2024年4月26日发(作者：贺梦秋)
碱基符号
生物信息学中常用的18个碱基字母
字母
碱基
单碱基
A
A
C
C
G
G
I
I
T
T
U
U
二碱基
K
G/T
M
A/C
R
A/G
S
G/C
W
A/T
Y
C/T
三碱基
B
C/G/T
D
A/G/T
H
A/C/T
V
A/C/G
四碱基
N
A/C/G/T
X
A/C/G/T
全称
Adenine
Cytosine
Guanine
Isosine
Thymine
Uracil
Keto
aMino
puRine
Strong pair
Weak pair
pYrimidine
Not A
Not C
Not G
Not U (or T)
Any
Unknown
说明
腺嘌呤
胞嘧啶
鸟嘌呤
次黄嘌呤
胸腺嘧啶
尿嘧啶
含酮基
含氨基
嘌呤
强配对
弱配对
嘧啶
非A
非C
非G
非U(T)
任一碱基
未知碱基
氨基酸
A
C
D
名称
丙氨酸
Name
'alanine
简写
Ala
Cys
Asp
密码子
GCX
TGM
AAM
分子量
121.15
132.12
残基
103.14
114.11
A
108.5
117.7
3
A
135
160
2
ml/g
丰度
748
631
619
pI pKa
亲水 疏水 侧链
-CH
2
SH
-CH
2
CONH
2
89.09 71.08 88.6 115 7.55 6.0
1.69 5.0 9.3
4.52 5.4
0.45 0.5 -CH
3
3.63 -2.8
13.31 -7.4
半胱氨酸 cy'stine
天冬氨酸 'asparic acid
1
E
F
H
I
K
L
N
P
R
S
T
V
Y
谷氨酸 glu'tamic acid
'glycine
'histidine
'lysine
'luecine
me'thionine
'proline
'arginine
'serine
'threonine
'valine
'tryptophan
'tyrosine
Glu
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln
Arg
Ser
Thr
Val
Trp
Tyr
GAP
TTM
GGX
CAM
ATM,ATA
AAP
CTX,TTP
ATG
GAM
CCX
CAP
147.13
165.19
155.16
131.17
146.19
131.17
149.21
133.10
115.13
146.15
129.12
147.18
137.15
113.17
128.18
113.17
131.21
115.09
128.14
156.20
101.11
186.21
163.18
138.4
189.9
153.2
166.7
168.6
166.7
162.9
111.1
143.9
173.4
116.1
227.8
193.6
190
210
195
175
200
170
185
150
145
180
225
140
155
255
230
643
774
670
884
789
885
745
579
758
674
666
613
689
847
734
712
6.32 12.58
0
12.62
11.91
-9.9
0
-CH
2
CH
2
COO
CH
2
(C
6
H
5
)
-H
+
-
苯丙氨酸 pheny'lalanine Phe
组氨酸
赖氨酸
亮氨酸
4.07 5.5
6.84 6.0
2.24
5.72
5.93
6.2
3.15 2.5
G 甘氨酸 75.07 57.06 60.1 75 632
0.5 -CH
2
(C
3
N
2
H
4
)
-4.2 -(CH
2
)
4
NH
3
-CH
2
CH(CH
3
)
2
-(CH
2
)
2
SCH
3
-CH
2
COO
-(CH
2
)
3
-
-CH
2
CH
2
CONH
2
+
-
+
异亮氨酸 iso'luecine 0.24 2.5 -CH(CH
3
)CH
2
CH
3
0.11 1.8
12.07
11.77
22.31
-0.2
-3.3
-0.3
9.33 6.0
5.30 4.5
M 蛋氨酸
脯氨酸
精氨酸
丝氨酸
苏氨酸
缬氨酸
酪氨酸
2.35 5.8 10.4 3.87 1.3
4.92 6.3
4.02 5.7 4.6
5.15 ~12
7.22 5.7
5.74 6.5
6.52 6.0
1.25
3.19
9.7
天冬酰胺 a'sparagine
97.12 122.7
Q 谷氨酰胺 'glutamine
CGX,AGP 174.20
TCX,AGM 105.09
ACX
GTX
TGG
TAM
119.12
117.15
204.23
181.19
-11.2 -(CH
2
)
3
CH(NH
2
)NH
2
-CH
2
OH
-CH(OH)CH
3
CH(CH
3
)
2
-CH
2
(C
8
N
1
H
6
)
CH
2
(C
6
H
4
)OH
87.08 89.0 115
99.14 140.0
7.45 -0.3
7.27 0.4
0.40 1.5
8.28 3.4
8.50 2.3
W 色氨酸
注：密码子说明见碱基符号；A
3
和A
2
分别是埃为单位的体积和面积；ml/g为溶解1g所需水量；丰度为SwissProt蛋白质数据库中的氨基酸丰度。张闻制作2009.6
2
2024年4月26日发(作者：贺梦秋)
碱基符号
生物信息学中常用的18个碱基字母
字母
碱基
单碱基
A
A
C
C
G
G
I
I
T
T
U
U
二碱基
K
G/T
M
A/C
R
A/G
S
G/C
W
A/T
Y
C/T
三碱基
B
C/G/T
D
A/G/T
H
A/C/T
V
A/C/G
四碱基
N
A/C/G/T
X
A/C/G/T
全称
Adenine
Cytosine
Guanine
Isosine
Thymine
Uracil
Keto
aMino
puRine
Strong pair
Weak pair
pYrimidine
Not A
Not C
Not G
Not U (or T)
Any
Unknown
说明
腺嘌呤
胞嘧啶
鸟嘌呤
次黄嘌呤
胸腺嘧啶
尿嘧啶
含酮基
含氨基
嘌呤
强配对
弱配对
嘧啶
非A
非C
非G
非U(T)
任一碱基
未知碱基
氨基酸
A
C
D
名称
丙氨酸
Name
'alanine
简写
Ala
Cys
Asp
密码子
GCX
TGM
AAM
分子量
121.15
132.12
残基
103.14
114.11
A
108.5
117.7
3
A
135
160
2
ml/g
丰度
748
631
619
pI pKa
亲水 疏水 侧链
-CH
2
SH
-CH
2
CONH
2
89.09 71.08 88.6 115 7.55 6.0
1.69 5.0 9.3
4.52 5.4
0.45 0.5 -CH
3
3.63 -2.8
13.31 -7.4
半胱氨酸 cy'stine
天冬氨酸 'asparic acid
1
E
F
H
I
K
L
N
P
R
S
T
V
Y
谷氨酸 glu'tamic acid
'glycine
'histidine
'lysine
'luecine
me'thionine
'proline
'arginine
'serine
'threonine
'valine
'tryptophan
'tyrosine
Glu
Gly
His
Ile
Lys
Leu
Met
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Pro
Gln
Arg
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TTM
GGX
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AAP
CTX,TTP
ATG
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CCX
CAP
147.13
165.19
155.16
131.17
146.19
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137.15
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128.18
113.17
131.21
115.09
128.14
156.20
101.11
186.21
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168.6
166.7
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111.1
143.9
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227.8
193.6
190
210
195
175
200
170
185
150
145
180
225
140
155
255
230
643
774
670
884
789
885
745
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758
674
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613
689
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6.32 12.58
0
12.62
11.91
-9.9
0
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2
CH
2
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-H
+
-
苯丙氨酸 pheny'lalanine Phe
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赖氨酸
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4.07 5.5
6.84 6.0
2.24
5.72
5.93
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3.15 2.5
G 甘氨酸 75.07 57.06 60.1 75 632
0.5 -CH
2
(C
3
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2
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4
)
-4.2 -(CH
2
)
4
NH
3
-CH
2
CH(CH
3
)
2
-(CH
2
)
2
SCH
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2
COO
-(CH
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-CH
2
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CONH
2
+
-
+
异亮氨酸 iso'luecine 0.24 2.5 -CH(CH
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)CH
2
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3
0.11 1.8
12.07
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M 蛋氨酸
脯氨酸
精氨酸
丝氨酸
苏氨酸
缬氨酸
酪氨酸
2.35 5.8 10.4 3.87 1.3
4.92 6.3
4.02 5.7 4.6
5.15 ~12
7.22 5.7
5.74 6.5
6.52 6.0
1.25
3.19
9.7
天冬酰胺 a'sparagine
97.12 122.7
Q 谷氨酰胺 'glutamine
CGX,AGP 174.20
TCX,AGM 105.09
ACX
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TGG
TAM
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117.15
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181.19
-11.2 -(CH
2
)
3
CH(NH
2
)NH
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CH(CH
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注：密码子说明见碱基符号；A
3
和A
2
分别是埃为单位的体积和面积；ml/g为溶解1g所需水量；丰度为SwissProt蛋白质数据库中的氨基酸丰度。张闻制作2009.6
2