2024年4月23日发(作者:庾初蝶)
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2008年4月
第l6卷第2期
中国实验动物学报
ACTA LABORAT0RIUM ANIMAUS SCIENTIA SINICA
April,2008
Vo1.16 No.2
e
(
研究报告E
、 、 ;、
小鼠晶体蛋白质组的双向电泳和质谱鉴定研究
季樱红 ,卢奕 ,李娜 ,金红 ,杨芄原
(1.复旦大学附属眼耳鼻喉科医院眼科,上海200031;2.复旦大学化学系,上海200433)
【摘要】 目的应用双向电泳和质谱技术研究5周龄小鼠晶体蛋白质组。方法 提取小鼠晶体总蛋白,进行
固相pH梯度(IPG)等电聚焦双向电泳,胶体考马斯亮蓝R一250染色,使用PDQuest 7.30图像分析软件分析电泳图
像。选择主要蛋白点胶上酶解,应用基质辅助激光解析电离飞行时间/飞行时间(MALDI—TOF/TOF)仪器进行串联
质谱(MS/MS)鉴定。结果 上样量为882 ttg和190 ttg时,分别检测370±41蛋白点(n=3)和57±5个蛋白点(n
=3)。高上样量能够较好地分离晶体低丰度蛋白,如念珠状纤维结构蛋白BFSP;低上样量可很好地分离高丰度蛋
白一晶体蛋白(包括 、aB;pAl~pA4; l~ 3;”~ 和 等)。质谱鉴定得到1种细胞骨架蛋白和l6种高丰
度晶体蛋白。结论双向电泳和质谱技术有效考察了晶体总蛋白质,为分析白内障形成过程中蛋白质的表达改变
提供了新的方法和途径。
【关键词】 小鼠晶体蛋白;蛋白质组;双向凝胶电泳;质谱
【中图分类号】R776.1;Q51 【文献标识码】A 【文章编号】1005—4847(2008)02—0105—06
Identification 0f Mouse Lens Proteins by TWO—Dimensional
Gel Electr0ph0resis and Mass Spectrometry
jI Ying—Hong ,LU Yi ,LI Na ,JIN Hong ,YANG Peng—Yuan
(1.Department of Ophthalmology,Eye&ENT Hospital of Fudan University,Shanghai 20003 1,China;
2.Department of Chemistry,Fudan University,Shanghai 200433,China)
【Abstract】 objective To separate and identify the lens proteomics in 5 weeks old mice using two—dimensional
electrophoresis(2-DE)and mass spectromety.Methods The protreins of mouse lens were separated using immobilized pH
gradient(IPG)two—dimensional electrophoresis(2-DE)and colloidal Coomassie brilliant blue(CBB)staining.Image analysis was
carried out using PDQuest 7.30 software package.Most of the proteins in gel were identiifed by matirx assisted laser adsorption/
ionization—time of lfight—tandem mass spectrometry(MALDI—TOF—MS/MS).Results When a 882 ttg sample or a 190 ttg sample
was added,370±41 spots and 57±5 spots were detected,respectively.When a higher sample was applied,low—abundance
proteins such as beaded filament structure protein(BFSP)could be separated.With a lower sample,the high—abundance proteins
were separated,such as aA~aB,pAl~pA4,口Bl~口B3,7A~7F and 7S crystlalins.Protein spots were identiifed by MALDI—
TOF/TOF,including one cytoskeletal protein and sixteen high・abundance crystllians.Conclusions The lens proteins can be well
separated and analyzed using 2-DE and mass spectromety.Prroteomic analysis technique offers a new avenue for analysis of lens
proteins and to assess their diferential expression in cataract.
【Key words】Mice crystallins;Proteome;Two—dimensional electrophoresis(2-DE);Mass spectrometyr
晶体为富含蛋白质的组织,蛋白质占了人类晶
体湿重的60%和干重的绝大部分。而蛋白质的氨
基酸序列、空间结构及数量决定了它们分子问的作
用,对维持晶体的透明起重要作用…。白内障的发
[基金项目]高等学校博士学科点专项科研基金(编号:
20060246056);上海市卫生局青年基金(2006Y10)。
病原因目前不甚明了,有报道表明,年龄、氧化、药
物、外伤、辐射、免疫反应等多种因素可引起蛋白质
的结构、数量的改变,从而导致晶体混浊。同时,晶
体蛋白质易受到各种翻译后修饰作用的影响如磷酸
化、氧化、糖化、乙酰化等。晶体蛋白质一旦被修饰,
其构象和功能将发生改变,晶体蛋白质可溶性下降,
不溶性蛋白含量增加,导致晶体透明度下降,从而产
[作者简介]季樱红(1979一),女,主治医师,复旦大学附属眼耳
鼻喉科医院眼科博士。E-mail:yinghongji@yahoo.com.cn
[通讯作者]卢奕(1965一),男,教授,博士,博士生导师,研究方
向为:白内障的基础与临床。Tel:021.64377134—147;E—mail:luyi eent@
yaho.com.cn
生白内障。基因虽是遗传信息的源头,而功能性蛋
白是基因功能的执行体,Wilkins和Williams于1994
年首次提出蛋白质组的概念 。
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106 中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No.2
蛋白质组是一个基因组、一种生物或一种细胞
(组织)所表达的全套蛋白质。应用蛋白质组技术可
研究晶体的蛋白质的结构与功能,为揭示白内障的
发病机制进一步提供实验基础。
1材料与方法
1.1实验试剂
固相pH梯度干胶条(IPG)胶条(18 cm,pH 3
~
10,线性)、IPG两性电解质缓冲液(pH 3~10,线
性)为Bio—Rad公司产品。尿素、3.[(3-胆酰胺丙
基).二乙胺].丙磺酸(CHAPS)、二硫苏糖醇(DTr)、
硫脲、苯甲基磺酰氟(PMSF)、溴酚蓝、矿物油、十二
烷基磺酸钠(SDS)、甘氨酸、甘油、丙烯酰胺、N,N一甲
叉双丙烯酰胺、四甲基乙二胺(TEMED)、过硫酸胺
(APS)、Tris、a.氰基.4.羟基肉桂酸(CHCA)、柠檬酸
胺、三氟乙酸(TFA)、myoglobin为Sigma公司产品。
乙腈(ACN)、碘乙酰胺为Fluka公司产品,测序级胰
蛋白酶购自Roche公司。其他常用试剂均为国产分
析纯。实验中所用水为MilliQ去离子水。
裂解液或泡涨液:尿素(7mol/L)+CHAPS
(4%)+硫脲(2mol/L)+PMSF(0.14%)。
平衡液A/B: s.HCL(1.5mol/L,pH 8.8)+尿
素(6mol/L)+甘油(20%)+SDS(2%)+DTr
(2%)/碘乙酰胺(2.5%)。
考马斯亮蓝染色液:考马斯亮蓝R.250(0.1%)
+乙醇(40%)+乙酸(10%)。
1.2实验设备
IPGphor水平等电聚焦电泳仪(Amersham
Pharmacia),POWER/PAC 1000垂直电泳仪(Bio.
Rad),GS一800凝胶成像仪(Bio.Rad),PDQUEST 7.30
2-DE图像分析软件(Bio—Rad),高速低温离心机
(Sigma),Millipore MilliQ去离子水仪(法国),紫外分
光光度仪(UV mini 1240),TS.1型脱色摇床,XW.
80A型漩涡混合器(江苏海门市麒麟医用仪器厂),
MALDI.TOF/TOF质谱仪(美国ABI公司)。
1.3实验方法
1.3.1实验对象:中国科学院上海生命科学院实验
动物中心提供的3只5周龄健康昆明小鼠,合格证
号:SCXK(沪)2003.0003。
1.3.2 晶体全蛋白的提取:脊椎脱臼处死小鼠,在
Zeiss显微镜下,行小鼠双眼球摘除术,乳酸林格氏
液冲洗眼球,从后部剪开巩膜,完整取出小鼠晶体,
去除晶体囊膜,立即置于液氮内保存。研钵用液氮
预冷后将晶体组织敲打成粉末状,刮取晶体粉末入
匀浆器研磨,加800 ttL裂解液,冰上孵育30 min,
15℃,12 000 r/min离心30 min,吸取上清液,.80℃冰
箱保存。Bradford法测定样品蛋白浓度。
1.3.3 双向电泳和染色:采用pH 3—10,18 cm胶
条,蛋白上样量分别为882 Fg和190 ttg,加入重泡涨
液至350 FL。20℃泡涨12 h以上。等点聚焦条件
设置:①梯度升压250 V/30 min;②梯度升压500 V/
30 min;③梯度升压1 000 V/h;④梯度升压2000 V/
h;⑤快速升压4000 V/h;⑥快速升压8 000 V/3 h,
等电聚焦80000 Vh。等电聚焦结束后,胶条先后在
平衡液A中平衡15 min,平衡液B中平衡15 min,然
后将胶条移至分离胶上端,琼脂糖(0.5%)封胶。
以恒电流方式,20 mA/胶电泳至蛋白转至分离胶后,
换用40 mA/胶,直至溴酚蓝前沿迁移至距凝胶底边
1 cm处停止电泳。凝胶用考马斯亮蓝染色液染色
12~16 h,后用脱色液脱色。
1.3.4 图像采集分析:染色后的凝胶用GS一800凝胶
扫描仪透射扫描,用PDQUEST 7.30软件进行分析。
1.3.5质谱鉴定分析:①胶上酶解:将选定蛋白斑
点切割下来,切碎置100 ttL脱色液(50 mmol/L
NH4HCO +50%乙腈(ACN)脱色20 min,重复2次。
然后加入100 ttL乙腈干胶10 min。接着加入3
浓度为12.5 ng/ttL Trypsin溶液,4℃冰箱内放置30
min,弃去多余的酶液,取出后在37℃烘箱中酶解过
夜。酶解结束后加入60 ttL 50%ACN/0.1%TFA进
行肽段提取,放置300 min,重复2次。将肽段溶液
在氮气流下吹干浓缩,备质谱检测。②质谱分析与
数据库检索:将肽段重新溶解于0.7 ttL 5 mg/mL的
CHCA溶液(溶于0.1%TFA+50%ACN)中,点到
MALDI靶板上,在室温下干燥。利用4700串联飞行
时间质谱仪[4700 Pmteomics Analyzer(TOF/TOFTM)
(Applied Biosystems,USA)]进行质谱分析,激光源为
355 nm波长的Nd:YAG激光器,加速电压为20 kV,
采用正离子模式和自动获取数据的模式采集数据。
PMF质量扫描范围为700~3500,选取强度最大的6
个峰进行串级质谱分析;PMF谱图用两个tyrpsin自
降解的峰m/z 842.510和m/z 2211.105进行内标校
正。所得结果用GPS(Applied Biosystems,USA).
MASCOT(Matirx Science,london,UK)进行数据库检
索。搜索参数设置:数据库为NCBI;检索种属为小
鼠,Mus musculus;数据检索的方式为combined;最大
允许漏切位点为1;酶为胰蛋白酶。质量误差范围
设置:PMF 0.3,MS/MS 0.4;设置的可变修饰为
carbamidomethylation(半胱氨酸)和氧化(甲硫氨
酸)。在数据库检索时胰酶自降解峰和污染物质的
峰都手工剔除。
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中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No.2 l07
2 结果
2.1双向凝胶电泳图像及分析结果
点(n=3)和57土5个蛋白点(n=3)。上样量为190
g时,任意选取30个蛋白点进行位置重复性分析,
在IEF方向(横向)平均为(0.92土0.15)mm,在
SDS.PAGE方向(纵向)(1.28土0.21 mm),表明蛋
较高上样量有利于分离晶体低丰度蛋白;低上
样量有利于分离高丰度蛋白一晶体蛋白(图1)。上
样量为882 g和190 g时,分别检测370±41蛋白
白质点在位置上具有较好的重复性。
lO
A
A上样量为882,ug,a对应于低丰度蛋白;B上样量为190,ug,b对应于高丰度蛋白一晶体蛋白。
B
图1小鼠晶体总蛋白的2一DE图谱(pH 3一lO,考染)
A:882,ug proteins were loaded.“a”corresponding to the low—abundance proteins;B:190 g proteins were loaded.…b’corresponding to the high
bundance praoteins.
Fig.1 Representative 2-DE gels showing the proteome map of total protein from lenses of the mice.(pH 3—10,R250
stained).
2.2质谱鉴定结果
采用MALDI—TOF/TOF质谱对样品先进行分析
(表1),鉴定出l7种蛋白质。包括1种低丰度蛋白
念珠状纤维结构蛋白(beaded filament structure
protein,BFSP/filensin)(图2),l6种高丰度晶体蛋白
质(晶体蛋白)(图3),其中BFSP/filensin的肽质量指
纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF)和离子分数最
高的肽段串联质谱图见图4。
嗣
●
■-■謦
■
.
_‘I
3讨论
晶体中的蛋白可分为水溶性和非水溶性两种,
晶体蛋白为水溶性蛋白,占了晶体中蛋白质总量的
90%左右,包括:a、G、7晶体蛋白。a晶体蛋白相对
分子质量最大,为600 X 103~900 X 10 ,包括aA和
7 : ::尊
jI
图2与图1A中方框小图对应的放大图谱,BFSP
为念珠状纤维结构蛋白
Fig.2 The map corresponding to the square box
defined in Fig.1 A.BFSP,beaded filament structural protein
aB,亚单位相对分子质量为20 X 10 左右。以包含
173个氨基酸,aB包含175个氨基酸。0晶体蛋白由
单个相对分质子量介于23 X 103—32 X 103之间的多
肽亚单位聚合而成,包括4种酸性亚单位( l、
2、pA3、pA4)和3种碱性亚单位( Bl、 B2、13B3)。
晶体蛋白相对分子质量最小(20 X 10 ),包括7个
成员,7A~ 和7s。而其中7C、7D、7s构成人类的
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108 中国实验动物学报2008年4月第16卷第2期 Acta Lab Aniat Sci Sin.April,2008,Vo1.16,No.2
主要7晶体蛋白。不溶性蛋白(脲溶性和脲不溶性
配方提高晶体疏水性蛋白的溶解性。尿素作为一种
中性离液剂,可溶解和解折叠大多数的蛋白质,形成
蛋白)包括细胞骨架蛋白、膜蛋白等。晶体内的细
胞骨架蛋白包括微丝、中间纤维和念珠状纤维等。
既往研究主要集中在晶体水溶性蛋白,本研究
完全随机的构象,使所有的离子团暴露于溶液中。
硫脲是一种比尿素具有更强能力的变性剂,两者的
目标是全部晶体蛋白,采用尿素结合硫脲的裂解液
结合提高了溶解蛋白尤其是膜蛋白的能力。
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中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16。No.2 109
pH-3—
100×i0 一
MW
lO
量,使得低丰度蛋白的分离受到影响。而低丰度蛋
白在细胞内具有重要的调节功能,因此,分离低丰度
蛋白是一种挑战。从不同上样量的凝胶图像中可以
看到,不同的上样量可用来分析不同丰度的蛋白质:
当上样量为190 g时,晶体蛋白可得到很好的分
离,但低丰度蛋白的斑点数很少。结果与国内外文
献报道的晶体组织相似 。当上样量为882”g
时,高相对分子质量的低丰度蛋白得到很好的分离,
而高丰度蛋白点互相重叠。
本实验鉴定得到16种高丰度晶体蛋白,包括
aA、aB;pA1~8A4;8Bl~8B3;yA~7F和7S等。众所
周知,aB晶体蛋白是小分子热休克蛋白的一种,具
有分子伴侣作用,能保护其他蛋白,对各种变性剂包
括加热、紫外线和化学处理造成的蛋白质的凝聚具
图3 正常晶体所有高丰度蛋白一结构蛋白(a、8、
)的分布(上样量190 ttg)
有抑制作用,并对其他蛋白的溶解性具有促进作
Fig.2 2-DE gels showing the high abundance protein
用 。应激状态时,aB晶体蛋白主要和细胞骨架蛋
such as a,8and protein from the mouse lenses(190 ttg of
protein was loaded)
白相结合,对细胞产生保护作用…。
晶体蛋白在结构上具有自身的特点,由于晶体
本实验还鉴定出1种低丰度蛋白念珠状纤维结
蛋白的含量过高(90%左右),限制了样品的上样
构蛋白(beaded filament structure protein,BFSP/
4700 Refledor spec MC[BP=14568.168461
.
苦
器 g
辇
.
船I-『l脚
盯加 s,■s Precursor1d56 78 spee MC[BP=232’.10 ̄Ol
图4小鼠BFSP/iilensin的MS(上图)和m/z 1456.78的MS/MS分析图(下
图)
Fig.4 MS and MS/MS spectra of m0use BFSP/filensin.Upper:MS specturm:
lower:MS/MS spectrum of m/z 1456.78
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l l0 中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No 2
iflensin)。它属细胞骨架蛋白,具有晶体特异性,只
在分化的晶体纤维细胞中表达。细胞骨架起着提供
胞质结构骨架、细胞运动和细胞大小、形态的决定和
维持作用。正常的细胞骨架蛋白功能和它们与晶体
蛋白的相互作用是透明晶体细胞结构的发育和维持
的基础。前面提及应激状态时aB可和细胞骨架蛋
参 考 文 献
l l J Delaye M,Tardieu A short-range order of crystallin proteins accounts
for eye lens transparency[J].Nature,1983,302(5907):415—417
[2]Swinbanks D.Government backs proteome proposal[J].Nature,
1995,78(6558):653.
【3]Lampi KJ,Shih M,Ueda Y,et a1.Lens proteomics:analysis of rat
crystlalin sequences and two—dimensional electophoresirs map[J].
Invest Ophthalmol Vis Sci,2002,43(1):216—224.
白相结合,与之结合的主要是中间纤维BFSP 。
BFSP的两大核心成分包括phakinin(BFSP.2、CP49)
【4] Ueda Y,Duncan MK,David LL.Lens proteomics:the accumulation
和filensin(BFSP.1、CP94、CP95、CP115)。已明确细
胞骨架蛋白的缺失可在大鼠中引起白内障 。
Jakobs等 首次发现细胞骨架蛋白突变可造成人类
先天性白内障,在一先天性白内障家系研究发现是
由于BFSP.2第三个外显子的核苷酸发生缺失突变,
导致读码框内233位的谷氨酸密码子缺失,蛋白结
构发生异常,使晶体失去透明。
晶体是一个无血管分布、无神经支配的组织,其
生理和病理变化受其它因素的影响较少。既往研究
热点晶体的研究集中在基因组水平,但随着技术的
发展,研究的对象由传统的单个基因、单个蛋白质转
变为基因组和蛋白质组。蛋白质组研究比基因组研
究更有实用性,有希望在蛋白质水平上(尤其是一
些重要蛋白)阐明白内障、后发障及白内障术后并
发症等晶体相关疾病的发病机制,并有可能提供此
类疾病预防与治疗的更有效的方法。
of crystlalin modiifcations in the mouse lens with age[J].Invest
Ophthalmol Vis Sci,2002,43(1):205—2l5.
[5]刘奕志,张敏,柳夏林,等.兔晶体蛋白质组的双向电泳和质
谱鉴定研究[J].中华眼科杂志,2004,加(2):l13—117.
16j Muehowski PJ,Bassuk JA,Lubsen NH,et at.Human aIphaB-
crystallin.Small heat shock protein and molecular chaperone[J].J
Biol Chem,1997,272(4):2578—2582.
[7] Muchowski PJ,Valdez MM,Clark JI.AlphaB-crystallin selectively
targets intermediate filament proteins during thermal stress[J].Invest
Ophthalmol Vis Sci,1999,加(5):951—958
[8] Matsushima H,David LL,Hiraoka T,et a1.Loss of cytoskeletal
proteins and lens cell opaciifcation in the selenite catracta model[J].
Exp Eye Res,1997,64(3):387—395.
[9] Jakobs PM,Hess JF,Fitzgerald PG,et a1.Autosomal-dominant
congenital catracta associated with a deletion mutation in the human
beaded filament protein gene BFSP2[J J.Am J Hum Genet,2000,66
(4):1432—1436.
[收稿151期]2007—10一l1
声明:本刊已入编:万方数据一数字化期刊群;中国核心期刊(遴选)数据库;中国科学引文
数据库;中国学术期刊(光盘版)电子杂志;中文生物医学期刊文献数据库(CMCC);中国生物医
学期刊引文数据库(CMCI)中国学术期刊文摘;作者著作权使用费与本刊稿酬一次性给付,不
再另行发放。作者如不同意将文章入编,投稿时敬请说明。
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季樱红 ,卢奕 ,李娜 ,金红 ,杨芄原
(1.复旦大学附属眼耳鼻喉科医院眼科,上海200031;2.复旦大学化学系,上海200433)
【摘要】 目的应用双向电泳和质谱技术研究5周龄小鼠晶体蛋白质组。方法 提取小鼠晶体总蛋白,进行
固相pH梯度(IPG)等电聚焦双向电泳,胶体考马斯亮蓝R一250染色,使用PDQuest 7.30图像分析软件分析电泳图
像。选择主要蛋白点胶上酶解,应用基质辅助激光解析电离飞行时间/飞行时间(MALDI—TOF/TOF)仪器进行串联
质谱(MS/MS)鉴定。结果 上样量为882 ttg和190 ttg时,分别检测370±41蛋白点(n=3)和57±5个蛋白点(n
=3)。高上样量能够较好地分离晶体低丰度蛋白,如念珠状纤维结构蛋白BFSP;低上样量可很好地分离高丰度蛋
白一晶体蛋白(包括 、aB;pAl~pA4; l~ 3;”~ 和 等)。质谱鉴定得到1种细胞骨架蛋白和l6种高丰
度晶体蛋白。结论双向电泳和质谱技术有效考察了晶体总蛋白质,为分析白内障形成过程中蛋白质的表达改变
提供了新的方法和途径。
【关键词】 小鼠晶体蛋白;蛋白质组;双向凝胶电泳;质谱
【中图分类号】R776.1;Q51 【文献标识码】A 【文章编号】1005—4847(2008)02—0105—06
Identification 0f Mouse Lens Proteins by TWO—Dimensional
Gel Electr0ph0resis and Mass Spectrometry
jI Ying—Hong ,LU Yi ,LI Na ,JIN Hong ,YANG Peng—Yuan
(1.Department of Ophthalmology,Eye&ENT Hospital of Fudan University,Shanghai 20003 1,China;
2.Department of Chemistry,Fudan University,Shanghai 200433,China)
【Abstract】 objective To separate and identify the lens proteomics in 5 weeks old mice using two—dimensional
electrophoresis(2-DE)and mass spectromety.Methods The protreins of mouse lens were separated using immobilized pH
gradient(IPG)two—dimensional electrophoresis(2-DE)and colloidal Coomassie brilliant blue(CBB)staining.Image analysis was
carried out using PDQuest 7.30 software package.Most of the proteins in gel were identiifed by matirx assisted laser adsorption/
ionization—time of lfight—tandem mass spectrometry(MALDI—TOF—MS/MS).Results When a 882 ttg sample or a 190 ttg sample
was added,370±41 spots and 57±5 spots were detected,respectively.When a higher sample was applied,low—abundance
proteins such as beaded filament structure protein(BFSP)could be separated.With a lower sample,the high—abundance proteins
were separated,such as aA~aB,pAl~pA4,口Bl~口B3,7A~7F and 7S crystlalins.Protein spots were identiifed by MALDI—
TOF/TOF,including one cytoskeletal protein and sixteen high・abundance crystllians.Conclusions The lens proteins can be well
separated and analyzed using 2-DE and mass spectromety.Prroteomic analysis technique offers a new avenue for analysis of lens
proteins and to assess their diferential expression in cataract.
【Key words】Mice crystallins;Proteome;Two—dimensional electrophoresis(2-DE);Mass spectrometyr
晶体为富含蛋白质的组织,蛋白质占了人类晶
体湿重的60%和干重的绝大部分。而蛋白质的氨
基酸序列、空间结构及数量决定了它们分子问的作
用,对维持晶体的透明起重要作用…。白内障的发
[基金项目]高等学校博士学科点专项科研基金(编号:
20060246056);上海市卫生局青年基金(2006Y10)。
病原因目前不甚明了,有报道表明,年龄、氧化、药
物、外伤、辐射、免疫反应等多种因素可引起蛋白质
的结构、数量的改变,从而导致晶体混浊。同时,晶
体蛋白质易受到各种翻译后修饰作用的影响如磷酸
化、氧化、糖化、乙酰化等。晶体蛋白质一旦被修饰,
其构象和功能将发生改变,晶体蛋白质可溶性下降,
不溶性蛋白含量增加,导致晶体透明度下降,从而产
[作者简介]季樱红(1979一),女,主治医师,复旦大学附属眼耳
鼻喉科医院眼科博士。E-mail:yinghongji@yahoo.com.cn
[通讯作者]卢奕(1965一),男,教授,博士,博士生导师,研究方
向为:白内障的基础与临床。Tel:021.64377134—147;E—mail:luyi eent@
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生白内障。基因虽是遗传信息的源头,而功能性蛋
白是基因功能的执行体,Wilkins和Williams于1994
年首次提出蛋白质组的概念 。
维普资讯
106 中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No.2
蛋白质组是一个基因组、一种生物或一种细胞
(组织)所表达的全套蛋白质。应用蛋白质组技术可
研究晶体的蛋白质的结构与功能,为揭示白内障的
发病机制进一步提供实验基础。
1材料与方法
1.1实验试剂
固相pH梯度干胶条(IPG)胶条(18 cm,pH 3
~
10,线性)、IPG两性电解质缓冲液(pH 3~10,线
性)为Bio—Rad公司产品。尿素、3.[(3-胆酰胺丙
基).二乙胺].丙磺酸(CHAPS)、二硫苏糖醇(DTr)、
硫脲、苯甲基磺酰氟(PMSF)、溴酚蓝、矿物油、十二
烷基磺酸钠(SDS)、甘氨酸、甘油、丙烯酰胺、N,N一甲
叉双丙烯酰胺、四甲基乙二胺(TEMED)、过硫酸胺
(APS)、Tris、a.氰基.4.羟基肉桂酸(CHCA)、柠檬酸
胺、三氟乙酸(TFA)、myoglobin为Sigma公司产品。
乙腈(ACN)、碘乙酰胺为Fluka公司产品,测序级胰
蛋白酶购自Roche公司。其他常用试剂均为国产分
析纯。实验中所用水为MilliQ去离子水。
裂解液或泡涨液:尿素(7mol/L)+CHAPS
(4%)+硫脲(2mol/L)+PMSF(0.14%)。
平衡液A/B: s.HCL(1.5mol/L,pH 8.8)+尿
素(6mol/L)+甘油(20%)+SDS(2%)+DTr
(2%)/碘乙酰胺(2.5%)。
考马斯亮蓝染色液:考马斯亮蓝R.250(0.1%)
+乙醇(40%)+乙酸(10%)。
1.2实验设备
IPGphor水平等电聚焦电泳仪(Amersham
Pharmacia),POWER/PAC 1000垂直电泳仪(Bio.
Rad),GS一800凝胶成像仪(Bio.Rad),PDQUEST 7.30
2-DE图像分析软件(Bio—Rad),高速低温离心机
(Sigma),Millipore MilliQ去离子水仪(法国),紫外分
光光度仪(UV mini 1240),TS.1型脱色摇床,XW.
80A型漩涡混合器(江苏海门市麒麟医用仪器厂),
MALDI.TOF/TOF质谱仪(美国ABI公司)。
1.3实验方法
1.3.1实验对象:中国科学院上海生命科学院实验
动物中心提供的3只5周龄健康昆明小鼠,合格证
号:SCXK(沪)2003.0003。
1.3.2 晶体全蛋白的提取:脊椎脱臼处死小鼠,在
Zeiss显微镜下,行小鼠双眼球摘除术,乳酸林格氏
液冲洗眼球,从后部剪开巩膜,完整取出小鼠晶体,
去除晶体囊膜,立即置于液氮内保存。研钵用液氮
预冷后将晶体组织敲打成粉末状,刮取晶体粉末入
匀浆器研磨,加800 ttL裂解液,冰上孵育30 min,
15℃,12 000 r/min离心30 min,吸取上清液,.80℃冰
箱保存。Bradford法测定样品蛋白浓度。
1.3.3 双向电泳和染色:采用pH 3—10,18 cm胶
条,蛋白上样量分别为882 Fg和190 ttg,加入重泡涨
液至350 FL。20℃泡涨12 h以上。等点聚焦条件
设置:①梯度升压250 V/30 min;②梯度升压500 V/
30 min;③梯度升压1 000 V/h;④梯度升压2000 V/
h;⑤快速升压4000 V/h;⑥快速升压8 000 V/3 h,
等电聚焦80000 Vh。等电聚焦结束后,胶条先后在
平衡液A中平衡15 min,平衡液B中平衡15 min,然
后将胶条移至分离胶上端,琼脂糖(0.5%)封胶。
以恒电流方式,20 mA/胶电泳至蛋白转至分离胶后,
换用40 mA/胶,直至溴酚蓝前沿迁移至距凝胶底边
1 cm处停止电泳。凝胶用考马斯亮蓝染色液染色
12~16 h,后用脱色液脱色。
1.3.4 图像采集分析:染色后的凝胶用GS一800凝胶
扫描仪透射扫描,用PDQUEST 7.30软件进行分析。
1.3.5质谱鉴定分析:①胶上酶解:将选定蛋白斑
点切割下来,切碎置100 ttL脱色液(50 mmol/L
NH4HCO +50%乙腈(ACN)脱色20 min,重复2次。
然后加入100 ttL乙腈干胶10 min。接着加入3
浓度为12.5 ng/ttL Trypsin溶液,4℃冰箱内放置30
min,弃去多余的酶液,取出后在37℃烘箱中酶解过
夜。酶解结束后加入60 ttL 50%ACN/0.1%TFA进
行肽段提取,放置300 min,重复2次。将肽段溶液
在氮气流下吹干浓缩,备质谱检测。②质谱分析与
数据库检索:将肽段重新溶解于0.7 ttL 5 mg/mL的
CHCA溶液(溶于0.1%TFA+50%ACN)中,点到
MALDI靶板上,在室温下干燥。利用4700串联飞行
时间质谱仪[4700 Pmteomics Analyzer(TOF/TOFTM)
(Applied Biosystems,USA)]进行质谱分析,激光源为
355 nm波长的Nd:YAG激光器,加速电压为20 kV,
采用正离子模式和自动获取数据的模式采集数据。
PMF质量扫描范围为700~3500,选取强度最大的6
个峰进行串级质谱分析;PMF谱图用两个tyrpsin自
降解的峰m/z 842.510和m/z 2211.105进行内标校
正。所得结果用GPS(Applied Biosystems,USA).
MASCOT(Matirx Science,london,UK)进行数据库检
索。搜索参数设置:数据库为NCBI;检索种属为小
鼠,Mus musculus;数据检索的方式为combined;最大
允许漏切位点为1;酶为胰蛋白酶。质量误差范围
设置:PMF 0.3,MS/MS 0.4;设置的可变修饰为
carbamidomethylation(半胱氨酸)和氧化(甲硫氨
酸)。在数据库检索时胰酶自降解峰和污染物质的
峰都手工剔除。
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中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No.2 l07
2 结果
2.1双向凝胶电泳图像及分析结果
点(n=3)和57土5个蛋白点(n=3)。上样量为190
g时,任意选取30个蛋白点进行位置重复性分析,
在IEF方向(横向)平均为(0.92土0.15)mm,在
SDS.PAGE方向(纵向)(1.28土0.21 mm),表明蛋
较高上样量有利于分离晶体低丰度蛋白;低上
样量有利于分离高丰度蛋白一晶体蛋白(图1)。上
样量为882 g和190 g时,分别检测370±41蛋白
白质点在位置上具有较好的重复性。
lO
A
A上样量为882,ug,a对应于低丰度蛋白;B上样量为190,ug,b对应于高丰度蛋白一晶体蛋白。
B
图1小鼠晶体总蛋白的2一DE图谱(pH 3一lO,考染)
A:882,ug proteins were loaded.“a”corresponding to the low—abundance proteins;B:190 g proteins were loaded.…b’corresponding to the high
bundance praoteins.
Fig.1 Representative 2-DE gels showing the proteome map of total protein from lenses of the mice.(pH 3—10,R250
stained).
2.2质谱鉴定结果
采用MALDI—TOF/TOF质谱对样品先进行分析
(表1),鉴定出l7种蛋白质。包括1种低丰度蛋白
念珠状纤维结构蛋白(beaded filament structure
protein,BFSP/filensin)(图2),l6种高丰度晶体蛋白
质(晶体蛋白)(图3),其中BFSP/filensin的肽质量指
纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF)和离子分数最
高的肽段串联质谱图见图4。
嗣
●
■-■謦
■
.
_‘I
3讨论
晶体中的蛋白可分为水溶性和非水溶性两种,
晶体蛋白为水溶性蛋白,占了晶体中蛋白质总量的
90%左右,包括:a、G、7晶体蛋白。a晶体蛋白相对
分子质量最大,为600 X 103~900 X 10 ,包括aA和
7 : ::尊
jI
图2与图1A中方框小图对应的放大图谱,BFSP
为念珠状纤维结构蛋白
Fig.2 The map corresponding to the square box
defined in Fig.1 A.BFSP,beaded filament structural protein
aB,亚单位相对分子质量为20 X 10 左右。以包含
173个氨基酸,aB包含175个氨基酸。0晶体蛋白由
单个相对分质子量介于23 X 103—32 X 103之间的多
肽亚单位聚合而成,包括4种酸性亚单位( l、
2、pA3、pA4)和3种碱性亚单位( Bl、 B2、13B3)。
晶体蛋白相对分子质量最小(20 X 10 ),包括7个
成员,7A~ 和7s。而其中7C、7D、7s构成人类的
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108 中国实验动物学报2008年4月第16卷第2期 Acta Lab Aniat Sci Sin.April,2008,Vo1.16,No.2
主要7晶体蛋白。不溶性蛋白(脲溶性和脲不溶性
配方提高晶体疏水性蛋白的溶解性。尿素作为一种
中性离液剂,可溶解和解折叠大多数的蛋白质,形成
蛋白)包括细胞骨架蛋白、膜蛋白等。晶体内的细
胞骨架蛋白包括微丝、中间纤维和念珠状纤维等。
既往研究主要集中在晶体水溶性蛋白,本研究
完全随机的构象,使所有的离子团暴露于溶液中。
硫脲是一种比尿素具有更强能力的变性剂,两者的
目标是全部晶体蛋白,采用尿素结合硫脲的裂解液
结合提高了溶解蛋白尤其是膜蛋白的能力。
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中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16。No.2 109
pH-3—
100×i0 一
MW
lO
量,使得低丰度蛋白的分离受到影响。而低丰度蛋
白在细胞内具有重要的调节功能,因此,分离低丰度
蛋白是一种挑战。从不同上样量的凝胶图像中可以
看到,不同的上样量可用来分析不同丰度的蛋白质:
当上样量为190 g时,晶体蛋白可得到很好的分
离,但低丰度蛋白的斑点数很少。结果与国内外文
献报道的晶体组织相似 。当上样量为882”g
时,高相对分子质量的低丰度蛋白得到很好的分离,
而高丰度蛋白点互相重叠。
本实验鉴定得到16种高丰度晶体蛋白,包括
aA、aB;pA1~8A4;8Bl~8B3;yA~7F和7S等。众所
周知,aB晶体蛋白是小分子热休克蛋白的一种,具
有分子伴侣作用,能保护其他蛋白,对各种变性剂包
括加热、紫外线和化学处理造成的蛋白质的凝聚具
图3 正常晶体所有高丰度蛋白一结构蛋白(a、8、
)的分布(上样量190 ttg)
有抑制作用,并对其他蛋白的溶解性具有促进作
Fig.2 2-DE gels showing the high abundance protein
用 。应激状态时,aB晶体蛋白主要和细胞骨架蛋
such as a,8and protein from the mouse lenses(190 ttg of
protein was loaded)
白相结合,对细胞产生保护作用…。
晶体蛋白在结构上具有自身的特点,由于晶体
本实验还鉴定出1种低丰度蛋白念珠状纤维结
蛋白的含量过高(90%左右),限制了样品的上样
构蛋白(beaded filament structure protein,BFSP/
4700 Refledor spec MC[BP=14568.168461
.
苦
器 g
辇
.
船I-『l脚
盯加 s,■s Precursor1d56 78 spee MC[BP=232’.10 ̄Ol
图4小鼠BFSP/iilensin的MS(上图)和m/z 1456.78的MS/MS分析图(下
图)
Fig.4 MS and MS/MS spectra of m0use BFSP/filensin.Upper:MS specturm:
lower:MS/MS spectrum of m/z 1456.78
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l l0 中国实验动物学报2008年4月第l6卷第2期Acta Lab Anim Sci Sin,April,2008,Vo1.16,No 2
iflensin)。它属细胞骨架蛋白,具有晶体特异性,只
在分化的晶体纤维细胞中表达。细胞骨架起着提供
胞质结构骨架、细胞运动和细胞大小、形态的决定和
维持作用。正常的细胞骨架蛋白功能和它们与晶体
蛋白的相互作用是透明晶体细胞结构的发育和维持
的基础。前面提及应激状态时aB可和细胞骨架蛋
参 考 文 献
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白相结合,与之结合的主要是中间纤维BFSP 。
BFSP的两大核心成分包括phakinin(BFSP.2、CP49)
【4] Ueda Y,Duncan MK,David LL.Lens proteomics:the accumulation
和filensin(BFSP.1、CP94、CP95、CP115)。已明确细
胞骨架蛋白的缺失可在大鼠中引起白内障 。
Jakobs等 首次发现细胞骨架蛋白突变可造成人类
先天性白内障,在一先天性白内障家系研究发现是
由于BFSP.2第三个外显子的核苷酸发生缺失突变,
导致读码框内233位的谷氨酸密码子缺失,蛋白结
构发生异常,使晶体失去透明。
晶体是一个无血管分布、无神经支配的组织,其
生理和病理变化受其它因素的影响较少。既往研究
热点晶体的研究集中在基因组水平,但随着技术的
发展,研究的对象由传统的单个基因、单个蛋白质转
变为基因组和蛋白质组。蛋白质组研究比基因组研
究更有实用性,有希望在蛋白质水平上(尤其是一
些重要蛋白)阐明白内障、后发障及白内障术后并
发症等晶体相关疾病的发病机制,并有可能提供此
类疾病预防与治疗的更有效的方法。
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[收稿151期]2007—10一l1
声明:本刊已入编:万方数据一数字化期刊群;中国核心期刊(遴选)数据库;中国科学引文
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