2024年5月24日发(作者:石双)
ABI7500荧光定量PCR仪标准操作规程
1. 目的
为规范使用人正确和正常的使用ABI 7500型核酸扩增荧光定量检测仪,保证扩增及结果分
析的标准化、规范化,特制定本规程。
2. 适用范围
适用于本公司ABI7500荧光定量PCR仪的操作。
3. 职责
3.1 使用人员负责本规程的实施。
3.2 设备使用人负责设备维护保养工作;设备责任人负责设备的定期维护保养工作。
3.3 质量监督员负责监督本规程的实施。
4. 内容
4.1 程序设置
4.1.1 打开电脑及仪器电源,待仪器电源项显示power绿色状态。
4.1.2 双击电脑桌面上的7500 software V2.3 图标打开程序,打开程序单击OK,待软件连接仪
器并测试校准状态后(若有出现连接失败可尝试重启电脑,检查USB线接口),出现如下界面,
单击Design Wizard选项,红色箭头指示位置有个下拉菜单,如下图所示。
下拉菜单中有一个Advanced Setup(高级设置)选项,如箭头所示:
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点击这个选项,可以进入下面这个界面,
①
②
③
如上图所示,红色箭头从上到下指示的分别是①实验名称、②仪器型号和③反应程序类型。
(带*号 的必需填)
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①
②
③
此图是上面图的延续(自己电脑显示不完全),红色箭头从上到下指示的分别是①Plate
Setup选项、②探针类型和③程序应用速度类型,一般使用的探针就是TaqMan探针,速度类
型选择默认就可以了(如果是7500fast的话则有快速模式可以选择)。下一步我们可以看到左
上角的红色箭头指示的一个Plate Setup选项,点击这个选项,就可以进入下一个设置界面。
① ②
③ ④ ⑤ ⑥ ⑦ ⑧ ⑨ ⑩
红色箭头①和②指的是设定反应探针和反应样品名称,箭头③处可以填写反应探针名称
(如P1,HBV,HCV)。箭头⑤是选择报告荧光,一般使用的发光基团是FAM,箭头⑥是选择粹
灭荧光,达安现在使用的是TAMRA荧光,科华现在使用的是BHQ,在这个仪器中无此选择
项,那么就选择none。箭头⑧处可以填写样品名称。点击箭头④和箭头⑨处可以添加反应探
针体系名称和样品名称。箭头⑦和箭头⑩是选择对应探针体系和对应样品的曲线颜色,可选择
也可以不选。(另:探针跟样品设定后可保存,方便以后实验调用,具体是点击箭头①②下面
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的Saved Taeget,下次调用则点击 Add Saved就可调出。)
为了方便讲解,我假定有1个反应探针DAAN和1个样本HBV1,如上图所示。设定完
成之后,我们点击红色箭头所指的选项,进入下个界面。
在上图,我们可以看到一个类似反应板的界面,黑色箭头①指示的有玫瑰红色下划线那一
排在选定反应孔后会显示出样本孔总数,标准品总数和阴性对照总数。从黑色箭头②可以看出
暂时还有48个反应孔空余。蓝色箭头①和②分别是放大这个孔板界面的按钮,蓝色箭头③是
显示大小还原默认设置按钮。
开始设置时,首先我们如红色箭头①所示选定A1孔,红色箭头②指示的是反应探针名称,
红色箭头③指示的样品类型,选定反应体系后可以在U——未知样本,S——标准样本,N——
阴性样本中选择一个。红色箭头⑤是个下拉菜单可以选择反应探针,在红色箭头④指示的框里
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单击鼠标,显示打钩就说明选定了反应体系。红色箭头⑥指示的是样品名称,红色箭头⑧是个
下拉菜单可以选择样品名称。在红色箭头⑦指示的框里单击鼠标,显示打钩就说明选定了样品
名称。红色箭头⑨指示的参比荧光,仪器默认是ROX,但是产品一般没有添加ROX荧光,所
以必须选择None。红色箭头⑩指示的定量标准品的设置,可根据标准曲线的值从4567升序或
是从7654降序的排列,单击可弹出以下界面,具体如下。
①
②
③
④
⑤
上图中,红色箭头①表示标准品的数量,②表示标准品是否走重复孔,③表示起始的浓度,
④表示10×的话则为升序,按照4567的浓度;1:10的话则为降序,按照7654的浓度。
例如:做了4个标准品,每个标准品做1个(即没有做复孔),起始浓度为10000,选择
10×,选择箭头⑤的自己选择孔位,点击左下角的Apply,则在第10排按照4567次方的顺序
排列。
此外也可以选择鼠标双击类似反应孔板的那个界面,会出现下面这个界面:
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⑤
② ①
③
④
如上图所示,选定反应孔双击后会出现这样一个界面,红色箭头①指示的Task—样品反
应类型,红色箭头②是指示的是Target—反应探针,红色箭头③指示的是Sample—样品名称。
这三个都是下拉菜单,可以选择前面设置好的反应体系和 样品名称。红色箭头④是个文本框,
可以备注样本的详细信息。按照样本放置的实际情况设置好之后,可以点击红色箭头⑤指示的
Run Method选项进入下个界面。
①
⑦
②③ ④
⑤⑥
上图的箭头①是设定反应体系体积的,箭头②是添加反应程序阶段的,箭头③是添加反应
程序步骤的,箭头⑤和⑥是制订收集荧光信号的标志,例如箭头⑥所示高亮显示时表示在此步
骤收集荧光信号。(切记,收集荧光只能1个地方,若是出现2个收集荧光信号的,则软件上
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会有出现蓝色的错误提示)
设定好循环条件,就可以进行模板保存,以便下次实验时调用程序,点击位于软件中间最
右方的键(注:这个键是由于本人电脑不是宽屏的(14寸acer。。。),如果是AB配的E6500
电脑则可以在软件上全部显示,不会出现键或是那些滑动条,但是。。字体会小点,,),
选择保存运行的模板,命名。下次实验使用的时候就不用再在设条件,直接点击open run
method,调出你所需要做的实验的扩增条件。
还有上图左方的reaction setup(反应体系设置)和materials list(耗材清单)不需要我们
去设置。
点击箭头⑦所指的run进入运行界面。
①
②
③
④
⑤
直接点击上图中的绿色START按钮,根据提示保存实验文件后开始实验,实验开始后在
绿色START按钮右方可出现实验的预计剩余时间。
箭头②表示的是实时的曲线图谱,③表示的是实时的温度曲线图谱,④表示的是实验的条
件。实验结束后按箭头⑤所指的分析,出现以下界面。
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⑧
①
②
③
④
⑤
⑥
⑦
做完实验后,曲线会出现在上图,以对数图谱的形式出现,若想换为线性图谱,可点击箭
头①所指示的去选择log或linear,其次,再点击箭头⑧的分析按钮(有实验数据的话会出现
的是analysis),样本的结果跟CT会在右边的96孔面板中出现,上面的显示不完全,曲线的
基线baseline跟阈值threshold设置是在上图数字⑦下面的那个地方(不是箭头⑦所指的地方),
进行设置。
箭头③表示的是实验标准曲线的参数。
箭头④⑤表示的是每个孔的原始光谱图。
箭头⑥表示的是一些附加的报警信息,例如重复孔偏差了,荧光偏差了,质控失控了。
箭头⑦表示的是上面4中图谱的集合,可自己选择组合查看。
4.1.3 实验结束后填写《设备使用记录》
4.2 结果分析
4.2.1 在analysis setup里面修改各个探针的baseline与threshold数值,点击绿色analyze图标,
软件及完成自动分析。
4.2.2 在amplification plot界面查看所有样品的扩增曲线。
4.2.3 整体曲线的观察,将所有曲线选中进行整体观察。
4.2.3.1 观察是否存在污染情况(包括标本污染和试剂污染),特别应注意大量曲线在同一 Ct
值出现上涨的情况。
4.2.3.2 观察是否有光路传导阻滞或电压波动等机器原因形成的异常曲线。
4.2.4 对照、质控品、标准品的分析
4.2.4.1 阴性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阴性标本。
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作用:用以监测实验室和前处理过程中是否存在污染。
4.2.4.2 阳性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阳性标本。
作用:用以监测实验能否正常检出阳性标本,避免假阴性的出现。
4.2.4.3 阳性室内质控品的分析:阳性室内质控品:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已
知或未知浓度的阳性室内质控血清。
作用:用以监控日常实验的精密度。
4.2.4.4 阳性标准品的分析:各梯度曲线的分布是否均匀,若各梯度曲线均未分开,则表明阳
性标准品稀释可能存在问题,提示实验中存在较大人为误差。
4.2.4.5 观察各曲线的 Ct 值是否在平日的正常位置:
若出现低拷贝标准品做不出,而各曲线 Ct 值均后移,则判断是否为试剂扩增效率下降(如
试剂过期或保存条件不合格)。
出现低拷贝标准品做不出,而高拷贝曲线 Ct 值均正常,则提示可能存在低拷贝阳性标准
品的降解情况。
若高拷贝标准品出现 Ct 值后移,且能排除上述情况,则判断是否为试剂灵敏度下降。
得出定量结果:调节基线和阈值以得到一较好的标准曲线。电脑据此曲线给出实验结果值。
4.3 仪器维护
4.3.1 注意开机关机顺序,机器开机后即可使用,无需预热。
4.3.2 电脑上使用专用U盘等移动存储设备,建议使用光盘刻录来转移数据。
4.3.3 针对电脑硬盘,进行周期性碎片整理,并将试验数据备份到其他存储设备上(比如光盘)
4.3.4 仪器表面与电脑表面应每月用软布擦拭(无需用水,禁用有机溶剂,会溶解机器表面的
漆层)。
4.3.5 灯泡更换:在灯泡使用达到寿命后(2000小时),或者意外损坏后需要更换。机器关闭
电脑30分钟后,打开前面上半册面板,取出旧灯泡,在操作过程中需要戴无尘手套操作,注
意灯泡高温。然后将新灯泡,用气吹吹掉表面的灰尘,安装灯泡。
4.3.6 样品孔清洁:样品孔污染后会影响PCR扩增的信号,是的该孔信号高于其他孔,造成假
阳性的结果,需要每月执行background校正,针对信号值超过72000的孔,使用棉签与去离
子水进行清洁。清洁时关闭机器电源,打开前面上半面板,将热盖板(黑色面板)推到后面,
清洁相应的孔,然后恢复原状,重新执行background校正,直到所有的信号值均低于72000。
4.3.7 按照仪器出厂说明书每6个月对仪器进行纯荧光校正和ROI校正。
4.3.8 仪器在搬运后需要进行背景校正、纯荧光校正和ROI校正,所有校正通过后才能进行实
验。
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4.4 维修
如出现故障,按照《设备管理制度》实施。
5. 支持文件
5.1 《设备管理制度》
6. 相关记录
6.1 《设备使用记录》
6.2 《设备维护保养计划清单》
7. 文件修改记录
序号 修改条款
1
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3
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5
修改方式
(补充或删减)
修改原因
修改前内容
修改人/日期 批准人/日期
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1. 目的
为规范使用人正确和正常的使用ABI 7500型核酸扩增荧光定量检测仪,保证扩增及结果分
析的标准化、规范化,特制定本规程。
2. 适用范围
适用于本公司ABI7500荧光定量PCR仪的操作。
3. 职责
3.1 使用人员负责本规程的实施。
3.2 设备使用人负责设备维护保养工作;设备责任人负责设备的定期维护保养工作。
3.3 质量监督员负责监督本规程的实施。
4. 内容
4.1 程序设置
4.1.1 打开电脑及仪器电源,待仪器电源项显示power绿色状态。
4.1.2 双击电脑桌面上的7500 software V2.3 图标打开程序,打开程序单击OK,待软件连接仪
器并测试校准状态后(若有出现连接失败可尝试重启电脑,检查USB线接口),出现如下界面,
单击Design Wizard选项,红色箭头指示位置有个下拉菜单,如下图所示。
下拉菜单中有一个Advanced Setup(高级设置)选项,如箭头所示:
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点击这个选项,可以进入下面这个界面,
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②
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如上图所示,红色箭头从上到下指示的分别是①实验名称、②仪器型号和③反应程序类型。
(带*号 的必需填)
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①
②
③
此图是上面图的延续(自己电脑显示不完全),红色箭头从上到下指示的分别是①Plate
Setup选项、②探针类型和③程序应用速度类型,一般使用的探针就是TaqMan探针,速度类
型选择默认就可以了(如果是7500fast的话则有快速模式可以选择)。下一步我们可以看到左
上角的红色箭头指示的一个Plate Setup选项,点击这个选项,就可以进入下一个设置界面。
① ②
③ ④ ⑤ ⑥ ⑦ ⑧ ⑨ ⑩
红色箭头①和②指的是设定反应探针和反应样品名称,箭头③处可以填写反应探针名称
(如P1,HBV,HCV)。箭头⑤是选择报告荧光,一般使用的发光基团是FAM,箭头⑥是选择粹
灭荧光,达安现在使用的是TAMRA荧光,科华现在使用的是BHQ,在这个仪器中无此选择
项,那么就选择none。箭头⑧处可以填写样品名称。点击箭头④和箭头⑨处可以添加反应探
针体系名称和样品名称。箭头⑦和箭头⑩是选择对应探针体系和对应样品的曲线颜色,可选择
也可以不选。(另:探针跟样品设定后可保存,方便以后实验调用,具体是点击箭头①②下面
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的Saved Taeget,下次调用则点击 Add Saved就可调出。)
为了方便讲解,我假定有1个反应探针DAAN和1个样本HBV1,如上图所示。设定完
成之后,我们点击红色箭头所指的选项,进入下个界面。
在上图,我们可以看到一个类似反应板的界面,黑色箭头①指示的有玫瑰红色下划线那一
排在选定反应孔后会显示出样本孔总数,标准品总数和阴性对照总数。从黑色箭头②可以看出
暂时还有48个反应孔空余。蓝色箭头①和②分别是放大这个孔板界面的按钮,蓝色箭头③是
显示大小还原默认设置按钮。
开始设置时,首先我们如红色箭头①所示选定A1孔,红色箭头②指示的是反应探针名称,
红色箭头③指示的样品类型,选定反应体系后可以在U——未知样本,S——标准样本,N——
阴性样本中选择一个。红色箭头⑤是个下拉菜单可以选择反应探针,在红色箭头④指示的框里
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单击鼠标,显示打钩就说明选定了反应体系。红色箭头⑥指示的是样品名称,红色箭头⑧是个
下拉菜单可以选择样品名称。在红色箭头⑦指示的框里单击鼠标,显示打钩就说明选定了样品
名称。红色箭头⑨指示的参比荧光,仪器默认是ROX,但是产品一般没有添加ROX荧光,所
以必须选择None。红色箭头⑩指示的定量标准品的设置,可根据标准曲线的值从4567升序或
是从7654降序的排列,单击可弹出以下界面,具体如下。
①
②
③
④
⑤
上图中,红色箭头①表示标准品的数量,②表示标准品是否走重复孔,③表示起始的浓度,
④表示10×的话则为升序,按照4567的浓度;1:10的话则为降序,按照7654的浓度。
例如:做了4个标准品,每个标准品做1个(即没有做复孔),起始浓度为10000,选择
10×,选择箭头⑤的自己选择孔位,点击左下角的Apply,则在第10排按照4567次方的顺序
排列。
此外也可以选择鼠标双击类似反应孔板的那个界面,会出现下面这个界面:
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⑤
② ①
③
④
如上图所示,选定反应孔双击后会出现这样一个界面,红色箭头①指示的Task—样品反
应类型,红色箭头②是指示的是Target—反应探针,红色箭头③指示的是Sample—样品名称。
这三个都是下拉菜单,可以选择前面设置好的反应体系和 样品名称。红色箭头④是个文本框,
可以备注样本的详细信息。按照样本放置的实际情况设置好之后,可以点击红色箭头⑤指示的
Run Method选项进入下个界面。
①
⑦
②③ ④
⑤⑥
上图的箭头①是设定反应体系体积的,箭头②是添加反应程序阶段的,箭头③是添加反应
程序步骤的,箭头⑤和⑥是制订收集荧光信号的标志,例如箭头⑥所示高亮显示时表示在此步
骤收集荧光信号。(切记,收集荧光只能1个地方,若是出现2个收集荧光信号的,则软件上
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会有出现蓝色的错误提示)
设定好循环条件,就可以进行模板保存,以便下次实验时调用程序,点击位于软件中间最
右方的键(注:这个键是由于本人电脑不是宽屏的(14寸acer。。。),如果是AB配的E6500
电脑则可以在软件上全部显示,不会出现键或是那些滑动条,但是。。字体会小点,,),
选择保存运行的模板,命名。下次实验使用的时候就不用再在设条件,直接点击open run
method,调出你所需要做的实验的扩增条件。
还有上图左方的reaction setup(反应体系设置)和materials list(耗材清单)不需要我们
去设置。
点击箭头⑦所指的run进入运行界面。
①
②
③
④
⑤
直接点击上图中的绿色START按钮,根据提示保存实验文件后开始实验,实验开始后在
绿色START按钮右方可出现实验的预计剩余时间。
箭头②表示的是实时的曲线图谱,③表示的是实时的温度曲线图谱,④表示的是实验的条
件。实验结束后按箭头⑤所指的分析,出现以下界面。
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①
②
③
④
⑤
⑥
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做完实验后,曲线会出现在上图,以对数图谱的形式出现,若想换为线性图谱,可点击箭
头①所指示的去选择log或linear,其次,再点击箭头⑧的分析按钮(有实验数据的话会出现
的是analysis),样本的结果跟CT会在右边的96孔面板中出现,上面的显示不完全,曲线的
基线baseline跟阈值threshold设置是在上图数字⑦下面的那个地方(不是箭头⑦所指的地方),
进行设置。
箭头③表示的是实验标准曲线的参数。
箭头④⑤表示的是每个孔的原始光谱图。
箭头⑥表示的是一些附加的报警信息,例如重复孔偏差了,荧光偏差了,质控失控了。
箭头⑦表示的是上面4中图谱的集合,可自己选择组合查看。
4.1.3 实验结束后填写《设备使用记录》
4.2 结果分析
4.2.1 在analysis setup里面修改各个探针的baseline与threshold数值,点击绿色analyze图标,
软件及完成自动分析。
4.2.2 在amplification plot界面查看所有样品的扩增曲线。
4.2.3 整体曲线的观察,将所有曲线选中进行整体观察。
4.2.3.1 观察是否存在污染情况(包括标本污染和试剂污染),特别应注意大量曲线在同一 Ct
值出现上涨的情况。
4.2.3.2 观察是否有光路传导阻滞或电压波动等机器原因形成的异常曲线。
4.2.4 对照、质控品、标准品的分析
4.2.4.1 阴性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阴性标本。
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作用:用以监测实验室和前处理过程中是否存在污染。
4.2.4.2 阳性对照:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已知阳性标本。
作用:用以监测实验能否正常检出阳性标本,避免假阴性的出现。
4.2.4.3 阳性室内质控品的分析:阳性室内质控品:试剂中加入与待检标本进行同样处理的已
知或未知浓度的阳性室内质控血清。
作用:用以监控日常实验的精密度。
4.2.4.4 阳性标准品的分析:各梯度曲线的分布是否均匀,若各梯度曲线均未分开,则表明阳
性标准品稀释可能存在问题,提示实验中存在较大人为误差。
4.2.4.5 观察各曲线的 Ct 值是否在平日的正常位置:
若出现低拷贝标准品做不出,而各曲线 Ct 值均后移,则判断是否为试剂扩增效率下降(如
试剂过期或保存条件不合格)。
出现低拷贝标准品做不出,而高拷贝曲线 Ct 值均正常,则提示可能存在低拷贝阳性标准
品的降解情况。
若高拷贝标准品出现 Ct 值后移,且能排除上述情况,则判断是否为试剂灵敏度下降。
得出定量结果:调节基线和阈值以得到一较好的标准曲线。电脑据此曲线给出实验结果值。
4.3 仪器维护
4.3.1 注意开机关机顺序,机器开机后即可使用,无需预热。
4.3.2 电脑上使用专用U盘等移动存储设备,建议使用光盘刻录来转移数据。
4.3.3 针对电脑硬盘,进行周期性碎片整理,并将试验数据备份到其他存储设备上(比如光盘)
4.3.4 仪器表面与电脑表面应每月用软布擦拭(无需用水,禁用有机溶剂,会溶解机器表面的
漆层)。
4.3.5 灯泡更换:在灯泡使用达到寿命后(2000小时),或者意外损坏后需要更换。机器关闭
电脑30分钟后,打开前面上半册面板,取出旧灯泡,在操作过程中需要戴无尘手套操作,注
意灯泡高温。然后将新灯泡,用气吹吹掉表面的灰尘,安装灯泡。
4.3.6 样品孔清洁:样品孔污染后会影响PCR扩增的信号,是的该孔信号高于其他孔,造成假
阳性的结果,需要每月执行background校正,针对信号值超过72000的孔,使用棉签与去离
子水进行清洁。清洁时关闭机器电源,打开前面上半面板,将热盖板(黑色面板)推到后面,
清洁相应的孔,然后恢复原状,重新执行background校正,直到所有的信号值均低于72000。
4.3.7 按照仪器出厂说明书每6个月对仪器进行纯荧光校正和ROI校正。
4.3.8 仪器在搬运后需要进行背景校正、纯荧光校正和ROI校正,所有校正通过后才能进行实
验。
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4.4 维修
如出现故障,按照《设备管理制度》实施。
5. 支持文件
5.1 《设备管理制度》
6. 相关记录
6.1 《设备使用记录》
6.2 《设备维护保养计划清单》
7. 文件修改记录
序号 修改条款
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(补充或删减)
修改原因
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