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亲子鉴定中STR基因座D2S1338突变分析与解决对策杨文海

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2024年7月31日发(作者:濮阳乐安)

亲子鉴定中STR基因座D2S1338突变分析与解决对策 杨文海

发布时间:2023-06-20T09:47:35.362Z 来源:《世界复合医学》2023年6期 作者: 杨文海

[导读] 探讨亲子鉴定中短串联重复序列(STR)基因座D2S1338突变情况

蚌埠市企业职工疾病研究所 邮编:233000

摘要:目的:探讨亲子鉴定中短串联重复序列(STR)基因座D2S1338突变情况,并提出相应的解决对策。方法:对基因组DNA进行

提取,选择IdentifilerTM15+1、AGCU21+1系统的STR基因座荧光标记试剂盒检测36个常染色体STR基因座。结果:使用IdentifilerTM15+1系

统检测后得知,除D2S1338基因座的分型外,其余14个被检基因座均与遗传规律相符。使用AGCU21+1系统检测后得知,STR基因座荧光标

记试剂盒补充检测,所检测的21个常染色体STR基因座均与遗传规律相符。结论:若STR基因座D2S1338发生突变,则需要使用AGCU21+1

系统予以补充检测。

关键词:亲子鉴定;STR基因座D2S1338;突变分析;解决对策

短串联重复序列(STR)是一类存在高度多态性的DNA序列,在人类基因组中广泛存在。当前不论是在国内还是在国外,在进行亲子鉴

定中,检测人员多选择STR基因座分型法进行检测。然而因受到环境诱变剂、射线等因素的不良影响,STR基因座可能会出现变异的不良情

况,复制滑脱是导致STR基因座突变的主要因素,常用STR基因座的突变率约为0.1%-0.5%,因此需要加强对该种情况的重视[1]。本研究将

予以如下报道。

1.资料与方法

1.1一般资料

研究选取案例为30岁争议父亲、25岁母亲、出生4个月的男孩。

1.2方法

(1)收集血液样本。抽取三人0.5ml的静脉血,分别将其放置于装有EDTA抗凝剂的试管中,之后将其放置于-20oC的环境进行保存。

(2)提取DNA。检测人员选择Chelex-100法对血液样本中的基因组DNA进行提取。

(3)PCR扩增与电泳分型。选择IdentifilerTM15+1系统对15个常染色体STR基因座及性别基因座Amelogenin进行检测。选择AGCU21+1

系统对21个常染色体STR基因座及性别基因座Amelogenin进行检测。

1.3观察指标

①IdentifilerTM15+1系统检测结果。

②AGCU21+1系统检测结果。

2.结果

2.1IdentifilerTM15+1系统检测结果

使用IdentifilerTM15+1系统检测后得知,除D2S1338基因座的分型外,其余14个被检基因座均与遗传规律相符,见表1。

表 1 IdentifilerTM15+1系统检测结果

基因型

轨迹

争议父

PI

母亲孩子

D8S1179

D21S11

D7S820

CSFlP0

D3S1358

TH01

D13S317

D16S539

D2S1338

D19S433

VWA

TPOX

D18S5l

D5S818

FGA

Amel

10/11

30/32.2

11/11

10/10

16/17

7/9

8/8

9/11

18/24

14/14

14/14

8/8

16/18

11/14

23/24

XY

11/13

29/31.2

8/8

12/12

16/16

7/9

8/11

9/13

17/24

14.2/17.2

16/17

9/11

13/17

10/11

23/25

XX

11/13

29/30

8/11

10/12

16/17

7/7

8/11

9/11

23/24

14/17.2

14/17

8/11

13/18

11/14

23/25

XY

1.583781

1.789547

2.881012

4.110151

2.424828

1.876875

1.907667

1.934234

0.000861

4.050221

3.895596

1.947039

10.989009

45.871557

1.559087

/

2.2AGCU21+1系统检测结果

使用AGCU21+1系统检测后得知,STR基因座荧光标记试剂盒补充检测,所检测的21个常染色体STR基因座均与遗传规律相符,见表

2。

表 2 AGCU21+1系统检测结果

基因型

轨迹

D6S474

D12ATA63

争议父

PI

母亲孩子

15/17

16/17

15/15

17/17

15/15

16/17

1.823901

2.624432

D22S1045

D10S1248

D1Sl677

D11S4463

DlSl627

D3S4529

D2S441

D6S1017

D4S2408

D19S433

D17S1301

D1GATA113

D18S853

D20S482

D14S1434

D9S1122

D2S1776

D10S1435

D5S2500

Amel

11/15

13/15

14/14

15/15

13/14

14/15

10/11.3

10/10

10/11

14/14

12/12

7/12

11/14

14/14

11/12

12/13

9/11

8/13

14/17

XY

14/17

12/13

14/16

14/16

13/14

14/16

10/10

10/12

9/9

14.2/17.2

11/12

7/12

11/12

12/14

14/14

12/12

11/12

12/12

18/18

XX

11/14

12/13

14/14

14/15

13/14

15/16

10/10

10/10

9/11

14/17.2

11/12

7/12

12/14

14/14

11/14

12/12

11/11

12/13

17/18

XY

2.505636

1.072358

2.174234

3.746172

1.253244

1.454201

2.030702

2.727088

4.666771

4.050221

1.547191

1.213633

2.095239

2.499064

3.192191

1.705283

1.706512

2.015821

2.340517

/

3.讨论

IdentifilerTM15+1系统包含13个核心STR基因座,便于在较多的法医DNA实验室之间对数据进行比对及共享。

90%的STR基因座突变均为一步突变,而重复次数少于10的基因座突变则少见,多于10的基因座突变则较多;且多为父方基因突变。在

本研究中,D2S1338为多于10的基因座突的基因座,可判定其产生一步突变;若仅按照分型结果,则将无法判定突变的主要来源。

因STR基因座出现基因突变情况较为多见,因此进行亲子鉴定时,若发现仅1个或2个STR基因座与孟德尔遗传规律相悖,则为防止因

STR基因突变而使得亲子关系发生错误,需要额外检测遗传标记,按照结果进行分析[2]。一般情况下,经过累积非父排除率大于99.99%的

多个基因座的检测,若存在超过3个的基因座与遗传规律相悖,则才能够排除亲权关系,特别是对于仅父亲一人参与的单亲鉴定,因缺少生

母基因,当争议父亲与生父存在近亲血缘关系时,则较易导致结果出现错误。

AGCU21+1STR荧光检测试剂盒共有21个非CODISSTR基因座,不会同IdentifilerTM15+1系统发生基因座重叠的不良情况,然而

D2S1338位点应在两个试剂盒交叉部分,进行一次检测便可得到21个STR基因座信息。依据本研究结果可知,检测人员利用AGCU21+1系统

对21个STR基因座进行检测,通过结果可知,所有分型结果均与孟德尔遗传定律相符,最终对被检者之间的血缘关系予以了准确判定,确

定D2S1338基因座出现基因突变。

参考文献:

[1]苏丽娟,王忆霄,单鑫,等.306例亲子鉴定案件基因突变的观察与分析[J].基因组学与应用生物学,2019,38(8):3511-3514.

[2]康冰,吴东,王鑫,等.亲子鉴定中23个STR基因座在河南汉族人群中的突变分析[J].中国优生与遗传杂志,2021,29(12):1707-1709.

2024年7月31日发(作者:濮阳乐安)

亲子鉴定中STR基因座D2S1338突变分析与解决对策 杨文海

发布时间:2023-06-20T09:47:35.362Z 来源:《世界复合医学》2023年6期 作者: 杨文海

[导读] 探讨亲子鉴定中短串联重复序列(STR)基因座D2S1338突变情况

蚌埠市企业职工疾病研究所 邮编:233000

摘要:目的:探讨亲子鉴定中短串联重复序列(STR)基因座D2S1338突变情况,并提出相应的解决对策。方法:对基因组DNA进行

提取,选择IdentifilerTM15+1、AGCU21+1系统的STR基因座荧光标记试剂盒检测36个常染色体STR基因座。结果:使用IdentifilerTM15+1系

统检测后得知,除D2S1338基因座的分型外,其余14个被检基因座均与遗传规律相符。使用AGCU21+1系统检测后得知,STR基因座荧光标

记试剂盒补充检测,所检测的21个常染色体STR基因座均与遗传规律相符。结论:若STR基因座D2S1338发生突变,则需要使用AGCU21+1

系统予以补充检测。

关键词:亲子鉴定;STR基因座D2S1338;突变分析;解决对策

短串联重复序列(STR)是一类存在高度多态性的DNA序列,在人类基因组中广泛存在。当前不论是在国内还是在国外,在进行亲子鉴

定中,检测人员多选择STR基因座分型法进行检测。然而因受到环境诱变剂、射线等因素的不良影响,STR基因座可能会出现变异的不良情

况,复制滑脱是导致STR基因座突变的主要因素,常用STR基因座的突变率约为0.1%-0.5%,因此需要加强对该种情况的重视[1]。本研究将

予以如下报道。

1.资料与方法

1.1一般资料

研究选取案例为30岁争议父亲、25岁母亲、出生4个月的男孩。

1.2方法

(1)收集血液样本。抽取三人0.5ml的静脉血,分别将其放置于装有EDTA抗凝剂的试管中,之后将其放置于-20oC的环境进行保存。

(2)提取DNA。检测人员选择Chelex-100法对血液样本中的基因组DNA进行提取。

(3)PCR扩增与电泳分型。选择IdentifilerTM15+1系统对15个常染色体STR基因座及性别基因座Amelogenin进行检测。选择AGCU21+1

系统对21个常染色体STR基因座及性别基因座Amelogenin进行检测。

1.3观察指标

①IdentifilerTM15+1系统检测结果。

②AGCU21+1系统检测结果。

2.结果

2.1IdentifilerTM15+1系统检测结果

使用IdentifilerTM15+1系统检测后得知,除D2S1338基因座的分型外,其余14个被检基因座均与遗传规律相符,见表1。

表 1 IdentifilerTM15+1系统检测结果

基因型

轨迹

争议父

PI

母亲孩子

D8S1179

D21S11

D7S820

CSFlP0

D3S1358

TH01

D13S317

D16S539

D2S1338

D19S433

VWA

TPOX

D18S5l

D5S818

FGA

Amel

10/11

30/32.2

11/11

10/10

16/17

7/9

8/8

9/11

18/24

14/14

14/14

8/8

16/18

11/14

23/24

XY

11/13

29/31.2

8/8

12/12

16/16

7/9

8/11

9/13

17/24

14.2/17.2

16/17

9/11

13/17

10/11

23/25

XX

11/13

29/30

8/11

10/12

16/17

7/7

8/11

9/11

23/24

14/17.2

14/17

8/11

13/18

11/14

23/25

XY

1.583781

1.789547

2.881012

4.110151

2.424828

1.876875

1.907667

1.934234

0.000861

4.050221

3.895596

1.947039

10.989009

45.871557

1.559087

/

2.2AGCU21+1系统检测结果

使用AGCU21+1系统检测后得知,STR基因座荧光标记试剂盒补充检测,所检测的21个常染色体STR基因座均与遗传规律相符,见表

2。

表 2 AGCU21+1系统检测结果

基因型

轨迹

D6S474

D12ATA63

争议父

PI

母亲孩子

15/17

16/17

15/15

17/17

15/15

16/17

1.823901

2.624432

D22S1045

D10S1248

D1Sl677

D11S4463

DlSl627

D3S4529

D2S441

D6S1017

D4S2408

D19S433

D17S1301

D1GATA113

D18S853

D20S482

D14S1434

D9S1122

D2S1776

D10S1435

D5S2500

Amel

11/15

13/15

14/14

15/15

13/14

14/15

10/11.3

10/10

10/11

14/14

12/12

7/12

11/14

14/14

11/12

12/13

9/11

8/13

14/17

XY

14/17

12/13

14/16

14/16

13/14

14/16

10/10

10/12

9/9

14.2/17.2

11/12

7/12

11/12

12/14

14/14

12/12

11/12

12/12

18/18

XX

11/14

12/13

14/14

14/15

13/14

15/16

10/10

10/10

9/11

14/17.2

11/12

7/12

12/14

14/14

11/14

12/12

11/11

12/13

17/18

XY

2.505636

1.072358

2.174234

3.746172

1.253244

1.454201

2.030702

2.727088

4.666771

4.050221

1.547191

1.213633

2.095239

2.499064

3.192191

1.705283

1.706512

2.015821

2.340517

/

3.讨论

IdentifilerTM15+1系统包含13个核心STR基因座,便于在较多的法医DNA实验室之间对数据进行比对及共享。

90%的STR基因座突变均为一步突变,而重复次数少于10的基因座突变则少见,多于10的基因座突变则较多;且多为父方基因突变。在

本研究中,D2S1338为多于10的基因座突的基因座,可判定其产生一步突变;若仅按照分型结果,则将无法判定突变的主要来源。

因STR基因座出现基因突变情况较为多见,因此进行亲子鉴定时,若发现仅1个或2个STR基因座与孟德尔遗传规律相悖,则为防止因

STR基因突变而使得亲子关系发生错误,需要额外检测遗传标记,按照结果进行分析[2]。一般情况下,经过累积非父排除率大于99.99%的

多个基因座的检测,若存在超过3个的基因座与遗传规律相悖,则才能够排除亲权关系,特别是对于仅父亲一人参与的单亲鉴定,因缺少生

母基因,当争议父亲与生父存在近亲血缘关系时,则较易导致结果出现错误。

AGCU21+1STR荧光检测试剂盒共有21个非CODISSTR基因座,不会同IdentifilerTM15+1系统发生基因座重叠的不良情况,然而

D2S1338位点应在两个试剂盒交叉部分,进行一次检测便可得到21个STR基因座信息。依据本研究结果可知,检测人员利用AGCU21+1系统

对21个STR基因座进行检测,通过结果可知,所有分型结果均与孟德尔遗传定律相符,最终对被检者之间的血缘关系予以了准确判定,确

定D2S1338基因座出现基因突变。

参考文献:

[1]苏丽娟,王忆霄,单鑫,等.306例亲子鉴定案件基因突变的观察与分析[J].基因组学与应用生物学,2019,38(8):3511-3514.

[2]康冰,吴东,王鑫,等.亲子鉴定中23个STR基因座在河南汉族人群中的突变分析[J].中国优生与遗传杂志,2021,29(12):1707-1709.

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