JIntReprodHealthamPlan,May2021ol.40o.3
蛐
F
熏
V
熏
N
基因分别为c.958C>T和外显子7-10缺失;其中无义
突变c.958C>T(p.R320X)为一男性半合子突变患儿,
该男性患者病情较重,主要是由于OTC基因携带在X
染色体上,这一酶的活性在男孩体内完全失活,导致
急性氨中毒,该临床表型与XL基因变异遗传模式相
符;而另一等位基因变异外显子7-10缺失,为一女
性杂合子突变患儿。通常女性杂合子突变,临床表
现高度多样,约15%患者发病;多数杂合子携带者
不出现高氨血症
[11]
。由于实验条件限制,本研究没有
做X染色体随机失活检测,但笔者推测例7正常的那
条X染色体发生了非随机失活,从而导致了疾病的
发生
[12-13]
。
3.3产前基因诊断可避免患儿出生本研究为2个
再生育家系提供产前基因诊断:例2家系胎儿检测到
SLC25A13
基因
c.1364G>T
父源携带突变;例
6
家系胎
儿未检测到与先证者相同的OTC基因c.958C>T半合
子突变。2个家庭均选择了继续妊娠,出生后随访至
1个月,生化指标及发育状况均正常。
综上,笔者对7例疑似UCD患儿进行了基因分
析,明确了其治病原因,并对两患者家系再生育时进
行了产前诊断。通过高通量测序技术对患者进行基
因分型后可及早给予干预治疗,可为遗传咨询及产
前诊断提供可靠依据
[14-16]
;进而在致病基因明确的
前提下,通过产前诊断或胚胎植入前单基因病检测
PGT-M)有效预防出生缺陷。
参考文献
[1]赵静.迟发型鸟氨酸氨甲酰转移酶缺乏症11例临床特点及基因
分析[D].重庆:重庆医科大学,2019.
[2]H覿berleJ,BurlinaA,ChakrapaniA,tedguidelinesfor
thediagnosisandmanagementofureacycledisorders:First
revision[J].JInheritMetabDis,2019,42(6)::
10.1002/jimd.12100.
[3]WooHI,ParkHD,largeneticsofcitrullinemia
typesIandII[J].ClinChimActa,2014,431::10.1016/j.
cca.2014.01.032.
[4]KobayashiK,BangLuY,XianLiM,ingofnine
SLC25A13mutations:theirfrequencyinpatientswithcitrin
deficiencyandhighcarrierratesinAsianpopulations[J].MolGenet
Metab,2003,80(3)::10.1016/S1096-7192(03)
00140-9.
[5]ZhangZH,YangZG,ChenFP,ingforfiveprevalent
mutationsofSLC25A13geneinGuangdong,China:amolecular
epidemiologicsurveyofcitrindeficiency[J].TohokuJExpMed,
2014,233(4)::10.1620/tjem.233.275.
[6]TabataA,ShengJS,UshikaiM,ficationof13novel
mutationsincludingaretrotransposalinsertioninSLC25A13gene
andfrequencyof30mutationsfoundinpatientswithcitrin
deficiency[J].JHumGenet,2008,53(6)::10.1007/
s10038-008-0282-2.
[7]LinWX,ZengHS,ZhangZH,lardiagnosisof
pediatricpatientswithcitrindeficiencyinChina:SLC25A13
mutationspectrumandthegeographicdistribution[J].SciRep,
2016,6::10.1038/srep29732.
[8]Diez-FernandezC,RüfenachtV,H覿onsinthe
HumanArgininosuccinateSynthetase(ASS1)Gene,Impacton
Patients,CommonChanges,andStructuralConsiderations[J].Hum
Mutat,2017,38(5)::10.1002/humu.23184.
[9]Marquis-NicholsonR,GlamuzinaE,ProsserD,linemia
typeI:molecularscreeningoftheASS1genebyexonicsequencing
andtargetedmutationanalysis[J].GenetMolRes,2010,9(3):
:10.4238/vol9-3gmr834.
[10]ChoiJH,LeeBH,KimJH,aloutcomesandthe
mutationspectrumoftheOTCgeneinpatientswithornithine
transcarbamylasedeficiency[J].JHumGenet,2015,60(9):501-
:10.1038/jhg.2015.54.
[11]ShaoY,JiangM,LinY,alandmutationanalysisof24
Chinesepatientswithornithinetranscarbamylasedeficiency[J].
ClinGenet,2017,92(3)::10.1111/cge.13004.
[12]MusalkovaD,SticovaE,RebounM,leX-chromosome
inactivationandenlargementofpericentralglutaminesynthetase
zonesintheliverofheterozygousfemaleswithOTCdeficiency[J].
VirchowsArch,2018,472(6)::10.1007/s00428-
018-2345-x.
[13]SloasHA3rd,EnceTC,MendezDR,ntersectionof
toxicology,psychiatry,andgenetics:adiagnosisofornithine
transcarbamylasedeficiency[J].AmJEmergMed,2013,31(9):
:10.1016/.2013.05.010.
[14]潘蕾,何志明,张锐.高通量测序技术在先天性脑积水基因诊断
中的应用[J].国际生殖健康/计划生育杂志,2019,38(6):450-
:10.3969/.1674-1889.2019.06.002.
[15]LiS,CaiY,ShiC,tationAnalysisandPrenatal
DiagnosisoftheOrnithineTranscarbamylase(OTC)GeneinTwo
FamilieswithOrnithineTranscarbamylaseDeficiency[J].MedSci
Monit,2018,24::10.12659/MSM.911295.
[16]Bijarnia-MahayS,H覿berleJ,JalanAB,cledisorders
inIndia:clinicalcourse,biochemicalandgeneticinvestigations,
andprenataltesting[J].OrphanetJRareDis,2018,13(1):174.
doi:10.1186/s13023-018-0908-1.
(收稿日期:2020-09-16)
[本文编辑王琳]
(
·后插一·
石家庄地区新生儿Citrin蛋白缺乏症串联质谱筛查结果分析
(正文见第182页
)
AB
注:A为c.1021+1G>A;B为c.851_854delTATG。
图1例1患儿的SLC25A13基因突变检测结果
尿素循环障碍患者家系的基因突变分析及产前诊断
(正文见第185页
)
先证者
父亲
母亲
胎儿
A例2家系SLC25A13基因变异c.1364G>TB例2家系SLC25A13基因变异c.1660_1661ins
图1产前诊断测序图
C例6家系OTC基因变异c.958C>T
胎儿埃布斯坦畸形一例
(正文见第196页
)
图1三尖瓣发育畸形图2三尖瓣返流