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叶酸代谢相关基因多态性的检测方法与设计方案

IT圈 admin 28浏览 0评论

2024年5月30日发(作者:范姜流如)

本技术提供了一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,包括:提取受试者的基因组

DNA

;配置单碱基延伸反应体系和聚合酶链式反应

PCR

扩增体系;顺次进行扩增反应;顺

次进行消化处理;顺次混合消化处理后的体系和单碱基延伸反应体系,进行延伸反应,并进

行纯化;利用液相色谱质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定基因组

DNA

特定

SNP

位点

的基因型;其中,洗脱流动相为含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的蒸

馏水,以及含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的甲醇,洗脱方式为梯度

洗脱。本方案能够灵敏、简便的对目标基因的

SNP

位点进行基因分型。

权利要求书

1.

一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,包括:

提取受试者的基因组

DNA

配置包含

SEQ ID NO.1

SEQ ID NO.3

所示的单碱基延伸引物序列的单碱基延伸反应体系,

并配置包含

SEQ ID NO.4

SEQ ID NO.9

所示的特异性扩增引物序列和所述基因组

DNA

的聚

合酶链式反应

PCR

扩增体系;

顺次对所述

PCR

扩增体系进行扩增反应;

顺次对扩增反应后的体系进行消化处理;

顺次混合消化处理后的体系和所述单碱基延伸反应体系,获得混合液,并对所述混合液进行

延伸反应;

顺次对延伸反应后的体系进行纯化处理;

利用液相色谱

-

质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定所述基因组

DNA

特定

SNP

位点的基

因型;

其中,所述液相色谱

-

质谱联用仪的洗脱流动相为含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的蒸馏水,以及含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的

甲醇,洗脱方式为梯度洗脱。

2.

根据权利要求

1

所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,

所述高效液相色谱仪的色谱条件包括:

C18

反相色谱柱,所述

C18

反相色谱柱的柱温为:

40

70

℃,所述纯化产物的进样量为:

10

50μl

3.

根据权利要求

1

所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,

所述液相色谱

-

质谱联用仪中,

2024年5月30日发(作者:范姜流如)

本技术提供了一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,包括:提取受试者的基因组

DNA

;配置单碱基延伸反应体系和聚合酶链式反应

PCR

扩增体系;顺次进行扩增反应;顺

次进行消化处理;顺次混合消化处理后的体系和单碱基延伸反应体系,进行延伸反应,并进

行纯化;利用液相色谱质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定基因组

DNA

特定

SNP

位点

的基因型;其中,洗脱流动相为含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的蒸

馏水,以及含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的甲醇,洗脱方式为梯度

洗脱。本方案能够灵敏、简便的对目标基因的

SNP

位点进行基因分型。

权利要求书

1.

一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,包括:

提取受试者的基因组

DNA

配置包含

SEQ ID NO.1

SEQ ID NO.3

所示的单碱基延伸引物序列的单碱基延伸反应体系,

并配置包含

SEQ ID NO.4

SEQ ID NO.9

所示的特异性扩增引物序列和所述基因组

DNA

的聚

合酶链式反应

PCR

扩增体系;

顺次对所述

PCR

扩增体系进行扩增反应;

顺次对扩增反应后的体系进行消化处理;

顺次混合消化处理后的体系和所述单碱基延伸反应体系,获得混合液,并对所述混合液进行

延伸反应;

顺次对延伸反应后的体系进行纯化处理;

利用液相色谱

-

质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定所述基因组

DNA

特定

SNP

位点的基

因型;

其中,所述液相色谱

-

质谱联用仪的洗脱流动相为含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的蒸馏水,以及含

1

%~

5

(v/v)

六氟异丙醇和

0.05

%~

0.3

(v/v)

三乙胺的

甲醇,洗脱方式为梯度洗脱。

2.

根据权利要求

1

所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,

所述高效液相色谱仪的色谱条件包括:

C18

反相色谱柱,所述

C18

反相色谱柱的柱温为:

40

70

℃,所述纯化产物的进样量为:

10

50μl

3.

根据权利要求

1

所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,

所述液相色谱

-

质谱联用仪中,

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