2024年3月25日发(作者：殳绮烟)
第５１卷
２０１２年
第４期
７月
中山大学学报（自然科学版）
ＡＣＴＡ ＳＣＩＥＮＴＩＡＲＵＭ ＮＡＴＵＲＡＬＩＵＭ ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ ＳＵＮＹＡＴＳＥＮＩ
Ｖｏ１．５１ Ｎｏ．４
Ｊｕ１． ２０１２
江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析
李婷婷 ，陈 斌 ，陈省平 ，刘 翠 ，姚 雪 ，陈伟洲 ，赖学文 ，刘 涛
（１．中国海洋大学海洋生命学院，山东青岛２６６００３；
２．中山大学中山医学院，广东广州５１００８０；
３．汕头大学，广东汕头５１５０６３；
４．汕头市水产研究所，广东汕头５１５０００）
摘 要：测定了江蓠属Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ和龙须菜属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ５个物种的２３个群体的ＩＴＳ（含５．８Ｓ ｒＤＮＡ）序列，
并结合ＧｅｎＢａｎｋ数据库中现有江蓠科Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ的１６个物种的ＩＴＳ序列进行分析，在不同分类阶元中探讨了
序列变异和和系统进化关系。江蓠科海藻ＩＴＳ序列长度在８９３～１ ５０８ ｂｐ之间，种间遗传距离在０．０４１～０．６００之
间，种内遗传距离在０．０００～０．０１２之间，其种间遗传距离均大于种内遗传距离；ＩＴＳ系统发育聚类结果显示江
蓠科分为两大分支，分别是江蓠属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ分支、龙须菜属／蓠生藻属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ分支；江蓠科海藻５．８Ｓ
序列种内种间变异￣ｌＬ＇ｂ，但存在稳定的属间区分位点，可用于属以上水平的分类鉴定；中国、美国和俄罗斯三
地的真江蓠群体的ＩＴＳ序列存在９个稳定的变异位点，可以将不同地理群体区分开。
关键词：江蓠科；江蓠属；龙须菜属；ＩＴＳ；５．８Ｓ ｒＤＮＡ；系统发育
中图分类号：Ｑ９４９；Ｑ３４９ 文献标志码：Ａ 文章编号：０５２９—６５７９（２０１２）０４—００９７—０９
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｆｉｖｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ Ｓｐｅｃｉｅｓ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）Ｂａｓｅｄ ｏｎ ＩＴＳ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ
ＬＩ Ｔｉｎｇｔｉｎｇ ，ＣＨＥＮ Ｂｉｎ ，ＣＨＥＮ Ｓｈｅｎｇｐｉｎｇ ，ＹＡＯ Ｘｕｅ ，ＬＩＵ Ｃｕｉ ，
ＣＨＥＮ Ｗｅｉｚｈｏｕ３
。
Ｉ Ｘｕｅｗｅｎ４
．
ＬＩＵ Ｔａｏ、
（１．Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍａｒｉｎｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｏｃｅａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎａ，Ｑｉｎｇｄａｏ ２６６００３，Ｃｈｉｎａ；
２．Ｚｈｏｎｇｓｈａｎ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，Ｓｕｎ Ｙａｔ—ｓｅｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ ５１００８０，Ｃｈｉｎａ；
３．Ｓｈａｎｔｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｔｏｕ ５ １ ５０６３，Ｃｈｉｎａ；
４．Ｓｈａｎｔｏｕ Ｆｉｓｈｅｒｉｅｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｓｈａｎｔｏｕ ５ １ ５０００，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）．
Ｗｅ ｃｏｍｐａｒｅｄ ＩＴＳ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ５．８Ｓ ｒＤＮＡ）ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｗｅｎｔｙ ｔｈｒｅｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｆｉｖｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ａｎｄ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ），ｗｉｔｈ ｔｈｅ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ １６ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅｎ ｓｐｅ—
ｃｉｅｓ ｄｏｗｎｌｏａｄｅｄ ｆｒｏｍ ＧｅｎＢａｎｋ ｄａｔａｂａｓｅ．Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉ－
ａｃｅａｅ ｖａｒｉｅｓ ｆｒｏｍ ８９３ ｔｏ １ ５０８ ｂｐ．Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｉｃ ｇｅｎｅｔｉｆｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｒａｎｇｅｓ ｆｒｏｍ ０．０４１ ｔｏ ０．６００；ｔｈｅ ｉｎ—
ｔｒａｓｐｅｃｉｆｉｃ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｒａｎｇｅｓ ｆｒｏｍ ０．０００ ｔｏ ０．０１２，ｔｈｅ ｆｏｒｍｅｒ ｉｓ ｍｕｃｈ ｈｉｇｈｅｒ ｔｈａｎ ｔｈｅ ｌａｔｔｅｒ．Ｔｗｏ
ｍａｉｎ ｌｉｎｅａｇｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｗｅｒｅ ｆｒｏｍ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ＼Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ／Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ
．
５．８Ｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｈａｓ ｌｏｗ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｍｏｎｇ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ａｍｏｎｇ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ，ｂｕｔ ｔｈｅ ｄｉｓｔｉｎｃｔ
ｓｉｔｅｓ ｗｅｒｅ ｆｏｕｎｄ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ｇｅｎｅｒａ ａｎｄ ｃａｎ ｂｅ ｕｓｅｄ ｏｎ ｇｅｎｕｓ ｌｅｖｅｌ ｏｒ ａｂｏｖｅ．Ｔｈｅｒｅ ａｒｅ ９ ｍｕｔａｎｔ ｓｉｔｅｓ ｔｈａｔ
ｃａｎ ｂｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈ ｔｈｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ ｆｒｏｍ Ｃｈｉｎａ
Ｒｕｓｓｉａ ａｎｄ ＵＳＡ．
，
Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ；Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ；Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ；ＩＴＳ；５．８Ｓ ｒＤＮＡ；ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｃ
收稿日期：２０１１—１１—０７
基金项目：国家科技基础性工作专项资助项目（２００７ＦＹ２１０５００）；广东省科技攻关资助项目（２００６Ｂ２０２０１０５６，
２０１０Ｂ０６０２０００１０，２０１０Ｂ０２０２０１０１５）
作者简介：李婷婷（１９８９年生），女，硕士研究生；通讯作者：刘涛；Ｅ—ｍａｉｌ：ｌｉｕｔａｏ＠ＯＵＣ．ｅｄｕ．ｃｎ
中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
江蓠科Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ在自然分类系统上属于
红藻ｆ－１ Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ江蓠目Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，包括江蓠
属Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ、龙须菜属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ、蓠生藻属
Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ、Ｃｕｒｄｉｅａ、Ｍｅｌａｎｔｈａｌｉａ
ＩＴＳ１—５．８Ｓ—ＩＴＳ２结构（本文将ＩＳ１—５．８Ｓ— Ｔ
ＩＴＳ２简称为ＩＴＳ）。此结构中５．８Ｓ是高度保守的基
因序列，而ＩＴＳ１和ＩＴＳ２是进化速度较快的序列，
利用ＩＴＳ序列可以从不同分类水平上探讨系统进化
关系。本文通过对来自江蓠属和龙须菜属总５个物 和Ｃｏｎｇｒａｃｉｌａｒｉａ ７个属。在红藻门中，江蓠科无论
是解剖学层面¨ 还是分子学层面 Ｊ，都是很明
种２３个种群的ＩＴＳ序列进行扩增，并与ＧｅｎＢａｎｋ
中江蓠科海藻ＩＴＳ序列进行比对分析，从分子水平
上阐明江蓠科海藻系统发育和种群水平的遗传变
异，为江蓠科海藻的分类和鉴定提供更多数据。
确的一个科，但是因缺乏足够多的形态学和生殖结
构特征，其属间种问存在着复杂的分类关系 一 。
在过去的２０年里，分子生物学技术不断的应用到
江蓠科分类研究中，揭示江蓠科种水平上的系统发
生关系。目前江蓠科分子系统学研究多采用１８Ｓ
ｒＤＮＡ［ ｏ一。
、
１材料与方法
１．１实验材料
Ｒｕｂｉｓｃ０ ｓｐａｃｅｒ［ 一 ３。
、
ＩＴＳ （ｉｎｔｅｍａｌ
ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒ） 。， ， 、ｒｂｃＬ Ｅ 一 、ｃｏｘ２—
本实验所用江蓠科海藻５个物种２３个群体由
中国海洋大学大型海藻种质库提供（见表１）。每
３１１３３９ 和ｐｓｂＡ［ 等序列。
ＩＴＳ序列包括ＩＳ１和ＩＴＴＳ２，是分别介于１８Ｓ与
个群体选取２～３株个体进行实验，总６６株实验材
料
５．８Ｓ、５．８ｓ与２８Ｓ ｒＤＮＡ之间的非编码序列，呈
表１实验材料信息 ’
Ｔａｂｌｅ １ Ｓａｍｐｌｅｓ ｕｓｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ
１） ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ江蓠属；Ｇｐ．：Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓ￣龙须菜属；２）Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ原产地为印度尼西亚；３）Ｇ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙＵａ原产
地为俄罗斯；４）ｅ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙＵａ原产地为美国，由中国海洋大学宫庆礼教授提供
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析
１．２实验方法
果得到的最适核酸替换模型为ＧＴＲ＋Ｉ＋Ｇ（参数：
Ｂａｓｅ ｆｒｅｑｕｅｎｃｉｅｓ：Ａ＝０．２６８ ６，Ｃ＝０．１７０ ８，Ｇ＝
０．２３７ ２，Ｔ＝０．３２３ ４；ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｒａｔｅ ｍａｔｒｉｘ：Ａ—
１．２．１总ＤＮＡ提取 总ＤＮＡ提取采用改进的
ＣＴＡＢ法 。所提取ＤＮＡ用Ｗ＝１％琼脂糖凝胶进
行电泳检测，使用ＮａｎｏＤｒｏｐ ＮＤ一１０００仪器，测定
Ａ２６ｏ ２８０、Ａ ６ｏ／／４：３。比值，对ＤＮＡ浓度和纯度进行
质量评价，并将ＤＮＡ模板浓度统一调整到５０ ｎｇ／
Ｌ。
Ｃ＝１．１９ ８，Ａ—Ｇ＝２．３８５ ８，Ａ—Ｔ＝１．３３４ １，Ｃ
—
Ｇ＝１．１４３ ２，Ｃ—Ｔ＝２．８６８ ０，Ｇ—Ｔ＝１．０００ ０；
ｐｒｏｐｏ￣ｉｏｎ ｏｆ ｉｎｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅｓ＝０．０９３ ０，ｇａｍｍａ ｐａ－
ｒａｍｅｔｅｒ＝２．５１０ ４），利用以上数据在ＰＡＵＰ４．０中
１．２．２ ＰＣＲ扩增 用于ＩＴＳ序列扩增的引物为
ＴＷ８ １：５’一ＧＧＧＡＴＣＣＧｒｒ］ ＣＣＧＴＡＧＧＴＧＡＡＣＣＴＧＣ
一
依据邻接法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ ｊｏｉｎｉｎｇ，ＮＪ）和最大似然法
（Ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ，ＭＬ）构建系统树，自举值
Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ为１ ０００次重复。依据最大简约法（Ｍａｘｉ—
３’： ＡＢ２８： ５’ 一 ＧＣＣＡＴＣＣＡＴＡＴＧＣＴＩ＇ＡＡ（ Ｔ—
ＴＣＡＧＣＧＧＧＴ一３ ，引物由上海博尚生物技术有
限公司合成。ＰＣＲ反应体系为２５ ，反应体系：
ｄｄＨ２Ｏ １６．８ ｔｘＬ，１０×Ｂｕｆｆｅｒ ２．５ Ｌ，ＭｇＣ１２（２５
ｍｍｏｌ／Ｌ）２．３ Ｌ，ｄＮＴＰ ２．０ ＩｘＬ，正反引物（１０
ｉｘｍｏｌ／Ｌ）各０．１ ＩｘＬ，ＤＮＡ模板（５０ ｎｇ／ｔｘＬ）１．０
ＩＬＬ，Ｔａｑ ＤＮＡ聚合酶（５ Ｕ／ｐ，Ｌ）０．２ ＩＬＬ。ＰＣＲ扩
增程序：９４℃预处理６ ｍｉｎ后，９４℃变性１ ｍｉｎ，
５１℃复性１ ｍｉｎ，７２ ｏＣ延伸１ ｍｉｎ，总３５个循环，
最后在７２℃延伸１０ ｍｉｎ，４℃保存。
１．２．３ ＰＣＲ产物纯化、克隆及测序ＰＣＲ产物用
ＴＩＡＮｇｅｌ Ｍｉｄｉ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ试剂盒（北京天根生
化科技有限公司）胶回收纯化后与ｐＭＤ１９一Ｔ载
体（ＴａＫａＲａ宝生物工程有限公司）连接后转化至
感受态Ｅ．ｃｏｌｉ ＴＯＰ １０（北京天根生化科技有限公
司）中，经氨苄青霉素抗性筛选，每份ＰＣＲ产物
挑取３个阳性克隆进行扩大培养，菌液ＰＣＲ扩增
并利用Ｗ＝１％琼脂糖凝胶电泳检测插入片段大小，
委托上海英骏生物技术有限公司公司进行双向测
序。
１．２．４数据分析利用ＳｅｑＭａｎ ７．１．０软件对测序
数据进行拼接和质量矫正，并与ＧｅｎＢａｎｋ中下载
到的江蓠科１６个物种的１９条ＩＴＳ全长序列进行对
比分析，选择长心卡帕藻Ｋａｐｐａｐｈｙｃｕｓ ａｌｖａｒｅｚｉｉ
（ＧＱ８６９８４９）作为外群（ＧｅｎＢａｎｋ获取号以及详细
信息见表１和表２）。用ＭＥＧＡ ４．０计算其碱基含
量和变异位点，并选择Ｋｉｍｕｒａ ２－ｐａｒａｍｅｔｅｒ和Ｃｏｍ—
ｐｌｅｔｅ Ｄｅｌｅｔｉｏｎ计算遗传距离。选择不同物种和不同
地理种群的序列用ＣｌｕｓｔａｌＸ １．８３软件进行序列比
对，用ＰＡＵＰ ４．０软件在Ｍｏｄｅｌｔｅｓｔ ３．７中计算不同
核酸替代模型的似然值并筛选出最适核酸替换模
型，最终按Ａｋａｔｋｅ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｃｒｉｔｅｒｉｏｎ（ＡＩＣ）结
ｍｕｍ ｐａｒｓｉｍｏｎｙ，ＭＰ）构建系统树时在ＰＡＵＰ ４．０
中采用启发式搜索（Ｈｅｕｒｉｓｔｉｃ ｓｅａｒｃｈ）的逐步加入
式算法（Ｓｔｅｐｗｉｓｅ ａｄｄｉｔｉｏｎ）分支交换法（Ｂｒａｎｃｈ
ｓｗａｐｐｉｎｇ ａｌｇｏｒｉｔｈｍ）设定为树二等分再连接算法
（Ｔｒｅｅ ｂｉｓｅｃｔｉｏｎ ｒｅｃｏｎｎｅｃｔｉｏｎ，ＴＢＲ），每轮搜索最大
尝试次数为１ ０００次，每步保留２０个树，自举值
Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ为１ ０００次重复。
２结果与分析
２．１ ＩＴＳ序列长度和ＧＣ含量分析
ＩＴＳ序列长度和ＧＣ含量分析结果见表２。江
蓠科海藻ＩＴＳ存在较为丰富的长度变异，长度在
８９３～１ ５０８ ｂｐ之间，其中龙须菜属龙须菜 ．
１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ和 ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ的ＩＴＳ序列长度较其
他物种短，分别为１ ０６５（１ ０６６）ｂｐ和８９３ ｂｐ；江
蓠科海藻ＩＴＳ１序列长度在１２１～５６８ ｂｐ之间，ＩＴＳ２
序列长度在５８５～９８４ ｂｐ之间，同一物种的ＩＴＳ２序
列明显长于ＩＳＴ１序列，且其ＧＣ含量明显高于
ＩＴＳ１序列。
相比ＩＴＳ１和ＩＴＳ２序列，江蓠科海藻的５．８Ｓ
序列长度较为稳定，除无管篱生藻Ｇｐ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ、
细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ和智利江蓠Ｇ．ｃｈｌｉｅｎｓｉｓ ３
个物种外，其他物种５．８ｓ序列长度均为１５９ ｂｐ；
５．８Ｓ序列ＧＣ含量也明显高于ＩＳＴ１和ＩＴＳ２序列的
ＧＣ含量。细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ５．８Ｓ序列为
１３９ ｂｐ，在６Ｏ ｂｐ位点后缺失１９个碱基，在１１４ ｂｐ
处缺失一个碱基；智利江蓠Ｇ．ｃｈｌｉｅｎｓｉｓ ５．８Ｓ序列
为１４０ ｂｐ，在６０ ｂｐ位点后缺失１９个碱基；蓠生
藻属无管篱生藻 ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ的５．８ｓ序列长１６２
ｂｐ，在１０２位点之后增加了３个Ｔ碱基（见图１）。
１００ 中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
１ ５Ｏ４～
Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ ３７２～３７３ ３５．７ １５９ ４９．１ ９７２～９７６ ３９．１
１ ５０８
１ ４２５～
３７．２
１ ４３０
Ｇ ｃｈｏｕａｅ
Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
３６９ ３８．７ １５９
１５９
１３９
１４０
１５９
１５９
１５９
１５９
４９．１
４９．１
４８．９
５０．Ｏ
４９．１
６０１ ４１．１
１１２９ ４１．５
３９．３
见表１
见表１
见表１
见表１
Ｔｈｉｓ ｗｏｒｋ
Ｇ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ ５２４～５２７ ３３．８ １５９ ４９．１ ７４２～７４５ ３７．１
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
１ ３０７—
５６７～５６８ ３５．７
５６８ ３５．９
３６．０
３３．３
３９．８
４２．０
３８．２
５７８—５８０ ３６．７
１ ３０５
５７８ ３６．８
３６．３
４０．６
４３．６
４１．７
４１．２
ｖａｒ．１ｉｕ
Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
Ｇ ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ
Ｇ ｕｅｒＦｌ￣ｏｓａ
３７．８
１ ２８５
１ Ｏ９４
１ Ｏ９２
３７．８
３７．８
４０．７
４３．２
４２．９
４１．５
４２．３
ｆ ｅｔ ａ１．［２２］
ＧＴＵ２１３４３
Ｇｏｆ
Ａｆ１Ｄ３４２６５
Ｕ２１３４２
３６１
１５６
３４４
３４６
３１９
５９３
７７８
７０５
５８５
６６１
６７８
７６１
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．［２２］
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．【 ］
Ｇ ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ
４９．１
４９．１
４９．１
４９．１
１ ２０８
１ ０９０
１ １３９
１ １８７～
ＡＦ４６８９１３．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［’。
ＡＦ４７２４２０
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４７２４１９
Ｂｅ１１
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９ １６
Ｂｅ１１
ＡＦ４７２４ｌ７．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［１ｏＪ
ＡＦ４７２４１８
Ｇ．ａｔ．１ｆａｃｉｎｕｌａｔａ
Ｇ．ａｔ．ｍａｍｍｉｆｌｌａｒｉｓ
Ｇ．ａｔ．ｔｆｅｐｏｃｅｎｓｉｓ ３５０～３５２ ３７．７
Ｇ ｃｅｒｖｉｃｏｒｎｉｓ
４４０
１５９
１５９
１５９
１５９
ｌ５９
１５９
１５９
１５９
１５９
４３．０
１ １８９
４２．２
４２．６
４２．４
４２．８
３９．０
４３．１
３８．８
４４．３
３６．０
３１．４
４９．１
４９．１
４９．１
１ ３６０
１ １６８
１ １３４
４２．０
４３．６
４２．２
４４．０
４２．９
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９１７
Ｂｅ１
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９１２
Ｂｅ１
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［１ｏ］
ＡＦ４６８９ｌ １
Ｂｅ１１
Ｕ２１３４１
Ｇ０ｆｆ ｅｔ ａ１．［ ］
Ｔｈｉｓ ｗｏｒｋ，
Ｌｉ ｅｔ ａ１．［２３］
ｅｆｏｌｉ ｍ ｖａｒ
ｔｉ砌ａｈｉａｅ
３６０
３５１
３２７
６４９
６２４
７４５
Ｇ ｐａｃｉｆｗａ
．
４９．１
４９．１
４８．４
１ ２３０
ｌ ０６５～
１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ
．
２５０
６６６～６６７ ４．１
１ ０６６
６１４ ４６．９
见表１，
ＥＵ５６１２３９
ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ
ｃａｕｄａｔａ
１２１
８９３
ｌ ２３９—
４５．１
４１．３
ｅｔ ａ１．［ ］
ＧＴＵ２ｌ２４６
Ｇｏｆｆ
ＡＦ４６８９１０．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９０９
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９０７
Ｂｅ１
Ｕ３３１３９
３４６～３５１ ３６．９
３２８ ３７．８
４９．７ ７２９～７３６ ４１．５
１ ２４１
Ｈ．ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ ４９．７
７２７ ４２．８
１ ２１４
７３４
４２．３
４４．８
Ｇｐ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ １０９ ３３．１ １６２ ４８．１
４６３ ４６．４
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．［ ］
１）Ｇ１．：Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ蓠生藻属； ：Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
２．２ ＩｒＩ’Ｓ序列比对分析
异位点。江蓠属与龙须菜属物种间的遗传距离在
０．４０１—０．５５４之间。江蓠属与Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间 对所有江蓠科的ＩＴＳ序列用ＭＥＧＡ ４．０进行比
对，比对后序列长度为１ ７８１ ｂｐ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｇａｐｓ），
计算遗传距离结果显示，江蓠科各属内的种间遗传
的遗传距离在０．１９３—０．４０９之间。江蓠属与篱生
藻属物种间的遗传距离在０．５２７～０．６００之间。龙
须菜属与Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间的遗传距离在０．３８２～
０．５３５之间。龙须菜属与篱生藻属物种间的遗传距
距离明显大于种内遗传距离（见表３）。江蓠属各
物种的种内遗传距离在０．０００～０．０１２之间，存在
０～３６个变异位点；细基江蓠繁枝变种和细基江蓠
离在０．２６７～０．４０６之间。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ与篱生藻属
物种间的遗传距离在０．５３３～０．５７８之间。
在本文研究的江蓠属和龙须菜属５个物种的
２３个群体中，龙须菜８个群体２４株个体的平均遗
传距离为０．０００，存在２个变异位点；芋根江蓠２
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ种间遗传距离为０．００４，存在２５个
变异位点，包括了１４个种间区分位点；江蓠属其
他物种的种间遗传距离在０．０４１—０．４１１之间，存
在１１１～６１１个变异位点。龙须菜属的种内遗传距
离为０．０００，龙须菜和Ｇｐ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ种间遗传距离
为０．３８２。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ中Ｈ ｃａｕｄａｔａ种内遗传距离
为０．００９，存在１４个变异位点；ＨＩ ｃａｕｄａｔａ和Ｈ．
ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ种间遗传距离为０．１２８，存在２５２个变
个群体６株个体的平均遗传距离为０．００３，存在１２
个变异位点；脆江蓠２个群体６株个体的平均遗传
距离为０．０００，存在１个变异位点；细基江蓠繁枝
变种６个群体１７株个体的平均遗传距离为０．００４，
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 １０１
ＡＣＡＡＣＴＣＧＴＡ ＡＣＧＧＴＧＧＡＴＧ ＴＣＴＣＧＧＣＴＣＣ ＴＡＣＡＴＣＧＡＴＧ
Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
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Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｔ．１ｉｕｉ
ＡＡＧＡＡＣＧＴＡＧ ＣＡＡＡＣＴＧＣＧＡ ＡＡＣＧＴＡＡＴＧＣ ＧＡＡＴＴＧＣＡＧＡ Ａ
Ｇ．ｖｅｒｒｕｃｏｓａ
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ
Ｇ．口 ｌａｃｉｎｕｌａｔａ
Ｇ．ａｆｆｍａｍｍｉｌｌａｒｉｓ
Ｇ．ａｆｆ．ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ
Ｇ．ｃｅｎ，ｉｃ０ｒｎｉｓ
Ｇ．ｆｏｌｉｉｆｅｒａ ｖａｒ
Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ
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Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔ ｉｔａｔａ
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［１６２］
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【１６２】
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［１６２］
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［１６２】
［１６２］
［１６２］
【１６２］
［１６２］
图１江蓠科海藻５．８Ｓ核苷酸序列比对
Ｆｉｇ．１ Ｔｈｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｏｆ ５．８Ｓ ａｍｏｎｇ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
存在１６个变异位点；上述物种不存在群体区分位
点。真江蓠５个群体１３株个体的平均遗传距离为
０．００２，１３个变异位点，且中国、俄罗斯和美国三
地的种群间存在９个稳定有效的信息位点，可区分
三地的群体（见图２），但在中国两野生真江蓠群
体间存在６个变异位点，均为个体的随机变异，并
无稳定有效的信息位点。
存在１～４个变异位点，其中有１个位点可进行属
的鉴别。江蓠属与蓠生藻属物种间的遗传距离在
０．０９９～０．１１６之间，存在１３～１７个变异位点，其
中１２个位点可进行属的鉴别。龙须菜属与 一
ｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种问的遗传距离在０．０５２～０．０８０之间，
存在８～１２个变异位点，其中５个位点可进行属的
鉴别。龙须菜属与蓠生藻属物种间的遗传距离为
单独对江蓠科海藻的５．８ｓ序列进行分析，比
对后序列长度为１６２ ｂｐ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｇａｐｓ），存在３６
０．０７３～０．１０１，存在１１～１５变异位点，其中７个
位点可进行属的鉴别。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ与蓠生藻属物
种问的遗传距离为０．１２３，存在１８个变异位点，
均可进行属的鉴别。在江蓠属中，除细基江蓠Ｇ．
ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ、智利江蓠Ｇ．ｃｈｉ￣ｎｓｉｓ和Ｇ．ｐａｃｉｉｃａ ｆ
个变异位点，其中包括了１４个信息位点，序列比
对结果见图１。江蓠属与龙须菜属物种间的遗传距
离在０．０４６～０．０８４之间，存在７～１１个变异位点，
其中４个位点可进行属的鉴别。江蓠属与 一
外，其他物种的５．８Ｓ序列完全一致；细基江蓠Ｇ．
ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ和智利江蓠Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ除碱基缺失外，
ｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间的遗传距离在０．００６～０．０２６之间，
１０２ 中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
两者与其他江蓠属物种都存在一个位点的变异；
Ｇ．ｐａｃｉｉｆｃａ与细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ、智利江蓠
Ｃｐ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ物种间的遗传距离为０．０６０，存在１０
个变异位点。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ中Ｈ ｃａｕｄａｔａ和Ｈ Ｃ，。（ —
ｓｉｓｓｉｍａ两物种５．８Ｓ序列完全一致。所有江蓠科物
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ的遗传距离均为０．０２９，与其他江蓠属
物种间的遗传距离均为０．０１９，存在３个变异位
种的５．８ｓ序列种内遗传距离都为０．０００。
点。龙须菜属的龙须菜种内遗传距离为０．０００，与
ＡＧＧＴＴ
ＱｉｎｇＤａｏ
ＴＴＣＡＣＡＡＡＡＡ ＡＣＡＧＣＣＴＡＡＣ ＧＣＡＡＣＡＴＧＧＴ ＴＴＣＴ１＿
４０
４０
４０
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４４０
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４４０
４４０
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４０
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ＱｉｎｇＤａｏ
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ＷｅｉＨａｉ
２４０
２４０
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２８０
２８０
２８０
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２４０
２４０
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ＷｅｉＨａｉ・・・・・・・・・・・－・・・・ －・・・・・一－－・・－・・・・一
３２０
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４３５
４３５
３２Ｏ
３２０
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Ｒｕｓｓｉａ
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．．．．． ．．．．．．一．．．．．．．．．．．．
４３５
４３５
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图２真江蓠不同地理群体间ＩＴＳ序列稳定有效信息位点
Ｆｉｇ．２ Ｔｈｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｓｉｔｅｓ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ
表３江蓠科海藻的种间遗传距离”
Ｔａｂｌｅ ３ Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ａｍｏｎｇ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｅｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
１） １：Ｇ ｃｈｏｕａｅ；２：Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ；３：Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ；４：Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｒ．１ｉｕｉ；５：Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ；６：Ｇ ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ；７：
Ｇ Ｌａｃｉｎｕｌａｔａ；８：Ｇ Ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ；９：Ｇ．ａｔ．Ｍａｍｍｉｆｌｌａｒｉｓ；１０：Ｇ ｆｏＺＵｆｅｒａ ｖａｒ；１１：Ｇ ｔｉｋｖａｈｉａｅ；１２：Ｇ ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ；１３：
ｅ ｃｅｒｖｉｃｏｒｎｉｓ；１４：Ｇ－ｐａｃｉｉｆｃａ；１５：Ｇ ｖｅｒｒｕｃｏｓａ；１６：Ｈ ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ；１７：Ｈ ｃａｕｄａｔｅ；１８：Ｇｐ・Ｌｅｍａｎｅ／ｆｏｒｍ／ｓ；１９：Ｇｐ．Ｔｅｎｕｉ—
ｆｒｏ，￣；２０：Ｇ１．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 ｌ０３
１ＯＯ Ｈ．ｃａｕｄａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
ｌＯ０ Ｈ．ｃａｕｄａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
・Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
１０Ｏ
・Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
１ｏｏＪ ９１
Ｈ．ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ｖｅｒｒｕｃｏｓａ Ｈａｌｉｆａｘ
ｌ０Ｃ
Ｇ．ｐａｃｆ，｝ｃａ Ｐｕｅｒｔｏ Ｒｉｃｏ
Ｇ．ｃｅｒｖｉｃＤｒ”ｉ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
７７
Ｇ．ａ ｍａｍｍｉｌｌａｒｉｓ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
ｌ １００Ｌ
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｉ １００
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ Ｃａｎａｄａ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ￣Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
Ｇ．口 ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｇ．ａｆｆ ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｇ．ｆｏｌｉｉｆｅｒａ ｖａｒ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ａ ｌａｃｉｎｕｌａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
８９
・Ｇ．ｃｈｏａｅ
▲Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ Ｃｈｉｎａ．＇Ｑｉｎｇｄａ
８４‘。‘’。‘——
▲Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐ ｖｌｌａ Ｃｈｉｎａ．＂ ｆ 口ｆ
・Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｒ，ｈｙｌｌａ Ｒｕｓｓｉａ
１００
・Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｌ￣ ｈｙｌｌａ
・Ｇ．ｆＰ 甜ｆ ｆ 口ｆｆ ｆ ＹａＦ．１ｉｕｉ
ｌＯ０
・Ｇ．ｆＰ 材ｆ ｆｆ口ｆｆ ｆｄ １）ａｔ，ｌｉｕｉ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ Ｃｈｉｎａ．＇Ｈａｉｎａｎ
ｌＯ０
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ ＮｅＷ Ｚｅａｌａｎｄ
。Ｇ
Ｇ
妻ｐＩ ．ｏｌｔ‘ｅｒ ｙｍｎｚｕａ ｏｉ ｆｎ。ｒｄｅｏｉ ｅ。ｆｎｓｏ ｓ白ｒ ＣｍａＶ ”ｉｅｌｓｆｎ ｏＣｅｚｒｈｎｕｉｅｎａｌａ．＇Ｑｉｎｇｄａｏ］１ Ｇｒ “ｃ “．，ａ…ｒ ‘．。 、Ｇｒａｃ “．， ｒ ‘．，．， ｎ
图３江蓠科海藻ＩＴＳ序列系统进化树（ＭＰ）
Ｆｉｇ．３ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｃ ｔｒｅｅ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｂａｓｅｄ ｏｎ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｂｙ ＭＰ ｍｅｔｈｏｄ
（●：养殖种群；▲：野生种群）
２．３ ＩＴＳ系统树构建
间存在较为广泛的变异。Ｙａｍａｍｏｔｏ等 根据精子
根据江蓠科物种ＩＳＴ序列用ＮＪ、ＭＰ和ＭＬ法 囊窠的发生位置将江蓠属分为江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
构建系统树，３种方法聚类结果一致，仅列出ＭＰ 和龙须菜属。但在本研究中用ＩＴＳ序列构建系统
法构建的系统树（见图３）。比对后总１７７２位点矩
树，结果显示Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种聚类到江蓠属内，
阵，３０２个稳定位点，９１个变异位点但无信息的位 并未形成单独的分支，不存在明显的属间遗传分
点，１ ３７９个信息位点，启发式搜寻后最终获得１
化，但与龙须菜属／蓠生藻属分别聚在两大分支上，
个最优简约树，步长为５ ４３５，一致性指数（ＣＩ）
存在明显的属间遗传分化。这与之前报道的ＳＳＵ
和严格性指数（ＲＩ）分别是０．５８６和０．７６５。从系 ｒＤＮＡ、Ｒｕｂｉｓｃｏ ｓｐａｃｅｒ和ｒｂｃＬ序列系统聚类的结果
统树结构中可以看出，２０种江蓠科海藻可基本分 是一致的¨ｏ１ ’ Ｊ。在江蓠属系统分类中，江蓠属和
为２大分支，包括龙须菜属／蓠生藻属分支，江蓠
Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ海藻精子囊窠包括了“Ｖ”型、 “Ｔ”
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ分支。其中龙须菜属和蓠生藻属处 型和“Ｐ型”３种类型，而龙须菜属精子囊窠则属
在系统树的最基部，说明其分化时间可能早于江蓠
于“Ｃ型” ，在系统树中可以将其分为两组；但
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ。江蓠属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ形成了３个小
江蓠属和Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ海藻并未按其精子囊窠排列
的分支，分别是细基江蓠繁枝变种Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
方式的类型而形成单独的分支，也没有形成与地域
ｖａｒ．１ｉｕｉ分支、真江蓠Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ分支、脆 分布相关的分支，这可能与这两个属存在着并系起
江蓠Ｇ．ｃｈｏｕａｅ与芋根江蓠Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ分支；青岛
源关系有关。篱生藻属寄生于江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
与威海的野生真江蓠关系最近，其次是俄罗斯和美 和龙须菜属海藻，其藻体内部构造和生殖结构同于
国的养殖真江蓠，支持率分别为１００、８４和１００。
江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ和龙须菜属 ；蓠生藻属海
３讨论
藻是从最初的宿主藻体进化而来 ，在寄生过程
中可从宿主获取叶绿体，而保留自身的核基因组和
江蓠科４个属２０个物种ＩＴＳ长度差异较大，
线粒体基因组 引，Ｂｅｌｌｏｒｉｎ等ｌｌ。。认为篱生藻属与
遗传距离和系统聚类分析结果显示，不同种、属之 龙须菜属海藻属于并系起源，至少有一个篱生藻属
中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
物种是由龙须菜属演化而来；本研究也显示了同样
的结果。但是蓠生藻属海藻寄生过程中是否会与宿
主发生遗传物质的水平转移，以及在不同寄主中是
否多次发生遗传物质的水平转移还有待证实。
ＩＴＳ序列无论是在序列长度还是变异程度上都
能很好地区分和鉴定江蓠科物种。细基江蓠和细基
江蓠繁枝变种的形态学主要差异是前者分枝１～２
次，后者具有更多纤细的分枝；尽管细基江蓠和细
基江蓠繁枝变种的ＩＴＳ序列遗传距离低于江蓠科全
部海藻的种间差异，属于种内差异水平，但其存在
着２５个变异位点，包括了１４个种间区分位点，同
时细基江蓠５．８Ｓ序列较江蓠属海藻缺失２０个碱
基，显示出独特的序列结构，这可能意味着细基江
蓠与细基江蓠繁枝变种之间的分类地位还需要进一
步的研究确认。
江蓠科海藻５．８Ｓ序列长度相对ＩＴＳ１和ＩＴＳ２
保守，且种内和种间变异很小，存在着特定的稳定
属间区分位点，且对于具有并系关系的属（江蓠
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ和龙须菜属／蓠生藻属）也具有稳
定的区分位点，因此利用这些位点可以进行江蓠科
属水平上的分类鉴定。同样已报道的江蓠科１８Ｓ
ｒＤＮＡ序列，也存在这特定的属间区分位点，能够
很好地区分属 。
本研究显示，龙须菜、脆江蓠和真江蓠（美
国和俄罗斯）的养殖群体的群体间和群体内变异
相比野生群体遗传变异较小，江蓠科海藻养殖主要
通过无性繁殖进行，不发生有性生殖过程的杂交以
及无性繁殖的遗传重组，这种养殖群体变异水平降
低的情况可能是由于养殖筛选的影响；但在细基江
蓠繁殖变种的养殖群体存在相对较高的遗传变异，
这可能是由于其自然分布和养殖主要集中在亚热带
和热带海域，生长速率和养殖继代频率高，导致其
群体ＩＴＳ序列变异幅度高于其他江蓠种群。在来自
中国、俄罗斯和美国三地的真江蓠群体中，存在着
９个与地理分布相关的信息位点，可以进行群体的
有效区分。这与在真江蓠、提克江蓠Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ、
绳江蓠 ．ｃｈｏｒｄａ、张氏江蓠Ｇ．ｃｈａｎｇｉｉ的ｃｏｘｌ和
ｒｂｃＬ基因序列存在的与地理位置相关的单倍型是一
致的 Ｊ。但在青岛和威海的真江蓠野生群体间
并不存在种群间的稳定区分位点，因此，信息位点
在地理群体识别的方面应用需要考虑到群体数量以
及地理距离的因素。
４前景展望
随着分子生物学研究的不断深入发展，核酸数
据的不断积累，利用单个或多个ＤＮＡ序列并结合
物种形态学研究物种分类与系统进化，逐渐成为现
代生物学研究的有力工具。目前，ＤＮＡ序列分析
在藻类分类鉴定中得到了广泛的应用，对阐明系统
进化关系提供了重要的证据。但从分子系统学研究
手段本身而言，也存在很多需要进一步研究和探讨
的问题。不同类群同一ＤＮＡ序列的进化速率有所
差异，同一类群中不同ＤＮＡ序列的进化速率也不
相同，另外由于藻类早期演化中存在着线粒体和叶
绿体内共生现象，其在平行演化中又存在着并系起
源和直系起源现象，这为研究藻类系统发育与分化
增添了较大的难度。从多个层次以及多个基因位点
上系统地研究藻类形态结构进化、生态适应以及基
因进化的内在关系则显得更为重要和迫切。
参考文献：
［１］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｓｔａｔｕｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９８９，２５：
２２８—２４１．
［２］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｐｒｏｐｏｓａｌ ｏｆ ｔｈｅ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ ｏｒｄ．ｎｏｖ．（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ ａｎ ａｎａｌｙ—
ｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｖｅｒｒｕｃｏｓａ
［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９８９，２５：２１３—２２７．
［３］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｄｉａｇｎｏｓｅｓ ａｎｄ
ｋｅｙ ｔｏ ｔｈｅ ｇｅｎｅｒａ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｅｉｌａｒｉａｌｅｓ，
Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｈｙｄｒｏｂｉｏｌｏｇｉａ，１９９０，２０４／２０５：１７３
—
１７８．
［４］ ＦＲＥＳＨＷＡＴＥＲ Ｄ Ｗ，ＲＵＥＮＥＳＳ Ｊ．Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａ—
ｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｏｆ ｓｏｍｅ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｇｅｌｉｄｉｕｍ（Ｇｅｌｉｄｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏ—
ｐｈｙｔａ）ｓｐｅｃｉｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ａｎａｌｙ—
ｓｉｓ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉａ，１９９４，３３：１８７—１９４．
［５］ ＳＡＵＮＤＥＲＳ Ｇ Ｗ，ＫＲＡＦＦ Ｇ Ｔ．Ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅ
ｏｎ ｒｅｄ ａｌｇａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ：ｆｏｃｕｓ ｏｎ ｔｈｅ Ｆｌｏｆｉｄｅｏｐｈｙｃｉｄａｅ［Ｊ］．
Ｐｌａｎｔ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ，１９９７，１１：１１５—１３８．
［６］ＨＡＲＰＥＲ Ｊ Ｔ，ＳＡＵＮＤＥＲＳ Ｇ Ｗ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ
ｏｆ ｔｈｅ Ｆｌｏｒｉｄｅｏｐｈｙｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｕｓｉｎｇ ｎｕｃｌｅａｒ ｌａｒｇｅ
ａｎｄ ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，
２００１，３７：１０７３—１０８２．
［７］ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ，ＲＩＣＥ Ｅ Ｌ，ＭＵＲＰＨＹ Ｃ Ａ，ｅｔ ａ１．Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔ—
ｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ａｓ ｄｅ—
ｔｅｒｍｉｎｅｄ ｂｙ １８Ｓ ｒＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉａ，１９９２，
３１：５１０—５２２．
［８］ ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ．Ａ ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ ｒｅｃｅｎｔ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｃｏｎｃｅｐｔｓ ａｎｄ ｄｅ—
ｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ
Ａｐｐｌ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９５，７：２５５—２６７．
［９］ ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ，ＲＡＧＡＮ Ｍ Ａ，ＣＲＩＴＣＨＬＥＹ Ａ Ｔ，ｅｔ ａ１．Ｍｏ—
ｌｅｃｕｌａｒ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏ—
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 １０５
ｐｈｙｔａ）：ｆｕｒｔｈｅｒ ｏｂｓｅｒｖａｔｉｏｎｓ ｏｎ ｓｏｍｅ ｕｎｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｓｐｅ—
ｃｉｅｓ［Ｊ］．Ｅｕｒｏｐ Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，２９：１９５—２０２．
［１０］ ＢＥＬＬＯＲＩＮ Ａ Ｍ，ＯＬＩＶＥＩＲＡ Ｍ Ｃ，ＯＬＩＶＥＩＲＡ Ｅ Ｃ．
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ａｎｄ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｒｉｎｅ ａｌｇａｌ ｆａｍｉｌｙ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ
ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒＤＮＡ ａｎｄ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ａｔｌａｎｔｉｃ ａｎｄ
Ｐａｃｉｉｆｃ ｓｐｅｃｉｅｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００２，３８：５５１—５６３．
［１１］ＩＹＥＲ Ｒ，ＴＲＯＮＣＨＩＮ Ｅ Ｍ，ＢＯＬＴＯＮ Ｊ Ｊ，ｅｔ ａ１．Ｍｏｌｅｃ—
ｕｌａｒ ｓｙｓｙｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ）
ｗｉｔｈ ｅｍｐｈａｓｉｓ ｏｎ ｓｏｕｔｈｅｒｎ Ａｆｒｉｃａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００５，
４１：６７２—６８４．
［１２］ ＧＵＩＬＬＥＭＩＮ Ｍ Ｌ，ＡＫＫＩ Ｓ Ａ，ＧＩＶＥＲＮＡＵＤ Ｔ，ｅｔ ａ１．
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓａｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｒａｐｉｄ ｍｏ—
ｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｔｈｏｄｓ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｆｒｏｍ
ｔｈｅ Ａｔｌａｎｔｉｃ ｃｏａｓｔ ｏｆ Ｍｏｒｏｃｃｏ［Ｊ］．Ａｑｕａｔｉｃ Ｂｏｔａｎｙ，
２００８，８９：３２４—３３０．
［１３］ ＢＹＲＮＥ Ｋ，ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ Ｃ，ＷＥＳＴ Ｊ，ｅｔ ａ１．
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ
ｓｏｕｔｈｅａｓｔｅｒｎ Ａｕｓｔｒａｌｉａ， ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｓｐｅｃｉｅｓ，
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｐｅｒｐｌｅｘａ ｓｐ．ｎｏｖ．：Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ，ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｎｄ ａｇａｒ ｃｏｎｔｅｎｔ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅ—
ｓｅａｒｃｈ，２００２，５０：２９５—３１１．
［１４］ ＷＥＩＮＢＥＲＧＥＲ Ｆ，ＧＵＩＬＬＥＭＩＮ Ｍ Ｌ，ＤＥＳＴＯＭＢＥ Ｃ，
ｅｔ ａ１．Ｄｅｆｅｎｓｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏ—
ｐｈｙｔａ）：ｓｕｂｓｔｒａｔｅ—ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｘｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ａｇａｒ ｏｌｉｇｏｓａｃ—
ｃｈａｒｉｄｅｓ ｉａ ｍｏｒｅ ａｎｃｉｅｎｔ ｔｈａｎ ｔｈｅ ｏｌｉｇｏａｇａｒ・・ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｏｘｉ—－
ｄａｔｉｖｅ ｂｕｒｓｔ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２０１０，４６：９５８—９６８．
［１５］ ＧＡＲＧＩＵＬＯ Ｇ Ｍ，ＭＯＲＡＢＩＴＯ Ｍ，ＧＥＮＯＶＥＳＥ Ｇ，ｅｔ
ａ１．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉ—
ａｃｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ ｆｒｏｍ ｔｈｅ Ｍｅｄｉｔｅ￣ａｎｅａｎ Ｓｅａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙ—
ｃｏｌ，２００６，１８：４９７—５０４．
［１６］ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＢＯＯ Ｓ Ｍ．Ｔａｘｏｎｏｍｙ ａｎｄ ｐｈｙ—
ｌｏｇｅｎｙ ｏｆ ｌｆａｔｔｅｎｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉｃｅａｅ，
Ｒｈｏｄｕｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ Ｋｏｒｅａ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｐｒｏ—
ｔｅｉｎ—ｃｏｄｉｎｇ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ａｎｄ ｐｓｂＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ［Ｊ］．Ｐｈｙ—
ｃｏｌｏｇｉａ，２００６，４５（５）：５２０—５２８．
［１７］ ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ
Ｇｒａｅｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）：Ａ ｃｒｉｔｉｃａｌ
ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｅｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙ—
ｃｏｌ，２００４，４０：１３８—１５９．
［１８］ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，Ｌ１ＡＯ Ｌ Ｍ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．ｅｔ ａ１．
Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙ—
ｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｅｓ ａｎｄ ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ
ｅｖｉｄｅｎｃｅ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００３，３９：１５４—１７１．
［１９］ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ Ｃ，ＵＲＧＥＲ Ｇ Ｂ，ＷＥＳＴ Ｊ Ａ，ｅｔ ａ１．
Ａ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ｍａｒｋｅｒ ｆｏｒ ｒｅｄ ａｌｇａｌ ｉｎｔｒａｓｐｅｃｉｉｆｃ ｒｅｌａ—
ｔｉｏｎｓｈｉｐｓ［Ｊ］．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｅｃｏｌｏｇｙ，１９９９，８：１４４３—
１４４７．
［２０］ 孙晓宇，罗丹，赵翠，等．不同保存条件下五种大型
海藻的ＤＮＡ提取和ＰＣＲ分析［Ｊ］．分子植物育种
（ｏｎｌｉｎｅ），２０１１，９（９５）：１６８０—１６９１．
［２１］
ＣＯＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ，ＶＡＣＱＵＩＥＲ Ｖ Ｄ．Ｅｘｐｌｏｒｉｎｇ ｔｈｅ ｐｈｙ—
ｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｕｔｉｌｉｔｙ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｆｏｒ ａｎｉｍａｌｓ：Ａ ｔｅｓｔ
ｃａｓｅ ｆｏｒ ａｂａｌｏｎｅ（Ｈａｌｉｏｔｉｓ）［Ｊ］．Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｅ—
ｖｏｌｕｔｉｏｎ，２００２，５４：２４６—２５７．
［２２］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ．ＭＯＯＮ Ｄ Ａ．Ｃ０ＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｄｅｌｉｎｅａｔｉｏｎ ｏｆ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ ｔｈｅ
ｒｅｄ ａｌｇａｌ ａｇａｒｏｐｈｙｔｅｓ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ）［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，３０（３）：５２１—
５３７．
［２３］
李敏，隋正红，易恒，等．龙须菜５．８Ｓ ｒＲＮＡ和ＩＴＳ
区的克隆与系统学分析［Ｊ］．中国海洋大学学报：自
然科学版，３９（１）：７７—８３．
［２４］
ＹＡＭＡＭＯＴＯ Ｈ．Ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｇｒａｃｉａｒｉｏｐｓｉｓ
ａｎｄ Ｇｒａｃｉａｒｉａ ｆｒｏｍ Ｊａｐａｎ［Ｊ］．Ｂｕｌｌ Ｆａｃ Ｆｉｓｈ．Ｈｏｋｋａｉｄｏ
Ｕｎｉｖ，１９７５，２６：２１７—２２２．
［２５］
ＩＳＡＢＥＬＬＡ Ａ Ａ，ＺＨＡＮＧ Ｊｕｎｆｕ，ＸＩＡ Ｂａｎｇｍｅｉ．Ｇｒａ—
ｃｉａｒｉａ ｍｉｘｔａ，ｓｐ．ｎｏｖ．ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｗｅｓｔｅｒｎ Ｐａｃｉｉｆｃ ｓｐｅｃｉｅｓ
ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ）［Ｊ］．Ｐａｃｉｆ－
ｉｃ Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，４５（１）：１２—２７．
［２６］ 夏邦美，张峻甫．中国海藻志［Ｍ］．北京：科学出版
社，１９９９：１７．
［２７］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ，ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ．Ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｐａｒａｓｉｔ—
ｉｓｍ ｉｎ ｒｅｄ ａｌｇａｅ：Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ｏｆ ａｄｅｌｐｈｏｐａｒａ—
ｓｉｔｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｈｏｓｔｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，３０：６９５—
７２０．
［２８］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ．ＣＯＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ．Ｆａｔｅ ｏｆ ｐａｒａｓｉｔｅ ａｎｄ ｈｏｓｔ
ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ＤＮＡ ｄｕｒｉｎｇ ｃｅｌｌｕｌａｒ ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｒｅｄ ａｌ—
ｇａｅ ｂｙ ｔｈｅｉｒ ｐａｒａｓｉｔｅｓ［Ｊ］．Ｔｈｅ Ｐｌａｎｔ Ｃｅｌｌ Ｏｎｌｉｎｅ，
１９９５，７（１１）：１８９９—１９１１．
［２９］
ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＧＥＲＡＬＤＩＮＯ Ｐ Ｊ Ｌ，ｅｔ ａ１．Ｍｉｔｏ—
ｃｈｏｎｄｒｉｌａ ｃｏｘｌ ａｎｄ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ｇｅｎｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｙｅｒ—
ｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ Ａｐｐｌ
Ｐｈｙｃｏｌ，２００８，２０：１６１～１６８．
［３０］
ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．Ｐｈｙｌｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｔｉｋｖａｈｉａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）：Ａ
ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕｉｔｙ ａ ｃｏｎｔｉｎｕｏｕｓｌｙ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｄ
ｓｐｅｃｉｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｖｉｄｅｎｃｅ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，
２００４，４０：１３８—１５９．
［３１］
ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＫＩＭ Ｓ Ｙ，ｅｔ ａ１．Ｒｅｉｎｓｔａｔｅｍｅｎｔ
ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ｃｈｏｒｄａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）
ｂａｓｅｄ ｏｎ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ａｎｄ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ｃｏｘｌ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ
［Ｊ］．Ａｌｇａｅ，２００８，２３（３）：２０９—２１７．
［３２］
ＹＯＷ Ｙ Ｙ，ＬＩＭ Ｐ Ｅ，ＰＨＡＮＧ Ｓ Ｍ．Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｃｈａｎｇｉｉ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ
ｗｅｓｔ ｃｏａｓｔ，Ｐｅｎｉｎｓｕｌａｒ Ｍａｌａｙｓｉａ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ
ｃｏｘＩ ｇｅｎｅ ａｎａｌｙｓｉｓ［Ｊ］．Ｊ Ａｐｐｌ Ｐｈｙｃｏｌ，２０１１，２３：２１９
——
２２６
2024年3月25日发(作者：殳绮烟)
第５１卷
２０１２年
第４期
７月
中山大学学报（自然科学版）
ＡＣＴＡ ＳＣＩＥＮＴＩＡＲＵＭ ＮＡＴＵＲＡＬＩＵＭ ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＡＴＩＳ ＳＵＮＹＡＴＳＥＮＩ
Ｖｏ１．５１ Ｎｏ．４
Ｊｕ１． ２０１２
江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析
李婷婷 ，陈 斌 ，陈省平 ，刘 翠 ，姚 雪 ，陈伟洲 ，赖学文 ，刘 涛
（１．中国海洋大学海洋生命学院，山东青岛２６６００３；
２．中山大学中山医学院，广东广州５１００８０；
３．汕头大学，广东汕头５１５０６３；
４．汕头市水产研究所，广东汕头５１５０００）
摘 要：测定了江蓠属Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ和龙须菜属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ５个物种的２３个群体的ＩＴＳ（含５．８Ｓ ｒＤＮＡ）序列，
并结合ＧｅｎＢａｎｋ数据库中现有江蓠科Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ的１６个物种的ＩＴＳ序列进行分析，在不同分类阶元中探讨了
序列变异和和系统进化关系。江蓠科海藻ＩＴＳ序列长度在８９３～１ ５０８ ｂｐ之间，种间遗传距离在０．０４１～０．６００之
间，种内遗传距离在０．０００～０．０１２之间，其种间遗传距离均大于种内遗传距离；ＩＴＳ系统发育聚类结果显示江
蓠科分为两大分支，分别是江蓠属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ分支、龙须菜属／蓠生藻属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ分支；江蓠科海藻５．８Ｓ
序列种内种间变异￣ｌＬ＇ｂ，但存在稳定的属间区分位点，可用于属以上水平的分类鉴定；中国、美国和俄罗斯三
地的真江蓠群体的ＩＴＳ序列存在９个稳定的变异位点，可以将不同地理群体区分开。
关键词：江蓠科；江蓠属；龙须菜属；ＩＴＳ；５．８Ｓ ｒＤＮＡ；系统发育
中图分类号：Ｑ９４９；Ｑ３４９ 文献标志码：Ａ 文章编号：０５２９—６５７９（２０１２）０４—００９７—０９
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｆｉｖｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ Ｓｐｅｃｉｅｓ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）Ｂａｓｅｄ ｏｎ ＩＴＳ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ
ＬＩ Ｔｉｎｇｔｉｎｇ ，ＣＨＥＮ Ｂｉｎ ，ＣＨＥＮ Ｓｈｅｎｇｐｉｎｇ ，ＹＡＯ Ｘｕｅ ，ＬＩＵ Ｃｕｉ ，
ＣＨＥＮ Ｗｅｉｚｈｏｕ３
。
Ｉ Ｘｕｅｗｅｎ４
．
ＬＩＵ Ｔａｏ、
（１．Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍａｒｉｎｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｏｃｅａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎａ，Ｑｉｎｇｄａｏ ２６６００３，Ｃｈｉｎａ；
２．Ｚｈｏｎｇｓｈａｎ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，Ｓｕｎ Ｙａｔ—ｓｅｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｇｕａｎｇｚｈｏｕ ５１００８０，Ｃｈｉｎａ；
３．Ｓｈａｎｔｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈａｎｔｏｕ ５ １ ５０６３，Ｃｈｉｎａ；
４．Ｓｈａｎｔｏｕ Ｆｉｓｈｅｒｉｅｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ，Ｓｈａｎｔｏｕ ５ １ ５０００，Ｃｈｉｎａ）
Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）．
Ｗｅ ｃｏｍｐａｒｅｄ ＩＴＳ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ５．８Ｓ ｒＤＮＡ）ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｔｗｅｎｔｙ ｔｈｒｅｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｆｉｖｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ａｎｄ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ），ｗｉｔｈ ｔｈｅ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ １６ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅｎ ｓｐｅ—
ｃｉｅｓ ｄｏｗｎｌｏａｄｅｄ ｆｒｏｍ ＧｅｎＢａｎｋ ｄａｔａｂａｓｅ．Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉ－
ａｃｅａｅ ｖａｒｉｅｓ ｆｒｏｍ ８９３ ｔｏ １ ５０８ ｂｐ．Ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｉｃ ｇｅｎｅｔｉｆｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｒａｎｇｅｓ ｆｒｏｍ ０．０４１ ｔｏ ０．６００；ｔｈｅ ｉｎ—
ｔｒａｓｐｅｃｉｆｉｃ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｒａｎｇｅｓ ｆｒｏｍ ０．０００ ｔｏ ０．０１２，ｔｈｅ ｆｏｒｍｅｒ ｉｓ ｍｕｃｈ ｈｉｇｈｅｒ ｔｈａｎ ｔｈｅ ｌａｔｔｅｒ．Ｔｗｏ
ｍａｉｎ ｌｉｎｅａｇｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｗｅｒｅ ｆｒｏｍ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ＼Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ／Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ
．
５．８Ｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｈａｓ ｌｏｗ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｍｏｎｇ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ａｍｏｎｇ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ，ｂｕｔ ｔｈｅ ｄｉｓｔｉｎｃｔ
ｓｉｔｅｓ ｗｅｒｅ ｆｏｕｎｄ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ｇｅｎｅｒａ ａｎｄ ｃａｎ ｂｅ ｕｓｅｄ ｏｎ ｇｅｎｕｓ ｌｅｖｅｌ ｏｒ ａｂｏｖｅ．Ｔｈｅｒｅ ａｒｅ ９ ｍｕｔａｎｔ ｓｉｔｅｓ ｔｈａｔ
ｃａｎ ｂｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｄｉｓｔｉｎｇｕｉｓｈ ｔｈｅ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ ｆｒｏｍ Ｃｈｉｎａ
Ｒｕｓｓｉａ ａｎｄ ＵＳＡ．
，
Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ；Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ；Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ；ＩＴＳ；５．８Ｓ ｒＤＮＡ；ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｃ
收稿日期：２０１１—１１—０７
基金项目：国家科技基础性工作专项资助项目（２００７ＦＹ２１０５００）；广东省科技攻关资助项目（２００６Ｂ２０２０１０５６，
２０１０Ｂ０６０２０００１０，２０１０Ｂ０２０２０１０１５）
作者简介：李婷婷（１９８９年生），女，硕士研究生；通讯作者：刘涛；Ｅ—ｍａｉｌ：ｌｉｕｔａｏ＠ＯＵＣ．ｅｄｕ．ｃｎ
中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
江蓠科Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ在自然分类系统上属于
红藻ｆ－１ Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ江蓠目Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，包括江蓠
属Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ、龙须菜属Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ、蓠生藻属
Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ、Ｃｕｒｄｉｅａ、Ｍｅｌａｎｔｈａｌｉａ
ＩＴＳ１—５．８Ｓ—ＩＴＳ２结构（本文将ＩＳ１—５．８Ｓ— Ｔ
ＩＴＳ２简称为ＩＴＳ）。此结构中５．８Ｓ是高度保守的基
因序列，而ＩＴＳ１和ＩＴＳ２是进化速度较快的序列，
利用ＩＴＳ序列可以从不同分类水平上探讨系统进化
关系。本文通过对来自江蓠属和龙须菜属总５个物 和Ｃｏｎｇｒａｃｉｌａｒｉａ ７个属。在红藻门中，江蓠科无论
是解剖学层面¨ 还是分子学层面 Ｊ，都是很明
种２３个种群的ＩＴＳ序列进行扩增，并与ＧｅｎＢａｎｋ
中江蓠科海藻ＩＴＳ序列进行比对分析，从分子水平
上阐明江蓠科海藻系统发育和种群水平的遗传变
异，为江蓠科海藻的分类和鉴定提供更多数据。
确的一个科，但是因缺乏足够多的形态学和生殖结
构特征，其属间种问存在着复杂的分类关系 一 。
在过去的２０年里，分子生物学技术不断的应用到
江蓠科分类研究中，揭示江蓠科种水平上的系统发
生关系。目前江蓠科分子系统学研究多采用１８Ｓ
ｒＤＮＡ［ ｏ一。
、
１材料与方法
１．１实验材料
Ｒｕｂｉｓｃ０ ｓｐａｃｅｒ［ 一 ３。
、
ＩＴＳ （ｉｎｔｅｍａｌ
ｔｒａｎｓｃｒｉｂｅｄ ｓｐａｃｅｒ） 。， ， 、ｒｂｃＬ Ｅ 一 、ｃｏｘ２—
本实验所用江蓠科海藻５个物种２３个群体由
中国海洋大学大型海藻种质库提供（见表１）。每
３１１３３９ 和ｐｓｂＡ［ 等序列。
ＩＴＳ序列包括ＩＳ１和ＩＴＴＳ２，是分别介于１８Ｓ与
个群体选取２～３株个体进行实验，总６６株实验材
料
５．８Ｓ、５．８ｓ与２８Ｓ ｒＤＮＡ之间的非编码序列，呈
表１实验材料信息 ’
Ｔａｂｌｅ １ Ｓａｍｐｌｅｓ ｕｓｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ
１） ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ江蓠属；Ｇｐ．：Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓ￣龙须菜属；２）Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ原产地为印度尼西亚；３）Ｇ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙＵａ原产
地为俄罗斯；４）ｅ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙＵａ原产地为美国，由中国海洋大学宫庆礼教授提供
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析
１．２实验方法
果得到的最适核酸替换模型为ＧＴＲ＋Ｉ＋Ｇ（参数：
Ｂａｓｅ ｆｒｅｑｕｅｎｃｉｅｓ：Ａ＝０．２６８ ６，Ｃ＝０．１７０ ８，Ｇ＝
０．２３７ ２，Ｔ＝０．３２３ ４；ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎ ｒａｔｅ ｍａｔｒｉｘ：Ａ—
１．２．１总ＤＮＡ提取 总ＤＮＡ提取采用改进的
ＣＴＡＢ法 。所提取ＤＮＡ用Ｗ＝１％琼脂糖凝胶进
行电泳检测，使用ＮａｎｏＤｒｏｐ ＮＤ一１０００仪器，测定
Ａ２６ｏ ２８０、Ａ ６ｏ／／４：３。比值，对ＤＮＡ浓度和纯度进行
质量评价，并将ＤＮＡ模板浓度统一调整到５０ ｎｇ／
Ｌ。
Ｃ＝１．１９ ８，Ａ—Ｇ＝２．３８５ ８，Ａ—Ｔ＝１．３３４ １，Ｃ
—
Ｇ＝１．１４３ ２，Ｃ—Ｔ＝２．８６８ ０，Ｇ—Ｔ＝１．０００ ０；
ｐｒｏｐｏ￣ｉｏｎ ｏｆ ｉｎｖａｒｉａｂｌｅ ｓｉｔｅｓ＝０．０９３ ０，ｇａｍｍａ ｐａ－
ｒａｍｅｔｅｒ＝２．５１０ ４），利用以上数据在ＰＡＵＰ４．０中
１．２．２ ＰＣＲ扩增 用于ＩＴＳ序列扩增的引物为
ＴＷ８ １：５’一ＧＧＧＡＴＣＣＧｒｒ］ ＣＣＧＴＡＧＧＴＧＡＡＣＣＴＧＣ
一
依据邻接法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ ｊｏｉｎｉｎｇ，ＮＪ）和最大似然法
（Ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ，ＭＬ）构建系统树，自举值
Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ为１ ０００次重复。依据最大简约法（Ｍａｘｉ—
３’： ＡＢ２８： ５’ 一 ＧＣＣＡＴＣＣＡＴＡＴＧＣＴＩ＇ＡＡ（ Ｔ—
ＴＣＡＧＣＧＧＧＴ一３ ，引物由上海博尚生物技术有
限公司合成。ＰＣＲ反应体系为２５ ，反应体系：
ｄｄＨ２Ｏ １６．８ ｔｘＬ，１０×Ｂｕｆｆｅｒ ２．５ Ｌ，ＭｇＣ１２（２５
ｍｍｏｌ／Ｌ）２．３ Ｌ，ｄＮＴＰ ２．０ ＩｘＬ，正反引物（１０
ｉｘｍｏｌ／Ｌ）各０．１ ＩｘＬ，ＤＮＡ模板（５０ ｎｇ／ｔｘＬ）１．０
ＩＬＬ，Ｔａｑ ＤＮＡ聚合酶（５ Ｕ／ｐ，Ｌ）０．２ ＩＬＬ。ＰＣＲ扩
增程序：９４℃预处理６ ｍｉｎ后，９４℃变性１ ｍｉｎ，
５１℃复性１ ｍｉｎ，７２ ｏＣ延伸１ ｍｉｎ，总３５个循环，
最后在７２℃延伸１０ ｍｉｎ，４℃保存。
１．２．３ ＰＣＲ产物纯化、克隆及测序ＰＣＲ产物用
ＴＩＡＮｇｅｌ Ｍｉｄｉ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ试剂盒（北京天根生
化科技有限公司）胶回收纯化后与ｐＭＤ１９一Ｔ载
体（ＴａＫａＲａ宝生物工程有限公司）连接后转化至
感受态Ｅ．ｃｏｌｉ ＴＯＰ １０（北京天根生化科技有限公
司）中，经氨苄青霉素抗性筛选，每份ＰＣＲ产物
挑取３个阳性克隆进行扩大培养，菌液ＰＣＲ扩增
并利用Ｗ＝１％琼脂糖凝胶电泳检测插入片段大小，
委托上海英骏生物技术有限公司公司进行双向测
序。
１．２．４数据分析利用ＳｅｑＭａｎ ７．１．０软件对测序
数据进行拼接和质量矫正，并与ＧｅｎＢａｎｋ中下载
到的江蓠科１６个物种的１９条ＩＴＳ全长序列进行对
比分析，选择长心卡帕藻Ｋａｐｐａｐｈｙｃｕｓ ａｌｖａｒｅｚｉｉ
（ＧＱ８６９８４９）作为外群（ＧｅｎＢａｎｋ获取号以及详细
信息见表１和表２）。用ＭＥＧＡ ４．０计算其碱基含
量和变异位点，并选择Ｋｉｍｕｒａ ２－ｐａｒａｍｅｔｅｒ和Ｃｏｍ—
ｐｌｅｔｅ Ｄｅｌｅｔｉｏｎ计算遗传距离。选择不同物种和不同
地理种群的序列用ＣｌｕｓｔａｌＸ １．８３软件进行序列比
对，用ＰＡＵＰ ４．０软件在Ｍｏｄｅｌｔｅｓｔ ３．７中计算不同
核酸替代模型的似然值并筛选出最适核酸替换模
型，最终按Ａｋａｔｋｅ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ Ｃｒｉｔｅｒｉｏｎ（ＡＩＣ）结
ｍｕｍ ｐａｒｓｉｍｏｎｙ，ＭＰ）构建系统树时在ＰＡＵＰ ４．０
中采用启发式搜索（Ｈｅｕｒｉｓｔｉｃ ｓｅａｒｃｈ）的逐步加入
式算法（Ｓｔｅｐｗｉｓｅ ａｄｄｉｔｉｏｎ）分支交换法（Ｂｒａｎｃｈ
ｓｗａｐｐｉｎｇ ａｌｇｏｒｉｔｈｍ）设定为树二等分再连接算法
（Ｔｒｅｅ ｂｉｓｅｃｔｉｏｎ ｒｅｃｏｎｎｅｃｔｉｏｎ，ＴＢＲ），每轮搜索最大
尝试次数为１ ０００次，每步保留２０个树，自举值
Ｂｏｏｔｓｔｒａｐ为１ ０００次重复。
２结果与分析
２．１ ＩＴＳ序列长度和ＧＣ含量分析
ＩＴＳ序列长度和ＧＣ含量分析结果见表２。江
蓠科海藻ＩＴＳ存在较为丰富的长度变异，长度在
８９３～１ ５０８ ｂｐ之间，其中龙须菜属龙须菜 ．
１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ和 ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ的ＩＴＳ序列长度较其
他物种短，分别为１ ０６５（１ ０６６）ｂｐ和８９３ ｂｐ；江
蓠科海藻ＩＴＳ１序列长度在１２１～５６８ ｂｐ之间，ＩＴＳ２
序列长度在５８５～９８４ ｂｐ之间，同一物种的ＩＴＳ２序
列明显长于ＩＳＴ１序列，且其ＧＣ含量明显高于
ＩＴＳ１序列。
相比ＩＴＳ１和ＩＴＳ２序列，江蓠科海藻的５．８Ｓ
序列长度较为稳定，除无管篱生藻Ｇｐ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ、
细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ和智利江蓠Ｇ．ｃｈｌｉｅｎｓｉｓ ３
个物种外，其他物种５．８ｓ序列长度均为１５９ ｂｐ；
５．８Ｓ序列ＧＣ含量也明显高于ＩＳＴ１和ＩＴＳ２序列的
ＧＣ含量。细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ５．８Ｓ序列为
１３９ ｂｐ，在６Ｏ ｂｐ位点后缺失１９个碱基，在１１４ ｂｐ
处缺失一个碱基；智利江蓠Ｇ．ｃｈｌｉｅｎｓｉｓ ５．８Ｓ序列
为１４０ ｂｐ，在６０ ｂｐ位点后缺失１９个碱基；蓠生
藻属无管篱生藻 ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ的５．８ｓ序列长１６２
ｂｐ，在１０２位点之后增加了３个Ｔ碱基（见图１）。
１００ 中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
１ ５Ｏ４～
Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ ３７２～３７３ ３５．７ １５９ ４９．１ ９７２～９７６ ３９．１
１ ５０８
１ ４２５～
３７．２
１ ４３０
Ｇ ｃｈｏｕａｅ
Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
３６９ ３８．７ １５９
１５９
１３９
１４０
１５９
１５９
１５９
１５９
４９．１
４９．１
４８．９
５０．Ｏ
４９．１
６０１ ４１．１
１１２９ ４１．５
３９．３
见表１
见表１
见表１
见表１
Ｔｈｉｓ ｗｏｒｋ
Ｇ ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ ５２４～５２７ ３３．８ １５９ ４９．１ ７４２～７４５ ３７．１
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
Ｔｈｉｓ ＷＯｒｋ
１ ３０７—
５６７～５６８ ３５．７
５６８ ３５．９
３６．０
３３．３
３９．８
４２．０
３８．２
５７８—５８０ ３６．７
１ ３０５
５７８ ３６．８
３６．３
４０．６
４３．６
４１．７
４１．２
ｖａｒ．１ｉｕ
Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
Ｇ ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ
Ｇ ｕｅｒＦｌ￣ｏｓａ
３７．８
１ ２８５
１ Ｏ９４
１ Ｏ９２
３７．８
３７．８
４０．７
４３．２
４２．９
４１．５
４２．３
ｆ ｅｔ ａ１．［２２］
ＧＴＵ２１３４３
Ｇｏｆ
Ａｆ１Ｄ３４２６５
Ｕ２１３４２
３６１
１５６
３４４
３４６
３１９
５９３
７７８
７０５
５８５
６６１
６７８
７６１
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．［２２］
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．【 ］
Ｇ ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ
４９．１
４９．１
４９．１
４９．１
１ ２０８
１ ０９０
１ １３９
１ １８７～
ＡＦ４６８９１３．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［’。
ＡＦ４７２４２０
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４７２４１９
Ｂｅ１１
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９ １６
Ｂｅ１１
ＡＦ４７２４ｌ７．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［１ｏＪ
ＡＦ４７２４１８
Ｇ．ａｔ．１ｆａｃｉｎｕｌａｔａ
Ｇ．ａｔ．ｍａｍｍｉｆｌｌａｒｉｓ
Ｇ．ａｔ．ｔｆｅｐｏｃｅｎｓｉｓ ３５０～３５２ ３７．７
Ｇ ｃｅｒｖｉｃｏｒｎｉｓ
４４０
１５９
１５９
１５９
１５９
ｌ５９
１５９
１５９
１５９
１５９
４３．０
１ １８９
４２．２
４２．６
４２．４
４２．８
３９．０
４３．１
３８．８
４４．３
３６．０
３１．４
４９．１
４９．１
４９．１
１ ３６０
１ １６８
１ １３４
４２．０
４３．６
４２．２
４４．０
４２．９
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９１７
Ｂｅ１
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９１２
Ｂｅ１
ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［１ｏ］
ＡＦ４６８９ｌ １
Ｂｅ１１
Ｕ２１３４１
Ｇ０ｆｆ ｅｔ ａ１．［ ］
Ｔｈｉｓ ｗｏｒｋ，
Ｌｉ ｅｔ ａ１．［２３］
ｅｆｏｌｉ ｍ ｖａｒ
ｔｉ砌ａｈｉａｅ
３６０
３５１
３２７
６４９
６２４
７４５
Ｇ ｐａｃｉｆｗａ
．
４９．１
４９．１
４８．４
１ ２３０
ｌ ０６５～
１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ
．
２５０
６６６～６６７ ４．１
１ ０６６
６１４ ４６．９
见表１，
ＥＵ５６１２３９
ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ
ｃａｕｄａｔａ
１２１
８９３
ｌ ２３９—
４５．１
４１．３
ｅｔ ａ１．［ ］
ＧＴＵ２ｌ２４６
Ｇｏｆｆ
ＡＦ４６８９１０．
Ｂｅ１１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９０９
１ｏｒｉｎ ｅｔ ａ１．［ 。］
ＡＦ４６８９０７
Ｂｅ１
Ｕ３３１３９
３４６～３５１ ３６．９
３２８ ３７．８
４９．７ ７２９～７３６ ４１．５
１ ２４１
Ｈ．ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ ４９．７
７２７ ４２．８
１ ２１４
７３４
４２．３
４４．８
Ｇｐ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ １０９ ３３．１ １６２ ４８．１
４６３ ４６．４
Ｇｏｆｆ ｅｔ ａ１．［ ］
１）Ｇ１．：Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｈｉｌａ蓠生藻属； ：Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
２．２ ＩｒＩ’Ｓ序列比对分析
异位点。江蓠属与龙须菜属物种间的遗传距离在
０．４０１—０．５５４之间。江蓠属与Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间 对所有江蓠科的ＩＴＳ序列用ＭＥＧＡ ４．０进行比
对，比对后序列长度为１ ７８１ ｂｐ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｇａｐｓ），
计算遗传距离结果显示，江蓠科各属内的种间遗传
的遗传距离在０．１９３—０．４０９之间。江蓠属与篱生
藻属物种间的遗传距离在０．５２７～０．６００之间。龙
须菜属与Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间的遗传距离在０．３８２～
０．５３５之间。龙须菜属与篱生藻属物种间的遗传距
距离明显大于种内遗传距离（见表３）。江蓠属各
物种的种内遗传距离在０．０００～０．０１２之间，存在
０～３６个变异位点；细基江蓠繁枝变种和细基江蓠
离在０．２６７～０．４０６之间。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ与篱生藻属
物种间的遗传距离在０．５３３～０．５７８之间。
在本文研究的江蓠属和龙须菜属５个物种的
２３个群体中，龙须菜８个群体２４株个体的平均遗
传距离为０．０００，存在２个变异位点；芋根江蓠２
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ种间遗传距离为０．００４，存在２５个
变异位点，包括了１４个种间区分位点；江蓠属其
他物种的种间遗传距离在０．０４１—０．４１１之间，存
在１１１～６１１个变异位点。龙须菜属的种内遗传距
离为０．０００，龙须菜和Ｇｐ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ种间遗传距离
为０．３８２。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ中Ｈ ｃａｕｄａｔａ种内遗传距离
为０．００９，存在１４个变异位点；ＨＩ ｃａｕｄａｔａ和Ｈ．
ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ种间遗传距离为０．１２８，存在２５２个变
个群体６株个体的平均遗传距离为０．００３，存在１２
个变异位点；脆江蓠２个群体６株个体的平均遗传
距离为０．０００，存在１个变异位点；细基江蓠繁枝
变种６个群体１７株个体的平均遗传距离为０．００４，
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 １０１
ＡＣＡＡＣＴＣＧＴＡ ＡＣＧＧＴＧＧＡＴＧ ＴＣＴＣＧＧＣＴＣＣ ＴＡＣＡＴＣＧＡＴＧ
Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ
Ｇ．ｃｈｏｕａｅ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｔ．１ｉｕｉ
ＡＡＧＡＡＣＧＴＡＧ ＣＡＡＡＣＴＧＣＧＡ ＡＡＣＧＴＡＡＴＧＣ ＧＡＡＴＴＧＣＡＧＡ Ａ
Ｇ．ｖｅｒｒｕｃｏｓａ
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ
Ｇ．口 ｌａｃｉｎｕｌａｔａ
Ｇ．ａｆｆｍａｍｍｉｌｌａｒｉｓ
Ｇ．ａｆｆ．ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ
Ｇ．ｃｅｎ，ｉｃ０ｒｎｉｓ
Ｇ．ｆｏｌｉｉｆｅｒａ ｖａｒ
Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ
Ｇ ｐａｃｉ，；ｃａ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔ ｉｔａｔａ
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ
Ｈ．ｃａｕｄａｔａ
Ｈ ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ
Ｇｐ．１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ
Ｇｐ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ
ＧＰ．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ
． ．． ．．．
Ｔ． ．．．．．．． ． ．． ．．
・
Ｔ． ．．．． ． ． ． ．．
Ｃ．．．．．．．．．．．．Ｔ．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．Ｃ
．．．．． ．．
Ｔ．． ．．．
Ｔ．ＣＧ
．
Ｔ
Ｃ Ｔ
ＴＡＴ Ｔ
ＣＴＣＧＴＧＡＡＴＣ ＡＴＣＡＡＡＴＴＴＴ Ｔ．．一ＧＡＡＣＧＣ ＡＡＧＴＧＧＣＧＣＴ
Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ
Ｇ．ｃｈｏｕａｅ
ＣＧＣＧＧＧＴＡＡＣ ＣＣＴＧＣＧＡＧＣＡ ＴＧＴＣＴＧＴＴＴＧ ＡＧＴＧＴＣＣＧＴＡ Ｃ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｔ．１ｉｕｉ
Ｇ．ｖｅｒｒｕｃｏｓａ
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ
Ｇ．口 ｌａｃｉｎｕｌａｔａ
Ｇ．ａｆｆ．ｍａｍｍｉｌｌａｒｉｓ
Ｇ． ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ
Ｇ．ｃＰｒｖｆｃＤ， ｆ
Ｇ．ｆｏｌｉｉｆｅｒａ ｖ口ｒ
Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ
Ｇ．ｐａｃｉｆｉｃａ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
Ｔ
Ｃ
ＣＡＧ
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ
Ｈ．ｃａｕｄａｔａ
Ｈ．ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ
Ｃ
Ｃ
．
Ｇｐ．１ｅｍａｎｅｉｆｏｒｍｉｓ
Ｇｐｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ
Ｇ口．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ
Ｃ
Ｔ
Ｔ
Ｔ
．．
．
Ｔ ．．
Ｃ．Ｔ．．ＣＧ
．．．Ｃ
．．．．．．．
．．．
Ｃ
Ｇ
ＴＧ ．
．
ＴＧ．．
Ｔ．．Ｃ Ｔ
［１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２］
【１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２］
【１６２】
［１６２］
［１６２］
［１６２］
［１６２】
［１６２］
［１６２］
【１６２］
［１６２］
图１江蓠科海藻５．８Ｓ核苷酸序列比对
Ｆｉｇ．１ Ｔｈｅ ａｌｉｇｎｍｅｎｔ ｏｆ ５．８Ｓ ａｍｏｎｇ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
存在１６个变异位点；上述物种不存在群体区分位
点。真江蓠５个群体１３株个体的平均遗传距离为
０．００２，１３个变异位点，且中国、俄罗斯和美国三
地的种群间存在９个稳定有效的信息位点，可区分
三地的群体（见图２），但在中国两野生真江蓠群
体间存在６个变异位点，均为个体的随机变异，并
无稳定有效的信息位点。
存在１～４个变异位点，其中有１个位点可进行属
的鉴别。江蓠属与蓠生藻属物种间的遗传距离在
０．０９９～０．１１６之间，存在１３～１７个变异位点，其
中１２个位点可进行属的鉴别。龙须菜属与 一
ｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种问的遗传距离在０．０５２～０．０８０之间，
存在８～１２个变异位点，其中５个位点可进行属的
鉴别。龙须菜属与蓠生藻属物种间的遗传距离为
单独对江蓠科海藻的５．８ｓ序列进行分析，比
对后序列长度为１６２ ｂｐ（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｇａｐｓ），存在３６
０．０７３～０．１０１，存在１１～１５变异位点，其中７个
位点可进行属的鉴别。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ与蓠生藻属物
种问的遗传距离为０．１２３，存在１８个变异位点，
均可进行属的鉴别。在江蓠属中，除细基江蓠Ｇ．
ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ、智利江蓠Ｇ．ｃｈｉ￣ｎｓｉｓ和Ｇ．ｐａｃｉｉｃａ ｆ
个变异位点，其中包括了１４个信息位点，序列比
对结果见图１。江蓠属与龙须菜属物种间的遗传距
离在０．０４６～０．０８４之间，存在７～１１个变异位点，
其中４个位点可进行属的鉴别。江蓠属与 一
外，其他物种的５．８Ｓ序列完全一致；细基江蓠Ｇ．
ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ和智利江蓠Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ除碱基缺失外，
ｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种间的遗传距离在０．００６～０．０２６之间，
１０２ 中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
两者与其他江蓠属物种都存在一个位点的变异；
Ｇ．ｐａｃｉｉｆｃａ与细基江蓠Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ、智利江蓠
Ｃｐ．ｔｅｎｕｉｆｒｏｎｓ物种间的遗传距离为０．０６０，存在１０
个变异位点。Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ中Ｈ ｃａｕｄａｔａ和Ｈ Ｃ，。（ —
ｓｉｓｓｉｍａ两物种５．８Ｓ序列完全一致。所有江蓠科物
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ的遗传距离均为０．０２９，与其他江蓠属
物种间的遗传距离均为０．０１９，存在３个变异位
种的５．８ｓ序列种内遗传距离都为０．０００。
点。龙须菜属的龙须菜种内遗传距离为０．０００，与
ＡＧＧＴＴ
ＱｉｎｇＤａｏ
ＴＴＣＡＣＡＡＡＡＡ ＡＣＡＧＣＣＴＡＡＣ ＧＣＡＡＣＡＴＧＧＴ ＴＴＣＴ１＿
４０
４０
４０
ＡＡｒＡＡＡＡＣＡＧ ＡＡＣＣＧＣＣＡＴＡ ＧＣＡＣＧＧＣＴＴＧ ＴＴＴＣＡＩ’ＡＴＣＡ
４４０
４４０
ＷｅｉＨａｉ
Ｒｕｓｓｉａ Ｇ
４４０
４４０
ＵＳＡ
Ｔ
４０
Ｇ
ＱｉｎｇＤａｏ
ＡＴＣＧＴＴＣＴＡＴ ＣＧＴＣＧＡＧＡＴＡ ＡＴＴＧＣＴＧＧＡＧ ＡＧＣＴＡＡＧＡＡＧ
ＷｅｉＨａｉ
２４０
２４０
ＴＡＧＧＡＧＴＧＡＴ ＧＡＣＣＡＴＡＡＡＡ ＡＣＡＡＴＧＣＴＴＴ ＴＴ．ＧＴＴＴＴＧＴ
２８０
２８０
２８０
２８０
Ｒｕｓｓｉａ
ＵＳＡ
Ｇ
２４０
２４０
．．．．．．．．．．．．．． ．． ．．． ．．．．．
Ｔ．．．．．
１．．．．．．
．．．．．．．．．． ．．．． ．． ．．． ．．． ．．
ＱｉｎｇＤａｏ ＴＴＴＴＴＧＧＧＣＧ ＴＴＴＴＡＴＴＧｃＴ ＴＣＴＴＴ－ＧＴＧＣ ＣＧＡＣＡＴＣＣＡＴ
ＷｅｉＨａｉ・・・・・・・・・・・－・・・・ －・・・・・一－－・・－・・・・一
３２０
ＴＧＴＧＣＧＡＡＡＣ ＣＡＡＣＣＣＡＡＡＡ ＡＣＴＴＡＡＧＡＴＡ ＴＴＴＴＴ
４３５
４３５
３２Ｏ
３２０
３２Ｏ
Ｇ Ｔ。。 ‘‘Ｇ
Ｒｕｓｓｉａ
ＵＳＡ
．．．Ｇ．．．．．．．．．．．．．．．．．．Ｔ．．．．．．．．．．．．．．
．．．．． ．．．．．．一．．．．．．．．．．．．
４３５
４３５
．．．．Ｇ ．．．
图２真江蓠不同地理群体间ＩＴＳ序列稳定有效信息位点
Ｆｉｇ．２ Ｔｈｅ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｓｉｔｅｓ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ｇｅｏｇｒａｐｈｉｃａｌ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ ｏｆ Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ
表３江蓠科海藻的种间遗传距离”
Ｔａｂｌｅ ３ Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅ ａｍｏｎｇ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｅｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ
１） １：Ｇ ｃｈｏｕａｅ；２：Ｇ ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ；３：Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ；４：Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ ｖａｒ．１ｉｕｉ；５：Ｇ ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ；６：Ｇ ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ；７：
Ｇ Ｌａｃｉｎｕｌａｔａ；８：Ｇ Ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ；９：Ｇ．ａｔ．Ｍａｍｍｉｆｌｌａｒｉｓ；１０：Ｇ ｆｏＺＵｆｅｒａ ｖａｒ；１１：Ｇ ｔｉｋｖａｈｉａｅ；１２：Ｇ ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ；１３：
ｅ ｃｅｒｖｉｃｏｒｎｉｓ；１４：Ｇ－ｐａｃｉｉｆｃａ；１５：Ｇ ｖｅｒｒｕｃｏｓａ；１６：Ｈ ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ；１７：Ｈ ｃａｕｄａｔｅ；１８：Ｇｐ・Ｌｅｍａｎｅ／ｆｏｒｍ／ｓ；１９：Ｇｐ．Ｔｅｎｕｉ—
ｆｒｏ，￣；２０：Ｇ１．ｏｒｙｚｏｉｄｅｓ
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 ｌ０３
１ＯＯ Ｈ．ｃａｕｄａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
ｌＯ０ Ｈ．ｃａｕｄａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
・Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
１０Ｏ
・Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ
１ｏｏＪ ９１
Ｈ．ｃｒａｓｓｉｓｓｉｍａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ｖｅｒｒｕｃｏｓａ Ｈａｌｉｆａｘ
ｌ０Ｃ
Ｇ．ｐａｃｆ，｝ｃａ Ｐｕｅｒｔｏ Ｒｉｃｏ
Ｇ．ｃｅｒｖｉｃＤｒ”ｉ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
７７
Ｇ．ａ ｍａｍｍｉｌｌａｒｉｓ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
ｌ １００Ｌ
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｉ １００
Ｇ．ｄｏｍｉｎｇｅｎｓｉｓ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ Ｃａｎａｄａ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ￣Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
Ｇ．口 ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｇ．ａｆｆ ｔｅｐｏｃｅｎｓｉｓ Ｂｒａｚｉｌ
Ｇ．ｆｏｌｉｉｆｅｒａ ｖａｒ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
Ｇ．ａ ｌａｃｉｎｕｌａｔａ Ｖｅｎｅｚｕｅｌａ
８９
・Ｇ．ｃｈｏａｅ
▲Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ Ｃｈｉｎａ．＇Ｑｉｎｇｄａ
８４‘。‘’。‘——
▲Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐ ｖｌｌａ Ｃｈｉｎａ．＂ ｆ 口ｆ
・Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｒ，ｈｙｌｌａ Ｒｕｓｓｉａ
１００
・Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｌ￣ ｈｙｌｌａ
・Ｇ．ｆＰ 甜ｆ ｆ 口ｆｆ ｆ ＹａＦ．１ｉｕｉ
ｌＯ０
・Ｇ．ｆＰ 材ｆ ｆｆ口ｆｆ ｆｄ １）ａｔ，ｌｉｕｉ
Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ Ｃｈｉｎａ．＇Ｈａｉｎａｎ
ｌＯ０
Ｇ．ｃｈｉｌｅｎｓｉｓ ＮｅＷ Ｚｅａｌａｎｄ
。Ｇ
Ｇ
妻ｐＩ ．ｏｌｔ‘ｅｒ ｙｍｎｚｕａ ｏｉ ｆｎ。ｒｄｅｏｉ ｅ。ｆｎｓｏ ｓ白ｒ ＣｍａＶ ”ｉｅｌｓｆｎ ｏＣｅｚｒｈｎｕｉｅｎａｌａ．＇Ｑｉｎｇｄａｏ］１ Ｇｒ “ｃ “．，ａ…ｒ ‘．。 、Ｇｒａｃ “．， ｒ ‘．，．， ｎ
图３江蓠科海藻ＩＴＳ序列系统进化树（ＭＰ）
Ｆｉｇ．３ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｉｃ ｔｒｅｅ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｂａｓｅｄ ｏｎ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｂｙ ＭＰ ｍｅｔｈｏｄ
（●：养殖种群；▲：野生种群）
２．３ ＩＴＳ系统树构建
间存在较为广泛的变异。Ｙａｍａｍｏｔｏ等 根据精子
根据江蓠科物种ＩＳＴ序列用ＮＪ、ＭＰ和ＭＬ法 囊窠的发生位置将江蓠属分为江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
构建系统树，３种方法聚类结果一致，仅列出ＭＰ 和龙须菜属。但在本研究中用ＩＴＳ序列构建系统
法构建的系统树（见图３）。比对后总１７７２位点矩
树，结果显示Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ物种聚类到江蓠属内，
阵，３０２个稳定位点，９１个变异位点但无信息的位 并未形成单独的分支，不存在明显的属间遗传分
点，１ ３７９个信息位点，启发式搜寻后最终获得１
化，但与龙须菜属／蓠生藻属分别聚在两大分支上，
个最优简约树，步长为５ ４３５，一致性指数（ＣＩ）
存在明显的属间遗传分化。这与之前报道的ＳＳＵ
和严格性指数（ＲＩ）分别是０．５８６和０．７６５。从系 ｒＤＮＡ、Ｒｕｂｉｓｃｏ ｓｐａｃｅｒ和ｒｂｃＬ序列系统聚类的结果
统树结构中可以看出，２０种江蓠科海藻可基本分 是一致的¨ｏ１ ’ Ｊ。在江蓠属系统分类中，江蓠属和
为２大分支，包括龙须菜属／蓠生藻属分支，江蓠
Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ海藻精子囊窠包括了“Ｖ”型、 “Ｔ”
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ分支。其中龙须菜属和蓠生藻属处 型和“Ｐ型”３种类型，而龙须菜属精子囊窠则属
在系统树的最基部，说明其分化时间可能早于江蓠
于“Ｃ型” ，在系统树中可以将其分为两组；但
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ。江蓠属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ形成了３个小
江蓠属和Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ海藻并未按其精子囊窠排列
的分支，分别是细基江蓠繁枝变种Ｇ．ｔｅｎｕｉｓｔｉｐｉｔａｔａ
方式的类型而形成单独的分支，也没有形成与地域
ｖａｒ．１ｉｕｉ分支、真江蓠Ｇ．ｖｅｒｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ分支、脆 分布相关的分支，这可能与这两个属存在着并系起
江蓠Ｇ．ｃｈｏｕａｅ与芋根江蓠Ｇ．ｂｌｏｄｇｅｔｔｉｉ分支；青岛
源关系有关。篱生藻属寄生于江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ
与威海的野生真江蓠关系最近，其次是俄罗斯和美 和龙须菜属海藻，其藻体内部构造和生殖结构同于
国的养殖真江蓠，支持率分别为１００、８４和１００。
江蓠属、Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ和龙须菜属 ；蓠生藻属海
３讨论
藻是从最初的宿主藻体进化而来 ，在寄生过程
中可从宿主获取叶绿体，而保留自身的核基因组和
江蓠科４个属２０个物种ＩＴＳ长度差异较大，
线粒体基因组 引，Ｂｅｌｌｏｒｉｎ等ｌｌ。。认为篱生藻属与
遗传距离和系统聚类分析结果显示，不同种、属之 龙须菜属海藻属于并系起源，至少有一个篱生藻属
中山大学学报（自然科学版） 第５１卷
物种是由龙须菜属演化而来；本研究也显示了同样
的结果。但是蓠生藻属海藻寄生过程中是否会与宿
主发生遗传物质的水平转移，以及在不同寄主中是
否多次发生遗传物质的水平转移还有待证实。
ＩＴＳ序列无论是在序列长度还是变异程度上都
能很好地区分和鉴定江蓠科物种。细基江蓠和细基
江蓠繁枝变种的形态学主要差异是前者分枝１～２
次，后者具有更多纤细的分枝；尽管细基江蓠和细
基江蓠繁枝变种的ＩＴＳ序列遗传距离低于江蓠科全
部海藻的种间差异，属于种内差异水平，但其存在
着２５个变异位点，包括了１４个种间区分位点，同
时细基江蓠５．８Ｓ序列较江蓠属海藻缺失２０个碱
基，显示出独特的序列结构，这可能意味着细基江
蓠与细基江蓠繁枝变种之间的分类地位还需要进一
步的研究确认。
江蓠科海藻５．８Ｓ序列长度相对ＩＴＳ１和ＩＴＳ２
保守，且种内和种间变异很小，存在着特定的稳定
属间区分位点，且对于具有并系关系的属（江蓠
属／Ｈｙｄｒｏｐｕｎｔｉａ和龙须菜属／蓠生藻属）也具有稳
定的区分位点，因此利用这些位点可以进行江蓠科
属水平上的分类鉴定。同样已报道的江蓠科１８Ｓ
ｒＤＮＡ序列，也存在这特定的属间区分位点，能够
很好地区分属 。
本研究显示，龙须菜、脆江蓠和真江蓠（美
国和俄罗斯）的养殖群体的群体间和群体内变异
相比野生群体遗传变异较小，江蓠科海藻养殖主要
通过无性繁殖进行，不发生有性生殖过程的杂交以
及无性繁殖的遗传重组，这种养殖群体变异水平降
低的情况可能是由于养殖筛选的影响；但在细基江
蓠繁殖变种的养殖群体存在相对较高的遗传变异，
这可能是由于其自然分布和养殖主要集中在亚热带
和热带海域，生长速率和养殖继代频率高，导致其
群体ＩＴＳ序列变异幅度高于其他江蓠种群。在来自
中国、俄罗斯和美国三地的真江蓠群体中，存在着
９个与地理分布相关的信息位点，可以进行群体的
有效区分。这与在真江蓠、提克江蓠Ｇ．ｔｉｋｖａｈｉａｅ、
绳江蓠 ．ｃｈｏｒｄａ、张氏江蓠Ｇ．ｃｈａｎｇｉｉ的ｃｏｘｌ和
ｒｂｃＬ基因序列存在的与地理位置相关的单倍型是一
致的 Ｊ。但在青岛和威海的真江蓠野生群体间
并不存在种群间的稳定区分位点，因此，信息位点
在地理群体识别的方面应用需要考虑到群体数量以
及地理距离的因素。
４前景展望
随着分子生物学研究的不断深入发展，核酸数
据的不断积累，利用单个或多个ＤＮＡ序列并结合
物种形态学研究物种分类与系统进化，逐渐成为现
代生物学研究的有力工具。目前，ＤＮＡ序列分析
在藻类分类鉴定中得到了广泛的应用，对阐明系统
进化关系提供了重要的证据。但从分子系统学研究
手段本身而言，也存在很多需要进一步研究和探讨
的问题。不同类群同一ＤＮＡ序列的进化速率有所
差异，同一类群中不同ＤＮＡ序列的进化速率也不
相同，另外由于藻类早期演化中存在着线粒体和叶
绿体内共生现象，其在平行演化中又存在着并系起
源和直系起源现象，这为研究藻类系统发育与分化
增添了较大的难度。从多个层次以及多个基因位点
上系统地研究藻类形态结构进化、生态适应以及基
因进化的内在关系则显得更为重要和迫切。
参考文献：
［１］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｃｏｍｐａｒａｔｉｖｅ
ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｓｔａｔｕｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９８９，２５：
２２８—２４１．
［２］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｐｒｏｐｏｓａｌ ｏｆ ｔｈｅ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ ｏｒｄ．ｎｏｖ．（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ ａｎ ａｎａｌｙ—
ｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｖｅｒｒｕｃｏｓａ
［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９８９，２５：２１３—２２７．
［３］ ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ，ＨＯＭＭＥＲＳＡＮＤ Ｍ Ｈ．Ｄｉａｇｎｏｓｅｓ ａｎｄ
ｋｅｙ ｔｏ ｔｈｅ ｇｅｎｅｒａ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｅｉｌａｒｉａｌｅｓ，
Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｈｙｄｒｏｂｉｏｌｏｇｉａ，１９９０，２０４／２０５：１７３
—
１７８．
［４］ ＦＲＥＳＨＷＡＴＥＲ Ｄ Ｗ，ＲＵＥＮＥＳＳ Ｊ．Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｒｅｌａ—
ｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｏｆ ｓｏｍｅ Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｇｅｌｉｄｉｕｍ（Ｇｅｌｉｄｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏ—
ｐｈｙｔａ）ｓｐｅｃｉｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ａｎａｌｙ—
ｓｉｓ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉａ，１９９４，３３：１８７—１９４．
［５］ ＳＡＵＮＤＥＲＳ Ｇ Ｗ，ＫＲＡＦＦ Ｇ Ｔ．Ａ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅ
ｏｎ ｒｅｄ ａｌｇａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ：ｆｏｃｕｓ ｏｎ ｔｈｅ Ｆｌｏｆｉｄｅｏｐｈｙｃｉｄａｅ［Ｊ］．
Ｐｌａｎｔ Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ，１９９７，１１：１１５—１３８．
［６］ＨＡＲＰＥＲ Ｊ Ｔ，ＳＡＵＮＤＥＲＳ Ｇ Ｗ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ
ｏｆ ｔｈｅ Ｆｌｏｒｉｄｅｏｐｈｙｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｕｓｉｎｇ ｎｕｃｌｅａｒ ｌａｒｇｅ
ａｎｄ ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄａｔａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，
２００１，３７：１０７３—１０８２．
［７］ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ，ＲＩＣＥ Ｅ Ｌ，ＭＵＲＰＨＹ Ｃ Ａ，ｅｔ ａ１．Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔ—
ｉｃ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ａｓ ｄｅ—
ｔｅｒｍｉｎｅｄ ｂｙ １８Ｓ ｒＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉａ，１９９２，
３１：５１０—５２２．
［８］ ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ．Ａ ｒｅｖｉｅｗ ｏｆ ｒｅｃｅｎｔ ｔａｘｏｎｏｍｉｃ ｃｏｎｃｅｐｔｓ ａｎｄ ｄｅ—
ｖｅｌｏｐｍｅｎｔｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ
Ａｐｐｌ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９５，７：２５５—２６７．
［９］ ＢＩＲＤ Ｃ Ｊ，ＲＡＧＡＮ Ｍ Ａ，ＣＲＩＴＣＨＬＥＹ Ａ Ｔ，ｅｔ ａ１．Ｍｏ—
ｌｅｃｕｌａｒ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏ—
第４期 李婷婷等：江蓠属和龙须菜属５种海藻ＩＴＳ序列分子系统学分析 １０５
ｐｈｙｔａ）：ｆｕｒｔｈｅｒ ｏｂｓｅｒｖａｔｉｏｎｓ ｏｎ ｓｏｍｅ ｕｎｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ ｓｐｅ—
ｃｉｅｓ［Ｊ］．Ｅｕｒｏｐ Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，２９：１９５—２０２．
［１０］ ＢＥＬＬＯＲＩＮ Ａ Ｍ，ＯＬＩＶＥＩＲＡ Ｍ Ｃ，ＯＬＩＶＥＩＲＡ Ｅ Ｃ．
Ｐｈｙｌｏｇｅｎｙ ａｎｄ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｒｉｎｅ ａｌｇａｌ ｆａｍｉｌｙ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ
ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｒＤＮＡ ａｎｄ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ａｔｌａｎｔｉｃ ａｎｄ
Ｐａｃｉｉｆｃ ｓｐｅｃｉｅｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００２，３８：５５１—５６３．
［１１］ＩＹＥＲ Ｒ，ＴＲＯＮＣＨＩＮ Ｅ Ｍ，ＢＯＬＴＯＮ Ｊ Ｊ，ｅｔ ａ１．Ｍｏｌｅｃ—
ｕｌａｒ ｓｙｓｙｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ）
ｗｉｔｈ ｅｍｐｈａｓｉｓ ｏｎ ｓｏｕｔｈｅｒｎ Ａｆｒｉｃａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００５，
４１：６７２—６８４．
［１２］ ＧＵＩＬＬＥＭＩＮ Ｍ Ｌ，ＡＫＫＩ Ｓ Ａ，ＧＩＶＥＲＮＡＵＤ Ｔ，ｅｔ ａ１．
Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓａｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｒａｐｉｄ ｍｏ—
ｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｔｈｏｄｓ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ ｆｒｏｍ
ｔｈｅ Ａｔｌａｎｔｉｃ ｃｏａｓｔ ｏｆ Ｍｏｒｏｃｃｏ［Ｊ］．Ａｑｕａｔｉｃ Ｂｏｔａｎｙ，
２００８，８９：３２４—３３０．
［１３］ ＢＹＲＮＥ Ｋ，ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ Ｃ，ＷＥＳＴ Ｊ，ｅｔ ａ１．
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ
ｓｏｕｔｈｅａｓｔｅｒｎ Ａｕｓｔｒａｌｉａ， ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ａ ｎｅｗ ｓｐｅｃｉｅｓ，
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｐｅｒｐｌｅｘａ ｓｐ．ｎｏｖ．：Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ，ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ａｎｄ ａｇａｒ ｃｏｎｔｅｎｔ［Ｊ］．Ｐｈｙｃｏｌｏｇｉｃａｌ Ｒｅ—
ｓｅａｒｃｈ，２００２，５０：２９５—３１１．
［１４］ ＷＥＩＮＢＥＲＧＥＲ Ｆ，ＧＵＩＬＬＥＭＩＮ Ｍ Ｌ，ＤＥＳＴＯＭＢＥ Ｃ，
ｅｔ ａ１．Ｄｅｆｅｎｓｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｒｈｏｄｏ—
ｐｈｙｔａ）：ｓｕｂｓｔｒａｔｅ—ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ｏｘｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ａｇａｒ ｏｌｉｇｏｓａｃ—
ｃｈａｒｉｄｅｓ ｉａ ｍｏｒｅ ａｎｃｉｅｎｔ ｔｈａｎ ｔｈｅ ｏｌｉｇｏａｇａｒ・・ａｃｔｉｖａｔｅｄ ｏｘｉ—－
ｄａｔｉｖｅ ｂｕｒｓｔ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２０１０，４６：９５８—９６８．
［１５］ ＧＡＲＧＩＵＬＯ Ｇ Ｍ，ＭＯＲＡＢＩＴＯ Ｍ，ＧＥＮＯＶＥＳＥ Ｇ，ｅｔ
ａ１．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉ—
ａｃｅａｅｎ ｓｐｅｃｉｅｓ ｆｒｏｍ ｔｈｅ Ｍｅｄｉｔｅ￣ａｎｅａｎ Ｓｅａ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙ—
ｃｏｌ，２００６，１８：４９７—５０４．
［１６］ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＢＯＯ Ｓ Ｍ．Ｔａｘｏｎｏｍｙ ａｎｄ ｐｈｙ—
ｌｏｇｅｎｙ ｏｆ ｌｆａｔｔｅｎｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉｃｅａｅ，
Ｒｈｏｄｕｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ Ｋｏｒｅａ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｐｒｏ—
ｔｅｉｎ—ｃｏｄｉｎｇ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ａｎｄ ｐｓｂＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ［Ｊ］．Ｐｈｙ—
ｃｏｌｏｇｉａ，２００６，４５（５）：５２０—５２８．
［１７］ ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ
Ｇｒａｅｉｌａｒｉａｃｅａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）：Ａ ｃｒｉｔｉｃａｌ
ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｅｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙ—
ｃｏｌ，２００４，４０：１３８—１５９．
［１８］ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，Ｌ１ＡＯ Ｌ Ｍ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．ｅｔ ａ１．
Ｓｙｓｔｅｍａｔｉｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙ—
ｔａ）ｂａｓｅｄ ｏｎ ｒｂｃＬ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｅｓ ａｎｄ ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌ
ｅｖｉｄｅｎｃｅ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，２００３，３９：１５４—１７１．
［１９］ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ Ｃ，ＵＲＧＥＲ Ｇ Ｂ，ＷＥＳＴ Ｊ Ａ，ｅｔ ａ１．
Ａ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ｍａｒｋｅｒ ｆｏｒ ｒｅｄ ａｌｇａｌ ｉｎｔｒａｓｐｅｃｉｉｆｃ ｒｅｌａ—
ｔｉｏｎｓｈｉｐｓ［Ｊ］．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｅｃｏｌｏｇｙ，１９９９，８：１４４３—
１４４７．
［２０］ 孙晓宇，罗丹，赵翠，等．不同保存条件下五种大型
海藻的ＤＮＡ提取和ＰＣＲ分析［Ｊ］．分子植物育种
（ｏｎｌｉｎｅ），２０１１，９（９５）：１６８０—１６９１．
［２１］
ＣＯＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ，ＶＡＣＱＵＩＥＲ Ｖ Ｄ．Ｅｘｐｌｏｒｉｎｇ ｔｈｅ ｐｈｙ—
ｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｕｔｉｌｉｔｙ ｏｆ ＩＴＳ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｆｏｒ ａｎｉｍａｌｓ：Ａ ｔｅｓｔ
ｃａｓｅ ｆｏｒ ａｂａｌｏｎｅ（Ｈａｌｉｏｔｉｓ）［Ｊ］．Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｅ—
ｖｏｌｕｔｉｏｎ，２００２，５４：２４６—２５７．
［２２］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ．ＭＯＯＮ Ｄ Ａ．Ｃ０ＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
ｄｅｌｉｎｅａｔｉｏｎ ｏｆ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｎｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｓ ｉｎ ｔｈｅ
ｒｅｄ ａｌｇａｌ ａｇａｒｏｐｈｙｔｅｓ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ａｎｄ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ
（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｌｅｓ）［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，３０（３）：５２１—
５３７．
［２３］
李敏，隋正红，易恒，等．龙须菜５．８Ｓ ｒＲＮＡ和ＩＴＳ
区的克隆与系统学分析［Ｊ］．中国海洋大学学报：自
然科学版，３９（１）：７７—８３．
［２４］
ＹＡＭＡＭＯＴＯ Ｈ．Ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｇｒａｃｉａｒｉｏｐｓｉｓ
ａｎｄ Ｇｒａｃｉａｒｉａ ｆｒｏｍ Ｊａｐａｎ［Ｊ］．Ｂｕｌｌ Ｆａｃ Ｆｉｓｈ．Ｈｏｋｋａｉｄｏ
Ｕｎｉｖ，１９７５，２６：２１７—２２２．
［２５］
ＩＳＡＢＥＬＬＡ Ａ Ａ，ＺＨＡＮＧ Ｊｕｎｆｕ，ＸＩＡ Ｂａｎｇｍｅｉ．Ｇｒａ—
ｃｉａｒｉａ ｍｉｘｔａ，ｓｐ．ｎｏｖ．ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｗｅｓｔｅｒｎ Ｐａｃｉｉｆｃ ｓｐｅｃｉｅｓ
ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｕｓ（Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ：Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ）［Ｊ］．Ｐａｃｉｆ－
ｉｃ Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，４５（１）：１２—２７．
［２６］ 夏邦美，张峻甫．中国海藻志［Ｍ］．北京：科学出版
社，１９９９：１７．
［２７］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ，ＺＵＣＣＡＲＥＬＬＯ Ｇ．Ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｐａｒａｓｉｔ—
ｉｓｍ ｉｎ ｒｅｄ ａｌｇａｅ：Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ｏｆ ａｄｅｌｐｈｏｐａｒａ—
ｓｉｔｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｈｏｓｔｓ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，１９９４，３０：６９５—
７２０．
［２８］
ＧＯＦＦ Ｌ Ｊ．ＣＯＬＥＭＡＮ Ａ Ｗ．Ｆａｔｅ ｏｆ ｐａｒａｓｉｔｅ ａｎｄ ｈｏｓｔ
ｏｒｇａｎｅｌｌｅ ＤＮＡ ｄｕｒｉｎｇ ｃｅｌｌｕｌａｒ ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎ ｏｆ ｒｅｄ ａｌ—
ｇａｅ ｂｙ ｔｈｅｉｒ ｐａｒａｓｉｔｅｓ［Ｊ］．Ｔｈｅ Ｐｌａｎｔ Ｃｅｌｌ Ｏｎｌｉｎｅ，
１９９５，７（１１）：１８９９—１９１１．
［２９］
ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＧＥＲＡＬＤＩＮＯ Ｐ Ｊ Ｌ，ｅｔ ａ１．Ｍｉｔｏ—
ｃｈｏｎｄｒｉｌａ ｃｏｘｌ ａｎｄ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ｇｅｎｅｓ ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｙｅｒ—
ｍｉｃｕｌｏｐｈｙｌｌａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）［Ｊ］．Ｊ Ａｐｐｌ
Ｐｈｙｃｏｌ，２００８，２０：１６１～１６８．
［３０］
ＧＵＲＧＥＬ Ｃ Ｆ Ｄ，ＦＲＥＤＥＲＩＣＱ Ｓ．Ｐｈｙｌｏｇｅｏｇｒａｐｈｙ ｏｆ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｔｉｋｖａｈｉａｅ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）：Ａ
ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｃｏｎｔｉｎｕｉｔｙ ａ ｃｏｎｔｉｎｕｏｕｓｌｙ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｅｄ
ｓｐｅｃｉｅｓ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｖｉｄｅｎｃｅ［Ｊ］．Ｊ Ｐｈｙｃｏｌ，
２００４，４０：１３８—１５９．
［３１］
ＫＩＭ Ｍ Ｓ，ＹＡＮＧ Ｅ Ｃ，ＫＩＭ Ｓ Ｙ，ｅｔ ａ１．Ｒｅｉｎｓｔａｔｅｍｅｎｔ
ｏｆ Ｇｒａｃｉｌａｒｉｏｐｓｉｓ ｃｈｏｒｄａ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）
ｂａｓｅｄ ｏｎ ｐｌａｓｔｉｄ ｒｂｃＬ ａｎｄ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ｃｏｘｌ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ
［Ｊ］．Ａｌｇａｅ，２００８，２３（３）：２０９—２１７．
［３２］
ＹＯＷ Ｙ Ｙ，ＬＩＭ Ｐ Ｅ，ＰＨＡＮＧ Ｓ Ｍ．Ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ
Ｇｒａｃｉｌａｒｉａ ｃｈａｎｇｉｉ（Ｇｒａｃｉｌａｒｉａｃｅａｅ，Ｒｈｏｄｏｐｈｙｔａ）ｆｒｏｍ
ｗｅｓｔ ｃｏａｓｔ，Ｐｅｎｉｎｓｕｌａｒ Ｍａｌａｙｓｉａ ｂａｓｅｄ ｏｎ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ
ｃｏｘＩ ｇｅｎｅ ａｎａｌｙｓｉｓ［Ｊ］．Ｊ Ａｐｐｌ Ｐｈｙｃｏｌ，２０１１，２３：２１９
——
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