2024年3月13日发(作者:硕舒云)
Gene Bio-Application
GeBA使用说明
GeBAflex-tube Kit 透析管为生物样品制备提供了极为方便、通用的操作系统。
该系统包括两种操作模式——透析和电洗脱,能够高效地替换样品缓冲液或从凝
胶中抽提蛋白质、DNA或RNA。所有操作只需在一支离心管中进行,简单快捷,
适合在很多实验条件下使用。样品操作中不再需要注射器,微量离心,专门的电
洗脱装置或是重复繁琐的操作步骤,只需实验室常规移液器进行样品的添加和移
除即可。GeBAflex-tube Kit透析管的双膜设计(可以方便地监测样品水分挥发
过程)和大表面积使其亦可用来浓缩生物样品。 GeBAflex-tube Kit 透析管按
容量不同分为几种型号:Mini型(10-250μl),Midi型(50-800μl),Maxi型
(500-3000μl)和Mega型(分别有3-10ml,10-15ml,15-20ml三种载样体积)。
Maxi型号的GeBAflex-tube Kit 透析管试剂盒中包括两个盖子,可以方便将透
析管的容量分别调节为500-200μl和2000-3000μl。Mega型透析管的截留分子
量有两种,以不同颜色区分:3.5kDa(蓝色)和6-8kDa(粉色);Mega型透析管
也配有不同的管帽,以方便地根据需要调整最大载样体积。底管则决定了它的截
留分子量,相同颜色的底管(具有相同的截留分子量)可以与不同的管帽(具有
不同的最大载样体积)组合使用的(如图1)。
所有GeBAflex-tube透析管膜都是经超级净化、EDTA处理过的再生纤维素膜,
不含硫与重金属。用浓度为35-70μg/ml的酸性、中性或碱性蛋白做测试,证实
此种透析管膜对蛋白质的非特异吸附可忽略不计。
除了用于透析,GeBAflex-tube透析管还可以从变性或非变性聚丙烯酰胺凝胶中
特异、有效地抽提和电洗脱蛋白质、蛋白-蛋白和蛋白-核酸复合物,所有操作仅
需2小时,并可在从二维双向电泳中高效回收蛋白的同时去除样品中的两性电解
质。纯化出的蛋白可以用于MALDI-MS,动物免疫制备抗体(前提是蛋白样品经
过透析去除已有缓冲体系),HPLC或肽谱分析。另外,GeBAflex-tube透析管还
能够用来从聚丙烯酰胺凝胶或琼脂糖凝胶中回收寡聚核苷酸,RNA和DNA。它的
适用范围包括从15个残基的寡核苷酸到80kbp的双链DNA。特别方便的是:用
GeBAflex-tube透析管操作不需要专门的电洗脱装置,GeBAflex-tube Kit透析
管配套试剂盒中提供了适用于三种型号透析管(Mini,Midi,Maxi)的支架,可
与多数常用的水平电泳仪兼容。试剂盒同时提供蛋白和核酸沉淀试剂,以及优化
过的从纯化后的蛋白样品中彻底去除SDS的缓冲液,使之可以用于之后的
MALDI-MS分析。
注意:Mega型透析管一般不用于电洗脱抽提DNA和RNA样品!
从琼脂糖凝胶中回收DNA或RNA >90%
从聚丙烯酰胺凝胶中回收DNA或RNA >90%
从SDS-PAGE中回收蛋白质 >60%
表1电洗脱后的样品回收效率电洗脱后的样品回收效率
GeBA:********************
Gene Bio-Application
试剂盒组分(Mini/Midi/Maxi)
GeBAflex-tube Dialysis & Extraction kit (2)
即GeBAflex-tube电洗脱配套试剂盒(2)试用装
2个 GeBAflex-tube 透析管(Mini,Midi或Maxi)已安放在白色透析管支架上
1个 浮架(可插4只小管,漂浮于替换的缓冲液上)
1ml 质谱分析用沉淀缓冲液(MS-Buffer);2ml 20%三氯乙酸(TCA) • 5ml 3M醋
酸钠溶液(KAc),pH5.2;装于独立小袋内。
GeBA:********************
Gene Bio-Application
GeBA EZ-Tube应用:从凝胶中抽提核酸
从聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶中抽提DNA或RNA的操作步骤:
1. 取下透析管帽并按照表5所示加入适量去离子水,竖直放置孵育5分钟以上,
轻轻旋上管帽。
注意:加入样品前预浸润透析管膜是非常重要的,不要跳过步骤1。因为干的膜
会吸收水分,造成透析管中水体积的减少。也不要触摸或挤压透析管膜,以免造
成膜的损坏。并且仔细检查膜是否漏水。膜再次放干之后,建议不要继续再使用。
2. 用干净锋利的刀片将含有DNA或RNA的部分切下,并修切掉多余的凝胶。
3. 取下管帽并用移液器把去离子水从透析管中取出,小心不要刺破透析膜。将
切割好的凝胶放入透析管中,每个不同型号透析管中能装的最大凝胶体积如表1
所示。加电洗脱缓冲液至膜的上端(所加缓冲液体积请参照表1)。添加缓冲液
时应避免引入气泡,这样会干扰电洗脱过程。轻轻旋上管帽。
注意:电洗脱时使用与凝胶电泳分离相同的缓冲液,将大块的凝胶分别装在不同
的透析管内。
4. 将透析管放在专用配套支架上(见图1)。透析管两侧的膜必须与电泳区垂直
以保证电流可以通过透析管。
图1:在支架上放置Midi型EZ-Tube透析管示意图。
透析管两侧的膜必须与电泳区垂直以保证电流可
以通过透析管。
5. 将装有透析管的支架放入水平电泳槽内(例如用来做DNA琼脂糖凝胶电泳的电
泳槽),加入电洗脱缓冲液。
表1 不同型号透析管的电洗脱参数
EZ-Tube透析管 加入去离子水体积 最大凝胶块体积 加入电洗脱缓冲液体积
Mini
Midi
Maxi
0.25ml
0.8ml
2.5-3.0ml
0.4cm×1.1cm
0.5cm×1cm
2cm×1cm
0.25ml
0.7-0.8ml
2.5-3.0ml
6. 电泳槽两端加上电压(通常80-150V)开始电洗脱,直到核酸都从凝胶切块中
分离出来。通常用的电泳时间请参照表2。每次洗脱的最优电泳时间根据样品特
点和凝胶浓度而不同,需要用户自行摸索。常用的电洗脱时间请参考表6-8。
小技巧:如果凝胶用溴化乙锭或SYBR
®
Green染色,可以用便携式或台式紫外
灯监控核酸抽提进程(推荐:DNR迷你型凝胶成像仪MicroBIS)。
7. 将电极反接继续电洗脱2分钟,使核酸从透析管的膜上脱离。
8. 轻轻打开透析管,在膜内侧缓慢地上下吸取电洗脱液至少5次,小心避免吸到
凝胶块并不要戳破透析管膜。将洗脱液转移至另一干净的离心管。
9. 14,000×g离心洗脱液1分钟使凝胶残留物沉淀。
10. 将上清转移至另一干净的离心管中,用常规标准方法浓缩样品或参考下文的
核酸沉淀沉淀操作流程。
GeBA:********************
Gene Bio-Application
表2. 100V电压条件下,从10%SDS-PAGE(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺)中电洗脱蛋
白所需最少时间
蛋白分子量(kDa)
14
18.4
19-26
25
29
35
40
45
50
66
81
116
128
*未测定
Mini型
30-40
35-45
*
40-50
*
50-60
*
55-65
*
70-80
*
90-100
时间(分钟)
Midi型
35-45
*
45-55
*
55-65
*
60-70
65-75
75-85
85-95
105-115
120-130
140-150
Maxi型
50-60
55-65
*
70-80
*
110-120
*
130-140
*
150-160
*
180-190
*
洗脱时间———核酸
电洗脱时间受多种因素影响,包括洗脱核酸片段大小,所用电压,凝胶切块大小,
凝胶浓度以及聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺配比。表3-5列出了从聚丙烯酰胺凝
胶和琼脂糖凝胶中抽提不同大小DNA和RNA所需的时间。
重要:每个样品所需的最优电泳时间是不同的
表3. 100-150V电压条件下从自然或变性4%聚丙烯酰胺凝胶(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯
酰胺)中电洗脱不同大小DNA片段所需最少时间。
DNA片段大小(bp)
100
200
300
500
822
1000
1044
1400
2700
*未测定
Mini型
10-15
15-20
*
30-35
*
55-60
*
75-80
时间(分钟)
Midi型
10-20
*
15-25
20-30
25-35
*
30-40
*
45-55
Maxi型
10-15
15-20
*
30-35
*
55-60
*
75-80
*
GeBA:********************
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表4. 100-150V电压条件下从自然或变性4%聚丙烯酰胺凝胶(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯
酰胺)中电洗脱不同大小RNA片段所需最少时间。
RNA片段大小(bp) 时间(分钟),Midi型
100 15-25
400 25-35
600 35-45
表5. 80-110V电压条件下从1%琼脂糖中电洗脱不同大小DNA片段所需最少时间。
1000 45-55
DNA片段大小(bp)
100-200
500-700
1000
2000
4361
5000
6557
8000
9416
10000
23130
*未测定
Mini型
*
10-15
15-20
25-30
*
40-45
*
50-55
*
55-60
*
时间(分钟)
Midi型
10-20
15-20
20-30
*
25-35
*
45-55
*
55-65
*
70-80
Maxi型
*
10-15
15-20
25-30
*
40-45
*
50-55
*
55-60
*
GeBA EZ-Tube应用:核酸沉淀
EZ-Tube电洗脱配套试剂盒提供的3M醋酸钠,pH5.2溶液可以有效地沉淀电洗脱后
的核酸样品。流程如下:
1. 向核酸样品中加入0.1倍体积的3M醋酸钠,pH5.2溶液和2倍体积的100%乙醇
或1倍体积100%异丙醇,轻轻振荡混匀。
2. 室温孵育5分钟。
3. 14,000×g离心5分钟,吸掉上清并用70%乙醇洗沉淀,轻轻振荡并重复70%乙
醇清洗。
4. 吸走上清,用100%乙醇洗沉淀并如步骤3中离心。吸掉上清后,风干沉淀使乙
醇挥发干净,将沉淀重溶于去离子水或其他缓冲液中。
GeBA:********************
2024年3月13日发(作者:硕舒云)
Gene Bio-Application
GeBA使用说明
GeBAflex-tube Kit 透析管为生物样品制备提供了极为方便、通用的操作系统。
该系统包括两种操作模式——透析和电洗脱,能够高效地替换样品缓冲液或从凝
胶中抽提蛋白质、DNA或RNA。所有操作只需在一支离心管中进行,简单快捷,
适合在很多实验条件下使用。样品操作中不再需要注射器,微量离心,专门的电
洗脱装置或是重复繁琐的操作步骤,只需实验室常规移液器进行样品的添加和移
除即可。GeBAflex-tube Kit透析管的双膜设计(可以方便地监测样品水分挥发
过程)和大表面积使其亦可用来浓缩生物样品。 GeBAflex-tube Kit 透析管按
容量不同分为几种型号:Mini型(10-250μl),Midi型(50-800μl),Maxi型
(500-3000μl)和Mega型(分别有3-10ml,10-15ml,15-20ml三种载样体积)。
Maxi型号的GeBAflex-tube Kit 透析管试剂盒中包括两个盖子,可以方便将透
析管的容量分别调节为500-200μl和2000-3000μl。Mega型透析管的截留分子
量有两种,以不同颜色区分:3.5kDa(蓝色)和6-8kDa(粉色);Mega型透析管
也配有不同的管帽,以方便地根据需要调整最大载样体积。底管则决定了它的截
留分子量,相同颜色的底管(具有相同的截留分子量)可以与不同的管帽(具有
不同的最大载样体积)组合使用的(如图1)。
所有GeBAflex-tube透析管膜都是经超级净化、EDTA处理过的再生纤维素膜,
不含硫与重金属。用浓度为35-70μg/ml的酸性、中性或碱性蛋白做测试,证实
此种透析管膜对蛋白质的非特异吸附可忽略不计。
除了用于透析,GeBAflex-tube透析管还可以从变性或非变性聚丙烯酰胺凝胶中
特异、有效地抽提和电洗脱蛋白质、蛋白-蛋白和蛋白-核酸复合物,所有操作仅
需2小时,并可在从二维双向电泳中高效回收蛋白的同时去除样品中的两性电解
质。纯化出的蛋白可以用于MALDI-MS,动物免疫制备抗体(前提是蛋白样品经
过透析去除已有缓冲体系),HPLC或肽谱分析。另外,GeBAflex-tube透析管还
能够用来从聚丙烯酰胺凝胶或琼脂糖凝胶中回收寡聚核苷酸,RNA和DNA。它的
适用范围包括从15个残基的寡核苷酸到80kbp的双链DNA。特别方便的是:用
GeBAflex-tube透析管操作不需要专门的电洗脱装置,GeBAflex-tube Kit透析
管配套试剂盒中提供了适用于三种型号透析管(Mini,Midi,Maxi)的支架,可
与多数常用的水平电泳仪兼容。试剂盒同时提供蛋白和核酸沉淀试剂,以及优化
过的从纯化后的蛋白样品中彻底去除SDS的缓冲液,使之可以用于之后的
MALDI-MS分析。
注意:Mega型透析管一般不用于电洗脱抽提DNA和RNA样品!
从琼脂糖凝胶中回收DNA或RNA >90%
从聚丙烯酰胺凝胶中回收DNA或RNA >90%
从SDS-PAGE中回收蛋白质 >60%
表1电洗脱后的样品回收效率电洗脱后的样品回收效率
GeBA:********************
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试剂盒组分(Mini/Midi/Maxi)
GeBAflex-tube Dialysis & Extraction kit (2)
即GeBAflex-tube电洗脱配套试剂盒(2)试用装
2个 GeBAflex-tube 透析管(Mini,Midi或Maxi)已安放在白色透析管支架上
1个 浮架(可插4只小管,漂浮于替换的缓冲液上)
1ml 质谱分析用沉淀缓冲液(MS-Buffer);2ml 20%三氯乙酸(TCA) • 5ml 3M醋
酸钠溶液(KAc),pH5.2;装于独立小袋内。
GeBA:********************
Gene Bio-Application
GeBA EZ-Tube应用:从凝胶中抽提核酸
从聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶中抽提DNA或RNA的操作步骤:
1. 取下透析管帽并按照表5所示加入适量去离子水,竖直放置孵育5分钟以上,
轻轻旋上管帽。
注意:加入样品前预浸润透析管膜是非常重要的,不要跳过步骤1。因为干的膜
会吸收水分,造成透析管中水体积的减少。也不要触摸或挤压透析管膜,以免造
成膜的损坏。并且仔细检查膜是否漏水。膜再次放干之后,建议不要继续再使用。
2. 用干净锋利的刀片将含有DNA或RNA的部分切下,并修切掉多余的凝胶。
3. 取下管帽并用移液器把去离子水从透析管中取出,小心不要刺破透析膜。将
切割好的凝胶放入透析管中,每个不同型号透析管中能装的最大凝胶体积如表1
所示。加电洗脱缓冲液至膜的上端(所加缓冲液体积请参照表1)。添加缓冲液
时应避免引入气泡,这样会干扰电洗脱过程。轻轻旋上管帽。
注意:电洗脱时使用与凝胶电泳分离相同的缓冲液,将大块的凝胶分别装在不同
的透析管内。
4. 将透析管放在专用配套支架上(见图1)。透析管两侧的膜必须与电泳区垂直
以保证电流可以通过透析管。
图1:在支架上放置Midi型EZ-Tube透析管示意图。
透析管两侧的膜必须与电泳区垂直以保证电流可
以通过透析管。
5. 将装有透析管的支架放入水平电泳槽内(例如用来做DNA琼脂糖凝胶电泳的电
泳槽),加入电洗脱缓冲液。
表1 不同型号透析管的电洗脱参数
EZ-Tube透析管 加入去离子水体积 最大凝胶块体积 加入电洗脱缓冲液体积
Mini
Midi
Maxi
0.25ml
0.8ml
2.5-3.0ml
0.4cm×1.1cm
0.5cm×1cm
2cm×1cm
0.25ml
0.7-0.8ml
2.5-3.0ml
6. 电泳槽两端加上电压(通常80-150V)开始电洗脱,直到核酸都从凝胶切块中
分离出来。通常用的电泳时间请参照表2。每次洗脱的最优电泳时间根据样品特
点和凝胶浓度而不同,需要用户自行摸索。常用的电洗脱时间请参考表6-8。
小技巧:如果凝胶用溴化乙锭或SYBR
®
Green染色,可以用便携式或台式紫外
灯监控核酸抽提进程(推荐:DNR迷你型凝胶成像仪MicroBIS)。
7. 将电极反接继续电洗脱2分钟,使核酸从透析管的膜上脱离。
8. 轻轻打开透析管,在膜内侧缓慢地上下吸取电洗脱液至少5次,小心避免吸到
凝胶块并不要戳破透析管膜。将洗脱液转移至另一干净的离心管。
9. 14,000×g离心洗脱液1分钟使凝胶残留物沉淀。
10. 将上清转移至另一干净的离心管中,用常规标准方法浓缩样品或参考下文的
核酸沉淀沉淀操作流程。
GeBA:********************
Gene Bio-Application
表2. 100V电压条件下,从10%SDS-PAGE(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺)中电洗脱蛋
白所需最少时间
蛋白分子量(kDa)
14
18.4
19-26
25
29
35
40
45
50
66
81
116
128
*未测定
Mini型
30-40
35-45
*
40-50
*
50-60
*
55-65
*
70-80
*
90-100
时间(分钟)
Midi型
35-45
*
45-55
*
55-65
*
60-70
65-75
75-85
85-95
105-115
120-130
140-150
Maxi型
50-60
55-65
*
70-80
*
110-120
*
130-140
*
150-160
*
180-190
*
洗脱时间———核酸
电洗脱时间受多种因素影响,包括洗脱核酸片段大小,所用电压,凝胶切块大小,
凝胶浓度以及聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺配比。表3-5列出了从聚丙烯酰胺凝
胶和琼脂糖凝胶中抽提不同大小DNA和RNA所需的时间。
重要:每个样品所需的最优电泳时间是不同的
表3. 100-150V电压条件下从自然或变性4%聚丙烯酰胺凝胶(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯
酰胺)中电洗脱不同大小DNA片段所需最少时间。
DNA片段大小(bp)
100
200
300
500
822
1000
1044
1400
2700
*未测定
Mini型
10-15
15-20
*
30-35
*
55-60
*
75-80
时间(分钟)
Midi型
10-20
*
15-25
20-30
25-35
*
30-40
*
45-55
Maxi型
10-15
15-20
*
30-35
*
55-60
*
75-80
*
GeBA:********************
Gene Bio-Application
表4. 100-150V电压条件下从自然或变性4%聚丙烯酰胺凝胶(29:1聚丙烯酰胺:甲叉双丙烯
酰胺)中电洗脱不同大小RNA片段所需最少时间。
RNA片段大小(bp) 时间(分钟),Midi型
100 15-25
400 25-35
600 35-45
表5. 80-110V电压条件下从1%琼脂糖中电洗脱不同大小DNA片段所需最少时间。
1000 45-55
DNA片段大小(bp)
100-200
500-700
1000
2000
4361
5000
6557
8000
9416
10000
23130
*未测定
Mini型
*
10-15
15-20
25-30
*
40-45
*
50-55
*
55-60
*
时间(分钟)
Midi型
10-20
15-20
20-30
*
25-35
*
45-55
*
55-65
*
70-80
Maxi型
*
10-15
15-20
25-30
*
40-45
*
50-55
*
55-60
*
GeBA EZ-Tube应用:核酸沉淀
EZ-Tube电洗脱配套试剂盒提供的3M醋酸钠,pH5.2溶液可以有效地沉淀电洗脱后
的核酸样品。流程如下:
1. 向核酸样品中加入0.1倍体积的3M醋酸钠,pH5.2溶液和2倍体积的100%乙醇
或1倍体积100%异丙醇,轻轻振荡混匀。
2. 室温孵育5分钟。
3. 14,000×g离心5分钟,吸掉上清并用70%乙醇洗沉淀,轻轻振荡并重复70%乙
醇清洗。
4. 吸走上清,用100%乙醇洗沉淀并如步骤3中离心。吸掉上清后,风干沉淀使乙
醇挥发干净,将沉淀重溶于去离子水或其他缓冲液中。
GeBA:********************