2024年5月30日发(作者:范姜流如)
本技术提供了一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,包括:提取受试者的基因组
DNA
;配置单碱基延伸反应体系和聚合酶链式反应
PCR
扩增体系;顺次进行扩增反应;顺
次进行消化处理;顺次混合消化处理后的体系和单碱基延伸反应体系,进行延伸反应,并进
行纯化;利用液相色谱质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定基因组
DNA
特定
SNP
位点
的基因型;其中,洗脱流动相为含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的蒸
馏水,以及含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的甲醇,洗脱方式为梯度
洗脱。本方案能够灵敏、简便的对目标基因的
SNP
位点进行基因分型。
权利要求书
1.
一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,包括:
提取受试者的基因组
DNA
;
配置包含
SEQ ID NO.1
~
SEQ ID NO.3
所示的单碱基延伸引物序列的单碱基延伸反应体系,
并配置包含
SEQ ID NO.4
~
SEQ ID NO.9
所示的特异性扩增引物序列和所述基因组
DNA
的聚
合酶链式反应
PCR
扩增体系;
顺次对所述
PCR
扩增体系进行扩增反应;
顺次对扩增反应后的体系进行消化处理;
顺次混合消化处理后的体系和所述单碱基延伸反应体系,获得混合液,并对所述混合液进行
延伸反应;
顺次对延伸反应后的体系进行纯化处理;
利用液相色谱
-
质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定所述基因组
DNA
特定
SNP
位点的基
因型;
其中,所述液相色谱
-
质谱联用仪的洗脱流动相为含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的蒸馏水,以及含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的
甲醇,洗脱方式为梯度洗脱。
2.
根据权利要求
1
所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,
所述高效液相色谱仪的色谱条件包括:
C18
反相色谱柱,所述
C18
反相色谱柱的柱温为:
40
~
70
℃,所述纯化产物的进样量为:
10
~
50μl
。
3.
根据权利要求
1
所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,
所述液相色谱
-
质谱联用仪中,
2024年5月30日发(作者:范姜流如)
本技术提供了一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,包括:提取受试者的基因组
DNA
;配置单碱基延伸反应体系和聚合酶链式反应
PCR
扩增体系;顺次进行扩增反应;顺
次进行消化处理;顺次混合消化处理后的体系和单碱基延伸反应体系,进行延伸反应,并进
行纯化;利用液相色谱质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定基因组
DNA
特定
SNP
位点
的基因型;其中,洗脱流动相为含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的蒸
馏水,以及含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的甲醇,洗脱方式为梯度
洗脱。本方案能够灵敏、简便的对目标基因的
SNP
位点进行基因分型。
权利要求书
1.
一种叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,包括:
提取受试者的基因组
DNA
;
配置包含
SEQ ID NO.1
~
SEQ ID NO.3
所示的单碱基延伸引物序列的单碱基延伸反应体系,
并配置包含
SEQ ID NO.4
~
SEQ ID NO.9
所示的特异性扩增引物序列和所述基因组
DNA
的聚
合酶链式反应
PCR
扩增体系;
顺次对所述
PCR
扩增体系进行扩增反应;
顺次对扩增反应后的体系进行消化处理;
顺次混合消化处理后的体系和所述单碱基延伸反应体系,获得混合液,并对所述混合液进行
延伸反应;
顺次对延伸反应后的体系进行纯化处理;
利用液相色谱
-
质谱联用仪检测纯化处理后的产物,确定所述基因组
DNA
特定
SNP
位点的基
因型;
其中,所述液相色谱
-
质谱联用仪的洗脱流动相为含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的蒸馏水,以及含
1
%~
5
%
(v/v)
六氟异丙醇和
0.05
%~
0.3
%
(v/v)
三乙胺的
甲醇,洗脱方式为梯度洗脱。
2.
根据权利要求
1
所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,
所述高效液相色谱仪的色谱条件包括:
C18
反相色谱柱,所述
C18
反相色谱柱的柱温为:
40
~
70
℃,所述纯化产物的进样量为:
10
~
50μl
。
3.
根据权利要求
1
所述的叶酸代谢相关基因多态性的检测方法,其特征在于,
所述液相色谱
-
质谱联用仪中,