2024年4月10日发(作者:汉季)
可以。DNA的碱基在260nm处有吸收。用紫外分光光度计测260nm处DNA
分子的OD值,就能通过朗伯-比尔定律OD=εlc换算出浓度。式子里l是吸收光
路的长度;c是浓度,单位一般用μg/ml;ε是吸光系数,双链DNA一般取0.02ml/
(μg·cm),单链DNA因为增色效应,ε要大一些,取0.05ml/(μg·cm)。
如果知道一个DNA片段的碱基数,还可以换算出DNA片段的物质的量浓度.
取1μDNA,用ddH2O水稀释到1ml,以1ml ddH2O为对照,紫外分光光度计
测定OD260,OD280,OD260/OD280(都在 1。8左右之间,说明 DNA样品纯
度较高),concentration。
另,基因组DNA1%的琼脂糖凝胶电泳检测均呈现完整清晰条带没有
拖尾,说明 DNA 样品的完整性好,也可通过DNA marker 推算出DNA浓度。
目的: 了解紫外吸收检测DNA浓度与纯度的原理,掌握测定方法.
原理: 核酸的最大吸收波长为260nm,蛋白质为280nm,在波长260nm
时,1OD值相当于双链DNA浓度为50μg/ml,单链
寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过
测定在260nm和280nm的OD值的比值
(OD260/OD280),估计核酸的纯度。纯净DNA的比值为1。8, RNA
为2。0.若比值高于1。8说明DNA样品中的RNA尚未除
尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比值降低。270nm存在高吸收表
明有酚的干扰。 紫外分光光度法只能用于测定浓度
大于0.25μg/ml的核酸溶液,对浓度更小的样品,可采用荧光分光光度
法。
试剂与仪器: 提取的质粒DNA,紫外分光光度仪.
操作步骤:
1) 分光光度计先用水在260nm和280nm两个波长下校零。
2) 取质粒DNA样品2μl,用水稀释100倍,转入分光光度计的石英比
色杯中。
3) 在260nm和280nm分别读出样品光密度值.如果样品浓度单位为
μg/μl,则样品DNA浓度为OD 值的10倍,即如
OD260〈/SUB〉=0。1,则样品浓度即为1μg/μl。
4) 若OD/OD〈SUB〉280大于1。8,说明
仍有RNA,可以考虑用RNA酶处理样品,若小于1.8,说
明样品中含有蛋白质或酚,应再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀纯化DNA。
“1od=0.05ug/ul”这个说法很不严谨。按照我的理解,这句话的意思是:在光程为
1cm的吸收池内,测得双链DNA的OD值为1时,DNA溶液的浓度为0.05μg/μL.
因为OD=εlc,这里OD=1,光程l通常都是1cm,双链DNA的吸收系数ε=0.02mL/
(μg·cm),那么浓度c=OD/(εl)=1/[0。02mL/(μg·cm)*1cm]=50μg/mL=0。
05μg/μL.
楼主的测定在类似条件下,所以l=1cm,ε=0.02mL/(μg·cm),而OD=0。45,
所以浓度c=OD/(εl)=0.45/[0。02mL/(μg·cm)*1cm]
=22.5μg/mL=0.0225μg/μL。
实验准备工作:
1
所用离心管、枪头要洗净、烘干(最好灭菌)。
2
试剂配制:
1 M Tris—HCl (pH 8。0): 称取Tris-Base 121g, 加入约800 ml 水在磁
力搅拌器上搅拌,使其充分溶解后加入浓盐酸调整pH至8.0后加水定溶至1000
ml. 灭菌后于室温保存。
2024年4月10日发(作者:汉季)
可以。DNA的碱基在260nm处有吸收。用紫外分光光度计测260nm处DNA
分子的OD值,就能通过朗伯-比尔定律OD=εlc换算出浓度。式子里l是吸收光
路的长度;c是浓度,单位一般用μg/ml;ε是吸光系数,双链DNA一般取0.02ml/
(μg·cm),单链DNA因为增色效应,ε要大一些,取0.05ml/(μg·cm)。
如果知道一个DNA片段的碱基数,还可以换算出DNA片段的物质的量浓度.
取1μDNA,用ddH2O水稀释到1ml,以1ml ddH2O为对照,紫外分光光度计
测定OD260,OD280,OD260/OD280(都在 1。8左右之间,说明 DNA样品纯
度较高),concentration。
另,基因组DNA1%的琼脂糖凝胶电泳检测均呈现完整清晰条带没有
拖尾,说明 DNA 样品的完整性好,也可通过DNA marker 推算出DNA浓度。
目的: 了解紫外吸收检测DNA浓度与纯度的原理,掌握测定方法.
原理: 核酸的最大吸收波长为260nm,蛋白质为280nm,在波长260nm
时,1OD值相当于双链DNA浓度为50μg/ml,单链
寡核苷酸的含量为30μg/ml,可以据此来计算核酸样品的浓度,还可通过
测定在260nm和280nm的OD值的比值
(OD260/OD280),估计核酸的纯度。纯净DNA的比值为1。8, RNA
为2。0.若比值高于1。8说明DNA样品中的RNA尚未除
尽,若样品中含有酚和蛋白质将导致比值降低。270nm存在高吸收表
明有酚的干扰。 紫外分光光度法只能用于测定浓度
大于0.25μg/ml的核酸溶液,对浓度更小的样品,可采用荧光分光光度
法。
试剂与仪器: 提取的质粒DNA,紫外分光光度仪.
操作步骤:
1) 分光光度计先用水在260nm和280nm两个波长下校零。
2) 取质粒DNA样品2μl,用水稀释100倍,转入分光光度计的石英比
色杯中。
3) 在260nm和280nm分别读出样品光密度值.如果样品浓度单位为
μg/μl,则样品DNA浓度为OD 值的10倍,即如
OD260〈/SUB〉=0。1,则样品浓度即为1μg/μl。
4) 若OD/OD〈SUB〉280大于1。8,说明
仍有RNA,可以考虑用RNA酶处理样品,若小于1.8,说
明样品中含有蛋白质或酚,应再用酚/氯仿抽提,以乙醇沉淀纯化DNA。
“1od=0.05ug/ul”这个说法很不严谨。按照我的理解,这句话的意思是:在光程为
1cm的吸收池内,测得双链DNA的OD值为1时,DNA溶液的浓度为0.05μg/μL.
因为OD=εlc,这里OD=1,光程l通常都是1cm,双链DNA的吸收系数ε=0.02mL/
(μg·cm),那么浓度c=OD/(εl)=1/[0。02mL/(μg·cm)*1cm]=50μg/mL=0。
05μg/μL.
楼主的测定在类似条件下,所以l=1cm,ε=0.02mL/(μg·cm),而OD=0。45,
所以浓度c=OD/(εl)=0.45/[0。02mL/(μg·cm)*1cm]
=22.5μg/mL=0.0225μg/μL。
实验准备工作:
1
所用离心管、枪头要洗净、烘干(最好灭菌)。
2
试剂配制:
1 M Tris—HCl (pH 8。0): 称取Tris-Base 121g, 加入约800 ml 水在磁
力搅拌器上搅拌,使其充分溶解后加入浓盐酸调整pH至8.0后加水定溶至1000
ml. 灭菌后于室温保存。