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IS6110基因缺失结核分枝杆菌感染的肺结核一例

IT圈 admin 41浏览 0评论

2024年8月1日发(作者:淳于觅荷)

• 302 •

中国防痨杂志 2021 年 3 月第 43 卷第 3 期 Chin J Antituben^March 2021,V〇1. 43,No. 3

•病例报告•

LSWiO基因缺失结核分枝杆菌感染的肺结核一例

谈小文王媛崔晓利党丽云雷静任斐赵国连

分子生物学检测方法因其具有检测敏感度高、特异性强

和时效性高等特点,成为结核病快速珍断的重要检测手段。

对于分子生物学检测,寻找检测效率高且存在特异性的靶基

因尤为重要,分子检测靶基因的种属特异性和多拷贝序列是

确保检测结果准确性和高效性的重要因素。结核病分子生

物学病原诊断常用的诊断靶标有

rfiiVAjqB

和基因等,以上基因均属于管家基因。其中

IS6n

〇为

多拷贝基因,其用于病原学诊断敏感度高于单拷贝基因,但

是基因并非存在于所有结核分枝杆菌中,有的菌株

/S6]

0

基因缺失,可能造成假阴性结果

2

。本研究对西安

市胸科医院收治的

1

例基因零拷贝菌株感染的结核

病患者病原学诊断过程及分离株测序结果进行分析,旨在为

临床诊断工作提供借鉴。

临床资料

患者,男,

50

岁。因间断咳嗽、咳痰、胸闷、气促

10

月,伴发热

1

周,于

2020

6

13

日入住西安市胸科医院。

患者

5

年前无明显诱因出现咳嗽、咳白色黏痰,未行特殊处

理。

2019

8

27

日患者因胸闷、气促,就诊于当地医院,

诊断为

尘肺

,给予对症治疗后症状稍有好转,但活动后仍

感到气促,休息后可缓解,随着病程进展,气促症状逐渐加

重。患者于

2020

6

5

日出现发热,最高体温

37.9

。,午

后明显

.

无畏寒、寒颤,就诊于山阳县中医医院,行胸部

CT

示双肺出现病灶并形成空洞,不排除肺结核可能,遂来我院

做进一步诊断治疗。患病期间,患者无咯血,无胸痛和心慌,

无恶心和呕吐,体质量

6

个月减轻

10 kg

人院时体格检查:体温

37 °C

脉搏

92

/min,

呼吸频率

开放科学(资源服务)标识码(

OSID)

的开放科

学计划以二维码为入口,提供丰富的线上扩展

功能,包括作者对论文背景的语音介绍、该研究

的附加说明、与读者的交互问答、拓展学术圈等。

读者“扫一扫”此二维码即可获得上述增值服务。

doi

10. 3969/j. issn. 1000-6621. 2021. 03. 020

基金项目:陕西省重点研发计划项目(

2018SF-254)

作者单位

:71010

〇西安市胸科医院检验科

通信作者:赵国连,

Email:****************

24

/min

,血压

140/100 mmHg(l mmHg=0. 133 kPa

)。患

者神志清楚

呼吸平稳,口齿清晰,全身皮肤黏膜无黄染,全

身浅表淋巴结无肿大

;

胸廓正常,无肋间隙增宽;双肺叩诊清

音,呼吸音粗,闻及干性啰音

;

心率

92

/min,

节律齐,无杂

;

腹部柔软,无压痛、反跳痛

;

肝脾肋下未扪及;四肢活动正

常,双下肢未见浮肿。

实验室检查:白细胞(

WBC) 5. 53 X 109/L[

正常范围:

(3.50

9.50)

109/1^],

血红蛋白(只

13)88/1(

正常范围:

13

〇〜

l75g/L),

血红细胞沉降率(

ESR)25 _/1 h

(正常范

围:

0

15mm/l h),C

反应蛋白(

CRP)130. 94 mg/L

(正常范

围:

0

6_00 mg/L);

抗链球菌溶素

O(ASO

)、类风湿因子

(1^)

、免疫球蛋白(每

0

181^

18

)

均阴性

,

结核感染

1

'细胞

斑点试验

(T-SPOT. TB)

阳性;降钙素原

1. 05 Fg/L

(正常范

围:

0

0_ 50

/L);

结核抗体五项

:38kDa

抗体阳性,培养滤液

蛋白

10(CFP-10)

抗体阳性,其余为阴性。痰标本涂片分枝

杆菌抗酸染色阳性

(+ + + +

)。痰标本分枝杆菌复合群核

酸检测

(

双通道

PCR-

荧光探针法)结果为非结核分枝杆菌核

酸阳性。结核分枝杆菌核酸检测

(RNA

恒温扩增)结果为结

核分枝杆菌阳性。为进一步验证双通道

PCR

-荧光探针法的

假阴性及

RNA

恒温扩增检测假阳性的可能,用同一份标本

进行结核分枝杆菌核酸检测

(

恒温扩增荧光法

),

结果为阴性

;

GeneXpert MTB/RIF

检测(巢式探针

-

焚光定量

PCR

法)结

核分枝杆菌阳性,利福平野生型。同时对患者人院标本进行

分枝杆菌

BACTEC MGIT 960

液体培养,

1

周后痰培养分枝

杆菌阳性

.MPB 64

单克隆抗体检测阳性。痰标本直接提取

的核酸样本及培养后细菌提取的核酸样本同时做分枝杆菌

菌种基因鉴定(

DNA

微阵列芯片法)结果均为结核分枝杆

菌。为进一步明确分子生物学检测结果不一致的原因,通过

痰标本直接提取核酸及培养后细菌提取核酸进行《们】

0

因测序

.

测序结果显示,该例患者感染的结核分枝杆菌为

基因零拷贝菌株。对培养后的菌株进行结核分枝杆

菌药物敏感性

(

微孔板法)试验显示除异烟肼和帕司烟肼耐

药外,其余药品均敏感。

影像学检查

:

患者人院前查胸部

CT(

山阳县中医医院,

2020-06-11):

胸廓对称无畸形,双侧肺野透光度降低,支气

中国防痨杂志

2021

3

月第

.〗3

卷第

3

Chin J 2021

V

I. 43,No. 3

管血管束增重、紊乱

,

双肺弥漫性粟粒状、

斑片状及条索状密度稍高影.双肺上叶后

段可见较大不规则厚壁空洞,边缘毛糙,

壁内凹凸不平,不光整,心影形态大小未

见异常。人院后在我院查胸部

• 303 •

CT(2020-

07-06

):双肺多叶多段有散在分布微小结

节密度增高影并空洞形成;尘肺;双侧胸

腔积液及胸膜增厚粘连(图

1

4

)。

治疗情况:患者住院初期分子诊断已

明确为结核分枝杆菌感染.而培养结果未

出,无法进行药物敏感性检测,且患者病

情复杂,病灶较重.遂给予左氧氟沙星加

强抗结核治疗,联合

H-R-ZKH:

异烟肼;

1

4

患者,男,

50

岁。胸部

CT

扫描

(2020-07-06)

显示,双肺弥漫分布粟粒状、斑片状

R:

利福平

;Z:

吡嗪酰胺;

E:

乙胺丁醇)方案

行抗结核治疗,并常规辅以预防性保肝治

疗。人院

及条索样密度增高影

.

边界欠清晰

密度不均匀,双肺上叶近肺门处病灶实变,以右肺为

著,局部伴空洞形成

.

右肺上叶部分支气管变窄

;

双肺门可见增大的淋巴结,伴钙化;双侧

胸膜增厚、粘连

15 d

后分枝杆菌培养阳性,微孔

板药物敏感性检测结果提示患者对异烟

肼和帕司烟肼耐药,胸部

CT

检查(

2020-07-06

)结果显示治

usno

为靶点的分子检测可能造成假阴性结果的可能。

在结核分枝杆菌检测中具有特异性、稳定性及高拷

疗效果不理想。经过评估,对该例患者治疗方案进行修正,

继续给予左氧氟沙星加强抗结核治疗,联合

R-Z-E-Am

贝性,相比于单拷贝的其他序列如

更高的敏感度和特异度,因此

MPB64

MTP40

等具有

(Am:

阿米卡星)方案行抗结核治疗,并转至耐药科继续治

,

患者诉因家庭原因坚持出院,于

出院。

/S6]]0

是目前临床分子生物

2020

7

8

日办理

学结核分枝杆菌诊断最常用的扩增粑点[6:。

但是

/6'6

】』

0

低拷贝甚至零拷贝的结核分枝杆菌将会对

IS6110

为检测粑点的检测方法的阳性率及准确性造成一

IS6110

缺失菌株(北京基因古

13. 5%

23. 57

%&7]。

讨 论

定影响。我国已有文献报道

结核分枝杆菌复合群是引起肺结核的主要病原体,

代株)在中国不同地区的流行率为

裴秀英等

IS6110

是结核分枝杆菌基因组中的一段多拷贝保守序列,

含有

M

16

株分离自上海的结核分枝杆菌菌株应用

术进行研究,发现

1361 bp

核苷酸和

28 bp

的反向末端的重复序列,只存

RFLP

1

IS6110

零拷贝株和

1

在于结核分枝杆菌复合群中[2]。对于我国广泛流行的北京

基因型结核分枝杆菌

:3:

,根据菌株基因组核转录因子

(nuclear

IS6110

单拷贝株。然而

.

目前对于中国大部分地区

IS6110

拷贝数分布的研究还不足.低拷贝或零拷贝菌株对临床诊断

的影响还需要进一步探究。

本例患者人院初期应用以和

分枝杆菌复合群核酸检测方法(双通道

transcription factors

NTF

)区域中是否存在结核分枝杆菌特

异性插人序列

(insertion sequence

IS)6110

,可分为北京基因

型古代株和北京基因型现代株

代株的

/«05

为靶基因的

2

个亚型[4]。北京基因型古

北京基因型现代株

PCR-

荧光探针法),

16S

NTF

区中没有

/^no,

NTF

结果为非结核分枝杆菌阳性,而以结核分枝杆菌复合群

区中至少含有

1

K6IJ0

IS6110

rRNA

序列特异性片段为靶标的结核分枝杆菌核酸检测方

近年来,基于针对结核分枝杆菌特定序列的

(RNA

恒温扩增

)

结果为结核分枝杆菌.出现两种分子生

hsp65

16S rRNA

、中

)B RRDR

区域、

85B

抗原

、38 kDa

抗原

物学检测结果不一致的情况。为进一步验证检测结果的准

确性

.

笔者又应用以

的某些序列的聚合酶链反应(

PCR)

扩增.已经开发了许多结

核病分子诊断方法。虽然大多数结核分枝杆菌分离株中

7.S6]]0

为单耙基因的结核分枝杆菌核

.

酸检测方法

(

恒温扩增荧光法),结果为结核分枝杆菌阴性

而以基因

W

基因为高拷贝基因,但谢彤等

[:>

报道天津地区

517

81 bp

利福平耐药核心区域(

RRDR

)为靶基

测(巢式探针

-

荧光定量

例临床分离株中

70

株为

/•S6]]0

基因缺陷株,其检出率髙达

因的

GeneXpert MTB/RIF

PCR

13. 5%,

所以临床应用中要警惕单拷贝或零拷贝分离株对以

法)

,

结果为结核分枝杆菌

.

利福平敏感。基于

4

种不同的分

• 304 •

中国防痨杂志 2021 年 3 月第 43 卷第 3 期 Chin J Antituberc,March 2021,V〇1. 43,No. 3

子生物学检测试剂得到的检测结果存在差异,通过分析各种

检测试剂的检测原理及检测靶点,怀疑为基因缺失

菌株.最后通过测序技术鉴定该例患者感染菌株为

测人员需要对不同检测试剂的检测原理进行熟练掌握,当不

同试验的检测结果出现不一致时,要积极协助临床进行分

析,以免出现错误判断

延误患者的诊断与治疗。

基因缺失。

本例患者出现两种分子生物学检测结果不一致的情况,

对针对

1S6110

单耙点的

PCR

方法在结核分枝杆菌检测方

面的可靠性会造成影响,导致假阴性结果的出现.而低拷贝

菌株因其多态性有限,也同样会影响其在基因分型中的鉴定

能力。因此,在结核病诊断方面需联合其他的基因靶点,如

MPB64

MTP40

16S rRNA

hsp65

等组成多重

PCR

法提高

临床标本中分枝杆菌检测的准确性。

除了选择合适的靶基因,不同原理的分子生物学检测技

术对结核分枝杆菌核酸检测阳性率也有一定的差异。本例

患者应用

4

种方法对结核分枝杆菌进行核酸检测,在实际应

用中都有可能出现假阳性或假阴性的情况.无法对原始标本

中结核分枝杆菌拷贝数实现绝对定量。数字聚合酶链式反

(digital polymerase chain reaction

dPCR

)是一项基于单分

子目标基因

PCR

扩增的绝对定量技术,比标准实时反转录

-

聚合酶链反应

(reverse transcription-polymerase chain reac_.

tion

RT-PCR)

具有更高的敏感度和准确性,且

dPCR

具有

无需循环

CT

值和标准曲线即可实现样品中

DNA

分子绝对

定量的优点[9],未来可能对于低浓度和低拷贝的结核分枝杆

菌核酸检测具有广泛的应用前景,但还需进行更多的研究加

以证实。

综上,基于目前结核分枝杆菌的分子生物学检测诊断试

剂的广泛应用,要警惕单拷贝或者零拷贝分离株对以

IS6110

为靶点的分子检测可能造成假阴性结果的可能。实验室检

参考文献

[1]

中华医学会结核病学分会临床检验专业委员会.结核病病原

学分子诊断专家共识

.

中华结核和呼吸杂志,

2018,41 (9):

688-695. doi

10. 3760/cma. j. issn. 1001-0939. 2018. 09. 008.

[2] Thierry D» Brisson-Noel A, Vincent-Levy-Frebault V, et al.

Characterization of a Mycobacterium tuberculosis insertion

sequence

IS6110,and its application in diagnosis. J Clin

Microbiol, 1990, 28(12

):

2668-2673. doi

10. 1128/JCM. 28.

12. 2668-2673. 1990.

[3] Gagneux S, Small PM Global phylogeography of Mycobacterium

tuberculosis and implications for tuberculosis product develop­

ment. Lancet Infect Dis, 2007, 7(5)

328-337. doi

10. 1016/

S1473-3099C07)70108-1.

[4] Mokrousov I, Ly HM, Otten T, et al. Origin and primary dis­

persal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype

clues

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):

1357-1364. doi

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[5]

谢彤,孙蕊,巨韩芳,等.结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段

的多态性研究

.

中国防痨杂志,

2018, 40(3): 269-273. doi:

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[6]

刘东鑫.中国结核分枝杆菌耐药特征研究及新型恒温扩增诊

断方法的建立

.

北京:中国疾病预防控制中心,

2019.

[7]

刘美伶

.

华东部分地区

W

-北京基因型结核分枝杆菌传播特征

研究

.

上海:复旦大学,

2013.

[8]

裴秀英,戴寿芝,王民,等

.IS6110

-限制性片段长度多态性

DNA

分型在结核分子流行病学研究中的应用.中华结核和呼

吸杂志,

2002, 25(1): 18-20. doi:10.3760/j:issn:1001-0939.

2002. 01. 006.

[9] Whale AS, Bushell CA, Grant PR» et al. Detection of Rare

Drug ResivStance Mutations by Digital PCR in a Human Influenza

A Virus Model System and Clinical Samples. J Clin Microbiol.

2016, 54(2

):

392-400. doi

10. 1128/JCM. 02611-15.

(

收稿日期:

2020-ll-07)

(

本文编辑

:

郭萌)

2024年8月1日发(作者:淳于觅荷)

• 302 •

中国防痨杂志 2021 年 3 月第 43 卷第 3 期 Chin J Antituben^March 2021,V〇1. 43,No. 3

•病例报告•

LSWiO基因缺失结核分枝杆菌感染的肺结核一例

谈小文王媛崔晓利党丽云雷静任斐赵国连

分子生物学检测方法因其具有检测敏感度高、特异性强

和时效性高等特点,成为结核病快速珍断的重要检测手段。

对于分子生物学检测,寻找检测效率高且存在特异性的靶基

因尤为重要,分子检测靶基因的种属特异性和多拷贝序列是

确保检测结果准确性和高效性的重要因素。结核病分子生

物学病原诊断常用的诊断靶标有

rfiiVAjqB

和基因等,以上基因均属于管家基因。其中

IS6n

〇为

多拷贝基因,其用于病原学诊断敏感度高于单拷贝基因,但

是基因并非存在于所有结核分枝杆菌中,有的菌株

/S6]

0

基因缺失,可能造成假阴性结果

2

。本研究对西安

市胸科医院收治的

1

例基因零拷贝菌株感染的结核

病患者病原学诊断过程及分离株测序结果进行分析,旨在为

临床诊断工作提供借鉴。

临床资料

患者,男,

50

岁。因间断咳嗽、咳痰、胸闷、气促

10

月,伴发热

1

周,于

2020

6

13

日入住西安市胸科医院。

患者

5

年前无明显诱因出现咳嗽、咳白色黏痰,未行特殊处

理。

2019

8

27

日患者因胸闷、气促,就诊于当地医院,

诊断为

尘肺

,给予对症治疗后症状稍有好转,但活动后仍

感到气促,休息后可缓解,随着病程进展,气促症状逐渐加

重。患者于

2020

6

5

日出现发热,最高体温

37.9

。,午

后明显

.

无畏寒、寒颤,就诊于山阳县中医医院,行胸部

CT

示双肺出现病灶并形成空洞,不排除肺结核可能,遂来我院

做进一步诊断治疗。患病期间,患者无咯血,无胸痛和心慌,

无恶心和呕吐,体质量

6

个月减轻

10 kg

人院时体格检查:体温

37 °C

脉搏

92

/min,

呼吸频率

开放科学(资源服务)标识码(

OSID)

的开放科

学计划以二维码为入口,提供丰富的线上扩展

功能,包括作者对论文背景的语音介绍、该研究

的附加说明、与读者的交互问答、拓展学术圈等。

读者“扫一扫”此二维码即可获得上述增值服务。

doi

10. 3969/j. issn. 1000-6621. 2021. 03. 020

基金项目:陕西省重点研发计划项目(

2018SF-254)

作者单位

:71010

〇西安市胸科医院检验科

通信作者:赵国连,

Email:****************

24

/min

,血压

140/100 mmHg(l mmHg=0. 133 kPa

)。患

者神志清楚

呼吸平稳,口齿清晰,全身皮肤黏膜无黄染,全

身浅表淋巴结无肿大

;

胸廓正常,无肋间隙增宽;双肺叩诊清

音,呼吸音粗,闻及干性啰音

;

心率

92

/min,

节律齐,无杂

;

腹部柔软,无压痛、反跳痛

;

肝脾肋下未扪及;四肢活动正

常,双下肢未见浮肿。

实验室检查:白细胞(

WBC) 5. 53 X 109/L[

正常范围:

(3.50

9.50)

109/1^],

血红蛋白(只

13)88/1(

正常范围:

13

〇〜

l75g/L),

血红细胞沉降率(

ESR)25 _/1 h

(正常范

围:

0

15mm/l h),C

反应蛋白(

CRP)130. 94 mg/L

(正常范

围:

0

6_00 mg/L);

抗链球菌溶素

O(ASO

)、类风湿因子

(1^)

、免疫球蛋白(每

0

181^

18

)

均阴性

,

结核感染

1

'细胞

斑点试验

(T-SPOT. TB)

阳性;降钙素原

1. 05 Fg/L

(正常范

围:

0

0_ 50

/L);

结核抗体五项

:38kDa

抗体阳性,培养滤液

蛋白

10(CFP-10)

抗体阳性,其余为阴性。痰标本涂片分枝

杆菌抗酸染色阳性

(+ + + +

)。痰标本分枝杆菌复合群核

酸检测

(

双通道

PCR-

荧光探针法)结果为非结核分枝杆菌核

酸阳性。结核分枝杆菌核酸检测

(RNA

恒温扩增)结果为结

核分枝杆菌阳性。为进一步验证双通道

PCR

-荧光探针法的

假阴性及

RNA

恒温扩增检测假阳性的可能,用同一份标本

进行结核分枝杆菌核酸检测

(

恒温扩增荧光法

),

结果为阴性

;

GeneXpert MTB/RIF

检测(巢式探针

-

焚光定量

PCR

法)结

核分枝杆菌阳性,利福平野生型。同时对患者人院标本进行

分枝杆菌

BACTEC MGIT 960

液体培养,

1

周后痰培养分枝

杆菌阳性

.MPB 64

单克隆抗体检测阳性。痰标本直接提取

的核酸样本及培养后细菌提取的核酸样本同时做分枝杆菌

菌种基因鉴定(

DNA

微阵列芯片法)结果均为结核分枝杆

菌。为进一步明确分子生物学检测结果不一致的原因,通过

痰标本直接提取核酸及培养后细菌提取核酸进行《们】

0

因测序

.

测序结果显示,该例患者感染的结核分枝杆菌为

基因零拷贝菌株。对培养后的菌株进行结核分枝杆

菌药物敏感性

(

微孔板法)试验显示除异烟肼和帕司烟肼耐

药外,其余药品均敏感。

影像学检查

:

患者人院前查胸部

CT(

山阳县中医医院,

2020-06-11):

胸廓对称无畸形,双侧肺野透光度降低,支气

中国防痨杂志

2021

3

月第

.〗3

卷第

3

Chin J 2021

V

I. 43,No. 3

管血管束增重、紊乱

,

双肺弥漫性粟粒状、

斑片状及条索状密度稍高影.双肺上叶后

段可见较大不规则厚壁空洞,边缘毛糙,

壁内凹凸不平,不光整,心影形态大小未

见异常。人院后在我院查胸部

• 303 •

CT(2020-

07-06

):双肺多叶多段有散在分布微小结

节密度增高影并空洞形成;尘肺;双侧胸

腔积液及胸膜增厚粘连(图

1

4

)。

治疗情况:患者住院初期分子诊断已

明确为结核分枝杆菌感染.而培养结果未

出,无法进行药物敏感性检测,且患者病

情复杂,病灶较重.遂给予左氧氟沙星加

强抗结核治疗,联合

H-R-ZKH:

异烟肼;

1

4

患者,男,

50

岁。胸部

CT

扫描

(2020-07-06)

显示,双肺弥漫分布粟粒状、斑片状

R:

利福平

;Z:

吡嗪酰胺;

E:

乙胺丁醇)方案

行抗结核治疗,并常规辅以预防性保肝治

疗。人院

及条索样密度增高影

.

边界欠清晰

密度不均匀,双肺上叶近肺门处病灶实变,以右肺为

著,局部伴空洞形成

.

右肺上叶部分支气管变窄

;

双肺门可见增大的淋巴结,伴钙化;双侧

胸膜增厚、粘连

15 d

后分枝杆菌培养阳性,微孔

板药物敏感性检测结果提示患者对异烟

肼和帕司烟肼耐药,胸部

CT

检查(

2020-07-06

)结果显示治

usno

为靶点的分子检测可能造成假阴性结果的可能。

在结核分枝杆菌检测中具有特异性、稳定性及高拷

疗效果不理想。经过评估,对该例患者治疗方案进行修正,

继续给予左氧氟沙星加强抗结核治疗,联合

R-Z-E-Am

贝性,相比于单拷贝的其他序列如

更高的敏感度和特异度,因此

MPB64

MTP40

等具有

(Am:

阿米卡星)方案行抗结核治疗,并转至耐药科继续治

,

患者诉因家庭原因坚持出院,于

出院。

/S6]]0

是目前临床分子生物

2020

7

8

日办理

学结核分枝杆菌诊断最常用的扩增粑点[6:。

但是

/6'6

】』

0

低拷贝甚至零拷贝的结核分枝杆菌将会对

IS6110

为检测粑点的检测方法的阳性率及准确性造成一

IS6110

缺失菌株(北京基因古

13. 5%

23. 57

%&7]。

讨 论

定影响。我国已有文献报道

结核分枝杆菌复合群是引起肺结核的主要病原体,

代株)在中国不同地区的流行率为

裴秀英等

IS6110

是结核分枝杆菌基因组中的一段多拷贝保守序列,

含有

M

16

株分离自上海的结核分枝杆菌菌株应用

术进行研究,发现

1361 bp

核苷酸和

28 bp

的反向末端的重复序列,只存

RFLP

1

IS6110

零拷贝株和

1

在于结核分枝杆菌复合群中[2]。对于我国广泛流行的北京

基因型结核分枝杆菌

:3:

,根据菌株基因组核转录因子

(nuclear

IS6110

单拷贝株。然而

.

目前对于中国大部分地区

IS6110

拷贝数分布的研究还不足.低拷贝或零拷贝菌株对临床诊断

的影响还需要进一步探究。

本例患者人院初期应用以和

分枝杆菌复合群核酸检测方法(双通道

transcription factors

NTF

)区域中是否存在结核分枝杆菌特

异性插人序列

(insertion sequence

IS)6110

,可分为北京基因

型古代株和北京基因型现代株

代株的

/«05

为靶基因的

2

个亚型[4]。北京基因型古

北京基因型现代株

PCR-

荧光探针法),

16S

NTF

区中没有

/^no,

NTF

结果为非结核分枝杆菌阳性,而以结核分枝杆菌复合群

区中至少含有

1

K6IJ0

IS6110

rRNA

序列特异性片段为靶标的结核分枝杆菌核酸检测方

近年来,基于针对结核分枝杆菌特定序列的

(RNA

恒温扩增

)

结果为结核分枝杆菌.出现两种分子生

hsp65

16S rRNA

、中

)B RRDR

区域、

85B

抗原

、38 kDa

抗原

物学检测结果不一致的情况。为进一步验证检测结果的准

确性

.

笔者又应用以

的某些序列的聚合酶链反应(

PCR)

扩增.已经开发了许多结

核病分子诊断方法。虽然大多数结核分枝杆菌分离株中

7.S6]]0

为单耙基因的结核分枝杆菌核

.

酸检测方法

(

恒温扩增荧光法),结果为结核分枝杆菌阴性

而以基因

W

基因为高拷贝基因,但谢彤等

[:>

报道天津地区

517

81 bp

利福平耐药核心区域(

RRDR

)为靶基

测(巢式探针

-

荧光定量

例临床分离株中

70

株为

/•S6]]0

基因缺陷株,其检出率髙达

因的

GeneXpert MTB/RIF

PCR

13. 5%,

所以临床应用中要警惕单拷贝或零拷贝分离株对以

法)

,

结果为结核分枝杆菌

.

利福平敏感。基于

4

种不同的分

• 304 •

中国防痨杂志 2021 年 3 月第 43 卷第 3 期 Chin J Antituberc,March 2021,V〇1. 43,No. 3

子生物学检测试剂得到的检测结果存在差异,通过分析各种

检测试剂的检测原理及检测靶点,怀疑为基因缺失

菌株.最后通过测序技术鉴定该例患者感染菌株为

测人员需要对不同检测试剂的检测原理进行熟练掌握,当不

同试验的检测结果出现不一致时,要积极协助临床进行分

析,以免出现错误判断

延误患者的诊断与治疗。

基因缺失。

本例患者出现两种分子生物学检测结果不一致的情况,

对针对

1S6110

单耙点的

PCR

方法在结核分枝杆菌检测方

面的可靠性会造成影响,导致假阴性结果的出现.而低拷贝

菌株因其多态性有限,也同样会影响其在基因分型中的鉴定

能力。因此,在结核病诊断方面需联合其他的基因靶点,如

MPB64

MTP40

16S rRNA

hsp65

等组成多重

PCR

法提高

临床标本中分枝杆菌检测的准确性。

除了选择合适的靶基因,不同原理的分子生物学检测技

术对结核分枝杆菌核酸检测阳性率也有一定的差异。本例

患者应用

4

种方法对结核分枝杆菌进行核酸检测,在实际应

用中都有可能出现假阳性或假阴性的情况.无法对原始标本

中结核分枝杆菌拷贝数实现绝对定量。数字聚合酶链式反

(digital polymerase chain reaction

dPCR

)是一项基于单分

子目标基因

PCR

扩增的绝对定量技术,比标准实时反转录

-

聚合酶链反应

(reverse transcription-polymerase chain reac_.

tion

RT-PCR)

具有更高的敏感度和准确性,且

dPCR

具有

无需循环

CT

值和标准曲线即可实现样品中

DNA

分子绝对

定量的优点[9],未来可能对于低浓度和低拷贝的结核分枝杆

菌核酸检测具有广泛的应用前景,但还需进行更多的研究加

以证实。

综上,基于目前结核分枝杆菌的分子生物学检测诊断试

剂的广泛应用,要警惕单拷贝或者零拷贝分离株对以

IS6110

为靶点的分子检测可能造成假阴性结果的可能。实验室检

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(

收稿日期:

2020-ll-07)

(

本文编辑

:

郭萌)

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