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荧光蛋白及其在微生物过程工程中的应用

IT圈 admin 32浏览 0评论

2024年4月17日发(作者:归骏奇)

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRISj

DOI

10.

13995/j.

aki.

11

-

1802/ts.

019462

荧光蛋白及其在微生物过程工程中的应用

毛洪丽

刘雨

建国

*

(

上海

工大学医疗器械与食品学院

食品科学与工程研究所

上海

,

20093

)

摘要

荧光蛋白是一系列在紫外光激发下产生荧光的发光蛋白

以其荧光稳定性好

灵敏度高

无毒害等优点

广泛应用于诸多领域

&

目前成功开发的荧光蛋白有绿色荧光蛋白

(

green

fluorescent

protein

,

GFP

)

蓝色荧光蛋

(

blue

fluorescent

protein

,

BFP

)

青色荧光蛋白

(

cyan

fluoesccnt

protein

,

CFP

)

色荧光蛋白

(

yellow

fluorescent

protein

,

YFP

)

红色荧光蛋白

(

red

fluorescent

protein

,

RFP

)&

荧光蛋白在微生物工程中菌株筛选方面的应用逐

渐成熟

菌株筛选是菌种工程中较为耗时

的步骤

荧光蛋白为菌株筛选提供了新突破口

&

本文从荧光蛋白

的基础研究出发

综述了近年来荧光蛋白在微生物工程中菌株筛选方面的进展和基于荧光蛋白的新型微生物筛

选技术

为荧光蛋白等其他发光蛋白在微生物菌种工程的应用提供参考&

关键词

荧光蛋白

菌种工程

筛选策略

微流体技术

20

世纪

60

年代初

,

MORISE

等⑴从多管水母

(

Aequorea

victoria

)

中分离出一种发光蛋白

并命名为

1

荧光蛋白

1.1

GFP

目前不同颜色的荧光蛋白主要有

5

其中

GFP

的研究最早

也最成熟

GFP

是由

238

个氨基酸

aequorin

由于

aequorin

在紫外光

(

UV

)

或蓝光激发

发岀绿色荧光

,所以

为绿色荧光蛋白

(

green

Iuorescent

protein

,

GFP

)

%

后来

,

PRASHER

'

2

(

GFP

发岀的绿色荧光是

接受了来自荧光素

组成的单体蛋白

分子量为

27

kD

10

%

GFP

分子呈

"

圆筒状

11

"

链形

成外

,

圆筒的

直径

3

酶-脱基荧光素激发态复合物或

Cc

2+

激发光蛋白

产生

发光过程发生

底部的

nm

,

长为

4nm

,

两端

a-

旋覆盖

将负责发光的基

团紧紧地包裹在筒中央

'

11-12

%

GFP

300

-500

nm

一种特殊的上皮细胞中

属于一种生物的通讯功能或

防御机制

%

绿色荧光蛋白的编码基因

(

酗)可以被整

其他生物体

其他生物体发

波长激发下发岀绿色荧光

'

13

并且能保持

10

mm

,

马金石等

'

14

研究表明

C-

多于

7

个氨

基因工程技

劭基因与其他蛋白质融合表

基酸或者带蛋氨酸的

致失去荧光

圆筒

达为研究细胞生物学的重要

'

3

(

%

TSIN

基于

内第

一条"

折叠片

开始于

N-

的第

10

基酸

,

N-

GFP

发光机理

通过基因突变得到一系列不同颜色的

10

基酸形成

子的主要成分

发色团

这种状

荧光蛋白

这些不同颜色的荧光蛋白

HEIM

SAI-

筒内中心位置

形成非常紧密

固的

TO

4

-

5

可以实现同时

跟踪

多种蛋白质的状态和多

态下的荧光不会由于和氧的相互碰撞而被碎灭从而

导致

产率降低

GFP

发色团由位于

65~67

处的

个生物事件

6-7

&

过程

8

(

微生物育种是食品和生物

工程

时费力

制约

少的工作

但是生物筛选步骤费

'

Ser

yr

ly

环状

肽组成

该氨基酸

联体以共价形

式与

GFP

的骨架相连

15

%

INOUYE

16

HEIM

生物的快速

高通量筛选

多种荧

光蛋白的

为微生物育种提供了有力工具

9

%

17

的研究

气是

GFP

发岀荧光的必要成分

%

种类的荧光蛋白性质岀发

光蛋白在

生型

GFP

的生色

"

筒状

中与周围的氨基

微生物育种方面

%

的进展

为微生物育种的开展提

酸残基

18

%

网络

如图

1

GFP

的一个引人注目的特点是

,其生色团的形成

第一作者

硕士研究生

(张建国副教授为通讯作者,

E-mail

jg-

zhang@

usst.

edu.

cn

)

没有物种的特异性

可以

生成

2

-4

h后自动催化

得到

19

%

CORMACK

20

对野生型

GFP

定点突变

可以增强

GFP

荧光强度的绿色荧光蛋白

称为增强

基金项目

:国

家自然

学基金项目

(

31870045&

21306112

)

收稿日期

2018

-

11

-27

改回日期

2018

-12

-25

252

2019

Vol.

45

No-

7

(

Total

389

)

综述与专题评论

CORMACK

'

20

(

改变野生型

(

F+

基因

导致其

Glnl83

I

Arg96

吸收光谱和发射光谱发生

Gln94

PWat308

,最终改

光蛋白的

以获得

颜色的荧光

光强度与荧光颜色

>Wat344

蛋白

°

蓝色荧光蛋白

(

blue

l/rescent

protein

,

BFP

$

Thr63

是将珊瑚野生型

GFP

中的

66

位酪氨酸突变为

Phel65

Gln69

(

Y66H

)

或双突变体

Y66H/Y145F

后得到能在约

380

nm

激发光产生

448

nm

蓝光的蛋白

但是这些

•Wat374

.

Wat383

Phe64

|Wat3701

(

W

95

#

Leu201

Th

»at3i>^

224

突变体的蓝色荧光的荧光

,

GFP

胞以

致细

15%

20%。

由于

BFP的激发光接近于紫外光

Glu222

仅穿透力很弱

还容易在操作中

Leu42

的自荧光

,

较少

'

23

(

与得到

BFP

,

GFP

66

1

GFP

生色团及其所处环境

Fig.

1

GFP

chromophore

and

its

environment

生色团为绿色

灰色

虚线为氢键

青色荧光蛋白

(

cyan

luorescent

protein

,

CFP

)

%

CFP

的激发波为

433

445

nm

,

发射波长为

475

503

nm

%

研究者

GFP

,

发第

203

位苏

光生色团的

黄绿色的荧光

,

氨酸和荧光基团的空间距离非常近

所以苏氨酸突

GFP

绿色荧光蛋白

%

GFP

的突变体也会改变荧光

为酪氨酸

(

T203Y

)

来稳定激发态

偶极矩

蛋白的发光特征

野生型

GFP

的主激发峰为

397

nm

,

副激发峰为

476

nm

,

发射峰约

509

nm

%

GFP

突变体

(

T203Y

)

使荧光蛋白的激发波

和发射波长红移约

20

nm

,

变体

S6ST

的激发峰红移至

484

nm

,

发射峰变为

507

nm

,

且荧光

生型

GFP

5

步突变

被称为黄色荧光蛋白

(

yellow

luorescent

protein

,

YFP

)

'11

(

YFP

进一步突变可得到荧光更加强烈

得到的突变体GFP

F64L

是一种在

37

d

下高效

成熟

的增强型

GFP

'

21

(。

这种突变体的缺陷是对

pH

值敏

较易形成

的增强型黄色荧光蛋白

(

enhanced

yellow

luorescent

protein

,

eYFP

)

%

当前研究致力于降低

YFP

对于氯离

pH

其在成

从温

珊瑚

中分离得到

,

通过突

以得到

2

面的

'

24

(

%

GFP

趋向于形成

后来

GFP

的第

65

490

nm

,

酸突变为苏氨酸

,

得到

,

蛋白

单体蛋白mGFP

mGFPI

和二聚体蛋白

dGFP

的亮度

GFP

2

倍以上

,

'

22

突变体

S65T

%

突变体

S65T

的激发谱中只有一个峰,

大的潜

(

%

(

red

luorescent

protein

,

RFP

)

%

1

比较了上述多种

1.2

其他颜色的荧光蛋白

1

Tab)

1

Comparison

of

properties

and

application

characteristics

of

fuorescent

proteies

各种颜色荧光蛋白性质和应用特点的比较

性质

特点

光蛋白的性质和各种荧光蛋白的

名称

GFP

光稳定

pH

剂等

'

(

pH

7

-12

)

在微生物

植物

动物中成功表达

GFP

表达不受细胞种类和位

置的限制

26

(

25

耐光白

'

BFP

等电点为

pH

6.

17

;

光稳定性差

BFP

产生荧光

成像过程利用紫外线来激发

作为

GFP

表达研究的对照或标记

;适用于

EGFP

RFP

YFP

一些光毒性问题

其他染料

蛋白的

平和细胞内定位

利用

CFP

蛋白

CFP

GFP

高度相似

可用

GFP

抗体检测

CFP

YFP

RFP

荧光最强

;

稳定性较差

对酸性敏感

,

pH

6.

5

时荧光强度丧失

50%

十分敏感'

27

-29

(

的荧光蛋白之一

胞内

pH

和氯离子浓度的

生物

作为荧光能量的接受体

光共振

mCherry

的稳定性好

较的激发波

产生的光性较

较的生物织

30

(

'

2019

年第

45

卷第

17

(

总第

389

)

253

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRIS

2

利用荧光蛋白作为标记筛选目的细胞

随着科技的发展

重组

DNA

技术

recambinant

蛋白的状态

GFP的生色团和目标蛋白融合表达可

目标蛋白是

误折叠

'

40

光蛋白

发为

pH

41

pH

转变为光颜色

DNA

technology

在微生物育种方面应用越来越普遍

的变化

表征细胞内

pH

pH

6.

8

-7.

8

之间

随着

pH

荧光蛋白强度增强

42

甚至全基因组改组

genome

shuffling

已经应用到微

生物育种过程中

'

31

o

为了筛选到性状

的微生

很多科学

胞筛

研究

生物

4

基于荧光蛋白的细胞筛选策略

为了提高细胞表达外源蛋白的表达效率

借助一

的筛

光蛋

白作为探针筛选目的

物菌种改良的多个方面取得

载体

速有效

简单易行和

些物理化学

UV

诱变

NTG

诱变等

目的蛋

性强等特点

近年来

各种荧光蛋白在工业微生

机突变

工作

等优点

近年

白的突变体

传统的筛

例如

96

孔板中的筛

高通量筛选

光蛋白具有基因片段相对较短

700

bp

),

表达

随机性大

的概念

流体技术

流体技术最初

,多学者

光蛋白作为筛

MANZ

43

代谢

物的筛选

例如单志新等

'

32

GFP

作为报

蛋白筛

制目的基

siRNA

'

33

体质

系统

UPS

获得

简便的带有

GFP

的酿酒酵母

GFP

的重组

'

34

生物和化学

的样品制

作单元集成

分离和

等基

以替代传统的生物和化学

离技术

的一种新型分析分

流体技术筛选目的菌株需要

好的技术储备

目前

光蛋白作

例如徐明

观察之后

为防止

通常处

续相和

为标记筛选微生物

GFP

标记

相的蒸发

微流体通道或

状态

成功获得大丽轮

的获得为后续大丽

转化株

大丽

胞正常生

44

为改

DAGKESAMANSKAYA

45

光转

光蛋白

流筛

过程的组织学和致

好的基础

荧光蛋白

理研究提供

筛选一

-蛋白酶体通

UPP

流体

等细

中直接生

可以直接恢复

达特定

的药物细胞

目的细胞的活性

该方法基于绿色到红色可切换荧

光蛋白的细胞内

在显微镜下监测液滴中细胞的

回收

45

是细胞内重要的蛋白质降解系统

影响恶性

胞发生与发展

'

35

蛋白酶体抑制剂通过

UPP

,

制 胞生长

成为

生长

光激

疗的新方法

方海

的研究

通过

法筛

胞基

同等

'

36

GFP

的筛选模型

得大量

稳定表达

以种光转

胞的

光蛋白

流控

选中具

蛋白酶体抑制剂的细胞株

目前

微生物育种过程中单细胞基

的应用前景

近几年

流体技术

较难

将荧

的蛋白质

与日

44

W

HUANG

光蛋白与一

以和

DNA

例如组蛋白结合蛋白和荧光蛋白

48

后的酵

流控筛选和全基

光鉴

H

S-mCher

e

定与酵母蛋白

胞与

a-

粉酶改

的突变

经突

and

HMG-mCher

e

来筛选已经发生突变的细胞

'"

绿色荧光蛋白的

a-

淀粉酶混

3

基于荧光蛋白表

细胞

状态

细胞内的状态影响细胞内蛋白质构象

例如蛋白

通过荧光底物

的液

产的淀粉酶突变体

系统

称之为

双荧光

的荧光强度选择

陈建武等

'

49

借助新潮霉素和荧光蛋白

2

类标记

的基

质错误折

和聚集

所以

蛋白质的

以说

明细胞内状态

VENTURA

'

38

采用

GFP

作为模型

蛋白

以阻止蛋白质错误折

的化学

系统

该策略以

GFP

和新霉素基因为正筛选标记

以红色荧光蛋白基因为负筛

目的细

最大

WANG

50

通过

色荧光蛋白

正远红外的

内蛋白质状态

例如

KUCHERAK

39

光分

发射波长为

625

nm

649

nm

与青色

绿色

黄色和

行多色标记成像

6FM-M

7AFM-M

标记突触核蛋白说明突触核

254

2019

Vol.

45

No.

17

Total

389

综述与专题评论

随着对荧光蛋白研究的深入

发现荧光蛋白发射

1996

6

(

2

)

:

178

-

182.

[

5

]

SADO

Y

OIKAWA

M

NAKAZAWA

H

el

al.

Machine

的荧光可以通过

波长的光

产生

3

荧光蛋白

光激活荧光蛋白

(

photoactivated

fluorescent

protein

,

PAFPs

)、

光转换荧光蛋白

(

photoconvenibie

learning

uided

mutagenesis

for

directed

ewlu/on

of

luo-

rescenl

proteins

[

J

]

.

ACS

Synthetic

Bioloyy

2018

7

(

9

)

:

2

014

-2

022.

[

6

]

DUDA

K

LONOWSKI

L

A

KOFOED-NIELSEN

M

I

fluorescent

protein

,

PCFPs

)

光开关荧光蛋白

(

/versl-

bie

photoswitching

luorescent

protein

,

PSFPs

)

%

其中

PCFPs

是指光照后荧光蛋白从一种发射短波长的荧

光状态

地转变为

外一种发射长波长的荧光

S.

High-efficiency

genome

editing

via

2A-csupled

cs-ce-

pression

of

luorescent

proteins

and

zine

finger

nucleases

or

CRISPR/Cs9

nickase

pairs

[

J

]

.

Nucleic

Acids

Re-

状态

目前为

的由绿转

的荧光蛋白主要有

Dendra2、

Eos

Kaede

KikGR

[

51

(

这些荧光蛋白具有

相同的生色团

His

-Tyr-Gly

,

光转换前发射绿色荧

光转换后变成

色荧光

胞筛

面发挥着

重要作用

但是目前

光转换蛋白的研究较少

,需

要继续开发更多种类生色团的荧光蛋白

5

展望

目前

GFP

的种类较为完全

在微生物过程工程

研究中

主要集中

胞筛选

微流体技术

通过调节其

荧光

将目的细胞分级

筛选

双光

筛选和光转换筛选策略员

单荧光筛选中筛

荧光蛋白

胞筛选的研究中

是热门

但是基

光蛋白筛

着一些问题与不

荧光强度的

线性性质使其定量非常

;

紫外激发

蛋白有光漂白和

作用

多生物

的自发

光现象,

并有着

的激发和发射波长等

所以

光蛋白

胞筛

其他

要继

参考文献

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rescencs

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2014

42

(

10

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e84.

[

7

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HOJJAND

KNUDSEN

C

ASGRIMSDOTTIR

E

S

RAHA

MI

K

el

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A

modified

monomeric

red

luorescent

protein

eepoeteefoeassessingCRISPR

a,tieity

[

J

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Feontieesin

Ce

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DeeeeopmentaeBioeogy

2018

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D

SEKINE

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BARSARHYNE

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TSUJI

F

I.

Aequoreq

green

fluorescent

pro

­

tein

[

J

]

&FEBS

Le

t

ees

1994

341

(

2

-3

)

:

277

-280&

[

17

]

HEIM

R

PRASHER

D

C

TSIEN

R

Y.

Wavelength

mu

­

tationsand

pos

t

eanseationaeautotidation

ofgeeen

feuoees-

cenl

protein

[

J

]

.

Procsedings

of

the

National

Academy

of

Sciences

of

the

United

States

of

America

1994

91

(

26

)

:

12

501 -

12

504.

2019

年第

45

卷第

17

(

总第

389

)

255

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRIS

j

[

18

]

CRAGGS

T

D.

Green

fuorescent

protein

:

structure

#

fcXdl

ing

and

chromophore

maturation

'

J

(

.

Chemical

Society

Reviews

#

2009

#

38

(

10

)

:

2

865

-

2

875.

[19

]

吴沛

巴晓

胡海

等.绿色荧光蛋白

GFP

的研究

进展及应用

[

J

]

.

生物医学工程研究

#

2009

#

28

(

1

)

83

-86.

[

20

]

CORMACK

B

P

#

VALDIVIA

R

H

#

FALKOW

S.

FACSl

optimized

mutantsofthegaeen

fluoaescentpaotein

( GFP

)

[

J

]

.

Gene

#

1996

#

173

(1

)

:

33

-38.

[21

]

HEIM

R

#

CUBIT

A

B

#

TSIN

R

Y.

Improved

green

血-

oaescence

[

J

]

.Natuae

#

1995

#

373

(

6

516

)

:

663

-664.

[

22

]

HAGAN

R

P

#

RHOADES

E

#

GRUBER

D

F

#

et

al.

A

new

b

aight

g

aeen-emi

t

ing

fluo

aescent

p

aotein

-engineeaed

monomeric

and

dimeric

forms

[

J

]

.

FEBS

Journal

#

2010

#

277

(

8

)

:

1

967

-

1

978.

[

23

]

DAY

R

N

#

DAVIISON

M

W.

The

fluorescent

protein

pale

t

e

:

Toolsfoace

lulaaimaging

[

J

]

.ChemicalSociety

Reviews

#

2009

#

38

(

10

)

:

2

887

-2

921.

[

24

]

GRISBECK

O

#

BAIRD

G

S

#

CAMPBELL

R

E

#

et

al.

Reducingtheeneiaonmentalsensitieityofye

l

ow

fluoaes-

centpaotein

mechanism

and

applications

[

J

]

.Jouanalof

Biological

Chemists

#

2001

#

276

(

31

)

:

29

188

29

194.

[

25

]

吴瑞

#

张树珍

绿色荧光蛋白及其在植物分子生物学

中的应用

[

J

]

•分子植物育种

#

2005

#

3

(

2

)

:

240

-

244.

[

26

]

汪恒英#周守标#常志州

.

绿色荧光蛋白

(

GFP

)

究进展

[

J

]

.

生物技术

#

2004

#

14

(

3

)

:

228

-233.

[

27

]

LLOPIS

J

#

MCCAFFERY

J

M

#

MIYAWAKI

A

#

et

al.

Measuaemen3ofcyosolic

#

miochondaial

#

and

golgipH

in

singlelieingce

l

swih

gaeen

fluoaescen3paoeins

[

J

]

.

Paoceedingsof3heNaionalAcademyofSciencesof3heU-

nied

S

aesofAmeaica

#

1998

#

95

(

12

)

:

6

803

-6

808.

[

28

]

JAYARAMAN

S

#

HAGGI

P

M

#

WACHTER

R

M

#

et

ism

and

ce

l

ulaaapplicationsofagaeen

fluo-

aescent

p

aotein-based

halidesensoa

[

J

]

.JouanalofBio-

logicalChemistay

#

2000

#

275

(

9

)

:

6

047

-6

050.

[

29

]

KUNER

T

#

AUGUSTINE

G

J.

A

genetical

l

y

enceded

ral

tiometaicindicatoafoachloaide

:

captuaingchloaidetaansi-

ents

in

cultuaed

hippocampal

neuaons

[

J

]

.

Neuaon

#

2000

#

27

(

3

):

447

-459.

[

30

]

郝丽梅

#

棣,

梅兴国.红色荧光蛋白的研究进展

[

J

]

.

学研究

#

2006

#

33

(

2

):

131

-133.

[31

]

李义勇

#

张亚雄

.

基因重组技术在工业微生物菌种选

育中应用的研究进展

[

J

]

.中国酿造#

2009

#

28

(

1

)

:

11

-14.

[

32

]

单志新

#

林秋雄

#

符永恒

#

等•用绿色荧光蛋白

(

GFP

)作为报告分子筛选有效的

siRNA

[

J

]

.

中国生

256

2019

Vol.

45

No-

7

(

Total

389

)

物化学与分子生物学报

#

2007

#

23

(

3

)

:

231

-235.

[

33

]

王弘

#

郑文岭

#

杨连生

#

.

以绿色荧光蛋白为报告

基因的酿酒酵母表达载体的构建

[

J

]

•广东医学

#

2002

#

23

(

12

)

:

1

239

-

1

240.

[

34

]

徐明

#

桂月晶

#

祁伟彦#等.绿色荧光蛋白基因标记棉

花黄萎病菌

[

J]

•植物保护

#

2013

#

39

(

5

):

128

-

133.

[

35

]

黄洁玉

#

张敏

.

蛋白酶体抑制剂在肺癌治疗中的研究

进展

[

J

]

.

中国医药导报#

2016

#

13

(

23

)

:

38

-41.

[

36

]

方海同#胡政#周光飕

.

一种基于绿色荧光蛋白的蛋

白酶体抑制剂细胞筛选模型

[

J

]

.

生物工程学报

#

2009

#

25

(

3

)

:

452

-456.

[

37

]

PARK

J

#

LEE

S

#

WON

N

#

-moleculeDNA

eisualization

usingAT-specificaed

and

non-specific g

aeen

DNA-binding

fluoaescentpaoteins

[

J

]

.

The

Analyst

#

2019

#(3

)

.

[

38

]

VENTURA

S

#

NAVARRO

S.

Sc

aeening

p

aotein

aggaega

tion

in

ce

l

susingfluoaescentlabelscoupled

toflow

cy-

tometay

[

J

]

.

Methods

in

MoleculaaBiology

(

Clifton

#

NJ)

#

2019

#

1873

:

195

-212.

[

39

]

KUCHERAK

O

A

#

SHVADCHAK

V

V

#

KYRIUKHA

Y

A

#

sisofafluoaescentpaobefoasensingmul-

tiplepaotein

states

[

J

]

.

Euaopean

Jou

anal

of

O

aganic

Chemists

#

2018

(

37

)

:

5

155

-5

162.

[

40

]

LII

Y

#

WOLSTENHOLME

C

H

#

CARTER

G

C

#

et

al.

Modulation

offluoaescentpaotein

chaomophoaestodetect

paotein

aggaegation

with

tuan-on

fluoaescence

[

J

]

.

Jou

anal

ofthe

Ameaican

ChemicalSociety

#

2018

#

140

(

24

)

:

7 381

-7

384.

[

41

]

7SHINODA

H

#

SHANNON

M

#

NAGAIT.

Fluoaescen

p

aoteins

fo

ain

eestigating

biological

e

eents

in

acidicenei-

aonments

[

J

]

.

InteanationalJouanalofMoleculaaSci-

ences

#

2018

#

19

(

6):

1

548.

[

42

]

EUM

KANG

B

#

LEE

S

#

BAKER

B

J.

Optical

cense-

quencesofagenetica

l

y-encoded

eoltageindicatoawith

a

pH

sensitieefluoaescentpaotein

[

J

]

.NeuaoscienceRe-

seaach

#

2018

.

[

43

]

MANZ

A

#

GRABER

N

#

WIDMER

H

M.

Miniaturized

te-

talchemicalanalysissystems

:

A

noeelconceptfoachemi-

cal

sensing

[

J

]

.

Sensors

&

Actuators

B

Chemical

#

1990

#

1(

1

):

244

-248.

[

44

]

HOSOKAWA

M

#

HOSHINO

Y

#

NISHIKAWA

Y

#

et

al.

Daople-based

mic

aofluidics

fo

ahigh-3h

aoughpu3sc

aeening

ofameagenomiclibaaayfoaisolaion

ofmicaobialenzymes

[

J

]

.Biosensoas&

Bioelecaonics

#

2015

#

67

:

379

-385.

[

45

]

DAGKESAMANSKAYA

A

#

LANGER

K

#

TAUZIN

A

S

#

hotoswitchablefluoaescentpaoteinsfoadaop-

let-based

micaofluidicscaeening

[

J

]

.JouanalofMicaobio-

综述与专题评论

loyicol

Methods

,

2018

#

147

:

59

65.

[

J

]

.

Pros

Natl

Acad

Sci

USA

,

2015

,

112

(

34

):

[

46

]

LONGWELL

C

K

,

LABANDH

L

,

COCHRAN

J

R.

High-throughput

screening

technoloyies

for

enzyme

engi

­

4

689

-4

696.

[

49

]

陈建武

任红艳

华文君

.

一种用于提高基因打靶

neering

[

J

]

.

Cur

r

Opin

Biotechnol

,

2017

,

48

:

196

-

202.

效率的

荧光筛选策略

[

J

]

.

中国生物工程杂志,

2017

,

37

(

1

)

:

58

-63.

[

50

]

WANG

L

,

JACKSON

W

C

,

STEINBACH

P

A

,

cl

S.

E-

[

47

]

SHEMBEKAR

N

,

HU

H

,

EUSTACE

D

,

el

S.

Single

­

cell

droplet

microluidis

screening

for

antibodies

specifis-

Sly

binding

to

taryel

cells

[

J

]

.

Cell

Reports

,

2018

,

22

(

8

)

:

2

206

-

2

215.

wlu/on

of

new

nonantibody

proteins

via

iterative

somatic

hypermutation

[

J

]

.

Proccedings

of

the

National

Academy

of

Sciences

of

the

United

States

of

America

,

2004

,

101

[

48

]

HUANG

M

,

BAI

Y

,

SJOSTROM

S

L

,

cl

S.

Microluidis

(

48

)

:

16

745

-

16

749.

screening

and

whole

enome

sequencing

identifies

muta

­

[

51

]

韩李阳

.

超分辨成像光转换荧光蛋白探针的筛选及应

用'

D

]

•长沙

南大学

2014.

tions

associated

with

improved

protein

secretion

by

yeast

Fluoresccnt

proteies

and

their

applicationt

ie

microbial

straie

engineeieg

MAO

Hongli

,

LIN

Yu

,

ZHANG

Jianguo

*

(

Institute

of

Food

Science

and

Engineering

,

School

of

Medical

Instrument

and

Food

Engineering

,

University

of

Shanghai

for

Science

and

Technoloyy

,

Shanghai

200093

,

China

)

ABSTRACT

Fluorescent

proteins

are

a

series

of

luminescent

proteins

under

UV

light.

Fluorescent

proteins

are

widely

used

as

markers

in

many

fields

due

to

their

good

stability

,

high

sensitivity

and

non-toxicity.

Currently

,

suc

­

cessfully

established

fluorescent

proteins

include

green

luorescent

protein

(

GFP

)

,

blue

luorescent

protein

(

BFP

),

cyan

luorescent

protein

(

CFP)

,

yellow

luorescent

protein

(

YFP

)

and

red

luorescent

protein

(

RFP

)

.

App/ca/ons

of

fluorescent

proteins

in

strain

screening

during

microbial

engineering

have

been

wli

developed.

Strain

screening

is

/mv-consuming

and

labor-intensive

,

and

fluorescent

proteins

provide

a

breakthrough

for

high-throughput

screening.

This

review

started

with

basic

research

work

on

luorescent

proteins

and

summarized

the

app/ca/ons

of

luorescent

proteins

in

microbial

strain

engineering

as

well

as

new

screening

tvchnoCyivs.

This

review

will

provide

a

basis

for

ap

­

plying

luorescent

proteins

and

other

luminescent

proteins

in

microbial

strain

engineering.

Key

words

fluorescent

protein

strain

engineering

screening

strategy

;

mic/luidics

tvchnoloyy

2019

年第

45

卷第

17

总第

389

257

2024年4月17日发(作者:归骏奇)

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRISj

DOI

10.

13995/j.

aki.

11

-

1802/ts.

019462

荧光蛋白及其在微生物过程工程中的应用

毛洪丽

刘雨

建国

*

(

上海

工大学医疗器械与食品学院

食品科学与工程研究所

上海

,

20093

)

摘要

荧光蛋白是一系列在紫外光激发下产生荧光的发光蛋白

以其荧光稳定性好

灵敏度高

无毒害等优点

广泛应用于诸多领域

&

目前成功开发的荧光蛋白有绿色荧光蛋白

(

green

fluorescent

protein

,

GFP

)

蓝色荧光蛋

(

blue

fluorescent

protein

,

BFP

)

青色荧光蛋白

(

cyan

fluoesccnt

protein

,

CFP

)

色荧光蛋白

(

yellow

fluorescent

protein

,

YFP

)

红色荧光蛋白

(

red

fluorescent

protein

,

RFP

)&

荧光蛋白在微生物工程中菌株筛选方面的应用逐

渐成熟

菌株筛选是菌种工程中较为耗时

的步骤

荧光蛋白为菌株筛选提供了新突破口

&

本文从荧光蛋白

的基础研究出发

综述了近年来荧光蛋白在微生物工程中菌株筛选方面的进展和基于荧光蛋白的新型微生物筛

选技术

为荧光蛋白等其他发光蛋白在微生物菌种工程的应用提供参考&

关键词

荧光蛋白

菌种工程

筛选策略

微流体技术

20

世纪

60

年代初

,

MORISE

等⑴从多管水母

(

Aequorea

victoria

)

中分离出一种发光蛋白

并命名为

1

荧光蛋白

1.1

GFP

目前不同颜色的荧光蛋白主要有

5

其中

GFP

的研究最早

也最成熟

GFP

是由

238

个氨基酸

aequorin

由于

aequorin

在紫外光

(

UV

)

或蓝光激发

发岀绿色荧光

,所以

为绿色荧光蛋白

(

green

Iuorescent

protein

,

GFP

)

%

后来

,

PRASHER

'

2

(

GFP

发岀的绿色荧光是

接受了来自荧光素

组成的单体蛋白

分子量为

27

kD

10

%

GFP

分子呈

"

圆筒状

11

"

链形

成外

,

圆筒的

直径

3

酶-脱基荧光素激发态复合物或

Cc

2+

激发光蛋白

产生

发光过程发生

底部的

nm

,

长为

4nm

,

两端

a-

旋覆盖

将负责发光的基

团紧紧地包裹在筒中央

'

11-12

%

GFP

300

-500

nm

一种特殊的上皮细胞中

属于一种生物的通讯功能或

防御机制

%

绿色荧光蛋白的编码基因

(

酗)可以被整

其他生物体

其他生物体发

波长激发下发岀绿色荧光

'

13

并且能保持

10

mm

,

马金石等

'

14

研究表明

C-

多于

7

个氨

基因工程技

劭基因与其他蛋白质融合表

基酸或者带蛋氨酸的

致失去荧光

圆筒

达为研究细胞生物学的重要

'

3

(

%

TSIN

基于

内第

一条"

折叠片

开始于

N-

的第

10

基酸

,

N-

GFP

发光机理

通过基因突变得到一系列不同颜色的

10

基酸形成

子的主要成分

发色团

这种状

荧光蛋白

这些不同颜色的荧光蛋白

HEIM

SAI-

筒内中心位置

形成非常紧密

固的

TO

4

-

5

可以实现同时

跟踪

多种蛋白质的状态和多

态下的荧光不会由于和氧的相互碰撞而被碎灭从而

导致

产率降低

GFP

发色团由位于

65~67

处的

个生物事件

6-7

&

过程

8

(

微生物育种是食品和生物

工程

时费力

制约

少的工作

但是生物筛选步骤费

'

Ser

yr

ly

环状

肽组成

该氨基酸

联体以共价形

式与

GFP

的骨架相连

15

%

INOUYE

16

HEIM

生物的快速

高通量筛选

多种荧

光蛋白的

为微生物育种提供了有力工具

9

%

17

的研究

气是

GFP

发岀荧光的必要成分

%

种类的荧光蛋白性质岀发

光蛋白在

生型

GFP

的生色

"

筒状

中与周围的氨基

微生物育种方面

%

的进展

为微生物育种的开展提

酸残基

18

%

网络

如图

1

GFP

的一个引人注目的特点是

,其生色团的形成

第一作者

硕士研究生

(张建国副教授为通讯作者,

E-mail

jg-

zhang@

usst.

edu.

cn

)

没有物种的特异性

可以

生成

2

-4

h后自动催化

得到

19

%

CORMACK

20

对野生型

GFP

定点突变

可以增强

GFP

荧光强度的绿色荧光蛋白

称为增强

基金项目

:国

家自然

学基金项目

(

31870045&

21306112

)

收稿日期

2018

-

11

-27

改回日期

2018

-12

-25

252

2019

Vol.

45

No-

7

(

Total

389

)

综述与专题评论

CORMACK

'

20

(

改变野生型

(

F+

基因

导致其

Glnl83

I

Arg96

吸收光谱和发射光谱发生

Gln94

PWat308

,最终改

光蛋白的

以获得

颜色的荧光

光强度与荧光颜色

>Wat344

蛋白

°

蓝色荧光蛋白

(

blue

l/rescent

protein

,

BFP

$

Thr63

是将珊瑚野生型

GFP

中的

66

位酪氨酸突变为

Phel65

Gln69

(

Y66H

)

或双突变体

Y66H/Y145F

后得到能在约

380

nm

激发光产生

448

nm

蓝光的蛋白

但是这些

•Wat374

.

Wat383

Phe64

|Wat3701

(

W

95

#

Leu201

Th

»at3i>^

224

突变体的蓝色荧光的荧光

,

GFP

胞以

致细

15%

20%。

由于

BFP的激发光接近于紫外光

Glu222

仅穿透力很弱

还容易在操作中

Leu42

的自荧光

,

较少

'

23

(

与得到

BFP

,

GFP

66

1

GFP

生色团及其所处环境

Fig.

1

GFP

chromophore

and

its

environment

生色团为绿色

灰色

虚线为氢键

青色荧光蛋白

(

cyan

luorescent

protein

,

CFP

)

%

CFP

的激发波为

433

445

nm

,

发射波长为

475

503

nm

%

研究者

GFP

,

发第

203

位苏

光生色团的

黄绿色的荧光

,

氨酸和荧光基团的空间距离非常近

所以苏氨酸突

GFP

绿色荧光蛋白

%

GFP

的突变体也会改变荧光

为酪氨酸

(

T203Y

)

来稳定激发态

偶极矩

蛋白的发光特征

野生型

GFP

的主激发峰为

397

nm

,

副激发峰为

476

nm

,

发射峰约

509

nm

%

GFP

突变体

(

T203Y

)

使荧光蛋白的激发波

和发射波长红移约

20

nm

,

变体

S6ST

的激发峰红移至

484

nm

,

发射峰变为

507

nm

,

且荧光

生型

GFP

5

步突变

被称为黄色荧光蛋白

(

yellow

luorescent

protein

,

YFP

)

'11

(

YFP

进一步突变可得到荧光更加强烈

得到的突变体GFP

F64L

是一种在

37

d

下高效

成熟

的增强型

GFP

'

21

(。

这种突变体的缺陷是对

pH

值敏

较易形成

的增强型黄色荧光蛋白

(

enhanced

yellow

luorescent

protein

,

eYFP

)

%

当前研究致力于降低

YFP

对于氯离

pH

其在成

从温

珊瑚

中分离得到

,

通过突

以得到

2

面的

'

24

(

%

GFP

趋向于形成

后来

GFP

的第

65

490

nm

,

酸突变为苏氨酸

,

得到

,

蛋白

单体蛋白mGFP

mGFPI

和二聚体蛋白

dGFP

的亮度

GFP

2

倍以上

,

'

22

突变体

S65T

%

突变体

S65T

的激发谱中只有一个峰,

大的潜

(

%

(

red

luorescent

protein

,

RFP

)

%

1

比较了上述多种

1.2

其他颜色的荧光蛋白

1

Tab)

1

Comparison

of

properties

and

application

characteristics

of

fuorescent

proteies

各种颜色荧光蛋白性质和应用特点的比较

性质

特点

光蛋白的性质和各种荧光蛋白的

名称

GFP

光稳定

pH

剂等

'

(

pH

7

-12

)

在微生物

植物

动物中成功表达

GFP

表达不受细胞种类和位

置的限制

26

(

25

耐光白

'

BFP

等电点为

pH

6.

17

;

光稳定性差

BFP

产生荧光

成像过程利用紫外线来激发

作为

GFP

表达研究的对照或标记

;适用于

EGFP

RFP

YFP

一些光毒性问题

其他染料

蛋白的

平和细胞内定位

利用

CFP

蛋白

CFP

GFP

高度相似

可用

GFP

抗体检测

CFP

YFP

RFP

荧光最强

;

稳定性较差

对酸性敏感

,

pH

6.

5

时荧光强度丧失

50%

十分敏感'

27

-29

(

的荧光蛋白之一

胞内

pH

和氯离子浓度的

生物

作为荧光能量的接受体

光共振

mCherry

的稳定性好

较的激发波

产生的光性较

较的生物织

30

(

'

2019

年第

45

卷第

17

(

总第

389

)

253

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRIS

2

利用荧光蛋白作为标记筛选目的细胞

随着科技的发展

重组

DNA

技术

recambinant

蛋白的状态

GFP的生色团和目标蛋白融合表达可

目标蛋白是

误折叠

'

40

光蛋白

发为

pH

41

pH

转变为光颜色

DNA

technology

在微生物育种方面应用越来越普遍

的变化

表征细胞内

pH

pH

6.

8

-7.

8

之间

随着

pH

荧光蛋白强度增强

42

甚至全基因组改组

genome

shuffling

已经应用到微

生物育种过程中

'

31

o

为了筛选到性状

的微生

很多科学

胞筛

研究

生物

4

基于荧光蛋白的细胞筛选策略

为了提高细胞表达外源蛋白的表达效率

借助一

的筛

光蛋

白作为探针筛选目的

物菌种改良的多个方面取得

载体

速有效

简单易行和

些物理化学

UV

诱变

NTG

诱变等

目的蛋

性强等特点

近年来

各种荧光蛋白在工业微生

机突变

工作

等优点

近年

白的突变体

传统的筛

例如

96

孔板中的筛

高通量筛选

光蛋白具有基因片段相对较短

700

bp

),

表达

随机性大

的概念

流体技术

流体技术最初

,多学者

光蛋白作为筛

MANZ

43

代谢

物的筛选

例如单志新等

'

32

GFP

作为报

蛋白筛

制目的基

siRNA

'

33

体质

系统

UPS

获得

简便的带有

GFP

的酿酒酵母

GFP

的重组

'

34

生物和化学

的样品制

作单元集成

分离和

等基

以替代传统的生物和化学

离技术

的一种新型分析分

流体技术筛选目的菌株需要

好的技术储备

目前

光蛋白作

例如徐明

观察之后

为防止

通常处

续相和

为标记筛选微生物

GFP

标记

相的蒸发

微流体通道或

状态

成功获得大丽轮

的获得为后续大丽

转化株

大丽

胞正常生

44

为改

DAGKESAMANSKAYA

45

光转

光蛋白

流筛

过程的组织学和致

好的基础

荧光蛋白

理研究提供

筛选一

-蛋白酶体通

UPP

流体

等细

中直接生

可以直接恢复

达特定

的药物细胞

目的细胞的活性

该方法基于绿色到红色可切换荧

光蛋白的细胞内

在显微镜下监测液滴中细胞的

回收

45

是细胞内重要的蛋白质降解系统

影响恶性

胞发生与发展

'

35

蛋白酶体抑制剂通过

UPP

,

制 胞生长

成为

生长

光激

疗的新方法

方海

的研究

通过

法筛

胞基

同等

'

36

GFP

的筛选模型

得大量

稳定表达

以种光转

胞的

光蛋白

流控

选中具

蛋白酶体抑制剂的细胞株

目前

微生物育种过程中单细胞基

的应用前景

近几年

流体技术

较难

将荧

的蛋白质

与日

44

W

HUANG

光蛋白与一

以和

DNA

例如组蛋白结合蛋白和荧光蛋白

48

后的酵

流控筛选和全基

光鉴

H

S-mCher

e

定与酵母蛋白

胞与

a-

粉酶改

的突变

经突

and

HMG-mCher

e

来筛选已经发生突变的细胞

'"

绿色荧光蛋白的

a-

淀粉酶混

3

基于荧光蛋白表

细胞

状态

细胞内的状态影响细胞内蛋白质构象

例如蛋白

通过荧光底物

的液

产的淀粉酶突变体

系统

称之为

双荧光

的荧光强度选择

陈建武等

'

49

借助新潮霉素和荧光蛋白

2

类标记

的基

质错误折

和聚集

所以

蛋白质的

以说

明细胞内状态

VENTURA

'

38

采用

GFP

作为模型

蛋白

以阻止蛋白质错误折

的化学

系统

该策略以

GFP

和新霉素基因为正筛选标记

以红色荧光蛋白基因为负筛

目的细

最大

WANG

50

通过

色荧光蛋白

正远红外的

内蛋白质状态

例如

KUCHERAK

39

光分

发射波长为

625

nm

649

nm

与青色

绿色

黄色和

行多色标记成像

6FM-M

7AFM-M

标记突触核蛋白说明突触核

254

2019

Vol.

45

No.

17

Total

389

综述与专题评论

随着对荧光蛋白研究的深入

发现荧光蛋白发射

1996

6

(

2

)

:

178

-

182.

[

5

]

SADO

Y

OIKAWA

M

NAKAZAWA

H

el

al.

Machine

的荧光可以通过

波长的光

产生

3

荧光蛋白

光激活荧光蛋白

(

photoactivated

fluorescent

protein

,

PAFPs

)、

光转换荧光蛋白

(

photoconvenibie

learning

uided

mutagenesis

for

directed

ewlu/on

of

luo-

rescenl

proteins

[

J

]

.

ACS

Synthetic

Bioloyy

2018

7

(

9

)

:

2

014

-2

022.

[

6

]

DUDA

K

LONOWSKI

L

A

KOFOED-NIELSEN

M

I

fluorescent

protein

,

PCFPs

)

光开关荧光蛋白

(

/versl-

bie

photoswitching

luorescent

protein

,

PSFPs

)

%

其中

PCFPs

是指光照后荧光蛋白从一种发射短波长的荧

光状态

地转变为

外一种发射长波长的荧光

S.

High-efficiency

genome

editing

via

2A-csupled

cs-ce-

pression

of

luorescent

proteins

and

zine

finger

nucleases

or

CRISPR/Cs9

nickase

pairs

[

J

]

.

Nucleic

Acids

Re-

状态

目前为

的由绿转

的荧光蛋白主要有

Dendra2、

Eos

Kaede

KikGR

[

51

(

这些荧光蛋白具有

相同的生色团

His

-Tyr-Gly

,

光转换前发射绿色荧

光转换后变成

色荧光

胞筛

面发挥着

重要作用

但是目前

光转换蛋白的研究较少

,需

要继续开发更多种类生色团的荧光蛋白

5

展望

目前

GFP

的种类较为完全

在微生物过程工程

研究中

主要集中

胞筛选

微流体技术

通过调节其

荧光

将目的细胞分级

筛选

双光

筛选和光转换筛选策略员

单荧光筛选中筛

荧光蛋白

胞筛选的研究中

是热门

但是基

光蛋白筛

着一些问题与不

荧光强度的

线性性质使其定量非常

;

紫外激发

蛋白有光漂白和

作用

多生物

的自发

光现象,

并有着

的激发和发射波长等

所以

光蛋白

胞筛

其他

要继

参考文献

[

1

(

7MORISEH

SHIMOMURA

O

JOHNSON

F

-

molecular

ene/y

transfer

in

the

bioluminescenl

system

of

Aequorea

[

J

]

.

Biochemist/^

1974

13

(

12

)

:

2

656

-

2

662.

[

2

]

PRASHER

D

C

ECKENRODE

V

K

WARD

W

W

el

S.

Prima/

structure

of

the

Aequoreq

victoria

greeniluorescenl

protein

[

J

]

.

Gene

1992

111

(

2

)

:

229

-233.

[

3

]

MISHIN

A

S

BELOUSOV

V

V

SOLNTSEV

K

M

el

S.

Novel

uses

of

luorescent

proteins

[

J

]

.

Current

Opinion

in

Chemical

Bioloyy

2015

27

:

1-9.

[

4

]

HEIM

R

TSIEN

R Y.

Engineering

green

luorescent

pro

­

tein

foeimpeoeed

beightness

eongeewaeeeengthsand

feuo-

rescencs

resonance

ene/y

transfer

[

J

]

.

Current

Bioloyy,

seae,h

2014

42

(

10

)

:

e84.

[

7

]

HOJJAND

KNUDSEN

C

ASGRIMSDOTTIR

E

S

RAHA

MI

K

el

al.

A

modified

monomeric

red

luorescent

protein

eepoeteefoeassessingCRISPR

a,tieity

[

J

]

.

Feontieesin

Ce

e

and

DeeeeopmentaeBioeogy

2018

6

:

54.

[

8

]

KAMIYAMA

D

SEKINE

S

BARSARHYNE

B

el

S.

Versatile

protein

tagging

in

cells

with

split

luorescent

pro

­

tein

[

J

]

.

Nature

Communications

2016

7

:

11

046.

[

9

]

BIKLECKA-CORNAL

M

MAKUSHOK

T

RAFELSKI

S

M.

A

review

of

luorescent

proteins

for

use

in

yeast

[

J

]

.

Methods

in

Molecular

Bioloyy

(

Clifton

NJ

)

2016

1

369

:

309

-346.

[

10

]

CHALFILM

KAIN

S

R.

Green

luorescent

protein

:

prop

­

erties

applications

and

protocels

secend

edition

[

M

].

2nd

ed.

John

Wiley

&

Sons

Ins.

2005.

[11

]

ORM

M,

CUBDT

A

B

KALLIO

K

el

al.

C/stal

sWuc-

turo

of

the

Aequoreq

v/toric

green

luorescent

protein

[

J

]

.

Science

1996

273

(

5

280

)

:

1

392

-

1

395.

[

12

]

YANG

F

MOSS

L

G

PHILLIES

N

G.

The

molecular

structure

of

green

luorescent

protein

[

J

]

.

Nature

Bio-

ichnoloyy

1996

14

(

10

)

:

1

246

-

1

251.

[

13

]

DELAGRAVE

S

YOUVAN

D

C.

Searching

sequence

space

to

engineer

proteins

:

exponential

ensemble

muta

­

genesis

[J

]

.

Bio/technoloyy

1993

11

(

13

)

:

1

548

-

1

552.

[

14

]

马金石

绿色荧光蛋白

[

J

]

.化学通报

2009

72

(

3

):

243

-250.

[

15

]

CODY

C

W

PRASHER

D

C

WESTLER

W

M

el

S.

Chemical

structure

of

the

hexxpeptide

chromophore

of

the

Aequoreq

green

uorescenl

protein

[

J

]

.

Biochemist/

1993

32

(

5

)

:

1

212

-1

218&

[

16

]

INOUYE

S

TSUJI

F

I.

Aequoreq

green

fluorescent

pro

­

tein

[

J

]

&FEBS

Le

t

ees

1994

341

(

2

-3

)

:

277

-280&

[

17

]

HEIM

R

PRASHER

D

C

TSIEN

R

Y.

Wavelength

mu

­

tationsand

pos

t

eanseationaeautotidation

ofgeeen

feuoees-

cenl

protein

[

J

]

.

Procsedings

of

the

National

Academy

of

Sciences

of

the

United

States

of

America

1994

91

(

26

)

:

12

501 -

12

504.

2019

年第

45

卷第

17

(

总第

389

)

255

食品与发酵工业

FOOD

AND

FERMENTATIN

IDUSTRIS

j

[

18

]

CRAGGS

T

D.

Green

fuorescent

protein

:

structure

#

fcXdl

ing

and

chromophore

maturation

'

J

(

.

Chemical

Society

Reviews

#

2009

#

38

(

10

)

:

2

865

-

2

875.

[19

]

吴沛

巴晓

胡海

等.绿色荧光蛋白

GFP

的研究

进展及应用

[

J

]

.

生物医学工程研究

#

2009

#

28

(

1

)

83

-86.

[

20

]

CORMACK

B

P

#

VALDIVIA

R

H

#

FALKOW

S.

FACSl

optimized

mutantsofthegaeen

fluoaescentpaotein

( GFP

)

[

J

]

.

Gene

#

1996

#

173

(1

)

:

33

-38.

[21

]

HEIM

R

#

CUBIT

A

B

#

TSIN

R

Y.

Improved

green

血-

oaescence

[

J

]

.Natuae

#

1995

#

373

(

6

516

)

:

663

-664.

[

22

]

HAGAN

R

P

#

RHOADES

E

#

GRUBER

D

F

#

et

al.

A

new

b

aight

g

aeen-emi

t

ing

fluo

aescent

p

aotein

-engineeaed

monomeric

and

dimeric

forms

[

J

]

.

FEBS

Journal

#

2010

#

277

(

8

)

:

1

967

-

1

978.

[

23

]

DAY

R

N

#

DAVIISON

M

W.

The

fluorescent

protein

pale

t

e

:

Toolsfoace

lulaaimaging

[

J

]

.ChemicalSociety

Reviews

#

2009

#

38

(

10

)

:

2

887

-2

921.

[

24

]

GRISBECK

O

#

BAIRD

G

S

#

CAMPBELL

R

E

#

et

al.

Reducingtheeneiaonmentalsensitieityofye

l

ow

fluoaes-

centpaotein

mechanism

and

applications

[

J

]

.Jouanalof

Biological

Chemists

#

2001

#

276

(

31

)

:

29

188

29

194.

[

25

]

吴瑞

#

张树珍

绿色荧光蛋白及其在植物分子生物学

中的应用

[

J

]

•分子植物育种

#

2005

#

3

(

2

)

:

240

-

244.

[

26

]

汪恒英#周守标#常志州

.

绿色荧光蛋白

(

GFP

)

究进展

[

J

]

.

生物技术

#

2004

#

14

(

3

)

:

228

-233.

[

27

]

LLOPIS

J

#

MCCAFFERY

J

M

#

MIYAWAKI

A

#

et

al.

Measuaemen3ofcyosolic

#

miochondaial

#

and

golgipH

in

singlelieingce

l

swih

gaeen

fluoaescen3paoeins

[

J

]

.

Paoceedingsof3heNaionalAcademyofSciencesof3heU-

nied

S

aesofAmeaica

#

1998

#

95

(

12

)

:

6

803

-6

808.

[

28

]

JAYARAMAN

S

#

HAGGI

P

M

#

WACHTER

R

M

#

et

ism

and

ce

l

ulaaapplicationsofagaeen

fluo-

aescent

p

aotein-based

halidesensoa

[

J

]

.JouanalofBio-

logicalChemistay

#

2000

#

275

(

9

)

:

6

047

-6

050.

[

29

]

KUNER

T

#

AUGUSTINE

G

J.

A

genetical

l

y

enceded

ral

tiometaicindicatoafoachloaide

:

captuaingchloaidetaansi-

ents

in

cultuaed

hippocampal

neuaons

[

J

]

.

Neuaon

#

2000

#

27

(

3

):

447

-459.

[

30

]

郝丽梅

#

棣,

梅兴国.红色荧光蛋白的研究进展

[

J

]

.

学研究

#

2006

#

33

(

2

):

131

-133.

[31

]

李义勇

#

张亚雄

.

基因重组技术在工业微生物菌种选

育中应用的研究进展

[

J

]

.中国酿造#

2009

#

28

(

1

)

:

11

-14.

[

32

]

单志新

#

林秋雄

#

符永恒

#

等•用绿色荧光蛋白

(

GFP

)作为报告分子筛选有效的

siRNA

[

J

]

.

中国生

256

2019

Vol.

45

No-

7

(

Total

389

)

物化学与分子生物学报

#

2007

#

23

(

3

)

:

231

-235.

[

33

]

王弘

#

郑文岭

#

杨连生

#

.

以绿色荧光蛋白为报告

基因的酿酒酵母表达载体的构建

[

J

]

•广东医学

#

2002

#

23

(

12

)

:

1

239

-

1

240.

[

34

]

徐明

#

桂月晶

#

祁伟彦#等.绿色荧光蛋白基因标记棉

花黄萎病菌

[

J]

•植物保护

#

2013

#

39

(

5

):

128

-

133.

[

35

]

黄洁玉

#

张敏

.

蛋白酶体抑制剂在肺癌治疗中的研究

进展

[

J

]

.

中国医药导报#

2016

#

13

(

23

)

:

38

-41.

[

36

]

方海同#胡政#周光飕

.

一种基于绿色荧光蛋白的蛋

白酶体抑制剂细胞筛选模型

[

J

]

.

生物工程学报

#

2009

#

25

(

3

)

:

452

-456.

[

37

]

PARK

J

#

LEE

S

#

WON

N

#

-moleculeDNA

eisualization

usingAT-specificaed

and

non-specific g

aeen

DNA-binding

fluoaescentpaoteins

[

J

]

.

The

Analyst

#

2019

#(3

)

.

[

38

]

VENTURA

S

#

NAVARRO

S.

Sc

aeening

p

aotein

aggaega

tion

in

ce

l

susingfluoaescentlabelscoupled

toflow

cy-

tometay

[

J

]

.

Methods

in

MoleculaaBiology

(

Clifton

#

NJ)

#

2019

#

1873

:

195

-212.

[

39

]

KUCHERAK

O

A

#

SHVADCHAK

V

V

#

KYRIUKHA

Y

A

#

sisofafluoaescentpaobefoasensingmul-

tiplepaotein

states

[

J

]

.

Euaopean

Jou

anal

of

O

aganic

Chemists

#

2018

(

37

)

:

5

155

-5

162.

[

40

]

LII

Y

#

WOLSTENHOLME

C

H

#

CARTER

G

C

#

et

al.

Modulation

offluoaescentpaotein

chaomophoaestodetect

paotein

aggaegation

with

tuan-on

fluoaescence

[

J

]

.

Jou

anal

ofthe

Ameaican

ChemicalSociety

#

2018

#

140

(

24

)

:

7 381

-7

384.

[

41

]

7SHINODA

H

#

SHANNON

M

#

NAGAIT.

Fluoaescen

p

aoteins

fo

ain

eestigating

biological

e

eents

in

acidicenei-

aonments

[

J

]

.

InteanationalJouanalofMoleculaaSci-

ences

#

2018

#

19

(

6):

1

548.

[

42

]

EUM

KANG

B

#

LEE

S

#

BAKER

B

J.

Optical

cense-

quencesofagenetica

l

y-encoded

eoltageindicatoawith

a

pH

sensitieefluoaescentpaotein

[

J

]

.NeuaoscienceRe-

seaach

#

2018

.

[

43

]

MANZ

A

#

GRABER

N

#

WIDMER

H

M.

Miniaturized

te-

talchemicalanalysissystems

:

A

noeelconceptfoachemi-

cal

sensing

[

J

]

.

Sensors

&

Actuators

B

Chemical

#

1990

#

1(

1

):

244

-248.

[

44

]

HOSOKAWA

M

#

HOSHINO

Y

#

NISHIKAWA

Y

#

et

al.

Daople-based

mic

aofluidics

fo

ahigh-3h

aoughpu3sc

aeening

ofameagenomiclibaaayfoaisolaion

ofmicaobialenzymes

[

J

]

.Biosensoas&

Bioelecaonics

#

2015

#

67

:

379

-385.

[

45

]

DAGKESAMANSKAYA

A

#

LANGER

K

#

TAUZIN

A

S

#

hotoswitchablefluoaescentpaoteinsfoadaop-

let-based

micaofluidicscaeening

[

J

]

.JouanalofMicaobio-

综述与专题评论

loyicol

Methods

,

2018

#

147

:

59

65.

[

J

]

.

Pros

Natl

Acad

Sci

USA

,

2015

,

112

(

34

):

[

46

]

LONGWELL

C

K

,

LABANDH

L

,

COCHRAN

J

R.

High-throughput

screening

technoloyies

for

enzyme

engi

­

4

689

-4

696.

[

49

]

陈建武

任红艳

华文君

.

一种用于提高基因打靶

neering

[

J

]

.

Cur

r

Opin

Biotechnol

,

2017

,

48

:

196

-

202.

效率的

荧光筛选策略

[

J

]

.

中国生物工程杂志,

2017

,

37

(

1

)

:

58

-63.

[

50

]

WANG

L

,

JACKSON

W

C

,

STEINBACH

P

A

,

cl

S.

E-

[

47

]

SHEMBEKAR

N

,

HU

H

,

EUSTACE

D

,

el

S.

Single

­

cell

droplet

microluidis

screening

for

antibodies

specifis-

Sly

binding

to

taryel

cells

[

J

]

.

Cell

Reports

,

2018

,

22

(

8

)

:

2

206

-

2

215.

wlu/on

of

new

nonantibody

proteins

via

iterative

somatic

hypermutation

[

J

]

.

Proccedings

of

the

National

Academy

of

Sciences

of

the

United

States

of

America

,

2004

,

101

[

48

]

HUANG

M

,

BAI

Y

,

SJOSTROM

S

L

,

cl

S.

Microluidis

(

48

)

:

16

745

-

16

749.

screening

and

whole

enome

sequencing

identifies

muta

­

[

51

]

韩李阳

.

超分辨成像光转换荧光蛋白探针的筛选及应

用'

D

]

•长沙

南大学

2014.

tions

associated

with

improved

protein

secretion

by

yeast

Fluoresccnt

proteies

and

their

applicationt

ie

microbial

straie

engineeieg

MAO

Hongli

,

LIN

Yu

,

ZHANG

Jianguo

*

(

Institute

of

Food

Science

and

Engineering

,

School

of

Medical

Instrument

and

Food

Engineering

,

University

of

Shanghai

for

Science

and

Technoloyy

,

Shanghai

200093

,

China

)

ABSTRACT

Fluorescent

proteins

are

a

series

of

luminescent

proteins

under

UV

light.

Fluorescent

proteins

are

widely

used

as

markers

in

many

fields

due

to

their

good

stability

,

high

sensitivity

and

non-toxicity.

Currently

,

suc

­

cessfully

established

fluorescent

proteins

include

green

luorescent

protein

(

GFP

)

,

blue

luorescent

protein

(

BFP

),

cyan

luorescent

protein

(

CFP)

,

yellow

luorescent

protein

(

YFP

)

and

red

luorescent

protein

(

RFP

)

.

App/ca/ons

of

fluorescent

proteins

in

strain

screening

during

microbial

engineering

have

been

wli

developed.

Strain

screening

is

/mv-consuming

and

labor-intensive

,

and

fluorescent

proteins

provide

a

breakthrough

for

high-throughput

screening.

This

review

started

with

basic

research

work

on

luorescent

proteins

and

summarized

the

app/ca/ons

of

luorescent

proteins

in

microbial

strain

engineering

as

well

as

new

screening

tvchnoCyivs.

This

review

will

provide

a

basis

for

ap

­

plying

luorescent

proteins

and

other

luminescent

proteins

in

microbial

strain

engineering.

Key

words

fluorescent

protein

strain

engineering

screening

strategy

;

mic/luidics

tvchnoloyy

2019

年第

45

卷第

17

总第

389

257

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