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已完成基因组测序的生物(植物部分)

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2024年6月3日发(作者:占柏)

水稻、玉米、大豆、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、番茄、拟南芥、杨树、

麻风树、苹果、桃、葡萄、花生

拟南芥 籼稻 粳稻 葡萄 番木瓜 高粱 黄瓜 玉米 栽培大豆 苹果 蓖麻 野草莓马铃

薯 白菜 野生番茄 番茄 梨 甜瓜 香蕉 亚麻 大麦 普通小麦 西瓜 甜橙 陆地棉 梅 毛

竹 桃 芝麻 杨树 麻风树 卷柏 狗尾草属 花生 甘蓝

物种 基因组大小和开放阅读框 文献

Sesamum indicum L. Sesame 芝麻(2n = 26) 293.7 Mb, 10,656 orfs 1

Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2

Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3

Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4

Prunus persica Peach 桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5

Aegilops tauschii 山羊草(DD) 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6

Triticum urartu 乌拉尔图小麦(AA) 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7

moso bamboo (Phyllostachys heterocycla) 毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8

Cicer arietinum Chickpea鹰嘴豆 ~738-Mb,28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740

Mb), 27,571 orfs 10

Prunus mume 梅 280 Mb, 31,390 orfs 11

Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12

Gossypium hirsutum L. 雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13

Citrus sinensis 甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14

甜橙 367 Mb 15

Citrullus lanatus watermelon 西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16

Betula nana dwarf birch,矮桦 450 Mb 17

Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻(产油藻类之一) 28.7 Mb,

11,973 orfs 18

Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19

Hordeum vulgare L. barley 大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb,26,159 high confidence

orfs,53,000 low confidence orfs 20

Gossypium raimondii cotton 雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976

orfs 21

2024年6月3日发(作者:占柏)

水稻、玉米、大豆、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、番茄、拟南芥、杨树、

麻风树、苹果、桃、葡萄、花生

拟南芥 籼稻 粳稻 葡萄 番木瓜 高粱 黄瓜 玉米 栽培大豆 苹果 蓖麻 野草莓马铃

薯 白菜 野生番茄 番茄 梨 甜瓜 香蕉 亚麻 大麦 普通小麦 西瓜 甜橙 陆地棉 梅 毛

竹 桃 芝麻 杨树 麻风树 卷柏 狗尾草属 花生 甘蓝

物种 基因组大小和开放阅读框 文献

Sesamum indicum L. Sesame 芝麻(2n = 26) 293.7 Mb, 10,656 orfs 1

Oryza brachyantha短药野生稻 261 Mb, 32,038 orfs 2

Chondrus crispus Red seaweed爱尔兰海藻 105 Mb, 9,606 orfs 3

Pyropia yezoensis susabi-nori海苔 43 Mb, 10,327 orfs 4

Prunus persica Peach 桃 226.6 of 265 Mb 27,852 orfs 5

Aegilops tauschii 山羊草(DD) 4.23 Gb (97% of the 4.36), 43,150 orfs 6

Triticum urartu 乌拉尔图小麦(AA) 4.66 Gb (94.3 % of 4.94 Gb, 34,879 orfs 7

moso bamboo (Phyllostachys heterocycla) 毛竹 2.05 Gb (95%) 31,987 orfs 8

Cicer arietinum Chickpea鹰嘴豆 ~738-Mb,28,269 orfs 9 520 Mb (70% of 740

Mb), 27,571 orfs 10

Prunus mume 梅 280 Mb, 31,390 orfs 11

Gossypium hirsutum L.陆地棉 2.425 Gb 12

Gossypium hirsutum L. 雷蒙德氏棉 761.8 Mb 13

Citrus sinensis 甜橙 87.3% of ~367 Mb, 29,445 orfs 14

甜橙 367 Mb 15

Citrullus lanatus watermelon 西瓜 353.5 of ~425 Mb (83.2%) 23,440 orfs 16

Betula nana dwarf birch,矮桦 450 Mb 17

Nannochloropsis oceanica CCMP1779微绿球藻(产油藻类之一) 28.7 Mb,

11,973 orfs 18

Triticum aestivum bread wheat普通小麦 17 Gb, 94,000 and 96,000 orfs 19

Hordeum vulgare L. barley 大麦 1.13 Gb of 5.1 Gb,26,159 high confidence

orfs,53,000 low confidence orfs 20

Gossypium raimondii cotton 雷蒙德氏棉 D subgenome,88% of 880 Mb 40,976

orfs 21

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