2024年3月22日发(作者:廉德运)
COVID-19的病毒学、流行病学以及发病
机制的认识
2019年年底,湖北省武汉市出现了一群原因不明确的肺
炎患者,随后,由于春节将近,人口流动大,疾病在在全国范
围内蔓延传染,截止到2020年6月2日24时,我国已有例确
诊病例。通过序列分析,人们认为这种肺炎是由一种新的冠状
病毒2019-nCoV引起的,后来WHO在2020年2月11日又将
其命名为2019冠状病毒病Coronavirus Disease-2019 (COVID-
19),在同一天,国际病毒分类学委员会(ICTV)将这种命名
为SARS-CoV-2.至今,SARS-CoV-2感染仍在蔓延,涉及欧洲、
非洲、美洲和大洋洲等地,这种病毒对全世界人民的健康构成
了严重威胁。中国大陆几乎所有省份都确认颁布了联合的预防
和检疫机制,及时控制住了疫情。但由于缺乏特定的抗病毒治
疗方法和临床治疗,全世界每天有数千例严重病例死亡。
一、病毒学
1.
起源
2.分类及其亚型
分离出的SARS-CoV-2,经过序列和退化树分析,被以为
是β-CoV的成员。1975年,国际病毒定名委员会正式定名了
冠状病毒科,冠状病毒科又分为两个亚科:Letovirinae亚科和
正冠状病毒亚科,而正冠状病毒亚科又下分为α、β、γ和δ四
个属。CoVs家族是一类包膜的,单股正链RNA病毒。其遗
传物资是所有RNA病毒中最大的,只感染人、鼠、猪、猫、
犬、禽类脊椎动物。这种病毒可引起呼吸道,肠道,肝脏和神
经系统疾病。个中,α和β属涉及人类、家畜和宠物等,病毒
种类较多,γ和δ属多是禽类冠状病毒,种类较少。国际病毒
分类委员会2018年已鉴定的人和动物冠状病毒共有23个亚属
38个种。虽然有多达38种,但是个中现在可感染人类的冠状
病毒仅6种—HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、
HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV。到现在,加上现在
的2019-nCoV,一共是7种。SARS冠状病毒(SARS-CoV)
和MERS冠状病毒(MERS-CoV)是β-CoV的成员。全基因
组系统发育树分析表示SARS-CoV-2与SARS-CoV和MERS-
CoV分别具有79.5%和50%的序列同一性。但是,SARS-
CoV-2和SARS-CoV的七个保守的复制酶的ORF1ab中的结构
域之间存在94.6%的序列同一性,并且SARS-CoV-2和其他β-
CoV之间的序列同一性都低于90%,这解释SARS-CoV-2属
于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属,并在遗传学上与SARS-
CoV不同,且2019-nCoV与SARS-CoV在RNA依赖性RNA
2024年3月22日发(作者:廉德运)
COVID-19的病毒学、流行病学以及发病
机制的认识
2019年年底,湖北省武汉市出现了一群原因不明确的肺
炎患者,随后,由于春节将近,人口流动大,疾病在在全国范
围内蔓延传染,截止到2020年6月2日24时,我国已有例确
诊病例。通过序列分析,人们认为这种肺炎是由一种新的冠状
病毒2019-nCoV引起的,后来WHO在2020年2月11日又将
其命名为2019冠状病毒病Coronavirus Disease-2019 (COVID-
19),在同一天,国际病毒分类学委员会(ICTV)将这种命名
为SARS-CoV-2.至今,SARS-CoV-2感染仍在蔓延,涉及欧洲、
非洲、美洲和大洋洲等地,这种病毒对全世界人民的健康构成
了严重威胁。中国大陆几乎所有省份都确认颁布了联合的预防
和检疫机制,及时控制住了疫情。但由于缺乏特定的抗病毒治
疗方法和临床治疗,全世界每天有数千例严重病例死亡。
一、病毒学
1.
起源
2.分类及其亚型
分离出的SARS-CoV-2,经过序列和退化树分析,被以为
是β-CoV的成员。1975年,国际病毒定名委员会正式定名了
冠状病毒科,冠状病毒科又分为两个亚科:Letovirinae亚科和
正冠状病毒亚科,而正冠状病毒亚科又下分为α、β、γ和δ四
个属。CoVs家族是一类包膜的,单股正链RNA病毒。其遗
传物资是所有RNA病毒中最大的,只感染人、鼠、猪、猫、
犬、禽类脊椎动物。这种病毒可引起呼吸道,肠道,肝脏和神
经系统疾病。个中,α和β属涉及人类、家畜和宠物等,病毒
种类较多,γ和δ属多是禽类冠状病毒,种类较少。国际病毒
分类委员会2018年已鉴定的人和动物冠状病毒共有23个亚属
38个种。虽然有多达38种,但是个中现在可感染人类的冠状
病毒仅6种—HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63、
HCoV-HKU1、SARS-CoV和MERS-CoV。到现在,加上现在
的2019-nCoV,一共是7种。SARS冠状病毒(SARS-CoV)
和MERS冠状病毒(MERS-CoV)是β-CoV的成员。全基因
组系统发育树分析表示SARS-CoV-2与SARS-CoV和MERS-
CoV分别具有79.5%和50%的序列同一性。但是,SARS-
CoV-2和SARS-CoV的七个保守的复制酶的ORF1ab中的结构
域之间存在94.6%的序列同一性,并且SARS-CoV-2和其他β-
CoV之间的序列同一性都低于90%,这解释SARS-CoV-2属
于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属,并在遗传学上与SARS-
CoV不同,且2019-nCoV与SARS-CoV在RNA依赖性RNA